Heatmap: Cluster_61 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000008.1_cds_GFH05773.1_250 (GFH05773)	0.01	1.0	0.0	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.07	0.67	0.01	0.02	0.09	0.0	0.04	0.03	0.0	0.06	0.03	0.01	0.14	0.0	0.0	0.0	0.02	0.17
lcl\|BLLF01000026.1_cds_GFH06182.1_659 (GFH06182)	0.09	1.0	0.0	0.01	0.03	0.09	0.11	0.04	0.14	0.65	0.03	0.05	0.11	0.03	0.1	0.22	0.1	0.33	0.21	0.15	0.56	0.24	0.35	0.14	0.07	0.15
lcl\|BLLF01000045.1_cds_GFH06564.1_1041 (GFH06564)	0.04	1.0	0.0	0.0	0.13	0.06	0.04	0.02	0.02	0.37	0.06	0.04	0.01	0.04	0.02	0.3	0.0	0.25	0.08	0.17	0.79	0.44	0.24	0.22	0.11	0.09
lcl\|BLLF01000157.1_cds_GFH08384.1_2861 (GFH08384)	0.12	0.58	0.0	0.0	0.0	0.14	0.04	0.0	0.07	0.45	0.0	0.07	0.27	0.11	0.0	0.0	0.0	0.63	1.0	0.0	0.34	0.0	0.35	0.08	0.11	0.12
lcl\|BLLF01000183.1_cds_GFH08771.1_3248 (GFH08771)	0.39	1.0	0.38	0.39	0.23	0.19	0.1	0.24	0.16	0.51	0.22	0.16	0.21	0.16	0.31	0.27	0.76	0.91	0.56	0.45	0.65	0.15	0.6	0.44	0.21	0.15
lcl\|BLLF01000214.1_cds_GFH09173.1_3650 (GFH09173)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.16	0.07	0.04	0.11	0.07	0.83	0.32	0.08	0.28	0.09	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.0	0.0	0.23	0.17	0.13
lcl\|BLLF01000248.1_cds_GFH09623.1_4100 (GFH09623)	0.6	0.83	0.0	0.07	0.0	0.08	0.05	0.05	0.02	0.32	0.05	0.0	0.14	0.06	0.17	1.0	0.2	0.88	0.46	0.0	0.25	0.0	0.0	0.02	0.04	0.0
lcl\|BLLF01000286.1_cds_GFH10086.1_4563 (GFH10086)	0.09	1.0	0.0	0.01	0.02	0.05	0.07	0.02	0.09	0.52	0.02	0.03	0.08	0.02	0.07	0.04	0.02	0.24	0.1	0.06	0.46	0.18	0.2	0.1	0.05	0.14
lcl\|BLLF01000335.1_cds_GFH10670.1_5147 (GFH10670)	0.09	0.59	0.0	0.45	0.35	0.34	0.36	0.39	0.35	0.7	0.29	0.16	0.38	0.35	0.31	0.69	0.29	1.0	0.69	0.13	0.32	0.49	0.61	0.24	0.16	0.29
lcl\|BLLF01000339.1_cds_GFH10703.1_5180 (GFH10703)	0.11	0.53	0.0	0.42	0.33	0.23	0.33	0.18	0.0	0.3	0.14	0.23	0.16	0.24	0.32	0.43	0.96	0.34	0.0	0.29	0.0	0.53	1.0	0.06	0.46	0.16
lcl\|BLLF01000377.1_cds_GFH11138.1_5615 (GFH11138)	0.26	1.0	0.17	0.13	0.29	0.29	0.22	0.12	0.3	0.55	0.24	0.21	0.3	0.2	0.19	0.21	0.46	0.58	0.36	0.38	0.6	0.5	0.78	0.13	0.13	0.11
lcl\|BLLF01000403.1_cds_GFH11436.1_5913 (GFH11436)	0.07	1.0	0.0	0.02	0.16	0.15	0.11	0.18	0.1	0.11	0.13	0.14	0.11	0.13	0.09	0.17	0.18	0.46	0.24	0.37	0.5	0.76	0.43	0.3	0.23	0.15
lcl\|BLLF01000445.1_cds_GFH11884.1_6361 (GFH11884)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000454.1_cds_GFH11972.1_6449 (GFH11972)	1.0	0.81	0.16	0.0	0.11	0.0	0.16	0.13	0.18	0.1	0.16	0.03	0.08	0.27	0.09	0.0	0.0	0.57	0.78	0.0	0.43	0.81	0.49	0.24	0.02	0.0
lcl\|BLLF01000507.1_cds_GFH12475.1_6952 (GFH12475)	0.0	1.0	0.0	0.17	0.06	0.06	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000527.1_cds_GFH12659.1_7136 (GFH12659)	0.56	0.69	0.22	0.27	0.0	0.0	0.09	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.63	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.17	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000574.1_cds_GFH13096.1_7573 (GFH13096)	0.2	0.86	0.0	0.0	0.17	0.13	0.0	0.02	0.04	0.32	0.02	0.13	0.05	0.09	0.26	0.0	0.87	0.7	0.0	0.3	0.0	0.55	1.0	0.12	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000653.1_cds_GFH13790.1_8267 (GFH13790)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.21	0.36	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.24
lcl\|BLLF01000678.1_cds_GFH14027.1_8504 (GFH14027)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.05	0.06	0.0	0.0	0.0	0.72	0.0	0.0	0.45	0.52	0.0	0.38	0.07	0.0	0.09
lcl\|BLLF01000721.1_cds_GFH14402.1_8879 (GFH14402)	0.14	1.0	0.0	0.0	0.16	0.18	0.07	0.05	0.09	0.67	0.1	0.07	0.13	0.17	0.04	0.0	0.28	0.39	0.44	0.08	0.27	0.46	0.87	0.04	0.12	0.02
lcl\|BLLF01000823.1_cds_GFH15231.1_9708 (GFH15231)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001061.1_cds_GFH16858.1_11335 (GFH16858)	0.23	0.97	0.0	0.42	0.11	0.07	0.11	0.13	0.2	0.23	0.26	0.35	0.11	0.14	0.1	0.32	0.48	0.76	0.76	0.21	0.35	0.0	1.0	0.24	0.29	0.24
lcl\|BLLF01001138.1_cds_GFH17375.1_11852 (GFH17375)	0.21	1.0	0.0	0.31	0.07	0.08	0.05	0.12	0.11	0.43	0.05	0.07	0.08	0.07	0.09	0.36	0.07	0.12	0.23	0.28	0.14	0.02	0.12	0.05	0.07	0.09
lcl\|BLLF01001283.1_cds_GFH18319.1_12796 (GFH18319)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001338.1_cds_GFH18681.1_13158 (GFH18681)	0.13	1.0	0.0	0.0	0.07	0.03	0.05	0.01	0.03	0.35	0.07	0.05	0.04	0.05	0.03	0.26	0.52	0.74	0.0	0.38	0.49	0.26	0.49	0.01	0.14	0.08
lcl\|BLLF01001351.1_cds_GFH18760.1_13237 (GFH18760)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.08	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001412.1_cds_GFH19138.1_13615 (GFH19138)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.03	0.05	0.06	0.2	0.0	0.06	0.03	0.06	0.06	0.0	0.21	0.22	0.69	0.18	0.89	0.37	0.65	0.3	0.21	0.05
lcl\|BLLF01001422.1_cds_GFH19200.1_13677 (GFH19200)	0.1	1.0	0.0	0.0	0.09	0.09	0.04	0.08	0.17	0.0	0.19	0.04	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14
lcl\|BLLF01001470.1_cds_GFH19480.1_13957 (GFH19480)	0.42	0.91	0.07	0.1	0.0	0.0	0.03	0.03	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.31	0.0	0.82	0.0	1.0	0.12	0.01	0.0
lcl\|BLLF01001551.1_cds_GFH19976.1_14453 (GFH19976)	0.3	1.0	0.0	0.07	0.22	0.18	0.17	0.25	0.29	0.66	0.2	0.18	0.3	0.16	0.27	0.25	0.31	0.47	0.28	0.43	0.48	0.4	0.44	0.37	0.46	0.29
lcl\|BLLF01001755.1_cds_GFH21065.1_15542 (GFH21065)	0.17	1.0	0.0	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.34	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.23	0.12	0.25	0.05	0.06	0.24	0.12	0.21	0.14	0.04	0.07
lcl\|BLLF01001896.1_cds_GFH21736.1_16213 (GFH21736)	0.11	1.0	0.05	0.09	0.1	0.12	0.17	0.06	0.17	0.21	0.08	0.07	0.22	0.05	0.13	0.36	0.16	0.3	0.3	0.24	0.28	0.22	0.41	0.11	0.14	0.14
lcl\|BLLF01001914.1_cds_GFH21833.1_16310 (GFH21833)	0.27	1.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.08	0.15	0.04	0.74	0.09	0.11	0.0	0.0	0.11	0.0	0.26	0.81	0.41	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.06
lcl\|BLLF01002114.1_cds_GFH22743.1_17220 (GFH22743)	0.21	1.0	0.0	0.32	0.11	0.11	0.11	0.05	0.2	0.69	0.17	0.05	0.11	0.05	0.05	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002129.1_cds_GFH22816.1_17293 (GFH22816)	0.1	1.0	0.0	0.0	0.06	0.02	0.05	0.0	0.02	0.29	0.02	0.0	0.02	0.0	0.02	0.19	0.29	0.31	0.22	0.12	0.22	0.44	0.47	0.05	0.03	0.0
lcl\|BLLF01002192.1_cds_GFH23098.1_17575 (GFH23098)	0.17	1.0	0.0	0.06	0.15	0.15	0.04	0.32	0.19	0.28	0.2	0.19	0.23	0.17	0.12	0.0	0.89	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.05	0.46	0.36
lcl\|BLLF01002311.1_cds_GFH23599.1_18076 (GFH23599)	0.0	1.0	0.0	0.38	0.0	0.1	0.0	0.09	0.0	0.0	0.1	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.7	0.0	0.0	0.63	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002311.1_cds_GFH23601.1_18078 (GFH23601)	0.2	1.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.15	0.05	0.22	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0
lcl\|BLLF01002394.1_cds_GFH23906.1_18383 (GFH23906)	0.55	1.0	0.0	0.3	0.45	0.18	0.0	0.09	0.06	0.64	0.33	0.07	0.04	0.1	0.03	0.91	0.0	0.24	0.0	0.0	0.33	0.37	0.0	0.04	0.16	0.33
lcl\|BLLF01002602.1_cds_GFH24672.1_19149 (GFH24672)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.45
lcl\|BLLF01002631.1_cds_GFH24783.1_19260 (GFH24783)	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.5	0.76	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.12
lcl\|BLLF01002662.1_cds_GFH24899.1_19376 (GFH24899)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.26	0.13	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002818.1_cds_GFH25452.1_19929 (GFH25452)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.06	0.06	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.0	0.83	0.14	0.19	0.1
lcl\|BLLF01002821.1_cds_GFH25464.1_19941 (GFH25464)	0.15	0.97	0.0	0.0	0.16	0.25	0.28	0.13	0.46	1.0	0.06	0.1	0.11	0.14	0.03	0.3	0.23	0.22	0.0	0.15	0.0	0.0	0.9	0.03	0.2	0.22
lcl\|BLLF01002845.1_cds_GFH25547.1_20024 (GFH25547)	0.0	0.53	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.43	0.64	0.0	0.0	0.29	0.46	0.0	1.0	0.09	0.39	0.24
lcl\|BLLF01002886.1_cds_GFH25678.1_20155 (GFH25678)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.11	0.11	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2
lcl\|BLLF01002911.1_cds_GFH25761.1_20238 (GFH25761)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003015.1_cds_GFH26080.1_20557 (GFH26080)	0.04	1.0	0.0	0.01	0.14	0.08	0.06	0.07	0.06	0.25	0.16	0.06	0.03	0.04	0.02	0.36	0.25	0.15	0.13	0.3	0.78	0.46	0.32	0.21	0.12	0.06
lcl\|BLLF01003089.1_cds_GFH26308.1_20785 (GFH26308)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003232.1_cds_GFH26759.1_21236 (GFH26759)	0.11	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.86	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003771.1_cds_GFH28169.1_22646 (GFH28169)	0.02	1.0	0.01	0.0	0.06	0.06	0.01	0.04	0.04	0.07	0.03	0.03	0.03	0.01	0.06	0.16	0.24	0.11	0.07	0.0	0.06	0.14	0.11	0.17	0.07	0.1
lcl\|BLLF01003788.1_cds_GFH28222.1_22699 (GFH28222)	0.42	1.0	0.22	0.01	0.26	0.4	0.26	0.18	0.3	0.86	0.42	0.3	0.26	0.25	0.19	0.83	0.55	0.54	0.26	0.35	0.46	0.21	0.7	0.21	0.26	0.28
lcl\|BLLF01003950.1_cds_GFH28599.1_23076 (GFH28599)	0.15	0.71	0.0	0.04	0.08	0.09	0.04	0.05	0.09	0.42	0.12	0.05	0.09	0.04	0.07	1.0	0.44	0.79	0.41	0.42	0.25	0.44	0.37	0.07	0.08	0.06
lcl\|BLLF01004122.1_cds_GFH28968.1_23445 (GFH28968)	0.0	0.89	0.0	0.0	0.47	0.16	0.15	0.17	0.09	1.0	0.45	0.32	0.14	0.16	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0
lcl\|BLLF01004244.1_cds_GFH29222.1_23699 (GFH29222)	0.0	0.34	0.0	0.28	0.11	0.09	0.24	0.13	0.18	0.37	0.41	0.17	0.3	0.28	0.11	0.26	0.19	0.6	0.6	0.17	0.0	0.32	1.0	0.03	0.14	0.0
lcl\|BLLF01004332.1_cds_GFH29414.1_23891 (GFH29414)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.19	0.05	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004690.1_cds_GFH30070.1_24547 (GFH30070)	0.42	1.0	0.0	0.0	0.24	0.14	0.0	0.04	0.05	0.31	0.2	0.05	0.06	0.15	0.05	0.0	0.0	0.69	0.52	0.29	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.16
lcl\|BLLF01004953.1_cds_GFH30506.1_24983 (GFH30506)	0.02	1.0	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.2	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.1	0.34	0.55	0.23	0.18	0.59	0.17	0.74	0.09	0.0	0.01
lcl\|BLLF01004961.1_cds_GFH30520.1_24997 (GFH30520)	0.12	1.0	0.0	0.0	0.05	0.11	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.14	0.07	0.05	0.93	0.0	0.38	0.55	0.0	0.0	0.0	0.36	0.16	0.13	0.5
lcl\|BLLF01004989.1_cds_GFH30562.1_25039 (GFH30562)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.09	0.0	0.09	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.24	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01005593.1_cds_GFH31396.1_25873 (GFH31396)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.19	0.0	0.41	0.0	0.52	0.21	0.0	0.0	0.09	0.05	0.16
lcl\|BLLF01005708.1_cds_GFH31544.1_26021 (GFH31544)	0.0	1.0	0.17	0.16	0.1	0.05	0.09	0.05	0.05	0.0	0.02	0.05	0.02	0.0	0.05	0.19	0.93	0.27	0.61	0.6	0.83	0.0	0.52	0.13	0.03	0.03
lcl\|BLLF01005844.1_cds_GFH31694.1_26171 (GFH31694)	0.17	1.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.1	0.17	0.0	0.62	0.22	0.09	0.22	0.09	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0
lcl\|BLLF01005948.1_cds_GFH31789.1_26266 (GFH31789)	0.53	1.0	0.11	0.01	0.18	0.33	0.33	0.13	0.48	0.66	0.15	0.16	0.25	0.11	0.34	0.81	0.61	0.32	0.22	0.41	0.45	0.31	0.38	0.21	0.23	0.17
lcl\|BLLF01005951.1_cds_GFH31795.1_26272 (GFH31795)	0.08	1.0	0.0	0.06	0.01	0.0	0.04	0.02	0.02	0.31	0.04	0.02	0.01	0.0	0.0	0.31	0.16	0.33	0.17	0.02	0.33	0.26	0.14	0.01	0.0	0.03
lcl\|BLLF01005973.1_cds_GFH31818.1_26295 (GFH31818)	0.09	1.0	0.0	0.0	0.19	0.23	0.12	0.18	0.16	0.42	0.14	0.1	0.19	0.14	0.1	0.12	0.48	0.37	0.14	0.12	0.32	0.22	0.27	0.14	0.04	0.11
lcl\|BLLF01007246.1_cds_GFH32855.1_27332 (GFH32855)	0.21	0.79	0.0	0.42	0.07	0.14	0.14	0.0	0.07	0.51	0.07	0.07	0.23	0.14	0.2	0.0	0.0	1.0	0.75	0.0	0.0	0.79	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01008164.1_cds_GFH33274.1_27751 (GFH33274)	0.98	1.0	0.0	0.1	0.1	0.08	0.07	0.11	0.06	0.0	0.09	0.05	0.07	0.06	0.28	0.0	0.0	0.71	0.35	0.2	0.33	0.56	0.12	0.05	0.16	0.12
lcl\|BLLF01009584.1_cds_GFH33768.1_28245 (GFH33768)	0.37	1.0	0.0	0.11	0.09	0.52	0.16	0.09	0.29	0.77	0.15	0.18	0.04	0.19	0.26	0.0	0.19	0.53	0.15	0.43	0.55	0.23	0.22	0.07	0.18	0.36

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)