Heatmap: Cluster_294 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000014.1_cds_GFH05926.1_403 (GFH05926)	0.29	0.78	1.0	0.24	0.27	0.26	0.23	0.34	0.21	0.12	0.16	0.3	0.29	0.27	0.26	0.75	0.71	0.24	0.21	0.14	0.27	0.56	0.34	0.29	0.27	0.14
lcl\|BLLF01000018.1_cds_GFH06016.1_493 (GFH06016)	0.42	0.58	0.69	0.19	0.42	0.38	0.27	0.44	0.17	0.16	0.23	0.4	0.31	0.26	0.23	0.22	0.26	0.11	0.31	0.24	0.12	1.0	0.14	0.23	0.19	0.14
lcl\|BLLF01000028.1_cds_GFH06219.1_696 (GFH06219)	0.26	0.3	1.0	0.13	0.0	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.0	0.02	0.01	0.0	0.01	0.25	0.28	0.06	0.09	0.1	0.11	0.12	0.08	0.29	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000050.1_cds_GFH06670.1_1147 (GFH06670)	0.31	0.68	1.0	0.28	0.36	0.26	0.16	0.49	0.15	0.08	0.3	0.22	0.24	0.28	0.15	0.45	0.68	0.46	0.4	0.24	0.38	0.32	0.38	0.36	0.16	0.17
lcl\|BLLF01000065.1_cds_GFH06951.1_1428 (GFH06951)	0.0	0.61	0.75	0.0	0.19	0.16	0.1	0.3	0.11	0.06	0.17	0.16	0.14	0.21	0.13	1.0	0.97	0.38	0.41	0.6	0.27	0.6	0.3	0.33	0.2	0.25
lcl\|BLLF01000103.1_cds_GFH07574.1_2051 (GFH07574)	0.05	1.0	0.84	0.21	0.16	0.38	0.25	0.38	0.15	0.06	0.14	0.55	0.39	0.41	0.24	0.5	0.54	0.11	0.2	0.14	0.15	0.72	0.25	0.47	0.22	0.17
lcl\|BLLF01000125.1_cds_GFH07925.1_2402 (GFH07925)	0.18	1.0	0.37	0.31	0.15	0.07	0.04	0.07	0.05	0.19	0.07	0.04	0.05	0.02	0.03	0.33	0.13	0.04	0.16	0.15	0.06	0.72	0.03	0.29	0.02	0.0
lcl\|BLLF01000190.1_cds_GFH08867.1_3344 (GFH08867)	0.48	0.43	0.19	0.28	0.14	0.15	0.15	0.14	0.22	0.61	0.13	0.16	0.18	0.11	0.12	0.33	0.48	0.73	0.36	0.63	0.49	1.0	0.45	0.69	0.44	0.38
lcl\|BLLF01000207.1_cds_GFH09074.1_3551 (GFH09074)	0.44	0.67	1.0	0.35	0.3	0.38	0.28	0.31	0.29	0.42	0.22	0.32	0.31	0.21	0.25	0.34	0.3	0.19	0.4	0.41	0.29	0.6	0.36	0.45	0.26	0.22
lcl\|BLLF01000285.1_cds_GFH10068.1_4545 (GFH10068)	0.26	1.0	0.7	0.43	0.16	0.2	0.16	0.21	0.15	0.2	0.19	0.32	0.3	0.24	0.23	0.22	0.25	0.13	0.14	0.2	0.11	0.47	0.14	0.28	0.21	0.2
lcl\|BLLF01000331.1_cds_GFH10621.1_5098 (GFH10621)	0.33	0.77	1.0	0.26	0.37	0.33	0.27	0.46	0.27	0.44	0.37	0.33	0.31	0.36	0.25	0.68	0.57	0.42	0.35	0.37	0.44	0.58	0.48	0.31	0.25	0.3
lcl\|BLLF01000362.1_cds_GFH10967.1_5444 (GFH10967)	0.04	1.0	0.8	0.21	0.17	0.31	0.26	0.26	0.23	0.41	0.13	0.24	0.22	0.17	0.15	0.59	0.67	0.12	0.16	0.17	0.26	0.68	0.42	0.58	0.19	0.22
lcl\|BLLF01000362.1_cds_GFH10970.1_5447 (GFH10970)	0.39	0.78	1.0	0.32	0.39	0.39	0.27	0.42	0.31	0.24	0.34	0.3	0.26	0.26	0.27	0.33	0.4	0.32	0.48	0.46	0.28	0.43	0.2	0.18	0.23	0.19
lcl\|BLLF01000381.1_cds_GFH11175.1_5652 (GFH11175)	0.37	0.36	1.0	0.11	0.12	0.08	0.08	0.11	0.08	0.27	0.05	0.04	0.06	0.02	0.05	0.24	0.16	0.02	0.16	0.17	0.05	0.52	0.06	0.34	0.01	0.0
lcl\|BLLF01000386.1_cds_GFH11237.1_5714 (GFH11237)	0.46	1.0	0.77	0.4	0.26	0.3	0.44	0.26	0.48	0.25	0.24	0.3	0.4	0.3	0.53	0.69	0.58	0.33	0.15	0.22	0.39	0.6	0.29	0.64	0.54	0.47
lcl\|BLLF01000400.1_cds_GFH11411.1_5888 (GFH11411)	0.28	0.8	1.0	0.27	0.37	0.26	0.17	0.33	0.22	0.16	0.28	0.21	0.22	0.19	0.2	0.45	0.58	0.33	0.56	0.32	0.36	0.16	0.35	0.16	0.1	0.13
lcl\|BLLF01000410.1_cds_GFH11513.1_5990 (GFH11513)	0.67	1.0	0.78	0.36	0.21	0.19	0.16	0.3	0.2	0.24	0.18	0.22	0.19	0.2	0.29	0.52	0.34	0.41	0.64	0.7	0.41	0.8	0.53	0.81	0.44	0.39
lcl\|BLLF01000520.1_cds_GFH12607.1_7084 (GFH12607)	0.4	1.0	0.8	0.59	0.41	0.39	0.29	0.48	0.31	0.42	0.43	0.44	0.4	0.42	0.34	0.26	0.54	0.43	0.41	0.51	0.37	0.43	0.41	0.48	0.27	0.29
lcl\|BLLF01000548.1_cds_GFH12864.1_7341 (GFH12864)	0.28	0.7	1.0	0.33	0.31	0.23	0.22	0.36	0.23	0.06	0.31	0.21	0.28	0.32	0.19	0.2	0.31	0.33	0.09	0.14	0.34	0.12	0.27	0.34	0.39	0.35
lcl\|BLLF01000569.1_cds_GFH13053.1_7530 (GFH13053)	0.11	0.47	1.0	0.15	0.17	0.19	0.55	0.1	0.39	0.08	0.14	0.2	0.23	0.12	0.62	0.47	0.4	0.44	0.09	0.06	0.28	0.35	0.38	0.35	0.21	0.16
lcl\|BLLF01000580.1_cds_GFH13140.1_7617 (GFH13140)	0.4	0.46	0.2	0.26	0.2	0.21	0.19	0.18	0.25	0.53	0.16	0.18	0.2	0.14	0.21	0.69	0.63	0.39	0.49	0.64	0.47	1.0	0.4	0.67	0.44	0.35
lcl\|BLLF01000587.1_cds_GFH13211.1_7688 (GFH13211)	0.46	0.72	0.74	0.25	0.4	0.4	0.64	0.21	0.39	0.45	0.22	0.35	0.29	0.21	0.28	0.55	0.99	0.43	0.44	0.49	0.65	1.0	0.54	0.55	0.27	0.07
lcl\|BLLF01000604.1_cds_GFH13363.1_7840 (GFH13363)	0.43	0.82	1.0	0.63	0.36	0.27	0.25	0.39	0.35	0.29	0.35	0.26	0.29	0.33	0.26	0.37	0.7	0.29	0.12	0.21	0.31	0.19	0.35	0.38	0.24	0.27
lcl\|BLLF01000605.1_cds_GFH13379.1_7856 (GFH13379)	0.07	1.0	0.97	0.18	0.29	0.49	0.25	0.32	0.25	0.06	0.31	0.55	0.35	0.34	0.2	0.17	0.12	0.1	0.34	0.14	0.2	0.17	0.23	0.22	0.27	0.28
lcl\|BLLF01000621.1_cds_GFH13520.1_7997 (GFH13520)	0.0	0.83	0.74	1.0	0.27	0.08	0.38	0.21	0.2	0.2	0.08	0.13	0.26	0.19	0.23	0.09	0.62	0.07	0.0	0.06	0.1	0.11	0.29	0.54	0.2	0.08
lcl\|BLLF01000639.1_cds_GFH13673.1_8150 (GFH13673)	0.54	0.88	1.0	0.48	0.26	0.29	0.19	0.34	0.14	0.2	0.17	0.2	0.16	0.18	0.09	0.32	0.61	0.77	0.75	0.43	0.62	0.67	0.58	0.65	0.23	0.18
lcl\|BLLF01000682.1_cds_GFH14063.1_8540 (GFH14063)	0.28	1.0	0.78	0.27	0.46	0.53	0.32	0.47	0.26	0.07	0.41	0.65	0.34	0.49	0.28	0.19	0.18	0.1	0.56	0.5	0.15	0.81	0.23	0.43	0.26	0.31
lcl\|BLLF01000694.1_cds_GFH14162.1_8639 (GFH14162)	0.26	0.68	1.0	0.28	0.09	0.16	0.18	0.18	0.2	0.1	0.08	0.22	0.2	0.17	0.24	0.52	0.36	0.12	0.43	0.33	0.17	0.85	0.28	0.67	0.18	0.14
lcl\|BLLF01000742.1_cds_GFH14563.1_9040 (GFH14563)	0.01	0.92	1.0	0.24	0.24	0.2	0.2	0.22	0.19	0.2	0.22	0.19	0.17	0.2	0.22	0.07	0.25	0.21	0.37	0.32	0.26	0.27	0.41	0.6	0.22	0.24
lcl\|BLLF01000770.1_cds_GFH14816.1_9293 (GFH14816)	0.28	1.0	0.64	0.36	0.3	0.27	0.23	0.34	0.22	0.19	0.26	0.39	0.33	0.31	0.31	0.3	0.33	0.26	0.23	0.33	0.23	0.61	0.28	0.43	0.27	0.24
lcl\|BLLF01000808.1_cds_GFH15113.1_9590 (GFH15113)	0.03	0.2	1.0	0.11	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.0	0.03	0.07	0.22	0.0	0.17	0.13	0.0	0.74	0.01	0.23	0.06	0.01
lcl\|BLLF01000856.1_cds_GFH15485.1_9962 (GFH15485)	0.25	0.75	1.0	0.54	0.18	0.23	0.25	0.36	0.34	0.39	0.2	0.27	0.29	0.35	0.3	0.52	0.42	0.45	0.27	0.2	0.47	0.52	0.56	0.5	0.22	0.17
lcl\|BLLF01000920.1_cds_GFH15923.1_10400 (GFH15923)	0.23	1.0	0.67	0.32	0.16	0.1	0.08	0.11	0.08	0.12	0.15	0.17	0.15	0.14	0.15	0.43	0.24	0.17	0.2	0.22	0.18	0.72	0.32	0.47	0.31	0.22
lcl\|BLLF01000934.1_cds_GFH16027.1_10504 (GFH16027)	0.08	0.94	1.0	0.14	0.28	0.24	0.35	0.26	0.56	0.1	0.27	0.25	0.3	0.23	0.8	0.64	0.46	0.26	0.14	0.36	0.2	0.35	0.37	0.42	0.55	0.43
lcl\|BLLF01001044.1_cds_GFH16738.1_11215 (GFH16738)	0.23	0.97	1.0	0.0	0.05	0.0	0.05	0.02	0.03	0.14	0.02	0.0	0.02	0.12	0.0	0.33	0.76	0.0	0.0	0.06	0.05	0.73	0.16	0.55	0.08	0.03
lcl\|BLLF01001308.1_cds_GFH18488.1_12965 (GFH18488)	0.16	1.0	0.52	0.22	0.12	0.29	0.22	0.15	0.13	0.03	0.16	0.45	0.3	0.36	0.26	0.36	0.37	0.12	0.26	0.19	0.15	0.4	0.32	0.28	0.08	0.07
lcl\|BLLF01001466.1_cds_GFH19452.1_13929 (GFH19452)	0.55	0.44	1.0	0.37	0.17	0.12	0.08	0.09	0.13	0.16	0.17	0.19	0.22	0.06	0.18	0.14	0.21	0.22	0.33	0.53	0.12	0.88	0.22	0.45	0.25	0.19
lcl\|BLLF01001488.1_cds_GFH19597.1_14074 (GFH19597)	0.5	0.72	0.5	0.44	0.22	0.23	0.18	0.19	0.22	0.19	0.22	0.27	0.2	0.19	0.27	0.56	0.58	0.47	0.46	0.58	0.43	1.0	0.5	0.73	0.45	0.36
lcl\|BLLF01001563.1_cds_GFH20042.1_14519 (GFH20042)	0.87	1.0	0.71	0.74	0.38	0.4	0.22	0.3	0.28	0.54	0.31	0.4	0.31	0.31	0.29	0.56	0.69	0.54	0.56	0.52	0.54	0.78	0.65	0.5	0.41	0.31
lcl\|BLLF01001644.1_cds_GFH20480.1_14957 (GFH20480)	0.13	1.0	0.8	0.07	0.17	0.46	0.2	0.17	0.1	0.02	0.13	0.62	0.25	0.23	0.12	0.08	0.11	0.12	0.38	0.2	0.13	0.09	0.2	0.15	0.5	0.5
lcl\|BLLF01001646.1_cds_GFH20493.1_14970 (GFH20493)	0.77	0.75	1.0	0.46	0.35	0.32	0.35	0.31	0.36	0.48	0.26	0.4	0.32	0.21	0.41	0.55	0.79	0.24	0.81	0.51	0.45	0.88	0.34	0.57	0.48	0.26
lcl\|BLLF01001775.1_cds_GFH21183.1_15660 (GFH21183)	0.14	0.52	1.0	0.17	0.29	0.32	0.4	0.34	0.42	0.51	0.27	0.39	0.48	0.33	0.51	0.45	0.57	0.34	0.62	0.49	0.31	0.83	0.29	0.46	0.51	0.43
lcl\|BLLF01001775.1_cds_GFH21184.1_15661 (GFH21184)	0.11	0.73	1.0	0.17	0.18	0.12	0.11	0.29	0.13	0.13	0.13	0.12	0.11	0.15	0.14	0.49	0.69	0.24	0.27	0.21	0.23	0.49	0.34	0.55	0.3	0.16
lcl\|BLLF01001775.1_cds_GFH21186.1_15663 (GFH21186)	0.34	1.0	0.9	0.31	0.18	0.14	0.11	0.2	0.13	0.19	0.16	0.19	0.15	0.15	0.17	0.37	0.52	0.28	0.26	0.29	0.31	0.53	0.34	0.34	0.29	0.24
lcl\|BLLF01001846.1_cds_GFH21519.1_15996 (GFH21519)	0.73	0.44	1.0	0.29	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.22	0.38	0.28	0.23	0.3	0.3	0.34	0.39	0.39	0.01	0.01
lcl\|BLLF01001921.1_cds_GFH21867.1_16344 (GFH21867)	0.32	0.4	1.0	0.34	0.24	0.24	0.19	0.16	0.2	0.24	0.18	0.25	0.25	0.15	0.28	0.19	0.3	0.17	0.24	0.48	0.13	0.48	0.17	0.28	0.24	0.15
lcl\|BLLF01001957.1_cds_GFH22048.1_16525 (GFH22048)	0.06	0.73	1.0	0.15	0.4	0.3	0.31	0.36	0.33	0.32	0.3	0.26	0.29	0.25	0.29	0.82	0.78	0.61	0.46	0.71	0.6	0.61	0.56	0.53	0.46	0.25
lcl\|BLLF01002035.1_cds_GFH22416.1_16893 (GFH22416)	0.05	0.68	1.0	0.64	0.27	0.21	0.27	0.48	0.52	0.61	0.32	0.27	0.39	0.44	0.77	0.51	0.46	0.36	0.18	0.2	0.39	0.0	0.4	0.43	0.63	0.5
lcl\|BLLF01002683.1_cds_GFH24974.1_19451 (GFH24974)	0.4	0.55	1.0	0.12	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.64	0.02	0.02	0.05	0.02	0.1	0.51	0.39	0.19	0.02	0.98	0.06	0.56	0.1	0.33	0.15	0.07
lcl\|BLLF01002751.1_cds_GFH25210.1_19687 (GFH25210)	0.04	1.0	0.78	0.33	0.18	0.23	0.16	0.18	0.18	0.21	0.15	0.23	0.21	0.14	0.23	0.11	0.06	0.12	0.1	0.2	0.1	0.4	0.25	0.35	0.24	0.18
lcl\|BLLF01002809.1_cds_GFH25413.1_19890 (GFH25413)	0.15	0.52	1.0	0.12	0.31	0.25	0.22	0.26	0.23	0.27	0.31	0.34	0.29	0.24	0.25	0.19	0.2	0.31	0.29	0.54	0.34	0.34	0.26	0.17	0.13	0.17
lcl\|BLLF01002820.1_cds_GFH25458.1_19935 (GFH25458)	0.12	0.94	1.0	0.43	0.41	0.39	0.45	0.36	0.55	0.38	0.36	0.3	0.32	0.31	0.52	0.33	0.49	0.47	0.29	0.22	0.41	0.31	0.39	0.61	0.31	0.26
lcl\|BLLF01002887.1_cds_GFH25681.1_20158 (GFH25681)	0.2	1.0	0.47	0.49	0.07	0.04	0.09	0.09	0.09	0.16	0.11	0.06	0.07	0.1	0.05	0.09	0.11	0.41	0.14	0.46	0.25	0.5	0.25	0.44	0.13	0.09
lcl\|BLLF01003017.1_cds_GFH26088.1_20565 (GFH26088)	0.15	1.0	0.37	0.45	0.14	0.25	0.25	0.19	0.17	0.22	0.15	0.32	0.24	0.3	0.28	0.58	0.29	0.19	0.63	0.29	0.19	0.51	0.34	0.23	0.25	0.22
lcl\|BLLF01003288.1_cds_GFH26921.1_21398 (GFH26921)	0.16	0.77	1.0	0.45	0.24	0.22	0.15	0.26	0.16	0.11	0.22	0.23	0.17	0.2	0.14	0.2	0.43	0.23	0.17	0.22	0.21	0.26	0.23	0.38	0.22	0.2
lcl\|BLLF01003447.1_cds_GFH27367.1_21844 (GFH27367)	0.33	0.76	0.95	0.14	0.38	0.32	0.29	0.49	0.26	0.15	0.22	0.29	0.3	0.25	0.23	0.5	1.0	0.43	0.53	0.22	0.41	0.76	0.6	0.51	0.28	0.18
lcl\|BLLF01004033.1_cds_GFH28781.1_23258 (GFH28781)	0.45	0.71	1.0	0.32	0.38	0.37	0.28	0.36	0.3	0.4	0.32	0.38	0.33	0.3	0.32	0.45	0.66	0.33	0.33	0.5	0.31	0.61	0.31	0.46	0.22	0.19
lcl\|BLLF01004071.1_cds_GFH28860.1_23337 (GFH28860)	0.29	0.91	0.94	0.24	0.29	0.52	0.3	0.39	0.27	0.04	0.3	0.6	0.44	0.49	0.34	0.17	0.28	0.18	0.39	0.38	0.2	1.0	0.27	0.28	0.14	0.12
lcl\|BLLF01004241.1_cds_GFH29217.1_23694 (GFH29217)	0.06	0.67	1.0	0.23	0.29	0.2	0.13	0.2	0.16	0.13	0.29	0.23	0.21	0.17	0.2	0.13	0.26	0.22	0.5	0.53	0.19	0.16	0.2	0.08	0.14	0.12
lcl\|BLLF01005045.1_cds_GFH30653.1_25130 (GFH30653)	0.01	1.0	0.98	0.51	0.1	0.07	0.09	0.15	0.12	0.09	0.08	0.1	0.12	0.12	0.15	0.25	0.31	0.2	0.09	0.11	0.15	0.11	0.2	0.62	0.4	0.28
lcl\|BLLF01007075.1_cds_GFH32755.1_27232 (GFH32755)	0.3	0.38	0.99	0.09	0.08	0.21	0.19	0.1	0.15	0.18	0.04	0.27	0.16	0.13	0.18	0.29	0.12	0.04	0.3	0.19	0.14	1.0	0.17	0.35	0.32	0.13

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)