Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000022.1_cds_GFH06092.1_569 (GFH06092)	0.23	0.0	0.0	0.18	0.52	0.41	0.36	0.29	0.22	0.54	0.56	0.21	0.11	0.24	0.14	0.19	0.29	0.53	1.0	0.63	0.97	0.12	0.08	0.01	0.52	0.36
lcl\|BLLF01000067.1_cds_GFH06980.1_1457 (GFH06980)	0.37	0.14	0.33	0.08	1.0	0.3	0.17	0.4	0.25	0.26	0.53	0.14	0.16	0.18	0.2	0.06	0.19	0.52	0.5	0.6	0.39	0.43	0.22	0.01	0.59	0.21
lcl\|BLLF01000077.1_cds_GFH07162.1_1639 (GFH07162)	0.87	0.24	0.19	0.45	1.0	0.52	0.53	0.39	0.44	0.94	0.77	0.33	0.35	0.39	0.34	0.39	0.5	0.78	0.39	0.68	0.65	0.55	0.51	0.12	0.67	0.43
lcl\|BLLF01000091.1_cds_GFH07389.1_1866 (GFH07389)	0.63	0.5	0.41	0.67	1.0	0.55	0.58	0.47	0.54	0.66	0.55	0.24	0.28	0.27	0.45	0.08	0.44	0.38	0.28	0.46	0.49	0.3	0.39	0.08	0.86	0.47
lcl\|BLLF01000102.1_cds_GFH07543.1_2020 (GFH07543)	1.0	0.72	0.56	0.06	0.78	0.46	0.28	0.5	0.34	0.78	0.56	0.24	0.29	0.31	0.23	0.09	0.12	0.4	0.53	0.47	0.36	0.34	0.53	0.08	0.74	0.32
lcl\|BLLF01000174.1_cds_GFH08637.1_3114 (GFH08637)	0.75	0.15	0.22	0.28	0.73	0.5	0.5	0.35	0.48	0.46	0.51	0.29	0.36	0.27	0.33	0.35	0.55	0.58	0.61	1.0	0.44	0.36	0.48	0.13	0.61	0.19
lcl\|BLLF01000175.1_cds_GFH08649.1_3126 (GFH08649)	0.74	0.14	1.0	0.3	0.83	0.47	0.49	0.58	0.48	0.25	0.51	0.16	0.34	0.34	0.3	0.67	0.88	0.33	0.32	0.47	0.21	0.48	0.32	0.04	0.93	0.31
lcl\|BLLF01000245.1_cds_GFH09582.1_4059 (GFH09582)	1.0	0.09	0.3	0.2	0.8	0.33	0.25	0.29	0.29	0.12	0.54	0.26	0.23	0.19	0.31	0.18	0.31	0.35	0.71	0.5	0.26	0.2	0.19	0.12	0.73	0.28
lcl\|BLLF01000255.1_cds_GFH09702.1_4179 (GFH09702)	0.44	0.35	0.4	0.19	1.0	0.26	0.22	0.39	0.21	0.19	0.62	0.15	0.15	0.2	0.21	0.54	0.37	0.56	0.65	0.63	0.43	0.28	0.3	0.04	0.49	0.24
lcl\|BLLF01000255.1_cds_GFH09703.1_4180 (GFH09703)	0.73	0.24	0.3	0.26	0.96	0.47	0.38	0.49	0.35	0.39	0.65	0.33	0.27	0.3	0.34	0.44	0.39	0.62	0.81	1.0	0.7	0.56	0.5	0.18	0.59	0.38
lcl\|BLLF01000275.1_cds_GFH09930.1_4407 (GFH09930)	0.81	0.26	0.0	0.6	0.5	0.47	0.43	0.26	0.34	0.17	0.45	0.33	0.3	0.31	0.33	0.34	0.25	0.76	1.0	0.63	0.53	0.51	0.36	0.12	0.32	0.31
lcl\|BLLF01000302.1_cds_GFH10279.1_4756 (GFH10279)	1.0	0.63	0.54	0.39	0.9	0.59	0.46	0.53	0.56	0.37	0.76	0.51	0.53	0.5	0.57	0.4	0.38	0.45	0.66	0.51	0.46	0.84	0.41	0.11	0.67	0.52
lcl\|BLLF01000302.1_cds_GFH10280.1_4757 (GFH10280)	0.96	0.76	0.87	0.31	0.89	0.69	0.49	0.54	0.5	0.46	0.73	0.49	0.47	0.43	0.47	0.4	0.5	0.59	0.68	0.57	0.61	1.0	0.51	0.23	0.69	0.5
lcl\|BLLF01000308.1_cds_GFH10346.1_4823 (GFH10346)	0.87	0.41	0.63	0.39	1.0	0.42	0.33	0.62	0.28	0.23	0.68	0.25	0.26	0.39	0.18	0.22	0.37	0.25	0.25	0.16	0.23	0.07	0.15	0.01	0.46	0.28
lcl\|BLLF01000309.1_cds_GFH10368.1_4845 (GFH10368)	0.45	0.42	1.0	0.24	0.74	0.62	0.36	0.7	0.42	0.09	0.57	0.43	0.38	0.46	0.33	0.59	0.6	0.34	0.47	0.51	0.28	0.62	0.41	0.19	0.57	0.48
lcl\|BLLF01000392.1_cds_GFH11311.1_5788 (GFH11311)	0.41	0.16	0.44	0.5	1.0	0.37	0.41	0.43	0.34	0.43	0.66	0.31	0.26	0.19	0.22	0.24	0.77	0.21	0.35	0.4	0.23	0.22	0.24	0.05	0.96	0.13
lcl\|BLLF01000398.1_cds_GFH11386.1_5863 (GFH11386)	0.69	0.09	0.0	0.44	0.92	0.47	0.44	0.42	0.44	0.13	0.53	0.23	0.32	0.3	0.23	0.23	0.44	1.0	0.96	0.79	0.59	0.51	0.53	0.12	0.56	0.3
lcl\|BLLF01000398.1_cds_GFH11387.1_5864 (GFH11387)	0.91	0.29	0.0	0.36	1.0	0.63	0.52	0.38	0.65	0.34	0.72	0.25	0.25	0.38	0.37	0.16	0.39	0.74	0.99	0.87	0.45	0.91	0.45	0.04	0.65	0.58
lcl\|BLLF01000431.1_cds_GFH11744.1_6221 (GFH11744)	0.87	0.37	0.39	0.93	0.73	0.45	0.55	0.32	0.32	0.42	0.49	0.27	0.24	0.21	0.28	0.3	1.0	0.43	0.12	0.33	0.48	0.19	0.43	0.11	0.81	0.58
lcl\|BLLF01000442.1_cds_GFH11849.1_6326 (GFH11849)	0.55	0.69	0.82	0.33	0.73	0.55	0.42	0.57	0.41	0.24	0.64	0.48	0.39	0.48	0.34	0.69	1.0	0.54	0.35	0.4	0.51	0.51	0.48	0.35	0.85	0.66
lcl\|BLLF01000456.1_cds_GFH11993.1_6470 (GFH11993)	0.65	0.3	0.65	0.38	0.67	0.33	0.4	0.38	0.36	0.26	0.56	0.17	0.26	0.25	0.25	0.25	0.7	0.48	0.24	0.49	0.22	0.36	0.35	0.14	1.0	0.23
lcl\|BLLF01000472.1_cds_GFH12146.1_6623 (GFH12146)	0.93	0.44	0.71	0.16	1.0	0.54	0.33	0.52	0.34	0.3	0.72	0.37	0.26	0.37	0.28	0.19	0.39	0.33	0.75	0.64	0.39	0.46	0.27	0.1	0.57	0.3
lcl\|BLLF01000479.1_cds_GFH12222.1_6699 (GFH12222)	0.69	0.07	0.43	0.16	0.98	0.72	0.47	0.56	0.51	0.94	0.71	0.31	0.33	0.43	0.28	0.19	0.4	0.29	0.23	0.32	0.6	0.48	0.24	0.19	1.0	0.83
lcl\|BLLF01000633.1_cds_GFH13619.1_8096 (GFH13619)	0.65	0.31	0.26	0.12	0.93	0.3	0.2	0.69	0.18	0.31	0.48	0.21	0.19	0.19	0.13	0.12	0.12	0.44	0.17	0.22	0.22	0.14	0.27	0.02	1.0	0.31
lcl\|BLLF01000633.1_cds_GFH13620.1_8097 (GFH13620)	0.88	0.52	0.46	0.23	1.0	0.33	0.23	0.56	0.18	0.64	0.57	0.19	0.18	0.18	0.14	0.11	0.22	0.36	0.25	0.24	0.26	0.11	0.21	0.01	0.8	0.29
lcl\|BLLF01000814.1_cds_GFH15165.1_9642 (GFH15165)	0.48	0.37	0.56	0.17	1.0	0.35	0.25	0.69	0.42	0.07	0.6	0.17	0.24	0.23	0.36	0.22	0.46	0.05	0.22	0.29	0.0	0.14	0.03	0.02	0.51	0.25
lcl\|BLLF01000847.1_cds_GFH15413.1_9890 (GFH15413)	0.38	0.57	0.0	0.95	1.0	0.27	0.35	0.21	0.28	0.15	0.95	0.38	0.27	0.33	0.37	0.0	0.0	0.81	0.24	0.28	0.22	0.0	0.16	0.05	0.9	0.34
lcl\|BLLF01001069.1_cds_GFH16902.1_11379 (GFH16902)	0.86	0.15	0.24	0.35	1.0	0.46	0.35	0.33	0.36	0.28	0.65	0.3	0.27	0.25	0.3	0.12	0.55	0.38	0.35	0.31	0.37	0.18	0.32	0.04	0.79	0.26
lcl\|BLLF01001171.1_cds_GFH17585.1_12062 (GFH17585)	1.0	0.38	0.54	0.34	0.75	0.47	0.46	0.42	0.56	0.39	0.51	0.26	0.28	0.27	0.44	0.37	0.58	0.47	0.61	0.4	0.44	0.48	0.37	0.15	0.66	0.3
lcl\|BLLF01001188.1_cds_GFH17703.1_12180 (GFH17703)	0.53	0.56	0.39	0.26	1.0	0.26	0.24	0.55	0.31	0.41	0.44	0.13	0.1	0.17	0.23	0.56	0.27	0.32	0.2	0.42	0.07	0.25	0.15	0.08	0.95	0.32
lcl\|BLLF01001239.1_cds_GFH18030.1_12507 (GFH18030)	0.93	0.37	0.6	0.34	0.92	0.51	0.26	0.7	0.41	0.73	1.0	0.43	0.37	0.67	0.39	0.21	0.57	0.58	0.42	0.53	0.39	0.16	0.36	0.27	0.99	0.76
lcl\|BLLF01001239.1_cds_GFH18031.1_12508 (GFH18031)	0.67	0.42	0.28	0.23	0.67	0.33	0.19	0.44	0.2	0.31	0.65	0.33	0.28	0.43	0.29	0.22	0.81	0.49	0.28	1.0	0.41	0.2	0.31	0.22	0.86	0.71
lcl\|BLLF01001251.1_cds_GFH18127.1_12604 (GFH18127)	0.4	0.25	0.11	0.25	0.69	0.61	0.42	0.48	0.43	0.69	0.57	0.31	0.33	0.41	0.34	0.34	0.29	0.73	1.0	0.71	0.41	0.48	0.56	0.07	0.65	0.44
lcl\|BLLF01001347.1_cds_GFH18740.1_13217 (GFH18740)	0.56	0.63	0.64	0.69	0.8	0.48	0.35	0.49	0.31	0.2	0.73	0.58	0.41	0.44	0.36	0.69	0.55	0.4	0.38	0.42	0.38	0.38	0.37	0.38	1.0	0.73
lcl\|BLLF01001414.1_cds_GFH19150.1_13627 (GFH19150)	0.76	0.49	0.96	0.51	1.0	0.48	0.32	0.48	0.31	0.46	0.68	0.32	0.21	0.25	0.25	0.24	0.69	0.38	0.6	0.61	0.34	0.73	0.29	0.21	0.77	0.33
lcl\|BLLF01001454.1_cds_GFH19387.1_13864 (GFH19387)	0.5	0.62	0.9	0.43	1.0	0.55	0.48	0.76	0.54	0.53	0.7	0.41	0.46	0.37	0.55	0.83	0.96	0.3	0.21	0.42	0.31	0.49	0.31	0.04	0.96	0.35
lcl\|BLLF01001739.1_cds_GFH20990.1_15467 (GFH20990)	0.35	0.56	0.66	0.15	0.64	0.43	0.33	0.65	0.39	0.16	0.5	0.46	0.42	0.46	0.45	0.67	1.0	0.31	0.2	0.14	0.3	0.23	0.24	0.32	0.76	0.55
lcl\|BLLF01001828.1_cds_GFH21433.1_15910 (GFH21433)	0.61	0.06	0.0	0.24	0.61	0.28	0.18	0.28	0.14	0.16	0.38	0.13	0.07	0.1	0.12	0.05	0.29	0.22	0.4	0.7	0.15	0.09	0.14	0.01	1.0	0.23
lcl\|BLLF01002010.1_cds_GFH22301.1_16778 (GFH22301)	0.24	0.1	0.0	0.82	0.85	0.63	0.45	0.53	0.89	0.53	1.0	0.35	0.32	0.57	0.47	0.25	0.56	0.78	0.29	0.33	0.54	0.31	0.97	0.03	0.95	0.73
lcl\|BLLF01002027.1_cds_GFH22369.1_16846 (GFH22369)	0.84	0.22	0.0	0.0	0.61	0.17	0.13	0.22	0.21	0.22	0.35	0.13	0.05	0.08	0.06	0.0	0.0	0.36	0.73	1.0	0.24	0.32	0.39	0.08	0.72	0.21
lcl\|BLLF01002027.1_cds_GFH22370.1_16847 (GFH22370)	0.8	0.43	0.0	0.26	1.0	0.32	0.26	0.47	0.36	0.72	0.47	0.12	0.15	0.15	0.22	0.27	0.53	0.52	0.52	0.53	0.53	0.25	0.24	0.02	0.79	0.11
lcl\|BLLF01002375.1_cds_GFH23835.1_18312 (GFH23835)	1.0	0.29	0.0	0.21	0.71	0.44	0.44	0.44	0.4	0.79	0.64	0.39	0.37	0.46	0.32	0.21	0.29	0.56	0.94	1.0	0.65	0.32	0.44	0.09	0.78	0.48
lcl\|BLLF01002639.1_cds_GFH24813.1_19290 (GFH24813)	0.87	0.52	0.75	0.3	1.0	0.35	0.26	0.42	0.22	0.34	0.68	0.26	0.18	0.33	0.13	0.11	0.36	0.54	0.64	0.7	0.38	0.27	0.29	0.08	0.68	0.35
lcl\|BLLF01002695.1_cds_GFH25028.1_19505 (GFH25028)	0.29	0.09	0.1	0.15	1.0	0.31	0.27	0.41	0.23	0.33	0.5	0.29	0.22	0.16	0.16	0.15	0.5	0.34	0.27	0.37	0.34	0.29	0.2	0.05	0.84	0.08
lcl\|BLLF01002811.1_cds_GFH25428.1_19905 (GFH25428)	0.82	0.56	0.07	1.0	0.63	0.62	0.56	0.52	0.61	0.31	0.75	0.59	0.63	0.69	0.56	0.56	0.31	0.54	0.43	0.32	0.69	0.34	0.81	0.38	0.65	0.6
lcl\|BLLF01003010.1_cds_GFH26067.1_20544 (GFH26067)	1.0	0.28	0.5	0.32	0.7	0.32	0.16	0.34	0.23	0.12	0.49	0.18	0.18	0.18	0.19	0.17	0.4	0.38	0.35	0.36	0.24	0.29	0.17	0.0	0.44	0.23
lcl\|BLLF01003124.1_cds_GFH26422.1_20899 (GFH26422)	0.75	0.22	0.22	0.2	0.84	0.51	0.43	0.44	0.42	0.5	0.74	0.26	0.28	0.33	0.24	0.23	0.49	0.37	0.53	0.71	0.31	0.18	0.29	0.03	1.0	0.51
lcl\|BLLF01003364.1_cds_GFH27142.1_21619 (GFH27142)	0.88	0.19	0.61	0.45	1.0	0.44	0.25	0.35	0.35	0.1	0.71	0.28	0.23	0.23	0.33	0.49	0.47	0.51	0.78	0.95	0.38	0.57	0.26	0.1	0.81	0.43
lcl\|BLLF01004733.1_cds_GFH30152.1_24629 (GFH30152)	0.68	0.64	0.7	0.28	1.0	0.67	0.49	0.58	0.58	0.6	0.83	0.62	0.49	0.49	0.55	0.41	0.43	0.42	0.62	0.58	0.5	0.7	0.4	0.38	0.83	0.64
lcl\|BLLF01005425.1_cds_GFH31185.1_25662 (GFH31185)	1.0	0.46	0.0	0.63	0.9	0.51	0.43	0.42	0.32	0.78	0.78	0.45	0.43	0.4	0.36	0.11	0.04	0.71	0.67	0.42	0.52	0.67	0.4	0.06	0.91	0.63
lcl\|BLLF01006162.1_cds_GFH32020.1_26497 (GFH32020)	0.56	0.24	0.32	0.34	0.79	0.78	0.51	0.48	0.76	0.94	0.67	0.31	0.27	0.33	0.19	0.16	0.28	1.0	0.31	0.58	0.53	0.39	0.58	0.22	0.69	0.77
lcl\|BLLF01007937.1_cds_GFH33184.1_27661 (GFH33184)	0.47	0.49	1.0	0.21	0.7	0.52	0.43	0.75	0.5	0.46	0.58	0.45	0.44	0.5	0.46	0.33	0.6	0.39	0.18	0.27	0.53	0.35	0.33	0.2	0.75	0.44
lcl\|BLLF01008413.1_cds_GFH33364.1_27841 (GFH33364)	0.82	0.25	0.4	0.26	1.0	0.56	0.45	0.69	0.65	0.79	0.73	0.39	0.41	0.38	0.49	0.24	0.18	0.72	0.4	0.63	0.39	0.36	0.43	0.19	0.8	0.57
lcl\|BLLF01009235.1_cds_GFH33660.1_28137 (GFH33660)	0.47	0.18	0.02	0.19	1.0	0.42	0.23	0.25	0.27	0.29	0.45	0.23	0.24	0.17	0.19	0.29	0.6	0.27	0.07	0.27	0.19	0.14	0.13	0.06	0.66	0.23
lcl\|BLLF01009693.1_cds_GFH33801.1_28278 (GFH33801)	0.57	0.42	0.0	1.0	0.7	0.49	0.44	0.35	0.49	0.49	0.76	0.39	0.3	0.58	0.39	0.05	0.14	0.52	0.59	0.27	0.4	0.17	0.58	0.25	0.82	0.46

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)