Heatmap: Cluster_74 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
0.02 0.0 0.0 0.02 0.12 0.09 0.08 0.1 0.13 0.13 0.1 0.06 0.07 0.09 0.04 0.34 1.0 0.15 0.0 0.02 0.08 0.0 0.12 0.03 0.1 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.4 0.24 0.23 0.27 0.41 0.37 0.32 0.31 0.39 0.31 0.43 0.39 0.38 0.33 0.38 0.72 1.0 0.44 0.22 0.26 0.4 0.13 0.43 0.33 0.34 0.4
0.13 0.06 0.0 0.0 0.08 0.1 0.05 0.12 0.06 0.11 0.1 0.11 0.11 0.14 0.08 0.21 1.0 0.25 0.3 0.38 0.28 0.22 0.17 0.11 0.2 0.17
0.04 0.0 0.0 0.06 0.04 0.44 0.54 0.19 0.48 0.06 0.13 0.17 0.61 0.24 0.35 0.34 1.0 0.2 0.0 0.06 0.27 0.0 0.26 0.0 0.08 0.05
0.0 0.0 0.0 0.29 0.02 0.0 0.09 0.0 0.03 0.0 0.03 0.02 0.03 0.02 0.05 0.0 1.0 0.19 0.26 0.2 0.24 0.0 0.0 0.1 0.06 0.05
0.17 0.03 0.0 0.14 0.14 0.17 0.32 0.09 0.28 0.25 0.21 0.19 0.18 0.16 0.26 0.15 1.0 0.11 0.06 0.1 0.14 0.05 0.09 0.08 0.1 0.11
0.11 0.01 0.0 0.16 0.13 0.14 0.32 0.12 0.28 0.24 0.2 0.18 0.2 0.17 0.3 0.28 1.0 0.15 0.09 0.06 0.12 0.04 0.09 0.18 0.19 0.15
0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.04 0.12 0.01 0.01 0.03 0.01 0.04 0.49 1.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.07 0.02 0.0 0.03 0.12
0.11 0.07 0.0 0.0 0.05 0.01 0.03 0.09 0.02 0.06 0.03 0.05 0.06 0.07 0.02 0.24 1.0 0.14 0.44 0.46 0.16 0.05 0.07 0.15 0.15 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.45 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.36 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.02 0.06 0.06
0.0 0.29 0.0 0.0 0.11 0.1 0.11 0.07 0.06 0.08 0.17 0.19 0.11 0.07 0.12 0.13 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.09
0.21 0.3 0.16 0.31 0.24 0.23 0.3 0.1 0.27 0.16 0.22 0.19 0.22 0.16 0.28 0.66 1.0 0.14 0.28 0.27 0.09 0.38 0.14 0.12 0.18 0.19
0.2 0.29 0.29 0.26 0.35 0.36 0.43 0.15 0.42 0.0 0.34 0.26 0.24 0.24 0.4 0.76 1.0 0.11 0.4 0.38 0.1 0.32 0.09 0.24 0.27 0.23
0.09 0.35 0.39 0.21 0.33 0.37 0.46 0.19 0.46 0.28 0.39 0.29 0.34 0.25 0.37 0.78 1.0 0.3 0.22 0.16 0.25 0.25 0.25 0.19 0.32 0.36
0.16 0.13 0.24 0.06 0.17 0.26 0.38 0.18 0.35 0.26 0.29 0.26 0.33 0.31 0.34 0.39 1.0 0.3 0.13 0.1 0.52 0.15 0.35 0.08 0.15 0.2
0.13 0.05 0.03 0.05 0.17 0.2 0.32 0.14 0.25 0.16 0.26 0.22 0.23 0.24 0.26 0.55 1.0 0.25 0.19 0.12 0.32 0.11 0.33 0.14 0.06 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 1.0 0.01 0.02 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.07 0.07 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.07 0.14 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.19 0.08 0.05 0.23 0.09 0.15 0.09 0.26 0.19 0.15 0.61 1.0 0.1 0.0 0.16 0.13 0.4 0.38 0.0 0.13 0.07
0.02 0.09 0.0 0.0 0.04 0.22 0.09 0.01 0.09 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.28 1.0 0.05 0.0 0.02 0.03 0.04 0.0 0.03 0.02 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.39 0.25 0.29 0.36 0.24 0.27 0.37 0.25 0.27 0.27 0.16 0.76 1.0 0.2 0.15 0.22 0.26 0.12 0.33 0.29 0.15 0.09
0.14 0.1 0.07 0.09 0.14 0.1 0.11 0.08 0.14 0.07 0.12 0.09 0.11 0.07 0.14 0.2 1.0 0.11 0.11 0.12 0.09 0.08 0.05 0.11 0.13 0.1
0.2 0.1 0.0 0.15 0.23 0.16 0.45 0.21 0.44 0.42 0.39 0.25 0.34 0.28 0.22 0.9 1.0 0.7 0.0 0.5 0.65 0.93 0.93 0.13 0.23 0.08
0.11 0.26 0.0 0.1 0.23 0.11 0.06 0.1 0.11 0.06 0.1 0.08 0.09 0.08 0.17 0.37 1.0 0.36 0.03 0.34 0.25 0.11 0.11 0.16 0.26 0.25
0.31 0.22 0.29 0.39 0.36 0.42 0.4 0.22 0.36 0.36 0.34 0.29 0.31 0.25 0.35 0.67 1.0 0.4 0.15 0.29 0.38 0.2 0.43 0.05 0.3 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.05 0.01 0.02 0.0 0.07 0.12 0.04 0.0 0.03 0.45 1.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.19 0.0 0.0 0.08 0.22
0.28 0.06 0.0 0.11 0.31 0.26 0.3 0.15 0.28 0.31 0.3 0.19 0.22 0.17 0.23 0.66 1.0 0.27 0.18 0.23 0.26 0.02 0.24 0.15 0.15 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.14 0.0 0.0 0.2 0.01 0.0 0.0 0.09 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.21 1.0 0.0 0.23 0.38 0.62 0.48 0.0 0.11 0.07 0.04
0.04 0.05 0.03 0.0 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.24 0.04 0.03 0.05 0.04 0.03 0.45 1.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.05 0.05
0.17 0.16 0.0 0.11 0.16 0.2 0.33 0.17 0.26 0.35 0.24 0.2 0.36 0.25 0.3 0.59 1.0 0.34 0.23 0.36 0.39 0.49 0.33 0.07 0.11 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.02 0.01 0.06 0.03 0.0 0.12 0.01 0.03 0.03 0.03 0.13 1.0 0.08 0.12 0.14 0.0 0.0 0.0 0.01 0.21 0.2
0.2 0.02 0.08 0.07 0.28 0.24 0.45 0.5 0.43 0.41 0.2 0.2 0.53 0.19 0.42 0.45 1.0 0.42 0.53 0.24 0.48 0.14 0.53 0.28 0.06 0.14
0.18 0.0 0.0 0.07 0.03 0.04 0.02 0.05 0.03 0.07 0.03 0.02 0.03 0.04 0.03 0.33 1.0 0.24 0.22 0.34 0.29 0.16 0.11 0.15 0.03 0.04
0.04 0.01 0.07 0.01 0.03 0.04 0.05 0.04 0.04 0.1 0.05 0.06 0.07 0.05 0.06 0.21 1.0 0.11 0.22 0.52 0.16 0.07 0.1 0.1 0.07 0.09
0.04 0.02 0.0 0.01 0.04 0.04 0.06 0.04 0.04 0.1 0.05 0.05 0.07 0.06 0.07 0.22 1.0 0.08 0.14 0.44 0.14 0.07 0.09 0.14 0.09 0.12
0.01 0.04 0.0 0.06 0.19 0.08 0.14 0.15 0.16 0.09 0.15 0.11 0.18 0.11 0.21 0.49 1.0 0.16 0.13 0.14 0.13 0.09 0.14 0.11 0.07 0.17
0.04 0.04 0.0 0.01 0.18 0.16 0.17 0.17 0.3 0.3 0.16 0.14 0.33 0.22 0.26 0.49 1.0 0.12 0.0 0.02 0.34 0.12 0.15 0.1 0.1 0.09
0.11 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.15 0.05 0.01 0.01 0.01 0.0 0.21 1.0 0.24 0.0 0.34 0.0 0.0 0.32 0.04 0.04 0.09
0.02 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.02 0.01 0.0 0.03 0.01 0.27 1.0 0.03 0.05 0.1 0.08 0.05 0.18 0.02 0.03 0.03
0.07 0.02 0.0 0.17 0.2 0.15 0.17 0.03 0.16 0.11 0.23 0.11 0.17 0.12 0.11 0.38 1.0 0.05 0.04 0.06 0.1 0.08 0.12 0.11 0.18 0.16
0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.12 0.13 0.05 0.08 0.38 0.08 0.09 0.08 0.11 0.08 0.65 1.0 0.2 0.15 0.0 0.0 0.15 0.19 0.02 0.16 0.07
0.27 0.01 0.0 0.12 0.13 0.08 0.09 0.06 0.11 0.27 0.09 0.07 0.07 0.05 0.13 0.3 1.0 0.18 0.14 0.38 0.23 0.24 0.16 0.1 0.08 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.09 0.19 0.0 0.15 0.05 0.16 0.1 0.14 0.9 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 0.0 0.23 0.17 0.34 0.21 0.11 0.14 0.29 0.24 0.23 0.33 0.42 0.17 0.73 1.0 0.45 0.0 0.45 0.41 0.32 0.68 0.04 0.24 0.19
0.03 0.0 0.0 0.0 0.1 0.13 0.07 0.11 0.08 0.16 0.14 0.13 0.18 0.13 0.13 0.48 1.0 0.04 0.02 0.02 0.04 0.03 0.04 0.01 0.12 0.11
0.18 0.03 0.11 0.02 0.38 0.2 0.19 0.3 0.24 0.06 0.32 0.22 0.25 0.22 0.23 0.82 1.0 0.35 0.12 0.23 0.39 0.08 0.4 0.3 0.18 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0
0.1 0.05 0.11 0.03 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.13 0.02 0.02 0.03 0.01 0.02 0.3 1.0 0.16 0.07 0.06 0.17 0.04 0.13 0.09 0.03 0.03
0.18 0.0 0.0 0.44 0.0 0.02 0.06 0.02 0.21 0.0 0.04 0.04 0.04 0.0 0.14 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.06 0.06 0.09
0.02 0.01 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.44 1.0 0.15 0.23 0.04 0.14 0.15 0.2 0.1 0.1 0.06
0.17 0.29 0.0 0.37 0.29 0.2 0.14 0.09 0.14 0.13 0.23 0.21 0.06 0.07 0.15 0.68 1.0 0.29 0.07 0.9 0.4 0.46 0.38 0.32 0.17 0.11
0.04 0.25 0.01 0.01 0.09 0.07 0.06 0.11 0.07 0.02 0.09 0.08 0.08 0.07 0.09 0.22 1.0 0.12 0.03 0.04 0.13 0.06 0.05 0.1 0.21 0.13
0.27 0.12 0.0 0.2 0.27 0.22 0.32 0.27 0.31 0.4 0.14 0.1 0.37 0.16 0.3 0.47 1.0 0.44 0.08 0.12 0.38 0.26 0.36 0.15 0.07 0.06
0.07 0.03 0.0 0.0 0.11 0.09 0.07 0.14 0.06 0.01 0.08 0.08 0.08 0.09 0.07 0.23 1.0 0.14 0.07 0.06 0.15 0.06 0.12 0.1 0.07 0.05
0.18 0.06 0.09 0.26 0.49 0.57 0.69 0.56 0.64 0.31 0.41 0.47 0.8 0.33 0.56 0.62 1.0 0.43 0.33 0.37 0.48 0.18 0.47 0.26 0.2 0.31
0.14 0.1 0.02 0.16 0.27 0.27 0.29 0.2 0.29 0.23 0.27 0.26 0.25 0.22 0.29 0.57 1.0 0.29 0.13 0.11 0.26 0.16 0.28 0.15 0.21 0.21
0.39 0.03 0.05 0.26 0.58 0.43 0.29 0.5 0.27 0.17 0.47 0.4 0.42 0.37 0.33 0.97 1.0 0.62 0.38 0.21 0.62 0.31 0.49 0.38 0.22 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.13 0.01 0.06 0.33 0.29 0.35 0.27 0.31 0.46 0.33 0.25 0.31 0.29 0.38 0.53 1.0 0.38 0.17 0.22 0.34 0.3 0.24 0.24 0.37 0.25
0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.05 0.01 0.0 0.0 0.08 0.14 0.09 0.11 0.12 0.47 0.09 0.11 0.17 0.11 0.12 0.48 1.0 0.04 0.04 0.02 0.03 0.02 0.06 0.01 0.14 0.1
0.01 0.0 0.0 0.09 0.02 0.0 0.06 0.0 0.06 0.0 0.01 0.03 0.05 0.0 0.11 0.2 1.0 0.08 0.03 0.01 0.14 0.05 0.02 0.02 0.16 0.11
0.01 0.0 0.02 0.04 0.01 0.01 0.05 0.01 0.04 0.03 0.02 0.02 0.04 0.01 0.11 0.33 1.0 0.03 0.06 0.01 0.07 0.09 0.03 0.01 0.09 0.07
0.3 0.18 0.05 0.2 0.58 0.49 0.72 0.56 0.66 0.16 0.55 0.42 0.42 0.45 0.68 0.58 1.0 0.71 0.1 0.4 0.58 0.3 0.75 0.31 0.21 0.36
0.11 0.11 0.02 0.04 0.06 0.04 0.07 0.04 0.07 0.12 0.06 0.06 0.08 0.07 0.08 0.24 1.0 0.08 0.13 0.33 0.16 0.05 0.08 0.08 0.09 0.13
0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.2 1.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.22 0.0 0.0 0.16 0.24 0.23 0.31 0.24 0.36 0.27 0.21 0.23 0.32 0.19 0.31 0.49 1.0 0.17 0.18 0.2 0.25 0.24 0.17 0.17 0.16 0.2
0.0 0.0 0.0 0.09 0.21 0.09 0.07 0.02 0.07 0.11 0.16 0.11 0.05 0.07 0.07 0.71 1.0 0.2 0.31 0.3 0.0 0.19 0.17 0.11 0.2 0.29
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.05 0.0 0.45 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.19 0.0 0.01 0.26 0.14 0.07 0.16 0.09 0.22 0.1 0.14 0.12 0.16 0.16 0.24 0.04 1.0 0.03 0.04 0.05 0.01 0.01 0.02 0.15 0.11 0.07
0.05 0.0 0.0 0.0 0.13 0.16 0.13 0.12 0.13 0.09 0.13 0.1 0.16 0.15 0.14 0.63 1.0 0.2 0.2 0.19 0.09 0.0 0.24 0.02 0.17 0.11
0.05 0.0 0.0 0.03 0.04 0.03 0.02 0.03 0.03 0.05 0.02 0.03 0.03 0.03 0.04 0.34 1.0 0.2 0.19 0.58 0.2 0.06 0.18 0.19 0.05 0.05
0.16 0.04 0.0 0.13 0.43 0.41 0.39 0.09 0.53 0.17 0.38 0.34 0.19 0.12 0.38 0.48 1.0 0.8 0.0 0.16 0.17 0.29 0.37 0.09 0.03 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.26 0.11 0.05 0.21 0.0 0.2 0.1 0.26 0.09 0.09 0.43 1.0 0.14 0.0 0.12 0.19 0.0 0.42 0.05 0.05 0.08
0.04 0.0 0.0 0.11 0.02 0.04 0.11 0.05 0.06 0.1 0.07 0.02 0.02 0.05 0.02 0.18 1.0 0.0 0.0 0.23 0.26 0.4 0.13 0.17 0.07 0.03
0.0 0.17 0.0 0.0 0.09 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.02 0.06 0.03 0.52 1.0 0.21 0.28 0.35 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.05 0.05 0.04 0.35 0.18 0.04 0.09 0.0 0.01 0.12 1.0 0.1 0.0 0.16 0.0 0.0 0.28 0.01 0.18 0.13
0.04 0.01 0.07 0.08 0.01 0.07 0.24 0.01 0.11 0.01 0.04 0.08 0.14 0.03 0.13 0.22 1.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.13 0.2
0.18 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.25 1.0 0.09 0.11 0.24 0.02 0.0 0.02 0.14 0.0 0.0
0.1 0.0 0.06 0.0 0.07 0.1 0.12 0.15 0.23 0.22 0.05 0.11 0.2 0.08 0.2 0.41 1.0 0.34 0.37 0.1 0.63 0.58 0.16 0.21 0.04 0.07
0.13 0.1 0.07 0.0 0.06 0.02 0.08 0.05 0.03 0.5 0.08 0.04 0.04 0.04 0.06 0.48 1.0 0.37 0.22 0.25 0.0 0.35 0.15 0.01 0.04 0.07
0.08 0.0 0.0 0.0 0.15 0.13 0.2 0.18 0.21 0.02 0.17 0.11 0.25 0.18 0.22 0.65 1.0 0.07 0.05 0.05 0.07 0.12 0.14 0.03 0.09 0.08
0.08 0.01 0.0 0.16 0.01 0.01 0.1 0.0 0.12 0.03 0.01 0.02 0.04 0.0 0.2 0.3 1.0 0.03 0.18 0.01 0.03 0.15 0.02 0.0 0.06 0.03
0.01 0.2 0.07 0.08 0.09 0.15 0.17 0.09 0.11 0.13 0.11 0.14 0.1 0.14 0.12 0.53 1.0 0.22 0.1 0.14 0.23 0.11 0.21 0.02 0.07 0.18
0.0 0.04 0.0 0.03 0.23 0.08 0.07 0.19 0.03 0.03 0.14 0.12 0.04 0.12 0.01 0.44 1.0 0.09 0.05 0.02 0.11 0.05 0.1 0.17 0.02 0.02
0.12 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.02 0.02 0.01 0.05 0.05 0.06 0.0 0.05 0.24 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.17 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)