Heatmap: Cluster_20 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
- - - -1.27 -1.11 -0.35 0.2 -1.25 -0.5 - 0.11 -0.45 -0.49 -0.57 -0.25 1.56 1.65 1.72 - 0.48 1.45 - 0.71 0.75 -0.14 -1.71
0.46 -2.14 - -0.0 -0.85 -0.22 0.04 -1.17 -0.11 -0.84 0.22 -0.86 0.37 -0.57 -0.38 1.24 1.12 0.58 -1.34 -0.93 1.13 -1.26 1.01 0.64 0.05 -1.28
-2.26 -1.68 -2.05 0.54 -0.53 -0.18 0.22 -1.33 -0.39 0.29 -0.01 -0.43 0.08 -0.28 -1.1 1.21 1.36 0.71 -0.96 -0.3 1.01 -0.98 0.56 -0.32 -0.11 0.03
-1.48 -4.06 - -1.12 -0.66 -0.25 -0.33 -1.5 -0.86 -0.31 -0.51 -0.76 -0.87 -0.93 -1.6 1.29 2.14 0.93 -1.29 -0.41 1.11 0.38 0.51 0.1 0.16 0.53
-1.78 - - -0.07 -0.02 0.19 0.06 -0.94 -0.47 -0.54 0.44 0.03 0.0 -0.03 -0.75 1.01 1.13 0.65 -1.0 -0.47 1.15 -0.38 0.72 0.2 -0.28 0.16
-0.05 -2.52 - -2.31 -0.62 0.42 -1.24 -0.94 -1.74 -0.21 -0.26 -0.16 -0.29 -0.0 -3.06 1.11 1.06 1.09 -3.47 -1.03 1.51 -1.07 1.58 -0.0 0.2 0.57
-1.3 -2.95 - 0.25 -0.16 0.23 0.29 -0.77 -0.28 -1.02 0.06 -0.08 0.05 -0.13 -0.91 0.74 0.68 1.09 -0.81 -1.11 1.44 -1.21 1.38 0.3 -0.86 -0.62
-1.4 -4.49 - -2.09 -0.96 -0.21 0.04 -1.08 -0.28 -0.36 -0.51 -0.04 -0.08 -0.24 -0.41 1.01 0.91 1.22 0.37 -1.08 1.29 0.27 1.36 0.73 -1.51 -1.23
-1.19 -5.1 - 0.98 -0.32 -0.49 -0.89 -0.75 -0.72 -0.36 -0.07 -0.53 -0.78 -0.59 -1.96 1.09 1.13 1.25 0.13 -0.45 1.01 -0.44 0.98 0.51 -0.25 -0.2
-0.44 -1.97 - -1.87 -0.41 0.42 0.25 -0.61 -0.42 -0.5 0.13 -0.12 -0.17 0.03 -0.58 1.15 0.65 0.93 -0.93 -0.0 0.86 -0.14 0.64 -0.23 -0.06 0.55
-3.84 - - -0.7 -0.7 0.29 -0.09 -0.45 -0.25 -2.4 -0.79 -0.35 -0.11 -0.63 -1.46 0.68 2.13 1.55 -0.67 -1.49 -0.21 -0.6 1.54 1.45 -1.57 -3.35
-1.7 -2.02 - -1.47 0.03 -0.88 -1.07 -0.57 -0.55 1.07 -0.51 -1.31 -1.37 -1.18 -0.85 0.82 1.34 1.1 -0.46 -0.38 1.51 -0.88 1.03 -0.42 1.15 -0.4
-0.2 -2.48 - -1.3 -0.21 -0.08 0.38 -0.76 -0.4 -1.19 -0.1 -0.03 0.08 -0.37 -0.2 1.28 1.07 1.12 -0.81 -0.92 0.74 -0.28 0.69 0.84 -0.24 -1.07
0.36 -3.59 -1.76 -0.97 0.01 0.17 -0.23 -1.07 -0.29 -1.28 0.03 0.07 0.05 -0.49 -0.51 0.91 1.44 0.34 -0.22 -0.66 0.5 0.25 0.61 0.47 -0.26 -0.12
-2.38 -2.43 -4.75 -3.22 -0.0 -0.08 0.19 0.13 -0.19 0.59 0.1 -0.09 0.24 0.5 -0.75 1.22 1.0 0.31 -0.8 -1.75 0.49 -0.22 0.54 0.51 -0.31 0.42
-1.9 -2.07 - -4.47 -0.48 0.11 -0.16 -0.51 -0.54 0.44 -0.14 0.06 -0.17 0.4 -0.74 1.46 1.1 0.65 -1.22 -1.34 0.79 -0.44 1.02 0.31 -0.43 0.6
-1.83 -2.46 - -2.22 0.06 0.06 -0.09 -0.41 -0.3 -0.46 0.47 -0.18 -0.02 -0.4 -0.67 1.15 0.86 0.96 -1.06 -0.34 1.32 -0.05 0.95 0.06 -0.16 -0.34
0.39 -2.8 - -1.89 -0.17 0.29 -0.08 -0.59 -0.34 -0.83 0.1 -0.02 -0.16 -0.23 -0.6 1.02 1.16 0.79 -0.38 -0.4 0.46 -0.22 0.9 0.74 -0.31 -0.65
-0.77 -1.16 -1.22 -0.71 -0.23 -0.17 -0.18 -0.98 -0.5 -1.1 -0.12 -0.4 -0.77 -0.6 -0.81 1.23 0.73 0.88 -0.54 -0.07 1.05 -0.86 0.71 0.43 0.54 0.67
-0.08 -4.13 - 0.57 -0.15 -0.16 0.11 -0.75 -0.09 0.39 -0.05 -0.49 -0.31 -0.51 -0.27 0.81 1.35 0.3 -1.21 0.37 0.92 0.19 0.72 -0.18 -0.91 -1.24
-2.51 - - -0.23 -0.79 -0.45 -0.23 -2.25 -0.12 -0.6 -0.72 -0.86 -0.36 -1.3 -0.3 0.37 1.58 1.49 0.6 0.2 1.56 0.51 0.74 0.35 -1.63 -1.12
-1.63 -1.58 - - -1.55 0.02 0.04 -1.67 -0.94 - -0.2 -0.5 -0.44 -1.61 -0.36 1.31 1.46 1.12 -0.46 -0.7 1.22 -1.38 1.4 0.74 0.64 0.44
-0.18 -0.89 -3.0 -0.27 -0.29 0.46 -0.21 -1.11 -0.86 0.04 0.01 -0.01 -0.14 -0.06 -1.21 0.29 1.35 0.84 -0.6 -0.36 1.15 -0.2 0.61 -0.17 -0.02 -0.46
-1.46 0.0 -0.46 -2.51 -0.07 -0.14 -0.25 0.58 -0.01 -1.85 -0.11 -0.1 -0.14 -0.01 -0.01 -1.16 -0.54 1.0 -0.02 -0.09 0.71 0.78 0.83 0.92 -0.44 -0.53
-2.02 -1.92 -6.29 -1.35 -0.59 0.13 0.22 -0.76 -0.88 -1.56 -0.13 0.05 -0.33 -0.21 -1.09 1.26 0.86 1.33 -0.83 -1.39 1.34 -0.49 1.08 0.61 0.3 -0.3
-0.47 -1.21 -3.17 0.38 -0.21 -0.16 0.02 -1.39 -0.18 0.01 -0.48 -0.32 -0.33 -0.59 -0.29 0.76 1.45 1.28 -0.26 -0.97 0.55 -0.19 0.51 0.51 -0.9 -0.58
-2.26 -1.35 -3.0 -0.87 -0.9 -0.43 -0.66 -1.45 -1.75 -2.74 0.03 -0.39 -0.44 -0.07 -1.9 1.33 1.85 0.83 -0.22 0.22 0.92 0.72 1.09 -0.22 -0.05 -0.25
-0.77 -1.12 -2.01 0.8 0.0 -0.01 -0.3 -0.8 -0.28 -0.38 0.02 -0.2 -0.49 -0.49 -0.39 0.8 1.04 0.8 -0.61 -0.46 0.75 0.21 0.88 0.06 -0.7 -0.64
-0.31 -1.77 -1.39 -0.99 -0.01 -0.24 0.15 -0.36 0.14 -0.38 -0.07 -0.53 -0.45 -0.31 0.07 0.98 1.02 1.06 -1.38 -0.81 0.75 -0.07 0.81 0.51 -0.49 -0.69
-2.42 -1.11 - -4.37 -1.04 0.54 -0.2 -1.47 -1.05 0.33 0.19 -0.41 -0.54 -0.21 -3.69 0.97 1.25 1.34 -1.53 -0.54 1.0 0.72 0.81 0.63 -0.33 0.28
-4.27 -0.76 - - -0.47 -1.8 -3.5 -2.04 -3.46 - 0.04 -1.33 -2.55 -2.65 -2.73 2.33 0.73 0.25 -0.21 0.56 2.77 - -0.39 -0.64 0.59 1.05
-0.68 -1.2 - -0.61 -0.1 -0.23 0.19 -0.57 0.05 0.76 0.09 -1.27 -0.5 -0.46 -0.24 0.78 1.02 1.06 -0.48 -1.1 0.47 0.17 0.72 0.86 -0.59 -0.89
-0.53 - - 0.83 -0.53 -2.02 -0.19 0.89 0.2 0.6 -1.16 -1.86 -0.13 0.58 -0.0 1.26 0.97 0.46 -2.76 -0.77 0.44 -0.68 0.23 1.54 -2.46 -1.54
-0.85 -1.82 -1.06 -0.2 -0.38 -0.24 -0.09 -1.02 -0.32 -0.23 -0.01 -0.54 -0.43 -0.49 -0.57 0.73 0.72 1.23 -0.24 -1.06 1.26 0.25 0.93 0.41 -0.51 -0.34
-1.26 -5.08 - -0.75 -0.2 -0.13 -0.03 -0.97 -0.28 -1.71 0.16 -0.32 -0.34 -0.22 -1.4 0.46 1.46 1.52 -0.06 -0.48 0.78 -0.14 0.74 0.82 -0.18 0.01
0.03 - -1.42 -0.04 -1.87 0.33 -1.08 -1.67 -1.93 -2.18 -0.69 -0.36 -0.62 -0.45 -3.62 0.81 1.25 1.38 -0.87 -1.28 1.85 -0.06 0.86 -0.09 0.37 0.74
-3.35 -3.75 - -3.08 -0.16 -0.05 -0.76 -1.38 -1.17 -4.3 -0.12 -0.37 -0.95 -0.82 -1.68 1.44 0.42 1.45 -0.25 -0.3 1.65 1.03 0.95 0.32 0.75 -0.32
-1.28 -2.72 -6.55 -2.59 0.17 0.3 0.3 -0.92 -0.23 -0.13 0.44 -0.22 0.18 -0.3 -0.8 0.92 1.27 0.65 -0.73 -0.27 0.9 0.31 0.37 0.14 -0.22 -0.05
-0.21 -1.36 -0.91 -0.39 0.12 0.13 -0.26 -1.22 -0.27 -1.01 -0.06 -0.33 -0.26 -0.37 -0.53 0.88 1.27 0.38 -0.28 -0.17 0.35 0.44 0.82 0.7 -0.79 -0.44
-1.3 -3.76 - -1.48 -0.26 0.71 -0.12 -1.16 -0.99 -2.69 0.23 0.23 -0.22 -0.34 -1.28 1.0 1.17 0.71 -0.07 -0.27 1.04 -0.52 0.9 0.45 0.44 0.3
-1.38 -1.93 -2.21 -2.43 -0.22 -0.05 -0.09 -0.89 -0.48 -0.51 -0.17 -0.46 -0.15 -0.65 -0.8 1.07 0.9 0.65 -0.27 0.11 1.07 -0.11 0.85 0.27 0.62 0.56
-1.29 -5.65 - -1.45 -0.71 0.45 0.22 -0.95 -0.38 -4.87 -0.26 0.02 0.1 0.05 -1.41 0.8 1.08 1.58 -1.56 -0.64 1.23 -0.16 0.55 0.2 0.23 0.63
0.08 -0.77 - -0.04 -0.06 0.19 -0.33 -1.2 -1.21 -0.77 0.17 -0.27 -0.16 -0.26 -1.95 1.05 1.1 0.65 -0.4 -0.68 1.15 -1.19 0.94 -0.19 0.11 0.48
-1.12 -2.56 - -0.28 -0.1 -0.16 -0.38 -1.38 -0.65 -0.07 -0.05 -0.24 -0.61 -0.8 -1.21 0.59 0.5 1.23 -0.72 -0.42 1.7 0.29 1.15 0.61 -0.17 -0.38
-0.29 -0.61 -0.32 -2.82 -0.9 0.02 -0.35 0.43 0.08 0.04 -0.6 -0.17 -0.26 0.05 -0.69 0.91 0.43 0.99 0.07 -0.4 0.88 0.13 0.87 0.39 -1.71 -1.35
- - - -0.71 -0.29 -0.79 0.04 -0.8 0.35 0.14 -2.07 -1.18 -0.35 -1.65 0.31 0.64 1.79 1.54 -0.46 0.05 1.88 - -0.05 0.7 -1.35 -0.68
-1.16 -2.63 - -1.27 -0.93 -0.28 -0.07 -1.07 -0.24 0.25 -0.23 0.04 0.07 -0.15 -0.41 1.34 1.0 0.6 -0.82 -0.91 0.86 -0.02 1.04 0.51 0.12 0.09
-2.08 -2.52 - -3.86 -0.36 0.34 -0.02 -0.83 -0.32 -0.44 0.02 -0.03 -0.18 -0.45 -0.75 1.3 1.13 0.96 -1.07 -0.5 1.03 -0.04 0.69 0.13 0.46 0.38
-0.71 -3.41 - -0.09 -0.49 -0.58 -0.48 -1.45 -0.86 -1.41 -0.3 -0.17 -0.51 -0.56 -0.35 0.71 1.06 1.29 -1.4 -0.15 1.34 0.48 1.23 0.41 0.56 -0.81
-1.66 -2.39 - -2.72 -0.27 0.15 0.07 -1.19 -0.39 -1.98 -0.8 -0.14 -1.34 -0.83 0.48 0.98 0.6 1.72 -0.62 -1.37 1.97 -0.88 1.16 0.83 -1.59 -1.11
-0.56 -1.4 -2.09 -1.53 -0.1 0.03 -0.04 -1.01 -0.24 0.12 -0.02 -0.51 -0.25 -0.38 -0.81 0.94 1.04 0.67 0.02 0.07 0.57 0.2 0.78 0.38 -0.48 0.19
-0.43 -1.73 -2.04 0.27 -0.14 -0.22 -0.1 -1.01 -0.31 0.27 0.1 -0.22 -0.29 -0.46 -0.39 0.15 0.91 1.09 -0.59 -0.61 0.67 -0.08 0.86 0.64 -0.32 -0.15
-0.98 -1.58 - -0.46 -0.16 -0.08 -0.17 -0.83 -0.12 0.06 -0.05 -0.49 -0.22 -0.58 -0.6 0.42 0.92 1.1 -0.5 -0.17 1.21 -0.01 1.19 0.52 -0.73 -0.5
-0.25 -0.61 -0.66 -0.6 0.3 -0.06 -0.07 0.24 -0.08 -1.75 -0.12 -0.27 -0.42 -0.16 -0.3 0.7 0.81 0.9 -0.02 -0.75 0.66 -0.16 0.48 0.52 -0.53 -0.66
-0.18 -3.17 -2.01 0.25 0.01 0.0 0.03 -1.13 -0.19 -0.68 -0.02 -0.36 -0.71 -0.42 -0.9 0.23 0.94 1.04 -0.8 -0.86 0.8 -1.24 1.03 0.72 0.38 0.56
-2.08 -0.72 -0.89 -3.26 -0.16 -0.29 -0.18 -0.12 -0.26 0.25 -0.35 -0.42 -0.55 -0.25 -0.63 1.39 0.72 0.88 -0.76 -0.37 0.71 0.14 1.0 -0.27 -0.09 0.35
-1.21 -0.82 -2.38 0.34 0.2 0.04 0.12 -0.67 -0.1 -0.47 0.27 -0.13 -0.04 -0.33 -0.27 0.83 0.8 0.83 -0.11 -0.8 0.77 -1.03 0.78 0.19 -0.42 -0.6
-1.9 -2.42 -1.12 -5.35 -0.16 -0.02 -0.56 -0.65 -0.67 0.09 -0.15 -0.21 -0.5 -0.17 -2.0 1.47 1.15 1.19 -1.51 -0.16 1.23 -0.62 0.65 -0.24 0.07 0.65
-0.12 -0.75 -0.72 -0.84 -0.3 0.13 0.09 -0.74 -0.22 -0.0 -0.1 -0.31 0.08 -0.19 -0.58 0.71 0.79 0.95 0.02 -1.32 1.08 -0.81 0.91 0.24 -0.88 -0.85
-0.07 -8.83 - -0.48 -0.77 -1.4 -0.44 0.44 -0.41 -3.89 -0.58 -0.56 0.13 0.32 0.33 1.54 1.46 0.11 0.9 0.07 0.13 -0.12 0.53 1.08 -2.66 -3.17
-0.48 -0.45 -3.6 -0.53 0.16 0.03 -0.4 -0.61 -0.4 -0.09 0.0 -0.47 -0.45 -0.75 -1.0 1.12 0.6 0.76 -0.13 0.08 0.95 -0.05 0.34 0.28 -0.07 0.37
-2.76 - - -2.46 0.21 -0.53 -0.31 -0.45 -0.83 -0.68 -0.47 -0.38 -0.99 -0.89 -0.78 1.23 0.69 1.06 -0.61 -0.17 1.92 -0.27 0.62 0.16 0.88 0.36
0.2 -1.88 - -0.44 -0.79 0.01 -0.91 -1.03 -0.5 -2.42 -0.0 -0.24 -0.51 -0.17 -1.05 1.16 0.82 1.18 -0.7 0.19 1.27 -0.03 -0.12 -0.28 0.67 0.75
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-0.92 -2.39 - -0.15 -0.67 0.11 0.12 -1.15 -0.7 -1.15 -0.53 -0.16 -0.49 -0.27 -1.39 0.94 1.77 1.43 -2.74 -1.39 0.95 -0.2 0.95 1.11 -0.61 -1.1
-2.28 -3.76 - -0.4 -1.14 0.4 -1.14 -0.84 -1.96 -0.28 0.18 -0.7 -0.47 0.21 -2.2 0.93 1.45 1.36 0.27 0.1 0.52 -1.39 1.15 0.15 0.22 0.54
-1.1 0.27 -1.45 -0.2 0.42 -0.05 -0.15 -0.69 -0.11 -0.48 0.42 -0.0 -0.83 -0.29 -0.75 0.54 1.16 0.76 -1.1 -0.23 1.0 -0.29 0.59 0.23 -1.04 -0.63
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-1.16 -1.8 - -0.56 -1.62 0.09 -0.96 -1.62 -1.75 -0.87 -0.93 -0.38 -0.23 -0.65 -2.05 1.29 1.61 1.21 0.97 -0.09 1.24 0.16 1.0 -0.2 0.15 -1.71
-1.46 -2.08 - -1.13 -0.26 -0.12 -0.83 -1.05 -0.5 -2.03 -0.17 -0.92 -0.62 -0.56 -1.02 0.21 0.46 1.39 -0.88 -2.12 1.8 1.1 1.61 0.37 -0.26 0.29
-0.8 -2.45 -2.0 -0.8 -0.33 0.0 0.37 -1.29 -0.03 -2.63 -0.37 -0.33 -0.72 -0.55 -0.48 1.19 1.47 1.16 -0.03 -0.35 0.78 -0.24 0.94 0.75 -0.94 -1.08
-1.73 -2.6 - -4.75 -0.46 -0.19 -0.08 0.68 -0.01 -0.29 -0.61 -0.81 -0.53 0.06 -0.85 1.47 0.46 1.24 -2.18 -3.32 1.46 0.25 1.06 1.15 -0.99 -1.1
-0.72 -1.63 - -4.39 -0.12 0.13 0.12 0.37 0.02 -0.34 -0.45 -0.51 -0.59 -0.15 -0.99 0.25 -0.26 1.44 -1.33 -1.96 1.65 -0.71 1.39 1.27 -0.74 -0.88
-0.68 -0.84 -4.34 -2.05 -1.08 0.25 -0.1 -0.84 -1.2 0.38 -0.45 -0.19 -0.62 -0.45 -0.7 1.35 1.45 1.37 -0.41 -0.45 1.37 - 1.28 -0.03 -1.91 -1.31
-2.78 -0.86 - -2.93 -1.02 -0.09 0.02 -1.22 0.23 -0.76 -0.68 -0.15 0.25 -0.06 -0.07 1.26 0.89 1.18 -1.75 -0.25 1.1 0.57 0.87 0.54 -0.32 -0.92
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-0.53 -1.35 -1.33 -1.54 0.08 0.06 -0.1 -0.19 -0.07 -1.08 0.18 0.03 0.02 0.05 -0.1 1.04 0.88 0.71 -1.24 -0.77 0.83 -0.13 0.69 0.57 -0.36 -0.74
0.16 - -4.06 -0.95 -0.06 -0.02 0.2 -0.89 0.29 -1.25 0.7 0.04 -0.6 0.09 -0.2 1.47 1.55 0.62 - -1.93 0.77 - 0.1 0.69 -0.06 -0.1
-0.65 - - 0.76 -0.98 -0.64 -0.42 0.63 -0.08 -1.19 -0.73 -0.19 0.22 1.04 0.18 0.89 -0.3 0.54 -1.84 -2.18 0.52 -0.63 0.91 1.83 -1.78 -0.83
-1.63 -3.74 - -1.0 -0.35 0.16 -0.54 -0.91 -1.47 -4.65 -0.05 -0.15 -0.25 -0.36 -1.41 0.31 0.88 1.52 0.08 0.01 1.6 0.55 1.18 0.14 0.06 -0.32
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-0.91 -1.32 -1.22 -3.21 -0.33 -0.18 -0.26 -0.17 -0.29 -0.56 0.13 -0.28 -0.03 0.25 -0.61 1.16 0.64 0.84 -1.24 -0.65 0.82 -0.18 0.93 0.95 0.05 -0.48
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0.3 - - -2.1 -1.56 0.61 -1.48 -0.92 -2.01 -1.57 -0.13 -1.2 -0.79 -0.19 -2.75 1.6 1.61 1.44 -0.85 0.33 1.12 -1.77 0.36 -0.58 0.36 0.96
-1.34 -2.45 - -0.79 -0.58 0.32 -1.07 -1.19 -1.81 -0.57 -0.35 -0.4 -0.53 -0.11 -2.28 0.81 1.23 1.08 -0.08 -0.04 0.73 0.62 1.07 1.03 -0.18 0.4
-2.57 - - - -0.53 0.31 -0.61 -1.07 -2.44 -1.43 0.1 -0.02 -0.37 -0.39 -1.6 1.81 0.86 1.22 -1.29 - 1.18 0.38 1.21 0.21 0.18 1.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.