Heatmap: Cluster_271 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000002.1_cds_GFH05566.1_43 (GFH05566)	0.63	0.0	0.0	1.0	0.0	0.02	0.15	0.0	0.34	0.34	0.0	0.0	0.04	0.02	0.07	0.16	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.79	0.37	0.11	0.12	0.06
lcl\|BLLF01000017.1_cds_GFH05994.1_471 (GFH05994)	0.63	0.0	0.0	0.5	0.0	0.01	0.19	0.03	0.43	1.0	0.01	0.02	0.01	0.01	0.44	0.22	0.36	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.06	0.01	0.11	0.07
lcl\|BLLF01000022.1_cds_GFH06097.1_574 (GFH06097)	0.79	0.06	0.0	0.03	0.14	0.11	0.17	0.08	0.17	1.0	0.2	0.15	0.18	0.14	0.19	0.39	0.21	0.16	0.16	0.11	0.3	0.15	0.21	0.07	0.27	0.2
lcl\|BLLF01000059.1_cds_GFH06845.1_1322 (GFH06845)	0.91	0.0	0.0	0.58	0.03	0.0	0.12	0.0	0.24	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.3	0.04	0.03	0.03	0.1	0.03	0.0	0.05	0.0	0.0	0.04	0.08
lcl\|BLLF01000084.1_cds_GFH07266.1_1743 (GFH07266)	0.79	0.16	0.0	0.0	0.03	0.08	0.11	0.03	0.16	1.0	0.12	0.05	0.07	0.04	0.17	0.33	0.11	0.33	0.0	0.0	0.0	0.49	0.13	0.11	0.4	0.62
lcl\|BLLF01000117.1_cds_GFH07807.1_2284 (GFH07807)	0.47	0.04	0.0	0.11	0.17	0.19	0.18	0.21	0.38	1.0	0.21	0.15	0.36	0.2	0.41	0.12	0.26	0.23	0.04	0.11	0.2	0.06	0.18	0.08	0.4	0.64
lcl\|BLLF01000126.1_cds_GFH07938.1_2415 (GFH07938)	1.0	0.34	0.21	0.11	0.29	0.25	0.4	0.19	0.34	0.57	0.29	0.18	0.22	0.15	0.29	0.5	0.6	0.62	0.4	0.33	0.64	0.49	0.5	0.25	0.54	0.39
lcl\|BLLF01000171.1_cds_GFH08603.1_3080 (GFH08603)	0.67	0.0	0.0	0.25	0.31	0.21	0.41	0.34	0.55	1.0	0.24	0.21	0.43	0.19	0.4	0.11	0.48	0.34	0.25	0.22	0.12	0.4	0.51	0.16	0.82	0.71
lcl\|BLLF01000201.1_cds_GFH09002.1_3479 (GFH09002)	1.0	0.0	0.0	0.04	0.2	0.2	0.24	0.11	0.27	0.67	0.26	0.27	0.39	0.1	0.47	0.09	0.21	0.04	0.08	0.17	0.2	0.28	0.04	0.07	0.2	0.22
lcl\|BLLF01000228.1_cds_GFH09358.1_3835 (GFH09358)	0.73	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.72	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.34
lcl\|BLLF01000229.1_cds_GFH09372.1_3849 (GFH09372)	0.96	0.16	0.01	0.41	0.36	0.4	0.33	0.36	0.43	1.0	0.35	0.27	0.41	0.32	0.48	0.16	0.2	0.48	0.54	0.59	0.43	0.99	0.44	0.3	0.31	0.31
lcl\|BLLF01000287.1_cds_GFH10108.1_4585 (GFH10108)	0.38	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.24	0.22	0.57	0.3	1.0	0.23	0.09	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000321.1_cds_GFH10504.1_4981 (GFH10504)	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.12	0.11	0.37	0.13	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.0	1.0	0.38	0.03	0.0	0.22
lcl\|BLLF01000323.1_cds_GFH10531.1_5008 (GFH10531)	1.0	0.04	0.0	0.0	0.06	0.13	0.35	0.03	0.34	0.6	0.08	0.17	0.16	0.04	0.28	0.45	0.28	0.17	0.0	0.09	0.19	0.28	0.09	0.0	0.16	0.18
lcl\|BLLF01000354.1_cds_GFH10861.1_5338 (GFH10861)	1.0	0.0	0.0	0.25	0.16	0.05	0.0	0.0	0.39	0.8	0.08	0.04	0.1	0.06	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.26	0.0	0.03	0.13	0.06
lcl\|BLLF01000448.1_cds_GFH11908.1_6385 (GFH11908)	0.74	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.18	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.71	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000540.1_cds_GFH12790.1_7267 (GFH12790)	0.74	0.0	0.0	0.04	0.23	0.21	0.22	0.09	0.24	1.0	0.21	0.13	0.19	0.18	0.13	0.26	0.1	0.9	0.08	0.09	0.55	0.16	0.35	0.07	0.2	0.42
lcl\|BLLF01000555.1_cds_GFH12919.1_7396 (GFH12919)	0.96	0.05	0.1	1.0	0.14	0.28	0.9	0.06	0.79	0.87	0.19	0.17	0.29	0.12	0.59	0.3	0.44	0.19	0.11	0.06	0.18	0.04	0.12	0.05	0.43	0.44
lcl\|BLLF01000555.1_cds_GFH12921.1_7398 (GFH12921)	0.97	0.2	0.27	0.09	0.3	0.27	0.3	0.17	0.24	0.69	0.37	0.29	0.29	0.24	0.3	1.0	0.66	0.39	0.08	0.09	0.38	0.1	0.24	0.05	0.26	0.21
lcl\|BLLF01000566.1_cds_GFH13018.1_7495 (GFH13018)	0.97	0.0	0.0	0.13	0.07	0.09	0.39	0.09	0.44	1.0	0.12	0.03	0.06	0.13	0.59	0.6	0.29	0.36	0.1	0.12	0.28	0.13	0.34	0.12	0.32	0.17
lcl\|BLLF01000589.1_cds_GFH13240.1_7717 (GFH13240)	0.6	0.24	0.0	1.0	0.46	0.31	0.16	0.25	0.38	0.68	0.31	0.29	0.31	0.16	0.2	0.87	0.62	0.17	0.0	0.66	0.21	0.81	0.26	0.51	0.38	0.69
lcl\|BLLF01000661.1_cds_GFH13873.1_8350 (GFH13873)	1.0	0.12	0.0	0.22	0.43	0.35	0.44	0.2	0.42	0.74	0.26	0.26	0.22	0.17	0.31	0.47	0.65	0.49	0.25	0.21	0.45	0.26	0.73	0.25	0.42	0.21
lcl\|BLLF01000690.1_cds_GFH14131.1_8608 (GFH14131)	1.0	0.07	0.11	0.42	0.08	0.05	0.09	0.04	0.16	0.67	0.1	0.06	0.12	0.05	0.2	0.04	0.01	0.06	0.09	0.12	0.06	0.05	0.03	0.04	0.06	0.03
lcl\|BLLF01000784.1_cds_GFH14926.1_9403 (GFH14926)	0.87	0.0	0.0	0.46	0.1	0.08	0.41	0.22	0.3	1.0	0.09	0.05	0.02	0.06	0.24	0.23	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.06
lcl\|BLLF01000870.1_cds_GFH15579.1_10056 (GFH15579)	1.0	0.26	0.31	0.33	0.33	0.36	0.56	0.24	0.5	0.79	0.26	0.37	0.37	0.22	0.52	0.5	0.67	0.55	0.2	0.34	0.48	0.45	0.51	0.41	0.59	0.48
lcl\|BLLF01000915.1_cds_GFH15882.1_10359 (GFH15882)	0.32	0.0	0.18	0.0	0.15	0.15	0.22	0.23	0.29	1.0	0.24	0.13	0.16	0.2	0.35	0.3	0.39	0.13	0.22	0.21	0.11	0.0	0.23	0.17	0.29	0.23
lcl\|BLLF01001012.1_cds_GFH16537.1_11014 (GFH16537)	1.0	0.32	0.49	0.26	0.3	0.34	0.44	0.24	0.49	0.66	0.29	0.3	0.35	0.25	0.48	0.68	0.71	0.57	0.35	0.57	0.49	0.78	0.56	0.28	0.56	0.43
lcl\|BLLF01001012.1_cds_GFH16540.1_11017 (GFH16540)	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.2	0.07	0.45	0.14	0.0	0.07	0.26	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.69	0.0	0.0	0.09	0.12	0.23
lcl\|BLLF01001062.1_cds_GFH16865.1_11342 (GFH16865)	0.33	0.1	0.16	0.13	0.3	0.23	0.24	0.26	0.43	1.0	0.24	0.22	0.41	0.19	0.53	0.48	0.53	0.22	0.11	0.13	0.36	0.24	0.44	0.27	0.38	0.31
lcl\|BLLF01001367.1_cds_GFH18848.1_13325 (GFH18848)	0.46	0.1	0.0	0.14	0.19	0.34	0.25	0.09	0.09	0.32	0.23	0.23	0.31	0.0	0.14	1.0	0.64	0.0	0.51	0.29	0.0	0.87	0.0	0.04	0.23	0.16
lcl\|BLLF01001390.1_cds_GFH18994.1_13471 (GFH18994)	1.0	0.29	0.17	0.22	0.41	0.48	0.51	0.16	0.63	0.62	0.38	0.36	0.38	0.26	0.5	0.26	0.22	0.35	0.35	0.29	0.48	0.21	0.34	0.4	0.66	0.55
lcl\|BLLF01001498.1_cds_GFH19658.1_14135 (GFH19658)	0.61	0.0	0.0	0.03	0.19	0.15	0.46	0.17	0.27	0.14	0.42	0.24	0.44	0.23	0.24	1.0	0.41	0.07	0.72	0.37	0.1	0.92	0.07	0.46	0.02	0.07
lcl\|BLLF01001518.1_cds_GFH19773.1_14250 (GFH19773)	0.5	0.0	0.0	0.1	0.07	0.09	0.11	0.02	0.17	1.0	0.08	0.05	0.07	0.07	0.23	0.25	0.46	0.0	0.12	0.0	0.0	0.21	0.0	0.01	0.15	0.11
lcl\|BLLF01001551.1_cds_GFH19978.1_14455 (GFH19978)	0.66	0.03	0.26	0.32	0.15	0.13	0.14	0.07	0.24	1.0	0.15	0.08	0.08	0.09	0.17	0.5	0.63	0.2	0.1	0.13	0.19	0.07	0.25	0.05	0.34	0.26
lcl\|BLLF01001610.1_cds_GFH20294.1_14771 (GFH20294)	1.0	0.0	0.0	0.03	0.1	0.16	0.28	0.1	0.38	0.53	0.08	0.07	0.12	0.12	0.25	0.41	0.15	0.0	0.06	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.35	0.17
lcl\|BLLF01001766.1_cds_GFH21127.1_15604 (GFH21127)	0.65	0.09	0.0	0.18	0.24	0.27	0.53	0.1	0.53	1.0	0.16	0.19	0.23	0.1	0.24	0.26	0.12	0.13	0.3	0.14	0.17	0.17	0.16	0.2	0.29	0.28
lcl\|BLLF01001821.1_cds_GFH21398.1_15875 (GFH21398)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.17	0.09	0.53	0.22	0.28	0.27	0.09	0.05	0.45	0.16	0.0	0.29	0.31	0.46	0.0	0.85	0.49	0.31	0.13	0.43	0.29
lcl\|BLLF01001822.1_cds_GFH21405.1_15882 (GFH21405)	0.92	0.22	0.0	0.0	0.0	0.1	0.03	0.03	0.0	1.0	0.04	0.0	0.0	0.03	0.03	0.0	0.0	0.25	0.0	0.42	0.0	0.39	0.74	0.09	0.06	0.17
lcl\|BLLF01001823.1_cds_GFH21409.1_15886 (GFH21409)	0.85	0.34	0.0	0.05	0.25	0.18	0.21	0.26	0.2	1.0	0.14	0.1	0.15	0.19	0.18	0.21	0.05	0.19	0.04	0.13	0.18	0.25	0.23	0.16	0.29	0.52
lcl\|BLLF01001895.1_cds_GFH21732.1_16209 (GFH21732)	0.74	0.0	0.0	0.07	0.0	0.02	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	1.0	0.0	0.03	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001897.1_cds_GFH21746.1_16223 (GFH21746)	0.74	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.39	0.02	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.18	0.02	0.2	0.03
lcl\|BLLF01002045.1_cds_GFH22461.1_16938 (GFH22461)	0.24	0.06	0.37	0.07	0.34	0.25	0.32	0.37	0.32	1.0	0.36	0.3	0.3	0.31	0.41	0.45	0.48	0.23	0.25	0.23	0.25	0.13	0.24	0.32	0.48	0.42
lcl\|BLLF01002146.1_cds_GFH22889.1_17366 (GFH22889)	0.52	0.0	0.0	0.04	0.04	0.05	0.08	0.05	0.17	1.0	0.17	0.08	0.18	0.08	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.09	0.02	0.21	0.32
lcl\|BLLF01002204.1_cds_GFH23152.1_17629 (GFH23152)	0.34	0.16	0.15	0.29	0.17	0.2	0.26	0.14	0.34	1.0	0.13	0.2	0.34	0.16	0.47	0.17	0.32	0.38	0.27	0.36	0.4	0.24	0.36	0.28	0.27	0.31
lcl\|BLLF01002282.1_cds_GFH23475.1_17952 (GFH23475)	1.0	0.14	0.1	0.01	0.17	0.06	0.23	0.1	0.13	0.49	0.38	0.25	0.24	0.23	0.11	0.61	0.46	0.19	0.15	0.12	0.17	0.14	0.12	0.04	0.09	0.2
lcl\|BLLF01002282.1_cds_GFH23476.1_17953 (GFH23476)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.08	0.21	0.08	0.1	0.51	0.31	0.19	0.24	0.26	0.11	0.7	0.61	0.49	0.16	0.14	0.54	0.1	0.32	0.03	0.1	0.16
lcl\|BLLF01002282.1_cds_GFH23478.1_17955 (GFH23478)	1.0	0.01	0.09	0.02	0.28	0.1	0.29	0.13	0.18	0.41	0.44	0.26	0.32	0.33	0.15	0.54	0.48	0.26	0.08	0.05	0.34	0.08	0.2	0.03	0.13	0.19
lcl\|BLLF01002470.1_cds_GFH24192.1_18669 (GFH24192)	1.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.46	0.81	0.02	0.02	0.0	0.0	0.39	0.14	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01
lcl\|BLLF01003143.1_cds_GFH26482.1_20959 (GFH26482)	0.98	0.01	0.0	0.34	0.23	0.24	0.17	0.1	0.2	1.0	0.33	0.23	0.2	0.1	0.18	0.85	0.33	0.36	0.0	0.18	0.33	0.43	0.0	0.03	0.21	0.29
lcl\|BLLF01003347.1_cds_GFH27097.1_21574 (GFH27097)	0.81	0.04	0.0	0.08	0.26	0.12	0.26	0.13	0.3	1.0	0.33	0.16	0.29	0.15	0.28	0.02	0.03	0.02	0.09	0.03	0.07	0.12	0.01	0.01	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003654.1_cds_GFH27872.1_22349 (GFH27872)	0.9	0.0	0.0	1.0	0.13	0.13	0.61	0.24	0.67	0.41	0.12	0.07	0.24	0.1	0.59	0.0	0.06	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.17
lcl\|BLLF01004292.1_cds_GFH29327.1_23804 (GFH29327)	1.0	0.2	0.0	0.11	0.23	0.02	0.41	0.14	0.39	0.74	0.37	0.12	0.18	0.14	0.24	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.05	0.46	0.37
lcl\|BLLF01004900.1_cds_GFH30433.1_24910 (GFH30433)	0.64	0.0	0.0	0.38	0.03	0.01	0.12	0.06	0.24	1.0	0.08	0.04	0.02	0.03	0.17	0.16	0.17	0.15	0.11	0.02	0.17	0.44	0.15	0.18	0.23	0.19
lcl\|BLLF01005073.1_cds_GFH30694.1_25171 (GFH30694)	1.0	0.48	0.26	0.48	0.5	0.42	0.48	0.35	0.68	0.9	0.44	0.36	0.46	0.39	0.56	0.42	0.51	0.51	0.59	0.54	0.49	0.54	0.39	0.38	0.46	0.4
lcl\|BLLF01005525.1_cds_GFH31312.1_25789 (GFH31312)	0.54	0.33	0.0	0.41	0.35	0.27	0.18	0.16	0.2	0.14	0.37	0.22	0.14	0.12	0.2	1.0	0.4	0.07	0.24	0.4	0.09	0.65	0.12	0.3	0.29	0.17
lcl\|BLLF01006108.1_cds_GFH31954.1_26431 (GFH31954)	0.42	0.01	0.01	0.09	0.06	0.09	0.2	0.09	0.4	1.0	0.07	0.09	0.11	0.07	0.28	0.15	0.17	0.1	0.04	0.04	0.09	0.05	0.1	0.06	0.28	0.22
lcl\|BLLF01006803.1_cds_GFH32561.1_27038 (GFH32561)	0.41	0.0	0.0	1.0	0.03	0.0	0.02	0.03	0.01	0.07	0.02	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.05	0.02	0.01	0.02	0.88	0.0	0.0	0.01	0.01
lcl\|BLLF01007055.1_cds_GFH32741.1_27218 (GFH32741)	0.96	0.0	0.0	0.84	0.0	0.24	0.54	0.0	1.0	0.78	0.04	0.04	0.17	0.0	0.5	0.73	0.54	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.2	0.2
lcl\|BLLF01007146.1_cds_GFH32795.1_27272 (GFH32795)	0.53	0.0	0.0	0.05	0.0	0.12	0.14	0.02	0.18	1.0	0.15	0.05	0.13	0.14	0.05	0.16	0.12	0.74	0.0	0.0	0.34	0.0	0.37	0.04	0.03	0.11
lcl\|BLLF01008751.1_cds_GFH33507.1_27984 (GFH33507)	0.98	0.0	0.07	0.06	0.08	0.12	0.27	0.03	0.25	1.0	0.1	0.08	0.14	0.06	0.34	0.19	0.13	0.1	0.3	0.13	0.17	0.23	0.13	0.08	0.1	0.04
lcl\|BLLF01008926.1_cds_GFH33564.1_28041 (GFH33564)	0.71	0.0	0.0	0.11	0.05	0.03	0.09	0.06	0.15	1.0	0.05	0.02	0.05	0.04	0.18	0.19	0.18	0.17	0.41	0.36	0.14	0.57	0.12	0.02	0.32	0.19
lcl\|BLLF01009264.1_cds_GFH33666.1_28143 (GFH33666)	0.42	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.28	0.0	0.04	0.0	0.04	0.09	0.09	0.04	0.13	0.0	0.0	0.0	0.47	0.27	0.0	1.0	0.0	0.05	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)