Heatmap: Cluster_89 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000010.1_cds_GFH05834.1_311 (GFH05834)	0.08	0.25	0.24	0.34	0.55	0.42	0.39	0.43	0.32	0.3	0.54	0.43	0.51	0.42	0.29	1.0	0.62	0.7	0.2	0.2	0.74	0.47	0.74	0.25	0.16	0.2
lcl\|BLLF01000020.1_cds_GFH06050.1_527 (GFH06050)	0.56	0.23	0.0	0.02	0.33	0.34	0.3	0.29	0.27	1.0	0.38	0.32	0.29	0.26	0.29	0.57	0.43	0.27	0.31	0.44	0.29	0.73	0.37	0.42	0.58	0.18
lcl\|BLLF01000034.1_cds_GFH06333.1_810 (GFH06333)	0.57	0.21	0.07	0.01	0.44	0.32	0.37	0.18	0.36	0.41	0.28	0.38	0.41	0.2	0.3	0.88	0.45	0.13	1.0	0.36	0.34	0.9	0.31	0.3	0.48	0.2
lcl\|BLLF01000043.1_cds_GFH06520.1_997 (GFH06520)	0.5	0.34	0.0	0.04	0.7	0.38	0.31	0.56	0.28	0.24	0.45	0.35	0.29	0.41	0.24	0.9	1.0	0.63	0.38	0.4	0.56	0.21	0.58	0.4	0.18	0.17
lcl\|BLLF01000048.1_cds_GFH06644.1_1121 (GFH06644)	0.09	0.0	0.0	0.08	0.27	0.25	0.18	0.21	0.09	0.18	0.4	0.24	0.36	0.52	0.09	1.0	0.43	0.85	0.0	0.0	0.9	0.41	0.52	0.12	0.03	0.0
lcl\|BLLF01000065.1_cds_GFH06952.1_1429 (GFH06952)	0.09	0.09	0.0	0.22	0.77	0.5	0.6	0.61	0.45	0.91	0.66	0.43	0.44	0.48	0.35	0.94	1.0	0.89	0.43	0.37	0.94	0.37	0.96	0.4	0.38	0.31
lcl\|BLLF01000075.1_cds_GFH07111.1_1588 (GFH07111)	0.78	0.48	0.36	0.47	0.72	0.65	0.58	0.76	0.56	0.43	0.6	0.64	0.56	0.52	0.54	0.77	0.84	0.79	0.94	1.0	0.72	0.56	0.72	0.52	0.49	0.49
lcl\|BLLF01000096.1_cds_GFH07464.1_1941 (GFH07464)	0.34	0.26	0.0	0.01	0.44	0.42	0.32	0.39	0.31	0.25	0.43	0.37	0.29	0.28	0.17	0.78	1.0	0.47	0.25	0.1	0.61	0.37	0.49	0.16	0.19	0.32
lcl\|BLLF01000112.1_cds_GFH07735.1_2212 (GFH07735)	0.71	0.07	0.0	0.0	0.9	0.62	0.7	0.68	0.84	0.69	0.82	0.52	0.56	0.7	0.84	0.41	0.73	0.62	1.0	0.37	0.68	0.13	0.25	0.37	0.34	0.28
lcl\|BLLF01000136.1_cds_GFH08081.1_2558 (GFH08081)	0.46	0.3	0.41	0.26	0.95	0.49	0.37	0.77	0.46	0.51	0.83	0.56	0.41	0.51	0.57	1.0	0.91	0.26	0.85	0.44	0.31	0.26	0.32	0.22	0.78	0.43
lcl\|BLLF01000166.1_cds_GFH08526.1_3003 (GFH08526)	0.63	0.54	0.05	0.07	0.63	0.61	0.53	0.58	0.56	0.8	0.74	0.61	0.68	0.6	0.52	0.89	0.7	0.6	0.89	1.0	0.69	0.95	0.67	0.73	0.71	0.64
lcl\|BLLF01000190.1_cds_GFH08868.1_3345 (GFH08868)	0.71	0.5	0.01	0.06	0.71	0.41	0.34	0.69	0.37	0.62	0.47	0.43	0.43	0.35	0.32	0.55	0.47	0.32	0.53	1.0	0.36	0.85	0.35	0.26	0.19	0.16
lcl\|BLLF01000247.1_cds_GFH09608.1_4085 (GFH09608)	0.36	0.04	0.0	0.42	0.74	0.6	0.47	0.64	0.52	0.71	0.67	0.56	0.49	0.47	0.42	1.0	0.8	0.36	0.68	0.54	0.36	0.25	0.36	0.1	0.3	0.29
lcl\|BLLF01000381.1_cds_GFH11180.1_5657 (GFH11180)	0.0	0.24	0.0	0.03	0.53	0.58	0.27	0.31	0.29	0.39	0.43	0.23	0.32	0.41	0.2	1.0	0.45	0.64	0.21	0.18	0.69	0.45	0.7	0.24	0.03	0.0
lcl\|BLLF01000404.1_cds_GFH11441.1_5918 (GFH11441)	0.46	0.5	0.1	0.22	0.88	0.54	0.37	0.61	0.41	0.73	0.76	0.4	0.44	0.53	0.35	1.0	0.85	0.59	0.29	0.56	0.75	0.36	0.45	0.11	0.31	0.41
lcl\|BLLF01000498.1_cds_GFH12387.1_6864 (GFH12387)	0.33	0.07	0.0	0.0	0.67	0.38	0.38	0.61	0.32	0.74	0.45	0.43	0.47	0.4	0.31	0.94	1.0	0.45	0.4	0.28	0.48	0.19	0.48	0.2	0.19	0.14
lcl\|BLLF01000498.1_cds_GFH12389.1_6866 (GFH12389)	0.44	0.29	0.0	0.03	0.81	0.49	0.57	0.73	0.48	0.87	0.65	0.54	0.54	0.51	0.39	0.72	0.7	0.8	0.59	0.53	1.0	0.7	0.83	0.24	0.24	0.17
lcl\|BLLF01000511.1_cds_GFH12504.1_6981 (GFH12504)	0.14	0.14	0.0	0.76	0.42	0.29	0.22	0.28	0.18	0.82	0.46	0.32	0.29	0.27	0.14	0.85	0.46	0.78	0.16	0.19	1.0	0.43	0.69	0.21	0.08	0.1
lcl\|BLLF01000511.1_cds_GFH12506.1_6983 (GFH12506)	0.18	0.34	0.16	0.26	0.76	0.47	0.28	0.41	0.23	0.88	0.62	0.53	0.36	0.36	0.18	0.81	0.55	0.67	0.19	0.18	1.0	0.48	0.7	0.31	0.11	0.17
lcl\|BLLF01000556.1_cds_GFH12941.1_7418 (GFH12941)	0.37	0.04	0.0	0.03	0.28	0.36	0.26	0.44	0.23	0.33	0.35	0.3	0.45	0.44	0.24	0.38	0.24	0.58	0.06	0.38	1.0	0.67	0.54	0.06	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000605.1_cds_GFH13375.1_7852 (GFH13375)	0.78	0.12	0.0	0.02	0.92	0.55	0.6	0.86	0.57	0.92	0.7	0.63	0.69	0.62	0.52	0.8	0.76	0.76	0.81	0.66	1.0	0.65	0.86	0.62	0.54	0.29
lcl\|BLLF01000636.1_cds_GFH13645.1_8122 (GFH13645)	0.91	0.22	0.0	0.35	0.5	0.67	0.59	0.72	0.71	0.96	0.51	0.63	0.82	0.65	0.53	0.87	0.55	0.52	0.23	0.28	0.65	1.0	0.64	0.23	0.46	0.57
lcl\|BLLF01000736.1_cds_GFH14517.1_8994 (GFH14517)	0.39	0.0	0.0	0.0	0.26	0.23	0.15	0.11	0.09	0.45	0.32	0.16	0.16	0.24	0.11	0.21	0.33	0.49	0.0	0.14	1.0	0.52	0.16	0.07	0.11	0.08
lcl\|BLLF01000932.1_cds_GFH16002.1_10479 (GFH16002)	0.88	0.2	0.12	0.13	0.84	0.48	0.38	0.67	0.33	0.92	0.82	0.53	0.46	0.46	0.33	0.42	0.42	0.41	0.34	0.73	0.46	1.0	0.33	0.13	0.1	0.08
lcl\|BLLF01001069.1_cds_GFH16910.1_11387 (GFH16910)	0.07	0.0	0.0	0.79	1.0	0.37	0.61	0.35	0.4	0.15	0.66	0.46	0.63	0.18	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.46	0.0	0.0	0.03	0.15	0.12
lcl\|BLLF01001120.1_cds_GFH17263.1_11740 (GFH17263)	0.07	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.13	0.39	0.03	0.1	0.22	0.15	0.09	0.14	0.07	0.01	0.01	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.01
lcl\|BLLF01001167.1_cds_GFH17554.1_12031 (GFH17554)	0.0	0.12	0.0	0.0	0.72	0.49	0.35	0.46	0.23	1.0	0.44	0.29	0.24	0.26	0.18	0.66	0.64	0.54	0.07	0.21	0.68	0.46	0.49	0.24	0.08	0.04
lcl\|BLLF01001167.1_cds_GFH17558.1_12035 (GFH17558)	0.04	0.16	0.0	0.02	0.65	0.42	0.36	0.35	0.26	1.0	0.58	0.34	0.32	0.25	0.11	0.45	0.67	0.35	0.18	0.28	0.4	0.54	0.23	0.22	0.06	0.03
lcl\|BLLF01001175.1_cds_GFH17607.1_12084 (GFH17607)	0.44	0.01	0.0	0.1	0.48	0.42	0.37	0.65	0.34	0.57	0.4	0.39	0.46	0.68	0.39	0.62	0.55	0.63	0.0	0.16	1.0	0.15	0.91	0.13	0.26	0.44
lcl\|BLLF01001387.1_cds_GFH18975.1_13452 (GFH18975)	0.34	0.1	0.0	0.0	1.0	0.27	0.27	0.62	0.15	0.13	0.51	0.51	0.49	0.38	0.25	0.16	0.15	0.07	0.38	0.5	0.09	0.16	0.08	0.1	0.08	0.04
lcl\|BLLF01001461.1_cds_GFH19426.1_13903 (GFH19426)	0.55	0.33	0.29	0.31	1.0	0.5	0.46	0.59	0.58	0.47	0.92	0.52	0.46	0.45	0.67	0.66	0.96	0.57	0.69	0.39	0.54	0.21	0.42	0.41	0.73	0.5
lcl\|BLLF01001598.1_cds_GFH20222.1_14699 (GFH20222)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.16	0.08	0.44	0.04	0.36	0.35	0.43	0.31	0.26	0.11	0.0	0.09	0.0	0.14	0.09	0.14	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0
lcl\|BLLF01001598.1_cds_GFH20223.1_14700 (GFH20223)	0.0	0.06	0.0	0.0	1.0	0.08	0.28	0.71	0.01	0.0	0.4	0.15	0.29	0.13	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001598.1_cds_GFH20224.1_14701 (GFH20224)	0.24	0.07	0.03	0.17	1.0	0.19	0.23	0.26	0.12	0.03	0.55	0.35	0.31	0.32	0.23	0.34	0.38	0.22	0.21	0.18	0.2	0.17	0.29	0.1	0.08	0.12
lcl\|BLLF01001598.1_cds_GFH20225.1_14702 (GFH20225)	0.08	0.04	0.0	0.12	1.0	0.19	0.2	0.25	0.09	0.02	0.45	0.32	0.29	0.28	0.19	0.09	0.13	0.09	0.05	0.08	0.12	0.09	0.14	0.16	0.05	0.08
lcl\|BLLF01001832.1_cds_GFH21453.1_15930 (GFH21453)	0.58	0.29	0.1	0.1	0.51	0.39	0.46	0.56	0.48	0.58	0.58	0.44	0.6	0.59	0.48	0.58	0.7	1.0	0.37	0.46	0.83	0.82	0.77	0.38	0.31	0.29
lcl\|BLLF01001838.1_cds_GFH21480.1_15957 (GFH21480)	0.3	0.6	0.04	0.06	0.63	0.68	0.48	0.36	0.42	0.42	0.52	0.53	0.47	0.4	0.3	0.87	0.78	1.0	0.38	0.53	0.97	0.51	1.0	0.44	0.19	0.28
lcl\|BLLF01001852.1_cds_GFH21550.1_16027 (GFH21550)	0.62	0.68	0.46	0.21	0.93	0.61	0.61	1.0	0.74	0.79	1.0	0.65	0.85	0.77	0.77	0.6	0.94	0.9	0.61	0.64	0.95	0.98	0.92	0.73	0.7	0.46
lcl\|BLLF01002047.1_cds_GFH22469.1_16946 (GFH22469)	0.38	0.33	0.15	0.02	0.47	0.36	0.32	0.45	0.33	0.32	0.49	0.34	0.37	0.32	0.19	0.74	1.0	0.39	0.35	0.25	0.4	0.19	0.35	0.24	0.23	0.26
lcl\|BLLF01002098.1_cds_GFH22678.1_17155 (GFH22678)	0.77	0.59	0.56	0.15	0.78	0.51	0.39	0.69	0.33	0.62	0.86	0.63	0.52	0.52	0.39	0.69	0.77	0.43	0.33	0.67	0.39	1.0	0.36	0.44	0.42	0.28
lcl\|BLLF01002138.1_cds_GFH22855.1_17332 (GFH22855)	0.48	0.43	0.24	0.42	0.42	0.34	0.32	0.24	0.41	0.37	0.31	0.39	0.35	0.23	0.49	0.55	0.49	0.33	0.51	0.35	0.29	1.0	0.35	0.38	0.28	0.17
lcl\|BLLF01002298.1_cds_GFH23546.1_18023 (GFH23546)	0.58	0.29	0.11	0.18	0.69	0.47	0.32	0.41	0.22	0.14	0.6	0.48	0.34	0.43	0.18	0.9	1.0	0.4	0.47	0.37	0.36	0.17	0.41	0.39	0.14	0.19
lcl\|BLLF01002579.1_cds_GFH24593.1_19070 (GFH24593)	0.78	0.05	0.0	0.13	0.8	0.64	0.53	0.75	0.58	1.0	0.81	0.61	0.5	0.59	0.58	0.45	0.84	0.51	0.38	0.72	0.53	0.55	0.5	0.41	0.34	0.34
lcl\|BLLF01002788.1_cds_GFH25346.1_19823 (GFH25346)	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0	0.17	0.55	0.16	0.22	0.0	0.59	0.34	0.51	0.18	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002809.1_cds_GFH25414.1_19891 (GFH25414)	0.63	0.05	0.0	0.01	1.0	0.33	0.17	0.83	0.1	0.33	0.47	0.17	0.07	0.26	0.06	0.06	0.07	0.07	0.08	0.11	0.09	0.06	0.08	0.06	0.24	0.13
lcl\|BLLF01002809.1_cds_GFH25415.1_19892 (GFH25415)	0.65	0.14	0.0	0.01	0.78	0.22	0.12	1.0	0.05	0.42	0.4	0.1	0.04	0.24	0.03	0.19	0.18	0.03	0.01	0.1	0.04	0.08	0.02	0.02	0.13	0.03
lcl\|BLLF01002809.1_cds_GFH25416.1_19893 (GFH25416)	0.32	0.6	0.0	0.01	0.93	0.24	0.14	1.0	0.06	0.32	0.49	0.12	0.04	0.26	0.03	0.04	0.12	0.11	0.02	0.07	0.07	0.02	0.01	0.03	0.13	0.05
lcl\|BLLF01002946.1_cds_GFH25885.1_20362 (GFH25885)	0.03	0.07	0.0	0.0	1.0	0.42	0.23	0.35	0.32	0.61	0.33	0.31	0.32	0.31	0.4	0.1	0.08	0.24	0.0	0.0	0.22	0.0	0.32	0.04	0.18	0.11
lcl\|BLLF01003082.1_cds_GFH26288.1_20765 (GFH26288)	0.19	0.11	0.03	0.03	1.0	0.26	0.28	0.77	0.14	0.18	0.42	0.49	0.54	0.35	0.54	0.19	0.23	0.05	0.53	0.73	0.08	0.48	0.15	0.3	0.09	0.04
lcl\|BLLF01003092.1_cds_GFH26320.1_20797 (GFH26320)	0.12	0.0	0.0	0.0	1.0	0.07	0.15	0.25	0.12	0.15	0.2	0.11	0.11	0.08	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.02	0.04	0.23	0.15
lcl\|BLLF01003092.1_cds_GFH26321.1_20798 (GFH26321)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.07	0.46	0.07	0.47	0.23	0.07	0.04	0.29	0.14	0.7	0.25	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.12	0.12
lcl\|BLLF01003093.1_cds_GFH26325.1_20802 (GFH26325)	0.99	0.47	0.15	0.25	0.83	0.56	0.5	0.81	0.63	0.78	0.81	0.58	0.78	0.66	0.65	0.44	0.72	0.69	0.6	0.6	0.62	1.0	0.67	0.33	0.56	0.46
lcl\|BLLF01003214.1_cds_GFH26712.1_21189 (GFH26712)	0.26	0.21	0.0	0.47	1.0	0.44	0.31	0.42	0.26	0.69	0.81	0.45	0.45	0.49	0.13	0.72	0.85	0.62	0.13	0.31	0.62	0.45	0.59	0.25	0.05	0.16
lcl\|BLLF01003509.1_cds_GFH27524.1_22001 (GFH27524)	0.43	0.03	0.0	0.0	1.0	0.25	0.31	0.6	0.15	0.15	0.56	0.43	0.49	0.4	0.25	0.17	0.23	0.03	0.27	0.36	0.13	0.3	0.04	0.02	0.11	0.06
lcl\|BLLF01003509.1_cds_GFH27525.1_22002 (GFH27525)	0.23	0.05	0.08	0.0	1.0	0.23	0.29	0.62	0.19	0.05	0.55	0.46	0.53	0.42	0.31	0.02	0.05	0.02	0.07	0.08	0.02	0.02	0.02	0.0	0.11	0.05
lcl\|BLLF01003810.1_cds_GFH28268.1_22745 (GFH28268)	0.0	0.11	0.0	0.08	1.0	0.43	0.35	0.32	0.34	0.0	0.68	0.33	0.28	0.28	0.32	0.36	0.29	0.02	0.48	0.41	0.0	0.34	0.02	0.17	0.54	0.17
lcl\|BLLF01003881.1_cds_GFH28444.1_22921 (GFH28444)	0.12	0.62	0.03	0.28	1.0	0.7	0.7	0.47	0.69	0.51	0.93	0.72	0.58	0.48	0.77	0.55	0.68	0.2	0.5	0.18	0.19	0.47	0.25	0.39	0.71	0.47
lcl\|BLLF01004048.1_cds_GFH28813.1_23290 (GFH28813)	0.55	0.27	0.25	0.25	0.4	0.41	0.48	0.31	0.57	0.46	0.34	0.35	0.42	0.26	0.52	0.55	0.41	0.39	0.57	0.41	0.43	1.0	0.36	0.41	0.42	0.41
lcl\|BLLF01004358.1_cds_GFH29462.1_23939 (GFH29462)	0.03	0.05	0.0	0.01	1.0	0.25	0.35	0.32	0.21	0.1	0.51	0.41	0.38	0.29	0.36	0.37	0.32	0.18	0.22	0.29	0.14	0.25	0.16	0.08	0.35	0.24
lcl\|BLLF01005153.1_cds_GFH30802.1_25279 (GFH30802)	0.97	0.31	0.0	0.0	0.21	0.29	0.23	0.22	0.33	1.0	0.18	0.24	0.2	0.06	0.15	0.2	0.62	0.0	0.2	0.14	0.0	0.7	0.43	0.22	0.25	0.11
lcl\|BLLF01005279.1_cds_GFH30999.1_25476 (GFH30999)	0.26	0.01	0.0	0.0	1.0	0.17	0.25	0.78	0.1	0.14	0.4	0.43	0.47	0.34	0.43	0.18	0.19	0.1	0.54	0.8	0.22	0.9	0.29	0.34	0.1	0.05
lcl\|BLLF01005834.1_cds_GFH31686.1_26163 (GFH31686)	0.02	0.03	0.0	0.0	0.35	0.37	0.31	0.29	0.18	1.0	0.45	0.27	0.23	0.28	0.12	0.87	0.42	0.3	0.22	0.34	0.33	0.74	0.32	0.17	0.1	0.04
lcl\|BLLF01006973.1_cds_GFH32685.1_27162 (GFH32685)	0.17	0.0	0.0	0.0	0.97	0.68	0.42	0.34	0.21	1.0	0.74	0.4	0.31	0.29	0.17	0.98	0.7	0.45	0.34	0.24	0.77	0.13	0.49	0.23	0.18	0.17
lcl\|BLLF01007895.1_cds_GFH33165.1_27642 (GFH33165)	0.07	0.16	0.0	0.03	1.0	0.35	0.16	0.52	0.11	0.43	0.59	0.16	0.1	0.28	0.08	0.13	0.13	0.0	0.2	0.37	0.0	0.0	0.03	0.02	0.05	0.04
lcl\|BLLF01008383.1_cds_GFH33351.1_27828 (GFH33351)	0.37	0.0	0.0	0.01	1.0	0.26	0.26	0.5	0.14	0.04	0.54	0.41	0.41	0.37	0.26	0.09	0.14	0.04	0.2	0.33	0.09	0.23	0.09	0.01	0.08	0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)