Heatmap: Cluster_28 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
-2.28 -2.27 -0.9 -0.19 0.36 0.62 0.77 -0.56 0.24 0.38 -0.0 0.04 -0.16 -0.24 0.12 0.57 0.92 -0.11 -0.39 -0.67 0.35 0.04 -0.05 -0.1 -0.27 -0.11
-0.93 - - -1.27 0.99 0.42 0.67 -0.12 0.21 -0.04 0.72 0.47 0.34 0.1 0.01 0.05 0.03 0.43 -0.31 -2.13 0.57 -2.23 0.9 -0.03 -0.11 -0.29
-0.33 -1.26 - -0.47 0.38 0.7 0.43 -0.76 -0.21 -1.22 0.06 0.13 -0.18 -0.47 -0.14 0.83 0.88 0.65 -1.26 -0.96 0.45 -0.27 0.58 0.81 -0.25 -0.21
0.11 -1.13 -2.85 -0.77 0.24 0.25 0.53 -1.12 0.22 -0.2 0.18 0.06 0.15 -0.3 0.06 1.39 0.75 -0.95 -1.27 -2.26 -0.55 -1.41 -0.42 0.47 0.92 0.81
-0.39 -1.49 -1.98 0.21 0.45 0.29 0.61 -0.15 0.3 0.37 0.22 0.2 -0.07 -0.19 -0.01 -0.25 0.24 0.62 -1.01 -1.17 0.47 -0.11 0.58 0.24 -0.62 -0.61
-0.44 -0.41 -0.78 0.35 0.6 0.43 0.33 -0.54 0.19 -1.23 0.3 0.24 0.01 -0.35 0.03 0.71 1.0 0.07 -0.48 -0.56 -0.45 -0.31 -0.16 -0.02 -0.3 -0.44
-1.41 -1.95 -5.43 -0.07 0.28 -0.19 -0.05 -0.39 -0.34 0.62 0.31 -0.24 -0.53 -0.29 -0.85 0.68 1.18 0.49 -1.48 -0.55 0.04 -0.32 0.62 0.54 0.71 0.39
-0.5 -1.63 -3.51 -0.22 0.43 0.36 0.16 -0.19 -0.01 -1.18 0.7 0.23 -0.02 0.25 0.01 1.1 0.81 0.0 -0.72 -1.44 0.08 -0.42 0.35 0.11 -0.03 -0.03
-0.18 -2.51 - -0.4 -0.15 0.33 0.31 -0.6 0.3 - 0.48 0.65 0.07 0.12 0.24 0.62 1.1 -0.42 -2.15 -0.97 1.05 0.51 0.25 0.33 -0.53 -0.26
0.01 -0.51 -1.71 0.67 -0.03 0.29 -0.4 -0.61 -0.28 0.11 -0.09 -0.48 -0.92 -0.81 -1.01 0.85 0.96 -0.16 -0.8 -0.79 0.0 0.11 -0.56 0.66 0.81 0.78
-2.07 -0.98 -1.9 -1.62 0.02 0.33 0.72 -0.6 0.17 0.02 0.1 0.07 0.02 -0.39 -0.08 0.99 0.88 0.46 -0.95 -1.19 0.54 0.13 0.49 0.58 -0.43 -0.39
-2.28 -1.75 -4.2 -0.63 -0.3 -0.34 -0.25 -0.47 -0.33 -0.47 -0.07 -0.11 -0.01 -0.5 -0.37 0.82 1.27 0.62 0.8 0.43 -0.19 0.88 0.61 0.31 -0.31 -0.58
-0.49 -1.31 -2.0 -0.62 0.36 0.06 0.42 -0.42 0.2 0.33 -0.03 -0.41 0.01 -0.79 0.34 0.58 -0.31 0.85 -0.79 -0.32 1.03 0.46 0.69 -0.07 -0.8 -0.9
-1.71 -1.74 - 0.17 0.21 0.14 0.98 -0.4 0.35 -0.31 0.3 -0.03 0.07 0.2 -0.04 -0.19 0.81 0.83 -2.28 -0.78 1.3 -1.2 0.82 -0.46 -0.66 -0.72
-0.86 -0.73 -0.7 -0.32 0.09 0.07 0.17 -0.66 0.08 0.26 -0.05 0.04 -0.17 -0.73 -0.65 0.62 1.04 0.08 -1.05 -0.8 -0.1 -0.34 0.07 0.66 0.65 0.65
-4.7 -3.89 - -1.07 -0.09 0.42 0.65 -0.86 0.35 -0.45 -0.06 -0.13 0.48 -0.25 0.03 1.76 1.57 0.47 -2.53 -1.77 0.67 0.13 -0.81 -0.26 -0.59 -0.13
-0.31 -2.34 - -1.41 0.36 -0.16 -0.14 -0.44 -0.1 1.07 0.08 -0.77 -0.19 -0.37 0.19 1.2 0.18 0.43 -1.57 -1.66 0.97 0.51 1.0 0.35 -0.37 -1.09
-0.53 -0.71 -0.2 0.35 0.38 0.02 0.6 0.07 0.1 0.46 0.35 0.01 0.07 0.3 0.23 0.26 0.64 -0.6 -1.02 -0.77 -0.37 -0.13 -0.62 0.21 -0.19 -0.7
-0.2 -1.46 -2.69 0.56 0.07 0.35 0.3 -0.9 0.31 0.3 0.05 -0.01 -0.12 -0.49 -0.12 0.37 0.86 0.48 -1.74 -0.64 -0.05 -0.36 0.22 0.46 0.19 0.18
-0.3 -1.91 -1.63 -3.04 0.2 0.0 -0.02 -0.07 0.2 0.29 0.22 -0.29 -0.12 -0.25 -0.43 0.86 0.81 0.16 0.11 -0.39 0.69 -0.14 0.49 0.37 -0.01 -0.33
- -4.55 - -2.78 0.43 0.08 -0.1 0.16 0.02 -1.25 0.05 0.37 0.05 0.45 -0.08 0.83 1.41 -0.53 -0.2 -0.35 0.35 -0.45 -0.31 0.23 0.68 0.91
-0.11 -0.26 - - 0.24 0.14 0.39 -0.51 0.38 -0.29 0.19 -0.27 0.36 -0.47 0.57 0.96 1.24 0.81 0.07 -0.15 -0.7 -2.14 -0.12 0.54 -0.54 -1.17
-0.73 - - -0.82 0.4 -0.48 1.21 0.59 1.27 - 0.43 -0.76 0.38 0.61 0.4 1.2 1.47 1.01 0.01 -1.39 -1.69 - -1.17 0.23 - -4.26
-2.02 -3.59 - -1.15 -0.51 0.25 0.6 -1.0 0.16 -5.0 -0.07 0.24 0.28 -0.13 0.05 1.91 0.85 0.47 -2.27 -1.63 0.61 0.56 1.04 0.64 -1.33 -1.43
- - - 0.27 1.28 0.72 0.55 0.25 0.59 - 0.66 0.4 0.79 0.32 0.41 0.73 1.61 - - -1.03 - - -0.16 0.18 -0.22 0.35
-0.16 -0.02 -0.95 0.66 -0.46 -0.29 -0.06 -1.16 -0.45 -2.63 -0.8 -1.21 -1.13 -1.52 -0.96 1.33 0.81 0.68 -1.25 -0.28 0.83 -0.15 -0.08 0.63 0.93 0.74
-0.66 -2.15 - 0.52 0.28 0.44 0.44 -1.08 0.64 0.6 0.36 0.14 0.03 -0.34 0.17 0.91 0.73 0.41 -1.12 -0.94 0.29 -1.21 0.12 -0.14 -0.63 -0.42
0.13 -2.9 -4.73 -0.23 0.21 0.55 0.52 -0.73 0.11 -0.74 -0.0 -0.08 0.1 -0.03 -0.2 0.3 0.81 0.57 -0.28 -0.96 0.74 0.28 0.29 0.49 -0.42 -0.69
-0.32 -0.4 -0.67 -0.44 0.61 0.4 0.07 -0.48 -0.03 -0.44 0.32 0.05 -0.07 -0.56 -0.31 0.7 1.42 0.05 -1.5 -0.61 -0.43 -0.83 -0.26 0.11 0.35 0.24
- -2.11 - -0.15 0.26 0.28 0.4 0.33 0.77 0.43 0.37 -0.05 0.31 0.51 -0.42 0.92 0.13 -0.02 -1.02 0.48 -0.14 - -0.03 -0.12 0.64 -0.12
-0.17 -1.47 - -2.91 0.09 0.52 0.01 -0.72 -0.38 -1.53 -0.07 0.11 -0.27 -0.35 -0.79 0.96 1.16 0.41 -0.07 0.43 0.39 0.86 0.18 0.54 -0.54 -0.08
-0.53 -3.71 - -1.09 0.43 0.24 0.46 -0.18 0.42 -0.61 0.48 -0.32 0.15 0.01 0.46 1.55 1.33 0.32 -3.05 -1.55 -0.05 -0.16 -0.45 0.1 -0.32 -0.58
-0.38 -0.46 -2.07 -1.87 0.53 -0.12 0.18 -0.64 0.04 0.52 -0.02 -0.46 -0.28 -0.04 0.0 0.26 -0.87 1.12 -0.18 -0.57 0.71 0.29 0.95 -0.39 -0.15 -0.07
0.09 -1.5 -7.37 -1.39 0.56 0.27 0.17 -0.42 -0.29 -1.11 0.39 0.13 -0.31 -0.24 -0.56 0.74 1.14 0.33 -0.85 -0.37 0.31 0.99 0.23 0.5 -0.68 -0.44
-3.13 - - -2.63 0.69 0.82 0.84 -0.37 0.42 0.98 0.64 0.62 0.21 0.19 0.13 0.85 0.87 -1.97 -0.38 -1.62 0.67 -0.3 -0.17 -0.26 -1.28 -1.07
-1.2 -3.87 - -0.42 0.51 0.13 0.7 0.5 -0.05 0.86 0.62 0.22 -0.1 0.36 0.23 -1.37 0.57 1.3 -3.3 -2.54 0.82 -1.03 0.99 -1.71 -0.35 -1.39
-0.45 -0.86 -0.83 -0.09 0.4 0.55 0.13 -0.81 0.39 -2.84 0.24 0.01 -0.26 -0.47 -0.31 0.43 1.17 0.89 -0.37 -0.35 0.09 -0.23 0.52 0.44 -0.92 -0.94
0.03 -1.57 - 0.09 0.42 0.01 0.11 -1.02 -0.18 -0.12 0.31 -0.08 -0.8 -0.44 -0.63 0.54 0.94 0.66 -0.4 -1.13 0.57 0.38 0.36 0.33 0.03 0.24
-0.12 -4.5 - -0.93 0.21 0.53 0.59 -0.41 0.22 -0.87 0.07 -0.46 -1.18 -1.6 -0.63 1.16 0.45 0.51 0.01 0.28 1.16 -0.33 0.95 -0.85 -0.05 0.02
-1.05 -1.59 - -2.81 0.23 0.37 0.18 -0.41 0.1 0.83 -0.44 -0.12 0.23 -0.16 -0.15 -0.07 1.05 0.73 -0.13 -0.03 0.9 -0.05 -0.2 0.65 -0.08 -1.25
-1.39 - - 0.61 -0.01 0.57 0.21 -0.3 0.55 0.05 0.7 0.09 0.29 -0.07 0.1 0.29 -1.46 0.42 -1.81 -1.04 0.4 0.86 0.41 0.56 -0.12 -0.58
- -2.92 - -0.42 -0.0 0.08 0.36 -0.41 0.89 -1.32 -0.35 0.15 0.16 -0.06 0.4 0.77 0.55 -0.17 - 0.22 - - 1.62 0.9 0.88 0.57
-1.46 -1.88 - -0.42 0.12 0.43 0.43 -0.65 0.37 -0.06 -0.01 0.05 0.04 -0.36 0.09 1.05 0.98 0.79 -1.21 -0.49 0.65 0.02 0.23 -0.1 -0.45 -0.48
-1.76 - - 0.45 0.44 0.35 0.54 -0.43 0.51 -1.09 0.66 0.28 -0.16 0.02 0.37 1.25 1.18 -0.83 -0.48 -1.76 0.02 -2.28 -0.29 0.38 0.4 -0.42
-1.43 - - 0.72 1.03 1.09 0.86 0.39 -0.06 0.07 0.91 0.32 -0.19 -0.09 -0.26 -0.43 -0.86 0.92 -1.2 -0.7 0.49 -2.12 -0.21 0.14 -0.73 -1.07
-0.58 0.5 -2.48 -0.53 -1.48 -0.96 0.54 -1.81 -0.42 -0.71 -1.99 -1.11 0.16 -1.93 -0.78 1.62 0.84 -0.57 0.02 -1.16 0.43 1.1 -0.75 0.74 1.02 0.69
-0.06 -2.67 - -0.49 -1.01 -0.09 0.34 -1.14 -0.12 -0.25 -0.82 -0.05 -0.18 -0.08 0.12 1.28 0.53 0.59 -0.6 -0.53 1.01 0.16 1.24 0.37 -0.4 -0.89
- - - 1.88 0.31 0.62 1.13 -0.43 -0.4 -0.92 0.7 0.3 0.74 0.87 0.46 0.58 0.74 - - - 0.69 -0.11 -0.79 - -0.87 -0.39
0.42 - -4.12 -1.82 -0.94 -0.19 -0.48 -1.95 -0.56 0.61 -0.62 -0.55 -0.16 -2.02 -1.29 1.25 0.36 1.34 -0.4 0.52 1.06 -1.91 1.67 0.38 -0.4 -0.14
-0.93 -6.86 -4.63 -3.75 0.23 0.72 0.77 -0.48 0.45 -0.84 0.22 0.37 0.17 0.2 0.01 0.89 0.67 0.5 -0.11 -0.46 -0.3 -0.72 0.45 0.2 -0.16 0.14
-0.78 -1.86 -2.81 -0.47 0.7 0.68 0.75 -0.24 0.42 -0.99 0.45 0.3 -0.12 -0.26 0.19 0.56 0.87 0.12 -0.43 -0.63 -0.11 0.19 -0.01 0.15 -0.32 -1.15
-3.48 -6.15 - -2.02 0.03 0.23 0.58 -0.32 0.25 -1.37 0.05 0.19 0.13 0.21 -0.02 1.52 0.29 0.58 -0.32 -1.88 0.76 -0.98 0.93 0.93 -0.3 -0.57
-0.45 -0.34 -2.65 -0.69 0.51 -0.16 0.78 -0.61 0.22 -0.51 0.29 -0.78 -0.44 -1.06 0.6 0.75 0.32 1.12 -0.52 -1.93 1.02 -0.22 0.47 -0.29 0.07 -1.33
-3.76 -3.94 - -2.43 1.13 1.21 0.42 -0.18 0.39 -1.32 0.69 0.27 0.02 0.18 -0.16 -0.23 1.21 -1.17 -1.59 0.4 - 0.07 0.4 0.36 0.29 0.31
- -0.33 - 1.19 0.49 0.67 0.91 0.21 0.67 -2.95 0.57 0.25 0.46 0.3 0.83 -1.45 1.7 -1.81 -2.23 -1.46 - - -1.24 -0.27 0.32 0.17
-0.16 -1.64 - -1.26 0.3 0.26 0.25 -0.5 -0.3 0.38 0.07 -0.1 -0.3 -0.95 -0.07 -0.14 -0.82 1.16 -0.59 -0.36 1.34 0.59 0.9 0.12 -0.73 -0.15
-1.32 - - -0.46 0.61 1.13 -0.25 0.72 0.39 -0.33 0.78 0.51 0.41 0.45 0.18 0.3 0.87 -0.32 -0.25 -0.56 -0.01 -0.98 -0.2 -0.35 -1.3 -0.57
-2.1 - - -0.51 0.35 0.16 0.31 -0.58 -0.08 -0.2 -0.03 -0.08 -0.32 -0.05 -0.23 1.87 0.88 0.57 - -3.21 -0.27 1.05 0.88 0.66 -0.89 -1.07
-1.15 - - -0.58 0.52 0.93 0.82 -1.27 0.5 0.36 0.72 0.31 0.26 0.26 -0.01 0.09 0.37 0.24 0.61 -0.31 -1.5 -0.83 0.08 0.22 -0.85 -0.29
-0.54 -2.04 -2.99 -2.14 0.08 -0.11 -0.23 -0.92 -0.3 0.48 0.25 -0.32 -0.03 -0.52 -0.6 0.57 0.91 0.56 -0.45 1.12 0.23 1.38 -0.07 0.52 -1.02 -1.27
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-0.22 -0.91 - -1.35 -0.17 0.3 0.41 -0.86 0.01 -0.41 0.4 -0.41 -0.12 -0.05 -0.46 0.79 0.9 0.43 -0.1 -0.5 0.9 -1.02 -0.11 0.81 -0.1 0.28
-0.88 - - -1.65 0.33 0.53 0.66 -0.28 0.31 -2.56 0.06 0.0 -0.36 -0.57 -0.17 1.15 0.96 0.9 -1.94 -1.91 1.1 -0.45 0.95 1.1 -1.21 -1.82
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-0.82 - - 0.11 0.83 0.87 0.47 -0.03 -0.08 -0.61 0.55 0.29 0.08 -0.26 0.06 -0.11 0.96 0.78 -1.76 -1.57 0.12 -1.68 0.39 0.23 0.0 0.1
0.4 -0.98 - 0.34 -0.05 0.78 0.95 -1.7 0.1 -0.35 -0.46 -0.05 0.18 -0.21 0.02 0.73 1.04 0.79 - -0.13 1.06 -0.55 0.58 -1.68 -2.75 -1.51
- - - 0.61 0.84 0.19 0.85 -1.48 1.56 -0.28 0.39 0.62 -0.51 -0.01 -0.03 1.81 -0.21 -0.13 - - - - - -0.3 1.66 -0.23
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-1.87 - - -1.17 -2.85 -0.13 0.83 -4.24 1.0 -0.87 -0.96 0.23 0.5 -0.1 -0.86 1.59 -0.19 0.98 0.84 -0.89 0.96 - 0.48 1.66 -0.79 -
-0.53 -2.78 - -0.57 0.32 -0.13 0.14 -0.72 0.45 0.17 0.59 -0.53 -0.39 -0.35 -0.45 0.58 1.2 0.87 -0.38 -0.31 0.69 0.21 0.61 0.02 -1.19 -0.52
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0.13 -1.71 - 0.5 0.95 0.84 -0.37 -0.7 -0.34 -1.39 0.74 -0.03 -0.34 -0.43 -0.48 -0.16 0.55 -0.03 0.75 -0.75 0.22 -0.59 0.61 0.34 -0.25 -0.13
-2.87 - - 0.92 -0.8 -1.13 -0.46 -0.55 -0.48 0.16 -0.56 -0.78 0.57 0.48 0.39 - 1.23 1.04 0.3 -0.52 0.76 1.38 0.7 0.6 -3.4 -1.38
0.31 -1.55 -1.83 -0.25 0.07 0.24 0.1 -0.31 0.12 -0.25 0.12 -0.1 -0.17 -0.44 -0.47 -0.22 1.04 0.63 -0.21 0.37 0.61 -0.01 0.6 -0.08 -0.93 -0.37
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-0.93 -1.24 - -0.71 0.43 0.11 0.69 -0.87 0.68 -1.14 0.52 0.31 0.01 -0.39 -0.09 1.49 1.0 -1.15 -0.74 -0.86 -2.27 -1.34 -2.75 0.96 0.54 0.87
-1.4 -1.58 - -1.41 0.64 0.66 1.02 -0.91 0.48 1.32 0.46 0.44 0.0 -0.34 -0.06 1.4 0.39 -0.94 - -1.65 - -0.9 0.57 0.03 0.33 -0.45
-1.18 -5.14 - -0.5 0.52 0.37 0.43 -0.59 0.32 0.01 0.17 0.11 -0.29 -0.72 -0.11 0.51 1.41 0.15 -1.2 -0.09 0.18 -0.01 -0.14 0.88 -0.47 0.17
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-2.11 - - -0.51 0.37 0.49 1.41 0.24 1.03 -1.67 0.47 0.12 0.4 0.72 0.81 0.09 0.66 0.15 -3.26 -2.5 -0.58 0.14 -0.16 0.54 -1.16 -1.42
-0.41 -1.71 - -0.26 0.58 0.12 0.14 -0.44 0.03 -0.45 0.76 0.35 -0.32 -0.43 -0.4 0.66 1.45 -0.09 -1.63 -1.87 0.38 -1.74 0.2 0.79 0.18 0.25
-0.5 -1.54 - 0.88 0.88 0.76 0.29 -0.27 0.02 -0.89 0.84 -0.09 0.1 0.41 -0.06 1.35 1.5 -0.01 -1.75 - -1.87 - -1.34 -0.54 0.07 -0.34
-1.66 - - -1.64 0.59 -0.01 0.74 -0.63 0.2 1.43 0.34 0.35 0.25 -0.56 -0.28 1.04 0.03 0.1 1.01 -0.55 -1.08 -1.24 0.9 -0.16 -1.34 -0.81
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.