Heatmap: Cluster_117 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000005.1_cds_GFH05690.1_167 (GFH05690)	0.0	0.0	0.0	0.15	0.05	0.26	0.2	0.05	0.54	1.0	0.1	0.05	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.0	0.0	0.12	0.25	0.09
lcl\|BLLF01000067.1_cds_GFH06982.1_1459 (GFH06982)	0.46	0.06	0.0	0.03	0.51	0.41	0.55	0.57	0.43	0.91	0.52	0.35	0.37	0.53	0.52	0.28	0.56	1.0	0.61	0.24	0.95	0.99	0.65	0.11	0.3	0.37
lcl\|BLLF01000070.1_cds_GFH07029.1_1506 (GFH07029)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.34	0.19	0.07	0.54	0.97	0.12	0.07	0.45	0.19	1.0	0.34	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000071.1_cds_GFH07044.1_1521 (GFH07044)	0.4	0.2	0.21	0.12	0.66	0.63	0.77	0.35	0.6	1.0	0.54	0.43	0.48	0.29	0.62	0.59	0.23	0.86	0.23	0.33	0.89	0.64	0.8	0.41	0.53	0.65
lcl\|BLLF01000081.1_cds_GFH07222.1_1699 (GFH07222)	0.64	0.2	0.01	0.0	0.46	0.55	0.57	0.58	0.76	1.0	0.52	0.37	0.53	0.47	0.68	0.7	0.86	0.51	0.42	0.44	0.46	0.33	0.59	0.32	0.21	0.19
lcl\|BLLF01000097.1_cds_GFH07480.1_1957 (GFH07480)	0.09	0.12	0.0	0.05	0.48	0.49	0.51	0.49	0.49	0.23	0.45	0.29	0.35	0.49	0.31	0.34	0.31	0.75	0.19	0.32	1.0	0.26	0.55	0.22	0.22	0.35
lcl\|BLLF01000101.1_cds_GFH07540.1_2017 (GFH07540)	0.18	0.0	0.0	0.3	0.05	0.08	0.23	0.03	0.45	1.0	0.05	0.06	0.09	0.03	0.4	0.13	0.13	0.16	0.02	0.1	0.22	0.0	0.1	0.03	0.05	0.06
lcl\|BLLF01000117.1_cds_GFH07804.1_2281 (GFH07804)	0.65	0.21	0.02	0.12	0.53	0.45	0.61	0.56	0.59	0.81	0.47	0.43	0.47	0.43	0.65	1.0	0.95	0.62	0.53	0.73	0.5	0.45	0.62	0.54	0.57	0.51
lcl\|BLLF01000188.1_cds_GFH08833.1_3310 (GFH08833)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000196.1_cds_GFH08937.1_3414 (GFH08937)	0.0	0.09	0.0	0.23	0.22	0.21	0.4	0.02	0.32	1.0	0.19	0.18	0.26	0.08	0.67	0.58	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.16	0.13	0.1	0.23
lcl\|BLLF01000283.1_cds_GFH10053.1_4530 (GFH10053)	0.14	0.08	0.0	0.1	0.06	0.4	0.51	0.19	1.0	1.0	0.13	0.21	0.67	0.3	0.98	0.39	0.17	0.25	0.55	0.21	0.42	0.19	0.49	0.03	0.06	0.06
lcl\|BLLF01000304.1_cds_GFH10298.1_4775 (GFH10298)	0.14	0.0	0.0	0.21	0.6	0.59	0.58	0.39	0.81	0.91	0.62	0.35	0.38	0.57	0.4	0.0	0.48	1.0	0.0	0.42	0.35	0.4	0.5	0.15	0.75	0.82
lcl\|BLLF01000338.1_cds_GFH10700.1_5177 (GFH10700)	0.12	0.05	0.0	0.21	0.28	0.64	0.35	0.16	0.63	0.44	0.35	0.29	0.49	0.19	0.68	0.43	1.0	0.25	0.49	0.21	0.22	0.38	0.16	0.16	0.04	0.04
lcl\|BLLF01000464.1_cds_GFH12055.1_6532 (GFH12055)	0.06	0.0	0.0	0.0	0.34	0.39	0.45	0.12	0.87	0.78	0.17	0.31	0.62	0.28	1.0	0.94	0.7	0.49	0.55	0.26	0.59	0.0	0.67	0.17	0.2	0.17
lcl\|BLLF01000533.1_cds_GFH12723.1_7200 (GFH12723)	0.68	0.19	0.0	0.08	0.01	0.06	0.39	0.01	0.79	1.0	0.01	0.01	0.06	0.03	0.67	0.34	0.37	0.5	0.11	0.09	0.35	0.37	0.5	0.08	0.15	0.09
lcl\|BLLF01000552.1_cds_GFH12901.1_7378 (GFH12901)	0.86	0.14	0.36	0.19	0.07	0.08	0.54	0.15	0.78	1.0	0.14	0.15	0.33	0.25	0.89	0.03	0.02	0.22	0.14	0.15	0.12	0.21	0.11	0.11	0.09	0.1
lcl\|BLLF01000597.1_cds_GFH13311.1_7788 (GFH13311)	0.1	0.14	0.0	0.08	0.01	0.11	0.19	0.03	0.22	1.0	0.04	0.05	0.14	0.0	0.09	0.0	0.0	0.1	0.15	0.04	0.14	0.08	0.2	0.07	0.15	0.06
lcl\|BLLF01000606.1_cds_GFH13386.1_7863 (GFH13386)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.02	0.26	0.0	0.34	1.0	0.03	0.04	0.05	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.04
lcl\|BLLF01000620.1_cds_GFH13503.1_7980 (GFH13503)	0.25	0.1	0.0	0.06	0.16	0.16	0.18	0.23	0.22	1.0	0.16	0.21	0.28	0.22	0.36	0.09	0.39	0.14	0.31	0.47	0.38	0.11	0.21	0.06	0.14	0.0
lcl\|BLLF01000740.1_cds_GFH14552.1_9029 (GFH14552)	0.34	0.0	0.0	0.0	0.18	0.33	0.38	0.23	0.34	1.0	0.2	0.22	0.23	0.11	0.41	0.06	0.11	0.38	0.04	0.22	0.42	0.04	0.42	0.15	0.0	0.01
lcl\|BLLF01000785.1_cds_GFH14939.1_9416 (GFH14939)	0.15	0.07	0.0	0.26	0.45	0.36	0.65	0.21	0.58	1.0	0.39	0.37	0.53	0.37	0.76	0.35	0.35	0.69	0.07	0.35	0.89	0.36	0.96	0.41	0.13	0.16
lcl\|BLLF01000788.1_cds_GFH14961.1_9438 (GFH14961)	0.2	0.2	0.0	0.09	0.25	0.39	0.42	0.27	0.42	0.43	0.29	0.3	0.2	0.35	0.26	0.37	0.1	0.69	0.22	0.12	1.0	0.17	0.32	0.06	0.16	0.18
lcl\|BLLF01000788.1_cds_GFH14962.1_9439 (GFH14962)	0.16	0.15	0.0	0.09	0.28	0.47	0.63	0.53	0.59	0.42	0.32	0.23	0.45	0.53	0.32	0.2	0.05	0.88	0.16	0.04	1.0	0.08	0.57	0.08	0.12	0.35
lcl\|BLLF01000855.1_cds_GFH15480.1_9957 (GFH15480)	0.1	0.0	0.0	0.11	0.5	0.38	0.55	0.49	0.64	1.0	0.6	0.47	0.57	0.56	0.53	0.4	0.17	0.84	0.13	0.15	0.67	0.49	0.7	0.27	0.26	0.19
lcl\|BLLF01000917.1_cds_GFH15900.1_10377 (GFH15900)	0.25	0.0	0.0	0.93	0.1	0.05	0.71	0.0	0.59	1.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0	0.55	0.28	0.0	0.76	0.0	0.37	0.28	0.08	0.09
lcl\|BLLF01001026.1_cds_GFH16629.1_11106 (GFH16629)	0.58	0.24	0.15	0.21	0.25	0.3	0.66	0.27	0.53	1.0	0.26	0.23	0.24	0.29	0.66	0.17	0.24	0.54	0.33	0.1	0.57	0.23	0.44	0.15	0.28	0.16
lcl\|BLLF01001189.1_cds_GFH17716.1_12193 (GFH17716)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.3	1.0	0.15	0.0	0.0	0.15	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001252.1_cds_GFH18134.1_12611 (GFH18134)	0.31	0.09	0.13	0.33	0.19	0.28	0.38	0.17	0.42	1.0	0.14	0.19	0.19	0.1	0.52	0.29	0.29	0.23	0.19	0.1	0.22	0.0	0.31	0.19	0.19	0.17
lcl\|BLLF01001310.1_cds_GFH18503.1_12980 (GFH18503)	0.42	0.0	0.0	0.0	0.39	0.43	0.41	0.3	0.46	1.0	0.57	0.22	0.14	0.18	0.36	0.88	0.47	0.21	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.09	0.61	0.11
lcl\|BLLF01001365.1_cds_GFH18833.1_13310 (GFH18833)	0.32	0.0	0.0	0.06	0.25	0.4	0.52	0.24	0.42	1.0	0.2	0.28	0.26	0.21	0.19	0.32	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	0.46
lcl\|BLLF01001395.1_cds_GFH19032.1_13509 (GFH19032)	0.38	0.37	0.21	0.26	0.52	0.5	0.74	0.43	0.65	1.0	0.49	0.38	0.45	0.48	0.6	0.44	0.26	0.68	0.31	0.44	0.8	0.46	0.76	0.33	0.48	0.55
lcl\|BLLF01001455.1_cds_GFH19395.1_13872 (GFH19395)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.09	0.22	0.3	1.0	0.08	0.23	0.18	0.16	0.74	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001475.1_cds_GFH19511.1_13988 (GFH19511)	0.79	0.0	0.22	0.42	0.15	0.16	0.58	0.11	0.81	1.0	0.18	0.18	0.32	0.15	0.72	0.37	0.32	0.35	0.34	0.27	0.26	0.34	0.21	0.24	0.36	0.22
lcl\|BLLF01001520.1_cds_GFH19785.1_14262 (GFH19785)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.48	0.58	0.66	0.34	0.69	1.0	0.48	0.34	0.45	0.29	0.38	0.17	0.08	0.62	0.13	0.3	0.49	0.42	0.48	0.21	0.61	0.56
lcl\|BLLF01001626.1_cds_GFH20394.1_14871 (GFH20394)	0.0	0.0	0.0	0.04	0.18	0.35	0.18	0.08	0.37	0.32	0.15	0.21	0.07	0.1	0.25	0.45	1.0	0.09	0.0	0.07	0.0	0.0	0.09	0.07	0.06	0.06
lcl\|BLLF01001661.1_cds_GFH20582.1_15059 (GFH20582)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.15	0.34	0.19	0.4	1.0	0.08	0.13	0.11	0.13	0.12	0.24	0.52	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.37	0.03	0.42	0.34
lcl\|BLLF01001762.1_cds_GFH21096.1_15573 (GFH21096)	0.57	0.43	0.21	0.29	0.52	0.47	0.58	0.48	0.61	1.0	0.54	0.46	0.53	0.4	0.73	0.64	0.37	0.69	0.22	0.61	0.7	0.49	0.52	0.43	0.46	0.48
lcl\|BLLF01001765.1_cds_GFH21120.1_15597 (GFH21120)	0.06	0.04	0.0	0.01	0.31	0.37	0.29	0.42	0.42	0.39	0.19	0.15	0.48	0.33	0.47	0.11	0.08	0.66	0.19	0.14	1.0	0.08	0.54	0.03	0.14	0.16
lcl\|BLLF01001893.1_cds_GFH21725.1_16202 (GFH21725)	0.5	0.13	0.0	0.32	0.52	0.53	0.87	0.43	0.69	0.99	0.51	0.52	0.57	0.59	0.56	0.3	0.23	1.0	0.43	0.38	0.92	0.41	0.66	0.38	0.49	0.49
lcl\|BLLF01002141.1_cds_GFH22871.1_17348 (GFH22871)	0.32	0.01	0.0	0.15	0.33	0.14	0.23	0.23	0.28	1.0	0.23	0.18	0.15	0.18	0.15	0.07	0.0	0.19	0.27	0.23	0.19	0.07	0.05	0.19	0.18	0.1
lcl\|BLLF01002546.1_cds_GFH24476.1_18953 (GFH24476)	0.22	0.16	0.0	0.21	0.69	0.49	0.8	0.3	0.74	1.0	0.55	0.33	0.45	0.3	0.66	0.96	0.41	0.95	0.3	0.42	0.92	0.43	0.83	0.3	0.52	0.51
lcl\|BLLF01002590.1_cds_GFH24636.1_19113 (GFH24636)	0.36	0.0	0.0	0.0	0.51	0.53	0.34	0.38	0.35	0.16	0.43	0.29	0.39	0.2	0.48	1.0	0.86	0.18	0.27	0.31	0.08	0.29	0.0	0.2	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002620.1_cds_GFH24736.1_19213 (GFH24736)	0.67	0.32	0.32	0.3	0.59	0.63	0.65	0.51	0.7	0.83	0.56	0.57	0.53	0.45	0.65	0.69	1.0	0.43	0.54	0.54	0.38	0.4	0.4	0.44	0.35	0.34
lcl\|BLLF01002787.1_cds_GFH25345.1_19822 (GFH25345)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.32	0.05	0.25	1.0	0.07	0.05	0.03	0.0	0.4	0.42	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.14
lcl\|BLLF01002816.1_cds_GFH25444.1_19921 (GFH25444)	0.22	0.0	0.0	0.31	0.41	0.51	0.82	0.27	0.85	1.0	0.83	0.23	0.26	0.59	0.46	0.27	0.3	0.53	0.08	0.18	0.72	0.08	0.42	0.15	0.46	0.61
lcl\|BLLF01002942.1_cds_GFH25876.1_20353 (GFH25876)	0.11	0.0	0.0	0.19	0.2	0.22	0.42	0.2	1.0	0.88	0.21	0.14	0.26	0.43	0.81	0.08	0.18	0.58	0.1	0.05	0.09	0.0	0.19	0.05	0.07	0.15
lcl\|BLLF01003053.1_cds_GFH26196.1_20673 (GFH26196)	0.0	0.0	0.0	0.71	0.26	0.07	0.57	0.18	0.73	0.92	0.34	0.07	0.54	0.11	1.0	0.65	0.0	0.0	0.51	0.58	0.0	0.0	0.0	0.47	0.39	0.28
lcl\|BLLF01003170.1_cds_GFH26576.1_21053 (GFH26576)	0.0	0.0	0.0	0.46	0.16	0.15	0.24	0.0	0.67	1.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0
lcl\|BLLF01003237.1_cds_GFH26778.1_21255 (GFH26778)	0.55	0.0	0.0	0.07	0.52	0.48	0.54	0.46	0.74	0.67	0.54	0.23	0.53	0.39	0.32	0.85	0.59	0.45	0.0	0.0	0.41	0.0	1.0	0.02	0.27	0.17
lcl\|BLLF01003455.1_cds_GFH27385.1_21862 (GFH27385)	0.79	0.27	0.0	0.16	0.5	0.33	0.52	0.49	0.66	1.0	0.5	0.34	0.42	0.38	0.4	0.71	0.85	0.55	0.51	0.32	0.7	0.13	0.59	0.25	0.4	0.24
lcl\|BLLF01003544.1_cds_GFH27611.1_22088 (GFH27611)	0.62	0.0	0.0	0.14	0.33	0.38	0.43	0.07	0.41	0.81	0.35	0.28	0.32	0.2	0.33	1.0	0.21	0.67	0.5	0.66	0.46	0.35	0.89	0.4	0.57	0.42
lcl\|BLLF01003985.1_cds_GFH28667.1_23144 (GFH28667)	0.02	0.0	0.0	0.0	0.03	0.08	0.15	0.0	0.31	1.0	0.05	0.04	0.09	0.01	0.21	0.0	0.06	0.0	0.18	0.05	0.08	0.19	0.06	0.02	0.24	0.07
lcl\|BLLF01004332.1_cds_GFH29409.1_23886 (GFH29409)	0.33	0.0	0.0	0.0	0.35	0.46	0.27	0.44	0.5	0.04	0.37	0.24	0.43	0.34	0.37	0.88	1.0	0.23	0.0	0.16	0.44	0.29	0.36	0.02	0.05	0.04
lcl\|BLLF01004501.1_cds_GFH29737.1_24214 (GFH29737)	0.54	0.03	0.25	0.09	0.67	0.59	0.71	0.72	0.56	0.96	0.52	0.51	0.53	0.63	0.62	0.18	0.07	0.86	0.24	0.27	1.0	0.62	0.87	0.2	0.4	0.57
lcl\|BLLF01005125.1_cds_GFH30757.1_25234 (GFH30757)	0.14	0.01	0.22	0.3	0.05	0.11	0.26	0.04	0.36	1.0	0.07	0.06	0.11	0.05	0.21	0.02	0.01	0.1	0.08	0.01	0.1	0.03	0.08	0.02	0.12	0.09
lcl\|BLLF01005156.1_cds_GFH30807.1_25284 (GFH30807)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.17	0.26	0.03	0.51	1.0	0.02	0.07	0.22	0.01	0.64	0.0	0.0	0.02	0.07	0.11	0.03	0.11	0.03	0.01	0.07	0.03
lcl\|BLLF01006453.1_cds_GFH32267.1_26744 (GFH32267)	0.39	0.0	0.0	0.0	0.23	0.19	0.23	0.21	0.31	1.0	0.22	0.25	0.3	0.19	0.34	0.06	0.06	0.2	0.25	0.36	0.18	0.18	0.17	0.2	0.04	0.04
lcl\|BLLF01006556.1_cds_GFH32354.1_26831 (GFH32354)	0.15	0.0	0.0	0.04	0.15	0.03	0.24	0.2	0.24	1.0	0.2	0.11	0.2	0.2	0.36	0.38	0.04	0.34	0.06	0.14	0.18	0.2	0.42	0.1	0.01	0.0
lcl\|BLLF01007645.1_cds_GFH33045.1_27522 (GFH33045)	0.49	0.0	0.0	0.06	0.35	0.41	0.22	0.37	0.45	1.0	0.46	0.12	0.34	0.34	0.65	0.88	0.79	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.07	0.25	0.1
lcl\|BLLF01007900.1_cds_GFH33167.1_27644 (GFH33167)	0.56	0.0	0.0	0.08	0.38	0.25	0.29	0.23	0.32	0.71	0.26	0.15	0.34	0.17	0.53	1.0	0.57	0.52	0.16	0.52	0.54	0.28	0.56	0.48	0.51	0.39
lcl\|BLLF01008370.1_cds_GFH33346.1_27823 (GFH33346)	0.22	0.05	0.04	0.03	0.38	0.46	0.5	0.3	0.39	1.0	0.29	0.26	0.24	0.35	0.36	0.22	0.11	0.73	0.26	0.13	0.72	0.0	0.71	0.17	0.41	0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)