Heatmap: Cluster_85 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000105.1_cds_GFH07613.1_2090 (GFH07613)	0.25	0.08	0.0	0.25	0.06	0.09	0.28	0.06	0.42	0.26	0.08	0.23	0.46	0.16	0.43	0.58	0.19	0.96	0.45	0.23	0.98	0.37	1.0	0.36	0.53	0.18
lcl\|BLLF01000105.1_cds_GFH07614.1_2091 (GFH07614)	0.28	0.06	0.0	0.21	0.05	0.09	0.26	0.05	0.46	0.31	0.08	0.16	0.37	0.14	0.43	0.47	0.24	1.0	0.43	0.16	0.92	0.71	0.97	0.45	0.54	0.14
lcl\|BLLF01000159.1_cds_GFH08409.1_2886 (GFH08409)	0.18	0.0	0.0	0.12	0.01	0.06	0.22	0.0	0.2	0.16	0.01	0.03	0.1	0.01	0.28	0.0	0.39	0.59	0.0	0.1	1.0	0.0	0.94	0.09	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000233.1_cds_GFH09427.1_3904 (GFH09427)	0.18	0.0	0.0	0.14	0.29	0.27	0.36	0.44	0.66	1.0	0.34	0.28	0.39	0.36	0.61	0.22	0.27	0.48	0.37	0.27	0.67	0.23	0.46	0.25	0.33	0.29
lcl\|BLLF01000297.1_cds_GFH10223.1_4700 (GFH10223)	0.33	0.13	0.0	0.24	0.13	0.18	0.43	0.06	0.36	0.57	0.11	0.16	0.12	0.06	0.31	0.56	0.21	0.89	0.45	0.29	0.92	1.0	0.84	0.47	0.27	0.25
lcl\|BLLF01000318.1_cds_GFH10474.1_4951 (GFH10474)	0.42	0.39	0.26	0.6	0.11	0.09	0.29	0.09	0.55	0.94	0.12	0.12	0.18	0.1	0.59	0.3	0.14	0.69	0.44	0.31	0.61	1.0	0.67	0.6	0.27	0.14
lcl\|BLLF01000375.1_cds_GFH11109.1_5586 (GFH11109)	0.69	0.01	0.62	0.17	0.11	0.26	0.51	0.05	0.59	0.61	0.18	0.14	0.23	0.12	0.45	0.28	0.41	1.0	0.52	0.44	0.95	0.39	0.81	0.2	0.16	0.21
lcl\|BLLF01000480.1_cds_GFH12228.1_6705 (GFH12228)	0.61	0.0	0.0	0.0	0.34	0.43	0.42	0.45	0.56	1.0	0.36	0.41	0.52	0.33	0.66	0.72	0.65	0.77	0.61	0.92	0.82	0.96	0.98	0.39	0.56	0.28
lcl\|BLLF01000496.1_cds_GFH12369.1_6846 (GFH12369)	0.01	0.29	0.0	0.06	0.07	0.19	0.24	0.05	0.72	0.99	0.11	0.12	0.36	0.08	0.62	0.94	0.78	1.0	0.44	0.42	0.94	0.89	0.85	0.37	0.18	0.17
lcl\|BLLF01000511.1_cds_GFH12507.1_6984 (GFH12507)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.17	0.17	0.31	0.3	0.69	0.28	0.18	0.22	0.25	0.36	0.15	0.12	0.74	0.13	0.29	1.0	0.37	0.72	0.48	0.15	0.08
lcl\|BLLF01000533.1_cds_GFH12722.1_7199 (GFH12722)	0.27	0.07	0.0	0.12	0.01	0.03	0.26	0.01	0.48	0.64	0.01	0.02	0.04	0.01	0.3	0.29	0.13	0.8	0.4	0.18	1.0	0.4	0.69	0.2	0.09	0.07
lcl\|BLLF01000565.1_cds_GFH13006.1_7483 (GFH13006)	0.14	0.0	0.0	0.11	0.29	0.2	0.42	0.53	0.49	1.0	0.32	0.19	0.36	0.33	0.43	0.33	0.19	0.46	0.04	0.15	0.56	0.53	0.36	0.08	0.26	0.38
lcl\|BLLF01000584.1_cds_GFH13176.1_7653 (GFH13176)	0.47	0.17	0.45	0.25	0.27	0.3	0.36	0.45	0.48	0.88	0.28	0.23	0.33	0.32	0.44	0.28	0.21	0.98	0.32	0.37	0.97	0.21	1.0	0.24	0.09	0.12
lcl\|BLLF01000744.1_cds_GFH14580.1_9057 (GFH14580)	0.17	0.02	0.1	0.02	0.17	0.2	0.31	0.25	0.52	0.83	0.23	0.15	0.23	0.22	0.46	0.47	0.36	0.96	0.35	0.42	1.0	0.57	0.87	0.38	0.38	0.27
lcl\|BLLF01000767.1_cds_GFH14792.1_9269 (GFH14792)	0.15	0.0	0.0	0.21	0.01	0.0	0.16	0.02	0.28	0.36	0.01	0.02	0.02	0.03	0.23	0.13	0.15	1.0	0.22	0.59	0.68	0.62	0.29	0.37	0.11	0.04
lcl\|BLLF01000988.1_cds_GFH16385.1_10862 (GFH16385)	0.19	0.04	0.0	0.05	0.3	0.22	0.19	0.22	0.34	0.63	0.3	0.24	0.29	0.34	0.25	0.04	0.11	0.51	0.09	0.21	1.0	0.05	0.69	0.2	0.17	0.15
lcl\|BLLF01001051.1_cds_GFH16791.1_11268 (GFH16791)	0.32	0.21	0.0	0.12	0.32	0.35	0.31	0.42	0.39	0.71	0.31	0.22	0.29	0.28	0.33	0.44	0.6	0.4	0.36	0.24	1.0	0.0	0.96	0.2	0.21	0.21
lcl\|BLLF01001099.1_cds_GFH17124.1_11601 (GFH17124)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.36	0.36	0.4	0.65	0.72	1.0	0.4	0.4	0.5	0.56	0.85	0.27	0.32	0.9	0.34	0.41	0.79	0.48	0.96	0.33	0.25	0.35
lcl\|BLLF01001218.1_cds_GFH17884.1_12361 (GFH17884)	0.3	0.38	0.11	0.1	0.2	0.35	0.37	0.13	0.86	0.93	0.24	0.28	0.5	0.22	0.76	0.81	0.67	0.96	0.34	0.38	1.0	0.52	0.92	0.49	0.36	0.3
lcl\|BLLF01001224.1_cds_GFH17929.1_12406 (GFH17929)	0.05	0.0	0.0	0.82	0.46	0.39	0.5	0.65	0.82	0.53	0.56	0.42	0.68	0.57	0.88	1.0	0.97	0.78	0.55	0.85	0.92	0.76	0.44	0.59	0.32	0.23
lcl\|BLLF01001246.1_cds_GFH18094.1_12571 (GFH18094)	0.04	0.0	0.0	0.09	0.42	0.4	0.38	0.53	0.55	0.81	0.33	0.39	0.42	0.38	0.64	0.19	0.49	1.0	0.74	0.33	0.89	0.29	0.87	0.33	0.32	0.53
lcl\|BLLF01001382.1_cds_GFH18935.1_13412 (GFH18935)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.24	0.19	0.38	0.27	1.0	0.17	0.22	0.28	0.23	0.37	0.0	0.0	0.54	0.2	0.28	0.78	0.2	0.49	0.23	0.25	0.2
lcl\|BLLF01001488.1_cds_GFH19594.1_14071 (GFH19594)	0.18	0.19	0.11	0.18	0.21	0.23	0.28	0.19	0.38	1.0	0.24	0.17	0.33	0.2	0.33	0.4	0.53	0.76	0.47	0.56	0.62	0.72	0.52	0.47	0.5	0.56
lcl\|BLLF01001673.1_cds_GFH20640.1_15117 (GFH20640)	0.49	0.01	0.03	0.1	0.27	0.39	0.31	0.43	0.55	0.93	0.39	0.29	0.25	0.33	0.49	0.35	0.31	0.93	0.31	0.34	1.0	0.58	0.81	0.55	0.28	0.4
lcl\|BLLF01001673.1_cds_GFH20641.1_15118 (GFH20641)	0.25	0.01	0.14	0.09	0.33	0.41	0.28	0.38	0.5	1.0	0.41	0.31	0.27	0.35	0.44	0.38	0.24	0.77	0.35	0.28	0.82	0.3	0.72	0.33	0.27	0.35
lcl\|BLLF01001720.1_cds_GFH20897.1_15374 (GFH20897)	0.26	0.0	0.0	0.07	0.27	0.12	0.14	0.45	0.09	0.61	0.2	0.21	0.18	0.24	0.2	0.0	0.4	0.9	0.0	0.0	1.0	0.64	0.54	0.41	0.27	0.23
lcl\|BLLF01001986.1_cds_GFH22186.1_16663 (GFH22186)	0.33	0.24	0.0	0.52	0.44	0.4	0.52	0.65	0.95	0.88	0.39	0.38	0.54	0.53	0.8	0.48	0.59	1.0	0.52	0.65	1.0	0.48	0.68	0.35	0.4	0.39
lcl\|BLLF01002016.1_cds_GFH22330.1_16807 (GFH22330)	0.2	0.08	0.35	0.31	0.43	0.43	0.34	0.72	0.53	0.89	0.55	0.38	0.49	0.61	0.53	0.3	0.18	0.88	0.66	0.68	0.76	0.84	1.0	0.25	0.34	0.43
lcl\|BLLF01002050.1_cds_GFH22485.1_16962 (GFH22485)	0.35	0.0	0.0	0.03	0.51	0.23	0.19	0.52	0.26	1.0	0.16	0.15	0.13	0.11	0.28	0.66	0.95	0.98	0.74	0.59	0.59	0.37	0.66	0.33	0.72	0.87
lcl\|BLLF01002077.1_cds_GFH22601.1_17078 (GFH22601)	0.27	0.33	0.43	0.04	0.25	0.34	0.77	0.23	0.87	0.92	0.28	0.39	0.47	0.19	0.8	0.69	0.79	0.76	0.94	0.45	0.89	0.95	1.0	0.85	0.64	0.41
lcl\|BLLF01002136.1_cds_GFH22844.1_17321 (GFH22844)	0.0	0.02	0.0	0.0	0.06	0.02	0.17	0.13	0.09	0.18	0.09	0.07	0.05	0.05	0.22	0.33	0.33	1.0	0.5	0.61	0.46	0.47	0.63	0.35	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002380.1_cds_GFH23853.1_18330 (GFH23853)	0.29	0.0	0.0	0.0	0.32	0.29	0.31	0.43	0.49	1.0	0.27	0.39	0.37	0.27	0.62	0.61	0.54	0.5	0.85	0.83	0.57	0.85	0.53	0.33	0.25	0.11
lcl\|BLLF01002485.1_cds_GFH24262.1_18739 (GFH24262)	0.31	0.03	0.12	0.1	0.13	0.15	0.27	0.1	0.33	0.41	0.13	0.11	0.14	0.09	0.32	0.25	0.29	0.69	0.23	0.34	1.0	0.24	0.78	0.23	0.17	0.17
lcl\|BLLF01002510.1_cds_GFH24346.1_18823 (GFH24346)	0.15	0.13	0.11	0.07	0.23	0.21	0.27	0.27	0.45	0.91	0.22	0.21	0.28	0.19	0.45	0.82	0.56	0.87	0.36	1.0	0.73	0.74	0.64	0.47	0.66	0.51
lcl\|BLLF01002540.1_cds_GFH24447.1_18924 (GFH24447)	0.32	0.03	0.08	0.01	0.26	0.24	0.23	0.42	0.34	0.91	0.23	0.19	0.18	0.23	0.29	0.21	0.19	0.82	0.58	0.38	1.0	0.32	0.71	0.45	0.12	0.11
lcl\|BLLF01002668.1_cds_GFH24918.1_19395 (GFH24918)	0.04	0.0	0.0	0.39	0.15	0.04	0.13	0.4	0.06	1.0	0.17	0.04	0.13	0.29	0.19	0.0	0.0	0.57	0.0	0.45	0.67	0.14	0.53	0.08	0.09	0.12
lcl\|BLLF01003020.1_cds_GFH26097.1_20574 (GFH26097)	0.51	0.16	0.11	0.18	0.26	0.27	0.34	0.45	0.52	1.0	0.36	0.3	0.43	0.42	0.53	0.41	0.36	0.59	0.36	0.39	0.71	0.47	0.53	0.09	0.18	0.2
lcl\|BLLF01004107.1_cds_GFH28932.1_23409 (GFH28932)	0.15	0.01	0.17	0.29	0.22	0.31	0.35	0.12	0.39	0.47	0.21	0.19	0.28	0.16	0.38	0.57	0.45	0.74	0.26	0.41	1.0	0.36	0.78	0.33	0.45	0.33
lcl\|BLLF01004201.1_cds_GFH29140.1_23617 (GFH29140)	0.22	0.02	0.0	0.25	0.04	0.1	0.37	0.05	0.5	0.44	0.1	0.21	0.44	0.19	0.51	0.81	0.29	0.84	0.48	0.25	0.95	0.56	1.0	0.57	0.52	0.14
lcl\|BLLF01004461.1_cds_GFH29658.1_24135 (GFH29658)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.07	0.0	0.1	0.23	0.03	0.03	0.07	0.03	0.07	0.0	0.24	1.0	0.0	0.0	0.69	0.4	0.0	0.32	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004481.1_cds_GFH29692.1_24169 (GFH29692)	0.39	0.0	0.0	0.19	0.13	0.11	0.25	0.07	0.25	0.55	0.15	0.21	0.53	0.21	0.24	0.54	0.62	0.76	0.34	0.16	1.0	0.3	0.91	0.24	0.34	0.12
lcl\|BLLF01004493.1_cds_GFH29721.1_24198 (GFH29721)	0.08	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.45	0.0	0.17	0.0	0.0	0.17	0.0	0.48	1.0	0.0	0.21	0.35	0.79	0.25	0.45	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004528.1_cds_GFH29786.1_24263 (GFH29786)	0.35	0.08	0.04	0.28	0.54	0.43	0.37	0.38	0.44	1.0	0.47	0.38	0.37	0.35	0.51	0.89	0.67	0.66	0.5	0.78	0.51	0.67	0.69	0.42	0.48	0.57
lcl\|BLLF01005346.1_cds_GFH31069.1_25546 (GFH31069)	0.39	0.06	0.0	0.24	0.46	0.52	0.42	0.4	0.63	0.88	0.42	0.4	0.45	0.3	0.53	0.48	0.36	1.0	0.5	0.59	0.81	0.53	0.98	0.46	0.39	0.39
lcl\|BLLF01005417.1_cds_GFH31172.1_25649 (GFH31172)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.2	0.13	0.06	0.57	0.94	0.0	0.04	0.03	0.04	0.34	0.48	0.0	0.71	0.21	0.24	1.0	0.46	0.56	0.08	0.29	0.1
lcl\|BLLF01005929.1_cds_GFH31770.1_26247 (GFH31770)	0.56	0.24	0.0	0.72	0.32	0.39	0.36	0.48	0.55	1.0	0.37	0.36	0.46	0.44	0.47	0.4	0.15	0.67	0.63	0.48	0.69	0.57	0.77	0.24	0.35	0.38
lcl\|BLLF01005998.1_cds_GFH31846.1_26323 (GFH31846)	0.19	0.01	0.0	0.16	0.06	0.11	0.33	0.06	0.45	0.38	0.1	0.2	0.44	0.19	0.54	0.6	0.24	0.9	0.3	0.25	0.87	0.32	1.0	0.56	0.51	0.14
lcl\|BLLF01006451.1_cds_GFH32266.1_26743 (GFH32266)	0.03	0.01	0.0	0.13	0.27	0.18	0.25	0.34	0.43	1.0	0.29	0.27	0.41	0.41	0.4	0.16	0.45	0.91	0.28	0.46	0.59	0.61	0.84	0.47	0.15	0.13
lcl\|BLLF01007006.1_cds_GFH32707.1_27184 (GFH32707)	0.49	0.09	0.37	0.55	0.39	0.2	0.25	0.17	0.45	0.21	0.28	0.19	0.23	0.13	0.61	0.46	0.47	0.9	0.28	0.62	0.78	0.53	1.0	0.17	0.14	0.14
lcl\|BLLF01008427.1_cds_GFH33375.1_27852 (GFH33375)	0.22	0.17	0.0	0.3	0.38	0.28	0.25	0.4	0.35	0.72	0.28	0.19	0.24	0.3	0.36	0.23	0.27	0.62	0.29	0.53	1.0	0.14	0.63	0.24	0.04	0.03
lcl\|BLLF01008449.1_cds_GFH33385.1_27862 (GFH33385)	0.15	0.18	0.0	0.0	0.0	0.02	0.12	0.0	0.29	0.1	0.0	0.0	0.05	0.0	0.33	0.07	0.3	0.61	0.33	0.0	1.0	0.0	0.83	0.4	0.12	0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)