Heatmap: Cluster_113 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000004.1_cds_GFH05621.1_98 (GFH05621)	0.38	0.12	0.0	0.08	0.39	0.33	0.31	0.55	0.27	0.59	0.54	0.29	0.42	0.54	0.29	0.75	0.8	0.67	0.49	0.29	1.0	0.66	0.67	0.41	0.87	0.73
lcl\|BLLF01000005.1_cds_GFH05659.1_136 (GFH05659)	0.19	0.22	0.0	0.19	0.34	0.41	0.26	0.27	0.34	0.5	0.32	0.24	0.29	0.3	0.25	0.25	0.34	0.79	0.45	0.49	0.66	0.37	0.57	0.21	0.57	1.0
lcl\|BLLF01000035.1_cds_GFH06377.1_854 (GFH06377)	0.3	0.32	0.0	0.0	0.29	0.18	0.06	0.34	0.04	0.54	0.2	0.09	0.09	0.14	0.12	0.38	0.0	1.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.63	0.08	0.24	0.4
lcl\|BLLF01000036.1_cds_GFH06392.1_869 (GFH06392)	0.02	0.12	0.0	0.03	0.28	0.3	0.17	0.18	0.2	0.17	0.24	0.16	0.17	0.2	0.16	0.43	0.19	0.48	0.14	0.23	0.62	0.27	0.42	0.33	0.74	1.0
lcl\|BLLF01000036.1_cds_GFH06396.1_873 (GFH06396)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.55	0.15	0.0	0.1	0.0	0.35	0.25	0.17	0.25	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.98	0.0	0.35	0.0	0.9	1.0
lcl\|BLLF01000069.1_cds_GFH07021.1_1498 (GFH07021)	0.17	0.0	0.0	0.07	0.37	0.39	0.35	0.18	0.23	0.39	0.34	0.25	0.36	0.33	0.23	0.06	0.44	0.41	0.3	0.3	0.31	0.36	0.4	0.21	0.7	1.0
lcl\|BLLF01000093.1_cds_GFH07413.1_1890 (GFH07413)	0.02	0.05	0.0	0.0	0.26	0.23	0.11	0.25	0.15	0.34	0.25	0.27	0.24	0.23	0.14	0.32	0.19	0.87	0.21	0.22	0.91	0.34	1.0	0.06	0.44	0.61
lcl\|BLLF01000132.1_cds_GFH08033.1_2510 (GFH08033)	0.19	0.28	0.0	0.42	0.37	0.25	0.25	0.41	0.32	0.55	0.37	0.33	0.32	0.53	0.23	0.1	0.28	1.0	0.43	0.2	0.91	0.21	0.94	0.22	0.69	0.8
lcl\|BLLF01000132.1_cds_GFH08034.1_2511 (GFH08034)	0.16	0.1	0.0	0.36	0.29	0.34	0.18	0.3	0.23	0.16	0.43	0.33	0.2	0.24	0.25	0.11	0.24	0.9	0.32	0.22	0.77	0.0	0.34	0.08	0.65	1.0
lcl\|BLLF01000137.1_cds_GFH08098.1_2575 (GFH08098)	0.21	0.24	0.0	0.07	0.3	0.14	0.38	0.14	0.31	0.43	0.5	0.29	0.36	0.34	0.28	0.22	0.16	0.25	0.14	0.2	0.18	0.27	0.25	0.17	0.51	1.0
lcl\|BLLF01000172.1_cds_GFH08611.1_3088 (GFH08611)	0.44	0.14	0.24	0.26	0.3	0.45	0.35	0.24	0.33	0.54	0.37	0.31	0.41	0.4	0.28	0.48	0.47	0.89	0.43	0.66	1.0	0.67	0.69	0.18	0.49	0.83
lcl\|BLLF01000267.1_cds_GFH09835.1_4312 (GFH09835)	0.07	0.0	0.0	0.0	0.05	0.13	0.09	0.44	0.35	0.0	0.21	0.11	0.15	0.16	0.2	0.0	0.0	1.0	0.81	0.42	0.89	0.45	0.83	0.07	0.88	0.73
lcl\|BLLF01000281.1_cds_GFH10018.1_4495 (GFH10018)	0.37	0.33	0.25	0.48	0.65	0.45	0.47	0.58	0.51	0.79	0.59	0.43	0.42	0.61	0.47	0.46	0.36	0.91	0.37	0.29	0.58	0.18	1.0	0.35	0.76	0.86
lcl\|BLLF01000307.1_cds_GFH10337.1_4814 (GFH10337)	0.25	0.04	0.0	0.04	0.19	0.23	0.16	0.12	0.14	0.63	0.21	0.21	0.17	0.23	0.1	0.16	0.24	0.44	0.19	0.24	0.57	0.05	0.22	0.14	0.57	1.0
lcl\|BLLF01000320.1_cds_GFH10487.1_4964 (GFH10487)	0.12	0.11	0.0	0.04	0.12	0.21	0.15	0.09	0.17	0.58	0.16	0.15	0.11	0.12	0.1	0.17	0.11	0.47	0.25	0.46	0.51	0.16	0.4	0.15	0.67	1.0
lcl\|BLLF01000321.1_cds_GFH10506.1_4983 (GFH10506)	0.65	0.45	0.11	0.23	0.57	0.76	0.58	0.39	0.68	1.0	0.72	0.48	0.51	0.48	0.45	0.89	0.49	0.9	0.17	0.27	1.0	0.4	0.81	0.72	0.95	0.99
lcl\|BLLF01000390.1_cds_GFH11287.1_5764 (GFH11287)	0.25	0.07	0.0	0.17	0.17	0.24	0.18	0.04	0.31	0.88	0.21	0.12	0.11	0.09	0.12	0.0	0.15	0.39	0.19	0.0	1.0	0.0	0.4	0.36	0.42	0.79
lcl\|BLLF01000390.1_cds_GFH11291.1_5768 (GFH11291)	0.1	0.08	0.0	0.07	0.26	0.16	0.22	0.16	0.25	0.44	0.18	0.15	0.18	0.16	0.15	0.31	0.0	0.42	0.16	0.04	1.0	0.0	0.36	0.02	0.32	0.43
lcl\|BLLF01000495.1_cds_GFH12359.1_6836 (GFH12359)	0.04	0.04	0.0	0.14	0.24	0.47	0.42	0.13	0.33	0.34	0.35	0.34	0.36	0.27	0.3	0.35	0.4	0.62	0.38	0.49	0.77	0.31	0.43	0.21	0.75	1.0
lcl\|BLLF01000507.1_cds_GFH12474.1_6951 (GFH12474)	0.19	0.21	0.0	0.1	0.38	0.4	0.35	0.3	0.35	0.7	0.38	0.36	0.26	0.31	0.23	0.4	0.38	0.62	0.18	0.25	0.67	0.28	0.5	0.41	0.75	1.0
lcl\|BLLF01000538.1_cds_GFH12764.1_7241 (GFH12764)	0.06	0.08	0.0	0.01	0.17	0.36	0.25	0.13	0.14	0.31	0.26	0.22	0.14	0.16	0.14	0.29	0.27	0.64	0.0	0.36	0.88	0.32	1.0	0.11	0.24	0.53
lcl\|BLLF01000559.1_cds_GFH12967.1_7444 (GFH12967)	0.3	0.07	0.12	0.09	0.15	0.28	0.26	0.1	0.26	0.53	0.22	0.22	0.25	0.23	0.25	0.5	0.33	0.9	0.71	0.9	0.77	0.59	0.65	0.06	0.67	1.0
lcl\|BLLF01000589.1_cds_GFH13236.1_7713 (GFH13236)	0.17	0.06	0.0	0.08	0.4	0.35	0.34	0.31	0.36	0.57	0.42	0.31	0.33	0.37	0.2	0.36	0.58	0.89	0.34	0.43	0.87	0.29	0.6	0.29	0.87	1.0
lcl\|BLLF01000729.1_cds_GFH14467.1_8944 (GFH14467)	0.16	0.79	0.09	0.22	0.25	0.29	0.32	0.27	0.48	0.54	0.16	0.37	0.21	0.14	0.7	0.66	0.57	0.81	0.29	0.4	0.97	0.58	0.79	0.43	0.78	1.0
lcl\|BLLF01000733.1_cds_GFH14505.1_8982 (GFH14505)	0.19	0.0	0.0	0.0	0.12	0.1	0.17	0.11	0.21	0.26	0.08	0.08	0.23	0.08	0.19	0.37	0.14	0.72	0.0	0.25	1.0	0.0	0.29	0.0	0.57	0.71
lcl\|BLLF01000737.1_cds_GFH14526.1_9003 (GFH14526)	0.18	0.0	0.0	0.07	0.07	0.11	0.11	0.12	0.25	0.18	0.09	0.11	0.06	0.07	0.1	0.51	0.13	0.5	0.35	1.0	0.45	0.3	0.39	0.11	0.67	0.93
lcl\|BLLF01000740.1_cds_GFH14550.1_9027 (GFH14550)	0.16	0.03	0.0	0.03	0.14	0.19	0.19	0.14	0.13	0.49	0.24	0.22	0.19	0.12	0.11	0.39	0.23	0.78	0.0	0.15	1.0	0.29	0.84	0.16	0.54	0.44
lcl\|BLLF01000760.1_cds_GFH14742.1_9219 (GFH14742)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.11	0.08	0.02	0.11	0.26	0.13	0.1	0.07	0.1	0.19	0.0	0.0	0.86	0.22	0.0	0.79	0.46	1.0	0.07	0.36	0.35
lcl\|BLLF01000941.1_cds_GFH16075.1_10552 (GFH16075)	0.04	0.9	0.06	0.02	0.37	0.31	0.28	0.29	0.32	0.44	0.33	0.28	0.44	0.19	0.2	0.43	0.45	0.86	0.5	0.23	1.0	0.66	0.77	0.39	0.69	0.9
lcl\|BLLF01000976.1_cds_GFH16300.1_10777 (GFH16300)	0.03	0.08	0.0	0.01	0.05	0.17	0.17	0.03	0.16	0.15	0.08	0.14	0.26	0.04	0.11	0.15	0.14	0.35	0.17	0.06	1.0	0.33	0.21	0.02	0.4	0.92
lcl\|BLLF01001008.1_cds_GFH16512.1_10989 (GFH16512)	0.16	0.0	0.0	0.21	0.14	0.14	0.09	0.07	0.1	0.46	0.08	0.14	0.16	0.21	0.02	0.16	0.49	0.64	0.19	0.0	0.7	0.2	0.38	0.28	1.0	0.48
lcl\|BLLF01001269.1_cds_GFH18240.1_12717 (GFH18240)	0.13	0.0	0.0	0.0	0.23	0.29	0.26	0.34	0.3	0.25	0.33	0.21	0.34	0.35	0.26	0.19	0.24	1.0	0.36	0.15	0.88	0.34	0.9	0.15	0.47	0.76
lcl\|BLLF01001314.1_cds_GFH18529.1_13006 (GFH18529)	0.07	0.0	0.0	0.0	0.34	0.37	0.45	0.28	0.36	0.67	0.49	0.38	0.32	0.29	0.16	0.31	0.93	0.49	0.0	0.21	0.9	0.65	0.81	0.29	1.0	0.84
lcl\|BLLF01001499.1_cds_GFH19662.1_14139 (GFH19662)	0.12	0.02	0.0	0.11	0.2	0.29	0.14	0.25	0.1	0.28	0.17	0.17	0.24	0.28	0.19	0.25	0.4	0.31	0.0	0.16	0.37	0.12	0.15	0.25	0.59	1.0
lcl\|BLLF01001547.1_cds_GFH19955.1_14432 (GFH19955)	0.33	0.43	0.0	0.43	0.22	0.29	0.23	0.11	0.17	0.41	0.26	0.22	0.23	0.25	0.1	0.39	0.63	0.94	0.59	0.3	0.93	0.12	0.63	0.31	0.69	1.0
lcl\|BLLF01001698.1_cds_GFH20797.1_15274 (GFH20797)	0.24	0.28	0.07	0.06	0.28	0.33	0.26	0.23	0.23	0.59	0.32	0.29	0.24	0.28	0.17	0.38	0.36	0.61	0.17	0.31	1.0	0.36	0.43	0.44	0.56	0.81
lcl\|BLLF01001768.1_cds_GFH21143.1_15620 (GFH21143)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.65	0.5	0.2	0.3	0.21	0.59	0.56	0.24	0.17	0.2	0.15	0.11	0.35	0.35	0.0	0.96	0.18	0.57	0.11	0.51	1.0
lcl\|BLLF01001770.1_cds_GFH21157.1_15634 (GFH21157)	0.26	0.21	0.01	0.31	0.41	0.44	0.42	0.26	0.34	0.57	0.4	0.42	0.27	0.28	0.15	0.49	0.51	0.38	0.13	0.24	0.77	0.55	0.57	0.63	0.72	1.0
lcl\|BLLF01001948.1_cds_GFH22004.1_16481 (GFH22004)	0.0	0.04	0.0	0.0	0.14	0.17	0.16	0.39	0.14	0.03	0.14	0.13	0.25	0.28	0.14	0.51	0.14	0.98	0.0	0.15	1.0	0.17	0.79	0.09	0.47	0.45
lcl\|BLLF01002068.1_cds_GFH22567.1_17044 (GFH22567)	0.27	0.28	0.18	0.16	0.19	0.24	0.29	0.2	0.28	0.24	0.35	0.33	0.42	0.32	0.38	0.12	0.19	0.51	0.2	0.18	0.69	0.45	0.39	0.22	0.52	1.0
lcl\|BLLF01002068.1_cds_GFH22568.1_17045 (GFH22568)	0.12	0.09	0.0	0.14	0.18	0.26	0.43	0.25	0.22	0.28	0.28	0.46	0.29	0.4	0.3	0.13	0.24	0.59	0.17	0.22	0.6	0.15	0.37	0.2	0.5	1.0
lcl\|BLLF01002079.1_cds_GFH22609.1_17086 (GFH22609)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.14	0.29	0.2	0.07	0.45	0.08	0.0	0.0	0.12	0.07	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.05	0.12	0.23
lcl\|BLLF01002278.1_cds_GFH23461.1_17938 (GFH23461)	0.18	0.18	0.0	0.16	0.27	0.21	0.21	0.32	0.22	0.65	0.35	0.19	0.26	0.23	0.2	0.43	0.23	0.62	0.46	0.55	0.6	0.65	0.37	0.27	0.88	1.0
lcl\|BLLF01002684.1_cds_GFH24979.1_19456 (GFH24979)	0.1	0.03	0.0	0.31	0.14	0.47	0.11	0.18	0.13	0.7	0.33	0.23	0.28	0.38	0.06	0.39	0.48	0.6	0.26	0.13	0.76	0.28	0.37	0.36	0.77	1.0
lcl\|BLLF01002768.1_cds_GFH25268.1_19745 (GFH25268)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.25	0.36	0.31	0.3	0.0	0.7	0.37	0.31	0.27	0.1	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.24	1.0
lcl\|BLLF01003072.1_cds_GFH26256.1_20733 (GFH26256)	0.35	0.08	0.0	0.11	0.16	0.19	0.1	0.18	0.13	0.33	0.18	0.14	0.08	0.12	0.09	0.4	0.19	0.42	0.44	0.61	0.48	0.46	0.31	0.22	0.53	1.0
lcl\|BLLF01003447.1_cds_GFH27364.1_21841 (GFH27364)	0.16	0.09	0.0	0.43	0.27	0.46	0.4	0.25	0.35	0.26	0.45	0.3	0.44	0.44	0.36	0.32	0.36	0.48	0.29	0.42	0.47	0.51	0.51	0.26	0.76	1.0
lcl\|BLLF01003484.1_cds_GFH27462.1_21939 (GFH27462)	0.0	0.06	0.0	0.0	0.16	0.29	0.37	0.16	0.27	0.2	0.26	0.28	0.17	0.36	0.12	0.43	0.21	1.0	0.17	0.28	0.61	0.18	0.88	0.18	0.15	0.67
lcl\|BLLF01003626.1_cds_GFH27806.1_22283 (GFH27806)	0.28	0.12	0.0	0.11	0.24	0.19	0.1	0.25	0.12	0.29	0.19	0.2	0.15	0.2	0.13	0.04	0.06	0.83	0.96	0.43	1.0	0.4	0.8	0.14	0.99	0.86
lcl\|BLLF01003987.1_cds_GFH28673.1_23150 (GFH28673)	0.04	0.29	0.0	0.11	0.36	0.44	0.38	0.27	0.26	0.17	0.47	0.14	0.29	0.2	0.22	0.12	0.09	0.36	0.0	0.0	0.25	0.0	0.18	0.07	0.34	1.0
lcl\|BLLF01004488.1_cds_GFH29708.1_24185 (GFH29708)	0.28	0.23	0.04	0.26	0.21	0.22	0.27	0.14	0.24	0.4	0.24	0.2	0.28	0.13	0.26	0.32	0.2	0.72	0.22	0.37	0.82	0.17	0.73	0.14	0.57	1.0
lcl\|BLLF01004942.1_cds_GFH30491.1_24968 (GFH30491)	0.13	0.34	0.0	0.15	0.43	0.51	0.45	0.21	0.38	0.67	0.44	0.34	0.33	0.29	0.27	0.67	0.63	0.58	0.1	0.21	0.7	0.36	0.48	0.48	0.94	1.0
lcl\|BLLF01005689.1_cds_GFH31517.1_25994 (GFH31517)	0.0	0.24	0.0	0.04	0.48	0.34	0.42	0.18	0.19	0.29	0.31	0.21	0.15	0.3	0.11	0.27	0.1	0.0	0.0	0.0	0.59	0.34	0.42	0.13	0.59	1.0
lcl\|BLLF01005700.1_cds_GFH31533.1_26010 (GFH31533)	0.04	0.02	0.0	0.11	0.26	0.32	0.34	0.3	0.37	0.12	0.59	0.37	0.32	0.72	0.26	0.07	0.15	0.54	0.11	0.04	0.35	0.08	0.48	0.1	0.58	1.0
lcl\|BLLF01005767.1_cds_GFH31603.1_26080 (GFH31603)	0.06	0.13	0.0	0.35	0.09	0.26	0.22	0.04	0.22	0.45	0.2	0.25	0.21	0.43	0.2	0.43	0.32	1.0	0.5	0.28	0.92	0.26	0.66	0.42	0.69	0.7
lcl\|BLLF01006446.1_cds_GFH32263.1_26740 (GFH32263)	0.36	0.23	0.0	0.05	0.17	0.24	0.2	0.12	0.26	0.47	0.18	0.22	0.18	0.21	0.11	0.28	0.61	0.53	0.13	0.24	0.64	0.29	0.55	0.13	0.67	1.0
lcl\|BLLF01006660.1_cds_GFH32451.1_26928 (GFH32451)	0.01	0.26	0.0	0.0	0.0	0.09	0.09	0.01	0.18	0.24	0.02	0.05	0.36	0.01	0.17	0.0	0.17	0.71	0.44	0.08	0.76	0.25	0.5	0.15	0.47	1.0
lcl\|BLLF01007652.1_cds_GFH33049.1_27526 (GFH33049)	0.05	0.0	0.0	0.3	0.11	0.24	0.24	0.13	0.08	0.91	0.2	0.17	0.33	0.25	0.05	1.0	0.59	0.29	0.2	0.17	0.67	0.26	0.42	0.45	0.6	1.0
lcl\|BLLF01007721.1_cds_GFH33084.1_27561 (GFH33084)	0.22	0.09	0.0	0.25	0.07	0.16	0.07	0.08	0.1	0.6	0.08	0.05	0.09	0.07	0.04	0.0	0.31	0.59	0.0	0.34	1.0	0.1	0.07	0.39	0.93	0.8
lcl\|BLLF01009055.1_cds_GFH33602.1_28079 (GFH33602)	0.06	0.0	0.0	0.0	0.13	0.05	0.38	0.02	0.18	0.17	0.19	0.05	0.28	0.4	0.15	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.06	0.64	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)