Heatmap: Cluster_265 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000005.1_cds_GFH05658.1_135 (GFH05658)	0.65	0.41	0.51	1.0	0.37	0.42	0.29	0.18	0.3	0.62	0.35	0.26	0.32	0.21	0.33	0.36	0.31	0.41	0.59	0.67	0.61	0.36	0.66	0.24	0.74	0.85
lcl\|BLLF01000024.1_cds_GFH06133.1_610 (GFH06133)	0.49	0.06	0.0	0.03	0.17	0.27	0.08	0.23	0.28	0.86	0.21	0.21	0.1	0.3	0.26	0.63	0.34	0.3	0.15	0.25	0.36	0.21	0.11	0.14	0.77	1.0
lcl\|BLLF01000065.1_cds_GFH06945.1_1422 (GFH06945)	0.64	0.25	0.88	0.44	0.39	0.46	0.38	0.49	0.6	1.0	0.43	0.36	0.42	0.41	0.45	0.46	0.44	0.68	0.59	0.59	0.79	0.67	0.58	0.27	0.9	0.71
lcl\|BLLF01000088.1_cds_GFH07332.1_1809 (GFH07332)	0.07	0.1	0.21	0.05	0.1	0.17	0.17	0.08	0.21	0.6	0.07	0.08	0.12	0.07	0.1	0.59	0.35	0.41	0.73	0.54	0.44	0.54	0.39	0.17	1.0	0.76
lcl\|BLLF01000095.1_cds_GFH07452.1_1929 (GFH07452)	0.0	0.0	0.0	0.07	0.09	0.2	0.07	0.02	0.06	0.28	0.07	0.04	0.09	0.06	0.13	1.0	0.15	0.16	0.0	0.4	0.43	0.0	0.16	0.13	0.58	0.98
lcl\|BLLF01000138.1_cds_GFH08114.1_2591 (GFH08114)	0.41	0.03	0.0	0.12	0.17	0.0	0.03	0.1	0.04	0.61	0.02	0.02	0.02	0.07	0.13	0.92	0.25	1.0	0.29	0.44	0.97	0.1	0.19	0.24	0.3	0.62
lcl\|BLLF01000151.1_cds_GFH08292.1_2769 (GFH08292)	0.01	0.02	0.06	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.68	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.37	1.0	0.21	0.57	0.26	0.26	0.76	0.3	0.1	0.9	0.41
lcl\|BLLF01000152.1_cds_GFH08300.1_2777 (GFH08300)	0.25	0.09	0.16	0.71	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.01	0.03	0.04	0.52	0.02	0.42	0.79	0.88	0.35	1.0	0.21	0.12	0.63	0.42
lcl\|BLLF01000192.1_cds_GFH08893.1_3370 (GFH08893)	0.23	0.04	0.0	0.54	0.24	0.18	0.2	0.09	0.14	0.27	0.24	0.18	0.17	0.22	0.24	0.54	0.04	0.56	0.35	1.0	0.25	0.23	0.08	0.04	0.96	0.56
lcl\|BLLF01000211.1_cds_GFH09125.1_3602 (GFH09125)	0.22	0.38	0.25	0.41	0.25	0.34	0.39	0.21	0.21	0.52	0.29	0.22	0.34	0.28	0.18	0.98	0.95	1.0	0.57	0.54	0.76	0.4	0.7	0.38	0.65	0.78
lcl\|BLLF01000320.1_cds_GFH10496.1_4973 (GFH10496)	0.4	0.06	0.0	0.54	0.29	0.31	0.34	0.1	0.27	0.59	0.3	0.24	0.35	0.22	0.21	0.35	0.74	1.0	0.38	0.51	0.75	0.52	0.81	0.26	0.85	0.66
lcl\|BLLF01000360.1_cds_GFH10940.1_5417 (GFH10940)	0.52	0.3	0.0	0.56	0.03	0.03	0.0	0.03	0.12	0.4	0.06	0.06	0.03	0.03	0.12	0.28	0.42	0.22	1.0	0.19	0.61	0.35	0.44	0.1	0.36	0.57
lcl\|BLLF01000409.1_cds_GFH11489.1_5966 (GFH11489)	0.17	0.29	0.35	0.19	0.3	0.16	0.2	0.44	0.23	1.0	0.38	0.32	0.36	0.4	0.36	0.57	0.73	0.68	0.96	0.9	0.66	0.6	0.59	0.51	0.68	0.53
lcl\|BLLF01000435.1_cds_GFH11781.1_6258 (GFH11781)	0.14	0.33	0.23	0.01	0.16	0.16	0.12	0.07	0.16	1.0	0.2	0.12	0.11	0.19	0.09	0.52	0.56	0.65	0.39	0.64	0.65	0.46	0.49	0.24	0.8	0.37
lcl\|BLLF01000474.1_cds_GFH12167.1_6644 (GFH12167)	0.42	0.21	0.12	0.23	0.3	0.34	0.1	0.31	0.13	0.38	0.3	0.17	0.25	0.24	0.06	0.56	0.57	0.62	0.48	0.64	0.43	0.56	0.47	0.25	1.0	0.4
lcl\|BLLF01000474.1_cds_GFH12168.1_6645 (GFH12168)	0.46	0.06	0.0	0.2	0.17	0.44	0.18	0.32	0.17	0.64	0.41	0.22	0.35	0.43	0.08	0.6	1.0	0.7	0.35	0.99	0.4	0.93	0.58	0.28	0.84	0.3
lcl\|BLLF01000513.1_cds_GFH12542.1_7019 (GFH12542)	0.0	0.04	0.0	0.05	0.21	0.12	0.05	0.0	0.08	0.33	0.2	0.05	0.04	0.05	0.08	0.63	0.12	0.0	0.37	0.31	0.51	0.19	0.61	0.18	0.71	1.0
lcl\|BLLF01000530.1_cds_GFH12688.1_7165 (GFH12688)	0.37	0.16	0.09	0.19	0.33	0.23	0.18	0.25	0.41	0.93	0.29	0.18	0.33	0.19	0.37	1.0	0.69	0.74	0.45	0.78	0.86	0.52	0.53	0.27	0.45	0.92
lcl\|BLLF01000531.1_cds_GFH12700.1_7177 (GFH12700)	0.06	0.07	0.0	0.1	0.3	0.11	0.17	0.07	0.17	0.28	0.21	0.16	0.18	0.11	0.07	0.63	0.94	0.68	0.19	1.0	0.43	0.49	0.98	0.25	0.97	0.95
lcl\|BLLF01000531.1_cds_GFH12701.1_7178 (GFH12701)	0.16	0.26	0.0	0.14	0.18	0.15	0.15	0.06	0.18	0.59	0.18	0.12	0.16	0.08	0.11	0.94	0.99	0.94	0.29	0.57	0.94	0.32	1.0	0.06	0.79	0.99
lcl\|BLLF01000556.1_cds_GFH12935.1_7412 (GFH12935)	0.69	0.12	0.3	0.29	0.32	0.2	0.37	0.25	0.3	0.17	0.24	0.22	0.29	0.24	0.29	0.43	0.38	1.0	0.68	0.81	0.99	0.94	0.92	0.38	0.69	0.64
lcl\|BLLF01000660.1_cds_GFH13866.1_8343 (GFH13866)	0.14	0.13	0.06	0.2	0.17	0.22	0.23	0.12	0.2	0.38	0.13	0.12	0.13	0.13	0.11	1.0	0.23	0.36	0.19	0.13	0.58	0.37	0.45	0.31	0.41	0.59
lcl\|BLLF01000675.1_cds_GFH13998.1_8475 (GFH13998)	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.19	0.53	0.59	0.15	1.0	0.73	0.49	0.16	0.05	0.7	0.42
lcl\|BLLF01000717.1_cds_GFH14367.1_8844 (GFH14367)	0.53	0.0	0.0	0.25	0.08	0.11	0.1	0.02	0.14	0.58	0.1	0.06	0.05	0.05	0.07	0.36	1.0	0.32	0.18	0.68	0.39	0.44	0.55	0.21	0.64	0.34
lcl\|BLLF01000729.1_cds_GFH14465.1_8942 (GFH14465)	0.21	0.21	0.0	0.06	0.23	0.25	0.29	0.24	0.27	0.78	0.23	0.25	0.29	0.23	0.28	1.0	0.65	0.5	0.23	0.28	0.83	0.36	0.63	0.32	0.42	0.52
lcl\|BLLF01000807.1_cds_GFH15110.1_9587 (GFH15110)	0.17	0.0	0.0	0.05	0.11	0.21	0.19	0.11	0.27	0.15	0.28	0.13	0.15	0.15	0.11	0.72	0.62	0.77	0.24	0.34	0.64	0.11	0.74	0.28	0.71	1.0
lcl\|BLLF01000944.1_cds_GFH16097.1_10574 (GFH16097)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.11	0.18	0.13	0.14	0.14	0.69	0.08	0.18	0.18	0.12	0.07	0.96	0.19	0.25	0.0	0.21	0.42	0.64	0.35	0.18	0.4	1.0
lcl\|BLLF01001115.1_cds_GFH17224.1_11701 (GFH17224)	0.18	0.0	0.0	0.0	0.04	0.1	0.08	0.04	0.04	0.29	0.04	0.05	0.12	0.05	0.02	1.0	0.25	0.44	0.35	0.29	0.64	0.66	0.47	0.1	0.34	0.65
lcl\|BLLF01001124.1_cds_GFH17285.1_11762 (GFH17285)	0.57	0.73	0.42	0.82	0.46	0.52	0.58	0.5	0.58	0.87	0.5	0.51	0.5	0.47	0.64	0.99	0.73	0.91	0.58	0.9	0.94	0.96	0.81	0.55	0.58	1.0
lcl\|BLLF01001328.1_cds_GFH18613.1_13090 (GFH18613)	0.32	0.07	0.0	0.04	0.35	0.3	0.32	0.21	0.25	0.65	0.37	0.14	0.19	0.37	0.13	1.0	0.26	0.64	0.15	0.14	0.42	0.38	0.54	0.17	0.46	0.86
lcl\|BLLF01001339.1_cds_GFH18688.1_13165 (GFH18688)	0.43	0.0	0.0	0.02	0.24	0.27	0.24	0.23	0.16	0.92	0.32	0.21	0.2	0.22	0.18	0.96	0.0	0.64	0.42	0.63	0.9	0.34	0.68	0.16	0.3	1.0
lcl\|BLLF01001534.1_cds_GFH19878.1_14355 (GFH19878)	0.32	0.0	0.0	0.62	0.25	0.13	0.23	0.14	0.18	0.11	0.4	0.18	0.29	0.17	0.2	0.4	1.0	0.87	0.74	0.37	0.51	0.29	0.18	0.34	0.58	0.49
lcl\|BLLF01001784.1_cds_GFH21229.1_15706 (GFH21229)	0.1	0.0	0.0	0.03	0.17	0.16	0.17	0.19	0.15	0.66	0.21	0.15	0.26	0.15	0.03	0.73	0.31	0.4	0.0	0.07	0.34	0.13	0.24	0.07	0.34	1.0
lcl\|BLLF01001838.1_cds_GFH21479.1_15956 (GFH21479)	0.38	0.2	0.05	0.01	0.21	0.17	0.14	0.17	0.16	0.76	0.18	0.11	0.08	0.11	0.11	1.0	0.37	0.52	0.25	0.47	0.69	0.56	0.55	0.18	0.41	0.63
lcl\|BLLF01001840.1_cds_GFH21494.1_15971 (GFH21494)	0.07	0.58	0.0	0.75	0.35	0.27	0.28	0.2	0.33	1.0	0.3	0.24	0.22	0.21	0.39	0.81	0.65	0.68	0.24	0.8	0.72	0.5	0.42	0.25	0.4	0.56
lcl\|BLLF01002086.1_cds_GFH22641.1_17118 (GFH22641)	0.34	0.31	0.0	0.12	0.3	0.33	0.37	0.16	0.26	0.82	0.42	0.3	0.26	0.29	0.3	1.0	0.43	0.7	0.06	0.17	0.96	0.39	0.41	0.26	0.64	0.86
lcl\|BLLF01002097.1_cds_GFH22677.1_17154 (GFH22677)	0.0	0.27	0.0	0.14	0.14	0.23	0.28	0.17	0.04	0.6	0.05	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.33	0.5	0.85	0.46	0.0	0.0	0.06	1.0	0.54
lcl\|BLLF01002179.1_cds_GFH23042.1_17519 (GFH23042)	0.06	0.18	0.0	0.03	0.16	0.18	0.21	0.1	0.23	0.57	0.15	0.16	0.2	0.14	0.15	0.72	0.35	0.56	0.2	0.31	0.6	0.72	0.54	0.34	0.79	1.0
lcl\|BLLF01002206.1_cds_GFH23164.1_17641 (GFH23164)	0.12	0.43	0.04	0.06	0.24	0.3	0.35	0.21	0.35	0.59	0.22	0.25	0.28	0.2	0.24	1.0	0.74	0.57	0.15	0.23	0.65	0.21	0.69	0.13	0.45	0.78
lcl\|BLLF01002225.1_cds_GFH23242.1_17719 (GFH23242)	0.37	0.17	0.0	0.18	0.3	0.28	0.24	0.22	0.39	0.59	0.27	0.31	0.23	0.21	0.28	1.0	0.13	0.35	0.13	0.29	0.42	0.53	0.28	0.19	0.68	0.88
lcl\|BLLF01002438.1_cds_GFH24083.1_18560 (GFH24083)	0.28	0.07	0.0	0.1	0.36	0.34	0.23	0.46	0.3	0.28	0.36	0.27	0.2	0.26	0.22	1.0	0.45	0.56	0.25	0.48	0.64	0.39	0.5	0.23	0.39	0.79
lcl\|BLLF01002575.1_cds_GFH24581.1_19058 (GFH24581)	0.12	0.14	0.62	1.0	0.19	0.29	0.16	0.05	0.25	0.47	0.25	0.19	0.19	0.17	0.16	0.16	0.12	0.26	0.58	0.71	0.33	0.41	0.51	0.17	0.49	0.5
lcl\|BLLF01002715.1_cds_GFH25087.1_19564 (GFH25087)	0.57	0.37	0.43	0.3	0.39	0.42	0.61	0.24	0.6	0.85	0.38	0.43	0.55	0.28	0.57	1.0	0.77	0.82	0.93	0.86	0.87	0.92	0.74	0.36	0.73	0.57
lcl\|BLLF01002800.1_cds_GFH25386.1_19863 (GFH25386)	0.11	0.0	0.0	0.01	0.16	0.16	0.11	0.16	0.11	0.37	0.11	0.13	0.09	0.11	0.12	1.0	0.08	0.29	0.22	0.36	0.61	0.84	0.32	0.22	0.44	0.31
lcl\|BLLF01002849.1_cds_GFH25564.1_20041 (GFH25564)	0.64	0.0	0.0	0.35	0.15	0.29	0.2	0.08	0.07	0.59	0.23	0.23	0.3	0.14	0.11	0.22	0.62	1.0	0.07	0.44	0.66	0.83	0.47	0.15	0.82	0.68
lcl\|BLLF01003964.1_cds_GFH28624.1_23101 (GFH28624)	0.41	0.18	0.0	0.69	0.26	0.28	0.37	0.13	0.2	0.3	0.35	0.3	0.26	0.22	0.24	0.52	1.0	0.72	0.18	0.59	0.76	0.34	0.47	0.4	0.71	0.73
lcl\|BLLF01003965.1_cds_GFH28625.1_23102 (GFH28625)	0.05	0.0	0.0	0.0	0.25	0.19	0.15	0.2	0.09	0.78	0.17	0.11	0.17	0.21	0.09	0.93	0.22	0.57	0.48	0.5	0.47	0.6	0.54	0.18	0.42	1.0
lcl\|BLLF01004417.1_cds_GFH29565.1_24042 (GFH29565)	0.43	0.0	0.0	0.07	0.06	0.18	0.16	0.04	0.18	0.37	0.14	0.27	0.24	0.14	0.14	0.94	1.0	0.82	0.87	0.49	0.82	0.36	0.91	0.19	0.8	0.61
lcl\|BLLF01004488.1_cds_GFH29709.1_24186 (GFH29709)	0.16	0.08	0.08	0.22	0.22	0.23	0.41	0.15	0.28	0.33	0.26	0.24	0.28	0.18	0.26	0.65	0.64	0.53	0.22	0.3	0.58	0.49	0.47	0.21	0.59	1.0
lcl\|BLLF01004591.1_cds_GFH29911.1_24388 (GFH29911)	0.68	0.14	0.35	0.66	0.38	0.26	0.3	0.14	0.32	0.55	0.32	0.24	0.35	0.16	0.27	0.37	0.48	0.92	0.5	0.66	0.59	1.0	0.58	0.35	0.91	0.76
lcl\|BLLF01004610.1_cds_GFH29952.1_24429 (GFH29952)	0.24	0.17	0.0	0.36	0.13	0.15	0.11	0.06	0.06	0.16	0.13	0.08	0.09	0.08	0.05	0.4	0.47	0.68	0.29	0.3	0.72	0.36	0.43	0.13	1.0	0.31
lcl\|BLLF01004763.1_cds_GFH30199.1_24676 (GFH30199)	0.62	0.37	0.59	0.45	0.35	0.42	0.38	0.22	0.58	1.0	0.31	0.24	0.31	0.18	0.4	0.48	0.78	0.82	0.86	0.96	0.75	0.74	0.71	0.23	0.9	0.77
lcl\|BLLF01006024.1_cds_GFH31880.1_26357 (GFH31880)	0.4	0.05	0.27	0.12	0.25	0.22	0.28	0.14	0.28	0.61	0.26	0.15	0.17	0.15	0.24	1.0	0.75	0.83	0.31	0.49	0.87	0.38	0.98	0.22	0.63	0.89
lcl\|BLLF01008058.1_cds_GFH33237.1_27714 (GFH33237)	0.02	0.05	0.0	0.0	0.13	0.22	0.08	0.3	0.18	0.7	0.11	0.15	0.06	0.07	0.17	1.0	0.22	0.29	0.19	0.26	0.77	0.3	0.55	0.21	0.6	0.95
lcl\|BLLF01008417.1_cds_GFH33367.1_27844 (GFH33367)	0.48	0.12	0.0	0.26	0.17	0.38	0.17	0.11	0.21	0.49	0.27	0.24	0.36	0.23	0.2	0.39	0.32	0.44	0.61	0.52	0.33	0.32	0.4	0.23	1.0	0.61

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)