Heatmap: Cluster_58 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
-0.08 0.11 -0.05 -0.24 0.5 0.06 -0.04 0.08 -0.18 -0.71 0.37 0.08 0.0 0.09 -0.14 0.08 0.91 0.1 -0.1 -0.35 -0.04 -0.41 -0.08 0.25 -0.59 -0.72
-2.25 -2.03 - -0.92 0.3 0.58 -0.07 -0.12 -0.15 -0.4 -0.28 -0.05 -0.21 0.06 -0.46 0.1 1.48 0.91 -1.67 -0.91 0.79 0.41 0.9 0.6 -0.79 -0.45
- -1.68 - 0.75 0.55 0.38 -1.01 -0.68 -1.1 -2.05 0.62 -0.42 -1.29 -0.15 -1.34 1.26 1.19 1.09 0.26 -0.14 0.56 -1.24 0.89 -0.08 -0.27 -0.01
-0.58 - - -0.81 1.75 1.19 -0.75 1.36 -0.79 -3.49 1.44 1.33 0.37 0.69 -1.19 -3.19 -1.17 -2.02 -2.46 -1.38 -1.63 -1.95 -1.29 0.74 0.53 0.34
-1.14 -1.45 - -0.32 0.55 0.45 0.19 0.32 -0.14 -2.06 1.1 -0.07 0.44 0.72 -1.19 0.51 0.73 0.61 -0.49 -0.67 0.74 -0.12 -0.45 0.36 -1.5 -0.79
-0.45 -0.23 -0.12 -0.36 0.37 -0.16 0.36 0.31 0.12 0.26 0.2 -0.04 0.28 -0.14 -0.32 0.35 1.11 0.18 -1.2 -1.56 -0.06 -0.9 -0.07 0.58 -0.21 -0.89
-0.21 -2.53 - -0.02 0.82 0.39 -0.17 0.23 -0.49 -2.08 0.9 0.01 0.4 0.11 -0.67 0.42 1.4 0.47 -1.36 -1.18 0.4 -0.86 0.27 0.91 -1.56 -0.99
-1.33 -1.25 - -0.26 0.31 0.31 0.39 0.8 0.3 0.31 1.03 0.69 0.25 0.38 -0.13 -0.57 -0.74 -0.55 -1.67 -0.32 -0.7 0.27 -0.74 0.09 0.4 0.51
-0.85 0.12 -2.18 0.33 1.19 0.45 -0.07 0.82 0.0 -1.07 0.61 0.51 0.03 0.29 -0.06 -0.87 -0.34 0.39 -1.11 -0.42 -0.28 -0.48 -0.5 0.09 0.01 -0.49
-2.94 -3.79 -2.14 -3.75 1.01 0.3 -0.22 1.26 -0.44 -1.24 1.16 0.8 0.32 0.89 -1.05 -0.53 1.09 -0.03 -2.05 -0.78 -0.14 -0.27 -0.62 0.65 -0.3 -0.23
0.68 - - -1.15 0.69 0.75 0.05 0.28 0.31 -2.85 0.87 0.23 0.22 0.72 0.01 0.65 0.68 -0.12 -0.12 -0.62 -0.66 -0.04 -0.4 -0.56 -0.82 -0.1
-1.06 -0.37 - -0.88 0.53 0.32 0.08 0.07 -0.03 -0.07 0.58 0.28 0.05 0.29 -0.75 0.51 1.02 0.54 -0.68 -1.33 0.35 -0.6 0.33 0.19 0.1 -0.8
-0.54 -1.24 -2.23 -0.48 0.46 0.59 0.5 -0.33 0.21 -0.84 0.19 0.26 -0.23 -0.17 -0.24 -0.01 0.76 0.81 -0.41 -0.83 0.47 -0.09 0.72 0.46 -1.27 -0.46
0.09 -0.22 -0.23 -0.43 0.78 0.51 0.07 0.67 -0.19 -0.33 0.42 0.39 -0.11 0.04 -0.54 -0.26 0.77 -0.83 -0.77 -0.77 -0.76 -0.02 -0.33 1.02 -0.76 -1.12
-0.27 -1.47 -0.42 -0.34 0.91 0.63 0.02 -0.16 -0.12 -0.72 0.36 0.38 -0.01 -0.24 -0.49 0.29 0.85 0.29 -0.92 -0.49 0.18 -0.85 0.02 0.83 -0.61 -0.62
-1.85 -1.04 -0.52 -0.58 1.0 0.4 -0.01 0.15 -0.48 -3.64 0.9 0.27 -0.19 0.2 -0.94 0.91 1.56 0.5 -1.1 -2.41 0.06 -0.02 0.14 0.41 -1.66 -1.55
0.25 0.14 -0.79 -0.02 0.63 0.33 0.01 0.35 -0.02 0.24 0.38 0.22 -0.02 0.18 -0.21 0.46 1.09 -0.51 -1.68 -1.21 -0.7 -0.37 -0.56 0.13 -0.59 -0.61
0.03 -0.27 -1.64 -0.86 0.64 0.0 -0.28 0.27 -0.47 -1.14 0.09 0.0 -0.37 -0.19 -0.59 -0.01 1.29 0.45 -0.35 -0.16 0.32 0.41 0.34 0.94 -0.89 -1.51
-0.46 -0.37 -2.08 0.4 0.33 0.19 -0.17 -0.17 -0.41 -1.82 0.42 0.05 -0.48 -0.04 -0.58 0.71 1.17 0.01 -0.49 0.56 -0.11 0.35 -0.02 0.25 -0.27 -0.45
-1.16 - -2.16 -0.71 0.65 0.57 0.54 0.12 0.14 -2.88 0.75 0.36 0.24 0.59 0.14 0.25 0.54 0.35 -0.49 -0.91 -0.27 -0.95 0.03 1.23 -0.74 -0.59
-1.26 -0.3 -0.85 -0.6 0.98 0.45 0.48 0.66 -0.18 0.14 0.79 0.37 0.27 0.83 -0.18 0.05 0.18 -0.54 -2.81 -2.04 -0.93 -2.41 -0.76 0.75 0.01 0.18
-1.28 -0.25 -0.9 -1.35 0.64 0.32 0.16 -0.17 0.03 -0.7 0.55 -0.02 -0.04 0.01 -0.56 0.44 0.73 0.62 -0.74 -0.76 0.13 -0.16 0.35 0.62 -0.15 -0.26
-0.73 -0.14 0.55 -1.01 0.26 -0.15 -0.13 -0.29 0.02 0.17 0.21 -0.61 -0.16 -0.15 -0.02 0.67 0.53 0.03 0.53 0.35 0.13 -0.54 0.46 -0.22 -0.43 -1.18
-0.57 -0.87 -0.8 -1.74 0.66 0.46 0.01 0.08 -0.14 -0.8 0.37 0.19 0.03 0.12 -0.4 0.59 0.62 0.41 -0.6 -0.69 0.35 0.28 0.6 0.55 -0.99 -1.0
-1.04 1.06 0.01 -0.25 0.48 0.15 -0.05 1.38 0.19 -1.18 0.37 0.08 0.05 0.78 -0.05 0.16 0.75 -1.04 -2.37 -2.45 -1.57 -2.0 -1.23 0.38 -0.19 -0.01
-3.22 - - - 0.73 0.2 -0.39 0.16 -0.84 -0.28 0.42 0.31 -0.41 -0.1 -0.67 0.5 1.27 -0.44 -0.18 -0.45 0.02 1.34 0.31 0.79 0.34 -0.06
-0.64 -4.12 - 0.3 0.47 0.7 0.58 -0.03 -0.01 -0.54 0.55 0.08 -0.24 0.35 -0.06 -0.26 -0.28 -0.03 -0.3 -1.44 -0.42 0.63 0.11 1.32 0.04 -0.78
-0.6 -0.23 - 0.39 0.86 0.32 -0.66 -0.36 -1.94 - 0.74 -0.14 -1.01 0.48 -2.73 0.9 1.22 0.77 0.01 0.57 -0.11 -0.14 0.85 -0.19 -2.06 -0.56
-1.18 0.49 -0.16 -0.21 0.63 -0.16 -0.24 0.14 -0.46 -1.58 0.77 0.1 -0.28 0.44 -0.47 0.62 1.39 -0.02 -1.85 -1.21 -0.16 -1.4 -0.21 0.26 0.18 -0.07
-0.57 -1.38 -0.27 -0.0 0.12 0.45 0.08 -0.4 -0.13 -1.27 0.24 0.18 0.25 -0.0 -0.27 0.73 1.3 0.2 -0.31 -0.16 0.54 -0.42 0.27 0.17 -2.22 -1.09
-1.89 - - -0.5 0.6 0.88 0.03 -0.37 -0.52 -2.56 0.75 0.31 -0.34 -0.04 -1.07 0.52 0.73 0.52 0.49 0.62 0.04 0.24 0.23 0.62 -0.76 -0.2
-2.06 -1.12 -2.74 -0.4 0.68 0.59 0.02 -0.02 0.13 -1.33 0.71 0.24 0.11 0.12 -0.19 -0.21 0.1 0.46 -0.31 0.06 0.03 0.2 0.36 0.75 -0.1 -0.48
- - - 0.01 0.88 0.96 0.32 1.38 -0.49 - 1.17 0.63 -0.61 0.76 -0.19 - -0.13 0.07 - -1.29 - 0.61 0.11 0.55 0.07 1.09
-0.17 -0.45 0.11 -0.73 0.48 0.26 0.2 0.19 0.1 -0.55 0.07 -0.02 0.13 -0.26 0.01 0.48 1.2 -0.26 -0.79 -0.94 -0.54 -0.22 -0.32 0.32 0.14 -0.35
-1.31 -0.34 0.43 -1.15 0.48 0.11 -0.04 -0.13 0.11 -0.78 0.3 -0.11 -0.37 -0.4 0.11 0.49 1.01 0.14 0.17 -0.03 -0.3 0.09 0.05 -0.01 0.02 -0.54
-0.43 -1.34 - -1.22 0.39 0.74 0.43 -0.47 0.36 0.06 0.02 0.3 -0.25 0.09 0.36 0.19 -0.46 -0.97 -0.39 -0.89 -0.51 0.01 0.8 1.24 0.43 -0.39
-0.8 0.69 0.82 -0.51 1.0 0.38 0.23 1.34 -0.06 -3.26 1.01 0.8 0.23 1.0 -0.66 -2.76 -1.74 -1.03 -3.54 -3.36 -1.34 -1.87 -0.96 0.67 -0.22 -0.1
-1.11 -1.9 - -0.42 0.6 0.64 0.18 -0.17 -0.12 -1.31 0.67 -0.1 -0.32 0.32 -1.33 0.85 1.17 0.64 -1.58 -0.53 0.41 -0.77 0.48 0.43 -0.2 -0.05
-0.51 -0.71 -0.71 0.11 0.54 0.43 -0.23 -0.21 -0.89 -1.41 0.5 0.31 -0.33 0.19 -1.44 0.52 1.37 0.57 -0.69 -1.15 0.61 -0.2 0.71 0.27 -1.53 -1.23
0.28 -0.41 0.26 0.44 0.69 -0.07 -0.08 0.07 0.05 -1.09 -0.31 0.19 -0.2 -0.11 -0.39 0.63 1.42 -0.5 -1.62 -0.78 -1.21 0.69 -0.86 0.55 -1.02 -0.98
-0.47 -0.76 -1.36 -0.35 0.56 0.06 0.03 0.21 0.02 -0.54 0.28 0.08 -0.18 0.34 -0.34 -0.21 -0.17 0.08 0.14 0.26 0.32 -0.78 0.21 0.88 0.18 -0.27
-0.28 0.79 -3.85 -3.24 1.39 0.3 -0.32 -0.04 0.58 -1.43 0.75 -0.31 0.32 -0.2 -0.82 1.86 1.79 - -0.9 0.55 - -1.32 - 0.09 -4.2 -
-2.07 -2.89 -1.38 -0.07 1.53 1.0 0.28 1.39 -0.51 -3.62 1.34 1.06 0.28 0.64 -1.27 -2.18 -0.98 -0.99 -4.75 -1.99 -0.88 -2.82 -0.62 1.25 -0.25 -0.16
0.23 -2.58 -2.29 -1.98 0.29 0.38 0.41 0.32 0.04 -1.35 1.06 0.66 0.42 0.9 -0.24 0.46 0.55 0.1 -1.19 -1.27 0.03 -0.37 0.17 0.17 -0.91 -0.69
0.24 0.59 - -0.65 0.38 -0.06 -0.23 0.08 -0.1 -1.58 0.45 -0.41 -0.04 0.13 -0.49 0.45 0.87 0.76 -0.72 -1.83 0.03 -1.29 0.18 1.2 -0.18 -0.29
-0.96 -2.32 -0.46 -0.75 0.52 0.27 -0.35 -0.07 -0.64 -1.62 0.55 0.42 -0.13 -0.15 -0.8 0.78 1.56 0.26 -0.06 -0.67 0.44 0.19 0.82 -0.03 -1.27 -1.66
0.52 - -3.69 -0.62 1.02 1.67 1.05 -0.07 0.53 -0.12 1.65 1.16 0.36 0.32 -0.29 -2.79 0.95 -2.14 -1.56 -1.18 - - - 0.1 -5.26 -1.79
0.76 - - -0.29 1.61 0.81 0.94 -1.43 0.72 -0.92 1.34 1.02 1.01 0.47 -0.21 -0.42 1.15 - - - - - -0.78 0.23 -2.89 -0.87
-1.1 - - 0.26 1.18 1.1 1.25 0.6 0.41 - 1.2 1.09 0.3 0.2 -0.48 -0.64 1.44 - - -2.33 - - - 1.72 -4.7 -1.68
-1.17 -0.57 -0.23 -1.45 0.67 0.37 -0.2 0.11 -0.58 -1.94 0.28 0.38 -0.69 -0.33 -1.45 0.55 1.65 0.28 -0.32 -1.08 -0.12 0.61 0.1 0.51 0.01 -0.79
-0.34 -0.26 0.36 -0.56 0.65 0.53 0.07 -0.03 -0.46 -1.97 0.38 0.36 -0.05 0.05 -0.53 0.51 1.31 -0.03 -1.48 -0.61 0.03 0.03 -0.27 0.6 -1.14 -1.35
-0.89 -1.34 -1.32 -0.64 0.47 0.72 0.2 -0.03 -0.01 -1.16 0.77 0.43 0.46 0.68 -0.07 0.68 0.85 0.01 -0.94 -0.13 -0.13 -0.96 -0.03 -0.07 -0.77 -0.59
-0.03 -3.13 -0.04 -0.74 -0.12 0.37 -0.02 0.17 -0.05 -1.11 -0.21 -0.22 -0.07 -0.08 -0.15 0.15 1.23 0.82 -0.58 -0.47 0.5 0.32 0.38 0.43 -0.81 -0.8
-1.04 - - -0.28 0.3 -0.09 -0.03 -0.76 -0.39 -1.34 0.73 -0.24 -0.01 0.01 -1.52 0.97 0.73 0.8 0.71 -0.11 0.27 -1.53 0.79 0.14 0.86 -0.3
0.37 -2.22 0.89 -0.04 1.08 0.34 -0.6 0.79 -0.81 -1.52 1.06 0.52 0.21 0.94 -0.81 0.3 - -2.37 -0.79 0.2 - -1.71 -0.06 -0.07 0.87 -0.67
-1.87 -2.25 -1.47 -0.48 -0.25 0.99 0.94 -0.53 0.95 - -0.02 -0.06 0.35 -0.91 -0.46 0.16 2.14 -1.33 -0.51 -1.53 -1.63 -0.43 -2.77 0.98 -0.29 0.69
0.01 -0.96 - -1.54 1.03 0.6 -0.04 0.48 -0.21 -0.95 1.13 0.14 0.08 0.68 -0.63 -0.17 0.99 0.03 -2.03 -2.04 -0.24 -1.63 0.24 0.74 -0.1 -0.17
-1.39 -0.27 -1.25 -0.52 0.66 0.19 0.13 -0.12 -0.17 -0.63 0.59 -0.0 0.23 0.08 -0.6 0.69 1.31 0.52 -0.66 -0.97 0.05 -1.09 -0.31 0.27 0.15 -0.48
-0.34 -0.33 0.09 -1.39 0.45 0.07 -0.06 0.66 0.03 0.27 0.34 0.24 0.12 0.27 -0.18 -0.92 -0.25 0.07 -0.17 -1.19 0.36 -0.29 0.59 0.07 -0.28 -0.12
0.66 - -1.83 -1.77 0.7 0.31 0.38 0.11 0.13 -0.82 0.61 0.39 0.38 0.59 0.14 0.42 0.48 -0.15 -1.36 -1.35 -0.43 0.25 0.09 -0.16 0.15 -0.36
-2.47 -9.57 - -2.16 0.3 0.2 -0.23 0.35 -0.11 -0.08 0.17 0.23 0.03 0.14 -0.18 0.78 1.03 0.08 -0.19 -0.06 -0.1 0.32 -0.16 0.66 0.45 0.29
-0.87 -3.04 - -0.64 1.22 0.96 0.06 0.29 -0.59 -2.82 1.05 0.75 -0.14 0.48 -1.11 0.56 1.37 -0.76 -0.61 -1.24 -1.22 -2.34 -0.49 1.39 -1.17 -0.56

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.