Heatmap: Cluster_80 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000148.1_cds_GFH08248.1_2725 (GFH08248)	0.0	0.11	1.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.01
lcl\|BLLF01000170.1_cds_GFH08581.1_3058 (GFH08581)	0.02	0.02	1.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.02	0.01	0.18	0.01	0.03	0.01	0.02	0.0	0.09	0.03	0.17	0.0	0.06	0.28	0.05	0.1	0.01	0.01	0.02
lcl\|BLLF01000190.1_cds_GFH08866.1_3343 (GFH08866)	0.05	0.06	1.0	0.0	0.07	0.06	0.07	0.02	0.09	0.07	0.06	0.08	0.06	0.03	0.07	0.0	0.15	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.07
lcl\|BLLF01000196.1_cds_GFH08949.1_3426 (GFH08949)	0.0	0.02	1.0	0.1	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.1	0.04
lcl\|BLLF01000250.1_cds_GFH09647.1_4124 (GFH09647)	0.13	0.0	1.0	0.47	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.07	0.05	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03
lcl\|BLLF01000271.1_cds_GFH09883.1_4360 (GFH09883)	0.05	0.03	1.0	0.33	0.06	0.06	0.1	0.06	0.09	0.16	0.08	0.11	0.12	0.06	0.1	0.09	0.2	0.25	0.11	0.09	0.15	0.0	0.0	0.13	0.03	0.08
lcl\|BLLF01000325.1_cds_GFH10552.1_5029 (GFH10552)	0.0	0.0	1.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.07	0.09	0.0	0.08	0.05	0.31	0.0	0.15	0.04	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000517.1_cds_GFH12583.1_7060 (GFH12583)	0.01	0.04	1.0	0.02	0.04	0.03	0.04	0.07	0.06	0.16	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.05	0.1	0.04	0.04	0.0	0.0	0.1	0.08	0.06	0.09
lcl\|BLLF01000655.1_cds_GFH13822.1_8299 (GFH13822)	0.03	0.0	1.0	0.0	0.1	0.06	0.06	0.09	0.14	0.0	0.07	0.08	0.1	0.09	0.22	0.06	0.35	0.0	0.0	0.12	0.2	0.0	0.0	0.04	0.13	0.06
lcl\|BLLF01000684.1_cds_GFH14081.1_8558 (GFH14081)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.05	0.07	0.04	0.04	0.01	0.09	0.09	0.03	0.05	0.07	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.14	0.0	0.05	0.0	0.09	0.11
lcl\|BLLF01000745.1_cds_GFH14588.1_9065 (GFH14588)	0.06	0.07	1.0	0.06	0.04	0.03	0.03	0.08	0.08	0.13	0.03	0.07	0.04	0.07	0.04	0.1	0.04	0.14	0.07	0.04	0.38	0.23	0.18	0.05	0.03	0.04
lcl\|BLLF01000834.1_cds_GFH15315.1_9792 (GFH15315)	0.0	0.04	1.0	0.44	0.14	0.06	0.07	0.06	0.07	0.12	0.14	0.07	0.06	0.06	0.03	0.08	0.12	0.13	0.0	0.17	0.18	0.0	0.06	0.09	0.1	0.12
lcl\|BLLF01000890.1_cds_GFH15720.1_10197 (GFH15720)	0.0	0.0	1.0	0.16	0.08	0.06	0.11	0.1	0.06	0.13	0.07	0.05	0.16	0.09	0.06	0.06	0.05	0.17	0.07	0.0	0.12	0.08	0.1	0.05	0.07	0.07
lcl\|BLLF01001031.1_cds_GFH16661.1_11138 (GFH16661)	0.0	0.0	1.0	0.06	0.07	0.04	0.04	0.0	0.0	0.12	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.03
lcl\|BLLF01001057.1_cds_GFH16831.1_11308 (GFH16831)	0.13	0.0	1.0	0.17	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001060.1_cds_GFH16855.1_11332 (GFH16855)	0.02	0.0	1.0	0.07	0.06	0.14	0.02	0.02	0.06	0.26	0.05	0.05	0.11	0.06	0.03	0.0	0.39	0.0	0.0	0.05	0.24	0.09	0.17	0.01	0.13	0.08
lcl\|BLLF01001182.1_cds_GFH17653.1_12130 (GFH17653)	0.01	0.1	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.0	0.03	0.01	0.07	0.04	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001189.1_cds_GFH17705.1_12182 (GFH17705)	0.12	0.06	1.0	0.18	0.05	0.03	0.07	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.07	0.04	0.05	0.06	0.08	0.05	0.13	0.1	0.12	0.13	0.17	0.06	0.06	0.02
lcl\|BLLF01001189.1_cds_GFH17715.1_12192 (GFH17715)	0.0	0.0	1.0	0.11	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.05	0.08	0.04	0.07	0.01	0.0	0.09	0.09	0.14	0.08	0.13	0.0	0.09	0.03	0.07	0.06
lcl\|BLLF01001251.1_cds_GFH18125.1_12602 (GFH18125)	0.03	0.13	1.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.06	0.06	0.0	0.08	0.04	0.0	0.09	0.01	0.02	0.01
lcl\|BLLF01001392.1_cds_GFH19019.1_13496 (GFH19019)	0.0	0.0	1.0	0.05	0.04	0.23	0.11	0.08	0.15	0.16	0.13	0.12	0.12	0.04	0.08	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.18	0.02	0.11	0.13
lcl\|BLLF01001520.1_cds_GFH19788.1_14265 (GFH19788)	0.0	0.1	1.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.02	0.0	0.1	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001652.1_cds_GFH20526.1_15003 (GFH20526)	0.15	0.13	1.0	0.11	0.12	0.05	0.13	0.02	0.19	0.15	0.07	0.04	0.07	0.03	0.14	0.0	0.0	0.09	0.07	0.11	0.0	0.12	0.08	0.03	0.12	0.06
lcl\|BLLF01001678.1_cds_GFH20673.1_15150 (GFH20673)	0.0	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001778.1_cds_GFH21200.1_15677 (GFH21200)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001901.1_cds_GFH21762.1_16239 (GFH21762)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001911.1_cds_GFH21818.1_16295 (GFH21818)	0.02	0.15	1.0	0.0	0.15	0.09	0.19	0.08	0.19	0.18	0.12	0.13	0.08	0.1	0.12	0.29	0.35	0.08	0.0	0.09	0.23	0.0	0.19	0.12	0.12	0.15
lcl\|BLLF01002020.1_cds_GFH22346.1_16823 (GFH22346)	0.03	0.0	1.0	0.26	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01
lcl\|BLLF01002058.1_cds_GFH22521.1_16998 (GFH22521)	0.06	0.01	1.0	0.37	0.07	0.04	0.04	0.04	0.08	0.0	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.0	0.1	0.1	0.0	0.02	0.28	0.0	0.2	0.16	0.05	0.17
lcl\|BLLF01002076.1_cds_GFH22598.1_17075 (GFH22598)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.01	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002094.1_cds_GFH22666.1_17143 (GFH22666)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
lcl\|BLLF01002228.1_cds_GFH23252.1_17729 (GFH23252)	0.16	0.06	1.0	0.25	0.08	0.05	0.07	0.02	0.01	0.13	0.12	0.01	0.12	0.08	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14
lcl\|BLLF01002289.1_cds_GFH23507.1_17984 (GFH23507)	0.03	0.08	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.09	0.03	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002472.1_cds_GFH24204.1_18681 (GFH24204)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.02	0.05	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.04	0.01	0.0	0.13	0.13	0.1	0.11	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.02
lcl\|BLLF01002543.1_cds_GFH24462.1_18939 (GFH24462)	0.08	0.09	1.0	0.27	0.1	0.07	0.11	0.12	0.06	0.34	0.2	0.09	0.13	0.09	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.03	0.0	0.18	0.14
lcl\|BLLF01002727.1_cds_GFH25128.1_19605 (GFH25128)	0.0	0.02	1.0	0.0	0.08	0.1	0.09	0.06	0.05	0.11	0.07	0.03	0.06	0.01	0.19	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.07
lcl\|BLLF01003121.1_cds_GFH26416.1_20893 (GFH26416)	0.06	0.04	1.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.06	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.1	0.04	0.04	0.04	0.0	0.03	0.03	0.06	0.02	0.0	0.01
lcl\|BLLF01003315.1_cds_GFH27002.1_21479 (GFH27002)	0.0	0.04	1.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
lcl\|BLLF01003827.1_cds_GFH28310.1_22787 (GFH28310)	0.0	0.01	1.0	0.24	0.09	0.06	0.05	0.03	0.07	0.17	0.05	0.05	0.07	0.07	0.1	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03
lcl\|BLLF01003901.1_cds_GFH28492.1_22969 (GFH28492)	0.01	0.0	1.0	0.6	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.0	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.12	0.06	0.0	0.07	0.03	0.0
lcl\|BLLF01004440.1_cds_GFH29620.1_24097 (GFH29620)	0.1	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
lcl\|BLLF01004485.1_cds_GFH29702.1_24179 (GFH29702)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.07	0.05	0.0	0.08	0.08	0.0	0.02	0.02	0.07	0.03	0.11	0.0	0.23	0.12	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.03
lcl\|BLLF01004997.1_cds_GFH30576.1_25053 (GFH30576)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
lcl\|BLLF01005522.1_cds_GFH31306.1_25783 (GFH31306)	0.0	0.03	1.0	0.05	0.02	0.08	0.1	0.0	0.16	0.0	0.0	0.02	0.03	0.03	0.18	0.15	0.22	0.12	0.0	0.0	0.24	0.0	0.12	0.06	0.11	0.08
lcl\|BLLF01005677.1_cds_GFH31500.1_25977 (GFH31500)	0.0	0.08	1.0	0.0	0.03	0.08	0.03	0.02	0.07	0.28	0.03	0.03	0.05	0.02	0.23	0.1	0.0	0.07	0.0	0.12	0.1	0.0	0.19	0.08	0.08	0.02
lcl\|BLLF01005886.1_cds_GFH31731.1_26208 (GFH31731)	0.04	0.08	1.0	0.0	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.12	0.01	0.02	0.06	0.05	0.04	0.06	0.0	0.13	0.07	0.04	0.0	0.07	0.13	0.03	0.0	0.06
lcl\|BLLF01006701.1_cds_GFH32484.1_26961 (GFH32484)	0.14	0.03	1.0	0.22	0.14	0.04	0.04	0.12	0.03	0.29	0.11	0.05	0.05	0.09	0.1	0.0	0.1	0.18	0.0	0.05	0.12	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01
lcl\|BLLF01006854.1_cds_GFH32598.1_27075 (GFH32598)	0.05	0.0	1.0	0.0	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.12	0.02	0.0	0.02	0.0	0.01	0.09	0.07	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.08
lcl\|BLLF01007891.1_cds_GFH33162.1_27639 (GFH33162)	0.27	0.08	1.0	0.06	0.19	0.06	0.14	0.09	0.07	0.35	0.07	0.07	0.13	0.07	0.14	0.0	0.14	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.1

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)