Heatmap: Cluster_224 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000004.1_cds_GFH05644.1_121 (GFH05644)	0.27	0.24	0.2	0.16	0.33	0.39	0.26	0.2	0.25	0.4	0.35	0.29	0.25	0.24	0.17	1.0	0.41	0.57	0.39	0.32	0.61	0.51	0.63	0.48	0.45	0.62
lcl\|BLLF01000062.1_cds_GFH06896.1_1373 (GFH06896)	0.12	0.0	0.04	0.05	0.18	0.35	0.22	0.06	0.17	0.1	0.19	0.19	0.03	0.18	0.14	0.15	0.44	0.61	0.35	0.88	0.93	0.69	0.86	1.0	0.32	0.28
lcl\|BLLF01000091.1_cds_GFH07390.1_1867 (GFH07390)	0.43	0.27	0.0	0.42	0.45	0.47	0.35	0.16	0.34	0.9	0.4	0.38	0.37	0.23	0.25	1.0	0.72	0.91	0.26	0.41	0.72	0.62	0.52	0.53	0.61	0.4
lcl\|BLLF01000120.1_cds_GFH07861.1_2338 (GFH07861)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.44	0.26	0.23	0.08	0.26	0.48	0.32	0.46	0.57	0.0	0.0	0.28	0.58	0.0	0.0	0.8	0.0	0.0	1.0	0.6	0.61
lcl\|BLLF01000145.1_cds_GFH08204.1_2681 (GFH08204)	0.1	0.04	0.0	0.32	0.23	0.68	0.55	0.17	0.31	0.25	0.28	0.4	0.35	0.4	0.28	0.72	0.4	0.63	0.0	0.24	0.68	0.11	0.56	1.0	0.6	0.59
lcl\|BLLF01000184.1_cds_GFH08778.1_3255 (GFH08778)	0.08	0.24	0.0	0.57	0.07	0.27	0.13	0.08	0.09	0.28	0.18	0.15	0.12	0.15	0.06	1.0	0.45	0.5	0.04	0.12	0.8	0.22	0.74	0.51	0.54	0.59
lcl\|BLLF01000222.1_cds_GFH09282.1_3759 (GFH09282)	0.18	0.12	0.0	0.02	0.09	0.25	0.09	0.1	0.06	0.27	0.15	0.15	0.19	0.2	0.05	1.0	0.62	0.55	0.12	0.34	0.96	0.4	0.49	0.46	0.48	0.6
lcl\|BLLF01000265.1_cds_GFH09812.1_4289 (GFH09812)	0.23	0.25	0.03	0.41	0.38	0.49	0.41	0.26	0.39	0.78	0.31	0.3	0.26	0.21	0.25	1.0	0.66	0.8	0.15	0.39	0.75	0.57	0.54	0.66	0.63	0.81
lcl\|BLLF01000278.1_cds_GFH09980.1_4457 (GFH09980)	0.21	0.15	0.12	0.32	0.72	0.54	0.47	0.24	0.36	0.24	0.6	0.57	0.37	0.28	0.34	0.65	0.54	0.62	0.19	0.42	0.62	0.7	0.69	1.0	0.36	0.31
lcl\|BLLF01000284.1_cds_GFH10066.1_4543 (GFH10066)	0.39	0.03	0.0	0.1	0.43	0.44	0.37	0.25	0.34	0.29	0.54	0.39	0.47	0.45	0.26	0.57	0.67	1.0	0.3	0.37	0.93	0.4	0.91	0.73	0.56	0.37
lcl\|BLLF01000302.1_cds_GFH10276.1_4753 (GFH10276)	0.15	0.0	0.0	0.26	0.34	0.39	0.23	0.29	0.3	0.0	0.39	0.31	0.28	0.22	0.11	0.58	0.77	0.72	0.67	0.84	0.12	0.71	0.54	1.0	0.41	0.52
lcl\|BLLF01000433.1_cds_GFH11762.1_6239 (GFH11762)	0.28	0.41	0.0	0.29	0.38	0.32	0.2	0.21	0.19	0.14	0.25	0.25	0.18	0.32	0.14	0.92	1.0	0.87	0.06	0.13	0.82	0.28	0.49	0.67	0.37	0.63
lcl\|BLLF01000449.1_cds_GFH11925.1_6402 (GFH11925)	0.3	0.43	0.0	0.12	0.41	0.33	0.29	0.29	0.26	0.34	0.39	0.27	0.26	0.24	0.19	0.84	1.0	0.45	0.18	0.29	0.67	0.32	0.24	0.48	0.38	0.38
lcl\|BLLF01000484.1_cds_GFH12267.1_6744 (GFH12267)	0.46	0.23	0.0	0.58	0.5	0.48	0.46	0.35	0.42	0.15	0.59	0.4	0.39	0.48	0.3	0.82	1.0	0.74	0.35	0.75	0.94	0.31	0.71	0.49	0.44	0.35
lcl\|BLLF01000546.1_cds_GFH12851.1_7328 (GFH12851)	0.28	0.03	0.02	0.54	0.53	0.53	0.44	0.41	0.43	0.31	0.7	0.48	0.46	0.4	0.39	0.62	0.71	0.57	0.22	0.22	0.44	0.5	0.68	1.0	0.46	0.31
lcl\|BLLF01000624.1_cds_GFH13544.1_8021 (GFH13544)	0.19	0.0	0.0	0.09	0.08	0.24	0.07	0.08	0.08	0.36	0.17	0.09	0.12	0.14	0.04	0.98	0.64	0.56	0.23	0.22	1.0	0.37	0.6	0.56	0.34	0.64
lcl\|BLLF01000664.1_cds_GFH13892.1_8369 (GFH13892)	0.21	0.0	0.0	0.49	0.34	0.56	0.38	0.36	0.34	0.16	0.46	0.46	0.51	0.38	0.38	0.23	0.52	0.54	0.14	0.0	1.0	0.29	0.72	0.88	0.29	0.21
lcl\|BLLF01000670.1_cds_GFH13939.1_8416 (GFH13939)	0.21	0.01	0.0	0.28	0.33	0.33	0.32	0.12	0.23	0.12	0.33	0.32	0.19	0.16	0.22	0.5	0.63	0.6	0.7	0.74	0.58	0.74	0.88	1.0	0.63	0.39
lcl\|BLLF01000671.1_cds_GFH13957.1_8434 (GFH13957)	0.27	0.18	0.0	0.18	0.22	0.25	0.31	0.14	0.14	0.45	0.19	0.2	0.14	0.19	0.1	1.0	0.57	0.51	0.33	0.38	0.53	0.41	0.95	0.34	0.25	0.28
lcl\|BLLF01000678.1_cds_GFH14024.1_8501 (GFH14024)	0.25	0.13	0.07	0.1	0.61	0.76	0.58	0.45	0.59	0.42	0.62	0.65	0.54	0.49	0.6	1.0	0.64	0.76	0.37	0.34	0.9	0.93	0.79	0.84	0.73	0.57
lcl\|BLLF01000696.1_cds_GFH14183.1_8660 (GFH14183)	0.03	0.0	0.0	0.24	0.33	0.23	0.36	0.17	0.29	0.11	0.28	0.27	0.3	0.23	0.33	0.68	0.48	0.72	0.1	0.32	1.0	0.26	0.58	0.67	0.4	0.17
lcl\|BLLF01000807.1_cds_GFH15107.1_9584 (GFH15107)	0.31	0.0	0.0	0.48	0.44	0.37	0.55	0.33	0.68	0.68	0.48	0.4	0.4	0.27	0.47	0.31	0.53	0.67	0.14	0.2	1.0	0.71	0.7	0.98	0.89	0.46
lcl\|BLLF01001008.1_cds_GFH16516.1_10993 (GFH16516)	0.02	0.12	0.0	0.56	0.54	0.27	0.37	0.27	0.31	0.4	0.55	0.36	0.24	0.3	0.28	0.49	0.18	0.51	0.1	0.27	0.44	0.1	0.7	1.0	0.47	0.15
lcl\|BLLF01001015.1_cds_GFH16561.1_11038 (GFH16561)	0.25	0.14	0.14	0.34	0.31	0.37	0.45	0.19	0.23	0.4	0.34	0.38	0.26	0.29	0.29	0.93	0.56	0.77	0.28	0.42	1.0	0.41	0.7	0.79	0.57	0.42
lcl\|BLLF01001109.1_cds_GFH17184.1_11661 (GFH17184)	0.28	0.27	0.16	0.35	0.88	0.6	0.5	0.37	0.41	0.48	0.75	0.51	0.44	0.44	0.33	0.94	1.0	0.85	0.29	0.38	0.81	0.43	0.74	0.88	0.49	0.46
lcl\|BLLF01001148.1_cds_GFH17447.1_11924 (GFH17447)	0.08	0.11	0.0	0.79	0.52	0.47	0.47	0.4	0.39	0.2	0.52	0.34	0.51	0.41	0.4	1.0	0.89	0.94	0.09	0.48	0.99	0.74	0.65	0.91	0.41	0.36
lcl\|BLLF01001161.1_cds_GFH17527.1_12004 (GFH17527)	0.12	0.21	0.0	0.21	0.25	0.25	0.21	0.22	0.16	0.2	0.22	0.2	0.18	0.13	0.1	0.5	0.26	0.84	0.0	0.09	1.0	0.18	0.22	0.31	0.05	0.09
lcl\|BLLF01001181.1_cds_GFH17645.1_12122 (GFH17645)	0.52	0.01	0.0	0.29	0.61	0.42	0.31	0.2	0.43	0.34	0.48	0.23	0.23	0.23	0.33	0.38	0.81	0.96	0.0	0.45	1.0	0.34	0.84	0.64	0.33	0.25
lcl\|BLLF01001332.1_cds_GFH18644.1_13121 (GFH18644)	0.4	0.01	0.0	0.46	0.36	0.36	0.28	0.31	0.33	0.3	0.4	0.33	0.31	0.36	0.27	0.42	0.72	0.91	0.22	0.43	1.0	0.4	0.36	0.63	0.46	0.29
lcl\|BLLF01001402.1_cds_GFH19074.1_13551 (GFH19074)	0.09	0.04	0.0	0.15	0.06	0.15	0.05	0.07	0.04	0.4	0.09	0.07	0.09	0.16	0.03	0.89	0.84	0.76	0.19	0.05	1.0	0.35	0.69	0.61	0.33	0.35
lcl\|BLLF01001553.1_cds_GFH19990.1_14467 (GFH19990)	0.06	0.0	0.0	0.22	0.34	0.46	0.46	0.12	0.36	0.68	0.53	0.43	0.5	0.37	0.4	0.81	0.54	0.83	0.35	0.24	0.92	0.51	1.0	0.77	0.55	0.42
lcl\|BLLF01001637.1_cds_GFH20448.1_14925 (GFH20448)	0.09	0.11	0.0	0.21	0.42	0.2	0.13	0.27	0.08	0.28	0.58	0.21	0.19	0.45	0.11	0.98	0.74	1.0	0.18	0.29	0.79	0.69	0.77	0.27	0.37	0.25
lcl\|BLLF01001692.1_cds_GFH20758.1_15235 (GFH20758)	0.58	0.05	0.0	0.55	0.86	0.77	0.7	0.55	0.72	0.31	0.8	0.76	0.62	0.53	0.65	1.0	0.83	0.8	0.41	0.37	0.7	0.66	0.56	0.98	0.49	0.35
lcl\|BLLF01001874.1_cds_GFH21652.1_16129 (GFH21652)	0.26	0.17	0.0	0.33	0.25	0.61	0.4	0.19	0.25	0.57	0.26	0.23	0.43	0.31	0.21	1.0	0.95	0.69	0.09	0.27	0.43	0.4	0.68	0.64	0.33	0.19
lcl\|BLLF01001906.1_cds_GFH21791.1_16268 (GFH21791)	0.76	0.46	0.2	0.56	0.33	0.26	0.51	0.19	0.39	0.34	0.39	0.32	0.45	0.27	0.34	1.0	0.93	0.84	0.45	0.26	0.83	0.44	0.79	0.88	0.4	0.42
lcl\|BLLF01002008.1_cds_GFH22287.1_16764 (GFH22287)	0.44	0.0	0.0	0.41	0.15	0.12	0.12	0.07	0.14	0.0	0.15	0.08	0.18	0.08	0.14	1.0	0.46	0.36	0.18	0.2	0.75	0.0	0.6	0.63	0.23	0.11
lcl\|BLLF01002027.1_cds_GFH22371.1_16848 (GFH22371)	0.24	0.11	0.0	0.62	0.3	0.36	0.4	0.23	0.31	0.24	0.25	0.21	0.27	0.4	0.23	0.2	0.57	1.0	0.32	0.29	0.87	0.42	0.57	0.72	0.1	0.07
lcl\|BLLF01002111.1_cds_GFH22729.1_17206 (GFH22729)	0.28	0.12	0.1	0.12	0.09	0.26	0.21	0.06	0.2	0.45	0.11	0.12	0.17	0.15	0.12	0.82	0.85	1.0	0.17	0.2	0.92	0.42	0.88	0.52	0.38	0.44
lcl\|BLLF01002127.1_cds_GFH22806.1_17283 (GFH22806)	0.56	0.15	0.19	0.07	0.36	0.41	0.46	0.32	0.37	0.4	0.47	0.43	0.47	0.39	0.3	1.0	0.83	0.65	0.24	0.35	0.74	0.7	0.73	0.55	0.65	0.42
lcl\|BLLF01002163.1_cds_GFH22963.1_17440 (GFH22963)	0.58	0.05	0.01	0.47	0.29	0.27	0.35	0.31	0.27	0.12	0.35	0.3	0.31	0.36	0.24	0.96	1.0	0.9	0.34	0.3	0.93	0.27	0.86	0.73	0.53	0.53
lcl\|BLLF01002182.1_cds_GFH23051.1_17528 (GFH23051)	0.4	0.01	0.01	0.16	0.37	0.61	0.53	0.22	0.32	0.19	0.43	0.52	0.42	0.4	0.21	0.62	0.6	1.0	0.27	0.34	0.82	0.26	0.5	0.83	0.23	0.14
lcl\|BLLF01002475.1_cds_GFH24218.1_18695 (GFH24218)	0.6	0.24	0.08	0.08	0.44	0.45	0.37	0.39	0.29	0.42	0.57	0.5	0.45	0.52	0.29	0.87	0.78	0.83	0.53	0.53	1.0	0.77	0.92	0.56	0.45	0.33
lcl\|BLLF01002568.1_cds_GFH24555.1_19032 (GFH24555)	0.32	0.28	0.0	0.11	0.51	0.46	0.31	0.29	0.27	0.34	0.49	0.31	0.25	0.33	0.19	1.0	0.62	0.73	0.16	0.29	0.56	0.54	0.47	0.46	0.44	0.39
lcl\|BLLF01002628.1_cds_GFH24772.1_19249 (GFH24772)	0.19	0.17	0.24	0.1	0.43	0.36	0.34	0.25	0.29	0.29	0.37	0.33	0.33	0.26	0.29	1.0	0.74	0.72	0.03	0.22	0.7	0.33	0.31	0.43	0.43	0.52
lcl\|BLLF01002699.1_cds_GFH25038.1_19515 (GFH25038)	0.08	0.04	0.0	0.23	0.53	0.52	0.5	0.31	0.2	0.28	0.53	0.38	0.27	0.31	0.15	0.4	0.88	0.81	0.0	0.2	0.8	0.25	0.69	1.0	0.17	0.24
lcl\|BLLF01002699.1_cds_GFH25043.1_19520 (GFH25043)	0.18	0.21	0.0	0.2	0.08	0.17	0.14	0.08	0.07	0.26	0.11	0.13	0.14	0.16	0.03	0.89	0.68	0.53	0.21	0.11	1.0	0.38	0.49	0.63	0.23	0.54
lcl\|BLLF01003306.1_cds_GFH26976.1_21453 (GFH26976)	0.3	0.03	0.0	0.11	0.15	0.27	0.2	0.12	0.11	0.43	0.2	0.1	0.23	0.25	0.06	1.0	0.54	0.87	0.33	0.15	0.9	0.34	0.99	0.42	0.33	0.48
lcl\|BLLF01003321.1_cds_GFH27021.1_21498 (GFH27021)	0.5	0.13	0.0	0.08	0.49	0.43	0.45	0.34	0.25	0.36	0.46	0.46	0.35	0.35	0.3	0.89	0.53	0.78	0.21	0.47	1.0	0.49	0.65	0.72	0.41	0.3
lcl\|BLLF01003821.1_cds_GFH28300.1_22777 (GFH28300)	0.2	0.13	0.01	0.2	0.48	0.56	0.7	0.38	0.63	0.47	0.48	0.57	0.58	0.42	0.62	0.58	0.49	0.82	0.21	0.22	0.87	0.74	0.78	1.0	0.87	0.49
lcl\|BLLF01003837.1_cds_GFH28339.1_22816 (GFH28339)	0.67	0.47	0.15	0.63	0.53	0.4	0.41	0.32	0.4	0.76	0.39	0.32	0.29	0.28	0.31	0.52	0.73	0.75	0.33	0.37	1.0	0.21	0.76	0.66	0.4	0.36
lcl\|BLLF01003925.1_cds_GFH28539.1_23016 (GFH28539)	0.53	0.24	0.1	0.38	0.55	0.5	0.36	0.39	0.38	0.5	0.48	0.5	0.5	0.39	0.31	0.39	0.57	0.72	0.52	0.6	0.72	0.67	0.79	1.0	0.46	0.43
lcl\|BLLF01004078.1_cds_GFH28873.1_23350 (GFH28873)	0.08	0.0	0.0	0.25	0.34	0.36	0.4	0.29	0.3	0.13	0.4	0.36	0.31	0.25	0.18	1.0	0.79	0.73	0.59	0.66	0.54	0.77	0.78	0.66	0.19	0.25
lcl\|BLLF01004387.1_cds_GFH29507.1_23984 (GFH29507)	0.21	0.1	0.0	0.42	0.5	0.48	0.34	0.35	0.37	0.28	0.66	0.41	0.56	0.46	0.29	0.55	0.52	1.0	0.4	0.19	0.76	0.68	0.99	0.9	0.35	0.3
lcl\|BLLF01004491.1_cds_GFH29714.1_24191 (GFH29714)	0.53	0.07	0.0	0.16	0.38	0.45	0.29	0.26	0.21	0.32	0.48	0.33	0.37	0.32	0.15	0.76	1.0	0.83	0.25	0.4	0.8	0.44	0.67	0.45	0.52	0.45
lcl\|BLLF01004554.1_cds_GFH29840.1_24317 (GFH29840)	0.15	0.04	0.0	0.15	0.27	0.3	0.14	0.25	0.21	0.08	0.36	0.14	0.2	0.1	0.06	0.58	0.6	0.68	0.14	0.5	1.0	0.14	0.63	0.59	0.34	0.31
lcl\|BLLF01004633.1_cds_GFH29987.1_24464 (GFH29987)	0.38	0.01	0.01	0.32	0.29	0.34	0.32	0.28	0.23	0.19	0.34	0.26	0.33	0.34	0.21	0.81	0.77	1.0	0.26	0.36	0.9	0.28	0.8	0.78	0.49	0.73
lcl\|BLLF01004638.1_cds_GFH29993.1_24470 (GFH29993)	0.36	0.16	0.14	0.56	0.48	0.46	0.4	0.24	0.35	0.43	0.52	0.33	0.32	0.31	0.34	0.63	0.54	1.0	0.12	0.38	0.79	0.23	0.73	0.85	0.45	0.35
lcl\|BLLF01004651.1_cds_GFH30015.1_24492 (GFH30015)	0.17	0.02	0.0	0.16	0.12	0.14	0.06	0.04	0.12	0.34	0.08	0.11	0.12	0.09	0.06	0.71	1.0	0.74	0.0	0.21	0.85	0.2	0.55	0.52	0.36	0.29
lcl\|BLLF01005451.1_cds_GFH31214.1_25691 (GFH31214)	0.17	0.16	0.0	0.13	0.34	0.37	0.28	0.17	0.2	0.31	0.42	0.36	0.24	0.29	0.11	0.48	0.35	1.0	0.09	0.22	0.67	0.27	0.48	0.5	0.03	0.03
lcl\|BLLF01005602.1_cds_GFH31406.1_25883 (GFH31406)	0.33	0.03	0.0	0.19	0.53	0.3	0.45	0.25	0.37	0.37	0.53	0.35	0.42	0.37	0.35	0.31	0.41	1.0	0.38	0.27	0.8	0.61	0.78	0.87	0.23	0.32
lcl\|BLLF01005807.1_cds_GFH31657.1_26134 (GFH31657)	0.29	0.0	0.0	0.49	0.49	0.33	0.31	0.35	0.26	0.13	0.53	0.35	0.21	0.3	0.17	0.83	1.0	0.66	0.36	0.42	0.68	0.41	0.62	0.31	0.57	0.27
lcl\|BLLF01006500.1_cds_GFH32309.1_26786 (GFH32309)	0.31	0.07	0.0	0.38	0.46	0.64	0.42	0.45	0.3	0.49	0.36	0.43	0.57	0.32	0.28	0.32	0.61	0.98	0.34	0.31	1.0	0.27	0.9	0.88	0.19	0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)