Heatmap: Cluster_290 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000003.1_cds_GFH05613.1_90 (GFH05613)	0.37	0.33	0.07	0.0	0.06	0.0	0.09	0.17	0.17	0.76	0.18	0.0	0.19	0.14	0.32	0.56	1.0	0.42	0.0	0.36	0.0	0.0	0.63	0.14	0.05	0.0
lcl\|BLLF01000038.1_cds_GFH06418.1_895 (GFH06418)	1.0	0.07	0.26	0.22	0.5	0.47	0.55	0.31	0.56	0.38	0.38	0.47	0.35	0.44	0.53	0.85	0.76	0.57	0.29	0.12	0.49	0.31	0.45	0.08	0.2	0.32
lcl\|BLLF01000041.1_cds_GFH06482.1_959 (GFH06482)	0.61	0.14	0.0	0.45	0.42	0.41	0.35	0.24	0.43	0.61	0.49	0.25	0.45	0.26	0.4	0.65	0.54	0.54	0.43	1.0	0.92	0.45	0.73	0.14	0.32	0.3
lcl\|BLLF01000044.1_cds_GFH06541.1_1018 (GFH06541)	1.0	0.0	0.0	0.53	0.15	0.21	0.55	0.04	0.31	0.82	0.18	0.19	0.41	0.26	0.43	0.76	0.54	0.95	0.33	0.2	0.82	0.38	0.73	0.07	0.25	0.2
lcl\|BLLF01000044.1_cds_GFH06544.1_1021 (GFH06544)	0.97	0.12	0.23	0.84	0.43	0.42	0.47	0.39	0.58	1.0	0.39	0.27	0.32	0.38	0.49	0.44	0.31	0.86	0.23	0.35	0.97	0.56	0.78	0.18	0.78	0.51
lcl\|BLLF01000072.1_cds_GFH07058.1_1535 (GFH07058)	0.37	0.12	0.0	0.1	0.03	0.08	0.24	0.02	0.23	0.0	0.05	0.02	0.08	0.06	0.09	1.0	0.17	0.08	0.12	0.12	0.13	0.15	0.12	0.09	0.24	0.37
lcl\|BLLF01000079.1_cds_GFH07187.1_1664 (GFH07187)	0.49	0.05	0.0	0.06	0.29	0.34	0.24	0.14	0.16	0.44	0.27	0.21	0.15	0.19	0.19	0.45	0.6	0.98	0.2	0.45	0.76	0.6	1.0	0.3	0.2	0.29
lcl\|BLLF01000087.1_cds_GFH07317.1_1794 (GFH07317)	0.59	0.19	0.0	0.63	0.43	0.36	0.42	0.24	0.47	0.55	0.51	0.22	0.22	0.36	0.33	0.78	1.0	0.51	0.73	0.55	0.5	0.54	0.68	0.26	0.56	0.51
lcl\|BLLF01000122.1_cds_GFH07879.1_2356 (GFH07879)	0.63	0.02	0.0	0.14	0.0	0.02	0.17	0.0	0.1	0.19	0.02	0.06	0.13	0.0	0.14	1.0	0.2	0.5	0.85	0.09	0.64	0.39	0.14	0.22	0.2	0.05
lcl\|BLLF01000138.1_cds_GFH08112.1_2589 (GFH08112)	0.6	0.11	0.0	0.0	0.31	0.46	0.23	0.81	0.09	0.11	0.61	0.76	0.49	0.85	0.47	1.0	0.91	0.47	0.16	0.15	0.69	0.2	0.44	0.05	0.6	0.45
lcl\|BLLF01000198.1_cds_GFH08964.1_3441 (GFH08964)	1.0	0.04	0.0	0.26	0.58	0.5	0.51	0.33	0.51	0.43	0.48	0.4	0.34	0.27	0.47	0.35	0.54	0.64	0.36	0.41	0.51	0.44	0.59	0.34	0.69	0.43
lcl\|BLLF01000271.1_cds_GFH09880.1_4357 (GFH09880)	0.83	0.3	0.19	0.58	0.52	0.41	0.59	0.37	0.58	0.68	0.58	0.44	0.53	0.42	0.61	0.63	1.0	0.7	0.6	0.52	0.58	0.49	0.55	0.5	0.56	0.49
lcl\|BLLF01000272.1_cds_GFH09888.1_4365 (GFH09888)	1.0	0.3	0.28	0.2	0.66	0.5	0.67	0.58	0.72	0.74	0.66	0.51	0.75	0.56	0.92	0.53	0.82	0.92	0.7	0.61	0.9	0.89	0.77	0.58	0.54	0.45
lcl\|BLLF01000289.1_cds_GFH10123.1_4600 (GFH10123)	0.71	0.26	0.34	0.32	0.38	0.46	0.48	0.2	0.43	0.62	0.34	0.38	0.4	0.22	0.35	0.49	1.0	0.46	0.37	0.22	0.52	0.15	0.57	0.17	0.24	0.19
lcl\|BLLF01000338.1_cds_GFH10696.1_5173 (GFH10696)	0.91	0.16	0.37	0.17	0.62	0.63	0.71	0.34	0.64	0.4	0.58	0.46	0.41	0.33	0.54	0.6	0.99	1.0	0.43	0.97	0.92	0.9	0.69	0.36	0.67	0.59
lcl\|BLLF01000356.1_cds_GFH10892.1_5369 (GFH10892)	0.88	0.07	0.0	0.37	0.28	0.24	0.25	0.84	0.27	0.66	0.58	0.14	0.43	0.78	0.35	1.0	0.49	0.62	0.23	0.44	0.72	0.08	0.57	0.24	0.31	0.27
lcl\|BLLF01000359.1_cds_GFH10924.1_5401 (GFH10924)	1.0	0.25	0.04	0.73	0.4	0.14	0.13	0.13	0.14	0.37	0.26	0.06	0.11	0.07	0.13	0.17	0.38	0.63	0.11	0.47	0.64	0.31	0.28	0.01	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000359.1_cds_GFH10926.1_5403 (GFH10926)	1.0	0.2	0.0	0.91	0.44	0.35	0.26	0.17	0.25	0.7	0.38	0.2	0.33	0.24	0.19	0.45	0.82	0.7	0.39	0.35	0.64	0.08	0.49	0.07	0.1	0.2
lcl\|BLLF01000372.1_cds_GFH11084.1_5561 (GFH11084)	0.7	0.0	0.0	0.29	0.0	0.01	0.56	0.0	0.45	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	1.0	0.2	0.08	0.44	0.12	0.03	0.61	0.12	0.06	0.03	0.01
lcl\|BLLF01000414.1_cds_GFH11559.1_6036 (GFH11559)	0.57	0.11	0.15	0.24	0.16	0.49	0.43	0.15	0.29	0.59	0.28	0.31	0.32	0.25	0.23	0.55	0.32	1.0	0.43	0.38	0.92	0.34	0.75	0.34	0.39	0.32
lcl\|BLLF01000471.1_cds_GFH12135.1_6612 (GFH12135)	0.59	0.0	0.0	0.48	0.28	0.24	0.29	0.18	0.31	0.33	0.23	0.24	0.27	0.19	0.18	0.39	0.57	0.78	0.27	0.36	1.0	0.0	0.66	0.25	0.24	0.25
lcl\|BLLF01000501.1_cds_GFH12416.1_6893 (GFH12416)	1.0	0.02	0.0	0.23	0.12	0.12	0.53	0.02	0.54	0.79	0.2	0.07	0.3	0.08	0.43	0.78	0.22	0.55	0.18	0.32	0.42	0.27	0.88	0.12	0.53	0.23
lcl\|BLLF01000710.1_cds_GFH14301.1_8778 (GFH14301)	1.0	0.08	0.09	0.25	0.49	0.46	0.55	0.26	0.9	0.66	0.52	0.35	0.43	0.28	0.61	0.59	0.68	0.96	0.45	0.96	0.94	0.72	0.76	0.35	0.32	0.24
lcl\|BLLF01000762.1_cds_GFH14760.1_9237 (GFH14760)	0.72	0.0	0.0	0.0	0.06	0.18	0.13	0.02	0.37	0.36	0.06	0.07	0.04	0.08	0.28	1.0	0.29	0.31	0.2	0.11	0.55	0.0	0.26	0.12	0.09	0.06
lcl\|BLLF01000845.1_cds_GFH15394.1_9871 (GFH15394)	0.77	0.06	0.19	0.08	0.58	0.39	0.35	0.23	0.38	0.69	0.41	0.33	0.34	0.22	0.4	0.88	0.56	1.0	0.47	0.54	0.7	0.54	0.99	0.28	0.55	0.59
lcl\|BLLF01001120.1_cds_GFH17262.1_11739 (GFH17262)	0.99	0.08	0.29	0.04	0.4	0.53	0.46	0.24	0.49	0.59	0.24	0.09	0.09	0.12	0.14	0.91	1.0	0.95	0.2	0.47	0.66	0.31	0.49	0.15	0.33	0.23
lcl\|BLLF01001124.1_cds_GFH17286.1_11763 (GFH17286)	0.47	0.02	0.03	1.0	0.18	0.19	0.23	0.08	0.37	0.24	0.24	0.16	0.23	0.15	0.24	0.33	0.68	0.63	0.38	0.18	0.5	0.16	0.48	0.05	0.07	0.11
lcl\|BLLF01001174.1_cds_GFH17602.1_12079 (GFH17602)	0.47	0.03	0.0	0.12	0.36	0.23	0.23	0.07	0.25	0.3	0.36	0.16	0.17	0.16	0.25	0.66	0.52	1.0	0.32	0.28	0.46	0.14	0.78	0.14	0.12	0.17
lcl\|BLLF01001255.1_cds_GFH18155.1_12632 (GFH18155)	1.0	0.03	0.0	0.35	0.37	0.47	0.43	0.12	0.31	0.26	0.37	0.25	0.4	0.21	0.43	0.6	0.72	0.87	0.05	0.15	0.4	0.23	0.43	0.26	0.5	0.3
lcl\|BLLF01001364.1_cds_GFH18831.1_13308 (GFH18831)	0.69	0.07	0.26	0.17	0.55	0.38	0.36	0.28	0.33	0.75	0.51	0.29	0.32	0.29	0.25	0.63	0.63	1.0	0.31	0.45	0.98	0.38	0.93	0.19	0.22	0.33
lcl\|BLLF01001372.1_cds_GFH18870.1_13347 (GFH18870)	0.81	0.0	0.0	0.1	0.28	0.23	0.37	0.04	0.52	0.0	0.05	0.04	0.29	0.08	0.09	1.0	0.68	0.0	0.0	0.0	0.51	0.66	0.72	0.04	0.39	0.15
lcl\|BLLF01001427.1_cds_GFH19230.1_13707 (GFH19230)	0.63	0.08	0.02	0.32	0.29	0.12	0.34	0.38	0.33	0.95	0.25	0.1	0.32	0.36	0.34	0.8	1.0	0.92	0.15	0.15	0.86	0.16	0.7	0.24	0.12	0.09
lcl\|BLLF01001462.1_cds_GFH19434.1_13911 (GFH19434)	0.81	0.22	0.16	0.42	0.31	0.41	0.32	0.22	0.35	0.68	0.31	0.34	0.36	0.28	0.34	0.51	0.43	0.91	0.26	0.58	1.0	0.3	0.83	0.26	0.26	0.3
lcl\|BLLF01001525.1_cds_GFH19816.1_14293 (GFH19816)	0.3	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.13	0.08	0.25	0.49	0.01	0.03	0.18	0.06	0.15	0.18	0.63	1.0	0.27	0.17	0.5	0.0	0.29	0.14	0.04	0.0
lcl\|BLLF01001569.1_cds_GFH20078.1_14555 (GFH20078)	0.86	0.0	0.0	0.43	0.31	0.24	0.58	0.14	0.31	0.68	0.26	0.17	0.33	0.19	0.39	0.73	0.94	1.0	0.1	0.16	0.37	0.0	0.51	0.08	0.33	0.4
lcl\|BLLF01001571.1_cds_GFH20080.1_14557 (GFH20080)	1.0	0.31	0.3	0.6	0.46	0.56	0.54	0.34	0.74	0.64	0.45	0.41	0.54	0.4	0.72	0.54	0.81	0.85	0.36	0.35	0.6	0.44	0.87	0.34	0.4	0.47
lcl\|BLLF01001703.1_cds_GFH20817.1_15294 (GFH20817)	0.41	0.0	0.0	0.15	0.11	0.17	0.19	0.09	0.17	0.27	0.17	0.08	0.03	0.1	0.12	0.76	0.44	0.73	1.0	0.0	0.86	0.0	0.47	0.29	0.34	0.31
lcl\|BLLF01001881.1_cds_GFH21681.1_16158 (GFH21681)	0.48	0.13	0.0	0.5	0.27	0.25	0.32	0.08	0.32	0.67	0.21	0.16	0.16	0.22	0.25	0.79	0.82	0.89	0.4	0.23	1.0	0.18	0.7	0.26	0.11	0.15
lcl\|BLLF01002050.1_cds_GFH22489.1_16966 (GFH22489)	0.74	0.11	0.0	0.17	0.59	0.51	0.48	0.27	0.57	0.66	0.53	0.34	0.38	0.25	0.4	1.0	0.64	0.99	0.32	0.66	0.92	0.59	0.76	0.2	0.49	0.46
lcl\|BLLF01002256.1_cds_GFH23371.1_17848 (GFH23371)	0.6	0.05	0.0	0.78	0.44	0.36	0.4	0.15	0.36	0.21	0.34	0.19	0.26	0.17	0.33	0.79	0.64	0.85	0.36	0.19	1.0	0.29	0.73	0.15	0.23	0.22
lcl\|BLLF01002385.1_cds_GFH23878.1_18355 (GFH23878)	0.69	0.03	0.12	0.97	0.33	0.28	0.28	0.1	0.31	0.42	0.22	0.17	0.15	0.15	0.34	0.54	1.0	0.78	0.22	0.62	0.6	0.1	0.92	0.08	0.51	0.29
lcl\|BLLF01002618.1_cds_GFH24730.1_19207 (GFH24730)	1.0	0.29	0.0	0.24	0.44	0.39	0.64	0.31	0.63	0.66	0.53	0.41	0.32	0.27	0.29	0.93	0.89	0.58	0.22	0.25	0.9	0.46	0.72	0.27	0.63	0.44
lcl\|BLLF01002761.1_cds_GFH25244.1_19721 (GFH25244)	1.0	0.0	0.0	0.52	0.15	0.07	0.26	0.02	0.39	0.13	0.17	0.12	0.2	0.12	0.31	0.67	0.81	0.57	0.21	0.32	0.65	0.3	0.8	0.15	0.54	0.53
lcl\|BLLF01002865.1_cds_GFH25617.1_20094 (GFH25617)	0.51	0.0	0.02	0.17	0.07	0.13	0.34	0.06	0.26	0.1	0.08	0.11	0.1	0.08	0.31	1.0	0.42	0.55	0.43	0.05	0.34	0.2	0.5	0.19	0.26	0.15
lcl\|BLLF01002970.1_cds_GFH25954.1_20431 (GFH25954)	0.51	0.09	0.29	0.11	0.37	0.34	0.4	0.21	0.38	0.71	0.33	0.23	0.33	0.21	0.33	0.54	0.34	1.0	0.32	0.38	0.86	0.45	0.8	0.36	0.31	0.38
lcl\|BLLF01003018.1_cds_GFH26089.1_20566 (GFH26089)	0.59	0.39	0.26	0.21	0.33	0.33	0.32	0.34	0.44	0.67	0.24	0.21	0.21	0.24	0.34	1.0	0.87	0.65	0.19	0.5	0.71	0.18	0.44	0.2	0.29	0.44
lcl\|BLLF01003128.1_cds_GFH26439.1_20916 (GFH26439)	0.39	0.0	0.0	0.0	0.06	0.09	0.02	0.03	0.21	0.56	0.03	0.0	0.08	0.03	0.04	0.8	0.49	0.41	0.62	0.18	1.0	0.0	0.1	0.12	0.33	0.14
lcl\|BLLF01003291.1_cds_GFH26928.1_21405 (GFH26928)	0.57	0.04	0.0	0.29	0.51	0.45	0.37	0.23	0.42	0.66	0.52	0.44	0.4	0.29	0.44	1.0	0.63	0.91	0.64	0.43	0.89	0.6	0.96	0.39	0.34	0.39
lcl\|BLLF01003316.1_cds_GFH27007.1_21484 (GFH27007)	0.39	0.34	0.21	0.37	0.37	0.49	0.39	0.19	0.39	0.29	0.41	0.27	0.32	0.24	0.3	0.68	1.0	0.62	0.43	0.31	0.5	0.31	0.63	0.14	0.23	0.37
lcl\|BLLF01003463.1_cds_GFH27408.1_21885 (GFH27408)	1.0	0.27	0.06	0.67	0.38	0.34	0.62	0.3	0.47	0.33	0.41	0.22	0.24	0.28	0.62	0.97	0.68	0.74	0.17	0.23	0.71	0.24	0.65	0.26	0.56	0.3
lcl\|BLLF01004435.1_cds_GFH29607.1_24084 (GFH29607)	1.0	0.14	0.08	0.5	0.29	0.34	0.44	0.24	0.43	0.59	0.32	0.18	0.26	0.28	0.37	0.32	0.46	0.65	0.14	0.19	0.71	0.25	0.81	0.03	0.47	0.43
lcl\|BLLF01005386.1_cds_GFH31122.1_25599 (GFH31122)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.63	0.13	0.9	0.58	0.0	0.31	0.55	0.0	0.0	0.95	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.23	0.0
lcl\|BLLF01005920.1_cds_GFH31764.1_26241 (GFH31764)	0.67	0.03	0.0	0.24	0.24	0.12	0.32	0.61	0.24	1.0	0.4	0.24	0.22	0.47	0.25	0.34	0.7	0.42	0.24	0.31	0.22	0.17	0.21	0.2	0.17	0.32
lcl\|BLLF01006994.1_cds_GFH32699.1_27176 (GFH32699)	0.77	0.07	0.0	0.28	0.25	0.08	0.22	0.66	0.26	0.91	0.23	0.08	0.11	0.32	0.32	0.69	0.95	1.0	0.15	0.42	0.23	0.4	0.66	0.09	0.21	0.06
lcl\|BLLF01007235.1_cds_GFH32845.1_27322 (GFH32845)	0.8	0.24	0.17	0.52	0.4	0.47	0.58	0.31	0.68	0.43	0.45	0.39	0.42	0.39	0.58	0.85	1.0	0.73	0.37	0.21	0.62	0.33	0.55	0.17	0.35	0.36
lcl\|BLLF01009640.1_cds_GFH33782.1_28259 (GFH33782)	0.45	0.29	0.23	0.31	0.29	0.23	0.21	0.2	0.3	0.44	0.36	0.16	0.21	0.23	0.27	1.0	0.84	0.42	0.3	0.53	0.88	0.22	0.62	0.12	0.24	0.47

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)