Heatmap: Cluster_110 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000005.1_cds_GFH05666.1_143 (GFH05666)	0.37	0.6	0.43	0.82	0.19	0.33	0.3	0.14	0.37	0.68	0.24	0.22	0.17	0.2	0.22	0.37	0.41	0.84	0.84	0.71	0.76	0.67	0.68	0.51	0.91	1.0
lcl\|BLLF01000005.1_cds_GFH05673.1_150 (GFH05673)	0.26	0.5	0.45	0.69	0.41	0.34	0.24	0.35	0.35	0.48	0.29	0.24	0.26	0.2	0.24	0.25	0.44	0.87	0.58	0.76	0.79	1.0	0.85	0.51	0.77	0.53
lcl\|BLLF01000011.1_cds_GFH05852.1_329 (GFH05852)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.04	0.57	0.0	0.05	0.05	0.12	0.04	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.74	1.0	0.0	0.13	0.36	0.52
lcl\|BLLF01000015.1_cds_GFH05942.1_419 (GFH05942)	0.0	0.0	0.64	0.0	0.05	0.11	0.2	0.05	0.16	0.29	0.09	0.11	0.07	0.07	0.11	0.0	0.0	0.54	0.26	0.2	0.39	1.0	0.53	0.14	0.17	0.3
lcl\|BLLF01000035.1_cds_GFH06359.1_836 (GFH06359)	0.18	0.0	0.0	0.0	0.22	0.11	0.01	0.07	0.13	0.24	0.18	0.07	0.0	0.0	0.13	0.0	1.0	0.27	0.39	0.23	0.73	0.0	0.26	0.43	0.47	0.25
lcl\|BLLF01000074.1_cds_GFH07108.1_1585 (GFH07108)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.07	0.13	0.0	0.0	0.07	0.13	0.0	0.0	0.06	0.61	0.45	0.48	0.71	0.4	0.0	0.75	0.47	0.04	0.22	0.89
lcl\|BLLF01000080.1_cds_GFH07195.1_1672 (GFH07195)	0.38	0.49	1.0	1.0	0.62	0.59	0.56	0.75	0.63	0.37	0.55	0.49	0.56	0.54	0.54	0.38	0.56	0.92	0.82	0.89	0.53	0.63	0.67	0.7	0.44	0.42
lcl\|BLLF01000082.1_cds_GFH07230.1_1707 (GFH07230)	0.15	0.29	0.0	1.0	0.59	0.57	0.44	0.31	0.39	0.75	0.49	0.48	0.32	0.37	0.35	0.74	0.68	0.62	0.17	0.22	0.54	0.73	0.57	0.71	0.73	0.7
lcl\|BLLF01000105.1_cds_GFH07603.1_2080 (GFH07603)	0.43	0.11	0.0	0.76	0.42	0.4	0.5	0.21	0.36	0.42	0.47	0.42	0.39	0.33	0.35	0.37	0.58	0.52	0.43	0.43	0.67	0.7	0.66	1.0	0.79	0.67
lcl\|BLLF01000145.1_cds_GFH08196.1_2673 (GFH08196)	0.41	0.09	0.0	1.0	0.27	0.35	0.42	0.17	0.44	0.59	0.42	0.3	0.38	0.32	0.36	0.32	0.34	0.66	0.55	0.73	0.71	0.76	0.57	0.76	0.7	0.7
lcl\|BLLF01000147.1_cds_GFH08226.1_2703 (GFH08226)	0.65	0.09	0.19	0.21	0.62	0.3	0.36	0.4	0.38	0.0	0.66	0.46	0.35	0.27	0.44	0.28	0.55	0.65	0.43	0.31	1.0	0.09	0.29	0.9	0.68	0.38
lcl\|BLLF01000284.1_cds_GFH10064.1_4541 (GFH10064)	0.55	0.13	0.11	1.0	0.28	0.28	0.17	0.14	0.19	0.17	0.31	0.2	0.16	0.15	0.21	0.37	0.35	0.35	0.69	0.38	0.4	0.25	0.24	0.09	0.67	0.62
lcl\|BLLF01000407.1_cds_GFH11477.1_5954 (GFH11477)	0.13	0.0	0.0	1.0	0.03	0.11	0.43	0.0	0.53	0.0	0.06	0.33	0.29	0.07	0.48	0.38	0.09	0.0	0.15	0.08	0.55	0.16	0.3	0.42	0.5	0.35
lcl\|BLLF01000429.1_cds_GFH11730.1_6207 (GFH11730)	0.56	0.08	0.27	0.62	0.58	0.36	0.48	0.39	0.61	0.23	0.57	0.43	0.35	0.33	0.59	0.5	0.39	0.68	0.71	0.61	0.9	0.4	0.6	1.0	0.78	0.84
lcl\|BLLF01000516.1_cds_GFH12562.1_7039 (GFH12562)	0.04	0.06	0.04	0.93	0.04	0.15	0.14	0.02	0.28	0.03	0.06	0.07	0.08	0.05	0.18	0.09	0.15	0.2	0.25	0.12	0.33	1.0	0.21	0.43	0.54	0.62
lcl\|BLLF01000516.1_cds_GFH12568.1_7045 (GFH12568)	0.22	0.0	0.0	0.11	0.52	0.23	0.24	0.05	0.26	0.59	0.17	0.25	0.03	0.17	0.2	0.0	0.37	0.55	0.0	0.54	0.54	0.31	0.78	0.38	1.0	1.0
lcl\|BLLF01000696.1_cds_GFH14182.1_8659 (GFH14182)	0.0	0.0	0.0	0.84	0.31	0.29	0.31	0.29	0.33	0.0	0.24	0.19	0.24	0.23	0.31	0.0	0.2	0.42	0.16	0.27	0.0	1.0	0.0	0.82	0.82	0.81
lcl\|BLLF01000711.1_cds_GFH14313.1_8790 (GFH14313)	0.4	0.49	0.97	0.13	0.41	0.32	0.23	0.5	0.3	0.24	0.34	0.38	0.28	0.38	0.26	0.2	0.43	0.33	0.24	0.38	0.27	1.0	0.28	0.55	0.26	0.26
lcl\|BLLF01000807.1_cds_GFH15106.1_9583 (GFH15106)	0.69	0.32	0.22	0.39	0.48	0.6	0.74	0.35	0.61	0.69	0.56	0.51	0.41	0.36	0.47	0.59	0.45	0.79	0.54	0.39	0.94	0.84	0.76	0.86	1.0	0.71
lcl\|BLLF01000863.1_cds_GFH15528.1_10005 (GFH15528)	0.63	0.23	0.12	0.7	0.49	0.43	0.56	0.61	0.7	0.18	0.42	0.42	0.44	0.36	0.58	0.27	0.2	0.52	0.26	0.63	0.38	0.42	0.43	0.77	1.0	0.59
lcl\|BLLF01000918.1_cds_GFH15902.1_10379 (GFH15902)	0.61	0.16	0.35	0.73	0.19	0.34	0.45	0.18	0.3	0.34	0.3	0.35	0.37	0.34	0.32	0.41	0.47	0.52	0.93	0.81	0.41	0.49	0.52	0.45	0.79	1.0
lcl\|BLLF01001072.1_cds_GFH16934.1_11411 (GFH16934)	0.01	0.09	0.38	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.04	0.16	0.01	0.11	0.04	0.04	0.09	0.2	0.11	0.0	0.07	0.38	0.0	1.0	0.02	0.13	0.18	0.29
lcl\|BLLF01001091.1_cds_GFH17066.1_11543 (GFH17066)	0.38	0.0	0.0	0.99	0.43	0.41	0.46	0.21	0.37	0.47	0.55	0.32	0.21	0.34	0.3	0.38	0.65	0.43	0.64	0.29	0.65	0.27	0.21	0.34	0.91	1.0
lcl\|BLLF01001127.1_cds_GFH17302.1_11779 (GFH17302)	0.45	0.02	0.0	0.98	0.14	0.2	0.59	0.31	0.72	0.68	0.12	0.16	0.19	0.13	0.81	0.0	0.08	0.5	0.13	0.14	0.58	0.26	0.08	0.73	1.0	0.74
lcl\|BLLF01001151.1_cds_GFH17459.1_11936 (GFH17459)	0.22	0.3	0.0	0.78	0.42	0.39	0.24	0.19	0.24	0.11	0.27	0.23	0.37	0.27	0.17	0.0	0.0	0.22	0.11	0.24	0.31	1.0	0.49	0.57	0.22	0.07
lcl\|BLLF01001226.1_cds_GFH17946.1_12423 (GFH17946)	0.97	0.03	0.06	0.09	0.62	0.82	0.66	0.22	0.45	0.89	0.59	0.65	0.6	0.34	0.41	0.49	0.73	0.9	0.33	1.0	0.79	0.56	0.98	0.8	0.64	0.81
lcl\|BLLF01001232.1_cds_GFH17981.1_12458 (GFH17981)	0.28	0.29	0.31	0.96	0.29	0.33	0.31	0.45	0.46	0.7	0.31	0.32	0.34	0.35	0.44	0.18	0.2	0.8	0.29	0.31	0.78	1.0	0.7	0.63	0.61	0.63
lcl\|BLLF01001246.1_cds_GFH18089.1_12566 (GFH18089)	0.52	0.02	0.07	0.85	0.42	0.5	0.51	0.28	0.49	0.14	0.7	0.46	0.57	0.51	0.45	0.4	0.25	0.42	0.16	0.13	0.83	0.21	0.73	0.36	0.94	1.0
lcl\|BLLF01001486.1_cds_GFH19572.1_14049 (GFH19572)	0.22	0.0	0.0	0.19	0.08	0.13	0.33	0.03	0.33	0.2	0.1	0.04	0.16	0.04	0.16	0.0	0.22	0.64	0.99	0.2	0.2	0.99	0.46	0.45	0.97	1.0
lcl\|BLLF01001487.1_cds_GFH19583.1_14060 (GFH19583)	0.27	0.32	0.0	0.72	0.4	0.3	0.33	0.54	0.63	0.23	0.38	0.35	0.56	0.48	0.54	0.82	0.54	0.78	0.43	1.0	0.74	0.23	0.92	0.65	0.7	0.54
lcl\|BLLF01001592.1_cds_GFH20194.1_14671 (GFH20194)	0.58	0.0	0.0	1.0	0.4	0.3	0.36	0.4	0.41	0.41	0.33	0.33	0.35	0.32	0.31	0.34	0.63	0.59	0.41	0.49	0.53	0.85	0.55	0.82	0.59	0.47
lcl\|BLLF01001642.1_cds_GFH20474.1_14951 (GFH20474)	0.26	0.23	0.0	1.0	0.34	0.46	0.51	0.19	0.51	0.76	0.48	0.33	0.29	0.37	0.35	0.8	0.76	0.39	0.31	0.58	0.37	0.61	0.56	0.78	0.63	0.67
lcl\|BLLF01001716.1_cds_GFH20881.1_15358 (GFH20881)	0.53	0.04	0.0	0.28	0.31	0.62	0.37	0.16	0.23	0.09	0.41	0.37	0.43	0.33	0.13	0.61	0.59	1.0	0.36	0.4	0.2	0.23	0.76	0.47	0.19	0.45
lcl\|BLLF01001764.1_cds_GFH21108.1_15585 (GFH21108)	0.17	0.07	0.0	0.02	0.04	0.08	0.08	0.08	0.06	0.38	0.05	0.1	0.06	0.13	0.07	0.11	0.07	0.04	0.06	0.15	0.07	1.0	0.16	0.23	0.23	0.49
lcl\|BLLF01001841.1_cds_GFH21499.1_15976 (GFH21499)	0.29	0.0	0.0	1.0	0.15	0.04	0.24	0.2	0.3	0.07	0.04	0.06	0.16	0.09	0.36	0.1	0.04	0.2	0.24	0.07	0.17	0.0	0.04	0.58	0.65	0.16
lcl\|BLLF01001846.1_cds_GFH21520.1_15997 (GFH21520)	0.52	0.02	0.0	0.43	0.28	0.28	0.36	0.31	0.52	0.58	0.2	0.23	0.38	0.21	0.71	0.14	0.28	0.43	0.48	0.23	0.32	0.44	0.51	0.85	1.0	0.72
lcl\|BLLF01002026.1_cds_GFH22368.1_16845 (GFH22368)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.71	0.64	0.0
lcl\|BLLF01002191.1_cds_GFH23094.1_17571 (GFH23094)	0.14	0.19	0.0	0.51	0.27	0.4	0.42	0.09	0.28	0.87	0.19	0.33	0.25	0.16	0.22	0.97	1.0	0.13	0.39	0.64	0.08	0.77	0.3	0.56	0.67	0.55
lcl\|BLLF01002204.1_cds_GFH23150.1_17627 (GFH23150)	0.27	0.44	0.55	0.18	0.33	0.34	0.24	0.49	0.39	0.54	0.43	0.35	0.4	0.47	0.23	0.38	0.38	0.14	0.34	0.59	0.2	0.84	0.15	0.35	0.66	1.0
lcl\|BLLF01002550.1_cds_GFH24493.1_18970 (GFH24493)	0.02	0.24	0.0	0.12	0.21	0.17	0.12	0.09	0.04	0.16	0.14	0.12	0.15	0.1	0.07	0.09	0.42	1.0	0.35	0.43	0.51	0.68	0.38	0.33	0.32	0.28
lcl\|BLLF01002622.1_cds_GFH24746.1_19223 (GFH24746)	0.2	0.14	0.0	0.25	0.2	0.3	0.67	0.08	0.42	0.37	0.33	0.23	0.26	0.29	0.24	0.65	0.24	0.66	0.17	0.17	0.87	1.0	0.91	0.61	0.53	0.64
lcl\|BLLF01002664.1_cds_GFH24905.1_19382 (GFH24905)	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002733.1_cds_GFH25149.1_19626 (GFH25149)	0.45	0.03	0.4	0.07	0.07	0.14	0.14	0.07	0.12	0.22	0.07	0.13	0.17	0.09	0.12	0.4	0.16	0.1	0.29	0.33	0.07	1.0	0.22	0.12	0.15	0.27
lcl\|BLLF01002835.1_cds_GFH25509.1_19986 (GFH25509)	0.24	0.47	0.35	1.0	0.42	0.31	0.34	0.55	0.43	0.81	0.39	0.39	0.48	0.46	0.51	0.21	0.19	0.67	0.76	0.97	0.63	0.41	0.63	0.75	0.52	0.47
lcl\|BLLF01003299.1_cds_GFH26956.1_21433 (GFH26956)	0.02	0.0	0.0	1.0	0.09	0.06	0.15	0.14	0.46	0.36	0.1	0.06	0.16	0.16	0.31	0.0	0.0	0.2	0.1	0.11	0.27	0.31	0.46	0.63	0.38	0.19
lcl\|BLLF01003466.1_cds_GFH27416.1_21893 (GFH27416)	0.51	0.08	0.24	0.11	0.09	0.14	0.1	0.05	0.17	0.27	0.13	0.11	0.09	0.08	0.17	0.31	0.2	0.36	1.0	0.7	0.13	0.1	0.39	0.22	0.8	0.78
lcl\|BLLF01003599.1_cds_GFH27743.1_22220 (GFH27743)	0.06	0.14	0.0	1.0	0.32	0.2	0.3	0.26	0.5	0.53	0.35	0.36	0.53	0.25	0.42	0.11	0.21	0.54	0.34	0.53	0.68	0.64	0.27	0.77	0.64	0.71
lcl\|BLLF01003709.1_cds_GFH28016.1_22493 (GFH28016)	0.42	0.51	0.09	1.0	0.5	0.45	0.42	0.62	0.63	0.94	0.45	0.43	0.44	0.45	0.56	0.46	0.44	0.6	0.56	0.84	0.66	0.52	0.58	0.72	0.73	0.66
lcl\|BLLF01003787.1_cds_GFH28218.1_22695 (GFH28218)	0.05	0.0	0.0	1.0	0.16	0.02	0.04	0.04	0.02	0.14	0.13	0.0	0.05	0.04	0.02	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.75	0.31	0.32	0.04	0.0
lcl\|BLLF01003864.1_cds_GFH28411.1_22888 (GFH28411)	0.06	0.0	0.0	0.28	0.01	0.07	0.03	0.02	0.01	0.19	0.03	0.09	0.01	0.06	0.05	0.05	0.0	0.04	0.06	0.25	0.06	1.0	0.0	0.06	0.31	0.6
lcl\|BLLF01004187.1_cds_GFH29111.1_23588 (GFH29111)	0.41	0.25	0.0	0.14	0.34	0.34	0.32	0.2	0.49	0.51	0.4	0.39	0.34	0.24	0.23	0.41	0.68	0.61	0.66	0.78	0.65	0.99	0.76	0.46	0.74	1.0
lcl\|BLLF01004365.1_cds_GFH29474.1_23951 (GFH29474)	0.52	0.1	0.0	0.24	0.45	0.64	0.44	0.2	0.38	0.3	0.54	0.58	0.65	0.49	0.29	0.35	0.55	0.79	0.6	0.62	0.63	0.58	1.0	0.59	0.79	0.83
lcl\|BLLF01004391.1_cds_GFH29511.1_23988 (GFH29511)	0.11	0.22	0.0	0.33	0.07	0.25	0.53	0.09	0.44	0.29	0.22	0.21	0.33	0.07	0.54	0.89	1.0	0.11	0.32	0.92	0.58	0.33	0.31	0.34	0.91	1.0
lcl\|BLLF01004527.1_cds_GFH29784.1_24261 (GFH29784)	0.94	0.14	0.0	0.38	0.43	0.59	0.55	0.22	0.39	0.63	0.38	0.47	0.42	0.22	0.35	1.0	0.83	0.73	0.34	0.8	0.95	0.67	0.91	0.77	0.6	0.31
lcl\|BLLF01004550.1_cds_GFH29831.1_24308 (GFH29831)	0.21	0.08	0.01	0.98	0.07	0.08	0.09	0.15	0.12	0.49	0.11	0.09	0.12	0.12	0.14	0.21	0.16	0.4	0.32	0.26	0.32	1.0	0.32	0.37	0.03	0.04
lcl\|BLLF01004809.1_cds_GFH30279.1_24756 (GFH30279)	0.05	0.02	0.0	1.0	0.23	0.37	0.29	0.09	0.34	0.43	0.2	0.29	0.09	0.14	0.16	0.23	0.23	0.18	0.18	0.35	0.41	0.57	0.47	0.73	0.51	0.26
lcl\|BLLF01004814.1_cds_GFH30292.1_24769 (GFH30292)	0.36	0.26	0.0	1.0	0.19	0.41	0.6	0.16	0.59	0.06	0.26	0.38	0.4	0.22	0.87	0.61	0.78	0.54	0.41	0.81	0.28	0.54	0.61	0.64	0.91	1.0
lcl\|BLLF01004815.1_cds_GFH30294.1_24771 (GFH30294)	0.15	0.0	0.0	0.58	0.6	0.46	0.34	0.39	0.42	0.17	0.34	0.38	0.48	0.31	0.36	0.08	0.24	1.0	0.28	0.16	0.26	0.99	0.62	0.98	0.79	0.42
lcl\|BLLF01004832.1_cds_GFH30319.1_24796 (GFH30319)	0.98	0.07	0.0	0.19	0.59	0.52	0.59	0.28	0.55	0.31	0.52	0.62	0.37	0.21	0.29	0.29	0.69	0.56	0.85	0.62	1.0	0.18	0.73	0.93	0.9	0.78
lcl\|BLLF01005108.1_cds_GFH30736.1_25213 (GFH30736)	0.2	0.02	0.0	0.8	0.24	0.27	0.25	0.17	0.27	0.29	0.32	0.2	0.29	0.19	0.21	0.17	0.28	0.68	0.32	0.27	0.62	1.0	0.68	0.54	0.24	0.33
lcl\|BLLF01005459.1_cds_GFH31223.1_25700 (GFH31223)	0.0	0.0	0.0	0.42	0.04	0.02	0.17	0.02	0.0	0.23	0.02	0.0	0.1	0.05	0.03	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.17	1.0	0.25	0.39	0.0	0.06
lcl\|BLLF01005772.1_cds_GFH31613.1_26090 (GFH31613)	0.26	0.29	0.43	1.0	0.34	0.26	0.19	0.44	0.47	0.35	0.23	0.23	0.29	0.36	0.54	0.0	0.2	0.98	0.64	0.83	0.46	0.68	0.45	0.58	0.5	0.39
lcl\|BLLF01006055.1_cds_GFH31905.1_26382 (GFH31905)	0.27	0.05	0.0	0.67	0.14	0.42	0.09	0.15	0.27	0.54	0.33	0.39	0.46	0.24	0.08	0.51	0.57	1.0	0.9	0.85	0.28	0.95	0.99	0.36	0.65	0.75
lcl\|BLLF01008619.1_cds_GFH33456.1_27933 (GFH33456)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.08	0.0	0.26	0.0	0.48	0.54	0.08	0.24	0.28	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.14	0.14
lcl\|BLLF01009039.1_cds_GFH33597.1_28074 (GFH33597)	0.13	0.0	0.0	0.56	0.03	0.1	0.15	0.17	0.12	0.14	0.06	0.17	0.31	0.33	0.22	0.22	0.14	0.42	0.58	0.47	0.3	1.0	0.72	0.35	0.03	0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)