Heatmap: Cluster_78 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000006.1_cds_GFH05701.1_178 (GFH05701)	0.66	0.3	0.71	0.45	0.67	0.63	0.63	0.74	0.72	0.29	0.69	0.54	0.73	0.69	0.87	0.28	0.4	0.76	0.46	0.46	0.82	0.21	0.61	0.39	1.0	0.74
lcl\|BLLF01000020.1_cds_GFH06058.1_535 (GFH06058)	0.19	0.06	0.39	0.0	0.0	0.06	0.05	0.0	0.03	0.5	0.05	0.05	0.17	0.08	0.04	0.0	0.0	0.0	1.0	0.47	0.15	0.0	0.22	0.01	0.15	0.65
lcl\|BLLF01000034.1_cds_GFH06337.1_814 (GFH06337)	0.0	0.24	0.4	0.0	0.66	0.58	0.56	0.52	0.65	0.44	0.58	0.51	0.46	0.56	0.38	0.7	0.37	0.17	0.27	0.56	0.41	0.1	0.22	0.39	0.78	1.0
lcl\|BLLF01000038.1_cds_GFH06423.1_900 (GFH06423)	0.1	0.52	1.0	0.58	0.53	0.5	0.77	0.42	0.83	0.54	0.33	0.34	0.8	0.31	0.53	0.09	0.13	0.13	0.07	0.36	0.33	0.32	0.22	0.06	0.63	0.69
lcl\|BLLF01000057.1_cds_GFH06814.1_1291 (GFH06814)	0.11	0.25	0.57	0.31	0.18	0.12	0.13	0.31	0.18	0.25	0.19	0.14	0.18	0.24	0.25	0.23	0.13	0.09	0.3	0.27	0.03	0.14	0.13	0.04	0.84	1.0
lcl\|BLLF01000073.1_cds_GFH07074.1_1551 (GFH07074)	0.33	0.09	0.88	0.55	0.36	0.41	0.33	0.2	0.23	0.93	0.46	0.32	0.3	0.43	0.18	0.22	0.09	0.55	0.37	0.17	0.64	0.22	0.43	0.18	1.0	0.96
lcl\|BLLF01000077.1_cds_GFH07157.1_1634 (GFH07157)	0.21	0.39	0.72	0.56	0.68	0.65	0.57	0.37	0.64	1.0	0.61	0.51	0.51	0.4	0.43	0.58	0.48	0.77	1.0	0.73	0.7	0.41	0.6	0.3	0.82	0.97
lcl\|BLLF01000088.1_cds_GFH07328.1_1805 (GFH07328)	0.16	0.1	1.0	0.32	0.45	0.25	0.47	0.17	0.32	0.9	0.31	0.44	0.36	0.26	0.47	0.12	0.43	0.36	0.27	0.86	0.44	0.82	0.65	0.49	0.8	0.74
lcl\|BLLF01000100.1_cds_GFH07509.1_1986 (GFH07509)	0.37	0.19	0.42	0.41	0.24	0.41	0.87	0.16	0.58	0.64	0.27	0.28	0.46	0.15	0.56	0.5	0.47	0.26	0.46	0.54	0.2	0.75	0.3	0.16	1.0	0.95
lcl\|BLLF01000128.1_cds_GFH07972.1_2449 (GFH07972)	0.0	0.0	0.0	0.47	0.32	0.54	0.55	0.26	0.61	0.0	0.31	0.47	0.29	0.15	0.42	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	0.83	1.0
lcl\|BLLF01000136.1_cds_GFH08085.1_2562 (GFH08085)	0.15	0.08	0.45	0.0	0.22	0.27	0.19	0.17	0.33	0.22	0.23	0.23	0.18	0.21	0.2	0.74	0.34	0.18	0.2	0.19	0.25	0.04	0.2	0.09	0.42	1.0
lcl\|BLLF01000188.1_cds_GFH08845.1_3322 (GFH08845)	0.04	0.2	0.3	0.47	0.11	0.03	0.04	0.04	0.18	0.61	0.13	0.06	0.12	0.05	0.1	1.0	0.0	0.11	0.17	0.47	0.77	0.18	0.55	0.08	0.46	0.62
lcl\|BLLF01000195.1_cds_GFH08926.1_3403 (GFH08926)	0.05	0.18	0.68	0.16	0.4	0.51	0.59	0.23	0.64	0.33	0.46	0.32	0.41	0.39	0.34	0.25	0.32	0.53	0.62	0.38	0.61	0.04	0.44	0.08	0.69	1.0
lcl\|BLLF01000195.1_cds_GFH08932.1_3409 (GFH08932)	0.21	0.14	0.83	0.3	0.15	0.28	0.31	0.03	0.41	0.28	0.15	0.23	0.07	0.04	0.4	0.37	0.22	0.46	0.44	0.65	1.0	0.36	0.21	0.15	0.77	0.62
lcl\|BLLF01000202.1_cds_GFH09010.1_3487 (GFH09010)	0.07	0.0	0.36	0.05	0.12	0.16	0.08	0.07	0.08	0.05	0.11	0.1	0.07	0.11	0.06	0.24	0.13	0.33	0.12	0.3	0.45	0.0	0.24	0.07	0.69	1.0
lcl\|BLLF01000247.1_cds_GFH09600.1_4077 (GFH09600)	0.1	0.15	0.0	0.12	0.24	0.24	0.61	0.04	0.58	0.26	0.09	0.0	0.0	0.04	0.61	0.0	0.27	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	1.0
lcl\|BLLF01000348.1_cds_GFH10796.1_5273 (GFH10796)	0.63	0.53	0.54	0.39	0.61	0.66	0.61	0.37	0.73	0.39	0.64	0.56	0.5	0.29	0.52	0.28	0.63	0.79	1.0	0.82	0.61	0.23	0.72	0.26	0.95	0.93
lcl\|BLLF01000371.1_cds_GFH11071.1_5548 (GFH11071)	0.49	0.46	0.67	0.18	0.29	0.53	0.3	0.29	0.28	0.06	0.35	0.41	0.29	0.25	0.16	0.16	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.51
lcl\|BLLF01000383.1_cds_GFH11205.1_5682 (GFH11205)	0.11	0.21	0.55	0.11	0.32	0.47	0.37	0.33	0.26	0.48	0.39	0.31	0.35	0.26	0.26	0.95	0.4	0.37	0.16	0.27	0.44	0.17	0.53	0.28	1.0	0.99
lcl\|BLLF01000413.1_cds_GFH11541.1_6018 (GFH11541)	0.53	0.62	0.65	0.37	0.6	0.75	0.6	0.76	0.66	0.34	0.54	0.55	0.66	0.73	0.5	0.27	0.24	0.86	0.3	0.25	0.84	0.58	1.0	0.41	0.81	0.76
lcl\|BLLF01000443.1_cds_GFH11860.1_6337 (GFH11860)	0.0	0.13	0.71	0.2	0.31	0.3	0.28	0.3	0.53	0.14	0.36	0.28	0.32	0.41	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.85
lcl\|BLLF01000501.1_cds_GFH12414.1_6891 (GFH12414)	0.36	0.01	0.51	0.11	0.43	0.62	0.63	0.21	0.62	0.69	0.7	0.53	0.55	0.51	0.46	0.38	0.46	0.11	0.18	0.41	0.33	0.23	0.14	0.12	1.0	0.84
lcl\|BLLF01000502.1_cds_GFH12424.1_6901 (GFH12424)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.61	0.54	0.29	1.0	0.24	0.32	0.33	0.93	0.35	0.69	0.0	0.25	0.27	0.4	0.68	0.18	0.0	0.0	0.67	0.43	0.81
lcl\|BLLF01000535.1_cds_GFH12740.1_7217 (GFH12740)	0.11	0.6	0.39	0.34	0.18	0.2	0.2	0.31	0.18	0.77	0.26	0.24	0.22	0.22	0.4	1.0	0.79	0.58	0.22	0.44	0.65	0.53	0.45	0.32	0.73	0.54
lcl\|BLLF01000634.1_cds_GFH13626.1_8103 (GFH13626)	0.11	0.02	0.37	0.01	0.48	0.38	0.48	0.11	0.37	0.02	0.39	0.42	0.65	0.2	0.34	0.31	0.25	0.29	0.0	0.26	0.28	0.15	0.06	0.04	0.9	1.0
lcl\|BLLF01000665.1_cds_GFH13903.1_8380 (GFH13903)	0.22	0.19	0.32	0.32	0.33	0.47	0.43	0.25	0.3	0.66	0.6	0.52	0.47	0.72	0.36	0.42	0.19	0.6	0.34	0.28	0.38	0.48	0.35	0.1	0.44	1.0
lcl\|BLLF01000684.1_cds_GFH14082.1_8559 (GFH14082)	0.0	0.55	1.0	0.0	0.31	0.51	0.57	0.37	0.35	0.29	0.37	0.35	0.49	0.34	0.46	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.01	0.72	0.65
lcl\|BLLF01000684.1_cds_GFH14086.1_8563 (GFH14086)	0.12	0.45	0.51	0.5	0.38	0.8	0.52	0.26	0.41	0.06	0.33	0.6	0.4	0.45	0.28	0.34	0.25	0.59	0.59	0.06	0.27	0.0	0.39	0.04	0.82	1.0
lcl\|BLLF01000693.1_cds_GFH14159.1_8636 (GFH14159)	0.09	0.27	0.53	0.33	0.24	0.3	0.19	0.17	0.15	0.93	0.24	0.22	0.17	0.12	0.13	0.81	0.5	0.66	0.21	0.76	0.71	0.31	0.33	0.19	1.0	0.92
lcl\|BLLF01000782.1_cds_GFH14914.1_9391 (GFH14914)	0.65	0.23	0.49	0.26	0.37	0.46	0.69	0.24	0.69	0.6	0.43	0.45	0.6	0.41	0.63	0.37	0.33	0.42	0.73	0.62	0.45	0.08	0.5	0.1	1.0	0.88
lcl\|BLLF01000840.1_cds_GFH15358.1_9835 (GFH15358)	0.1	0.07	0.55	0.61	0.62	0.46	0.73	0.5	0.69	0.14	0.37	0.42	0.61	0.33	0.52	0.24	0.62	0.1	0.14	0.04	0.11	0.1	0.13	0.69	0.8	1.0
lcl\|BLLF01000862.1_cds_GFH15520.1_9997 (GFH15520)	0.39	0.2	0.99	0.6	0.31	0.29	0.25	0.22	0.19	0.38	0.38	0.43	0.42	0.25	0.19	0.26	0.34	0.24	0.16	0.13	0.07	0.19	0.34	0.42	0.91	1.0
lcl\|BLLF01000920.1_cds_GFH15916.1_10393 (GFH15916)	0.03	0.55	1.0	0.28	0.42	0.27	0.42	0.57	0.32	0.49	0.6	0.26	0.34	0.56	0.16	0.4	0.21	0.45	0.0	0.11	0.12	0.57	0.27	0.24	0.59	0.48
lcl\|BLLF01000920.1_cds_GFH15919.1_10396 (GFH15919)	0.33	0.55	0.53	0.12	0.61	0.55	0.57	0.59	0.64	0.42	0.58	0.44	0.61	0.62	0.46	0.29	0.48	0.95	0.24	0.38	1.0	0.42	0.77	0.22	0.77	0.76
lcl\|BLLF01000975.1_cds_GFH16283.1_10760 (GFH16283)	0.06	0.34	0.83	0.28	0.69	0.72	0.6	0.43	0.61	0.37	0.66	0.75	0.73	0.6	0.51	0.53	0.63	0.64	0.04	0.29	0.24	0.08	0.69	0.48	1.0	0.81
lcl\|BLLF01001090.1_cds_GFH17060.1_11537 (GFH17060)	0.09	0.0	0.51	0.06	0.71	0.69	1.0	0.5	0.8	0.11	0.83	0.69	0.67	0.52	0.55	0.13	0.12	0.36	0.08	0.13	0.25	0.08	0.38	0.36	0.82	0.93
lcl\|BLLF01001106.1_cds_GFH17163.1_11640 (GFH17163)	0.03	0.23	0.25	0.17	0.15	0.44	0.43	0.24	0.18	0.07	0.53	0.31	0.42	0.43	0.1	0.0	0.15	0.48	0.24	0.07	0.44	0.25	0.32	0.14	1.0	0.69
lcl\|BLLF01001242.1_cds_GFH18056.1_12533 (GFH18056)	0.02	0.48	0.71	0.0	0.47	0.56	0.3	0.16	0.16	1.0	0.27	0.21	0.6	0.11	0.08	0.0	0.05	0.11	0.25	0.0	0.23	0.0	0.16	0.03	0.37	0.31
lcl\|BLLF01001302.1_cds_GFH18443.1_12920 (GFH18443)	0.34	0.29	0.62	0.55	0.55	0.51	0.37	0.46	0.49	1.0	0.59	0.52	0.53	0.52	0.48	0.26	0.17	0.34	0.48	0.43	0.22	0.11	0.17	0.23	0.36	0.39
lcl\|BLLF01001324.1_cds_GFH18589.1_13066 (GFH18589)	0.05	0.74	1.0	0.29	0.67	0.31	0.5	0.53	0.54	0.29	0.42	0.36	0.44	0.59	0.57	0.06	0.0	0.05	0.0	0.0	0.06	0.07	0.0	0.08	0.51	0.42
lcl\|BLLF01001374.1_cds_GFH18883.1_13360 (GFH18883)	0.07	0.15	0.65	0.2	0.65	0.68	0.83	0.43	0.63	0.13	0.51	0.3	0.46	0.38	0.53	0.12	0.27	0.37	0.0	0.04	0.13	0.07	0.32	0.32	0.73	1.0
lcl\|BLLF01001376.1_cds_GFH18895.1_13372 (GFH18895)	0.06	0.0	0.0	0.5	0.78	0.52	0.55	0.46	0.66	0.15	0.37	0.47	0.43	0.48	0.48	0.0	0.16	0.17	0.51	0.14	0.0	0.53	0.34	1.0	0.66	0.95
lcl\|BLLF01001454.1_cds_GFH19391.1_13868 (GFH19391)	0.11	0.24	0.41	0.08	0.31	0.26	0.33	0.22	0.25	1.0	0.38	0.28	0.19	0.19	0.12	0.1	0.25	0.11	0.0	0.09	0.07	0.0	0.0	0.06	0.43	0.28
lcl\|BLLF01001561.1_cds_GFH20030.1_14507 (GFH20030)	0.09	0.2	0.64	0.28	0.22	0.39	0.37	0.2	0.21	0.39	0.27	0.27	0.18	0.18	0.14	0.81	0.51	0.64	0.1	0.2	0.79	0.32	0.27	0.26	0.66	1.0
lcl\|BLLF01001678.1_cds_GFH20676.1_15153 (GFH20676)	0.05	0.16	1.0	0.25	0.48	0.49	0.46	0.44	0.51	0.33	0.48	0.35	0.46	0.23	0.34	0.0	0.07	0.07	0.22	0.25	0.0	0.35	0.22	0.09	0.9	0.6
lcl\|BLLF01002091.1_cds_GFH22654.1_17131 (GFH22654)	0.2	0.13	0.61	0.13	0.04	0.16	0.7	0.04	0.55	1.0	0.16	0.09	0.37	0.09	0.36	0.0	0.03	0.32	0.6	0.2	0.06	0.19	0.07	0.0	0.25	0.32
lcl\|BLLF01002104.1_cds_GFH22703.1_17180 (GFH22703)	0.18	0.36	0.28	0.07	0.61	0.79	0.6	0.66	0.59	0.45	0.74	0.41	0.44	0.52	0.28	0.5	0.32	0.84	0.08	0.38	1.0	0.09	0.89	0.17	0.31	0.84
lcl\|BLLF01002162.1_cds_GFH22954.1_17431 (GFH22954)	0.57	1.0	0.97	0.71	0.5	0.42	0.62	0.72	0.61	0.6	0.43	0.42	0.53	0.66	0.84	0.04	0.03	0.6	0.11	0.59	0.51	0.51	0.42	0.18	0.64	0.63
lcl\|BLLF01002330.1_cds_GFH23671.1_18148 (GFH23671)	0.15	0.37	1.0	0.16	0.27	0.33	0.45	0.37	0.38	0.2	0.68	0.49	0.88	0.79	0.3	0.13	0.08	0.3	0.59	0.15	0.69	0.5	0.43	0.17	0.57	0.76
lcl\|BLLF01002692.1_cds_GFH25010.1_19487 (GFH25010)	0.14	0.37	0.35	0.14	0.49	0.48	0.46	0.47	0.64	0.89	0.52	0.52	0.59	0.59	0.56	0.24	0.43	0.53	0.23	0.19	0.48	0.54	0.37	0.23	1.0	0.92
lcl\|BLLF01002755.1_cds_GFH25223.1_19700 (GFH25223)	0.22	0.13	0.26	0.0	0.41	0.6	0.4	0.26	0.37	0.41	0.43	0.37	0.32	0.4	0.2	0.12	0.02	0.45	0.0	0.13	0.61	0.02	1.0	0.1	0.38	0.57
lcl\|BLLF01002868.1_cds_GFH25626.1_20103 (GFH25626)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.33	0.55	0.0	0.08	0.0	0.0	0.25	0.0	0.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	1.0
lcl\|BLLF01002928.1_cds_GFH25816.1_20293 (GFH25816)	0.06	0.36	0.35	0.26	0.3	0.23	0.14	0.14	0.12	1.0	0.26	0.28	0.43	0.25	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.14	0.52	0.65
lcl\|BLLF01003077.1_cds_GFH26268.1_20745 (GFH26268)	0.13	0.11	0.45	0.38	0.12	0.17	0.64	0.05	0.56	0.43	0.06	0.16	0.22	0.15	0.35	0.14	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.17	0.0	0.05	1.0	0.91
lcl\|BLLF01003103.1_cds_GFH26356.1_20833 (GFH26356)	0.16	0.54	0.65	0.45	0.66	0.63	0.56	0.49	0.6	1.0	0.56	0.44	0.59	0.67	0.52	0.11	0.14	0.62	0.24	0.41	0.47	0.0	0.35	0.18	0.85	0.99
lcl\|BLLF01003318.1_cds_GFH27011.1_21488 (GFH27011)	0.08	0.29	1.0	0.25	0.38	0.68	0.38	0.44	0.35	0.16	0.54	0.54	0.54	0.59	0.4	0.12	0.2	0.27	0.26	0.32	0.18	0.0	0.06	0.24	0.34	0.89
lcl\|BLLF01003542.1_cds_GFH27603.1_22080 (GFH27603)	0.27	0.49	1.0	0.35	0.68	0.57	0.32	0.58	0.47	0.81	0.63	0.54	0.4	0.47	0.35	0.35	0.17	0.09	0.18	0.28	0.17	0.0	0.19	0.05	0.94	0.99
lcl\|BLLF01003624.1_cds_GFH27803.1_22280 (GFH27803)	0.77	0.48	0.57	0.58	0.68	0.5	0.64	0.39	0.66	0.25	0.7	0.44	0.5	0.39	0.62	0.19	0.38	0.74	1.0	0.48	0.58	0.47	0.69	0.36	0.95	0.34
lcl\|BLLF01004399.1_cds_GFH29528.1_24005 (GFH29528)	0.09	0.72	0.49	0.17	0.55	0.61	0.51	0.35	0.41	0.32	0.51	0.62	0.55	0.35	0.5	0.78	0.68	0.6	0.3	0.45	0.9	0.53	0.41	0.38	1.0	0.99
lcl\|BLLF01004792.1_cds_GFH30254.1_24731 (GFH30254)	0.15	0.0	0.0	0.8	0.55	0.46	0.56	0.31	0.91	0.21	0.48	0.44	0.49	0.38	0.86	0.17	0.09	0.08	0.65	0.69	0.23	0.0	0.13	0.72	1.0	0.89
lcl\|BLLF01005227.1_cds_GFH30910.1_25387 (GFH30910)	0.0	0.0	0.8	0.51	0.21	0.52	0.34	0.1	0.2	0.0	0.66	0.3	0.37	0.32	0.24	0.0	0.0	0.0	0.21	0.08	0.0	0.0	0.0	0.07	1.0	0.69
lcl\|BLLF01005227.1_cds_GFH30911.1_25388 (GFH30911)	0.04	0.0	0.7	0.0	0.67	0.49	0.39	0.34	0.33	1.0	0.48	0.44	0.35	0.25	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.24	0.25
lcl\|BLLF01008981.1_cds_GFH33576.1_28053 (GFH33576)	0.39	0.09	0.75	0.1	0.06	0.25	0.16	0.05	0.12	0.38	0.1	0.21	0.22	0.12	0.07	0.18	0.35	0.6	0.62	0.43	0.51	0.07	0.5	0.09	0.88	1.0
lcl\|BLLF01009344.1_cds_GFH33694.1_28171 (GFH33694)	0.07	0.2	0.68	0.21	0.29	0.29	0.3	0.32	0.3	0.35	0.28	0.2	0.42	0.37	0.2	0.1	0.31	0.26	0.08	0.14	0.64	0.09	0.34	0.14	0.4	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)