Heatmap: Cluster_104 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000022.1_cds_GFH06106.1_583 (GFH06106)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.1	0.19	0.0	0.23	0.0	0.56	0.17	0.07	0.07	0.03	0.31	0.44	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.23
lcl\|BLLF01000030.1_cds_GFH06264.1_741 (GFH06264)	0.12	0.07	0.0	0.07	0.5	0.25	0.16	0.11	0.17	0.55	0.4	0.18	0.19	0.13	0.12	1.0	0.6	0.3	0.08	0.36	0.45	0.23	0.15	0.05	0.15	0.42
lcl\|BLLF01000033.1_cds_GFH06330.1_807 (GFH06330)	0.45	0.03	0.31	0.13	0.81	0.48	0.27	0.35	0.29	0.67	0.57	0.2	0.12	0.22	0.18	0.11	0.18	0.06	0.11	0.6	0.08	0.03	0.03	0.01	0.26	1.0
lcl\|BLLF01000043.1_cds_GFH06522.1_999 (GFH06522)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.23	0.16	0.21	0.0	0.0	0.41	0.0	0.26	0.15	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.5	0.39
lcl\|BLLF01000103.1_cds_GFH07572.1_2049 (GFH07572)	0.15	0.02	0.54	0.18	1.0	0.39	0.13	0.58	0.14	0.18	0.66	0.15	0.05	0.32	0.12	0.13	0.18	0.15	0.01	0.57	0.16	0.02	0.06	0.02	0.14	0.75
lcl\|BLLF01000194.1_cds_GFH08919.1_3396 (GFH08919)	0.0	0.0	0.0	0.13	0.43	0.3	0.18	0.32	0.25	0.84	0.09	0.13	0.28	0.21	0.17	0.0	0.29	0.31	0.0	0.26	0.43	0.49	0.31	0.19	1.0	0.65
lcl\|BLLF01000281.1_cds_GFH10021.1_4498 (GFH10021)	0.03	0.09	0.24	0.43	0.84	0.2	0.16	0.08	0.11	0.7	0.63	0.14	0.08	0.12	0.15	0.8	0.84	0.14	0.14	0.14	0.76	0.07	0.21	0.09	0.16	1.0
lcl\|BLLF01000281.1_cds_GFH10023.1_4500 (GFH10023)	0.09	0.07	0.0	0.5	0.81	0.3	0.16	0.06	0.08	0.89	0.51	0.17	0.12	0.11	0.16	1.0	0.81	0.22	0.0	0.43	0.75	0.33	0.38	0.08	0.09	0.97
lcl\|BLLF01000281.1_cds_GFH10024.1_4501 (GFH10024)	0.0	0.0	0.0	0.32	0.82	0.21	0.0	0.13	0.1	0.0	0.19	0.07	0.07	0.07	0.3	0.0	0.0	0.0	0.38	0.21	0.0	0.0	0.25	0.08	0.23	1.0
lcl\|BLLF01000308.1_cds_GFH10343.1_4820 (GFH10343)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.28	0.2	0.23	0.12	0.0	0.7	0.19	0.07	0.12	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.98
lcl\|BLLF01000330.1_cds_GFH10608.1_5085 (GFH10608)	0.02	0.05	0.0	0.41	1.0	0.35	0.28	0.13	0.23	0.53	0.72	0.32	0.34	0.29	0.25	0.92	0.99	0.07	0.0	0.28	0.09	0.1	0.0	0.11	0.35	0.93
lcl\|BLLF01000535.1_cds_GFH12744.1_7221 (GFH12744)	0.1	0.16	0.35	0.41	0.64	0.16	0.11	0.14	0.09	0.78	0.38	0.12	0.06	0.1	0.11	0.53	0.41	0.0	0.03	0.54	0.05	0.08	0.09	0.04	0.25	1.0
lcl\|BLLF01000554.1_cds_GFH12916.1_7393 (GFH12916)	0.04	0.0	0.0	0.47	0.93	0.62	0.3	0.38	0.33	0.1	0.63	0.48	0.35	0.4	0.24	0.0	0.0	0.11	0.0	0.29	0.18	0.18	0.12	0.13	1.0	0.38
lcl\|BLLF01000579.1_cds_GFH13129.1_7606 (GFH13129)	0.0	0.0	0.0	0.48	0.76	0.53	0.11	0.35	0.1	0.0	1.0	0.48	0.22	0.38	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.36
lcl\|BLLF01000641.1_cds_GFH13691.1_8168 (GFH13691)	0.11	0.0	0.0	0.28	0.77	0.35	0.12	0.45	0.25	0.45	0.39	0.16	0.13	0.18	0.2	0.0	0.0	0.0	0.25	0.43	0.0	0.0	0.17	0.11	1.0	0.89
lcl\|BLLF01000732.1_cds_GFH14496.1_8973 (GFH14496)	0.0	0.0	0.0	0.31	1.0	0.83	0.39	0.55	0.5	0.28	0.6	0.77	0.61	0.49	0.5	0.2	0.8	0.26	0.12	0.13	0.42	0.5	0.0	0.34	0.52	0.55
lcl\|BLLF01000787.1_cds_GFH14955.1_9432 (GFH14955)	0.0	0.0	0.0	0.16	0.5	0.07	0.04	0.0	0.04	0.13	0.27	0.09	0.0	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.2	0.23	0.0	0.13	0.13	0.63
lcl\|BLLF01000793.1_cds_GFH15000.1_9477 (GFH15000)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.9	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
lcl\|BLLF01001047.1_cds_GFH16759.1_11236 (GFH16759)	0.03	0.01	0.89	0.16	1.0	0.33	0.08	0.37	0.06	0.25	0.64	0.13	0.03	0.2	0.08	0.04	0.25	0.26	0.13	0.75	0.2	0.01	0.19	0.01	0.15	0.94
lcl\|BLLF01001163.1_cds_GFH17535.1_12012 (GFH17535)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.08	0.16	0.21	0.22	0.0	0.15	0.15	0.08	0.07	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	1.0
lcl\|BLLF01001212.1_cds_GFH17853.1_12330 (GFH17853)	0.01	0.18	0.0	0.33	0.84	0.29	0.18	0.21	0.17	0.32	0.57	0.23	0.2	0.3	0.16	0.6	1.0	0.35	0.06	0.36	0.91	0.31	0.39	0.14	0.19	0.61
lcl\|BLLF01001212.1_cds_GFH17854.1_12331 (GFH17854)	0.06	0.0	0.0	0.15	1.0	0.2	0.15	0.18	0.17	0.33	0.8	0.23	0.14	0.23	0.24	0.0	1.0	0.55	0.0	0.31	0.0	0.21	0.0	0.03	0.04	0.3
lcl\|BLLF01001243.1_cds_GFH18063.1_12540 (GFH18063)	0.03	0.0	0.0	0.13	0.69	0.12	0.14	0.06	0.13	0.54	0.46	0.14	0.11	0.1	0.17	0.32	1.0	0.27	0.25	0.38	0.39	0.09	0.11	0.16	0.41	0.8
lcl\|BLLF01001267.1_cds_GFH18231.1_12708 (GFH18231)	0.03	0.06	0.0	0.08	0.48	0.25	0.16	0.2	0.25	0.3	0.39	0.22	0.13	0.2	0.17	0.02	0.19	0.01	0.02	1.0	0.02	0.0	0.01	0.03	0.29	0.6
lcl\|BLLF01001291.1_cds_GFH18369.1_12846 (GFH18369)	0.18	0.01	0.0	0.46	1.0	0.54	0.24	0.3	0.3	0.5	0.84	0.27	0.29	0.4	0.12	0.99	0.73	0.6	0.14	0.51	0.66	0.15	0.29	0.25	0.14	0.74
lcl\|BLLF01001366.1_cds_GFH18840.1_13317 (GFH18840)	0.0	0.0	0.0	0.72	0.85	1.0	0.56	0.26	0.42	0.0	0.42	0.44	0.49	0.37	0.3	0.0	0.54	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.05	0.33	0.73
lcl\|BLLF01001398.1_cds_GFH19046.1_13523 (GFH19046)	0.07	0.12	0.0	0.1	0.53	0.21	0.23	0.13	0.16	0.24	0.39	0.15	0.14	0.08	0.16	0.17	0.29	0.0	0.05	1.0	0.14	0.0	0.1	0.11	0.28	0.48
lcl\|BLLF01001515.1_cds_GFH19751.1_14228 (GFH19751)	0.09	0.13	0.0	0.17	1.0	0.55	0.27	0.4	0.29	0.69	0.68	0.35	0.41	0.56	0.18	0.14	0.0	0.18	0.22	0.34	0.45	0.11	0.22	0.14	0.24	0.99
lcl\|BLLF01001515.1_cds_GFH19752.1_14229 (GFH19752)	0.04	0.13	0.0	0.29	1.0	0.6	0.29	0.35	0.3	0.23	0.74	0.31	0.28	0.47	0.19	0.43	0.36	0.48	0.06	0.27	0.4	0.2	0.35	0.19	0.15	0.98
lcl\|BLLF01001625.1_cds_GFH20392.1_14869 (GFH20392)	0.0	0.0	0.0	0.13	1.0	0.27	0.08	0.02	0.16	0.42	0.74	0.1	0.07	0.08	0.12	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.37
lcl\|BLLF01001689.1_cds_GFH20738.1_15215 (GFH20738)	0.0	0.0	0.0	0.56	1.0	0.31	0.07	0.29	0.06	0.0	0.54	0.25	0.26	0.36	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.52
lcl\|BLLF01001768.1_cds_GFH21141.1_15618 (GFH21141)	0.09	0.0	0.0	0.58	1.0	0.76	0.6	0.34	0.3	0.06	0.77	0.58	0.29	0.45	0.26	0.53	0.33	0.14	0.21	0.12	0.0	0.11	0.21	0.45	0.61	0.86
lcl\|BLLF01001894.1_cds_GFH21729.1_16206 (GFH21729)	0.26	0.08	0.17	0.29	0.42	0.33	0.19	0.33	0.2	0.33	0.34	0.28	0.13	0.14	0.09	0.14	0.31	0.16	0.07	1.0	0.09	0.16	0.17	0.03	0.25	0.31
lcl\|BLLF01001905.1_cds_GFH21787.1_16264 (GFH21787)	0.08	0.0	0.0	0.85	1.0	0.17	0.1	0.12	0.23	0.1	0.86	0.19	0.02	0.31	0.05	0.87	0.97	0.34	0.17	0.48	0.47	0.0	0.45	0.05	0.23	0.66
lcl\|BLLF01001977.1_cds_GFH22141.1_16618 (GFH22141)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.34	0.0	0.16	0.25	0.56	0.13	0.34	0.05	0.12	0.12	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	1.0
lcl\|BLLF01002033.1_cds_GFH22403.1_16880 (GFH22403)	0.11	0.07	0.59	0.47	1.0	0.3	0.28	0.13	0.29	0.56	0.62	0.13	0.11	0.15	0.21	0.97	0.99	0.0	0.0	0.52	0.05	0.07	0.0	0.07	0.22	0.79
lcl\|BLLF01002106.1_cds_GFH22712.1_17189 (GFH22712)	0.02	0.0	0.0	0.0	1.0	0.17	0.12	0.01	0.03	0.11	0.75	0.19	0.07	0.08	0.1	0.39	0.81	0.3	0.0	0.05	0.08	0.1	0.12	0.21	0.14	0.41
lcl\|BLLF01002188.1_cds_GFH23080.1_17557 (GFH23080)	0.22	0.24	0.06	0.21	0.78	0.43	0.36	0.22	0.44	0.6	0.65	0.21	0.26	0.25	0.34	0.99	0.96	0.34	0.05	0.36	0.51	0.34	0.31	0.19	0.43	1.0
lcl\|BLLF01002263.1_cds_GFH23402.1_17879 (GFH23402)	0.11	0.11	0.0	0.05	0.58	0.6	0.25	0.44	0.37	0.69	0.42	0.58	0.49	0.48	0.22	0.32	0.24	0.25	0.19	0.0	0.17	0.6	0.38	0.05	0.58	1.0
lcl\|BLLF01002324.1_cds_GFH23656.1_18133 (GFH23656)	0.12	0.01	0.0	0.55	0.73	0.21	0.26	0.04	0.21	0.49	0.53	0.2	0.09	0.09	0.19	0.63	1.0	0.11	0.05	0.39	0.05	0.0	0.07	0.1	0.34	0.77
lcl\|BLLF01002384.1_cds_GFH23875.1_18352 (GFH23875)	0.25	0.12	0.02	0.16	0.74	0.62	0.3	0.27	0.28	0.4	0.43	0.36	0.27	0.22	0.26	0.15	0.32	0.0	0.21	0.25	0.39	0.0	0.33	0.2	0.35	1.0
lcl\|BLLF01002590.1_cds_GFH24638.1_19115 (GFH24638)	0.05	0.25	0.0	0.22	0.43	0.33	0.19	0.18	0.19	0.25	0.38	0.21	0.25	0.15	0.17	0.29	0.15	0.13	0.23	0.64	0.16	0.17	0.09	0.04	0.65	1.0
lcl\|BLLF01002782.1_cds_GFH25328.1_19805 (GFH25328)	0.18	0.0	0.0	0.88	1.0	0.86	0.47	0.44	0.41	0.67	0.8	0.53	0.49	0.6	0.21	0.16	0.12	0.12	0.0	0.0	0.51	0.39	0.36	0.3	0.73	0.71
lcl\|BLLF01002801.1_cds_GFH25389.1_19866 (GFH25389)	0.05	0.0	0.0	0.17	1.0	0.36	0.08	0.26	0.15	0.13	0.35	0.1	0.13	0.14	0.08	0.18	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.28	0.1	0.56	0.83
lcl\|BLLF01003000.1_cds_GFH26043.1_20520 (GFH26043)	0.13	0.0	0.1	0.0	0.25	0.12	0.22	0.19	0.08	0.78	0.04	0.14	0.21	0.07	0.23	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.07	1.0
lcl\|BLLF01003105.1_cds_GFH26360.1_20837 (GFH26360)	0.21	0.0	0.04	0.0	1.0	0.27	0.11	0.19	0.08	0.72	0.58	0.05	0.14	0.08	0.15	0.14	0.32	0.11	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.39
lcl\|BLLF01003174.1_cds_GFH26593.1_21070 (GFH26593)	0.05	0.0	0.21	0.21	0.91	0.29	0.33	0.38	0.56	0.42	0.8	0.27	0.47	0.23	0.69	0.07	0.15	0.1	0.15	0.53	0.14	0.25	0.1	0.22	0.65	1.0
lcl\|BLLF01003550.1_cds_GFH27625.1_22102 (GFH27625)	0.4	0.0	0.1	0.25	0.74	0.31	0.07	0.33	0.08	0.31	0.47	0.12	0.06	0.25	0.09	0.06	0.27	0.2	0.09	0.71	0.14	0.06	0.06	0.01	0.17	1.0
lcl\|BLLF01003803.1_cds_GFH28255.1_22732 (GFH28255)	0.07	0.25	0.0	0.11	0.54	0.21	0.11	0.03	0.14	0.5	0.39	0.07	0.06	0.07	0.07	0.17	0.14	0.04	0.0	0.89	0.04	0.0	0.03	0.03	0.31	1.0
lcl\|BLLF01003966.1_cds_GFH28626.1_23103 (GFH28626)	0.48	0.0	0.0	0.0	0.8	0.47	0.32	0.3	0.35	1.0	0.57	0.28	0.32	0.35	0.29	0.0	0.0	0.06	0.14	0.17	0.29	0.1	0.0	0.01	0.27	0.66
lcl\|BLLF01003998.1_cds_GFH28700.1_23177 (GFH28700)	0.06	0.18	0.0	0.24	0.77	0.5	0.31	0.47	0.43	0.98	0.24	0.24	0.25	0.25	0.21	0.39	0.16	0.3	0.1	0.17	0.19	0.27	0.07	0.18	1.0	0.82
lcl\|BLLF01004135.1_cds_GFH28999.1_23476 (GFH28999)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.46	0.47	0.37	0.13	0.43	0.6	0.13	0.0	0.32	0.13	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.08	0.33	0.11
lcl\|BLLF01005690.1_cds_GFH31518.1_25995 (GFH31518)	0.02	0.04	0.0	0.06	0.38	0.21	0.13	0.01	0.12	0.44	0.32	0.06	0.05	0.03	0.1	0.0	0.0	0.18	0.0	1.0	0.37	0.0	0.04	0.0	0.16	0.32
lcl\|BLLF01005734.1_cds_GFH31572.1_26049 (GFH31572)	0.0	0.0	0.0	0.17	1.0	0.61	0.38	0.27	0.16	0.1	0.83	0.4	0.17	0.16	0.27	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.01	0.41	0.82
lcl\|BLLF01005947.1_cds_GFH31788.1_26265 (GFH31788)	0.17	0.13	0.0	0.22	0.69	0.39	0.17	0.27	0.31	1.0	0.55	0.26	0.23	0.33	0.22	0.71	0.4	0.08	0.0	0.1	0.11	0.06	0.04	0.02	0.24	0.84
lcl\|BLLF01006752.1_cds_GFH32524.1_27001 (GFH32524)	0.23	0.02	0.51	0.2	0.68	0.17	0.05	0.28	0.05	0.22	0.39	0.07	0.02	0.11	0.04	0.12	0.3	0.22	0.07	1.0	0.23	0.09	0.07	0.02	0.14	0.82
lcl\|BLLF01007113.1_cds_GFH32775.1_27252 (GFH32775)	0.0	0.12	0.0	0.96	1.0	0.86	0.39	0.38	0.15	0.0	0.71	0.71	0.59	0.29	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.16
lcl\|BLLF01007526.1_cds_GFH32988.1_27465 (GFH32988)	0.0	0.28	0.0	0.26	1.0	0.86	0.32	0.5	0.47	0.17	0.81	0.76	0.43	0.48	0.31	0.08	0.0	0.37	0.46	0.26	0.85	0.1	0.55	0.05	0.68	0.82
lcl\|BLLF01008388.1_cds_GFH33354.1_27831 (GFH33354)	0.0	0.0	0.0	0.17	1.0	0.55	0.34	0.15	0.21	0.0	0.47	0.28	0.12	0.16	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.36	0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)