Heatmap: Cluster_152 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000006.1_cds_GFH05711.1_188 (GFH05711)	0.21	0.39	0.38	0.36	0.69	0.45	0.34	0.34	0.37	0.28	0.59	0.36	0.39	0.33	0.27	0.46	0.79	0.7	0.6	1.0	0.58	0.35	0.4	0.1	0.09	0.14
lcl\|BLLF01000057.1_cds_GFH06795.1_1272 (GFH06795)	0.3	0.04	0.0	0.43	0.19	0.21	0.13	0.12	0.19	0.36	0.22	0.17	0.09	0.15	0.09	0.27	0.61	0.25	0.05	1.0	0.64	0.11	0.28	0.08	0.21	0.17
lcl\|BLLF01000125.1_cds_GFH07927.1_2404 (GFH07927)	0.09	0.02	0.19	0.26	0.26	0.15	0.04	0.08	0.06	0.14	0.17	0.04	0.05	0.05	0.04	0.07	0.07	0.36	0.24	1.0	0.25	0.03	0.23	0.01	0.05	0.06
lcl\|BLLF01000212.1_cds_GFH09143.1_3620 (GFH09143)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.25	0.0	0.04	0.08	0.27	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07
lcl\|BLLF01000236.1_cds_GFH09466.1_3943 (GFH09466)	0.07	0.0	0.0	0.18	0.27	0.04	0.05	0.0	0.0	0.19	0.11	0.09	0.12	0.06	0.03	0.0	0.0	0.21	0.16	1.0	0.3	0.0	0.11	0.02	0.0	0.13
lcl\|BLLF01000320.1_cds_GFH10486.1_4963 (GFH10486)	0.03	0.03	0.0	0.15	0.23	0.15	0.05	0.12	0.07	0.22	0.16	0.15	0.05	0.1	0.06	0.06	0.0	0.36	0.22	1.0	0.14	0.0	0.06	0.0	0.09	0.21
lcl\|BLLF01000353.1_cds_GFH10848.1_5325 (GFH10848)	0.03	0.04	0.19	0.07	0.06	0.03	0.02	0.01	0.02	0.09	0.02	0.04	0.0	0.0	0.01	0.06	0.03	0.06	0.0	1.0	0.06	0.09	0.04	0.06	0.02	0.05
lcl\|BLLF01000383.1_cds_GFH11207.1_5684 (GFH11207)	0.03	0.08	0.44	0.14	0.14	0.1	0.09	0.01	0.04	0.36	0.07	0.1	0.11	0.03	0.04	0.13	0.0	0.25	0.29	1.0	0.14	0.23	0.1	0.06	0.09	0.09
lcl\|BLLF01000398.1_cds_GFH11391.1_5868 (GFH11391)	0.16	0.0	0.38	0.18	0.19	0.14	0.09	0.06	0.11	0.24	0.15	0.09	0.1	0.08	0.08	0.25	0.21	0.07	0.16	1.0	0.18	0.14	0.06	0.05	0.17	0.24
lcl\|BLLF01000454.1_cds_GFH11976.1_6453 (GFH11976)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.49	0.08	0.09	0.13	0.08	0.0	0.38	0.18	0.12	0.28	0.06	0.19	0.14	0.74	0.22	1.0	0.2	0.47	0.0	0.0	0.1	0.21
lcl\|BLLF01000519.1_cds_GFH12602.1_7079 (GFH12602)	0.67	0.25	0.21	0.07	0.14	0.16	0.18	0.19	0.17	0.48	0.17	0.16	0.16	0.2	0.17	0.46	0.31	0.2	0.2	1.0	0.26	0.18	0.21	0.06	0.18	0.19
lcl\|BLLF01000586.1_cds_GFH13200.1_7677 (GFH13200)	0.02	0.02	0.18	0.21	0.16	0.05	0.02	0.03	0.02	0.32	0.08	0.06	0.01	0.03	0.01	0.25	0.13	0.06	0.09	1.0	0.08	0.09	0.04	0.01	0.03	0.06
lcl\|BLLF01000650.1_cds_GFH13772.1_8249 (GFH13772)	0.77	0.41	0.27	0.38	0.57	0.61	0.5	0.52	0.72	0.65	0.61	0.48	0.46	0.47	0.63	0.38	0.51	0.75	0.43	1.0	0.72	0.73	0.6	0.42	0.48	0.41
lcl\|BLLF01000721.1_cds_GFH14399.1_8876 (GFH14399)	0.73	0.05	0.29	0.17	0.53	0.37	0.31	0.37	0.41	0.62	0.36	0.2	0.27	0.21	0.28	0.08	0.3	0.41	0.52	1.0	0.37	0.37	0.28	0.16	0.25	0.2
lcl\|BLLF01000739.1_cds_GFH14542.1_9019 (GFH14542)	0.03	0.21	0.37	0.26	0.84	0.38	0.2	0.42	0.28	0.15	0.75	0.35	0.35	0.45	0.26	0.25	1.0	0.6	0.15	0.47	0.81	0.39	0.5	0.03	0.2	0.29
lcl\|BLLF01000747.1_cds_GFH14616.1_9093 (GFH14616)	0.91	0.24	0.0	0.19	0.43	0.24	0.25	0.18	0.3	0.11	0.35	0.16	0.18	0.18	0.21	0.41	0.62	0.62	0.57	1.0	0.41	0.14	0.47	0.21	0.31	0.27
lcl\|BLLF01000774.1_cds_GFH14852.1_9329 (GFH14852)	0.3	0.12	0.0	0.07	0.31	0.22	0.23	0.13	0.06	0.5	0.18	0.08	0.11	0.12	0.05	0.41	1.0	0.44	0.22	0.71	0.44	0.0	0.0	0.07	0.28	0.12
lcl\|BLLF01000785.1_cds_GFH14933.1_9410 (GFH14933)	0.15	0.19	0.13	0.09	0.14	0.1	0.07	0.09	0.08	0.15	0.09	0.07	0.03	0.04	0.04	0.01	0.02	0.06	0.04	1.0	0.07	0.18	0.05	0.01	0.1	0.05
lcl\|BLLF01000856.1_cds_GFH15483.1_9960 (GFH15483)	0.16	0.01	0.55	0.09	0.12	0.08	0.09	0.06	0.04	0.43	0.05	0.04	0.04	0.06	0.06	0.19	0.1	0.22	0.41	1.0	0.15	0.15	0.14	0.05	0.17	0.14
lcl\|BLLF01000923.1_cds_GFH15940.1_10417 (GFH15940)	0.02	0.16	0.17	0.14	0.11	0.05	0.02	0.01	0.01	0.22	0.06	0.04	0.01	0.02	0.02	0.12	0.07	0.0	0.04	1.0	0.01	0.04	0.02	0.0	0.08	0.18
lcl\|BLLF01001121.1_cds_GFH17265.1_11742 (GFH17265)	0.7	0.37	0.09	0.28	0.44	0.38	0.25	0.37	0.31	0.7	0.4	0.35	0.32	0.38	0.21	0.19	0.21	0.18	0.53	1.0	0.25	0.27	0.18	0.08	0.21	0.17
lcl\|BLLF01001170.1_cds_GFH17583.1_12060 (GFH17583)	0.0	0.0	0.0	0.11	0.64	0.18	0.02	0.07	0.14	0.71	0.32	0.14	0.1	0.21	0.11	0.0	0.0	0.65	0.39	1.0	0.72	0.21	0.13	0.08	0.09	0.34
lcl\|BLLF01001403.1_cds_GFH19080.1_13557 (GFH19080)	0.32	0.14	0.0	0.35	0.17	0.15	0.22	0.15	0.15	0.28	0.16	0.13	0.23	0.18	0.12	0.38	0.35	0.29	0.5	1.0	0.49	0.28	0.45	0.27	0.1	0.11
lcl\|BLLF01001432.1_cds_GFH19259.1_13736 (GFH19259)	0.05	0.0	0.38	0.2	0.2	0.05	0.01	0.03	0.02	0.13	0.08	0.07	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	1.0	0.01	0.01	0.05	0.02	0.04	0.06
lcl\|BLLF01001476.1_cds_GFH19516.1_13993 (GFH19516)	0.23	0.09	0.59	0.05	0.08	0.05	0.04	0.05	0.06	0.67	0.09	0.05	0.1	0.04	0.09	0.24	0.09	0.2	0.14	1.0	0.3	0.05	0.12	0.05	0.12	0.06
lcl\|BLLF01001523.1_cds_GFH19809.1_14286 (GFH19809)	0.39	0.17	0.41	0.25	0.41	0.29	0.2	0.15	0.18	0.29	0.4	0.2	0.16	0.2	0.14	0.36	0.64	0.56	0.4	1.0	0.48	0.04	0.35	0.11	0.13	0.19
lcl\|BLLF01001543.1_cds_GFH19932.1_14409 (GFH19932)	0.1	0.04	0.19	0.02	0.04	0.03	0.05	0.0	0.04	0.0	0.01	0.12	0.07	0.03	0.06	0.04	0.0	0.03	0.12	1.0	0.0	0.22	0.02	0.06	0.11	0.11
lcl\|BLLF01001595.1_cds_GFH20207.1_14684 (GFH20207)	0.62	0.38	0.0	0.24	0.55	0.33	0.24	0.4	0.26	1.0	0.32	0.24	0.33	0.34	0.29	0.27	0.08	0.43	0.29	0.96	0.44	0.33	0.47	0.17	0.24	0.21
lcl\|BLLF01001630.1_cds_GFH20422.1_14899 (GFH20422)	0.44	0.0	0.0	0.0	0.12	0.06	0.08	0.08	0.09	0.12	0.08	0.03	0.07	0.07	0.06	0.32	0.26	0.46	0.12	1.0	0.3	0.13	0.2	0.06	0.03	0.1
lcl\|BLLF01001714.1_cds_GFH20870.1_15347 (GFH20870)	0.22	0.23	0.5	0.18	0.22	0.15	0.11	0.14	0.13	0.26	0.15	0.12	0.14	0.09	0.1	0.42	0.4	0.26	0.23	1.0	0.31	0.52	0.35	0.17	0.09	0.09
lcl\|BLLF01001812.1_cds_GFH21355.1_15832 (GFH21355)	0.12	0.1	0.25	0.17	0.09	0.07	0.04	0.06	0.05	0.14	0.06	0.05	0.03	0.03	0.03	0.08	0.07	0.12	0.1	1.0	0.1	0.08	0.13	0.2	0.07	0.17
lcl\|BLLF01001815.1_cds_GFH21372.1_15849 (GFH21372)	0.74	0.08	0.17	0.1	0.42	0.37	0.31	0.18	0.36	0.7	0.38	0.27	0.28	0.24	0.23	0.39	0.66	0.32	0.48	1.0	0.31	0.2	0.21	0.08	0.35	0.19
lcl\|BLLF01001949.1_cds_GFH22014.1_16491 (GFH22014)	0.39	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.23	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.47	0.24
lcl\|BLLF01002003.1_cds_GFH22266.1_16743 (GFH22266)	0.08	0.14	0.28	0.16	0.36	0.19	0.24	0.12	0.2	0.26	0.26	0.12	0.16	0.08	0.13	0.48	0.58	0.41	0.54	1.0	0.31	0.35	0.41	0.12	0.14	0.15
lcl\|BLLF01002019.1_cds_GFH22340.1_16817 (GFH22340)	0.78	0.3	0.15	0.38	0.37	0.22	0.1	0.37	0.21	0.33	0.29	0.23	0.23	0.24	0.19	0.14	0.32	0.82	0.52	1.0	0.77	0.3	0.51	0.15	0.15	0.22
lcl\|BLLF01002054.1_cds_GFH22506.1_16983 (GFH22506)	0.15	0.28	0.27	0.24	0.54	0.3	0.24	0.41	0.24	0.16	0.57	0.37	0.33	0.38	0.24	0.37	0.58	0.64	0.59	1.0	0.55	0.54	0.36	0.19	0.2	0.33
lcl\|BLLF01002099.1_cds_GFH22682.1_17159 (GFH22682)	0.03	0.0	0.38	0.09	0.21	0.1	0.03	0.01	0.01	0.15	0.14	0.05	0.0	0.01	0.0	0.06	0.19	0.02	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.07
lcl\|BLLF01002099.1_cds_GFH22683.1_17160 (GFH22683)	0.36	0.0	0.0	0.23	0.0	0.08	0.07	0.0	0.0	0.0	0.08	0.07	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13
lcl\|BLLF01002165.1_cds_GFH22973.1_17450 (GFH22973)	0.45	0.03	0.0	0.02	0.1	0.04	0.03	0.01	0.02	0.1	0.05	0.03	0.02	0.02	0.03	0.15	0.32	0.15	0.11	1.0	0.26	0.36	0.3	0.1	0.02	0.05
lcl\|BLLF01002351.1_cds_GFH23744.1_18221 (GFH23744)	0.25	0.14	0.28	0.12	0.16	0.14	0.21	0.05	0.17	0.36	0.11	0.13	0.1	0.04	0.17	0.51	0.37	0.19	0.09	1.0	0.17	0.45	0.2	0.08	0.09	0.08
lcl\|BLLF01002632.1_cds_GFH24787.1_19264 (GFH24787)	0.95	0.0	0.0	0.0	0.16	0.2	0.07	0.18	0.13	0.85	0.25	0.2	0.11	0.0	0.19	0.96	0.45	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.16	0.11
lcl\|BLLF01002735.1_cds_GFH25152.1_19629 (GFH25152)	0.2	0.12	0.26	0.24	0.25	0.17	0.1	0.14	0.14	0.43	0.2	0.11	0.08	0.12	0.11	0.12	0.14	0.17	0.09	1.0	0.25	0.17	0.12	0.07	0.09	0.16
lcl\|BLLF01002927.1_cds_GFH25813.1_20290 (GFH25813)	0.21	0.0	0.0	0.09	0.03	0.17	0.07	0.03	0.03	0.19	0.06	0.18	0.03	0.06	0.0	0.27	1.0	0.42	0.32	0.54	0.29	0.0	0.0	0.14	0.19	0.1
lcl\|BLLF01003044.1_cds_GFH26172.1_20649 (GFH26172)	0.12	0.16	0.25	0.12	0.09	0.05	0.07	0.02	0.06	0.21	0.07	0.04	0.05	0.03	0.05	0.15	0.02	0.08	0.02	1.0	0.13	0.09	0.03	0.01	0.04	0.16
lcl\|BLLF01003256.1_cds_GFH26833.1_21310 (GFH26833)	0.47	0.09	0.1	0.26	0.25	0.12	0.11	0.14	0.15	0.18	0.26	0.12	0.11	0.13	0.11	0.18	0.25	0.42	0.26	1.0	0.59	0.14	0.36	0.04	0.06	0.14
lcl\|BLLF01003358.1_cds_GFH27124.1_21601 (GFH27124)	0.0	0.0	0.0	0.14	0.42	0.09	0.16	0.19	0.34	0.0	0.32	0.07	0.16	0.09	0.09	0.43	0.32	0.34	0.25	1.0	0.46	0.27	0.0	0.07	0.19	0.04
lcl\|BLLF01003537.1_cds_GFH27596.1_22073 (GFH27596)	0.61	0.07	0.01	0.04	0.43	0.3	0.28	0.2	0.33	0.65	0.24	0.09	0.17	0.08	0.14	0.25	0.27	0.24	0.13	1.0	0.18	0.1	0.18	0.07	0.1	0.05
lcl\|BLLF01003613.1_cds_GFH27773.1_22250 (GFH27773)	0.68	0.44	0.39	0.5	0.81	0.58	0.49	0.63	0.57	0.45	0.68	0.48	0.65	0.6	0.61	0.8	1.0	0.73	0.94	0.89	0.73	0.86	0.64	0.4	0.34	0.25
lcl\|BLLF01003651.1_cds_GFH27863.1_22340 (GFH27863)	0.83	0.15	0.0	0.0	0.04	0.24	0.07	0.02	0.03	0.29	0.08	0.05	0.0	0.02	0.09	0.16	0.0	0.26	0.0	1.0	0.53	0.2	0.6	0.3	0.0	0.1
lcl\|BLLF01003688.1_cds_GFH27958.1_22435 (GFH27958)	0.21	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.13	0.13	0.2	1.0	0.74	0.42	0.0	0.07	0.0	0.03
lcl\|BLLF01003905.1_cds_GFH28501.1_22978 (GFH28501)	0.55	0.0	0.0	0.06	0.15	0.13	0.1	0.12	0.17	0.08	0.13	0.06	0.07	0.08	0.1	0.23	0.34	0.14	0.2	1.0	0.37	0.07	0.18	0.08	0.28	0.16
lcl\|BLLF01004414.1_cds_GFH29559.1_24036 (GFH29559)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.11	0.16	0.09	0.09	0.0	0.09	0.18	0.09	0.02	0.4	0.06	0.0	0.21	0.11	0.55	0.25	0.06	0.45	0.58	0.25	0.1
lcl\|BLLF01004718.1_cds_GFH30124.1_24601 (GFH30124)	0.72	0.05	0.0	0.0	0.08	0.02	0.02	0.04	0.01	0.15	0.03	0.01	0.0	0.01	0.0	0.04	0.09	0.0	0.05	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.38	0.07
lcl\|BLLF01004921.1_cds_GFH30458.1_24935 (GFH30458)	0.14	0.21	0.4	0.21	0.18	0.17	0.15	0.12	0.12	0.2	0.16	0.13	0.13	0.15	0.1	0.12	0.28	0.2	0.14	1.0	0.2	0.35	0.16	0.17	0.16	0.12
lcl\|BLLF01005677.1_cds_GFH31502.1_25979 (GFH31502)	0.83	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)