Heatmap: Cluster_32 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000005.1_cds_GFH05687.1_164 (GFH05687)	0.11	0.0	0.0	0.14	0.08	0.12	0.26	0.05	0.14	0.04	0.08	0.1	0.19	0.05	0.17	1.0	0.37	0.24	0.07	0.0	0.2	0.15	0.48	0.48	0.09	0.08
lcl\|BLLF01000062.1_cds_GFH06910.1_1387 (GFH06910)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000109.1_cds_GFH07678.1_2155 (GFH07678)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.17	0.18	0.02	0.25	0.0	0.0	0.04	0.1	0.04	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000210.1_cds_GFH09121.1_3598 (GFH09121)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000237.1_cds_GFH09474.1_3951 (GFH09474)	0.0	0.0	0.0	0.13	0.08	0.08	0.21	0.19	0.26	0.27	0.05	0.09	0.55	0.16	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	1.0	0.14	0.07
lcl\|BLLF01000257.1_cds_GFH09722.1_4199 (GFH09722)	0.37	0.0	0.0	0.0	0.62	0.3	0.31	0.0	0.15	1.0	0.18	0.46	0.85	0.28	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.69	0.25	0.51
lcl\|BLLF01000350.1_cds_GFH10820.1_5297 (GFH10820)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000373.1_cds_GFH11093.1_5570 (GFH11093)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000402.1_cds_GFH11417.1_5894 (GFH11417)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.28	0.27	0.24	0.49	0.0	0.3	0.18	0.39	0.47	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.38	0.31
lcl\|BLLF01000435.1_cds_GFH11792.1_6269 (GFH11792)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.31	0.0	0.0	0.15	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.53
lcl\|BLLF01000518.1_cds_GFH12591.1_7068 (GFH12591)	0.0	0.56	0.0	0.11	0.18	0.26	0.09	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.53	0.29	0.24
lcl\|BLLF01000527.1_cds_GFH12668.1_7145 (GFH12668)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.5	0.17	0.35	0.3	0.16	0.0	0.17	0.0	0.35	0.38	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.56	0.28
lcl\|BLLF01000600.1_cds_GFH13335.1_7812 (GFH13335)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000646.1_cds_GFH13735.1_8212 (GFH13735)	0.02	0.0	0.0	0.05	0.01	0.0	0.05	0.03	0.05	0.38	0.05	0.0	0.01	0.01	0.02	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	1.0	0.06	0.0
lcl\|BLLF01000675.1_cds_GFH14002.1_8479 (GFH14002)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000703.1_cds_GFH14242.1_8719 (GFH14242)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.21	0.22	0.0	0.0	0.0	0.27	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000718.1_cds_GFH14375.1_8852 (GFH14375)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000747.1_cds_GFH14617.1_9094 (GFH14617)	0.0	0.0	0.0	0.05	1.0	0.6	0.41	0.17	0.57	0.0	0.81	0.24	0.73	0.88	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.43	0.07
lcl\|BLLF01000823.1_cds_GFH15230.1_9707 (GFH15230)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.99	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.68	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000893.1_cds_GFH15737.1_10214 (GFH15737)	0.0	0.0	0.0	0.36	0.36	0.12	0.32	0.06	0.35	0.0	0.58	0.18	0.14	0.37	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.2	0.0
lcl\|BLLF01000920.1_cds_GFH15924.1_10401 (GFH15924)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.23	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000923.1_cds_GFH15942.1_10419 (GFH15942)	0.01	0.0	0.0	0.12	0.05	0.07	0.1	0.04	0.1	0.55	0.06	0.04	0.05	0.01	0.13	0.0	0.06	0.0	0.0	0.03	0.04	0.2	0.16	1.0	0.6	0.09
lcl\|BLLF01000934.1_cds_GFH16022.1_10499 (GFH16022)	0.11	0.6	0.0	0.54	0.68	0.27	0.09	0.37	0.22	0.58	0.34	0.0	0.05	0.29	0.26	0.41	0.61	0.64	0.0	0.54	0.44	0.0	0.32	1.0	0.37	0.52
lcl\|BLLF01001163.1_cds_GFH17533.1_12010 (GFH17533)	0.0	0.0	0.0	0.46	0.23	0.08	0.0	0.14	0.07	1.0	0.08	0.08	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.6	0.65	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001184.1_cds_GFH17668.1_12145 (GFH17668)	0.05	0.0	0.04	0.0	0.08	0.19	0.11	0.11	0.08	0.2	0.01	0.17	0.23	0.07	0.3	1.0	0.13	0.35	0.11	0.12	0.11	0.25	0.48	0.27	0.23	0.11
lcl\|BLLF01001293.1_cds_GFH18386.1_12863 (GFH18386)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.25	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.42	0.0
lcl\|BLLF01001515.1_cds_GFH19749.1_14226 (GFH19749)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.83	0.23	0.48	0.57	0.0	0.4	0.22	0.82	0.68	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001522.1_cds_GFH19806.1_14283 (GFH19806)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001527.1_cds_GFH19833.1_14310 (GFH19833)	0.2	0.17	0.03	0.09	0.05	0.05	0.11	0.02	0.11	0.0	0.06	0.07	0.03	0.05	0.04	0.5	0.22	0.0	0.15	0.17	0.11	0.23	0.13	1.0	0.02	0.04
lcl\|BLLF01001641.1_cds_GFH20467.1_14944 (GFH20467)	0.0	0.0	0.0	0.63	0.21	0.11	0.16	0.43	0.5	0.0	0.61	0.11	0.51	0.52	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.09	0.35
lcl\|BLLF01001682.1_cds_GFH20701.1_15178 (GFH20701)	0.0	0.0	0.0	0.27	0.31	0.15	0.41	0.21	0.17	0.0	0.0	0.08	0.17	0.16	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.13
lcl\|BLLF01001699.1_cds_GFH20800.1_15277 (GFH20800)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001853.1_cds_GFH21558.1_16035 (GFH21558)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.25	0.1	0.05	0.0	0.0	0.05	0.05	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001903.1_cds_GFH21774.1_16251 (GFH21774)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.2	0.0	0.17	0.19	0.0	0.0	0.2	0.0	0.39	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.32
lcl\|BLLF01001947.1_cds_GFH22002.1_16479 (GFH22002)	0.08	0.0	0.0	0.41	0.1	0.17	0.39	0.22	0.26	0.0	0.3	0.07	0.31	0.38	0.16	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.34	0.0	0.24	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001972.1_cds_GFH22114.1_16591 (GFH22114)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.5	1.0
lcl\|BLLF01002292.1_cds_GFH23516.1_17993 (GFH23516)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002351.1_cds_GFH23745.1_18222 (GFH23745)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002447.1_cds_GFH24115.1_18592 (GFH24115)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.0	1.0
lcl\|BLLF01002476.1_cds_GFH24220.1_18697 (GFH24220)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.28
lcl\|BLLF01002498.1_cds_GFH24303.1_18780 (GFH24303)	0.0	0.24	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.11	0.11	0.06	0.03	0.05	0.03	1.0	0.1	0.11	0.0	0.0	0.15	0.0	0.74	0.45	0.03	0.0
lcl\|BLLF01002636.1_cds_GFH24807.1_19284 (GFH24807)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002645.1_cds_GFH24837.1_19314 (GFH24837)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.7	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002719.1_cds_GFH25098.1_19575 (GFH25098)	0.33	0.0	0.0	0.0	0.12	0.03	0.26	0.24	0.15	0.6	0.06	0.13	0.41	0.14	0.3	0.89	0.22	0.7	0.0	0.37	0.66	0.0	0.22	1.0	0.17	0.11
lcl\|BLLF01002776.1_cds_GFH25303.1_19780 (GFH25303)	0.0	0.0	0.0	0.55	0.05	0.19	0.36	0.25	0.23	0.27	0.07	0.15	0.16	0.0	0.27	0.38	0.0	0.0	0.0	0.26	0.44	0.0	0.35	1.0	0.08	0.3
lcl\|BLLF01002997.1_cds_GFH26037.1_20514 (GFH26037)	0.07	0.0	0.0	0.32	0.95	0.8	0.46	0.5	0.67	0.35	1.0	0.52	0.83	0.9	0.44	0.0	0.12	0.38	0.19	0.43	0.18	0.0	0.25	0.59	0.38	0.51
lcl\|BLLF01003012.1_cds_GFH26073.1_20550 (GFH26073)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003019.1_cds_GFH26096.1_20573 (GFH26096)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.17	0.19	0.31	0.0	0.0	0.0	0.17	0.2	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003845.1_cds_GFH28363.1_22840 (GFH28363)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004019.1_cds_GFH28749.1_23226 (GFH28749)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.68	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004048.1_cds_GFH28811.1_23288 (GFH28811)	0.13	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.07	0.05	0.16	0.35	0.0	0.11	0.12	0.11	0.31	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.45	0.0	0.09
lcl\|BLLF01004181.1_cds_GFH29098.1_23575 (GFH29098)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.15	0.0	0.06	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.24	0.0	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004281.1_cds_GFH29304.1_23781 (GFH29304)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	1.0	0.0
lcl\|BLLF01004407.1_cds_GFH29545.1_24022 (GFH29545)	0.0	0.0	0.0	0.28	0.14	0.14	0.18	0.34	0.22	0.0	0.29	0.0	0.1	0.04	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.46	0.52	0.0	1.0	0.08	0.15
lcl\|BLLF01004518.1_cds_GFH29767.1_24244 (GFH29767)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004542.1_cds_GFH29817.1_24294 (GFH29817)	0.0	0.0	0.0	0.28	0.09	0.09	0.48	0.13	0.27	0.61	0.1	0.0	0.31	0.0	0.09	0.0	0.32	0.34	0.5	0.0	0.0	0.0	1.0	0.78	0.08	0.08
lcl\|BLLF01004633.1_cds_GFH29988.1_24465 (GFH29988)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004701.1_cds_GFH30090.1_24567 (GFH30090)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004764.1_cds_GFH30203.1_24680 (GFH30203)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0
lcl\|BLLF01005179.1_cds_GFH30841.1_25318 (GFH30841)	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.0
lcl\|BLLF01005250.1_cds_GFH30951.1_25428 (GFH30951)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0
lcl\|BLLF01005438.1_cds_GFH31202.1_25679 (GFH31202)	0.0	0.0	0.0	0.18	0.06	0.0	0.0	0.11	0.11	0.0	0.12	0.06	0.12	0.11	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.39	0.1
lcl\|BLLF01007258.1_cds_GFH32861.1_27338 (GFH32861)	0.0	0.0	0.0	0.11	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01007269.1_cds_GFH32867.1_27344 (GFH32867)	0.04	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.18	0.05	0.25	0.12	0.04	0.0	0.1	0.04	0.09	1.0	0.0	0.13	0.0	0.33	0.0	0.0	0.78	0.48	0.03	0.03
lcl\|BLLF01007415.1_cds_GFH32941.1_27418 (GFH32941)	0.23	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.12	0.05	0.05	1.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.3	0.0	0.13	0.39	0.0	0.08
lcl\|BLLF01008069.1_cds_GFH33241.1_27718 (GFH33241)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.2	0.56	0.38	0.0	0.23	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.67
lcl\|BLLF01008265.1_cds_GFH33312.1_27789 (GFH33312)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01008338.1_cds_GFH33334.1_27811 (GFH33334)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01009341.1_cds_GFH33693.1_28170 (GFH33693)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)