Heatmap: Cluster_286 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000023.1_cds_GFH06116.1_593 (GFH06116)	0.21	0.31	0.0	0.05	0.26	0.37	0.3	0.17	0.27	0.39	0.24	0.27	0.28	0.24	0.21	1.0	0.4	0.32	0.07	0.11	0.51	0.22	0.24	0.07	0.27	0.53
lcl\|BLLF01000032.1_cds_GFH06307.1_784 (GFH06307)	0.28	0.18	0.0	0.31	0.39	0.57	0.51	0.26	0.66	0.29	0.63	0.43	0.48	0.47	0.64	0.77	0.37	0.53	0.14	0.24	0.58	0.15	0.3	0.18	0.95	1.0
lcl\|BLLF01000043.1_cds_GFH06536.1_1013 (GFH06536)	0.2	0.18	0.0	0.51	0.6	0.63	0.44	0.46	0.39	0.52	0.55	0.52	0.47	0.5	0.31	0.33	0.58	0.51	0.43	0.57	0.49	0.71	0.38	0.67	1.0	0.98
lcl\|BLLF01000116.1_cds_GFH07793.1_2270 (GFH07793)	0.21	0.0	0.0	0.24	0.53	0.53	0.5	0.11	0.29	0.13	0.5	0.37	0.29	0.25	0.15	0.19	0.0	0.29	0.33	0.19	0.4	0.0	0.36	0.23	0.67	1.0
lcl\|BLLF01000124.1_cds_GFH07910.1_2387 (GFH07910)	0.13	0.24	0.26	0.09	0.57	0.44	0.32	0.36	0.27	0.17	0.59	0.7	0.41	0.4	0.17	0.08	0.16	0.28	0.73	0.48	0.18	0.18	0.21	0.19	0.88	1.0
lcl\|BLLF01000165.1_cds_GFH08501.1_2978 (GFH08501)	0.0	0.0	0.0	0.6	0.3	0.8	0.23	0.25	0.1	0.0	0.72	0.53	0.51	0.34	0.19	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.98	1.0
lcl\|BLLF01000222.1_cds_GFH09294.1_3771 (GFH09294)	0.06	0.02	0.0	0.01	0.86	0.51	0.3	0.27	0.2	0.26	0.52	0.39	0.17	0.14	0.13	0.58	0.53	0.38	0.24	0.5	0.15	0.04	0.34	0.16	0.94	1.0
lcl\|BLLF01000228.1_cds_GFH09366.1_3843 (GFH09366)	0.2	0.14	0.0	0.28	0.72	0.73	0.63	0.39	0.79	0.31	0.85	0.56	0.61	0.66	0.5	1.0	0.86	0.53	0.5	0.3	0.58	0.3	0.48	0.37	0.42	0.87
lcl\|BLLF01000290.1_cds_GFH10146.1_4623 (GFH10146)	0.05	0.03	0.0	0.16	0.32	0.25	0.53	0.28	0.59	0.26	0.4	0.19	0.41	0.28	0.53	0.49	0.48	0.36	0.15	0.04	0.52	0.09	0.53	0.24	0.63	1.0
lcl\|BLLF01000318.1_cds_GFH10480.1_4957 (GFH10480)	0.5	0.0	0.0	0.24	0.52	0.55	0.57	0.39	0.55	0.37	0.71	0.36	0.42	0.25	0.39	0.83	0.39	0.0	0.12	0.14	0.34	0.39	0.41	0.24	0.89	1.0
lcl\|BLLF01000336.1_cds_GFH10680.1_5157 (GFH10680)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.62	0.4	0.49	0.58	0.39	0.73	0.49	0.58	0.69	0.69	0.55	0.73	0.53	0.4	0.16	0.73	0.04	0.34	0.16	1.0	0.85
lcl\|BLLF01000339.1_cds_GFH10715.1_5192 (GFH10715)	0.2	0.02	0.0	0.29	0.42	0.39	0.45	0.16	0.33	0.32	0.6	0.44	0.43	0.39	0.18	0.79	1.0	0.18	0.13	0.07	0.48	0.28	0.09	0.21	0.91	0.76
lcl\|BLLF01000368.1_cds_GFH11038.1_5515 (GFH11038)	0.2	0.53	0.21	0.01	0.46	0.71	0.43	0.33	0.43	0.82	0.59	0.61	0.41	0.49	0.36	0.65	0.59	0.58	0.18	0.16	0.98	0.28	0.34	0.29	0.67	1.0
lcl\|BLLF01000414.1_cds_GFH11557.1_6034 (GFH11557)	0.32	0.08	0.0	0.33	0.46	0.45	0.49	0.38	0.46	0.61	0.37	0.4	0.41	0.38	0.49	0.14	0.12	0.42	0.16	0.18	0.51	0.2	0.39	0.28	0.62	1.0
lcl\|BLLF01000417.1_cds_GFH11600.1_6077 (GFH11600)	0.1	0.29	0.22	0.15	0.55	0.53	0.63	0.32	0.51	0.87	0.63	0.55	0.48	0.4	0.43	0.88	0.74	0.53	0.24	0.32	0.81	0.27	0.46	0.22	0.85	1.0
lcl\|BLLF01000449.1_cds_GFH11922.1_6399 (GFH11922)	0.17	0.43	0.02	0.21	0.71	0.64	0.35	0.44	0.39	0.67	0.65	0.41	0.36	0.45	0.22	0.26	0.43	0.62	0.0	0.11	0.85	0.07	0.45	0.15	0.5	1.0
lcl\|BLLF01000556.1_cds_GFH12934.1_7411 (GFH12934)	0.31	0.01	0.0	0.35	0.58	0.49	0.45	0.29	0.35	0.08	0.46	0.34	0.41	0.33	0.35	0.6	0.7	0.32	0.13	0.25	0.45	0.74	0.2	0.49	1.0	0.83
lcl\|BLLF01000591.1_cds_GFH13250.1_7727 (GFH13250)	0.18	0.02	0.01	0.2	0.19	0.66	0.57	0.3	0.32	0.18	0.61	0.4	0.71	0.54	0.27	0.21	0.27	0.2	0.31	0.24	0.23	0.19	0.2	0.07	0.97	1.0
lcl\|BLLF01000593.1_cds_GFH13278.1_7755 (GFH13278)	0.23	0.0	0.0	0.23	0.91	0.7	0.59	0.46	0.51	0.43	0.9	0.62	0.42	0.7	0.31	0.73	0.69	0.63	0.52	0.3	0.53	0.4	0.63	0.34	0.82	1.0
lcl\|BLLF01000711.1_cds_GFH14318.1_8795 (GFH14318)	0.35	0.0	0.0	0.0	0.38	0.35	0.5	0.14	0.12	0.32	0.47	0.38	0.36	0.24	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	1.0
lcl\|BLLF01000789.1_cds_GFH14969.1_9446 (GFH14969)	0.2	0.07	0.0	0.19	0.34	0.36	0.36	0.19	0.36	0.15	0.36	0.41	0.32	0.44	0.25	0.9	0.57	0.58	0.43	0.35	0.53	0.42	0.62	0.48	1.0	0.62
lcl\|BLLF01000889.1_cds_GFH15718.1_10195 (GFH15718)	0.27	0.19	0.0	0.11	0.4	0.52	0.56	0.4	0.53	0.73	0.56	0.59	0.51	0.34	0.67	0.43	0.65	0.54	0.35	0.21	0.28	0.0	0.33	0.15	1.0	0.81
lcl\|BLLF01001054.1_cds_GFH16808.1_11285 (GFH16808)	0.56	0.26	0.24	0.35	0.59	0.53	0.6	0.28	0.48	0.45	0.61	0.55	0.51	0.42	0.39	0.99	0.9	0.57	0.36	0.5	0.59	0.68	0.44	0.58	1.0	0.83
lcl\|BLLF01001241.1_cds_GFH18045.1_12522 (GFH18045)	0.34	0.21	0.0	0.12	0.57	0.4	0.38	0.22	0.3	0.36	0.42	0.45	0.26	0.32	0.21	1.0	0.7	0.33	0.7	0.32	0.4	0.35	0.35	0.55	0.68	0.99
lcl\|BLLF01001503.1_cds_GFH19690.1_14167 (GFH19690)	0.2	0.0	0.0	0.33	0.56	0.6	0.54	0.19	0.32	0.22	0.53	0.47	0.27	0.24	0.42	0.2	0.23	0.56	0.12	0.2	0.33	0.38	0.16	0.3	0.49	1.0
lcl\|BLLF01001531.1_cds_GFH19854.1_14331 (GFH19854)	0.13	0.16	0.0	0.04	0.39	0.48	0.28	0.17	0.24	0.42	0.32	0.33	0.28	0.2	0.16	1.0	0.27	0.36	0.07	0.11	0.64	0.23	0.34	0.17	0.24	0.44
lcl\|BLLF01001531.1_cds_GFH19856.1_14333 (GFH19856)	0.18	0.52	0.0	0.03	0.4	0.49	0.42	0.33	0.36	0.43	0.36	0.36	0.37	0.3	0.27	1.0	0.58	0.53	0.12	0.17	0.81	0.39	0.47	0.16	0.43	0.66
lcl\|BLLF01001564.1_cds_GFH20049.1_14526 (GFH20049)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.15	0.06	0.17	0.03	0.26	0.36	0.5	0.3	0.28	0.02	0.08	0.0	0.24	0.0	0.1	0.08	0.0	0.12	0.05	0.67	1.0
lcl\|BLLF01001630.1_cds_GFH20421.1_14898 (GFH20421)	0.24	0.32	0.0	0.03	0.69	0.89	0.68	0.43	0.5	0.22	1.0	0.7	0.52	0.76	0.42	0.61	0.87	0.62	0.3	0.44	0.52	0.5	0.65	0.35	0.72	0.93
lcl\|BLLF01001690.1_cds_GFH20745.1_15222 (GFH20745)	0.26	0.35	0.0	0.0	0.35	0.2	0.43	0.09	0.28	0.36	0.19	0.15	0.12	0.1	0.09	0.0	0.0	0.26	0.0	0.11	0.18	0.0	0.39	0.02	1.0	0.86
lcl\|BLLF01001753.1_cds_GFH21054.1_15531 (GFH21054)	0.52	0.13	0.0	0.19	0.77	0.54	0.56	0.32	0.34	0.5	0.55	0.35	0.26	0.32	0.46	0.65	0.31	0.55	0.28	0.33	0.51	0.51	0.32	0.27	1.0	0.87
lcl\|BLLF01001802.1_cds_GFH21302.1_15779 (GFH21302)	0.14	0.22	0.14	0.18	0.73	0.81	0.62	0.6	0.53	0.26	0.79	0.53	0.54	0.64	0.35	0.46	1.0	0.43	0.17	0.46	0.62	0.15	0.47	0.27	0.77	0.92
lcl\|BLLF01002047.1_cds_GFH22472.1_16949 (GFH22472)	0.11	0.05	0.0	0.12	0.44	0.51	0.35	0.34	0.26	0.21	0.51	0.46	0.51	0.45	0.17	0.5	0.37	0.39	0.24	0.3	0.54	0.19	0.58	0.14	0.98	1.0
lcl\|BLLF01002055.1_cds_GFH22513.1_16990 (GFH22513)	0.28	0.58	0.2	0.31	1.0	0.89	0.56	0.71	0.66	0.63	0.89	0.65	0.67	0.7	0.41	0.65	0.83	0.98	0.44	0.4	0.83	0.19	0.63	0.28	0.81	0.87
lcl\|BLLF01002349.1_cds_GFH23739.1_18216 (GFH23739)	0.28	0.08	0.0	0.17	0.38	0.4	0.29	0.34	0.49	0.37	0.57	0.29	0.49	0.29	0.26	0.46	0.74	0.41	0.08	0.0	0.43	0.25	0.51	0.09	0.65	1.0
lcl\|BLLF01002382.1_cds_GFH23866.1_18343 (GFH23866)	0.0	0.0	0.0	0.09	0.6	0.64	0.66	0.66	0.33	0.13	0.82	0.39	0.52	0.61	0.32	0.64	0.74	0.28	0.53	0.0	0.1	0.23	0.49	0.17	1.0	0.75
lcl\|BLLF01002427.1_cds_GFH24041.1_18518 (GFH24041)	0.0	0.0	0.0	0.07	0.23	0.42	0.52	0.27	0.58	0.08	0.52	0.35	0.43	0.27	0.25	0.11	0.25	0.18	0.13	0.23	0.25	0.0	0.18	0.15	0.86	1.0
lcl\|BLLF01002573.1_cds_GFH24569.1_19046 (GFH24569)	0.19	0.36	0.15	0.03	0.62	0.53	0.47	0.45	0.48	0.5	0.58	0.51	0.5	0.44	0.33	1.0	0.51	0.44	0.15	0.23	0.5	0.33	0.35	0.18	0.51	0.73
lcl\|BLLF01002612.1_cds_GFH24712.1_19189 (GFH24712)	0.33	0.25	0.0	0.12	1.0	0.68	0.31	0.6	0.18	0.39	0.74	0.6	0.3	0.48	0.09	0.55	0.58	0.3	0.27	0.19	0.32	0.11	0.28	0.11	0.67	0.99
lcl\|BLLF01002637.1_cds_GFH24809.1_19286 (GFH24809)	0.19	0.06	0.0	0.22	0.71	0.63	0.6	0.35	0.48	0.52	0.71	0.56	0.62	0.39	0.43	0.89	0.77	0.46	0.25	0.25	0.45	0.41	0.43	0.24	1.0	0.96
lcl\|BLLF01003035.1_cds_GFH26136.1_20613 (GFH26136)	0.1	0.0	0.0	0.58	0.55	0.51	0.64	0.2	0.41	0.06	0.56	0.39	0.42	0.31	0.27	0.42	0.31	0.39	0.1	0.39	0.27	0.42	0.2	0.36	1.0	0.84
lcl\|BLLF01004353.1_cds_GFH29457.1_23934 (GFH29457)	0.28	0.43	0.25	0.1	0.92	0.86	0.58	0.65	0.62	0.72	0.8	0.65	0.55	0.58	0.41	1.0	0.57	0.41	0.11	0.22	0.7	0.25	0.36	0.46	0.65	0.89
lcl\|BLLF01005223.1_cds_GFH30901.1_25378 (GFH30901)	0.53	0.32	0.17	0.37	0.7	0.48	0.46	0.32	0.33	0.37	0.53	0.42	0.34	0.34	0.23	0.24	0.24	0.27	0.54	0.38	0.41	0.3	0.38	0.21	1.0	0.92
lcl\|BLLF01005450.1_cds_GFH31213.1_25690 (GFH31213)	0.12	0.07	0.0	0.42	0.44	0.34	0.28	0.24	0.26	0.39	0.48	0.31	0.37	0.33	0.28	0.47	0.92	0.76	0.2	0.28	0.83	0.68	0.49	0.47	0.8	1.0
lcl\|BLLF01005890.1_cds_GFH31736.1_26213 (GFH31736)	0.63	0.33	0.0	0.06	0.54	0.61	0.5	0.24	0.47	0.75	0.45	0.41	0.35	0.31	0.31	1.0	0.28	0.39	0.22	0.25	0.54	0.46	0.19	0.38	0.94	0.98
lcl\|BLLF01007404.1_cds_GFH32935.1_27412 (GFH32935)	0.02	0.22	0.0	0.05	0.55	0.63	0.5	0.44	0.55	1.0	0.71	0.51	0.45	0.46	0.63	0.49	0.39	0.19	0.67	0.35	0.77	0.35	0.39	0.3	0.96	0.82
lcl\|BLLF01007720.1_cds_GFH33083.1_27560 (GFH33083)	0.16	0.1	0.0	0.02	0.67	0.79	0.69	0.28	0.66	0.37	0.65	0.6	0.8	0.55	0.56	1.0	0.66	0.69	0.13	0.12	0.56	0.5	0.29	0.24	0.75	0.89

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)