Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
0.37 0.35 0.0 0.0 0.05 0.07 0.07 0.04 0.08 0.2 0.06 0.03 0.1 0.04 0.11 1.0 0.34 0.18 0.0 0.14 0.15 0.09 0.06 0.0 0.03 0.17
0.04 0.6 0.0 0.06 0.31 0.21 0.13 0.08 0.16 0.17 0.24 0.12 0.09 0.11 0.12 1.0 0.32 0.35 0.15 0.27 0.37 0.21 0.28 0.22 0.15 0.34
0.15 0.32 0.08 0.03 0.11 0.13 0.1 0.05 0.09 0.3 0.1 0.08 0.07 0.05 0.07 1.0 0.25 0.15 0.07 0.16 0.32 0.25 0.17 0.16 0.26 0.45
0.2 0.27 0.04 0.01 0.28 0.38 0.3 0.27 0.34 0.17 0.21 0.24 0.2 0.17 0.23 1.0 0.2 0.16 0.18 0.35 0.21 0.19 0.21 0.27 0.28 0.89
0.04 0.12 0.0 0.01 0.08 0.12 0.11 0.11 0.11 0.2 0.08 0.07 0.04 0.07 0.07 1.0 0.16 0.08 0.05 0.07 0.17 0.12 0.11 0.13 0.33 0.89
0.13 0.22 0.06 0.01 0.08 0.11 0.1 0.1 0.1 0.21 0.07 0.06 0.05 0.07 0.06 1.0 0.15 0.12 0.05 0.16 0.23 0.21 0.14 0.12 0.18 0.55
0.41 0.37 0.14 0.18 0.18 0.16 0.14 0.1 0.18 0.54 0.16 0.13 0.15 0.12 0.13 1.0 0.45 0.34 0.19 0.29 0.53 0.42 0.28 0.18 0.26 0.33
0.28 0.25 0.0 0.06 0.38 0.35 0.38 0.24 0.35 0.3 0.27 0.36 0.21 0.23 0.11 0.8 0.38 0.52 0.25 0.3 0.38 0.38 0.6 0.28 0.51 1.0
0.34 0.46 0.0 0.0 0.16 0.23 0.23 0.33 0.23 0.24 0.11 0.13 0.13 0.18 0.19 1.0 0.28 0.3 0.16 0.32 0.57 0.29 0.3 0.12 0.26 0.45
0.32 0.41 0.09 0.06 0.1 0.18 0.09 0.19 0.17 0.25 0.09 0.11 0.1 0.11 0.13 1.0 0.07 0.16 0.12 0.24 0.26 0.16 0.19 0.18 0.16 0.48
0.19 0.44 0.0 0.03 0.09 0.11 0.11 0.12 0.16 0.41 0.08 0.05 0.07 0.1 0.12 1.0 0.12 0.15 0.08 0.16 0.32 0.14 0.26 0.15 0.3 0.77
0.12 0.03 0.0 0.01 0.09 0.21 0.19 0.1 0.19 0.21 0.08 0.12 0.08 0.07 0.12 1.0 0.07 0.1 0.01 0.11 0.13 0.09 0.19 0.14 0.15 0.65
0.24 0.21 0.0 0.01 0.12 0.17 0.13 0.12 0.12 0.4 0.13 0.14 0.1 0.11 0.12 1.0 0.21 0.26 0.08 0.13 0.17 0.36 0.24 0.23 0.26 0.52
0.3 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.06 0.04 0.08 0.37 0.08 0.08 0.04 0.08 0.06 1.0 0.19 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.34
0.19 0.08 0.0 0.07 0.15 0.22 0.2 0.12 0.18 0.44 0.11 0.12 0.13 0.09 0.15 1.0 0.13 0.08 0.01 0.09 0.12 0.11 0.12 0.17 0.18 0.55
0.25 0.28 0.0 0.01 0.11 0.19 0.15 0.09 0.15 0.37 0.12 0.13 0.14 0.11 0.14 1.0 0.23 0.25 0.25 0.39 0.28 0.11 0.18 0.11 0.12 0.38
0.31 0.35 0.05 0.03 0.24 0.23 0.18 0.19 0.22 0.32 0.19 0.15 0.14 0.13 0.13 1.0 0.48 0.41 0.32 0.58 0.56 0.49 0.37 0.3 0.22 0.31
0.16 0.31 0.25 0.2 0.29 0.27 0.25 0.15 0.26 0.11 0.28 0.23 0.2 0.16 0.26 1.0 0.64 0.24 0.31 0.39 0.21 0.4 0.39 0.29 0.26 0.17
0.21 0.37 0.08 0.04 0.18 0.18 0.15 0.18 0.17 0.4 0.15 0.15 0.14 0.15 0.14 1.0 0.22 0.19 0.1 0.18 0.33 0.18 0.19 0.13 0.23 0.49
0.42 0.38 0.18 0.04 0.23 0.21 0.15 0.16 0.19 0.63 0.21 0.13 0.15 0.14 0.11 1.0 0.76 0.55 0.12 0.22 0.72 0.21 0.45 0.31 0.29 0.48
0.6 0.17 0.08 0.06 0.13 0.14 0.14 0.1 0.18 0.6 0.14 0.12 0.14 0.1 0.11 1.0 0.49 0.2 0.11 0.18 0.3 0.24 0.19 0.06 0.32 0.38
0.41 0.66 0.0 0.06 0.19 0.19 0.13 0.21 0.16 0.58 0.17 0.16 0.11 0.13 0.1 1.0 0.25 0.36 0.29 0.47 0.5 0.35 0.26 0.09 0.34 0.52
0.44 0.54 0.05 0.02 0.13 0.13 0.12 0.14 0.16 0.68 0.1 0.09 0.11 0.09 0.12 1.0 0.12 0.24 0.15 0.31 0.54 0.26 0.34 0.31 0.32 0.6
0.08 0.45 0.0 0.01 0.13 0.2 0.17 0.11 0.15 0.41 0.12 0.1 0.07 0.08 0.08 1.0 0.19 0.06 0.06 0.15 0.11 0.1 0.08 0.12 0.33 0.7
0.63 0.23 0.0 0.18 0.13 0.21 0.2 0.11 0.16 0.71 0.16 0.1 0.25 0.18 0.13 1.0 0.52 0.52 0.21 0.51 0.32 0.0 0.43 0.09 0.28 0.37
0.22 0.58 0.12 0.1 0.28 0.21 0.15 0.13 0.16 0.28 0.18 0.13 0.11 0.1 0.11 1.0 0.27 0.27 0.07 0.26 0.36 0.21 0.23 0.19 0.26 0.44
0.1 0.09 0.05 0.04 0.03 0.11 0.1 0.05 0.07 0.39 0.08 0.08 0.1 0.09 0.04 1.0 0.18 0.17 0.06 0.08 0.22 0.11 0.2 0.12 0.18 0.53
0.48 0.33 0.09 0.11 0.37 0.26 0.19 0.21 0.19 0.52 0.31 0.2 0.2 0.18 0.17 1.0 0.54 0.33 0.15 0.25 0.51 0.21 0.34 0.13 0.3 0.4
0.24 0.48 0.09 0.17 0.3 0.27 0.23 0.27 0.23 0.39 0.29 0.23 0.24 0.22 0.23 1.0 0.58 0.34 0.3 0.36 0.48 0.46 0.4 0.29 0.26 0.26
0.16 0.02 0.0 0.02 0.08 0.12 0.19 0.08 0.22 0.74 0.06 0.08 0.1 0.06 0.13 1.0 0.05 0.12 0.03 0.16 0.17 0.12 0.19 0.23 0.16 0.57
0.13 0.04 0.0 0.02 0.05 0.21 0.14 0.08 0.14 0.51 0.08 0.09 0.11 0.09 0.06 1.0 0.08 0.16 0.05 0.09 0.26 0.14 0.24 0.09 0.18 0.69
0.32 0.37 0.22 0.12 0.3 0.26 0.18 0.21 0.23 0.68 0.27 0.22 0.16 0.15 0.27 1.0 0.54 0.55 0.32 0.41 0.7 0.41 0.49 0.34 0.29 0.4
0.39 0.41 0.09 0.01 0.32 0.24 0.25 0.28 0.25 0.12 0.23 0.23 0.19 0.19 0.21 0.81 0.19 0.31 0.27 0.31 0.51 0.26 0.31 0.17 0.49 1.0
0.26 0.1 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.02 0.09 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 1.0 0.25 0.26 0.0 0.23 0.18 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06
0.1 0.35 0.03 0.01 0.02 0.03 0.04 0.02 0.03 0.07 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 1.0 0.43 0.14 0.17 0.24 0.19 0.02 0.15 0.04 0.05 0.05
0.46 0.45 0.16 0.08 0.2 0.22 0.18 0.16 0.25 0.68 0.18 0.16 0.16 0.13 0.16 1.0 0.22 0.39 0.27 0.5 0.67 0.35 0.37 0.19 0.4 0.53
0.22 0.16 0.0 0.07 0.05 0.04 0.02 0.02 0.06 0.31 0.05 0.02 0.04 0.0 0.0 1.0 0.36 0.0 0.0 0.14 0.56 0.0 0.0 0.01 0.2 0.49
0.39 0.59 0.05 0.06 0.21 0.24 0.18 0.33 0.23 0.68 0.21 0.18 0.18 0.22 0.2 1.0 0.23 0.49 0.16 0.34 0.76 0.35 0.48 0.28 0.5 0.81
0.54 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.08 0.04 0.03 0.47 0.07 0.0 0.04 0.0 0.0 0.54 1.0 0.48 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.08 0.39 0.35
0.55 0.19 0.0 0.0 0.18 0.24 0.22 0.21 0.18 0.71 0.2 0.17 0.27 0.23 0.19 1.0 0.81 0.35 0.53 0.18 0.59 0.11 0.28 0.15 0.61 0.45
0.02 0.39 0.0 0.02 0.07 0.12 0.09 0.05 0.11 0.33 0.08 0.09 0.07 0.06 0.06 1.0 0.61 0.17 0.1 0.12 0.22 0.26 0.22 0.19 0.17 0.23
0.09 0.35 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.07 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 1.0 0.25 0.33 0.12 0.2 0.41 0.1 0.34 0.04 0.05 0.06
0.29 0.36 0.01 0.04 0.08 0.1 0.09 0.07 0.12 0.32 0.08 0.07 0.07 0.06 0.08 1.0 0.25 0.24 0.18 0.23 0.45 0.29 0.27 0.27 0.16 0.35
0.61 0.39 0.0 0.07 0.29 0.31 0.25 0.33 0.32 0.43 0.29 0.29 0.33 0.32 0.31 0.98 0.37 0.39 0.28 0.4 0.48 0.32 0.38 0.19 0.49 1.0
0.26 0.38 0.03 0.06 0.25 0.22 0.16 0.16 0.16 0.23 0.17 0.13 0.12 0.14 0.12 1.0 0.3 0.23 0.06 0.27 0.32 0.16 0.18 0.19 0.22 0.29
0.35 0.39 0.0 0.12 0.08 0.15 0.13 0.06 0.13 0.65 0.1 0.11 0.15 0.14 0.1 1.0 0.3 0.45 0.19 0.42 0.54 0.37 0.39 0.15 0.21 0.42
0.79 0.44 0.23 0.15 0.31 0.36 0.36 0.37 0.41 0.76 0.36 0.32 0.38 0.33 0.36 1.0 0.92 0.59 0.26 0.35 0.59 0.59 0.55 0.23 0.58 0.75
0.23 0.25 0.0 0.04 0.11 0.11 0.1 0.08 0.18 0.32 0.11 0.1 0.11 0.08 0.12 1.0 0.16 0.3 0.17 0.28 0.41 0.06 0.21 0.23 0.42 0.6
0.18 0.39 0.0 0.02 0.14 0.14 0.14 0.11 0.17 0.39 0.16 0.1 0.11 0.11 0.11 1.0 0.25 0.22 0.17 0.17 0.41 0.21 0.25 0.11 0.23 0.38
0.2 0.3 0.02 0.02 0.12 0.16 0.15 0.09 0.14 0.3 0.12 0.11 0.15 0.1 0.1 1.0 0.32 0.22 0.25 0.35 0.36 0.27 0.18 0.22 0.23 0.36
0.23 0.34 0.04 0.03 0.08 0.11 0.09 0.15 0.13 0.23 0.07 0.08 0.07 0.09 0.09 1.0 0.08 0.1 0.05 0.12 0.14 0.18 0.15 0.18 0.16 0.4
0.29 0.12 0.0 0.02 0.15 0.18 0.15 0.13 0.14 0.22 0.13 0.15 0.13 0.1 0.1 1.0 0.28 0.06 0.09 0.12 0.1 0.15 0.12 0.25 0.37 0.69
0.54 0.42 0.11 0.05 0.24 0.25 0.19 0.29 0.27 0.46 0.17 0.14 0.16 0.19 0.21 1.0 0.23 0.31 0.15 0.24 0.44 0.36 0.33 0.15 0.42 0.86
0.13 0.51 0.06 0.03 0.05 0.06 0.03 0.06 0.06 0.25 0.05 0.03 0.03 0.03 0.03 1.0 0.3 0.19 0.08 0.17 0.27 0.23 0.19 0.07 0.12 0.21
0.26 0.28 0.0 0.09 0.11 0.16 0.14 0.1 0.13 0.36 0.09 0.14 0.14 0.11 0.14 1.0 0.18 0.24 0.29 0.26 0.17 0.22 0.29 0.14 0.18 0.17
0.3 0.38 0.12 0.04 0.22 0.28 0.26 0.2 0.23 0.38 0.24 0.2 0.18 0.19 0.17 1.0 0.3 0.14 0.07 0.12 0.3 0.08 0.2 0.25 0.5 0.91
0.02 0.36 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.41 0.0 0.19 0.14 0.05 0.23 0.34 0.11 0.12 0.01
0.2 0.08 0.0 0.02 0.09 0.18 0.18 0.13 0.23 0.2 0.09 0.11 0.11 0.09 0.15 1.0 0.07 0.06 0.05 0.12 0.2 0.14 0.1 0.24 0.39 0.77
0.06 0.43 0.0 0.02 0.11 0.09 0.11 0.1 0.11 0.27 0.1 0.08 0.08 0.08 0.07 1.0 0.46 0.17 0.08 0.13 0.24 0.23 0.17 0.1 0.16 0.2
0.27 0.28 0.0 0.03 0.19 0.22 0.16 0.13 0.18 0.35 0.17 0.12 0.1 0.1 0.1 1.0 0.31 0.21 0.05 0.13 0.43 0.22 0.17 0.11 0.42 0.6
0.49 0.19 0.0 0.0 0.19 0.21 0.15 0.06 0.18 0.38 0.14 0.13 0.12 0.09 0.08 0.93 0.3 0.12 0.04 0.14 0.23 0.15 0.14 0.16 0.38 1.0
0.13 0.39 0.15 0.11 0.14 0.18 0.12 0.13 0.14 0.54 0.14 0.09 0.07 0.09 0.1 1.0 0.27 0.33 0.11 0.23 0.46 0.3 0.29 0.2 0.27 0.51
0.22 0.32 0.05 0.03 0.15 0.15 0.1 0.15 0.13 0.16 0.12 0.1 0.07 0.08 0.09 1.0 0.21 0.24 0.21 0.33 0.36 0.14 0.26 0.15 0.3 0.55
0.32 0.46 0.0 0.05 0.07 0.07 0.07 0.13 0.11 0.2 0.07 0.07 0.08 0.08 0.08 1.0 0.16 0.14 0.06 0.12 0.18 0.1 0.19 0.15 0.16 0.27
0.49 0.09 0.0 0.0 0.14 0.37 0.36 0.21 0.19 0.8 0.18 0.03 0.28 0.32 0.11 0.42 1.0 0.33 0.66 0.28 0.76 0.0 0.22 0.24 0.23 0.31
0.16 0.36 0.01 0.01 0.04 0.04 0.03 0.05 0.03 0.29 0.03 0.03 0.02 0.03 0.03 1.0 0.26 0.24 0.1 0.22 0.3 0.4 0.2 0.11 0.17 0.28
0.03 0.46 0.0 0.0 0.13 0.11 0.11 0.08 0.03 0.26 0.13 0.05 0.03 0.15 0.03 1.0 0.63 0.42 0.0 0.13 0.28 0.27 0.0 0.06 0.09 0.24
0.26 0.05 0.0 0.01 0.09 0.09 0.09 0.15 0.12 0.34 0.08 0.08 0.08 0.09 0.1 1.0 0.19 0.19 0.12 0.2 0.32 0.39 0.24 0.28 0.16 0.23
0.15 0.39 0.0 0.14 0.12 0.15 0.11 0.06 0.13 0.33 0.13 0.09 0.09 0.1 0.08 1.0 0.58 0.31 0.16 0.14 0.37 0.35 0.22 0.08 0.13 0.2
0.22 0.17 0.04 0.01 0.09 0.11 0.08 0.12 0.1 0.32 0.08 0.07 0.04 0.07 0.07 1.0 0.18 0.25 0.21 0.41 0.44 0.27 0.25 0.15 0.26 0.57
0.08 0.35 0.03 0.02 0.09 0.13 0.15 0.07 0.17 0.0 0.08 0.09 0.08 0.06 0.12 1.0 0.15 0.18 0.08 0.21 0.36 0.16 0.2 0.09 0.32 0.82
0.42 0.49 0.11 0.1 0.25 0.23 0.17 0.14 0.17 0.67 0.19 0.18 0.16 0.11 0.12 1.0 0.53 0.36 0.34 0.58 0.68 0.55 0.37 0.29 0.32 0.46
0.13 0.55 0.17 0.14 0.37 0.23 0.27 0.23 0.28 0.32 0.27 0.18 0.21 0.16 0.19 1.0 0.22 0.28 0.07 0.25 0.35 0.15 0.28 0.17 0.31 0.38
0.0 0.49 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.45 0.26 0.0 0.22 0.27 0.21 0.45 0.06 0.06 0.05
0.34 0.32 0.08 0.14 0.19 0.18 0.16 0.16 0.23 0.47 0.16 0.17 0.16 0.15 0.16 1.0 0.43 0.33 0.41 0.51 0.53 0.56 0.27 0.24 0.27 0.29
0.88 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.13 0.07 0.95 0.0 0.0 0.24 0.42 0.14 0.0 1.0 0.53 0.0 0.45 0.73 0.0 0.0 0.35 0.14 0.26
0.34 0.12 0.0 0.02 0.1 0.17 0.19 0.07 0.19 0.47 0.09 0.09 0.1 0.07 0.11 1.0 0.12 0.14 0.06 0.12 0.17 0.15 0.18 0.12 0.18 0.66
0.08 0.27 0.0 0.0 0.05 0.05 0.03 0.04 0.04 0.09 0.04 0.03 0.02 0.02 0.03 1.0 0.21 0.11 0.15 0.26 0.19 0.04 0.12 0.02 0.12 0.23
0.15 0.45 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.69 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.22 0.21 0.14 0.35 0.44 0.25 0.24 0.05 0.16 0.36
0.15 0.02 0.0 0.0 0.08 0.07 0.05 0.05 0.07 0.5 0.05 0.05 0.05 0.05 0.07 1.0 0.13 0.05 0.06 0.12 0.12 0.23 0.12 0.2 0.2 0.24

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)