Heatmap: Cluster_291 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000035.1_cds_GFH06368.1_845 (GFH06368)	0.05	0.0	0.0	0.0	0.15	0.09	0.17	0.15	0.17	1.0	0.19	0.19	0.12	0.24	0.15	0.0	0.0	0.3	0.11	0.06	0.21	0.12	0.07	0.03	0.8	0.53
lcl\|BLLF01000068.1_cds_GFH06999.1_1476 (GFH06999)	0.91	0.0	0.0	0.04	0.53	0.4	0.48	0.46	0.47	1.0	0.37	0.39	0.49	0.31	0.37	0.59	0.6	0.63	0.51	0.44	0.75	0.45	0.43	0.4	0.91	0.76
lcl\|BLLF01000088.1_cds_GFH07329.1_1806 (GFH07329)	0.29	0.28	0.0	0.31	0.25	0.29	0.32	0.15	0.34	1.0	0.34	0.3	0.31	0.16	0.26	0.52	0.63	0.44	0.39	0.41	0.46	0.58	0.29	0.27	0.64	0.43
lcl\|BLLF01000094.1_cds_GFH07441.1_1918 (GFH07441)	0.18	0.0	0.0	0.1	0.11	0.26	0.21	0.14	0.06	0.74	0.19	0.18	0.12	0.16	0.11	0.3	1.0	0.23	0.0	0.1	0.48	0.19	0.35	0.34	0.13	0.11
lcl\|BLLF01000118.1_cds_GFH07824.1_2301 (GFH07824)	0.29	0.42	0.0	0.19	0.31	0.14	0.34	0.39	0.22	1.0	0.17	0.33	0.32	0.32	0.32	0.47	0.7	0.28	0.28	0.23	0.13	0.15	0.37	0.52	0.57	0.64
lcl\|BLLF01000136.1_cds_GFH08082.1_2559 (GFH08082)	0.19	0.02	0.1	0.25	0.49	0.39	0.35	0.22	0.41	0.88	0.5	0.33	0.3	0.25	0.25	0.93	1.0	0.35	0.12	0.25	0.45	0.3	0.43	0.45	0.72	0.69
lcl\|BLLF01000145.1_cds_GFH08201.1_2678 (GFH08201)	0.0	0.07	0.0	0.01	0.18	0.2	0.14	0.17	0.19	1.0	0.17	0.09	0.1	0.11	0.13	0.38	0.11	0.42	0.18	0.18	0.16	0.28	0.3	0.24	0.45	0.27
lcl\|BLLF01000194.1_cds_GFH08913.1_3390 (GFH08913)	0.49	0.05	0.0	0.02	0.6	0.37	0.37	0.35	0.46	1.0	0.44	0.38	0.38	0.27	0.48	0.43	0.46	0.47	0.54	0.73	0.48	0.5	0.5	0.26	0.76	0.6
lcl\|BLLF01000204.1_cds_GFH09036.1_3513 (GFH09036)	0.56	0.26	0.11	0.4	0.44	0.35	0.45	0.28	0.52	1.0	0.55	0.48	0.41	0.4	0.45	0.85	0.7	0.68	0.27	0.22	0.7	0.28	0.74	0.45	0.76	0.53
lcl\|BLLF01000278.1_cds_GFH09978.1_4455 (GFH09978)	0.12	0.09	0.0	0.0	0.15	0.06	0.24	0.0	0.09	1.0	0.11	0.24	0.05	0.17	0.05	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.74	0.37
lcl\|BLLF01000295.1_cds_GFH10196.1_4673 (GFH10196)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.15	0.1	0.04	0.16	1.0	0.1	0.11	0.13	0.15	0.28	0.0	0.0	0.3	0.0	0.51	0.0	0.0	0.1	0.1	0.67	0.66
lcl\|BLLF01000316.1_cds_GFH10452.1_4929 (GFH10452)	0.05	0.0	0.0	0.03	0.04	0.05	0.05	0.05	0.13	1.0	0.04	0.09	0.07	0.11	0.11	0.19	0.28	0.44	0.11	0.25	0.41	0.23	0.22	0.15	0.73	0.22
lcl\|BLLF01000332.1_cds_GFH10629.1_5106 (GFH10629)	0.16	0.18	0.25	0.17	0.5	0.32	0.42	0.51	0.49	1.0	0.39	0.3	0.28	0.32	0.41	0.54	0.71	0.5	0.14	0.52	0.41	0.24	0.42	0.43	0.57	0.45
lcl\|BLLF01000337.1_cds_GFH10684.1_5161 (GFH10684)	0.48	0.19	0.03	0.07	0.46	0.35	0.26	0.37	0.29	1.0	0.4	0.34	0.3	0.31	0.26	0.32	0.64	0.54	0.13	0.29	0.53	0.46	0.42	0.13	0.99	0.51
lcl\|BLLF01000341.1_cds_GFH10735.1_5212 (GFH10735)	0.27	0.17	0.0	0.3	0.27	0.3	0.32	0.11	0.37	0.92	0.17	0.28	0.2	0.19	0.18	0.62	0.48	0.46	0.11	0.06	1.0	0.34	0.5	0.19	0.68	0.71
lcl\|BLLF01000374.1_cds_GFH11099.1_5576 (GFH11099)	0.07	0.12	0.0	0.04	0.24	0.23	0.17	0.4	0.42	1.0	0.2	0.23	0.37	0.37	0.46	0.35	0.89	0.27	0.39	0.38	0.1	0.55	0.58	0.43	0.7	0.55
lcl\|BLLF01000409.1_cds_GFH11493.1_5970 (GFH11493)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.05	0.09	0.07	0.19	1.0	0.03	0.01	0.01	0.0	0.14	0.35	0.44	0.18	0.14	0.23	0.25	0.15	0.18	0.22	0.4	0.26
lcl\|BLLF01000411.1_cds_GFH11518.1_5995 (GFH11518)	0.12	0.0	0.0	0.03	0.26	0.29	0.24	0.2	0.37	1.0	0.35	0.25	0.3	0.23	0.3	0.57	0.59	0.31	0.1	0.29	0.19	0.44	0.31	0.34	0.78	0.39
lcl\|BLLF01000432.1_cds_GFH11749.1_6226 (GFH11749)	0.17	0.01	0.0	0.0	0.42	0.25	0.36	0.12	0.26	0.9	0.25	0.11	0.12	0.13	0.25	0.53	1.0	0.19	0.05	0.16	0.35	0.05	0.22	0.25	0.2	0.19
lcl\|BLLF01000516.1_cds_GFH12569.1_7046 (GFH12569)	0.35	0.11	0.0	0.28	0.47	0.37	0.4	0.12	0.48	0.9	0.47	0.22	0.15	0.18	0.54	0.68	0.63	0.53	0.0	1.0	0.55	0.0	0.26	0.51	0.97	0.77
lcl\|BLLF01000567.1_cds_GFH13034.1_7511 (GFH13034)	0.27	0.04	0.0	0.35	0.24	0.22	0.31	0.12	0.29	1.0	0.2	0.22	0.25	0.2	0.37	0.45	0.18	0.43	0.17	0.3	0.18	0.56	0.18	0.1	0.41	0.31
lcl\|BLLF01000593.1_cds_GFH13279.1_7756 (GFH13279)	0.13	0.0	0.0	0.16	0.26	0.21	0.22	0.18	0.22	0.53	0.19	0.13	0.15	0.28	0.15	0.24	1.0	0.4	0.19	0.08	0.6	0.2	0.37	0.25	0.28	0.23
lcl\|BLLF01000910.1_cds_GFH15856.1_10333 (GFH15856)	0.16	0.04	0.07	0.48	0.27	0.19	0.37	0.1	0.35	1.0	0.2	0.15	0.13	0.11	0.31	0.57	0.53	0.28	0.07	0.27	0.37	0.32	0.26	0.25	0.56	0.33
lcl\|BLLF01000914.1_cds_GFH15881.1_10358 (GFH15881)	0.29	0.0	0.0	0.55	0.82	0.3	0.44	0.34	0.29	0.59	0.46	0.18	0.33	0.03	0.26	0.0	0.0	0.87	0.65	0.37	0.6	0.34	0.43	0.05	1.0	0.15
lcl\|BLLF01000942.1_cds_GFH16079.1_10556 (GFH16079)	0.41	0.0	0.0	0.06	0.61	0.6	0.59	0.25	0.61	1.0	0.48	0.31	0.3	0.21	0.39	0.92	0.82	0.38	0.36	0.37	0.53	0.23	0.86	0.33	0.67	0.53
lcl\|BLLF01000944.1_cds_GFH16092.1_10569 (GFH16092)	0.14	0.0	0.0	0.12	0.28	0.31	0.18	0.17	0.26	0.83	0.24	0.23	0.17	0.11	0.23	0.58	1.0	0.35	0.0	0.62	0.44	0.1	0.2	0.3	0.32	0.21
lcl\|BLLF01000995.1_cds_GFH16413.1_10890 (GFH16413)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.19	0.11	0.02	0.12	0.93	0.13	0.3	0.18	0.05	0.14	0.0	0.49	0.38	0.0	0.43	0.0	0.0	0.51	0.11	1.0	0.54
lcl\|BLLF01001047.1_cds_GFH16761.1_11238 (GFH16761)	0.38	0.37	0.19	0.02	0.61	0.63	0.5	0.55	0.47	1.0	0.64	0.59	0.57	0.51	0.36	0.57	0.54	0.79	0.42	0.62	0.91	0.51	0.71	0.28	0.92	0.81
lcl\|BLLF01001068.1_cds_GFH16894.1_11371 (GFH16894)	0.17	0.0	0.0	0.49	0.49	0.36	0.5	0.2	0.49	0.85	0.28	0.21	0.18	0.27	0.47	0.6	0.85	0.59	0.18	0.6	0.49	0.19	0.58	0.45	1.0	0.49
lcl\|BLLF01001185.1_cds_GFH17677.1_12154 (GFH17677)	0.22	0.29	0.17	0.15	0.2	0.22	0.27	0.17	0.36	1.0	0.31	0.28	0.36	0.28	0.47	0.18	0.26	0.4	0.3	0.34	0.42	0.36	0.48	0.21	0.55	0.42
lcl\|BLLF01001410.1_cds_GFH19123.1_13600 (GFH19123)	0.03	0.0	0.0	0.29	0.12	0.11	0.12	0.12	0.23	1.0	0.09	0.12	0.17	0.08	0.32	0.35	0.21	0.2	0.21	0.29	0.32	0.5	0.35	0.18	0.47	0.28
lcl\|BLLF01001950.1_cds_GFH22018.1_16495 (GFH22018)	0.55	0.19	0.0	0.06	0.35	0.3	0.39	0.32	0.38	0.98	0.43	0.33	0.36	0.39	0.25	0.66	0.54	0.74	0.33	0.18	1.0	0.22	0.87	0.29	0.51	0.43
lcl\|BLLF01001979.1_cds_GFH22153.1_16630 (GFH22153)	0.0	0.0	0.0	0.05	0.16	0.21	0.05	0.16	0.22	1.0	0.4	0.39	0.2	0.14	0.1	0.0	0.0	0.33	0.33	0.19	0.0	0.17	0.33	0.05	0.98	0.61
lcl\|BLLF01002217.1_cds_GFH23209.1_17686 (GFH23209)	0.09	0.04	0.0	0.19	0.16	0.06	0.15	0.21	0.12	0.48	0.23	0.06	0.16	0.22	0.05	0.39	1.0	0.45	0.08	0.05	0.56	0.13	0.32	0.12	0.03	0.03
lcl\|BLLF01002253.1_cds_GFH23358.1_17835 (GFH23358)	0.0	0.0	0.0	0.25	0.18	0.08	0.12	0.08	0.13	0.32	0.14	0.03	0.05	0.05	0.3	0.0	0.45	0.36	0.0	0.3	0.0	0.19	0.24	0.58	0.69	1.0
lcl\|BLLF01002259.1_cds_GFH23380.1_17857 (GFH23380)	0.57	0.16	0.0	0.04	0.6	0.44	0.53	0.27	0.44	1.0	0.37	0.4	0.41	0.23	0.39	0.62	0.75	0.35	0.35	0.31	0.56	0.17	0.45	0.25	0.72	0.63
lcl\|BLLF01002498.1_cds_GFH24304.1_18781 (GFH24304)	0.0	0.0	0.0	0.08	0.18	0.1	0.05	0.12	0.15	1.0	0.27	0.13	0.03	0.07	0.02	0.0	0.17	0.37	0.28	0.31	0.0	0.0	0.0	0.03	0.85	0.43
lcl\|BLLF01002766.1_cds_GFH25258.1_19735 (GFH25258)	0.35	0.16	0.0	0.31	0.72	0.49	0.56	0.56	0.6	0.79	0.59	0.37	0.45	0.48	0.47	0.32	0.72	0.72	0.58	0.87	0.79	0.75	0.54	0.16	1.0	0.41
lcl\|BLLF01002945.1_cds_GFH25882.1_20359 (GFH25882)	0.3	0.04	0.0	0.21	0.42	0.4	0.38	0.24	0.4	0.78	0.42	0.33	0.34	0.3	0.29	0.68	1.0	0.36	0.17	0.35	0.41	0.36	0.25	0.35	0.45	0.29
lcl\|BLLF01003013.1_cds_GFH26075.1_20552 (GFH26075)	0.72	0.02	0.0	0.11	0.97	0.6	0.57	0.51	0.44	0.84	0.65	0.7	0.81	0.38	0.48	1.0	0.92	0.33	0.24	0.13	0.23	0.9	0.34	0.24	0.79	0.89
lcl\|BLLF01003022.1_cds_GFH26102.1_20579 (GFH26102)	0.0	0.03	0.0	0.13	0.34	0.18	0.16	0.1	0.23	1.0	0.18	0.08	0.14	0.19	0.11	0.64	0.48	0.4	0.3	0.43	0.42	0.16	0.4	0.11	0.74	0.59
lcl\|BLLF01003138.1_cds_GFH26462.1_20939 (GFH26462)	0.23	0.16	0.13	0.24	0.14	0.19	0.27	0.14	0.3	1.0	0.16	0.14	0.17	0.18	0.26	0.19	0.19	0.19	0.36	0.31	0.26	0.46	0.19	0.1	0.48	0.6
lcl\|BLLF01003296.1_cds_GFH26943.1_21420 (GFH26943)	0.15	0.0	0.0	0.04	0.2	0.27	0.16	0.15	0.13	0.39	0.33	0.21	0.29	0.32	0.06	0.42	0.5	0.3	0.1	0.25	0.27	0.0	0.3	0.28	1.0	0.58
lcl\|BLLF01003841.1_cds_GFH28352.1_22829 (GFH28352)	0.25	0.0	0.0	0.08	0.04	0.04	0.09	0.05	0.13	1.0	0.03	0.06	0.13	0.03	0.2	0.0	0.48	0.2	0.15	0.26	0.28	0.0	0.3	0.06	0.44	0.42
lcl\|BLLF01004936.1_cds_GFH30487.1_24964 (GFH30487)	0.32	0.36	0.0	0.05	0.13	0.16	0.24	0.08	0.36	1.0	0.19	0.08	0.12	0.11	0.35	0.37	0.06	0.23	0.0	0.21	0.64	0.46	0.33	0.16	0.64	0.38
lcl\|BLLF01005240.1_cds_GFH30932.1_25409 (GFH30932)	0.6	0.06	0.2	0.3	0.45	0.36	0.39	0.14	0.34	1.0	0.43	0.26	0.17	0.16	0.25	0.89	0.91	0.76	0.0	0.25	0.61	0.21	0.73	0.35	0.97	0.87
lcl\|BLLF01005307.1_cds_GFH31032.1_25509 (GFH31032)	0.54	0.13	0.0	0.3	0.21	0.17	0.35	0.09	0.36	1.0	0.26	0.16	0.19	0.16	0.25	0.32	0.48	0.41	0.47	0.46	0.7	0.2	0.44	0.44	0.8	0.47
lcl\|BLLF01005371.1_cds_GFH31099.1_25576 (GFH31099)	0.24	0.02	0.0	0.13	0.19	0.18	0.19	0.08	0.2	1.0	0.2	0.1	0.1	0.09	0.11	0.42	0.66	0.34	0.21	0.16	0.33	0.2	0.33	0.29	0.76	0.5
lcl\|BLLF01005705.1_cds_GFH31537.1_26014 (GFH31537)	0.05	0.08	0.14	0.01	0.24	0.26	0.23	0.16	0.27	1.0	0.19	0.18	0.19	0.14	0.22	0.59	0.26	0.17	0.27	0.33	0.24	0.3	0.16	0.26	0.5	0.47
lcl\|BLLF01006012.1_cds_GFH31861.1_26338 (GFH31861)	0.36	0.06	0.0	0.23	0.25	0.27	0.29	0.17	0.24	0.68	0.27	0.28	0.2	0.23	0.24	0.48	0.52	0.27	0.14	0.27	0.24	0.24	0.34	0.56	1.0	0.93
lcl\|BLLF01006384.1_cds_GFH32200.1_26677 (GFH32200)	0.2	0.0	0.0	0.0	0.19	0.33	0.16	0.1	0.17	1.0	0.23	0.19	0.16	0.13	0.14	0.0	0.43	0.19	0.1	0.17	0.36	0.1	0.39	0.06	0.69	0.53

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)