Heatmap: Cluster_88 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
0.0 0.0 0.0 106.77 6.07 55.01 30.9 20.19 26.23 0.0 10.65 23.72 18.92 9.95 9.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.37 21.68 16.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
10.22 0.0 0.0 12.85 36.57 48.93 25.72 7.92 12.35 13.86 22.06 31.87 18.86 25.54 18.35 0.0 0.0 122.3 45.87 12.99 63.3 0.0 30.36 17.85 7.05 24.95
0.0 0.0 0.0 2.61 6.09 4.33 2.82 1.57 1.67 0.0 6.21 0.89 6.43 1.63 1.67 0.0 0.0 0.0 0.0 10.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.44
0.0 0.0 0.0 0.0 2.03 0.68 2.47 1.61 3.23 4.36 0.34 1.71 5.4 0.7 5.14 3.08 0.0 0.0 0.0 2.04 0.0 0.0 0.0 0.9 1.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 4.48 0.0 0.0 0.0 8.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 4.87 3.2 0.0 1.49 1.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.65 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.22 0.17 0.1 0.11 0.0 0.06 0.23 0.36 0.06 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 1.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 16.52 16.39 6.96 10.53 11.34 0.0 26.23 7.14 2.8 8.41 13.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 26.65 0.0 8.55 15.51 15.61
0.0 0.0 0.0 7.82 0.0 0.0 2.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.55 0.0 0.0 20.94 4.65 4.67 7.58 2.06 8.94 0.0 5.02 2.29 4.83 4.37 8.86 21.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 32.96 1.34 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 15.15 19.07 8.45 7.46 13.08 8.82 11.55 8.08 1.62 5.41 1.32 12.47 27.76 0.0 14.6 8.27 26.87 0.0 0.0 1.58 4.49 2.29
0.0 0.0 0.0 29.03 12.14 33.66 7.84 8.85 2.32 0.0 10.44 21.54 0.0 2.66 11.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.96 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.23 3.01 5.45 2.96 0.0 0.0 0.0 0.0 3.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.23 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.79 1.58 0.0 0.0 0.0 1.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.92 4.0 6.94 1.06 8.24 3.35 0.62 3.33 0.0 0.1 0.19 0.85 0.26 0.84 0.88 9.81 6.88 0.0 1.75 1.9 2.18 4.78 2.53 0.16 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 13.74 19.7 16.64 7.73 19.52 4.39 0.0 3.3 13.57 6.61 1.68 10.2 0.0 0.0 10.9 0.0 18.52 0.0 34.52 10.82 0.0 2.51 0.0
0.0 0.0 0.0 10.35 13.7 34.25 34.94 12.62 6.64 0.0 3.43 6.77 22.52 28.1 16.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.0 0.0 0.0
0.0 1.22 0.0 1.12 0.09 0.26 0.9 0.38 0.8 1.09 0.0 0.04 0.05 0.17 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.3 0.05 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.98 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.89 0.0 0.0 3.77 0.0 3.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.83 0.0 0.0 12.05 4.88 4.88 3.33 1.37 2.75 0.0 5.34 2.27 2.89 2.1 2.48 0.0 0.0 8.19 0.0 0.0 5.65 0.0 0.0 3.52 6.14 4.31
0.0 0.0 0.0 0.0 2.13 3.68 0.6 1.02 1.02 0.0 1.14 1.08 1.74 0.47 2.01 0.0 3.58 7.53 5.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 8.94 2.96 8.89 2.92 2.76 8.58 0.0 2.97 0.0 3.1 3.28 11.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.63 0.0 0.29 0.0 2.06 0.0 0.31 0.68 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 1.93 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 20.04 35.66 65.36 18.35 19.26 0.0 33.93 27.68 61.51 18.62 23.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.02 32.93 6.63
0.96 0.0 0.0 3.63 2.43 0.8 2.49 1.83 5.81 5.22 2.41 2.77 5.22 2.86 5.81 0.0 2.74 2.88 0.0 4.89 3.97 0.0 2.86 1.31 1.33 1.34
0.0 0.0 0.0 0.0 1.68 0.0 0.0 3.07 0.0 0.0 5.07 0.0 1.81 1.51 1.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.58 0.0
0.0 0.0 0.0 3.17 0.0 1.49 1.36 0.0 0.88 0.0 0.95 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 3.77 0.0 0.0 0.0 0.0 3.74 1.29 0.0 0.0
3.01 0.0 0.0 0.29 2.53 18.19 6.36 1.14 4.5 4.49 1.53 1.41 1.78 1.06 1.66 0.0 0.74 4.05 2.25 2.01 4.24 1.24 5.23 3.66 1.34 0.17
0.0 0.0 0.0 100.24 9.19 16.58 36.82 10.68 23.81 0.0 19.91 23.88 32.84 2.96 7.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.1 0.0 0.0 3.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 4.86 0.0 0.0 0.0 2.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.24 0.0 3.59
3.0 0.0 0.0 0.0 4.86 1.6 2.46 0.75 1.22 5.22 1.67 2.84 2.54 1.24 3.99 4.13 2.79 2.88 4.51 0.0 3.97 4.56 0.0 1.07 1.37 2.01
13.02 5.71 0.0 4.09 18.43 13.58 2.67 8.75 8.56 0.0 13.39 12.12 6.48 9.1 3.99 0.0 18.51 0.0 14.6 16.55 0.0 0.0 9.66 7.78 10.1 9.73
0.0 0.0 0.0 0.0 2.49 7.51 2.84 0.0 7.25 0.0 7.51 24.97 30.21 12.45 2.37 0.0 0.0 17.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.47 4.13 4.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.98 0.0 0.96 0.0 0.0 0.98 1.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 4.21 4.16 0.0 0.0 28.19 0.0 0.0 4.12 4.46 12.48 3.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.96 13.78 7.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.7 0.0 16.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.75 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 5.33 3.53 1.78 3.37 1.72 0.0 2.07 3.51 3.97 3.73 1.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.8 0.0 12.64 3.85 5.68 5.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.16 8.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.16 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 1.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 7.65 11.46 8.06 6.77 0.0 0.0 7.62 3.91 8.6 3.77 18.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.93 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.05 0.0 0.0 0.0 3.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.84 5.21 0.0
0.0 0.0 0.0 7.54 22.76 35.17 10.98 9.29 9.66 0.0 12.52 27.43 20.19 24.9 7.24 0.0 0.0 35.86 53.8 15.24 0.0 0.0 0.0 28.21 0.0 0.0
8.19 0.0 0.0 0.0 6.17 2.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.73 1.83 1.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
21.81 13.49 0.0 9.66 22.59 27.2 52.91 14.7 32.51 0.0 18.99 16.02 42.31 29.3 35.57 29.45 21.86 22.99 0.0 0.0 31.73 0.0 11.41 27.15 26.49 16.06
1.52 0.0 0.0 0.0 1.28 0.96 0.64 0.61 0.0 0.0 1.06 0.62 1.73 0.28 1.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.15 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.45 0.81 1.33 2.97 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12.83 4.19 0.0 0.0 0.0 0.0 4.19 0.0 0.0 8.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 3.3 6.49 0.0 0.0 0.0 0.0 7.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.9 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.13 0.14 0.0 0.07 0.36 0.54 0.27 0.21 0.66 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.35 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 8.75 2.92 6.14 5.23 19.44 0.0 6.24 2.84 9.43 0.0 11.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.53 9.5 9.56
4.87 0.0 0.0 0.0 2.83 0.81 1.01 0.78 0.0 5.24 0.0 0.79 1.73 2.97 0.79 0.0 5.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.14 2.27 0.38 3.01 4.74 2.45 2.64 5.7 3.38 1.21 1.18 4.28 10.28 2.7 0.0 2.3 3.73 0.0 2.68 1.21 1.25 1.9
0.0 0.0 0.0 3.41 0.0 3.38 0.0 2.06 1.09 0.0 0.0 1.12 0.0 0.0 1.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.14 1.34 0.2 2.37 2.01 2.28 2.13 1.96 0.72 5.63 2.26 1.63 1.9 1.79 0.39 0.0 2.4 0.0 0.0 0.26 4.86 0.0 0.56 0.38 0.74
0.0 0.0 0.0 4.09 8.21 19.03 32.33 11.19 11.78 0.0 26.73 14.97 19.9 9.3 7.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.36 13.46 4.52
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.86 0.0 0.0 0.13 0.15 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0
6.22 0.0 0.0 0.0 1.75 8.67 2.83 4.05 5.01 5.62 5.49 6.05 2.86 4.14 4.18 0.0 0.0 12.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.07 0.0 5.81
0.0 0.0 0.0 0.0 2.31 14.0 2.28 0.0 0.0 0.0 2.71 4.66 0.0 0.0 6.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.83 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.34 0.72 0.0 1.36 0.82 0.99 0.57 0.0 0.0 1.61 0.25 0.54 1.65 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 27.69 54.7 53.12 12.49 46.39 0.0 3.43 20.77 37.97 10.61 29.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 25.79 28.37 11.42
0.17 0.0 0.0 0.0 1.01 0.57 0.31 0.26 0.78 1.39 0.76 0.15 0.32 0.56 0.9 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 1.42 0.0 0.0 0.27 0.24 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 8.25 0.0 9.26 3.63 15.7 0.0 29.91 12.09 13.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.54 6.74 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.13 0.0 0.14 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23
0.0 0.0 0.0 41.18 5.92 19.67 8.31 5.44 5.66 0.0 7.81 3.93 6.45 6.03 3.71 17.92 0.0 41.98 0.0 11.89 0.0 0.0 27.79 11.89 12.91 13.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.55 0.0 4.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.49 0.0 3.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.67 9.42 0.0 0.0 0.0 2.08 2.51 2.53
0.0 0.0 0.0 0.0 13.98 0.0 2.63 4.48 8.95 15.05 7.34 2.38 0.0 0.0 2.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 22.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 46.95 27.45 15.72 19.81 17.78 18.8 0.0 43.53 15.52 33.6 26.37 22.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12.32 19.31 19.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 22.86 70.49 14.12 36.74 0.0 31.73 30.18 54.92 15.53 36.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.92 37.7 18.98
0.0 0.0 0.0 8.66 2.87 25.99 37.93 2.67 5.54 0.0 2.87 23.05 16.7 35.36 13.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 15.09 44.14 22.44 8.76 23.65 19.47 21.14 10.51 14.22 6.62 11.79 35.13 8.09 0.0 0.0 19.52 0.0 0.0 6.97 21.27 30.19 17.76
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.08 2.52 3.94 0.0 0.0 0.0 1.62 1.22 3.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.66 1.58 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 127.82 813.3 0.05 0.04 41.74 0.0 39.18 138.56 139.89 29.91 100.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 57.38 0.0
4.15 0.0 0.0 2.61 0.0 0.88 0.0 0.0 4.18 0.0 3.46 0.85 0.0 1.72 2.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.43 2.9
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.05 0.0 3.16 0.0 10.51 0.0 3.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.74 0.69 0.0 0.0 4.33 3.75 3.05 1.78 3.56 3.44 2.0 2.93 2.38 1.34 0.7 0.0 11.45 2.52 9.95 2.84 6.33 0.0 3.66 1.63 2.29 1.6

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)