Heatmap: Cluster_236 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000056.1_cds_GFH06792.1_1269 (GFH06792)	0.18	0.0	0.0	0.29	0.07	0.05	0.18	0.0	0.12	0.08	0.0	0.01	0.06	0.0	0.06	1.0	0.59	0.09	0.05	0.0	0.04	0.2	0.4	0.36	0.08	0.01
lcl\|BLLF01000062.1_cds_GFH06903.1_1380 (GFH06903)	0.05	0.0	0.0	0.13	0.25	0.38	0.27	0.15	0.14	0.04	0.35	0.29	0.4	0.36	0.19	1.0	0.74	0.47	0.0	0.07	0.32	0.25	0.19	0.44	0.31	0.24
lcl\|BLLF01000069.1_cds_GFH07025.1_1502 (GFH07025)	0.15	0.2	0.12	0.13	0.13	0.31	0.23	0.06	0.14	0.25	0.06	0.35	0.2	0.07	0.24	0.71	0.49	0.01	0.15	0.42	0.02	1.0	0.13	0.29	0.59	0.24
lcl\|BLLF01000107.1_cds_GFH07641.1_2118 (GFH07641)	0.1	0.17	0.5	0.09	0.14	0.21	0.62	0.07	0.31	0.21	0.17	0.26	0.27	0.14	0.22	1.0	0.86	0.1	0.4	0.13	0.14	0.37	0.15	0.31	0.2	0.08
lcl\|BLLF01000113.1_cds_GFH07758.1_2235 (GFH07758)	0.43	0.34	0.07	1.0	0.46	0.41	0.31	0.12	0.24	0.3	0.44	0.31	0.29	0.19	0.16	0.77	0.97	0.78	0.5	0.55	0.67	0.48	0.65	0.5	0.18	0.22
lcl\|BLLF01000153.1_cds_GFH08317.1_2794 (GFH08317)	0.14	0.02	0.0	0.02	0.18	0.26	0.24	0.05	0.15	0.16	0.16	0.3	0.19	0.09	0.2	0.89	0.6	0.05	0.06	0.35	0.07	1.0	0.13	0.25	0.26	0.09
lcl\|BLLF01000157.1_cds_GFH08385.1_2862 (GFH08385)	0.11	0.0	0.0	0.52	0.08	0.31	0.24	0.33	0.08	0.0	0.31	0.19	0.61	0.52	0.03	1.0	0.42	0.89	0.0	0.0	0.92	0.35	0.66	0.41	0.1	0.18
lcl\|BLLF01000176.1_cds_GFH08669.1_3146 (GFH08669)	0.0	0.11	0.09	0.05	0.06	0.08	0.16	0.07	0.2	0.12	0.05	0.09	0.1	0.05	0.15	1.0	0.36	0.06	0.01	0.06	0.09	0.29	0.34	0.31	0.13	0.07
lcl\|BLLF01000182.1_cds_GFH08760.1_3237 (GFH08760)	0.47	0.01	0.0	1.0	0.35	0.36	0.23	0.22	0.13	0.07	0.46	0.37	0.31	0.38	0.08	0.63	0.83	0.87	0.57	0.35	0.68	0.48	0.49	0.21	0.26	0.23
lcl\|BLLF01000203.1_cds_GFH09019.1_3496 (GFH09019)	0.79	0.33	0.38	0.33	0.34	0.39	0.3	0.22	0.28	0.85	0.36	0.27	0.2	0.23	0.25	0.78	1.0	0.59	0.16	0.55	0.56	0.81	0.77	0.22	0.45	0.51
lcl\|BLLF01000235.1_cds_GFH09449.1_3926 (GFH09449)	0.53	0.02	0.0	0.18	0.27	0.2	0.14	0.08	0.12	0.13	0.13	0.22	0.15	0.09	0.12	0.81	0.33	0.21	0.74	0.6	0.48	1.0	0.63	0.6	0.31	0.25
lcl\|BLLF01000405.1_cds_GFH11458.1_5935 (GFH11458)	0.73	0.27	0.5	0.38	0.54	0.49	0.44	0.22	0.35	0.19	0.43	0.35	0.34	0.23	0.35	0.76	1.0	0.35	0.35	0.45	0.47	0.55	0.37	0.54	0.3	0.36
lcl\|BLLF01000465.1_cds_GFH12067.1_6544 (GFH12067)	0.88	0.13	0.0	0.61	0.26	0.52	0.5	0.14	0.45	0.68	0.23	0.24	0.19	0.13	0.41	0.79	0.96	0.75	0.49	0.72	0.81	0.72	1.0	0.7	0.21	0.19
lcl\|BLLF01000476.1_cds_GFH12175.1_6652 (GFH12175)	0.84	0.44	0.26	0.47	0.45	0.42	0.28	0.17	0.27	0.43	0.38	0.32	0.25	0.24	0.22	1.0	0.91	0.59	0.39	0.39	0.68	0.85	0.67	0.46	0.41	0.33
lcl\|BLLF01000493.1_cds_GFH12344.1_6821 (GFH12344)	0.23	0.02	0.0	0.35	0.08	0.17	0.18	0.05	0.08	0.1	0.1	0.36	0.16	0.09	0.15	0.63	0.31	0.03	0.04	0.7	0.12	1.0	0.08	0.6	0.46	0.19
lcl\|BLLF01000525.1_cds_GFH12643.1_7120 (GFH12643)	0.16	0.04	0.1	0.17	0.27	0.33	0.27	0.17	0.19	0.11	0.27	0.2	0.16	0.16	0.12	1.0	0.75	0.3	0.07	0.03	0.21	0.09	0.22	0.33	0.08	0.14
lcl\|BLLF01000531.1_cds_GFH12699.1_7176 (GFH12699)	0.82	0.15	0.51	0.49	0.4	0.49	0.35	0.2	0.24	0.21	0.41	0.45	0.29	0.31	0.21	1.0	0.67	0.39	0.29	0.85	0.19	0.8	0.21	0.62	0.41	0.4
lcl\|BLLF01000546.1_cds_GFH12850.1_7327 (GFH12850)	0.61	0.14	0.02	0.95	0.43	0.43	0.39	0.15	0.26	0.67	0.41	0.32	0.26	0.2	0.31	0.68	1.0	0.66	0.26	0.68	0.57	0.83	0.64	0.35	0.55	0.3
lcl\|BLLF01000582.1_cds_GFH13158.1_7635 (GFH13158)	0.48	0.25	0.36	0.53	0.59	0.37	0.37	0.32	0.4	0.3	0.42	0.32	0.27	0.25	0.38	1.0	0.83	0.52	0.59	0.74	0.54	0.85	0.61	0.55	0.39	0.2
lcl\|BLLF01000602.1_cds_GFH13351.1_7828 (GFH13351)	0.47	0.36	0.43	0.68	0.28	0.38	0.36	0.14	0.33	0.1	0.26	0.39	0.38	0.18	0.28	1.0	0.89	0.57	0.53	0.57	0.53	1.0	0.61	0.39	0.08	0.07
lcl\|BLLF01000631.1_cds_GFH13597.1_8074 (GFH13597)	0.37	0.04	0.26	0.19	0.3	0.25	0.4	0.18	0.35	0.23	0.27	0.26	0.21	0.24	0.36	0.94	0.88	0.22	0.39	0.2	0.31	1.0	0.42	0.4	0.24	0.15
lcl\|BLLF01000827.1_cds_GFH15268.1_9745 (GFH15268)	0.06	0.06	0.0	0.14	0.16	0.2	0.27	0.11	0.22	0.11	0.2	0.16	0.23	0.17	0.17	1.0	0.85	0.43	0.09	0.15	0.32	0.06	0.7	0.5	0.24	0.18
lcl\|BLLF01000878.1_cds_GFH15640.1_10117 (GFH15640)	0.8	0.26	0.21	0.41	0.31	0.36	0.33	0.15	0.32	0.37	0.28	0.24	0.16	0.18	0.34	0.87	1.0	0.15	0.46	0.4	0.23	0.38	0.3	0.57	0.18	0.12
lcl\|BLLF01000896.1_cds_GFH15764.1_10241 (GFH15764)	0.59	0.0	0.0	0.39	0.12	0.14	0.2	0.07	0.11	0.28	0.16	0.14	0.11	0.11	0.13	0.92	1.0	0.26	0.27	0.22	0.32	0.08	0.25	0.59	0.27	0.04
lcl\|BLLF01000926.1_cds_GFH15961.1_10438 (GFH15961)	0.34	0.26	0.17	0.39	0.25	0.29	0.42	0.16	0.54	0.5	0.3	0.29	0.28	0.24	0.52	0.82	1.0	0.42	0.45	0.27	0.49	0.89	0.54	0.56	0.48	0.46
lcl\|BLLF01001179.1_cds_GFH17630.1_12107 (GFH17630)	0.68	0.37	0.19	0.8	0.48	0.56	0.48	0.35	0.4	0.41	0.46	0.53	0.37	0.32	0.42	0.95	1.0	0.66	0.5	0.46	0.52	0.85	0.68	0.56	0.34	0.28
lcl\|BLLF01001199.1_cds_GFH17776.1_12253 (GFH17776)	0.33	0.32	0.43	0.18	0.18	0.26	0.3	0.19	0.39	0.23	0.15	0.24	0.21	0.14	0.36	1.0	0.52	0.27	0.13	0.24	0.28	0.38	0.46	0.68	0.33	0.2
lcl\|BLLF01001211.1_cds_GFH17844.1_12321 (GFH17844)	0.25	0.01	0.01	0.16	0.1	0.28	0.19	0.07	0.12	0.04	0.1	0.31	0.18	0.12	0.11	1.0	0.36	0.1	0.15	0.29	0.14	0.91	0.2	0.39	0.37	0.26
lcl\|BLLF01001299.1_cds_GFH18429.1_12906 (GFH18429)	0.88	0.47	0.23	0.51	0.44	0.3	0.26	0.2	0.19	0.67	0.28	0.19	0.13	0.11	0.22	0.76	1.0	0.48	0.47	0.78	0.33	0.56	0.45	0.31	0.62	0.29
lcl\|BLLF01001348.1_cds_GFH18745.1_13222 (GFH18745)	0.11	0.11	0.0	0.33	0.04	0.03	0.11	0.38	0.11	0.1	0.09	0.05	0.22	0.31	0.21	0.97	0.68	0.18	0.49	0.29	0.21	1.0	0.41	0.43	0.08	0.07
lcl\|BLLF01001785.1_cds_GFH21232.1_15709 (GFH21232)	0.44	0.23	0.26	0.69	0.36	0.38	0.38	0.17	0.21	0.08	0.4	0.24	0.29	0.27	0.21	0.51	0.95	1.0	0.31	0.53	0.67	0.37	0.69	0.34	0.23	0.26
lcl\|BLLF01001917.1_cds_GFH21849.1_16326 (GFH21849)	0.27	0.28	0.33	0.01	0.31	0.3	0.3	0.13	0.29	0.14	0.26	0.26	0.19	0.17	0.29	1.0	0.87	0.23	0.32	0.06	0.19	0.55	0.21	0.48	0.45	0.23
lcl\|BLLF01001933.1_cds_GFH21928.1_16405 (GFH21928)	0.14	0.02	0.11	0.09	0.1	0.15	0.19	0.05	0.11	0.29	0.09	0.2	0.15	0.06	0.12	1.0	0.56	0.12	0.1	0.33	0.07	0.54	0.2	0.34	0.32	0.17
lcl\|BLLF01001964.1_cds_GFH22081.1_16558 (GFH22081)	0.25	0.14	0.14	0.14	0.13	0.11	0.35	0.07	0.3	0.1	0.09	0.08	0.12	0.06	0.2	1.0	0.57	0.03	0.15	0.09	0.07	0.23	0.11	0.21	0.27	0.11
lcl\|BLLF01002348.1_cds_GFH23736.1_18213 (GFH23736)	0.24	0.13	0.0	0.09	0.09	0.23	0.21	0.06	0.05	0.01	0.13	0.38	0.11	0.12	0.15	0.27	0.14	0.34	0.16	0.65	0.18	1.0	0.36	0.57	0.3	0.12
lcl\|BLLF01002363.1_cds_GFH23789.1_18266 (GFH23789)	0.77	0.15	0.22	0.4	0.53	0.43	0.54	0.27	0.45	0.51	0.42	0.38	0.41	0.26	0.48	0.76	1.0	0.8	0.58	0.62	0.67	0.72	0.74	0.48	0.28	0.26
lcl\|BLLF01002653.1_cds_GFH24862.1_19339 (GFH24862)	0.41	0.28	0.1	0.31	0.3	0.31	0.35	0.11	0.23	0.19	0.26	0.33	0.34	0.2	0.28	1.0	0.79	0.31	0.19	0.34	0.42	0.87	0.61	0.48	0.25	0.11
lcl\|BLLF01002812.1_cds_GFH25434.1_19911 (GFH25434)	0.63	0.1	0.0	0.27	0.42	0.35	0.33	0.17	0.25	0.92	0.49	0.2	0.31	0.17	0.26	1.0	0.79	0.73	0.41	0.47	0.89	0.87	0.55	0.44	0.42	0.38
lcl\|BLLF01002838.1_cds_GFH25521.1_19998 (GFH25521)	0.62	0.51	0.14	0.42	0.53	0.51	0.6	0.28	0.58	0.51	0.37	0.39	0.53	0.24	0.57	0.82	0.74	0.9	0.82	0.7	1.0	0.63	0.97	0.65	0.48	0.46
lcl\|BLLF01002856.1_cds_GFH25586.1_20063 (GFH25586)	0.6	0.16	0.33	0.12	0.2	0.26	0.12	0.09	0.09	0.18	0.18	0.19	0.1	0.11	0.08	0.73	0.56	0.36	0.44	0.44	0.54	1.0	0.64	0.37	0.21	0.15
lcl\|BLLF01002988.1_cds_GFH26006.1_20483 (GFH26006)	0.15	0.01	0.0	0.04	0.08	0.19	0.14	0.02	0.0	0.08	0.08	0.22	0.09	0.05	0.12	1.0	0.48	0.0	0.0	0.08	0.32	0.58	0.09	0.21	0.15	0.21
lcl\|BLLF01002989.1_cds_GFH26008.1_20485 (GFH26008)	0.13	0.03	0.11	0.04	0.05	0.04	0.24	0.03	0.15	0.19	0.06	0.07	0.09	0.05	0.19	1.0	0.72	0.45	0.46	0.07	0.25	0.21	0.14	0.43	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003166.1_cds_GFH26554.1_21031 (GFH26554)	0.0	0.02	0.02	0.0	0.14	0.19	0.18	0.2	0.19	0.2	0.13	0.15	0.15	0.12	0.14	1.0	0.4	0.05	0.05	0.07	0.11	0.18	0.3	0.33	0.12	0.11
lcl\|BLLF01003166.1_cds_GFH26556.1_21033 (GFH26556)	0.18	0.28	0.16	0.06	0.09	0.09	0.11	0.1	0.09	0.14	0.07	0.1	0.08	0.07	0.08	1.0	0.45	0.08	0.05	0.07	0.11	0.29	0.44	0.22	0.09	0.08
lcl\|BLLF01003429.1_cds_GFH27309.1_21786 (GFH27309)	0.51	0.07	0.21	0.08	0.27	0.33	0.36	0.15	0.26	0.13	0.15	0.29	0.29	0.16	0.31	0.99	1.0	0.09	0.3	0.12	0.2	0.38	0.48	0.39	0.15	0.09
lcl\|BLLF01003469.1_cds_GFH27424.1_21901 (GFH27424)	0.24	0.06	0.0	0.08	0.05	0.1	0.15	0.05	0.14	0.08	0.03	0.08	0.16	0.14	0.13	1.0	0.36	0.26	0.07	0.1	0.16	0.21	0.22	0.28	0.23	0.16
lcl\|BLLF01003734.1_cds_GFH28083.1_22560 (GFH28083)	0.23	1.0	0.03	0.65	0.13	0.4	0.88	0.15	0.92	0.51	0.14	0.16	0.34	0.08	0.37	0.67	0.26	0.5	0.66	0.41	0.57	0.72	0.36	0.43	0.33	0.41
lcl\|BLLF01003907.1_cds_GFH28508.1_22985 (GFH28508)	0.0	0.0	0.0	0.14	0.04	0.07	0.12	0.1	0.08	0.0	0.08	0.08	0.11	0.2	0.14	1.0	0.55	0.05	0.11	0.1	0.19	0.46	0.34	0.28	0.05	0.06
lcl\|BLLF01003961.1_cds_GFH28619.1_23096 (GFH28619)	0.0	0.0	0.0	0.1	0.01	0.04	0.08	0.01	0.06	0.14	0.07	0.05	0.02	0.07	0.03	1.0	0.74	0.08	0.35	0.07	0.22	0.0	0.08	0.27	0.0	0.04
lcl\|BLLF01004500.1_cds_GFH29736.1_24213 (GFH29736)	0.7	0.12	0.0	0.8	0.7	0.54	0.46	0.31	0.33	0.3	0.42	0.39	0.29	0.29	0.3	0.63	0.65	0.6	0.21	0.28	0.64	1.0	0.76	0.43	0.76	0.27
lcl\|BLLF01004515.1_cds_GFH29764.1_24241 (GFH29764)	0.03	0.02	0.0	0.05	0.26	0.25	0.21	0.14	0.2	0.31	0.27	0.23	0.24	0.34	0.12	1.0	0.58	0.32	0.0	0.15	0.36	0.18	0.11	0.27	0.13	0.2
lcl\|BLLF01004610.1_cds_GFH29951.1_24428 (GFH29951)	0.26	0.32	0.35	0.09	0.07	0.25	0.32	0.16	0.24	0.29	0.04	0.29	0.32	0.14	0.26	1.0	0.49	0.11	0.35	0.24	0.25	0.78	0.39	0.58	0.74	0.19
lcl\|BLLF01004821.1_cds_GFH30303.1_24780 (GFH30303)	0.24	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.07	0.08	0.06	0.14	0.0	0.0	0.05	0.1	0.08	1.0	0.45	0.62	0.23	0.13	0.0	0.0	0.31	0.39	0.0	0.0
lcl\|BLLF01005238.1_cds_GFH30925.1_25402 (GFH30925)	0.18	0.0	0.0	0.56	0.18	0.16	0.15	0.05	0.12	0.06	0.1	0.07	0.07	0.06	0.08	0.27	0.48	1.0	0.11	0.61	0.64	0.28	0.5	0.19	0.17	0.18
lcl\|BLLF01005675.1_cds_GFH31494.1_25971 (GFH31494)	0.56	0.26	0.0	0.67	0.34	0.24	0.38	0.25	0.38	0.21	0.35	0.22	0.31	0.32	0.32	0.81	1.0	0.46	0.26	0.25	0.58	0.54	0.51	0.43	0.25	0.2
lcl\|BLLF01007287.1_cds_GFH32881.1_27358 (GFH32881)	0.53	0.0	0.0	0.17	0.08	0.18	0.18	0.02	0.1	0.36	0.07	0.13	0.08	0.03	0.12	0.65	0.3	0.08	0.12	0.67	0.33	1.0	0.16	0.45	0.11	0.13
lcl\|BLLF01007474.1_cds_GFH32966.1_27443 (GFH32966)	0.59	0.69	0.24	0.35	0.26	0.44	0.96	0.16	0.69	0.46	0.21	0.15	0.34	0.23	0.39	0.76	1.0	0.77	0.98	0.63	0.86	0.59	0.82	0.5	0.45	0.42
lcl\|BLLF01009435.1_cds_GFH33723.1_28200 (GFH33723)	0.35	0.0	0.0	0.03	0.15	0.09	0.23	0.09	0.19	0.35	0.16	0.06	0.2	0.25	0.15	1.0	0.45	0.78	0.35	0.13	0.54	0.0	0.23	0.36	0.0	0.02
lcl\|BLLF01009632.1_cds_GFH33780.1_28257 (GFH33780)	0.11	0.0	0.0	0.09	0.02	0.43	0.08	0.11	0.1	0.4	0.17	0.22	0.48	0.37	0.1	0.57	0.32	1.0	0.0	0.09	0.92	0.35	0.44	0.28	0.23	0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)