Heatmap: Cluster_276 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000003.1_cds_GFH05602.1_79 (GFH05602)	0.32	0.33	0.0	0.57	0.38	0.53	0.52	0.18	0.33	0.63	0.47	0.53	0.59	0.45	0.4	0.97	1.0	0.48	0.35	0.43	0.55	0.43	0.61	0.64	0.68	0.47
lcl\|BLLF01000034.1_cds_GFH06351.1_828 (GFH06351)	0.1	0.39	0.1	0.66	0.95	0.87	0.77	0.41	0.7	0.86	0.73	0.6	0.6	0.49	0.56	1.0	0.62	0.29	0.11	0.25	0.55	0.57	0.49	0.41	0.75	0.74
lcl\|BLLF01000043.1_cds_GFH06537.1_1014 (GFH06537)	0.1	0.0	0.0	0.73	0.97	0.91	0.96	0.73	0.89	0.87	1.0	0.83	0.82	0.76	0.78	0.12	0.18	0.96	0.0	0.08	0.79	0.0	0.76	0.58	0.71	0.72
lcl\|BLLF01000056.1_cds_GFH06785.1_1262 (GFH06785)	0.33	0.4	0.05	0.34	0.6	0.57	0.48	0.31	0.42	0.64	0.62	0.52	0.54	0.43	0.4	0.77	1.0	0.41	0.44	0.42	0.49	0.35	0.34	0.45	0.67	0.62
lcl\|BLLF01000066.1_cds_GFH06966.1_1443 (GFH06966)	0.21	0.0	0.0	0.28	0.59	0.72	0.8	0.3	0.6	0.61	0.54	0.56	0.49	0.4	0.59	1.0	0.55	0.33	0.33	0.27	0.29	0.24	0.36	0.45	0.75	0.74
lcl\|BLLF01000072.1_cds_GFH07063.1_1540 (GFH07063)	0.2	0.0	0.0	0.57	0.89	0.98	0.93	0.49	1.0	0.41	0.92	0.63	0.71	0.64	0.68	0.29	0.54	0.34	0.34	0.39	0.86	0.0	0.45	0.86	0.67	0.6
lcl\|BLLF01000106.1_cds_GFH07630.1_2107 (GFH07630)	0.05	0.0	0.0	0.46	1.0	0.72	0.92	0.35	0.83	0.37	0.87	0.69	0.66	0.41	0.42	0.35	0.26	0.14	0.0	0.12	0.0	0.0	0.81	0.55	0.69	0.64
lcl\|BLLF01000133.1_cds_GFH08044.1_2521 (GFH08044)	0.1	0.33	0.0	0.3	0.55	0.64	0.57	0.5	0.57	0.31	0.66	0.57	0.51	0.5	0.42	0.06	0.23	0.24	0.0	0.08	0.4	0.23	0.24	0.49	0.74	1.0
lcl\|BLLF01000137.1_cds_GFH08104.1_2581 (GFH08104)	0.11	0.07	0.3	0.22	0.86	0.73	0.57	0.3	0.61	0.42	0.93	0.73	1.0	0.54	0.51	0.27	0.89	0.46	0.15	0.11	0.45	0.3	0.61	0.1	0.42	0.62
lcl\|BLLF01000147.1_cds_GFH08232.1_2709 (GFH08232)	0.2	0.15	0.11	0.49	0.55	0.65	0.6	0.5	0.68	1.0	0.42	0.4	0.42	0.38	0.59	0.44	0.49	0.37	0.14	0.27	0.36	0.71	0.35	0.26	0.44	0.48
lcl\|BLLF01000185.1_cds_GFH08810.1_3287 (GFH08810)	0.0	0.0	0.0	0.26	0.71	0.86	1.0	0.32	0.59	0.28	0.81	0.37	0.6	0.58	0.55	0.0	0.15	0.54	0.23	0.39	0.85	0.24	0.38	0.74	0.55	0.5
lcl\|BLLF01000206.1_cds_GFH09065.1_3542 (GFH09065)	0.21	0.32	0.11	0.22	0.54	0.57	0.53	0.34	0.51	1.0	0.58	0.5	0.53	0.42	0.57	0.4	0.34	0.56	0.3	0.32	0.49	0.23	0.5	0.15	0.66	0.56
lcl\|BLLF01000228.1_cds_GFH09367.1_3844 (GFH09367)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.49	0.29	0.12	0.36	1.0	0.25	0.45	0.49	0.27	0.44	0.2	0.15	0.24	0.12	0.2	0.11	0.0	0.0	0.09	0.51	0.46
lcl\|BLLF01000250.1_cds_GFH09645.1_4122 (GFH09645)	0.08	0.04	0.36	0.12	0.33	0.5	0.5	0.2	0.45	1.0	0.36	0.31	0.43	0.31	0.17	0.22	0.12	0.38	0.13	0.11	0.12	0.13	0.29	0.18	0.4	0.32
lcl\|BLLF01000253.1_cds_GFH09671.1_4148 (GFH09671)	0.49	0.5	0.0	0.34	0.66	0.62	0.68	0.36	0.54	0.52	0.7	0.55	0.61	0.49	0.6	1.0	0.97	0.61	0.52	0.63	0.72	0.66	0.53	0.54	0.73	0.53
lcl\|BLLF01000273.1_cds_GFH09905.1_4382 (GFH09905)	0.34	0.07	0.0	0.54	0.83	0.8	0.86	0.71	0.91	0.86	0.82	0.73	0.71	0.62	0.73	0.73	0.73	0.45	0.43	0.46	0.49	0.57	0.35	0.79	0.99	1.0
lcl\|BLLF01000405.1_cds_GFH11453.1_5930 (GFH11453)	0.07	0.0	0.0	0.0	0.81	0.57	0.3	0.47	0.34	1.0	0.66	0.5	0.25	0.57	0.26	0.32	0.27	0.0	0.33	0.0	0.0	0.35	0.0	0.28	0.52	0.55
lcl\|BLLF01000508.1_cds_GFH12482.1_6959 (GFH12482)	0.17	0.11	0.0	0.4	0.5	0.57	0.49	0.33	0.48	1.0	0.6	0.59	0.49	0.47	0.43	0.37	0.4	0.21	0.24	0.16	0.24	0.23	0.28	0.4	0.55	0.57
lcl\|BLLF01000510.1_cds_GFH12502.1_6979 (GFH12502)	0.39	0.31	0.4	0.46	0.7	0.64	0.85	0.57	0.86	1.0	0.82	0.75	0.84	0.6	0.56	0.31	0.36	0.64	0.15	0.48	0.66	0.57	0.6	0.78	0.69	0.43
lcl\|BLLF01000674.1_cds_GFH13987.1_8464 (GFH13987)	0.05	0.0	0.0	0.0	0.63	0.57	0.53	0.41	0.45	0.66	0.49	0.61	0.58	0.5	0.6	0.56	0.28	0.14	0.0	0.0	1.0	0.0	0.29	0.28	0.6	0.24
lcl\|BLLF01000719.1_cds_GFH14382.1_8859 (GFH14382)	0.02	0.04	0.15	0.01	0.52	0.45	0.46	0.4	0.56	1.0	0.42	0.36	0.52	0.35	0.48	0.42	0.37	0.24	0.4	0.47	0.27	0.56	0.3	0.14	0.47	0.43
lcl\|BLLF01000729.1_cds_GFH14464.1_8941 (GFH14464)	0.25	0.42	0.0	0.12	0.64	0.66	0.53	0.25	0.5	0.6	0.5	0.49	0.59	0.43	0.35	1.0	0.76	0.8	0.32	0.48	0.66	0.53	0.72	0.59	0.78	0.9
lcl\|BLLF01000749.1_cds_GFH14631.1_9108 (GFH14631)	0.0	0.0	0.0	0.43	0.51	0.69	0.75	0.36	0.81	0.0	0.59	0.64	0.49	0.5	0.47	0.0	0.04	0.09	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.46	1.0	0.99
lcl\|BLLF01000790.1_cds_GFH14974.1_9451 (GFH14974)	0.07	0.31	0.0	0.51	0.39	0.6	0.55	0.22	0.55	1.0	0.49	0.44	0.32	0.32	0.34	0.49	0.83	0.88	0.26	0.15	0.59	0.39	0.36	0.15	0.23	0.44
lcl\|BLLF01000796.1_cds_GFH15027.1_9504 (GFH15027)	0.0	0.37	0.0	0.1	0.45	0.58	0.74	0.36	0.71	1.0	0.64	0.48	0.87	0.71	0.72	0.0	0.0	0.25	0.0	0.21	0.51	0.0	0.12	0.4	0.71	0.4
lcl\|BLLF01000814.1_cds_GFH15163.1_9640 (GFH15163)	0.28	0.22	0.23	0.26	0.7	0.65	0.54	0.37	0.49	0.82	0.83	0.47	0.58	0.4	0.41	0.98	0.97	0.57	0.48	0.67	0.63	0.27	0.32	0.44	0.73	1.0
lcl\|BLLF01000846.1_cds_GFH15409.1_9886 (GFH15409)	0.26	0.23	0.09	0.54	0.54	0.7	0.65	0.4	0.65	1.0	0.58	0.55	0.52	0.54	0.52	0.45	0.67	0.57	0.25	0.24	0.53	0.48	0.56	0.31	0.54	0.58
lcl\|BLLF01000879.1_cds_GFH15651.1_10128 (GFH15651)	0.06	0.08	0.0	0.64	0.44	0.47	0.51	0.34	0.46	0.67	0.55	0.38	0.41	0.45	0.45	0.1	0.08	0.29	0.06	0.24	0.11	0.26	0.16	0.27	1.0	0.66
lcl\|BLLF01000911.1_cds_GFH15859.1_10336 (GFH15859)	0.12	0.04	0.0	0.19	0.46	0.54	0.4	0.18	0.32	0.42	0.26	0.32	0.28	0.25	0.18	1.0	0.44	0.32	0.0	0.03	0.24	0.17	0.28	0.22	0.37	0.54
lcl\|BLLF01001060.1_cds_GFH16849.1_11326 (GFH16849)	0.52	0.34	0.17	0.36	0.84	0.71	0.64	0.58	0.61	1.0	0.72	0.64	0.59	0.55	0.49	0.55	0.78	0.46	0.58	0.59	0.41	0.49	0.4	0.56	0.78	0.75
lcl\|BLLF01001081.1_cds_GFH16996.1_11473 (GFH16996)	0.2	0.05	0.6	0.76	0.5	0.68	0.56	0.27	0.36	1.0	0.58	0.55	0.51	0.56	0.42	0.22	0.38	0.31	0.21	0.31	0.35	0.18	0.98	0.24	0.75	0.92
lcl\|BLLF01001228.1_cds_GFH17961.1_12438 (GFH17961)	0.03	0.35	0.0	0.3	0.9	0.94	0.75	0.58	0.65	1.0	0.7	0.49	0.67	0.44	0.72	0.48	0.22	0.52	0.07	0.24	0.43	0.36	0.53	0.29	0.75	0.68
lcl\|BLLF01001304.1_cds_GFH18463.1_12940 (GFH18463)	0.22	0.0	0.0	0.28	0.77	0.88	0.78	0.41	0.79	0.15	0.53	0.57	0.67	0.54	0.65	0.21	0.48	1.0	0.13	0.35	0.46	0.26	0.99	0.44	0.42	0.35
lcl\|BLLF01001445.1_cds_GFH19335.1_13812 (GFH19335)	0.2	0.16	0.05	0.17	0.44	0.63	0.53	0.4	0.57	1.0	0.45	0.66	0.62	0.45	0.44	0.14	0.23	0.13	0.31	0.57	0.18	0.4	0.17	0.3	0.65	0.56
lcl\|BLLF01001482.1_cds_GFH19545.1_14022 (GFH19545)	0.19	0.06	0.0	0.2	0.38	0.42	0.5	0.25	0.53	1.0	0.39	0.3	0.35	0.28	0.49	0.35	0.43	0.27	0.1	0.04	0.21	0.24	0.21	0.16	0.71	0.5
lcl\|BLLF01001483.1_cds_GFH19554.1_14031 (GFH19554)	0.24	0.23	0.21	0.12	0.58	0.61	0.59	0.34	0.69	1.0	0.64	0.55	0.52	0.32	0.31	0.69	0.65	0.2	0.34	0.51	0.11	0.45	0.2	0.35	0.5	0.44
lcl\|BLLF01001621.1_cds_GFH20363.1_14840 (GFH20363)	0.19	0.0	0.0	0.43	0.66	0.66	0.73	0.3	0.62	1.0	0.55	0.42	0.47	0.47	0.53	0.85	0.76	0.53	0.46	0.15	0.3	0.21	0.61	0.31	0.92	0.89
lcl\|BLLF01002193.1_cds_GFH23102.1_17579 (GFH23102)	0.54	0.39	0.0	0.09	1.0	0.8	0.89	0.55	0.73	0.71	0.83	0.66	0.72	0.41	0.66	0.09	0.05	0.65	0.12	0.36	0.87	0.37	0.62	0.42	0.66	0.7
lcl\|BLLF01002315.1_cds_GFH23614.1_18091 (GFH23614)	0.37	0.32	0.09	0.49	0.57	0.64	0.72	0.58	0.77	0.56	0.59	0.62	0.62	0.57	0.65	0.48	0.73	0.49	0.17	0.27	0.43	0.47	0.42	0.95	1.0	0.82
lcl\|BLLF01002495.1_cds_GFH24295.1_18772 (GFH24295)	0.18	0.1	0.17	0.47	0.78	0.97	1.0	0.46	0.9	0.46	0.84	0.88	0.81	0.63	0.79	0.55	0.6	0.43	0.42	0.37	0.41	0.54	0.47	0.69	0.93	0.77
lcl\|BLLF01002565.1_cds_GFH24546.1_19023 (GFH24546)	0.03	0.0	0.0	0.0	0.97	1.0	0.61	0.43	0.8	0.0	0.76	0.68	0.77	0.36	0.7	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.13	0.0	0.09	0.49	0.78	0.15
lcl\|BLLF01002612.1_cds_GFH24711.1_19188 (GFH24711)	0.0	0.0	0.0	0.66	0.72	0.79	0.89	0.7	0.67	0.45	1.0	0.7	0.48	0.9	0.5	0.18	0.54	0.92	0.11	0.18	0.69	0.34	0.99	0.71	0.52	0.43
lcl\|BLLF01002711.1_cds_GFH25079.1_19556 (GFH25079)	0.2	0.12	0.0	0.48	1.0	0.84	0.83	0.41	0.76	0.93	0.81	0.87	0.82	0.6	0.85	0.16	0.12	0.55	0.32	0.29	0.53	0.07	0.59	0.62	0.92	0.58
lcl\|BLLF01002891.1_cds_GFH25695.1_20172 (GFH25695)	0.3	0.26	0.17	0.6	0.66	0.67	0.58	0.33	0.49	0.46	0.61	0.42	0.43	0.42	0.42	0.49	1.0	0.86	0.14	0.24	0.7	0.45	0.57	0.43	0.36	0.42
lcl\|BLLF01003002.1_cds_GFH26052.1_20529 (GFH26052)	0.46	0.31	0.0	0.17	0.43	0.64	0.63	0.39	0.72	0.25	0.66	0.67	0.66	0.6	0.44	0.6	0.54	0.31	0.13	0.11	0.36	0.35	0.25	0.66	0.89	1.0
lcl\|BLLF01003111.1_cds_GFH26380.1_20857 (GFH26380)	0.09	0.09	0.31	0.11	0.35	0.22	0.26	0.31	0.37	1.0	0.28	0.26	0.35	0.2	0.32	0.09	0.05	0.19	0.19	0.14	0.22	0.18	0.26	0.15	0.33	0.27
lcl\|BLLF01003138.1_cds_GFH26463.1_20940 (GFH26463)	0.04	0.36	0.0	0.2	0.37	0.45	0.76	0.26	0.76	0.13	0.45	0.5	0.45	0.48	0.47	0.06	0.05	0.19	0.0	0.0	0.07	0.15	0.19	0.68	1.0	0.99
lcl\|BLLF01003253.1_cds_GFH26827.1_21304 (GFH26827)	0.0	0.0	0.0	0.68	0.41	0.43	0.31	0.3	0.63	0.0	0.4	0.36	0.38	0.62	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	1.0	0.89
lcl\|BLLF01003333.1_cds_GFH27050.1_21527 (GFH27050)	0.07	0.0	0.0	0.19	0.4	0.37	0.41	0.14	0.68	1.0	0.31	0.22	0.26	0.15	0.47	0.37	0.63	0.22	0.0	0.0	0.3	0.35	0.22	0.15	0.2	0.71
lcl\|BLLF01003756.1_cds_GFH28134.1_22611 (GFH28134)	0.39	0.25	0.41	0.36	0.49	0.54	0.49	0.51	0.56	1.0	0.51	0.52	0.67	0.41	0.53	0.31	0.47	0.36	0.54	0.56	0.38	0.57	0.32	0.28	0.5	0.42
lcl\|BLLF01003889.1_cds_GFH28463.1_22940 (GFH28463)	0.0	0.0	0.0	0.35	0.56	0.46	0.35	0.34	0.24	0.0	0.39	0.39	0.41	0.17	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	1.0	0.42
lcl\|BLLF01004360.1_cds_GFH29466.1_23943 (GFH29466)	0.1	0.41	0.29	0.37	0.73	0.51	0.6	0.41	0.71	1.0	0.53	0.62	0.52	0.37	0.67	0.22	0.32	0.55	0.13	0.07	0.06	0.2	0.29	0.61	0.62	0.57
lcl\|BLLF01004584.1_cds_GFH29894.1_24371 (GFH29894)	0.05	0.0	0.0	0.81	0.86	1.0	0.76	0.53	0.89	0.33	1.0	0.67	0.83	0.76	0.93	0.33	0.69	0.83	0.47	0.35	0.57	0.41	0.62	0.94	0.83	0.62
lcl\|BLLF01005670.1_cds_GFH31490.1_25967 (GFH31490)	0.34	0.45	0.91	0.47	0.55	0.6	0.47	0.49	0.53	1.0	0.49	0.54	0.64	0.54	0.56	0.1	0.26	0.62	0.04	0.18	0.64	0.33	0.45	0.23	0.65	0.85
lcl\|BLLF01005738.1_cds_GFH31579.1_26056 (GFH31579)	0.17	0.29	0.0	0.19	0.46	0.42	0.45	0.5	0.43	0.46	0.45	0.31	0.43	0.49	0.37	0.66	0.15	0.61	0.15	0.13	0.57	0.41	0.2	1.0	0.8	0.81
lcl\|BLLF01006459.1_cds_GFH32270.1_26747 (GFH32270)	0.13	0.0	0.0	0.05	0.85	1.0	0.79	0.44	0.67	0.53	0.83	0.9	0.54	0.53	0.5	0.21	0.28	0.46	0.24	0.11	0.36	0.41	0.61	0.46	0.56	0.68
lcl\|BLLF01006589.1_cds_GFH32387.1_26864 (GFH32387)	0.16	0.1	0.0	0.44	0.44	0.54	0.8	0.33	0.8	0.48	0.64	0.52	0.33	0.28	0.57	0.23	0.45	0.23	0.09	0.05	0.24	0.09	0.06	0.52	0.89	1.0
lcl\|BLLF01006748.1_cds_GFH32519.1_26996 (GFH32519)	0.2	0.26	0.15	0.39	0.58	0.83	0.76	0.36	0.5	0.84	0.68	0.35	0.43	0.42	0.37	0.32	0.96	0.97	0.22	0.21	0.64	0.69	1.0	0.38	0.43	0.55
lcl\|BLLF01007336.1_cds_GFH32905.1_27382 (GFH32905)	0.07	0.07	0.0	0.29	0.68	0.82	0.75	0.31	0.66	0.87	0.78	0.51	1.0	0.55	0.54	0.15	0.38	0.72	0.24	0.07	0.72	0.19	0.56	0.03	0.65	0.7
lcl\|BLLF01007728.1_cds_GFH33087.1_27564 (GFH33087)	0.25	0.23	0.0	0.0	0.31	0.4	0.37	0.29	0.47	1.0	0.29	0.24	0.61	0.12	0.51	0.4	0.15	0.0	0.24	0.13	0.22	0.0	0.0	0.01	0.11	0.07

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)