Heatmap: Cluster_92 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
0.0 0.67 0.9 0.37 0.39 0.62 0.63 0.51 0.48 0.0 0.34 0.5 0.38 0.41 0.32 1.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.64
0.0 0.0 1.0 0.08 0.24 0.17 0.27 0.21 0.31 0.29 0.28 0.14 0.24 0.22 0.32 0.51 0.35 0.06 0.04 0.02 0.19 0.0 0.14 0.11 0.33 0.39
0.17 0.47 1.0 0.85 0.38 0.38 0.35 0.08 0.35 0.39 0.27 0.16 0.19 0.18 0.2 0.46 0.2 0.09 0.04 0.36 0.26 0.08 0.09 0.05 0.05 0.12
0.2 0.79 1.0 0.05 0.47 0.53 0.33 0.26 0.31 0.21 0.44 0.27 0.3 0.32 0.26 0.48 0.53 0.18 0.09 0.2 0.21 0.24 0.21 0.19 0.36 0.28
0.12 0.49 1.0 0.23 0.54 0.43 0.37 0.31 0.45 0.19 0.5 0.35 0.33 0.31 0.32 0.42 0.56 0.12 0.28 0.19 0.18 0.16 0.14 0.2 0.5 0.49
0.08 0.06 0.22 0.05 0.1 0.23 0.17 0.07 0.09 0.43 0.1 0.09 0.11 0.1 0.07 1.0 0.24 0.33 0.16 0.1 0.5 0.16 0.4 0.13 0.17 0.4
0.22 0.28 0.5 0.41 0.08 0.05 0.15 0.04 0.15 0.65 0.07 0.06 0.05 0.03 0.18 1.0 0.65 0.0 0.22 0.03 0.0 0.11 0.0 0.05 0.34 0.2
0.18 0.52 0.94 0.7 0.32 0.38 0.38 0.23 0.47 1.0 0.43 0.34 0.33 0.17 0.53 0.58 0.49 0.27 0.63 0.19 0.36 0.23 0.32 0.28 0.82 0.33
0.16 0.75 0.77 0.02 0.05 0.11 0.0 0.18 0.08 0.31 0.08 0.15 0.24 0.29 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.11 0.04
0.43 0.65 1.0 0.82 0.6 0.79 0.63 0.27 0.35 0.74 0.53 0.49 0.5 0.48 0.5 0.67 0.7 0.5 0.38 0.22 0.24 0.34 0.36 0.14 0.34 0.36
0.4 0.53 1.0 0.49 0.44 0.28 0.21 0.19 0.16 0.14 0.44 0.26 0.17 0.17 0.2 0.89 0.92 0.35 0.04 0.11 0.08 0.04 0.3 0.06 0.21 0.14
0.17 0.04 0.6 0.23 0.34 0.26 0.22 0.06 0.18 0.63 0.44 0.26 0.4 0.23 0.18 0.98 1.0 0.0 0.08 0.0 0.04 0.0 0.1 0.03 0.54 0.62
0.42 1.0 0.98 0.17 0.69 0.48 0.24 0.25 0.29 0.29 0.59 0.41 0.23 0.25 0.21 0.3 0.26 0.06 0.14 0.22 0.14 0.06 0.0 0.0 0.15 0.57
0.29 0.66 1.0 0.14 0.37 0.4 0.41 0.36 0.5 0.55 0.37 0.34 0.33 0.3 0.43 0.72 0.76 0.2 0.03 0.05 0.16 0.09 0.23 0.05 0.35 0.28
0.17 0.8 1.0 0.35 0.49 0.42 0.29 0.33 0.26 0.8 0.45 0.36 0.33 0.39 0.2 0.97 0.9 0.19 0.02 0.13 0.12 0.23 0.15 0.05 0.4 0.34
0.07 0.67 1.0 0.13 0.57 0.29 0.21 0.22 0.23 0.76 0.42 0.24 0.18 0.32 0.14 0.85 0.99 0.16 0.15 0.12 0.15 0.24 0.16 0.06 0.47 0.33
0.0 0.55 1.0 0.5 0.88 0.65 0.41 0.37 0.54 0.71 0.79 0.58 0.52 0.53 0.31 0.43 0.69 0.28 0.0 0.05 0.08 0.09 0.17 0.05 0.4 0.33
0.33 0.83 0.67 0.14 0.59 0.7 0.44 0.45 0.37 1.0 0.66 0.47 0.38 0.5 0.34 0.65 0.9 0.1 0.43 0.24 0.26 0.08 0.29 0.29 0.39 0.38
0.01 0.24 1.0 0.0 0.24 0.3 0.19 0.13 0.11 0.21 0.21 0.27 0.15 0.17 0.12 0.34 0.16 0.18 0.0 0.0 0.2 0.0 0.11 0.06 0.24 0.35
0.05 0.35 1.0 0.03 0.37 0.33 0.24 0.25 0.33 0.32 0.44 0.47 0.29 0.26 0.21 0.62 0.53 0.35 0.0 0.12 0.38 0.11 0.48 0.18 0.39 0.57
0.14 0.8 1.0 0.0 0.81 0.52 0.33 0.46 0.21 0.34 0.69 0.41 0.45 0.46 0.22 0.13 0.2 0.02 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.12 0.11
0.32 0.7 1.0 0.37 0.36 0.51 0.25 0.11 0.27 0.38 0.29 0.35 0.28 0.12 0.23 0.0 0.26 0.14 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.33 0.3
0.0 0.37 0.3 0.19 0.36 0.31 0.17 0.14 0.1 0.07 0.44 0.31 0.18 0.2 0.07 1.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.42
0.13 0.12 0.0 0.11 0.12 0.22 0.17 0.19 0.17 0.24 0.08 0.1 0.11 0.06 0.19 1.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.14 0.19
1.0 0.94 0.91 0.52 0.51 0.44 0.37 0.36 0.37 0.63 0.6 0.24 0.47 0.5 0.34 0.3 0.36 0.35 0.0 0.07 0.76 0.0 0.45 0.1 0.21 0.18
0.03 0.4 0.63 0.0 0.02 0.05 0.05 0.05 0.06 0.47 0.03 0.03 0.01 0.03 0.04 1.0 0.48 0.24 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.06 0.12 0.08
0.5 1.0 0.76 0.0 0.4 0.38 0.35 0.27 0.39 0.66 0.44 0.33 0.35 0.15 0.35 0.6 0.18 0.38 0.38 0.07 0.12 0.29 0.27 0.2 0.15 0.1
0.04 0.35 0.41 0.01 0.22 0.28 0.17 0.21 0.18 0.54 0.22 0.18 0.09 0.12 0.1 1.0 0.43 0.28 0.03 0.1 0.32 0.21 0.21 0.09 0.36 0.64
0.37 0.46 0.2 0.34 0.24 0.37 0.33 0.14 0.25 0.47 0.28 0.26 0.35 0.22 0.22 1.0 0.82 0.33 0.06 0.09 0.23 0.13 0.29 0.1 0.35 0.31
0.42 0.51 0.78 0.0 0.05 0.27 0.47 0.29 0.21 0.29 0.21 0.34 0.47 0.62 0.38 1.0 0.51 0.34 0.19 0.31 0.0 0.34 0.0 0.0 0.05 0.25
0.0 0.46 1.0 0.7 0.47 0.31 0.25 0.12 0.48 0.13 0.21 0.22 0.3 0.11 0.21 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.27 0.25
0.0 0.47 1.0 0.63 0.44 0.4 0.43 0.19 0.45 0.76 0.37 0.43 0.39 0.47 0.28 0.81 0.6 0.33 0.25 0.1 0.16 0.17 0.27 0.12 0.62 0.76
0.25 0.6 0.9 0.13 0.34 0.27 0.26 0.38 0.3 0.32 0.3 0.24 0.32 0.33 0.18 0.47 1.0 0.26 0.1 0.19 0.16 0.35 0.1 0.16 0.21 0.16
0.22 0.59 1.0 0.43 0.45 0.3 0.26 0.31 0.32 0.5 0.41 0.29 0.35 0.26 0.31 0.66 0.64 0.31 0.16 0.3 0.28 0.28 0.25 0.04 0.29 0.26
0.0 1.0 0.92 0.0 0.38 0.11 0.15 0.04 0.22 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.31
0.05 0.58 0.88 0.17 0.22 0.19 0.2 0.31 0.26 0.44 0.19 0.25 0.23 0.27 0.21 1.0 0.95 0.16 0.12 0.23 0.18 0.45 0.15 0.11 0.33 0.29
0.08 0.11 0.31 0.01 0.28 0.26 0.27 0.12 0.15 0.3 0.24 0.18 0.14 0.2 0.13 1.0 0.18 0.4 0.07 0.12 0.47 0.2 0.23 0.1 0.27 0.59
0.39 0.88 1.0 0.63 0.69 0.59 0.49 0.54 0.6 0.59 0.54 0.61 0.61 0.41 0.62 0.64 0.79 0.3 0.36 0.51 0.33 0.28 0.36 0.34 0.74 0.69
0.51 1.0 0.65 0.42 0.48 0.31 0.22 0.3 0.29 0.33 0.39 0.29 0.34 0.25 0.26 0.44 0.51 0.23 0.08 0.09 0.18 0.07 0.21 0.09 0.12 0.16
0.42 0.97 1.0 0.28 0.81 0.62 0.28 0.25 0.39 0.36 0.7 0.44 0.49 0.36 0.37 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.01 0.22 0.32
0.07 0.37 1.0 0.21 0.28 0.3 0.35 0.24 0.29 0.53 0.26 0.27 0.28 0.25 0.22 0.54 0.6 0.22 0.09 0.06 0.22 0.1 0.23 0.07 0.37 0.35
0.04 0.81 1.0 0.7 0.6 0.54 0.7 0.52 0.43 0.51 0.75 0.46 0.56 0.4 0.77 0.0 0.11 0.37 0.09 0.15 0.31 0.09 0.18 0.1 0.32 0.43
0.44 0.3 0.81 0.14 0.26 0.55 0.53 0.29 0.44 0.4 0.37 0.39 0.65 0.57 0.41 0.82 0.83 0.72 0.3 0.15 1.0 0.49 0.52 0.14 0.41 0.59
0.25 0.67 1.0 0.31 0.8 0.58 0.52 0.33 0.46 0.37 0.56 0.43 0.48 0.32 0.45 0.16 0.35 0.53 0.33 0.08 0.3 0.05 0.15 0.48 0.54 0.51
0.39 0.65 0.8 0.83 0.54 0.46 0.48 0.28 0.46 0.57 0.48 0.42 0.34 0.3 0.42 0.9 1.0 0.37 0.12 0.2 0.23 0.23 0.36 0.26 0.51 0.46
0.07 0.49 1.0 0.42 0.39 0.3 0.21 0.41 0.25 0.14 0.53 0.29 0.31 0.35 0.2 0.06 0.05 0.25 0.23 0.09 0.21 0.16 0.2 0.18 0.14 0.19
0.31 0.76 1.0 0.86 0.95 0.57 0.53 0.36 0.47 0.55 0.48 0.25 0.29 0.2 0.28 0.24 0.86 0.06 0.09 0.03 0.26 0.11 0.1 0.06 0.65 0.29
0.22 0.37 0.03 0.39 0.11 0.26 0.28 0.1 0.31 0.62 0.12 0.22 0.28 0.15 0.24 1.0 0.56 0.06 0.0 0.05 0.0 0.0 0.12 0.01 0.31 0.25
0.62 0.66 0.92 0.41 0.51 0.41 0.5 0.56 0.58 1.0 0.82 0.45 0.71 0.87 0.43 0.57 0.66 0.75 0.27 0.18 0.4 0.59 0.34 0.12 0.35 0.38
0.56 0.78 0.89 0.49 0.68 0.59 0.6 0.4 0.66 0.42 0.57 0.55 0.52 0.4 0.57 0.45 1.0 0.24 0.28 0.29 0.26 0.31 0.29 0.45 0.5 0.34
0.29 0.86 1.0 0.1 0.86 0.78 0.4 0.59 0.48 0.65 0.55 0.47 0.39 0.42 0.46 0.27 0.55 0.26 0.25 0.33 0.31 0.08 0.14 0.16 0.34 0.46
0.32 0.52 0.48 0.46 0.38 0.39 0.28 0.41 0.29 1.0 0.37 0.37 0.28 0.37 0.35 0.73 0.62 0.24 0.14 0.2 0.19 0.22 0.14 0.07 0.07 0.09
0.04 0.68 1.0 0.0 0.3 0.23 0.39 0.21 0.32 0.01 0.22 0.24 0.33 0.12 0.24 0.63 0.46 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.04 0.52 0.75
0.04 0.48 0.33 0.25 0.24 0.23 0.22 0.12 0.21 0.38 0.2 0.22 0.26 0.15 0.25 1.0 0.59 0.01 0.0 0.05 0.0 0.04 0.01 0.01 0.42 0.15
0.32 0.4 0.52 0.44 0.4 0.23 0.2 0.27 0.28 1.0 0.36 0.2 0.21 0.26 0.24 0.97 0.53 0.2 0.05 0.07 0.1 0.11 0.19 0.05 0.54 0.41
0.0 0.42 0.52 0.4 0.36 0.35 0.26 0.21 0.27 0.27 0.28 0.3 0.2 0.23 0.25 1.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.29
0.16 0.72 0.89 0.21 0.31 0.29 0.21 0.3 0.24 0.56 0.29 0.23 0.2 0.23 0.21 0.94 1.0 0.33 0.17 0.14 0.3 0.24 0.34 0.12 0.33 0.38
0.01 1.0 0.76 0.38 0.76 0.58 0.35 0.4 0.32 0.36 0.6 0.47 0.46 0.42 0.26 0.59 0.65 0.2 0.29 0.12 0.21 0.18 0.2 0.17 0.23 0.28
0.01 0.27 0.44 0.58 0.07 0.1 0.41 0.06 0.36 0.58 0.06 0.06 0.15 0.05 0.41 0.74 1.0 0.04 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.28 0.08
0.09 0.42 1.0 0.06 0.4 0.56 0.37 0.32 0.41 0.03 0.33 0.4 0.32 0.25 0.35 0.68 0.65 0.09 0.17 0.15 0.15 0.26 0.08 0.18 0.52 0.43
0.23 0.66 1.0 0.27 0.77 0.52 0.38 0.33 0.34 0.7 0.6 0.33 0.32 0.36 0.23 0.41 0.79 0.31 0.15 0.34 0.5 0.03 0.14 0.05 0.4 0.46
0.23 0.3 0.78 0.07 0.21 0.33 0.37 0.21 0.31 0.12 0.25 0.35 0.4 0.37 0.42 1.0 0.62 0.06 0.0 0.15 0.18 0.17 0.09 0.12 0.3 0.35
0.0 0.3 1.0 0.16 0.21 0.25 0.13 0.28 0.21 0.51 0.24 0.28 0.19 0.11 0.32 0.53 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.25
0.08 0.45 1.0 0.39 0.36 0.34 0.15 0.22 0.22 0.47 0.24 0.22 0.19 0.23 0.2 0.34 0.89 0.17 0.0 0.15 0.18 0.09 0.19 0.28 0.36 0.3
0.0 1.0 0.76 0.03 0.27 0.24 0.34 0.32 0.33 0.1 0.25 0.3 0.37 0.38 0.32 0.32 0.38 0.05 0.32 0.22 0.17 0.24 0.14 0.24 0.23 0.25
0.16 0.64 1.0 0.44 0.67 0.4 0.39 0.45 0.32 0.08 0.48 0.4 0.36 0.39 0.29 0.42 0.48 0.33 0.13 0.18 0.16 0.43 0.33 0.4 0.52 0.45
0.0 0.36 1.0 0.79 0.38 0.3 0.25 0.26 0.37 0.2 0.63 0.18 0.32 0.29 0.23 0.52 0.48 0.26 0.0 0.08 0.24 0.0 0.34 0.08 0.06 0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)