Heatmap: Cluster_66 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000004.1_cds_GFH05646.1_123 (GFH05646)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.0	0.05	0.06	1.0	0.02	0.0	0.04	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.13	0.13
lcl\|BLLF01000019.1_cds_GFH06032.1_509 (GFH06032)	0.06	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.03	0.04	0.06	1.0	0.04	0.03	0.03	0.03	0.05	0.06	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.0	0.03	0.01	0.08	0.06
lcl\|BLLF01000041.1_cds_GFH06489.1_966 (GFH06489)	0.02	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	1.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01
lcl\|BLLF01000041.1_cds_GFH06493.1_970 (GFH06493)	0.04	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.02	0.02	0.01	1.0	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.0	0.01	0.01
lcl\|BLLF01000219.1_cds_GFH09237.1_3714 (GFH09237)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.06	0.04	0.0	0.13	1.0	0.06	0.04	0.0	0.07	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.13	0.19
lcl\|BLLF01000434.1_cds_GFH11767.1_6244 (GFH11767)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000531.1_cds_GFH12698.1_7175 (GFH12698)	0.05	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.03	0.0	0.0	1.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.12	0.0
lcl\|BLLF01000628.1_cds_GFH13567.1_8044 (GFH13567)	0.02	0.01	0.02	0.29	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.03	0.04	0.05
lcl\|BLLF01000724.1_cds_GFH14426.1_8903 (GFH14426)	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.08	0.04	0.02	0.05	1.0	0.04	0.0	0.07	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.19
lcl\|BLLF01000820.1_cds_GFH15204.1_9681 (GFH15204)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000890.1_cds_GFH15721.1_10198 (GFH15721)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001082.1_cds_GFH17001.1_11478 (GFH17001)	0.08	0.02	0.05	0.0	0.06	0.06	0.05	0.04	0.06	1.0	0.06	0.04	0.05	0.04	0.03	0.07	0.04	0.1	0.01	0.03	0.11	0.03	0.07	0.06	0.07	0.05
lcl\|BLLF01001094.1_cds_GFH17087.1_11564 (GFH17087)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	1.0	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.11	0.05	0.02	0.04	0.07	0.01	0.08	0.01	0.02	0.02
lcl\|BLLF01001474.1_cds_GFH19503.1_13980 (GFH19503)	0.05	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.06	0.06	0.05	1.0	0.05	0.07	0.05	0.05	0.05	0.0	0.07	0.0	0.0	0.03	0.05	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03
lcl\|BLLF01001559.1_cds_GFH20015.1_14492 (GFH20015)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0
lcl\|BLLF01001702.1_cds_GFH20812.1_15289 (GFH20812)	0.04	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	0.05	0.04	0.06	1.0	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.0	0.06	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.08	0.02
lcl\|BLLF01001960.1_cds_GFH22064.1_16541 (GFH22064)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.01	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.04	0.0	0.0	0.04	0.0	0.12	0.01
lcl\|BLLF01002315.1_cds_GFH23615.1_18092 (GFH23615)	0.03	0.01	0.0	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.07	1.0	0.05	0.03	0.06	0.04	0.05	0.03	0.03	0.06	0.05	0.03	0.05	0.01	0.05	0.02	0.17	0.28
lcl\|BLLF01002491.1_cds_GFH24280.1_18757 (GFH24280)	0.07	0.0	0.0	0.0	0.09	0.08	0.07	0.1	0.12	1.0	0.09	0.09	0.09	0.09	0.09	0.1	0.14	0.09	0.06	0.06	0.13	0.03	0.09	0.04	0.07	0.1
lcl\|BLLF01002784.1_cds_GFH25337.1_19814 (GFH25337)	0.02	0.0	0.0	0.02	0.1	0.01	0.04	0.07	0.06	1.0	0.01	0.01	0.0	0.1	0.04	0.13	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.12	0.02
lcl\|BLLF01003093.1_cds_GFH26322.1_20799 (GFH26322)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003191.1_cds_GFH26647.1_21124 (GFH26647)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003241.1_cds_GFH26790.1_21267 (GFH26790)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03	0.03	0.02	0.04	1.0	0.06	0.03	0.04	0.04	0.03	0.11	0.15	0.16	0.05	0.08	0.15	0.07	0.18	0.03	0.1	0.06
lcl\|BLLF01003288.1_cds_GFH26920.1_21397 (GFH26920)	0.11	0.04	0.04	0.11	0.18	0.09	0.13	0.09	0.17	1.0	0.16	0.11	0.14	0.1	0.13	0.04	0.04	0.1	0.16	0.19	0.13	0.08	0.11	0.03	0.16	0.19
lcl\|BLLF01003334.1_cds_GFH27056.1_21533 (GFH27056)	0.04	0.02	0.0	0.11	0.06	0.09	0.1	0.05	0.21	1.0	0.07	0.05	0.08	0.07	0.14	0.08	0.05	0.15	0.04	0.05	0.15	0.0	0.01	0.01	0.06	0.08
lcl\|BLLF01003376.1_cds_GFH27169.1_21646 (GFH27169)	0.06	0.0	0.0	0.04	0.03	0.02	0.03	0.04	0.05	1.0	0.04	0.04	0.02	0.01	0.05	0.19	0.0	0.07	0.05	0.18	0.2	0.11	0.0	0.05	0.05	0.06
lcl\|BLLF01003575.1_cds_GFH27686.1_22163 (GFH27686)	0.05	0.0	0.0	0.0	0.06	0.05	0.05	0.02	0.03	1.0	0.05	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.0	0.0	0.02	0.07	0.21
lcl\|BLLF01003707.1_cds_GFH28012.1_22489 (GFH28012)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	1.0	0.06	0.02	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003801.1_cds_GFH28250.1_22727 (GFH28250)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.02	0.07	1.0	0.04	0.0	0.0	0.03	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004009.1_cds_GFH28728.1_23205 (GFH28728)	0.08	0.06	0.02	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.09	1.0	0.06	0.03	0.09	0.02	0.06	0.0	0.05	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.05	0.11	0.15
lcl\|BLLF01004511.1_cds_GFH29756.1_24233 (GFH29756)	0.01	0.01	0.0	0.0	0.07	0.05	0.07	0.06	0.1	1.0	0.05	0.05	0.09	0.06	0.13	0.1	0.06	0.02	0.18	0.24	0.02	0.03	0.01	0.0	0.02	0.01
lcl\|BLLF01004596.1_cds_GFH29920.1_24397 (GFH29920)	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.07	0.15	0.1	0.15	0.1	0.0	0.17	0.02	0.01	0.04
lcl\|BLLF01004718.1_cds_GFH30126.1_24603 (GFH30126)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.07	1.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0
lcl\|BLLF01004896.1_cds_GFH30424.1_24901 (GFH30424)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01005098.1_cds_GFH30728.1_25205 (GFH30728)	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.03	0.06	0.05	0.09	1.0	0.05	0.02	0.06	0.05	0.12	0.02	0.02	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.04
lcl\|BLLF01005677.1_cds_GFH31501.1_25978 (GFH31501)	0.01	0.01	0.0	0.0	0.04	0.04	0.05	0.04	0.1	1.0	0.03	0.04	0.05	0.03	0.08	0.0	0.04	0.02	0.0	0.08	0.06	0.1	0.1	0.02	0.16	0.14
lcl\|BLLF01005806.1_cds_GFH31655.1_26132 (GFH31655)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.24	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.02
lcl\|BLLF01005806.1_cds_GFH31656.1_26133 (GFH31656)	0.02	0.05	0.0	0.0	0.07	0.03	0.06	0.05	0.06	1.0	0.04	0.02	0.06	0.03	0.05	0.1	0.0	0.04	0.12	0.07	0.14	0.0	0.08	0.0	0.05	0.03
lcl\|BLLF01006083.1_cds_GFH31933.1_26410 (GFH31933)	0.03	0.0	0.0	0.0	0.09	0.06	0.03	0.09	0.08	1.0	0.08	0.09	0.03	0.07	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.06
lcl\|BLLF01006083.1_cds_GFH31934.1_26411 (GFH31934)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.01	0.09	0.01	1.0	0.07	0.05	0.0	0.04	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01008034.1_cds_GFH33229.1_27706 (GFH33229)	0.13	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.0	0.04	0.04	1.0	0.04	0.03	0.02	0.03	0.05	0.05	0.04	0.0	0.09	0.04	0.09	0.07	0.0	0.01	0.09	0.04
lcl\|BLLF01008480.1_cds_GFH33398.1_27875 (GFH33398)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.02	0.03	0.03	1.0	0.03	0.01	0.05	0.04	0.01	0.0	0.0	0.06	0.0	0.06	0.0	0.05	0.06	0.0	0.08	0.08
lcl\|BLLF01008624.1_cds_GFH33458.1_27935 (GFH33458)	0.16	0.0	0.0	0.01	0.12	0.06	0.11	0.08	0.08	1.0	0.1	0.08	0.1	0.05	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.1
lcl\|BLLF01008671.1_cds_GFH33480.1_27957 (GFH33480)	0.06	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	1.0	0.04	0.02	0.04	0.0	0.05	0.01	0.0	0.02	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0
lcl\|BLLF01009167.1_cds_GFH33640.1_28117 (GFH33640)	0.0	0.02	0.0	0.05	0.03	0.03	0.0	0.11	0.05	1.0	0.02	0.0	0.04	0.02	0.08	0.07	0.0	0.06	0.0	0.1	0.0	0.0	0.12	0.0	0.05	0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)