Heatmap: Cluster_168 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000004.1_cds_GFH05623.1_100 (GFH05623)	0.0	0.0	0.0	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	1.0	0.0
lcl\|BLLF01000046.1_cds_GFH06587.1_1064 (GFH06587)	0.0	0.0	0.0	0.14	0.64	0.76	0.26	0.0	0.0	0.34	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
lcl\|BLLF01000145.1_cds_GFH08206.1_2683 (GFH08206)	0.0	0.0	0.0	0.77	0.3	0.77	0.43	0.15	1.0	0.51	0.31	0.33	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.51
lcl\|BLLF01000147.1_cds_GFH08231.1_2708 (GFH08231)	0.0	0.06	0.2	0.59	0.42	0.51	0.48	0.43	0.21	0.7	0.42	0.49	0.47	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.74	0.23	0.06	0.21	0.27
lcl\|BLLF01000158.1_cds_GFH08395.1_2872 (GFH08395)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.61	0.71	0.16	0.0	0.24	0.38	0.59	0.75	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	0.9	1.0
lcl\|BLLF01000170.1_cds_GFH08592.1_3069 (GFH08592)	0.0	0.0	0.0	0.21	0.08	0.25	0.08	0.16	0.0	0.44	0.05	0.1	0.07	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.25
lcl\|BLLF01000204.1_cds_GFH09044.1_3521 (GFH09044)	0.0	0.0	0.79	0.35	0.53	0.71	0.74	0.67	0.56	1.0	0.17	0.28	0.09	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.71	0.72	0.81
lcl\|BLLF01000207.1_cds_GFH09080.1_3557 (GFH09080)	0.13	0.0	0.33	0.0	0.44	0.24	0.15	0.05	0.0	0.28	0.11	0.77	0.51	0.1	0.0	0.37	0.39	0.0	0.34	0.54	0.0	0.0	0.49	1.0	0.92
lcl\|BLLF01000212.1_cds_GFH09147.1_3624 (GFH09147)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000219.1_cds_GFH09248.1_3725 (GFH09248)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	1.0	0.15	0.46	0.0	0.0	0.8	0.0	0.14	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000252.1_cds_GFH09668.1_4145 (GFH09668)	0.0	0.0	0.69	0.23	0.51	0.2	0.21	0.27	0.0	0.68	0.69	0.45	0.25	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.91	1.0
lcl\|BLLF01000258.1_cds_GFH09730.1_4207 (GFH09730)	0.26	0.0	0.13	0.55	0.46	0.44	0.51	0.23	0.43	0.68	0.44	0.43	0.45	0.27	0.2	0.15	0.16	0.47	0.27	0.22	1.0	0.16	0.17	0.47	0.37
lcl\|BLLF01000276.1_cds_GFH09948.1_4425 (GFH09948)	0.0	0.0	1.0	0.54	0.0	0.81	0.8	0.0	0.0	0.27	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000277.1_cds_GFH09960.1_4437 (GFH09960)	0.0	0.04	1.0	0.19	0.83	0.95	0.24	0.62	0.31	0.5	0.62	0.45	0.38	0.46	0.22	0.0	0.34	0.25	0.0	0.23	0.27	0.0	0.25	0.47	0.79
lcl\|BLLF01000298.1_cds_GFH10240.1_4717 (GFH10240)	0.0	0.28	0.88	0.15	0.0	0.15	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000371.1_cds_GFH11075.1_5552 (GFH11075)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.43	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	1.0	0.44
lcl\|BLLF01000422.1_cds_GFH11645.1_6122 (GFH11645)	0.0	0.0	0.14	0.79	0.27	0.12	0.27	0.16	0.2	0.48	0.03	0.08	0.11	0.14	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0	0.0
lcl\|BLLF01000521.1_cds_GFH12617.1_7094 (GFH12617)	0.08	0.07	0.32	0.25	0.63	0.25	0.23	0.31	0.68	0.43	0.21	0.31	0.39	0.3	0.0	0.48	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	1.0	0.05	0.17	0.23
lcl\|BLLF01000539.1_cds_GFH12786.1_7263 (GFH12786)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000549.1_cds_GFH12876.1_7353 (GFH12876)	0.0	0.0	1.0	0.59	0.33	0.74	0.54	0.4	0.0	0.35	0.41	0.26	0.24	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.14
lcl\|BLLF01000649.1_cds_GFH13762.1_8239 (GFH13762)	0.04	0.08	0.8	0.25	0.53	1.0	0.15	0.27	0.48	0.37	0.51	0.19	0.45	0.2	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.31	0.21
lcl\|BLLF01000920.1_cds_GFH15915.1_10392 (GFH15915)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.99	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000976.1_cds_GFH16291.1_10768 (GFH16291)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.38	0.0	0.28	0.62	0.32	0.16	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.13	1.0	0.27
lcl\|BLLF01001054.1_cds_GFH16811.1_11288 (GFH16811)	0.0	0.0	0.0	0.35	0.12	0.12	0.23	0.34	0.76	0.12	0.12	0.37	0.12	1.0	0.0	0.79	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.0
lcl\|BLLF01001185.1_cds_GFH17680.1_12157 (GFH17680)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
lcl\|BLLF01001188.1_cds_GFH17704.1_12181 (GFH17704)	0.0	0.0	0.33	0.22	0.22	0.0	0.1	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.12	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.72	0.0
lcl\|BLLF01001197.1_cds_GFH17755.1_12232 (GFH17755)	0.0	0.0	0.0	0.32	0.11	0.2	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	1.0	0.43
lcl\|BLLF01001305.1_cds_GFH18470.1_12947 (GFH18470)	0.0	0.0	1.0	0.17	0.16	0.78	0.47	0.24	0.0	0.08	0.33	0.37	0.78	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.82	0.69
lcl\|BLLF01001359.1_cds_GFH18796.1_13273 (GFH18796)	0.0	0.0	1.0	0.25	0.0	0.25	0.54	0.24	0.0	0.33	0.08	0.0	0.45	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.27	0.14
lcl\|BLLF01001427.1_cds_GFH19228.1_13705 (GFH19228)	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.32	0.27	0.0	0.33	0.0	0.0	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001588.1_cds_GFH20169.1_14646 (GFH20169)	0.0	0.0	0.83	0.27	0.83	1.0	0.38	0.6	0.0	1.0	0.48	0.67	0.12	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.23	0.23
lcl\|BLLF01001616.1_cds_GFH20335.1_14812 (GFH20335)	0.0	0.0	0.0	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
lcl\|BLLF01001662.1_cds_GFH20592.1_15069 (GFH20592)	0.0	0.0	0.0	0.1	0.76	0.1	0.09	0.14	0.31	0.46	0.38	0.35	0.1	0.09	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.47	0.54	0.0	0.4	1.0	0.58
lcl\|BLLF01001968.1_cds_GFH22091.1_16568 (GFH22091)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.6	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	1.0	0.34
lcl\|BLLF01002073.1_cds_GFH22587.1_17064 (GFH22587)	0.0	0.0	0.0	0.78	0.77	0.0	0.73	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.77
lcl\|BLLF01002173.1_cds_GFH23004.1_17481 (GFH23004)	0.0	0.0	0.0	0.67	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.0
lcl\|BLLF01002394.1_cds_GFH23904.1_18381 (GFH23904)	0.0	0.0	0.0	0.86	0.43	1.0	0.51	0.56	0.74	0.36	0.44	0.81	0.42	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.9
lcl\|BLLF01002401.1_cds_GFH23939.1_18416 (GFH23939)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.78	0.62	0.41	0.36	0.0	0.9	0.73	0.79	0.32	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.9	0.0	0.84	0.0	0.13	0.25	0.62
lcl\|BLLF01002496.1_cds_GFH24300.1_18777 (GFH24300)	0.34	0.0	1.0	0.18	0.18	0.61	0.31	0.55	0.43	0.73	0.29	0.49	0.34	0.42	0.61	0.3	0.35	0.41	0.13	0.0	0.0	0.16	0.29	0.4	0.4
lcl\|BLLF01002536.1_cds_GFH24437.1_18914 (GFH24437)	0.0	0.0	0.81	0.08	0.04	0.0	0.0	0.09	0.12	0.1	0.08	0.19	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.21	0.0
lcl\|BLLF01002585.1_cds_GFH24616.1_19093 (GFH24616)	0.0	0.0	0.15	0.57	0.56	0.16	0.58	0.45	1.0	0.1	0.1	0.33	0.26	0.15	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.73	0.19	0.25	0.37
lcl\|BLLF01002615.1_cds_GFH24721.1_19198 (GFH24721)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
lcl\|BLLF01002708.1_cds_GFH25071.1_19548 (GFH25071)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002870.1_cds_GFH25632.1_20109 (GFH25632)	0.0	0.0	0.0	0.4	0.71	0.42	0.29	0.39	0.0	0.45	0.3	0.23	0.35	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	1.0	0.67
lcl\|BLLF01003439.1_cds_GFH27344.1_21821 (GFH27344)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.93	0.96	0.0	1.0	0.49	0.53	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.0	0.84
lcl\|BLLF01003803.1_cds_GFH28253.1_22730 (GFH28253)	0.0	0.0	0.0	0.4	0.13	0.49	0.58	0.32	0.0	0.34	0.27	0.28	0.81	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.42	0.48
lcl\|BLLF01003884.1_cds_GFH28451.1_22928 (GFH28451)	0.0	0.0	0.0	0.43	0.32	0.66	0.61	0.31	0.0	1.0	0.32	0.23	0.32	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.88	0.36
lcl\|BLLF01003904.1_cds_GFH28500.1_22977 (GFH28500)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.2	0.19	0.0	0.0	0.4	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	1.0	0.0
lcl\|BLLF01004258.1_cds_GFH29248.1_23725 (GFH29248)	0.0	0.0	0.0	0.54	0.36	0.48	0.45	0.35	0.0	1.0	0.48	0.19	0.36	0.7	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.89	0.0
lcl\|BLLF01004304.1_cds_GFH29351.1_23828 (GFH29351)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004624.1_cds_GFH29970.1_24447 (GFH29970)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.93	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.0	0.0
lcl\|BLLF01005016.1_cds_GFH30605.1_25082 (GFH30605)	0.0	0.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.28	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0
lcl\|BLLF01005323.1_cds_GFH31045.1_25522 (GFH31045)	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	1.0	0.28	0.15	0.0	0.84	0.41	0.7	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.13
lcl\|BLLF01005518.1_cds_GFH31301.1_25778 (GFH31301)	0.0	0.0	0.0	0.3	0.75	0.15	0.28	0.43	0.0	0.0	0.45	0.31	0.16	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.98	1.0
lcl\|BLLF01005580.1_cds_GFH31380.1_25857 (GFH31380)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01006116.1_cds_GFH31962.1_26439 (GFH31962)	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	1.0	0.09	0.1	0.0	0.3	0.5	0.11	0.11	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0
lcl\|BLLF01006577.1_cds_GFH32377.1_26854 (GFH32377)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87
lcl\|BLLF01008174.1_cds_GFH33277.1_27754 (GFH33277)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.48	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.45	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01009648.1_cds_GFH33785.1_28262 (GFH33785)	0.0	0.0	0.13	0.18	0.4	0.56	0.08	0.38	0.0	0.15	0.18	0.41	0.27	0.17	0.4	0.6	0.32	0.0	0.27	0.0	1.0	0.63	0.16	0.8	0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)