Heatmap: Cluster_96 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000007.1_cds_GFH05735.1_212 (GFH05735)	0.88	0.32	0.72	0.14	0.08	0.09	0.15	0.1	0.07	0.6	0.14	0.07	0.07	0.12	0.11	1.0	0.74	0.31	0.47	0.75	0.5	0.06	0.34	0.15	0.33	0.24
lcl\|BLLF01000009.1_cds_GFH05797.1_274 (GFH05797)	1.0	0.03	0.29	0.0	0.01	0.03	0.07	0.01	0.13	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.09	0.02	0.06	0.04	0.04	0.09	0.07	0.04	0.0	0.01	0.15	0.13
lcl\|BLLF01000015.1_cds_GFH05955.1_432 (GFH05955)	1.0	0.0	0.81	0.42	0.13	0.06	0.59	0.04	0.56	0.28	0.11	0.05	0.03	0.15	0.46	0.2	0.07	0.23	0.34	0.39	0.21	0.61	0.23	0.21	0.28	0.11
lcl\|BLLF01000054.1_cds_GFH06755.1_1232 (GFH06755)	1.0	0.25	0.42	0.14	0.16	0.12	0.1	0.08	0.13	0.72	0.12	0.06	0.12	0.06	0.14	0.82	0.46	0.53	0.37	0.5	0.55	0.35	0.36	0.17	0.17	0.15
lcl\|BLLF01000067.1_cds_GFH06994.1_1471 (GFH06994)	1.0	0.39	0.97	0.02	0.06	0.04	0.08	0.06	0.08	0.63	0.07	0.06	0.06	0.06	0.11	0.86	0.33	0.34	0.43	0.32	0.48	0.3	0.45	0.09	0.08	0.05
lcl\|BLLF01000085.1_cds_GFH07280.1_1757 (GFH07280)	1.0	0.0	0.33	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.23	0.0
lcl\|BLLF01000126.1_cds_GFH07931.1_2408 (GFH07931)	1.0	0.12	0.45	0.45	0.08	0.08	0.07	0.04	0.1	0.08	0.06	0.05	0.07	0.04	0.07	0.04	0.05	0.11	0.05	0.07	0.18	0.04	0.11	0.08	0.08	0.07
lcl\|BLLF01000172.1_cds_GFH08614.1_3091 (GFH08614)	0.78	0.28	1.0	0.05	0.06	0.05	0.09	0.07	0.08	0.75	0.08	0.04	0.07	0.07	0.08	0.33	0.23	0.38	0.13	0.06	0.28	0.12	0.29	0.08	0.05	0.03
lcl\|BLLF01000198.1_cds_GFH08965.1_3442 (GFH08965)	1.0	0.15	0.71	0.43	0.46	0.38	0.38	0.21	0.63	0.09	0.3	0.43	0.24	0.17	0.39	0.26	0.21	0.45	0.14	0.0	0.31	0.09	0.18	0.16	0.27	0.34
lcl\|BLLF01000280.1_cds_GFH10003.1_4480 (GFH10003)	0.7	0.16	1.0	0.0	0.3	0.28	0.45	0.22	0.42	0.42	0.32	0.24	0.2	0.13	0.4	0.0	0.11	0.15	0.0	0.08	0.07	0.11	0.14	0.18	0.42	0.28
lcl\|BLLF01000306.1_cds_GFH10310.1_4787 (GFH10310)	1.0	0.0	0.66	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.14	0.0	0.0	0.16	0.0	0.08	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000352.1_cds_GFH10842.1_5319 (GFH10842)	1.0	0.08	0.6	0.19	0.09	0.09	0.1	0.07	0.11	0.4	0.1	0.09	0.12	0.1	0.17	0.29	0.39	0.23	0.13	0.12	0.25	0.13	0.14	0.06	0.18	0.17
lcl\|BLLF01000376.1_cds_GFH11127.1_5604 (GFH11127)	0.57	0.0	0.58	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.07	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.04	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000529.1_cds_GFH12684.1_7161 (GFH12684)	0.69	0.22	1.0	0.16	0.35	0.11	0.1	0.11	0.19	0.28	0.18	0.1	0.08	0.11	0.13	0.3	0.49	0.23	0.27	0.33	0.57	0.21	0.26	0.01	0.25	0.24
lcl\|BLLF01000594.1_cds_GFH13282.1_7759 (GFH13282)	0.78	0.67	1.0	0.82	0.41	0.46	0.4	0.42	0.34	0.39	0.35	0.34	0.26	0.29	0.36	0.49	0.4	0.7	0.6	0.48	0.62	0.57	0.59	0.55	0.65	0.47
lcl\|BLLF01000642.1_cds_GFH13707.1_8184 (GFH13707)	0.7	0.16	1.0	0.02	0.01	0.05	0.07	0.02	0.08	0.2	0.04	0.01	0.12	0.01	0.1	0.4	0.16	0.07	0.0	0.09	0.26	0.31	0.33	0.06	0.15	0.13
lcl\|BLLF01000655.1_cds_GFH13813.1_8290 (GFH13813)	0.45	0.0	0.47	1.0	0.01	0.03	0.23	0.02	0.27	0.0	0.02	0.04	0.04	0.02	0.21	0.0	0.0	0.14	0.41	0.0	0.0	0.11	0.0	0.02	0.05	0.03
lcl\|BLLF01000731.1_cds_GFH14477.1_8954 (GFH14477)	1.0	0.03	0.38	0.05	0.04	0.06	0.07	0.05	0.09	0.3	0.05	0.03	0.05	0.05	0.12	0.07	0.03	0.04	0.08	0.05	0.05	0.0	0.02	0.02	0.11	0.04
lcl\|BLLF01000745.1_cds_GFH14586.1_9063 (GFH14586)	1.0	0.0	0.87	0.51	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.08	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.02	0.03	0.1	0.22	0.0	0.05	0.02	0.0	0.03	0.03
lcl\|BLLF01000777.1_cds_GFH14874.1_9351 (GFH14874)	0.46	0.16	0.9	1.0	0.01	0.02	0.28	0.01	0.34	0.04	0.0	0.01	0.01	0.01	0.4	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.07	0.0	0.01	0.06	0.08
lcl\|BLLF01000820.1_cds_GFH15206.1_9683 (GFH15206)	0.99	0.01	1.0	0.18	0.03	0.08	0.32	0.04	0.3	0.0	0.09	0.08	0.12	0.06	0.37	0.13	0.05	0.13	0.19	0.04	0.25	0.33	0.15	0.06	0.17	0.1
lcl\|BLLF01000875.1_cds_GFH15619.1_10096 (GFH15619)	0.49	0.04	0.31	1.0	0.0	0.01	0.04	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.09	0.01	0.02	0.0	0.1	0.01	0.01	0.08	0.01	0.0	0.06	0.06
lcl\|BLLF01001003.1_cds_GFH16479.1_10956 (GFH16479)	0.8	0.05	0.91	1.0	0.01	0.02	0.05	0.0	0.09	0.11	0.02	0.01	0.02	0.01	0.15	0.52	0.53	0.62	0.28	0.21	0.47	0.28	0.51	0.35	0.1	0.08
lcl\|BLLF01001024.1_cds_GFH16619.1_11096 (GFH16619)	0.7	0.46	1.0	0.05	0.03	0.03	0.03	0.03	0.07	0.53	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.21	0.14	0.14	0.11	0.13	0.24	0.14	0.2	0.02	0.07	0.07
lcl\|BLLF01001039.1_cds_GFH16701.1_11178 (GFH16701)	1.0	0.04	0.36	0.22	0.01	0.02	0.13	0.01	0.09	0.07	0.02	0.02	0.03	0.01	0.1	0.08	0.12	0.06	0.07	0.01	0.12	0.05	0.09	0.03	0.03	0.06
lcl\|BLLF01001145.1_cds_GFH17420.1_11897 (GFH17420)	0.31	0.08	1.0	0.59	0.01	0.05	0.19	0.02	0.16	0.04	0.02	0.07	0.01	0.01	0.18	0.06	0.05	0.15	0.22	0.08	0.0	0.0	0.05	0.0	0.26	0.18
lcl\|BLLF01001146.1_cds_GFH17425.1_11902 (GFH17425)	0.76	0.38	1.0	0.2	0.32	0.3	0.26	0.26	0.23	0.27	0.27	0.18	0.2	0.2	0.19	0.24	0.37	0.24	0.09	0.67	0.3	0.3	0.2	0.11	0.11	0.17
lcl\|BLLF01001184.1_cds_GFH17667.1_12144 (GFH17667)	0.54	0.33	1.0	0.0	0.02	0.14	0.2	0.16	0.09	0.76	0.17	0.16	0.11	0.24	0.09	0.18	0.13	0.28	0.21	0.12	0.38	0.66	0.0	0.05	0.0	0.03
lcl\|BLLF01001186.1_cds_GFH17692.1_12169 (GFH17692)	0.73	0.09	1.0	0.06	0.01	0.03	0.04	0.0	0.04	0.41	0.03	0.0	0.04	0.02	0.06	0.18	0.15	0.0	0.12	0.24	0.0	0.1	0.14	0.02	0.03	0.02
lcl\|BLLF01001209.1_cds_GFH17838.1_12315 (GFH17838)	0.57	0.0	1.0	0.28	0.02	0.04	0.15	0.0	0.27	0.15	0.03	0.08	0.04	0.0	0.25	0.11	0.08	0.33	0.13	0.21	0.23	0.0	0.08	0.09	0.38	0.16
lcl\|BLLF01001307.1_cds_GFH18482.1_12959 (GFH18482)	1.0	0.01	0.87	0.65	0.01	0.0	0.12	0.0	0.15	0.04	0.01	0.01	0.01	0.0	0.17	0.0	0.0	0.2	0.03	0.02	0.09	0.0	0.2	0.05	0.15	0.09
lcl\|BLLF01001418.1_cds_GFH19172.1_13649 (GFH19172)	1.0	0.0	0.67	0.18	0.03	0.02	0.11	0.04	0.23	0.17	0.02	0.03	0.04	0.06	0.21	0.0	0.0	0.14	0.65	0.73	0.26	0.23	0.05	0.0	0.28	0.19
lcl\|BLLF01001418.1_cds_GFH19173.1_13650 (GFH19173)	1.0	0.0	0.67	0.18	0.03	0.02	0.11	0.04	0.23	0.17	0.02	0.03	0.04	0.06	0.21	0.0	0.0	0.14	0.65	0.73	0.26	0.23	0.05	0.0	0.28	0.19
lcl\|BLLF01001491.1_cds_GFH19619.1_14096 (GFH19619)	0.72	0.21	1.0	0.19	0.32	0.19	0.3	0.17	0.26	0.71	0.3	0.19	0.14	0.16	0.26	0.15	0.26	0.64	0.23	0.15	0.55	0.27	0.38	0.12	0.32	0.24
lcl\|BLLF01001513.1_cds_GFH19736.1_14213 (GFH19736)	1.0	0.04	0.2	0.07	0.0	0.01	0.09	0.0	0.1	0.04	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.03	0.08	0.23	0.12	0.04	0.02	0.05	0.04	0.09	0.06
lcl\|BLLF01001601.1_cds_GFH20245.1_14722 (GFH20245)	0.81	0.02	0.78	1.0	0.01	0.0	0.06	0.01	0.11	0.0	0.02	0.02	0.04	0.02	0.11	0.09	0.13	0.14	0.11	0.12	0.1	0.0	0.14	0.05	0.05	0.05
lcl\|BLLF01001618.1_cds_GFH20347.1_14824 (GFH20347)	0.72	0.38	1.0	0.09	0.33	0.34	0.33	0.29	0.36	0.82	0.38	0.26	0.2	0.25	0.32	0.31	0.19	0.16	0.0	0.49	0.17	0.06	0.32	0.2	0.4	0.33
lcl\|BLLF01001713.1_cds_GFH20869.1_15346 (GFH20869)	0.43	0.0	0.4	1.0	0.0	0.0	0.11	0.01	0.28	0.13	0.01	0.01	0.02	0.0	0.34	0.05	0.02	0.09	0.21	0.1	0.02	0.1	0.03	0.01	0.16	0.05
lcl\|BLLF01002086.1_cds_GFH22640.1_17117 (GFH22640)	0.86	0.21	1.0	0.13	0.11	0.16	0.14	0.15	0.16	0.32	0.07	0.05	0.07	0.14	0.11	0.58	0.55	0.15	0.51	0.0	0.0	0.31	0.11	0.19	0.16	0.23
lcl\|BLLF01002138.1_cds_GFH22851.1_17328 (GFH22851)	0.71	0.07	1.0	0.26	0.02	0.02	0.07	0.0	0.41	0.03	0.01	0.01	0.02	0.0	0.16	0.0	0.0	0.04	0.36	0.07	0.0	0.18	0.0	0.0	0.08	0.02
lcl\|BLLF01002187.1_cds_GFH23076.1_17553 (GFH23076)	1.0	0.0	0.18	0.1	0.03	0.08	0.11	0.02	0.11	0.02	0.05	0.05	0.08	0.03	0.15	0.0	0.0	0.06	0.2	0.07	0.08	0.27	0.07	0.01	0.18	0.14
lcl\|BLLF01002218.1_cds_GFH23213.1_17690 (GFH23213)	0.94	0.2	0.8	0.08	0.18	0.22	0.17	0.23	0.21	0.38	0.22	0.22	0.24	0.19	0.2	0.14	0.2	0.76	0.53	0.46	1.0	0.54	0.49	0.43	0.28	0.3
lcl\|BLLF01002343.1_cds_GFH23720.1_18197 (GFH23720)	0.8	0.05	0.33	0.04	0.07	0.05	0.09	0.06	0.07	1.0	0.06	0.07	0.07	0.08	0.08	0.34	0.19	0.45	0.1	0.12	0.45	0.26	0.37	0.11	0.04	0.01
lcl\|BLLF01002367.1_cds_GFH23807.1_18284 (GFH23807)	0.96	0.21	0.61	0.06	0.09	0.08	0.14	0.05	0.12	1.0	0.09	0.06	0.08	0.07	0.17	0.6	0.48	0.41	0.19	0.18	0.4	0.23	0.4	0.1	0.12	0.09
lcl\|BLLF01002582.1_cds_GFH24607.1_19084 (GFH24607)	0.51	0.27	1.0	0.67	0.2	0.16	0.29	0.11	0.23	0.38	0.17	0.19	0.2	0.15	0.19	0.35	0.57	0.13	0.18	0.13	0.1	0.13	0.13	0.25	0.11	0.15
lcl\|BLLF01002618.1_cds_GFH24731.1_19208 (GFH24731)	1.0	0.17	0.67	0.25	0.0	0.01	0.12	0.03	0.12	0.66	0.0	0.0	0.0	0.03	0.06	0.37	0.08	0.76	0.13	0.1	0.0	0.0	0.52	0.02	0.14	0.09
lcl\|BLLF01002704.1_cds_GFH25060.1_19537 (GFH25060)	1.0	0.26	0.65	0.22	0.17	0.2	0.12	0.24	0.18	0.33	0.19	0.18	0.16	0.18	0.15	0.09	0.17	0.27	0.2	0.33	0.21	0.2	0.24	0.1	0.21	0.19
lcl\|BLLF01002830.1_cds_GFH25492.1_19969 (GFH25492)	1.0	0.11	0.43	0.67	0.03	0.09	0.21	0.06	0.3	0.27	0.07	0.1	0.11	0.07	0.14	0.06	0.19	0.82	0.54	0.11	0.5	0.35	0.79	0.11	0.41	0.31
lcl\|BLLF01002873.1_cds_GFH25642.1_20119 (GFH25642)	0.99	0.06	1.0	0.4	0.19	0.21	0.35	0.31	0.61	0.11	0.22	0.25	0.31	0.15	0.42	0.15	0.11	0.0	0.24	0.1	0.0	0.31	0.19	0.15	0.72	0.41
lcl\|BLLF01002890.1_cds_GFH25687.1_20164 (GFH25687)	1.0	0.06	0.85	0.01	0.05	0.03	0.06	0.02	0.06	0.19	0.04	0.01	0.02	0.05	0.07	0.83	0.6	0.25	0.13	0.16	0.29	0.24	0.31	0.1	0.08	0.05
lcl\|BLLF01003027.1_cds_GFH26117.1_20594 (GFH26117)	1.0	0.28	0.69	0.13	0.05	0.08	0.1	0.05	0.07	0.55	0.08	0.06	0.06	0.06	0.11	0.8	0.78	0.28	0.19	0.22	0.38	0.24	0.37	0.23	0.12	0.1
lcl\|BLLF01003166.1_cds_GFH26555.1_21032 (GFH26555)	0.98	0.09	1.0	0.25	0.19	0.17	0.18	0.11	0.3	0.49	0.12	0.09	0.24	0.13	0.22	0.43	0.13	0.31	0.32	0.21	0.07	0.15	0.16	0.05	0.26	0.07
lcl\|BLLF01003173.1_cds_GFH26588.1_21065 (GFH26588)	1.0	0.13	0.35	0.18	0.0	0.0	0.06	0.01	0.13	0.14	0.0	0.0	0.0	0.01	0.14	0.0	0.0	0.0	0.41	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
lcl\|BLLF01003225.1_cds_GFH26742.1_21219 (GFH26742)	1.0	0.17	0.55	0.03	0.15	0.18	0.11	0.08	0.15	0.18	0.16	0.11	0.14	0.11	0.1	0.47	0.16	0.49	0.66	0.51	0.49	0.24	0.31	0.13	0.05	0.08
lcl\|BLLF01003485.1_cds_GFH27466.1_21943 (GFH27466)	1.0	0.03	0.34	0.0	0.02	0.04	0.16	0.04	0.09	0.46	0.06	0.05	0.08	0.04	0.06	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003579.1_cds_GFH27695.1_22172 (GFH27695)	1.0	0.12	0.54	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.08	0.57	0.02	0.04	0.01	0.03	0.06	0.31	0.06	0.21	0.24	0.11	0.16	0.0	0.15	0.02	0.02	0.08
lcl\|BLLF01003814.1_cds_GFH28277.1_22754 (GFH28277)	0.84	0.01	1.0	0.85	0.0	0.0	0.1	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.12	0.03	0.01	0.08	0.2	0.06	0.11	0.03	0.15	0.01	0.14	0.1
lcl\|BLLF01004063.1_cds_GFH28841.1_23318 (GFH28841)	1.0	0.0	0.32	0.1	0.01	0.01	0.03	0.0	0.05	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.07	0.02	0.03	0.02	0.05	0.08	0.02	0.05	0.07	0.01	0.01	0.02
lcl\|BLLF01004453.1_cds_GFH29640.1_24117 (GFH29640)	1.0	0.23	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.0	0.0	0.01	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004453.1_cds_GFH29641.1_24118 (GFH29641)	0.6	0.15	1.0	0.53	0.1	0.07	0.08	0.08	0.11	0.04	0.06	0.02	0.03	0.03	0.14	0.35	0.58	0.44	0.33	0.25	0.3	0.24	0.24	0.23	0.11	0.1
lcl\|BLLF01004651.1_cds_GFH30013.1_24490 (GFH30013)	1.0	0.33	0.68	0.47	0.06	0.13	0.14	0.13	0.09	0.46	0.21	0.08	0.08	0.17	0.12	0.43	0.44	0.8	0.22	0.27	0.57	0.51	0.84	0.31	0.39	0.43
lcl\|BLLF01004847.1_cds_GFH30351.1_24828 (GFH30351)	1.0	0.1	0.54	0.08	0.09	0.09	0.08	0.08	0.11	0.53	0.1	0.05	0.09	0.09	0.09	0.68	0.32	0.44	0.2	0.2	0.33	0.3	0.35	0.13	0.1	0.08
lcl\|BLLF01006754.1_cds_GFH32528.1_27005 (GFH32528)	1.0	0.0	0.65	0.2	0.04	0.11	0.09	0.06	0.13	0.3	0.08	0.08	0.07	0.1	0.13	0.35	0.31	0.72	0.13	0.31	0.66	0.1	0.68	0.22	0.16	0.11
lcl\|BLLF01006855.1_cds_GFH32599.1_27076 (GFH32599)	1.0	0.15	0.49	0.05	0.15	0.09	0.07	0.1	0.09	0.56	0.12	0.08	0.11	0.08	0.12	0.25	0.25	0.3	0.14	0.23	0.27	0.17	0.29	0.16	0.23	0.14
lcl\|BLLF01007631.1_cds_GFH33037.1_27514 (GFH33037)	1.0	0.5	0.95	0.03	0.1	0.1	0.14	0.06	0.16	0.48	0.09	0.08	0.09	0.06	0.14	0.25	0.36	0.8	0.1	0.32	0.59	0.34	0.68	0.2	0.12	0.16
lcl\|BLLF01008043.1_cds_GFH33234.1_27711 (GFH33234)	0.96	0.14	1.0	0.05	0.01	0.0	0.14	0.07	0.21	0.96	0.18	0.02	0.16	0.1	0.2	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)