Heatmap: Cluster_159 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000009.1_cds_GFH05794.1_271 (GFH05794)	0.7	0.07	0.26	0.26	0.46	0.26	0.28	0.24	0.31	0.27	0.46	0.34	0.25	0.26	0.33	1.0	0.84	0.16	0.69	0.65	0.1	0.47	0.14	0.23	0.3	0.22
lcl\|BLLF01000009.1_cds_GFH05795.1_272 (GFH05795)	0.71	0.13	0.26	0.14	0.37	0.21	0.23	0.21	0.25	0.16	0.4	0.3	0.2	0.21	0.24	1.0	0.76	0.08	0.39	0.52	0.05	0.38	0.12	0.31	0.32	0.19
lcl\|BLLF01000011.1_cds_GFH05862.1_339 (GFH05862)	0.66	0.08	0.04	0.05	0.6	0.3	0.17	0.06	0.09	0.5	0.28	0.32	0.09	0.03	0.1	0.14	0.34	0.03	0.07	0.65	0.05	1.0	0.06	0.23	0.22	0.15
lcl\|BLLF01000013.1_cds_GFH05900.1_377 (GFH05900)	0.78	0.29	0.15	0.19	0.4	0.31	0.28	0.2	0.25	0.56	0.35	0.3	0.26	0.31	0.34	0.6	0.42	0.55	0.47	0.48	0.59	1.0	0.38	0.08	0.21	0.16
lcl\|BLLF01000035.1_cds_GFH06358.1_835 (GFH06358)	0.98	0.36	0.33	0.48	0.42	0.4	0.37	0.3	0.51	0.45	0.45	0.42	0.39	0.29	0.51	0.93	0.77	0.63	0.63	0.77	0.47	1.0	0.45	0.23	0.36	0.25
lcl\|BLLF01000041.1_cds_GFH06495.1_972 (GFH06495)	0.58	0.07	0.01	0.1	0.19	0.35	0.38	0.15	0.44	0.45	0.23	0.28	0.38	0.23	0.35	1.0	0.46	0.57	0.25	0.55	0.5	0.74	0.53	0.16	0.37	0.37
lcl\|BLLF01000090.1_cds_GFH07370.1_1847 (GFH07370)	0.8	0.0	0.0	0.0	0.56	0.31	0.16	0.11	0.23	1.0	0.37	0.19	0.0	0.09	0.18	0.54	0.52	0.34	0.0	0.72	0.23	0.94	0.08	0.17	0.39	0.18
lcl\|BLLF01000165.1_cds_GFH08507.1_2984 (GFH08507)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.4	0.36	0.32	0.43	0.72	0.44	0.37	0.32	0.31	0.33	0.58	0.89	0.7	0.56	0.7	0.67	0.75	0.68	0.43	0.44	0.39
lcl\|BLLF01000182.1_cds_GFH08744.1_3221 (GFH08744)	0.73	0.21	0.17	0.34	0.59	0.61	0.39	0.28	0.35	0.29	0.49	0.38	0.37	0.29	0.26	1.0	0.88	0.65	0.45	0.47	0.75	0.35	0.43	0.5	0.41	0.47
lcl\|BLLF01000229.1_cds_GFH09373.1_3850 (GFH09373)	0.82	0.0	0.0	0.03	0.44	0.22	0.18	0.17	0.12	0.15	0.37	0.28	0.17	0.17	0.12	1.0	0.62	0.5	0.38	0.61	0.43	0.71	0.29	0.06	0.28	0.22
lcl\|BLLF01000247.1_cds_GFH09605.1_4082 (GFH09605)	0.69	0.15	0.21	0.23	0.33	0.33	0.35	0.19	0.3	0.29	0.37	0.29	0.26	0.27	0.22	1.0	0.8	0.58	0.56	0.5	0.48	0.84	0.42	0.3	0.25	0.21
lcl\|BLLF01000247.1_cds_GFH09606.1_4083 (GFH09606)	0.7	0.16	0.19	0.32	0.43	0.44	0.44	0.31	0.46	0.59	0.56	0.41	0.38	0.42	0.33	0.89	0.91	0.82	0.62	0.63	0.68	1.0	0.51	0.19	0.41	0.4
lcl\|BLLF01000253.1_cds_GFH09672.1_4149 (GFH09672)	1.0	0.2	0.1	0.32	0.41	0.23	0.22	0.18	0.31	0.23	0.31	0.2	0.23	0.19	0.34	0.29	0.26	0.29	0.34	0.27	0.26	0.3	0.22	0.07	0.26	0.18
lcl\|BLLF01000268.1_cds_GFH09840.1_4317 (GFH09840)	0.73	0.17	0.04	0.25	0.31	0.22	0.18	0.18	0.25	0.26	0.31	0.29	0.2	0.2	0.19	0.23	0.25	0.35	0.12	0.39	0.33	1.0	0.21	0.13	0.3	0.23
lcl\|BLLF01000354.1_cds_GFH10864.1_5341 (GFH10864)	1.0	0.08	0.18	0.06	0.47	0.27	0.18	0.23	0.16	0.18	0.46	0.24	0.19	0.25	0.17	0.35	0.38	0.42	0.32	0.24	0.31	0.25	0.31	0.04	0.29	0.18
lcl\|BLLF01000370.1_cds_GFH11054.1_5531 (GFH11054)	0.35	0.45	0.2	0.13	0.15	0.32	0.35	0.35	0.29	0.43	0.15	0.34	0.43	0.37	0.31	1.0	0.41	0.42	0.58	0.29	0.63	0.73	0.55	0.35	0.19	0.24
lcl\|BLLF01000478.1_cds_GFH12207.1_6684 (GFH12207)	0.43	0.05	0.0	0.2	0.01	0.0	0.04	0.01	0.01	0.04	0.0	0.01	0.04	0.04	0.0	1.0	0.6	0.17	0.02	0.08	0.34	0.51	0.0	0.04	0.02	0.0
lcl\|BLLF01000493.1_cds_GFH12347.1_6824 (GFH12347)	0.26	0.02	0.0	0.18	0.02	0.02	0.07	0.03	0.07	0.08	0.01	0.01	0.04	0.01	0.07	1.0	0.49	0.0	0.0	0.07	0.29	0.27	0.0	0.07	0.06	0.08
lcl\|BLLF01000549.1_cds_GFH12875.1_7352 (GFH12875)	1.0	0.17	0.29	0.08	0.43	0.35	0.34	0.31	0.35	0.39	0.46	0.38	0.39	0.39	0.31	0.39	0.47	0.47	0.59	0.53	0.41	0.55	0.36	0.21	0.33	0.24
lcl\|BLLF01000583.1_cds_GFH13169.1_7646 (GFH13169)	0.85	0.66	0.17	0.09	0.5	0.53	0.32	0.36	0.24	0.28	0.41	0.34	0.33	0.35	0.21	1.0	0.97	0.49	0.34	0.71	0.55	0.72	0.29	0.29	0.45	0.42
lcl\|BLLF01000592.1_cds_GFH13267.1_7744 (GFH13267)	0.75	0.06	0.01	0.26	0.37	0.34	0.23	0.17	0.2	0.19	0.3	0.24	0.16	0.17	0.14	1.0	0.85	0.42	0.26	0.23	0.41	0.33	0.32	0.28	0.26	0.25
lcl\|BLLF01000703.1_cds_GFH14235.1_8712 (GFH14235)	0.8	0.27	0.0	0.19	0.16	0.22	0.28	0.1	0.37	0.31	0.17	0.15	0.2	0.1	0.35	1.0	0.51	0.46	0.66	0.71	0.3	0.79	0.46	0.22	0.36	0.31
lcl\|BLLF01000866.1_cds_GFH15550.1_10027 (GFH15550)	0.8	0.14	0.0	0.07	0.33	0.25	0.28	0.1	0.21	0.26	0.3	0.25	0.17	0.09	0.21	0.31	0.33	0.19	0.23	0.5	0.18	1.0	0.16	0.32	0.68	0.32
lcl\|BLLF01001125.1_cds_GFH17293.1_11770 (GFH17293)	0.63	0.08	0.01	0.08	0.3	0.41	0.39	0.04	0.21	0.19	0.23	0.28	0.27	0.15	0.19	1.0	0.7	0.46	0.31	0.31	0.36	0.37	0.64	0.33	0.2	0.3
lcl\|BLLF01001309.1_cds_GFH18498.1_12975 (GFH18498)	0.72	0.25	0.26	0.17	0.48	0.4	0.37	0.28	0.28	0.41	0.42	0.28	0.28	0.25	0.3	1.0	0.87	0.65	0.58	0.49	0.56	0.62	0.56	0.37	0.55	0.46
lcl\|BLLF01001325.1_cds_GFH18599.1_13076 (GFH18599)	0.65	0.0	0.06	0.09	0.38	0.22	0.17	0.22	0.16	0.53	0.32	0.23	0.16	0.18	0.13	1.0	0.81	0.37	0.29	0.41	0.24	0.69	0.34	0.31	0.45	0.39
lcl\|BLLF01001374.1_cds_GFH18885.1_13362 (GFH18885)	0.84	0.28	0.19	0.48	0.14	0.42	0.25	0.26	0.2	0.5	0.22	0.48	0.35	0.51	0.42	0.88	0.71	0.67	0.51	0.46	0.53	1.0	0.83	0.32	0.33	0.35
lcl\|BLLF01001374.1_cds_GFH18887.1_13364 (GFH18887)	0.33	0.29	0.04	0.26	0.11	0.25	0.27	0.23	0.16	0.19	0.18	0.34	0.25	0.39	0.29	1.0	0.48	0.37	0.25	0.24	0.22	0.51	0.56	0.24	0.19	0.15
lcl\|BLLF01001382.1_cds_GFH18936.1_13413 (GFH18936)	0.6	0.15	0.02	0.18	0.16	0.23	0.28	0.08	0.24	0.33	0.17	0.24	0.19	0.1	0.27	1.0	0.53	0.17	0.17	0.45	0.19	0.53	0.25	0.31	0.44	0.39
lcl\|BLLF01001401.1_cds_GFH19072.1_13549 (GFH19072)	0.98	0.25	0.11	0.09	0.54	0.57	0.55	0.59	0.45	0.46	0.57	0.45	0.48	0.47	0.47	0.89	0.47	0.7	0.57	0.72	0.8	1.0	0.6	0.16	0.18	0.21
lcl\|BLLF01001469.1_cds_GFH19477.1_13954 (GFH19477)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.29	0.23	0.23	0.22	0.28	0.3	0.25	0.29	0.28	0.21	0.62	0.69	0.8	0.57	0.61	0.69	0.42	0.41	0.09	0.11	0.16
lcl\|BLLF01001590.1_cds_GFH20182.1_14659 (GFH20182)	0.95	0.04	0.03	0.04	0.43	0.37	0.29	0.31	0.24	0.2	0.4	0.32	0.25	0.28	0.21	1.0	0.92	0.43	0.4	0.36	0.42	0.72	0.41	0.15	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001640.1_cds_GFH20464.1_14941 (GFH20464)	1.0	0.13	0.26	0.05	0.44	0.27	0.25	0.17	0.27	0.53	0.24	0.36	0.3	0.09	0.27	0.27	0.56	0.05	0.21	0.45	0.08	0.9	0.11	0.34	0.77	0.3
lcl\|BLLF01001640.1_cds_GFH20465.1_14942 (GFH20465)	1.0	0.1	0.3	0.04	0.41	0.24	0.22	0.15	0.26	0.85	0.21	0.32	0.35	0.13	0.33	0.5	0.6	0.07	0.2	0.58	0.11	0.92	0.12	0.18	0.8	0.29
lcl\|BLLF01001650.1_cds_GFH20511.1_14988 (GFH20511)	0.42	0.16	0.0	0.24	0.08	0.09	0.17	0.08	0.09	0.09	0.1	0.14	0.11	0.15	0.03	1.0	0.51	0.39	0.19	0.11	0.36	0.61	0.32	0.11	0.05	0.1
lcl\|BLLF01001662.1_cds_GFH20594.1_15071 (GFH20594)	0.26	0.0	0.0	0.0	0.03	0.07	0.17	0.16	0.07	0.3	0.11	0.17	0.31	0.2	0.23	1.0	0.38	0.32	0.02	0.13	0.87	0.64	0.31	0.22	0.11	0.24
lcl\|BLLF01001736.1_cds_GFH20972.1_15449 (GFH20972)	0.8	0.16	0.06	0.12	0.3	0.29	0.35	0.22	0.29	0.28	0.17	0.27	0.27	0.17	0.26	1.0	0.97	0.14	0.32	0.18	0.18	0.74	0.22	0.47	0.58	0.21
lcl\|BLLF01001889.1_cds_GFH21717.1_16194 (GFH21717)	0.93	0.24	0.09	0.21	0.37	0.46	0.35	0.2	0.29	0.35	0.44	0.47	0.46	0.27	0.41	0.38	0.48	0.35	0.26	0.54	0.36	1.0	0.48	0.28	0.41	0.28
lcl\|BLLF01001930.1_cds_GFH21914.1_16391 (GFH21914)	0.39	0.47	0.3	0.17	0.2	0.4	0.35	0.27	0.32	0.29	0.12	0.33	0.38	0.28	0.3	0.95	0.54	0.14	0.43	0.3	0.22	1.0	0.43	0.41	0.27	0.19
lcl\|BLLF01002112.1_cds_GFH22735.1_17212 (GFH22735)	1.0	0.54	0.25	0.54	0.4	0.44	0.44	0.34	0.38	0.48	0.43	0.43	0.28	0.31	0.27	0.99	0.75	0.74	0.65	0.95	0.56	0.98	0.88	0.35	0.31	0.27
lcl\|BLLF01002124.1_cds_GFH22794.1_17271 (GFH22794)	1.0	0.07	0.03	0.25	0.42	0.32	0.29	0.23	0.3	0.35	0.35	0.25	0.25	0.23	0.25	0.53	0.61	0.31	0.39	0.75	0.41	0.37	0.32	0.11	0.24	0.2
lcl\|BLLF01002337.1_cds_GFH23693.1_18170 (GFH23693)	1.0	0.1	0.1	0.09	0.34	0.26	0.26	0.26	0.26	0.47	0.27	0.28	0.28	0.22	0.3	0.59	0.52	0.48	0.3	0.52	0.5	0.95	0.65	0.5	0.63	0.27
lcl\|BLLF01002451.1_cds_GFH24129.1_18606 (GFH24129)	0.7	0.08	0.0	0.15	0.29	0.33	0.38	0.19	0.35	0.55	0.35	0.3	0.35	0.32	0.31	0.76	0.62	1.0	0.42	0.31	0.69	0.54	0.61	0.4	0.4	0.46
lcl\|BLLF01002596.1_cds_GFH24659.1_19136 (GFH24659)	0.87	0.75	0.41	0.69	0.49	0.33	0.36	0.21	0.37	0.67	0.34	0.33	0.47	0.35	0.37	0.75	0.45	0.48	0.8	0.9	0.59	0.92	1.0	0.39	0.32	0.3
lcl\|BLLF01002653.1_cds_GFH24863.1_19340 (GFH24863)	0.31	0.31	0.05	0.11	0.15	0.17	0.21	0.06	0.12	0.13	0.16	0.22	0.22	0.12	0.21	1.0	0.65	0.16	0.16	0.27	0.24	0.54	0.23	0.18	0.28	0.08
lcl\|BLLF01002773.1_cds_GFH25290.1_19767 (GFH25290)	1.0	0.58	0.25	0.27	0.46	0.34	0.3	0.22	0.37	0.44	0.41	0.31	0.33	0.26	0.3	0.56	0.73	0.42	0.78	0.75	0.44	0.79	0.36	0.21	0.46	0.4
lcl\|BLLF01002825.1_cds_GFH25477.1_19954 (GFH25477)	0.8	0.0	0.0	0.06	0.4	0.29	0.29	0.16	0.34	0.45	0.31	0.25	0.23	0.16	0.31	1.0	0.85	0.45	0.48	0.49	0.42	0.61	0.35	0.29	0.34	0.24
lcl\|BLLF01002948.1_cds_GFH25895.1_20372 (GFH25895)	0.83	0.07	0.1	0.21	0.46	0.45	0.35	0.13	0.44	0.41	0.44	0.45	0.37	0.14	0.57	0.43	0.38	0.11	0.21	0.79	0.12	1.0	0.11	0.61	0.97	0.55
lcl\|BLLF01003257.1_cds_GFH26834.1_21311 (GFH26834)	0.61	0.0	0.0	0.49	0.18	0.27	0.2	0.13	0.09	0.18	0.16	0.11	0.08	0.09	0.17	1.0	0.62	0.59	0.49	0.44	0.45	0.62	0.45	0.12	0.09	0.12
lcl\|BLLF01003340.1_cds_GFH27075.1_21552 (GFH27075)	0.5	0.22	0.15	0.29	0.51	0.36	0.31	0.46	0.31	0.21	0.43	0.35	0.31	0.29	0.34	0.34	0.34	0.37	0.28	1.0	0.28	0.95	0.26	0.4	0.29	0.27
lcl\|BLLF01003415.1_cds_GFH27275.1_21752 (GFH27275)	1.0	0.0	0.02	0.09	0.42	0.31	0.22	0.23	0.25	0.15	0.39	0.34	0.3	0.22	0.27	0.2	0.34	0.18	0.42	0.34	0.21	0.14	0.16	0.06	0.28	0.21
lcl\|BLLF01003674.1_cds_GFH27926.1_22403 (GFH27926)	1.0	0.16	0.21	0.27	0.42	0.44	0.32	0.34	0.26	0.66	0.36	0.59	0.42	0.42	0.4	0.18	0.31	0.14	0.14	0.71	0.12	0.79	0.12	0.16	0.45	0.29
lcl\|BLLF01003852.1_cds_GFH28380.1_22857 (GFH28380)	1.0	0.11	0.0	0.09	0.32	0.13	0.23	0.2	0.19	0.55	0.23	0.07	0.07	0.08	0.12	0.28	0.11	0.45	0.08	0.18	0.35	0.16	0.12	0.03	0.37	0.16
lcl\|BLLF01004710.1_cds_GFH30111.1_24588 (GFH30111)	0.44	0.39	0.16	0.61	0.23	0.27	0.32	0.38	0.34	0.43	0.22	0.28	0.35	0.38	0.41	1.0	0.76	0.57	0.22	0.41	0.58	0.72	0.76	0.32	0.31	0.22
lcl\|BLLF01004886.1_cds_GFH30412.1_24889 (GFH30412)	0.37	0.11	0.07	0.13	0.14	0.18	0.16	0.14	0.07	0.17	0.03	0.27	0.23	0.06	0.38	1.0	0.75	0.03	0.09	0.35	0.05	0.74	0.13	0.28	0.36	0.14
lcl\|BLLF01005165.1_cds_GFH30824.1_25301 (GFH30824)	0.46	0.39	0.15	0.11	0.12	0.26	0.29	0.27	0.22	0.38	0.14	0.31	0.37	0.28	0.25	1.0	0.45	0.29	0.29	0.15	0.42	0.75	0.38	0.28	0.2	0.23
lcl\|BLLF01005208.1_cds_GFH30877.1_25354 (GFH30877)	1.0	0.17	0.0	0.26	0.41	0.31	0.21	0.25	0.2	0.33	0.42	0.23	0.2	0.26	0.2	0.69	0.93	0.31	0.54	0.46	0.48	0.31	0.45	0.13	0.31	0.26
lcl\|BLLF01006168.1_cds_GFH32026.1_26503 (GFH32026)	1.0	0.03	0.05	0.09	0.29	0.41	0.33	0.37	0.27	0.17	0.15	0.26	0.25	0.2	0.2	0.1	0.16	0.19	0.49	0.3	0.18	0.47	0.22	0.09	0.08	0.11
lcl\|BLLF01006588.1_cds_GFH32386.1_26863 (GFH32386)	0.44	0.65	0.0	0.04	0.36	0.44	0.27	0.16	0.2	0.49	0.4	0.33	0.35	0.26	0.15	1.0	0.76	0.33	0.21	0.69	0.35	0.34	0.06	0.09	0.48	0.49
lcl\|BLLF01007370.1_cds_GFH32919.1_27396 (GFH32919)	1.0	0.29	0.09	0.22	0.51	0.26	0.26	0.15	0.25	0.31	0.3	0.18	0.21	0.12	0.2	0.27	0.38	0.27	0.17	0.48	0.25	0.74	0.2	0.06	0.53	0.14
lcl\|BLLF01008566.1_cds_GFH33429.1_27906 (GFH33429)	1.0	0.01	0.0	0.0	0.42	0.19	0.24	0.22	0.27	0.24	0.39	0.12	0.37	0.24	0.13	0.83	0.78	0.61	0.29	0.31	0.6	0.38	0.26	0.08	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)