Heatmap: Cluster_287 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000008.1_cds_GFH05777.1_254 (GFH05777)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.07	0.6	0.09	0.53	1.0	0.04	0.07	0.78	0.03	0.41	0.0	0.0	0.07	0.21	0.06	0.19	0.11	0.0	0.07	0.1	0.16
lcl\|BLLF01000041.1_cds_GFH06479.1_956 (GFH06479)	0.18	0.18	0.0	0.04	0.31	0.54	1.0	0.27	0.94	0.46	0.34	0.47	0.61	0.23	0.64	0.79	0.71	0.22	0.0	0.08	0.24	0.0	0.18	0.38	0.79	0.65
lcl\|BLLF01000056.1_cds_GFH06787.1_1264 (GFH06787)	0.03	0.02	0.0	0.0	0.41	0.64	0.35	0.45	0.21	0.07	0.24	0.66	0.31	0.26	0.21	0.19	0.21	0.37	0.11	0.13	0.62	0.24	0.37	0.12	1.0	0.72
lcl\|BLLF01000156.1_cds_GFH08374.1_2851 (GFH08374)	0.36	0.69	0.34	0.69	0.58	0.79	0.89	0.43	1.0	0.77	0.6	0.62	0.81	0.47	0.7	0.83	0.95	0.94	0.3	0.11	0.78	0.39	0.69	0.46	0.52	0.48
lcl\|BLLF01000196.1_cds_GFH08941.1_3418 (GFH08941)	0.35	0.34	0.0	0.12	0.6	0.67	0.74	0.6	0.8	1.0	0.49	0.46	0.47	0.5	0.42	0.39	0.57	0.64	0.33	0.26	0.76	0.32	0.81	0.59	0.99	0.93
lcl\|BLLF01000205.1_cds_GFH09055.1_3532 (GFH09055)	0.48	0.0	0.0	0.35	0.24	0.51	1.0	0.14	0.75	0.07	0.43	0.53	0.6	0.33	0.57	0.2	0.44	0.23	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.2	0.95	0.61
lcl\|BLLF01000223.1_cds_GFH09295.1_3772 (GFH09295)	0.13	0.24	0.46	0.48	0.59	0.75	0.74	0.44	1.0	0.82	0.5	0.43	0.75	0.42	0.65	0.66	0.46	0.69	0.5	0.62	0.51	0.17	0.68	0.47	0.77	0.82
lcl\|BLLF01000246.1_cds_GFH09589.1_4066 (GFH09589)	0.43	0.08	0.32	0.76	0.68	0.75	0.98	0.38	0.78	1.0	0.57	0.52	0.59	0.45	0.74	0.51	0.52	0.41	0.44	0.38	0.28	0.12	0.39	0.33	0.9	0.84
lcl\|BLLF01000258.1_cds_GFH09742.1_4219 (GFH09742)	0.17	0.14	0.0	0.3	0.79	0.71	0.87	0.45	0.72	0.92	0.83	0.77	0.84	0.72	0.47	0.13	0.4	0.9	0.68	0.22	0.98	0.54	0.71	0.61	1.0	0.76
lcl\|BLLF01000295.1_cds_GFH10202.1_4679 (GFH10202)	0.25	0.3	0.24	0.33	0.54	0.73	0.77	0.36	0.75	0.52	0.5	0.54	0.65	0.51	0.53	0.51	0.5	0.51	0.37	0.4	0.5	0.6	0.38	0.47	1.0	0.85
lcl\|BLLF01000404.1_cds_GFH11446.1_5923 (GFH11446)	0.69	0.0	0.38	0.43	0.73	0.47	0.8	0.44	0.65	1.0	0.75	0.5	0.56	0.65	0.73	0.39	0.67	0.03	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.02	0.66	0.94
lcl\|BLLF01000679.1_cds_GFH14039.1_8516 (GFH14039)	0.43	0.2	0.15	0.52	0.76	0.72	0.75	0.57	0.7	0.19	0.66	0.68	0.63	0.6	0.88	0.71	1.0	0.23	0.04	0.42	0.24	0.09	0.23	0.2	0.83	0.82
lcl\|BLLF01000706.1_cds_GFH14260.1_8737 (GFH14260)	0.0	0.6	0.0	0.0	0.4	0.73	0.99	0.21	0.91	1.0	0.54	0.8	0.96	0.42	0.56	0.96	0.55	0.79	0.33	0.19	0.43	0.21	0.79	0.29	0.6	0.58
lcl\|BLLF01000706.1_cds_GFH14261.1_8738 (GFH14261)	0.02	0.18	0.0	0.11	0.4	0.62	0.81	0.18	0.82	0.87	0.44	0.64	1.0	0.31	0.64	0.44	0.23	0.19	0.13	0.07	0.42	0.3	0.44	0.5	0.76	0.8
lcl\|BLLF01000799.1_cds_GFH15050.1_9527 (GFH15050)	0.11	0.01	0.0	0.23	0.37	0.44	0.47	0.23	1.0	0.31	0.54	0.44	0.97	0.27	0.86	0.54	0.66	0.58	0.17	0.47	0.34	0.43	0.4	0.43	0.81	0.69
lcl\|BLLF01000874.1_cds_GFH15611.1_10088 (GFH15611)	0.03	0.2	0.0	0.04	0.24	0.24	0.64	0.22	0.6	0.39	0.26	0.22	0.59	0.27	0.48	1.0	0.49	0.69	0.0	0.29	0.48	0.0	0.43	0.16	0.1	0.12
lcl\|BLLF01000944.1_cds_GFH16090.1_10567 (GFH16090)	0.28	0.13	0.0	0.25	0.62	0.64	0.75	0.36	0.7	0.88	0.59	0.47	0.52	0.5	0.39	0.27	0.12	0.84	0.24	0.31	0.87	0.33	0.44	0.5	0.81	1.0
lcl\|BLLF01000963.1_cds_GFH16220.1_10697 (GFH16220)	0.5	0.0	0.0	0.41	0.55	0.71	0.93	0.27	0.94	0.4	0.7	0.42	0.52	0.29	0.75	0.23	0.8	0.4	0.16	0.12	0.25	0.12	0.4	0.24	1.0	0.95
lcl\|BLLF01001071.1_cds_GFH16923.1_11400 (GFH16923)	0.04	0.0	0.0	0.0	0.46	0.46	0.57	0.3	0.55	0.3	0.57	0.5	0.5	0.35	0.44	0.28	0.32	0.22	0.06	0.03	0.56	0.0	0.33	0.41	1.0	0.55
lcl\|BLLF01001231.1_cds_GFH17975.1_12452 (GFH17975)	0.0	0.23	0.0	0.38	0.52	0.19	0.4	0.2	0.46	1.0	0.22	0.12	0.36	0.15	0.24	0.0	0.0	0.89	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.12	0.5
lcl\|BLLF01001242.1_cds_GFH18058.1_12535 (GFH18058)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.49	0.3	0.29	0.26	0.31	0.23	0.1	0.52	0.1	0.16	0.0	0.0	0.52	0.0	0.0	0.0	0.27	0.17	0.01	1.0	0.37
lcl\|BLLF01001605.1_cds_GFH20269.1_14746 (GFH20269)	0.48	0.0	0.0	0.61	0.2	0.05	0.66	0.0	0.44	0.99	0.06	0.1	0.29	0.0	0.39	0.46	0.0	0.36	0.0	0.62	1.0	0.0	0.36	0.28	0.33	0.25
lcl\|BLLF01001617.1_cds_GFH20343.1_14820 (GFH20343)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.82	0.57	0.61	0.58	0.29	0.58	0.7	0.31	0.33	0.45	0.33	0.37	0.06	0.0	0.22	0.72	0.21	0.13	0.31	1.0	0.73
lcl\|BLLF01001640.1_cds_GFH20460.1_14937 (GFH20460)	0.21	0.0	0.0	0.03	0.22	0.22	0.39	0.3	0.31	1.0	0.36	0.16	0.19	0.16	0.14	0.09	0.07	0.41	0.15	0.13	0.51	0.28	0.38	0.31	0.49	0.45
lcl\|BLLF01001694.1_cds_GFH20767.1_15244 (GFH20767)	0.31	0.46	0.0	0.36	0.7	0.8	0.59	0.53	0.84	1.0	0.8	0.66	0.61	0.41	0.5	0.06	0.19	0.3	0.38	0.34	0.35	0.24	0.2	0.26	0.71	0.96
lcl\|BLLF01001796.1_cds_GFH21282.1_15759 (GFH21282)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.3	0.65	0.18	0.37	0.0	0.38	0.36	0.5	0.21	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	1.0	0.55
lcl\|BLLF01001840.1_cds_GFH21493.1_15970 (GFH21493)	0.38	0.08	0.2	0.95	0.69	0.65	0.88	0.33	0.87	1.0	0.76	0.4	0.46	0.35	0.72	0.59	0.33	0.52	0.52	0.54	0.88	0.64	0.58	0.55	0.8	0.74
lcl\|BLLF01001985.1_cds_GFH22182.1_16659 (GFH22182)	0.69	0.0	0.0	0.66	0.1	0.12	0.37	0.09	0.32	0.53	0.12	0.14	0.1	0.02	0.2	0.64	0.0	0.38	0.36	0.84	1.0	0.0	0.75	0.29	0.54	0.31
lcl\|BLLF01002040.1_cds_GFH22441.1_16918 (GFH22441)	0.32	0.47	0.12	0.49	0.63	0.81	0.8	0.35	0.53	0.63	0.76	0.75	0.56	0.53	0.38	0.28	0.33	0.6	0.19	0.4	0.61	0.6	0.84	0.52	1.0	0.93
lcl\|BLLF01002167.1_cds_GFH22983.1_17460 (GFH22983)	0.02	0.22	0.0	0.46	0.64	0.56	0.53	0.27	0.74	1.0	0.46	0.43	0.42	0.32	0.34	0.21	0.26	0.61	0.17	0.33	0.46	0.0	0.16	0.24	0.74	0.82
lcl\|BLLF01002224.1_cds_GFH23238.1_17715 (GFH23238)	0.15	0.22	0.0	0.31	0.68	0.95	0.66	0.38	0.91	0.54	0.95	0.45	0.41	0.45	0.46	0.29	0.43	0.67	0.67	0.25	0.41	0.12	0.15	0.35	1.0	0.89
lcl\|BLLF01002592.1_cds_GFH24641.1_19118 (GFH24641)	0.0	0.13	0.0	0.0	0.42	0.61	0.89	0.3	0.74	0.55	0.47	0.85	0.88	0.42	0.27	1.0	0.67	0.33	0.0	0.0	0.24	0.57	0.0	0.03	0.39	0.35
lcl\|BLLF01002974.1_cds_GFH25967.1_20444 (GFH25967)	0.0	0.32	0.0	0.12	0.25	0.46	0.46	0.18	0.42	0.77	0.49	0.57	1.0	0.31	0.48	0.49	0.32	0.03	0.0	0.02	0.31	0.23	0.13	0.04	0.85	0.91
lcl\|BLLF01003327.1_cds_GFH27038.1_21515 (GFH27038)	0.0	0.0	0.0	0.21	0.26	0.2	0.09	0.18	0.2	0.6	0.36	0.09	0.85	0.37	0.2	0.29	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.65	1.0
lcl\|BLLF01003415.1_cds_GFH27273.1_21750 (GFH27273)	0.32	0.13	0.0	0.24	0.39	0.69	0.98	0.37	0.9	0.26	0.51	0.59	0.59	0.4	0.69	0.32	0.71	0.29	0.17	0.24	0.57	0.71	0.29	0.28	0.81	1.0
lcl\|BLLF01003637.1_cds_GFH27826.1_22303 (GFH27826)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.23	0.52	0.03	0.23	0.0	0.15	0.43	0.19	0.07	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	1.0	0.79
lcl\|BLLF01003690.1_cds_GFH27966.1_22443 (GFH27966)	0.03	0.0	0.0	0.04	0.08	0.27	0.65	0.03	0.41	1.0	0.13	0.19	0.57	0.02	0.34	0.14	0.16	0.17	0.0	0.07	0.12	0.13	0.0	0.02	0.21	0.28
lcl\|BLLF01003815.1_cds_GFH28283.1_22760 (GFH28283)	0.39	0.6	0.0	0.17	0.58	0.94	0.95	0.57	0.59	0.82	0.74	0.61	0.81	0.6	0.57	1.0	0.78	0.75	0.12	0.17	0.68	0.64	0.78	0.46	0.69	0.51
lcl\|BLLF01003888.1_cds_GFH28461.1_22938 (GFH28461)	0.15	0.23	0.0	0.85	0.39	0.29	0.54	0.26	0.78	1.0	0.49	0.51	0.83	0.32	0.61	0.36	0.27	0.36	0.27	0.0	0.25	0.39	0.35	0.32	0.73	0.77
lcl\|BLLF01004675.1_cds_GFH30048.1_24525 (GFH30048)	0.28	0.14	0.0	0.09	0.83	0.86	0.84	0.39	0.88	0.66	0.85	0.81	0.5	0.39	0.36	0.13	0.1	0.52	0.31	0.18	1.0	0.16	0.82	0.53	0.64	0.89
lcl\|BLLF01004774.1_cds_GFH30226.1_24703 (GFH30226)	0.0	0.0	0.0	0.12	0.57	0.41	0.51	0.53	0.35	0.0	0.38	0.32	1.0	0.25	0.16	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.87	0.61
lcl\|BLLF01004970.1_cds_GFH30535.1_25012 (GFH30535)	0.29	0.0	0.0	0.26	0.72	0.74	1.0	0.52	0.57	0.08	0.53	0.72	0.56	0.56	0.73	0.14	0.72	0.26	0.06	0.13	0.42	0.27	0.11	0.18	0.77	0.96
lcl\|BLLF01005987.1_cds_GFH31837.1_26314 (GFH31837)	0.0	0.0	0.0	0.36	0.18	0.48	0.47	0.25	0.47	0.2	0.35	0.42	0.27	0.27	0.26	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.0	0.22	0.37	1.0	0.71
lcl\|BLLF01006337.1_cds_GFH32167.1_26644 (GFH32167)	0.05	0.47	0.0	0.35	0.54	0.4	0.8	0.45	0.68	0.1	0.49	0.37	0.58	0.65	0.6	0.15	0.45	0.31	0.06	0.03	0.49	0.04	0.21	0.26	1.0	0.54
lcl\|BLLF01007218.1_cds_GFH32833.1_27310 (GFH32833)	0.0	0.07	0.0	0.36	0.51	0.48	0.67	0.14	0.79	0.47	0.71	0.32	0.29	0.29	0.28	0.11	0.08	0.17	0.26	0.44	0.33	0.14	0.34	0.47	0.89	1.0
lcl\|BLLF01008482.1_cds_GFH33399.1_27876 (GFH33399)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.58	0.04	0.74	1.0	0.0	0.0	0.25	0.02	0.25	0.2	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.16	0.05	0.04	0.07
lcl\|BLLF01009200.1_cds_GFH33650.1_28127 (GFH33650)	0.31	0.32	0.3	0.69	0.61	0.72	0.63	0.31	1.0	0.75	0.68	0.57	0.64	0.35	0.69	0.28	0.21	0.77	0.33	0.61	0.53	0.61	0.55	0.53	0.7	0.67

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)