Heatmap: Cluster_273 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000005.1_cds_GFH05688.1_165 (GFH05688)	0.51	0.77	0.45	0.25	0.38	0.39	0.27	0.46	0.33	0.5	0.35	0.27	0.33	0.31	0.27	0.37	0.44	0.48	0.44	0.23	0.57	0.24	0.39	0.21	0.6	1.0
lcl\|BLLF01000019.1_cds_GFH06036.1_513 (GFH06036)	0.02	0.44	0.0	0.0	0.12	0.37	0.18	0.11	0.18	0.95	0.21	0.27	0.23	0.24	0.17	1.0	0.64	0.3	0.04	0.06	0.17	0.17	0.13	0.01	0.61	0.91
lcl\|BLLF01000027.1_cds_GFH06202.1_679 (GFH06202)	0.49	0.55	0.0	0.32	0.49	0.53	0.41	0.32	0.42	1.0	0.43	0.6	0.52	0.33	0.29	0.23	0.03	0.15	0.18	0.15	0.29	0.14	0.21	0.09	0.75	0.75
lcl\|BLLF01000047.1_cds_GFH06619.1_1096 (GFH06619)	0.15	0.89	0.0	0.04	0.33	0.43	0.3	0.29	0.31	0.94	0.33	0.28	0.28	0.25	0.21	1.0	0.73	0.31	0.21	0.33	0.45	0.29	0.23	0.09	0.61	0.9
lcl\|BLLF01000047.1_cds_GFH06621.1_1098 (GFH06621)	0.01	0.51	0.0	0.01	0.11	0.17	0.11	0.15	0.15	0.14	0.11	0.14	0.14	0.13	0.09	0.36	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	1.0
lcl\|BLLF01000058.1_cds_GFH06825.1_1302 (GFH06825)	0.0	0.6	0.33	0.48	0.85	0.44	0.62	0.34	0.75	1.0	0.77	0.47	0.57	0.46	0.57	0.0	0.0	0.1	0.03	0.09	0.13	0.08	0.07	0.05	0.52	0.62
lcl\|BLLF01000087.1_cds_GFH07319.1_1796 (GFH07319)	0.0	0.32	0.0	0.7	0.08	0.31	0.24	0.0	0.44	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13
lcl\|BLLF01000100.1_cds_GFH07515.1_1992 (GFH07515)	0.0	0.0	0.0	0.7	0.2	0.18	0.39	0.48	0.54	1.0	0.41	0.15	0.53	0.3	0.86	0.71	0.7	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.18	0.1	0.13	0.09
lcl\|BLLF01000142.1_cds_GFH08161.1_2638 (GFH08161)	0.03	0.15	0.0	0.77	0.13	0.1	0.09	0.19	0.26	1.0	0.05	0.18	0.26	0.15	0.32	0.24	0.0	0.09	0.14	0.0	0.13	0.0	0.0	0.01	0.28	0.47
lcl\|BLLF01000229.1_cds_GFH09383.1_3860 (GFH09383)	0.59	0.59	0.07	0.01	0.21	0.26	0.22	0.17	0.24	0.6	0.2	0.19	0.17	0.16	0.15	1.0	0.11	0.22	0.05	0.26	0.42	0.18	0.19	0.08	0.34	0.73
lcl\|BLLF01000238.1_cds_GFH09485.1_3962 (GFH09485)	0.83	0.82	0.0	0.41	0.16	0.22	0.14	0.08	0.16	0.71	0.03	0.03	0.0	0.03	0.08	1.0	0.37	0.2	0.29	0.0	0.81	0.0	0.19	0.19	0.09	0.86
lcl\|BLLF01000248.1_cds_GFH09622.1_4099 (GFH09622)	0.02	0.92	0.0	0.06	0.23	0.19	0.16	0.09	0.17	0.95	0.26	0.17	0.33	0.14	0.1	1.0	0.85	0.26	0.0	0.33	0.09	0.22	0.14	0.04	0.36	0.57
lcl\|BLLF01000311.1_cds_GFH10390.1_4867 (GFH10390)	0.95	0.55	0.89	0.66	0.64	0.62	0.54	0.81	0.71	0.41	0.65	0.55	0.48	0.57	0.47	0.36	0.46	0.32	0.93	1.0	0.32	0.44	0.42	0.38	0.48	0.62
lcl\|BLLF01000394.1_cds_GFH11334.1_5811 (GFH11334)	0.18	0.23	0.0	0.83	0.53	0.35	0.36	0.21	0.59	1.0	0.47	0.26	0.37	0.27	0.35	0.42	0.21	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.33	0.44
lcl\|BLLF01000457.1_cds_GFH11998.1_6475 (GFH11998)	0.26	0.48	0.0	0.36	0.13	0.1	0.08	0.02	0.09	0.48	0.09	0.08	0.11	0.07	0.05	0.24	0.05	0.24	0.0	0.0	0.13	0.08	0.38	0.13	0.65	1.0
lcl\|BLLF01000471.1_cds_GFH12126.1_6603 (GFH12126)	0.69	1.0	0.14	0.05	0.12	0.13	0.13	0.14	0.19	0.73	0.12	0.11	0.11	0.12	0.12	0.54	0.1	0.12	0.18	0.34	0.3	0.12	0.17	0.09	0.47	0.78
lcl\|BLLF01000502.1_cds_GFH12423.1_6900 (GFH12423)	0.18	0.16	0.21	0.77	0.24	0.17	0.4	0.32	0.52	1.0	0.29	0.16	0.37	0.29	0.48	0.31	0.28	0.39	0.12	0.17	0.27	0.16	0.27	0.13	0.19	0.18
lcl\|BLLF01000545.1_cds_GFH12836.1_7313 (GFH12836)	0.24	0.8	0.0	0.4	0.42	0.23	0.44	0.17	0.3	1.0	0.43	0.25	0.25	0.19	0.33	0.6	0.22	0.3	0.0	0.0	0.42	0.19	0.12	0.03	0.33	0.56
lcl\|BLLF01000601.1_cds_GFH13345.1_7822 (GFH13345)	0.24	0.74	0.43	0.5	0.73	0.78	0.74	0.51	0.62	1.0	0.71	0.6	0.64	0.52	0.49	0.26	0.34	0.4	0.09	0.1	0.5	0.15	0.43	0.33	0.77	0.82
lcl\|BLLF01000671.1_cds_GFH13959.1_8436 (GFH13959)	0.19	1.0	0.0	0.22	0.63	0.66	0.35	0.31	0.53	0.88	0.65	0.46	0.62	0.29	0.59	0.09	0.23	0.0	0.06	0.12	0.06	0.07	0.04	0.03	0.85	0.69
lcl\|BLLF01000839.1_cds_GFH15346.1_9823 (GFH15346)	0.38	0.72	0.06	0.06	0.27	0.3	0.23	0.25	0.31	0.64	0.23	0.17	0.17	0.2	0.21	1.0	0.25	0.23	0.14	0.2	0.27	0.29	0.27	0.04	0.45	0.91
lcl\|BLLF01000839.1_cds_GFH15347.1_9824 (GFH15347)	0.13	0.55	0.03	0.06	0.27	0.28	0.19	0.32	0.28	0.24	0.19	0.15	0.15	0.18	0.21	0.25	0.14	0.13	0.06	0.07	0.16	0.08	0.17	0.16	0.58	1.0
lcl\|BLLF01000876.1_cds_GFH15630.1_10107 (GFH15630)	0.0	0.15	0.0	0.35	0.19	0.15	0.04	0.22	0.11	1.0	0.04	0.08	0.13	0.07	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.26
lcl\|BLLF01000898.1_cds_GFH15776.1_10253 (GFH15776)	0.03	0.64	0.0	0.04	0.45	0.44	0.53	0.34	0.55	1.0	0.41	0.51	0.59	0.5	0.55	0.84	0.35	0.3	0.03	0.1	0.32	0.24	0.41	0.04	0.42	0.81
lcl\|BLLF01000968.1_cds_GFH16251.1_10728 (GFH16251)	0.0	0.62	0.0	0.87	0.51	0.24	0.68	0.22	0.54	0.55	0.26	0.27	0.37	0.22	0.49	1.0	0.58	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.01	0.17	0.15
lcl\|BLLF01001050.1_cds_GFH16782.1_11259 (GFH16782)	0.41	0.24	0.33	0.99	0.57	0.49	0.56	0.36	0.46	0.37	0.53	0.46	0.38	0.48	0.35	1.0	0.79	0.33	0.15	0.05	0.35	0.0	0.53	0.17	0.44	0.61
lcl\|BLLF01001080.1_cds_GFH16987.1_11464 (GFH16987)	0.61	0.74	0.24	0.23	0.41	0.29	0.24	0.47	0.32	1.0	0.41	0.32	0.34	0.29	0.27	0.71	0.67	0.71	0.18	0.72	0.72	0.31	0.61	0.35	0.78	0.81
lcl\|BLLF01001093.1_cds_GFH17080.1_11557 (GFH17080)	0.0	0.27	0.0	0.6	0.12	0.04	0.2	0.24	0.37	1.0	0.05	0.18	0.45	0.28	0.29	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.01	0.11	0.2
lcl\|BLLF01001214.1_cds_GFH17865.1_12342 (GFH17865)	0.17	0.12	0.34	1.0	0.4	0.31	0.44	0.36	0.58	0.8	0.46	0.35	0.41	0.4	0.52	0.82	0.68	0.08	0.18	0.03	0.18	0.12	0.3	0.0	0.3	0.2
lcl\|BLLF01001363.1_cds_GFH18824.1_13301 (GFH18824)	0.53	0.62	0.56	0.99	0.71	0.56	0.52	0.53	0.53	1.0	0.63	0.46	0.43	0.43	0.49	0.6	0.83	0.04	0.05	0.02	0.09	0.01	0.04	0.0	0.41	0.47
lcl\|BLLF01001374.1_cds_GFH18884.1_13361 (GFH18884)	0.23	0.52	0.27	0.2	0.42	0.59	0.42	0.36	0.5	1.0	0.46	0.51	0.56	0.49	0.31	0.4	0.38	0.44	0.34	0.34	0.48	0.3	0.49	0.16	0.55	0.68
lcl\|BLLF01001583.1_cds_GFH20146.1_14623 (GFH20146)	0.0	0.62	0.24	0.58	0.64	0.5	0.49	0.46	0.46	0.98	0.75	0.69	0.61	0.46	0.49	0.62	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.52
lcl\|BLLF01001603.1_cds_GFH20254.1_14731 (GFH20254)	0.76	0.56	0.84	0.24	0.56	0.43	0.45	0.61	0.63	1.0	0.41	0.41	0.62	0.43	0.55	0.43	0.36	0.48	0.95	0.61	0.43	0.19	0.37	0.41	0.7	0.54
lcl\|BLLF01001619.1_cds_GFH20355.1_14832 (GFH20355)	0.41	0.63	0.49	0.32	0.35	0.32	0.37	0.38	0.4	0.69	0.36	0.3	0.29	0.3	0.38	0.66	0.67	0.15	0.07	0.19	0.18	0.22	0.14	0.11	0.59	1.0
lcl\|BLLF01001663.1_cds_GFH20596.1_15073 (GFH20596)	0.0	0.72	0.0	0.25	0.32	0.28	0.23	0.2	0.52	0.87	0.27	0.37	0.28	0.25	0.17	0.23	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	1.0
lcl\|BLLF01001680.1_cds_GFH20689.1_15166 (GFH20689)	0.21	0.55	0.21	0.8	0.46	0.37	0.4	0.28	0.48	1.0	0.4	0.28	0.38	0.29	0.38	0.48	0.37	0.5	0.24	0.47	0.31	0.4	0.36	0.23	0.37	0.4
lcl\|BLLF01001948.1_cds_GFH22008.1_16485 (GFH22008)	0.16	0.39	0.46	0.5	0.85	0.91	0.76	0.4	0.53	0.66	1.0	0.77	0.69	0.52	0.58	0.68	0.29	0.42	0.13	0.06	0.47	0.06	0.42	0.06	0.92	0.69
lcl\|BLLF01002204.1_cds_GFH23155.1_17632 (GFH23155)	1.0	0.36	0.49	0.41	0.72	0.43	0.33	0.75	0.48	0.47	0.57	0.38	0.53	0.54	0.51	0.41	0.34	0.56	0.82	0.95	0.53	0.48	0.63	0.32	0.49	0.41
lcl\|BLLF01002273.1_cds_GFH23442.1_17919 (GFH23442)	0.2	0.85	0.27	0.25	0.65	0.62	0.62	0.79	1.0	0.9	0.55	0.58	0.55	0.5	0.69	0.29	0.11	0.48	0.72	0.8	0.51	0.13	0.37	0.38	0.91	0.84
lcl\|BLLF01002276.1_cds_GFH23451.1_17928 (GFH23451)	0.25	0.76	0.08	0.04	0.26	0.24	0.18	0.24	0.2	0.47	0.23	0.14	0.11	0.13	0.13	0.54	0.2	0.22	0.17	0.26	0.27	0.43	0.17	0.12	0.51	1.0
lcl\|BLLF01002549.1_cds_GFH24488.1_18965 (GFH24488)	0.34	0.43	0.17	0.14	0.17	0.15	0.19	0.15	0.21	1.0	0.18	0.11	0.13	0.11	0.21	0.97	0.15	0.1	0.09	0.15	0.14	0.1	0.16	0.11	0.74	0.61
lcl\|BLLF01002580.1_cds_GFH24602.1_19079 (GFH24602)	0.46	0.78	0.0	0.09	0.23	0.25	0.23	0.43	0.4	0.8	0.22	0.2	0.22	0.26	0.29	0.87	0.11	0.29	0.19	0.28	0.46	0.2	0.35	0.33	0.44	1.0
lcl\|BLLF01002750.1_cds_GFH25206.1_19683 (GFH25206)	0.64	0.84	0.1	0.12	0.4	0.31	0.25	0.54	0.3	1.0	0.33	0.25	0.28	0.32	0.19	0.55	0.25	0.38	0.15	0.26	0.45	0.43	0.29	0.24	0.61	0.81
lcl\|BLLF01003267.1_cds_GFH26869.1_21346 (GFH26869)	0.03	0.56	0.0	0.02	0.35	0.27	0.38	0.25	0.52	1.0	0.32	0.19	0.29	0.22	0.25	0.07	0.26	0.11	0.09	0.05	0.16	0.0	0.23	0.05	0.37	0.5
lcl\|BLLF01003315.1_cds_GFH27001.1_21478 (GFH27001)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.15	0.0	0.0	0.59	1.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003383.1_cds_GFH27189.1_21666 (GFH27189)	0.0	0.57	0.27	0.1	0.27	0.38	0.33	0.19	0.31	1.0	0.33	0.28	0.41	0.3	0.17	0.75	0.42	0.21	0.05	0.15	0.24	0.19	0.24	0.02	0.61	0.8
lcl\|BLLF01003464.1_cds_GFH27413.1_21890 (GFH27413)	0.31	0.5	0.55	0.86	0.89	0.82	0.73	0.58	1.0	0.92	0.63	0.72	0.94	0.54	0.82	0.52	0.94	0.48	0.11	0.53	0.62	0.34	0.69	0.58	0.64	0.75
lcl\|BLLF01003517.1_cds_GFH27541.1_22018 (GFH27541)	0.0	1.0	0.51	0.1	0.34	0.42	0.58	0.32	0.47	0.77	0.28	0.5	0.56	0.37	0.39	0.54	0.29	0.35	0.29	0.37	0.64	0.73	0.43	0.09	0.58	0.55
lcl\|BLLF01003794.1_cds_GFH28241.1_22718 (GFH28241)	0.0	0.7	0.16	0.26	0.24	0.31	0.22	0.2	0.23	1.0	0.24	0.19	0.16	0.22	0.17	0.9	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.47
lcl\|BLLF01003795.1_cds_GFH28243.1_22720 (GFH28243)	0.65	0.94	0.18	0.05	0.48	0.5	0.43	0.63	0.5	0.6	0.35	0.41	0.37	0.32	0.31	0.57	0.19	0.3	0.37	0.63	0.53	0.21	0.35	0.29	0.67	1.0
lcl\|BLLF01004455.1_cds_GFH29645.1_24122 (GFH29645)	0.51	0.79	0.0	0.06	0.33	0.38	0.25	0.39	0.43	0.9	0.32	0.29	0.3	0.23	0.31	1.0	0.14	0.3	0.29	0.44	0.39	0.17	0.3	0.24	0.57	0.91
lcl\|BLLF01004609.1_cds_GFH29950.1_24427 (GFH29950)	0.0	0.36	0.0	0.78	0.17	0.25	0.34	0.13	0.47	1.0	0.24	0.2	0.3	0.24	0.37	0.46	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.22
lcl\|BLLF01004858.1_cds_GFH30367.1_24844 (GFH30367)	0.33	0.75	0.0	0.04	0.05	0.04	0.03	0.07	0.02	1.0	0.08	0.08	0.06	0.06	0.02	0.72	0.46	0.13	0.15	0.34	0.12	0.26	0.12	0.1	0.49	0.54
lcl\|BLLF01005411.1_cds_GFH31163.1_25640 (GFH31163)	0.15	0.71	0.26	0.16	0.33	0.35	0.5	0.23	0.53	1.0	0.31	0.34	0.43	0.22	0.42	0.3	0.22	0.5	0.36	0.43	0.47	0.37	0.42	0.14	0.4	0.58
lcl\|BLLF01005958.1_cds_GFH31805.1_26282 (GFH31805)	0.06	0.73	0.24	0.7	0.35	0.27	0.36	0.18	0.36	1.0	0.32	0.26	0.39	0.24	0.28	0.45	0.52	0.08	0.2	0.06	0.06	0.08	0.1	0.05	0.52	0.64
lcl\|BLLF01005971.1_cds_GFH31815.1_26292 (GFH31815)	0.49	0.86	0.37	0.24	0.61	0.53	0.38	0.89	0.63	1.0	0.55	0.37	0.51	0.47	0.55	0.38	0.45	0.51	1.0	0.47	0.47	0.12	0.42	0.18	0.58	0.62
lcl\|BLLF01006305.1_cds_GFH32145.1_26622 (GFH32145)	0.37	1.0	0.32	0.12	0.33	0.36	0.3	0.65	0.39	0.8	0.33	0.29	0.41	0.43	0.37	0.53	0.65	0.27	0.54	0.44	0.27	0.43	0.3	0.16	0.74	0.81
lcl\|BLLF01006588.1_cds_GFH32385.1_26862 (GFH32385)	0.39	0.8	0.0	0.1	0.29	0.35	0.33	0.18	0.25	0.97	0.28	0.22	0.23	0.18	0.14	1.0	0.39	0.3	0.29	0.36	0.3	0.12	0.17	0.12	0.41	0.61

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)