Heatmap: Cluster_102 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
0.06 0.02 0.18 0.15 0.07 0.01 0.05 0.0 0.02 0.11 0.09 0.02 0.0 0.01 0.06 0.87 1.0 0.04 0.06 0.19 0.06 0.09 0.09 0.02 0.03 0.12
0.09 0.0 0.0 0.29 0.15 0.08 0.1 0.26 0.12 0.12 0.14 0.09 0.13 0.15 0.13 0.98 1.0 0.29 0.12 0.11 0.22 0.04 0.29 0.17 0.19 0.21
0.12 0.03 0.02 0.05 0.14 0.11 0.13 0.09 0.1 0.09 0.12 0.12 0.1 0.1 0.09 1.0 0.95 0.13 0.26 0.18 0.22 0.23 0.26 0.12 0.14 0.05
0.07 0.18 0.0 0.05 0.07 0.08 0.09 0.09 0.11 0.14 0.06 0.05 0.05 0.05 0.08 1.0 0.49 0.07 0.11 0.08 0.12 0.03 0.05 0.26 0.13 0.15
0.05 0.12 0.0 0.1 0.12 0.06 0.05 0.08 0.08 0.18 0.07 0.08 0.08 0.03 0.06 1.0 0.37 0.27 0.04 0.17 0.24 0.04 0.1 0.25 0.08 0.05
0.07 0.08 0.0 0.01 0.08 0.1 0.06 0.11 0.1 0.23 0.09 0.07 0.08 0.08 0.09 1.0 0.31 0.07 0.03 0.11 0.11 0.13 0.05 0.18 0.13 0.11
0.14 0.05 0.0 0.11 0.12 0.1 0.07 0.1 0.08 0.12 0.14 0.07 0.08 0.09 0.04 1.0 0.88 0.29 0.22 0.25 0.33 0.22 0.44 0.17 0.09 0.23
0.05 0.15 0.0 0.0 0.04 0.03 0.07 0.02 0.07 0.29 0.06 0.04 0.05 0.02 0.13 1.0 0.79 0.21 0.1 0.08 0.17 0.12 0.16 0.06 0.15 0.09
0.09 0.09 0.0 0.03 0.06 0.04 0.05 0.08 0.05 0.25 0.04 0.03 0.04 0.05 0.05 1.0 0.82 0.15 0.08 0.11 0.1 0.05 0.17 0.13 0.05 0.03
0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.04 0.01 0.0 0.05 0.04 0.01 0.01 0.04 1.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.05
0.0 0.03 0.0 0.11 0.01 0.02 0.04 0.01 0.02 0.03 0.02 0.04 0.02 0.02 0.01 1.0 0.74 0.13 0.11 0.07 0.14 0.06 0.17 0.06 0.05 0.02
0.12 0.03 0.1 0.12 0.04 0.05 0.03 0.02 0.02 0.11 0.06 0.03 0.03 0.07 0.01 1.0 0.73 0.13 0.04 0.02 0.15 0.09 0.14 0.08 0.03 0.03
0.08 0.05 0.0 0.07 0.07 0.17 0.13 0.05 0.08 0.06 0.07 0.15 0.15 0.12 0.08 1.0 0.8 0.19 0.23 0.11 0.17 0.15 0.34 0.34 0.24 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 1.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.03 0.01 0.04 0.15 0.02 0.02 0.06 0.02 0.03 0.89 1.0 0.24 0.07 0.17 0.12 0.0 0.12 0.04 0.04 0.06
0.03 0.04 0.23 0.07 0.02 0.09 0.05 0.04 0.03 0.05 0.05 0.05 0.07 0.04 0.02 1.0 0.54 0.16 0.03 0.11 0.17 0.05 0.24 0.17 0.14 0.12
0.0 0.03 0.2 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.19 0.01 0.01 0.03 0.02 0.03 0.97 1.0 0.19 0.11 0.05 0.04 0.0 0.0 0.12 0.04 0.07
0.1 0.04 0.0 0.05 0.09 0.09 0.14 0.05 0.1 0.05 0.07 0.07 0.06 0.03 0.1 1.0 0.49 0.0 0.08 0.12 0.04 0.08 0.0 0.19 0.07 0.06
0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.08 0.04 1.0 0.42 0.0 0.17 0.0 0.15 0.0 0.0 0.13 0.03 0.0
0.01 0.01 0.06 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.07 0.03 0.04 0.02 0.03 0.02 0.1 1.0 0.35 0.04 0.09 0.03 0.1 0.02 0.15 0.16 0.06 0.01
0.07 0.02 0.15 0.06 0.03 0.01 0.03 0.03 0.13 0.11 0.02 0.02 0.13 0.02 0.14 1.0 0.61 0.24 0.11 0.18 0.24 0.15 0.14 0.27 0.02 0.01
0.05 0.01 0.0 0.1 0.06 0.12 0.1 0.03 0.03 0.18 0.12 0.09 0.11 0.11 0.03 1.0 0.98 0.08 0.04 0.09 0.0 0.04 0.03 0.11 0.05 0.02
0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.02 0.02 0.08 0.03 0.02 0.02 0.02 0.0 1.0 0.62 0.0 0.05 0.08 0.1 0.24 0.07 0.1 0.04 0.04
0.01 0.02 0.09 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.76 0.05 0.06 0.04 0.08 0.05 0.07 0.02 0.01 0.0
0.06 0.0 0.0 0.14 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.1 0.05
0.19 0.12 0.07 0.15 0.23 0.17 0.15 0.16 0.15 0.07 0.18 0.13 0.11 0.13 0.09 1.0 0.88 0.23 0.19 0.18 0.27 0.24 0.24 0.28 0.25 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.73 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0
0.07 0.09 0.0 0.04 0.06 0.08 0.08 0.06 0.05 0.07 0.07 0.06 0.05 0.06 0.04 1.0 0.65 0.2 0.04 0.06 0.21 0.07 0.54 0.04 0.08 0.07
0.24 0.12 0.07 0.11 0.13 0.14 0.16 0.08 0.16 0.28 0.14 0.11 0.13 0.1 0.15 1.0 0.81 0.32 0.21 0.14 0.38 0.28 0.31 0.16 0.19 0.17
0.03 0.02 0.08 0.03 0.09 0.1 0.08 0.04 0.07 0.1 0.11 0.06 0.05 0.05 0.05 1.0 0.69 0.26 0.08 0.15 0.25 0.15 0.15 0.02 0.08 0.12
0.1 0.03 0.0 0.01 0.08 0.06 0.1 0.04 0.06 0.15 0.09 0.07 0.1 0.06 0.06 1.0 0.71 0.2 0.07 0.12 0.32 0.22 0.33 0.04 0.08 0.08
0.1 0.05 0.07 0.08 0.09 0.08 0.12 0.04 0.11 0.11 0.07 0.07 0.08 0.06 0.09 1.0 0.8 0.19 0.17 0.11 0.25 0.11 0.3 0.19 0.12 0.09
0.05 0.06 0.0 0.04 0.02 0.03 0.04 0.02 0.03 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.01 1.0 0.74 0.19 0.22 0.14 0.16 0.17 0.21 0.09 0.03 0.02
0.15 0.05 0.0 0.03 0.15 0.18 0.13 0.08 0.13 0.04 0.12 0.14 0.16 0.12 0.11 1.0 0.71 0.16 0.06 0.13 0.05 0.12 0.16 0.17 0.1 0.08
0.03 0.04 0.0 0.01 0.03 0.03 0.02 0.0 0.01 0.04 0.04 0.02 0.03 0.02 0.0 1.0 0.77 0.05 0.0 0.33 0.24 0.19 0.05 0.07 0.13 0.07
0.35 0.18 0.29 0.36 0.47 0.41 0.4 0.43 0.41 0.38 0.42 0.38 0.38 0.45 0.44 1.0 1.0 0.44 0.45 0.27 0.46 0.58 0.56 0.57 0.3 0.26
0.0 0.14 0.0 0.0 0.02 0.03 0.06 0.04 0.03 0.12 0.02 0.01 0.03 0.02 0.03 1.0 0.11 0.06 0.04 0.03 0.0 0.05 0.03 0.12 0.05 0.08
0.03 0.06 0.0 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.03 0.22 0.02 0.02 0.04 0.0 0.03 0.88 1.0 0.27 0.13 0.26 0.19 0.14 0.29 0.03 0.04 0.04
0.05 0.05 0.0 0.05 0.02 0.01 0.02 0.01 0.03 0.13 0.01 0.02 0.01 0.0 0.02 1.0 0.86 0.31 0.1 0.15 0.13 0.25 0.4 0.08 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.05 0.02 0.08 0.08 0.02 0.03 0.04 0.03 0.11 1.0 0.87 0.03 0.0 0.04 0.02 0.05 0.03 0.04 0.12 0.26
0.11 0.06 0.01 0.1 0.07 0.12 0.12 0.08 0.08 0.25 0.1 0.13 0.16 0.12 0.07 1.0 0.7 0.2 0.06 0.09 0.15 0.09 0.15 0.28 0.22 0.22
0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 1.0 0.9 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.08 0.15 0.02 0.03
0.06 0.06 0.16 0.04 0.02 0.03 0.02 0.03 0.01 0.07 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 1.0 0.85 0.15 0.09 0.22 0.15 0.14 0.14 0.28 0.06 0.04
0.11 0.04 0.02 0.08 0.07 0.05 0.04 0.03 0.04 0.03 0.06 0.03 0.02 0.04 0.02 0.76 1.0 0.13 0.07 0.09 0.1 0.1 0.09 0.06 0.04 0.02
0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.05 0.02 0.23 0.04 0.01 0.01 0.02 0.01 1.0 0.38 0.12 0.23 0.05 0.25 0.0 0.24 0.22 0.02 0.02
0.04 0.02 0.02 0.03 0.08 0.07 0.12 0.09 0.09 0.06 0.07 0.05 0.06 0.07 0.09 1.0 0.44 0.07 0.11 0.09 0.08 0.11 0.09 0.15 0.14 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.96 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.07 0.0 0.0
0.12 0.01 0.0 0.08 0.08 0.13 0.16 0.07 0.13 0.04 0.1 0.11 0.14 0.1 0.12 1.0 0.53 0.18 0.08 0.07 0.2 0.12 0.31 0.29 0.11 0.05
0.03 0.0 0.0 0.07 0.07 0.04 0.05 0.01 0.02 0.04 0.11 0.03 0.04 0.04 0.02 1.0 0.67 0.08 0.0 0.27 0.11 0.0 0.31 0.07 0.12 0.13
0.07 0.23 0.2 0.19 0.21 0.13 0.2 0.24 0.17 0.09 0.18 0.13 0.14 0.17 0.27 1.0 0.83 0.22 0.11 0.26 0.25 0.13 0.27 0.16 0.19 0.19
0.04 0.02 0.01 0.05 0.13 0.16 0.19 0.14 0.19 0.09 0.15 0.11 0.09 0.13 0.12 1.0 0.74 0.26 0.16 0.19 0.24 0.22 0.21 0.26 0.17 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.04 1.0 0.69 0.0 0.15 0.0 0.13 0.0 0.0 0.03 0.02 0.02
0.03 0.0 0.0 0.12 0.07 0.15 0.1 0.07 0.09 0.1 0.11 0.04 0.06 0.04 0.05 1.0 0.64 0.07 0.05 0.15 0.0 0.06 0.04 0.29 0.11 0.08
0.11 0.0 0.04 0.04 0.06 0.08 0.13 0.06 0.15 0.05 0.05 0.05 0.08 0.04 0.11 1.0 1.0 0.06 0.26 0.22 0.11 0.34 0.05 0.09 0.07 0.06
0.01 0.1 0.16 0.12 0.06 0.03 0.08 0.02 0.03 0.04 0.07 0.05 0.08 0.03 0.03 0.72 1.0 0.15 0.1 0.14 0.2 0.1 0.27 0.13 0.06 0.12
0.0 0.11 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.03 0.04 0.02 0.0 0.08 0.05 0.07 0.05 0.02 0.67 1.0 0.1 0.0 0.08 0.0 0.08 0.14 0.06 0.1 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 1.0 0.79 0.07 0.05 0.0 0.09 0.05 0.36 0.01 0.02 0.02
0.01 0.16 0.0 0.15 0.12 0.11 0.08 0.02 0.05 0.04 0.08 0.06 0.08 0.05 0.06 1.0 0.81 0.27 0.04 0.17 0.25 0.23 0.13 0.16 0.15 0.21
0.17 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.11 0.05 0.1 0.13 0.08 0.07 0.1 0.07 0.12 1.0 0.72 0.3 0.3 0.1 0.26 0.25 0.34 0.11 0.11 0.1
0.09 0.0 0.0 0.0 0.11 0.07 0.07 0.09 0.06 0.04 0.2 0.02 0.04 0.04 0.02 1.0 0.42 0.25 0.13 0.06 0.25 0.16 0.17 0.24 0.03 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.12 1.0 0.93 0.0 0.15 0.25 0.0 0.15 0.0 0.06 0.07 0.02
0.07 0.0 0.0 0.03 0.1 0.12 0.12 0.05 0.18 0.07 0.1 0.1 0.07 0.11 0.11 1.0 0.7 0.05 0.0 0.04 0.24 0.07 0.21 0.15 0.16 0.17
0.07 0.0 0.0 0.02 0.04 0.01 0.02 0.05 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.88 1.0 0.06 0.09 0.1 0.08 0.03 0.13 0.2 0.01 0.01
0.13 0.19 0.09 0.39 0.24 0.2 0.24 0.23 0.28 0.17 0.2 0.15 0.13 0.15 0.22 1.0 0.77 0.26 0.32 0.25 0.28 0.1 0.22 0.23 0.27 0.24
0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.04 0.01 0.01 0.04 0.26 0.07 0.06 0.07 0.05 0.03 1.0 0.67 0.35 0.0 0.18 0.1 0.0 0.35 0.03 0.05 0.02
0.0 0.06 0.0 0.02 0.02 0.07 0.04 0.01 0.03 0.09 0.02 0.03 0.05 0.03 0.01 1.0 0.74 0.29 0.0 0.0 0.13 0.08 0.1 0.02 0.02 0.07
0.08 0.04 0.0 0.19 0.14 0.12 0.13 0.14 0.13 0.03 0.12 0.09 0.12 0.17 0.12 1.0 0.59 0.3 0.17 0.09 0.2 0.22 0.28 0.33 0.18 0.17
0.15 0.01 0.0 0.01 0.12 0.12 0.11 0.17 0.14 0.01 0.14 0.17 0.11 0.16 0.11 1.0 0.86 0.26 0.06 0.09 0.27 0.16 0.29 0.34 0.02 0.01
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.09 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 1.0 0.97 0.31 0.1 0.03 0.28 0.0 0.24 0.05 0.01 0.0
0.18 0.02 0.0 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.98 1.0 0.08 0.12 0.08 0.17 0.17 0.04 0.1 0.05 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.04 0.04 0.07 0.11 0.06 0.06 0.03 0.02 0.02 0.16 1.0 0.32 0.04 0.02 0.01 0.09 0.09 0.15 0.16 0.15 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.01 0.06 0.1 0.03 0.03 0.01 0.01 0.0 0.88 1.0 0.22 0.0 0.2 0.42 0.11 0.13 0.11 0.03 0.0
0.04 0.04 0.0 0.02 0.05 0.11 0.13 0.04 0.05 0.04 0.08 0.08 0.07 0.08 0.03 1.0 0.47 0.17 0.04 0.09 0.14 0.07 0.1 0.21 0.16 0.16
0.03 0.0 0.0 0.01 0.06 0.05 0.07 0.02 0.06 0.04 0.06 0.05 0.03 0.03 0.04 0.7 1.0 0.06 0.24 0.24 0.03 0.11 0.08 0.05 0.12 0.08
0.07 0.01 0.11 0.06 0.13 0.21 0.26 0.09 0.16 0.16 0.1 0.16 0.14 0.11 0.13 1.0 0.6 0.18 0.12 0.09 0.18 0.08 0.15 0.29 0.17 0.14
0.25 0.0 0.0 0.02 0.19 0.17 0.17 0.32 0.22 0.33 0.22 0.24 0.23 0.29 0.22 1.0 0.78 0.38 0.15 0.22 0.41 0.47 0.4 0.39 0.11 0.13
0.02 0.03 0.0 0.0 0.13 0.07 0.07 0.03 0.01 0.12 0.14 0.12 0.06 0.04 0.03 0.94 1.0 0.24 0.0 0.08 0.29 0.18 0.28 0.07 0.05 0.04
0.14 0.11 0.14 0.15 0.12 0.12 0.11 0.08 0.12 0.11 0.1 0.1 0.1 0.09 0.09 1.0 0.56 0.17 0.05 0.07 0.22 0.09 0.24 0.25 0.1 0.09

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)