Heatmap: Cluster_22 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000080.1_cds_GFH07199.1_1676 (GFH07199)	0.0	1.0	0.0	0.14	0.02	0.02	0.2	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04
lcl\|BLLF01000084.1_cds_GFH07258.1_1735 (GFH07258)	0.0	1.0	0.05	0.21	0.07	0.3	0.23	0.09	0.31	0.72	0.17	0.06	0.21	0.03	0.32	0.0	0.3	0.0	0.29	0.0	0.0	0.25	0.16	0.03	0.16	0.08
lcl\|BLLF01000098.1_cds_GFH07491.1_1968 (GFH07491)	0.13	1.0	0.0	0.13	0.11	0.13	0.08	0.07	0.06	0.36	0.08	0.08	0.03	0.03	0.02	0.35	0.18	0.22	0.0	0.09	0.11	0.04	0.14	0.01	0.13	0.17
lcl\|BLLF01000149.1_cds_GFH08251.1_2728 (GFH08251)	0.01	1.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.1	0.01	0.02	0.0	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.02	0.11	0.05	0.0	0.03	0.02	0.03	0.02
lcl\|BLLF01000166.1_cds_GFH08516.1_2993 (GFH08516)	0.07	1.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.08	0.11	0.03	0.01	0.02	0.06	0.0	0.04	0.04	0.04	0.04
lcl\|BLLF01000204.1_cds_GFH09045.1_3522 (GFH09045)	0.12	1.0	0.0	0.01	0.02	0.05	0.1	0.02	0.18	0.69	0.02	0.14	0.18	0.02	0.45	0.03	0.02	0.03	0.05	0.03	0.03	0.05	0.03	0.02	0.06	0.03
lcl\|BLLF01000204.1_cds_GFH09046.1_3523 (GFH09046)	0.03	1.0	0.0	0.01	0.02	0.05	0.09	0.02	0.11	0.24	0.02	0.14	0.12	0.02	0.32	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.02
lcl\|BLLF01000206.1_cds_GFH09056.1_3533 (GFH09056)	0.19	1.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000207.1_cds_GFH09082.1_3559 (GFH09082)	0.01	1.0	0.01	0.01	0.04	0.07	0.25	0.03	0.19	0.03	0.03	0.05	0.15	0.01	0.21	0.01	0.01	0.0	0.21	0.01	0.0	0.04	0.0	0.01	0.08	0.04
lcl\|BLLF01000229.1_cds_GFH09374.1_3851 (GFH09374)	0.1	1.0	0.1	0.0	0.06	0.06	0.06	0.06	0.07	0.2	0.06	0.07	0.07	0.04	0.06	0.11	0.07	0.1	0.1	0.12	0.09	0.06	0.12	0.08	0.18	0.15
lcl\|BLLF01000231.1_cds_GFH09404.1_3881 (GFH09404)	0.1	1.0	0.09	0.05	0.03	0.05	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.09	0.05	0.05	0.05	0.12	0.06	0.08	0.2	0.21	0.15	0.07	0.07	0.06	0.04	0.04
lcl\|BLLF01000271.1_cds_GFH09882.1_4359 (GFH09882)	0.0	1.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000408.1_cds_GFH11480.1_5957 (GFH11480)	0.03	1.0	0.0	0.01	0.04	0.03	0.04	0.01	0.05	0.1	0.03	0.03	0.03	0.02	0.08	0.03	0.02	0.09	0.03	0.09	0.03	0.0	0.02	0.06	0.09	0.12
lcl\|BLLF01000512.1_cds_GFH12526.1_7003 (GFH12526)	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000546.1_cds_GFH12849.1_7326 (GFH12849)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.26	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.07	0.07	0.07	0.01	0.04	0.09	0.0	0.04	0.03	0.03	0.03
lcl\|BLLF01000571.1_cds_GFH13067.1_7544 (GFH13067)	0.03	1.0	0.16	0.05	0.16	0.14	0.13	0.16	0.23	0.36	0.16	0.08	0.11	0.1	0.29	0.08	0.0	0.18	0.05	0.05	0.33	0.1	0.24	0.17	0.29	0.18
lcl\|BLLF01000690.1_cds_GFH14136.1_8613 (GFH14136)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.04	0.15	0.25	0.02	0.24	0.33	0.05	0.07	0.29	0.01	0.15	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.1
lcl\|BLLF01000721.1_cds_GFH14398.1_8875 (GFH14398)	0.0	1.0	0.05	0.14	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.01	0.01	0.06	0.05	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.05	0.01
lcl\|BLLF01000806.1_cds_GFH15098.1_9575 (GFH15098)	0.1	1.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.03	0.05	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0
lcl\|BLLF01000826.1_cds_GFH15262.1_9739 (GFH15262)	0.32	1.0	0.24	0.23	0.23	0.19	0.21	0.21	0.19	0.15	0.22	0.2	0.16	0.19	0.18	0.09	0.23	0.23	0.13	0.18	0.18	0.45	0.19	0.12	0.25	0.22
lcl\|BLLF01001001.1_cds_GFH16461.1_10938 (GFH16461)	0.07	1.0	0.02	0.01	0.02	0.04	0.07	0.03	0.06	0.38	0.02	0.12	0.1	0.02	0.28	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02
lcl\|BLLF01001139.1_cds_GFH17381.1_11858 (GFH17381)	0.17	1.0	0.0	0.13	0.0	0.02	0.02	0.04	0.02	0.22	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.31	0.23	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.09	0.04
lcl\|BLLF01001147.1_cds_GFH17432.1_11909 (GFH17432)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.03	0.0	0.08	0.05	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.18	0.0	0.28	0.02	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001295.1_cds_GFH18395.1_12872 (GFH18395)	0.0	1.0	0.07	0.0	0.01	0.03	0.4	0.02	0.28	0.0	0.02	0.02	0.09	0.0	0.28	0.02	0.01	0.0	0.39	0.02	0.0	0.04	0.0	0.0	0.02	0.01
lcl\|BLLF01001389.1_cds_GFH18989.1_13466 (GFH18989)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.0	0.02	0.02	0.01	0.0	0.05	0.13	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
lcl\|BLLF01001389.1_cds_GFH18991.1_13468 (GFH18991)	0.02	1.0	0.03	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.0	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0
lcl\|BLLF01001523.1_cds_GFH19807.1_14284 (GFH19807)	0.14	1.0	0.0	0.07	0.13	0.14	0.11	0.2	0.2	0.54	0.14	0.1	0.21	0.12	0.16	0.33	0.16	0.2	0.05	0.06	0.19	0.09	0.17	0.04	0.19	0.14
lcl\|BLLF01001803.1_cds_GFH21308.1_15785 (GFH21308)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.03	0.0	0.01	0.22	0.03	0.0	0.07	0.01	0.1	0.12	0.08	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.08	0.0	0.05	0.11
lcl\|BLLF01001899.1_cds_GFH21756.1_16233 (GFH21756)	0.0	1.0	0.08	0.0	0.07	0.08	0.3	0.05	0.19	0.01	0.08	0.09	0.21	0.02	0.19	0.04	0.03	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04
lcl\|BLLF01002073.1_cds_GFH22583.1_17060 (GFH22583)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.08	0.02	0.11	0.02	0.01	0.04	0.21	0.28	0.03	0.05	0.56	0.04	0.04	0.02	0.0	0.13	0.1
lcl\|BLLF01002265.1_cds_GFH23409.1_17886 (GFH23409)	0.05	1.0	0.0	0.17	0.03	0.08	0.33	0.12	0.19	0.14	0.2	0.15	0.21	0.08	0.25	0.17	0.0	0.15	0.1	0.11	0.0	0.0	0.0	0.05	0.15	0.1
lcl\|BLLF01002310.1_cds_GFH23597.1_18074 (GFH23597)	0.03	1.0	0.14	0.0	0.04	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.06	0.01	0.0	0.04	0.03	0.21	0.16	0.0	0.0	0.0	0.11	0.13	0.0	0.02	0.0	0.02
lcl\|BLLF01002312.1_cds_GFH23603.1_18080 (GFH23603)	0.12	1.0	0.27	0.06	0.07	0.05	0.05	0.06	0.06	0.2	0.05	0.06	0.06	0.04	0.05	0.13	0.05	0.09	0.09	0.09	0.09	0.05	0.11	0.05	0.11	0.11
lcl\|BLLF01002379.1_cds_GFH23848.1_18325 (GFH23848)	0.01	1.0	0.19	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.02
lcl\|BLLF01002384.1_cds_GFH23872.1_18349 (GFH23872)	0.14	1.0	0.0	0.05	0.14	0.28	0.39	0.07	0.45	0.0	0.22	0.12	0.26	0.17	0.27	0.06	0.17	0.0	0.16	0.13	0.0	0.06	0.0	0.07	0.02	0.0
lcl\|BLLF01002550.1_cds_GFH24494.1_18971 (GFH24494)	0.02	1.0	0.24	0.0	0.13	0.16	0.1	0.15	0.18	0.29	0.13	0.12	0.11	0.1	0.13	0.14	0.1	0.04	0.06	0.06	0.11	0.04	0.06	0.03	0.1	0.14
lcl\|BLLF01002604.1_cds_GFH24680.1_19157 (GFH24680)	0.03	1.0	0.0	0.07	0.02	0.07	0.11	0.04	0.17	0.13	0.04	0.03	0.1	0.03	0.39	0.0	0.12	0.37	0.18	0.15	0.16	0.0	0.24	0.08	0.11	0.12
lcl\|BLLF01002666.1_cds_GFH24912.1_19389 (GFH24912)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0
lcl\|BLLF01002703.1_cds_GFH25056.1_19533 (GFH25056)	0.01	1.0	0.1	0.07	0.07	0.1	0.23	0.06	0.26	0.15	0.06	0.07	0.23	0.03	0.2	0.07	0.11	0.02	0.06	0.06	0.03	0.04	0.02	0.01	0.07	0.13
lcl\|BLLF01002786.1_cds_GFH25343.1_19820 (GFH25343)	0.09	1.0	0.04	0.0	0.06	0.09	0.07	0.03	0.06	0.21	0.06	0.05	0.07	0.03	0.05	0.38	0.29	0.17	0.09	0.09	0.19	0.07	0.11	0.03	0.17	0.17
lcl\|BLLF01002898.1_cds_GFH25718.1_20195 (GFH25718)	0.1	1.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.08	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.1	0.07	0.05	0.02	0.05	0.1	0.05	0.04	0.01	0.08	0.08
lcl\|BLLF01003031.1_cds_GFH26124.1_20601 (GFH26124)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003229.1_cds_GFH26753.1_21230 (GFH26753)	0.0	1.0	0.0	0.03	0.0	0.01	0.1	0.0	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01
lcl\|BLLF01003395.1_cds_GFH27223.1_21700 (GFH27223)	0.09	1.0	0.0	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.1	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.37	0.12	0.12	0.16	0.21	0.22	0.09	0.18	0.07	0.21	0.25
lcl\|BLLF01003408.1_cds_GFH27251.1_21728 (GFH27251)	0.01	1.0	0.0	0.05	0.06	0.04	0.01	0.12	0.0	0.06	0.04	0.05	0.03	0.08	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.2	0.01	0.01	0.0	0.0	0.08	0.29
lcl\|BLLF01003458.1_cds_GFH27392.1_21869 (GFH27392)	0.06	1.0	0.0	0.0	0.06	0.06	0.06	0.04	0.11	0.32	0.04	0.07	0.14	0.03	0.15	0.24	0.14	0.04	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.0	0.09	0.08
lcl\|BLLF01003477.1_cds_GFH27443.1_21920 (GFH27443)	0.0	1.0	0.04	0.0	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.04	0.06
lcl\|BLLF01003690.1_cds_GFH27963.1_22440 (GFH27963)	0.01	1.0	0.0	0.02	0.02	0.05	0.16	0.01	0.16	0.2	0.05	0.04	0.15	0.01	0.1	0.06	0.01	0.04	0.15	0.02	0.06	0.05	0.02	0.0	0.06	0.1
lcl\|BLLF01003690.1_cds_GFH27964.1_22441 (GFH27964)	0.01	1.0	0.0	0.03	0.04	0.1	0.28	0.03	0.26	0.33	0.07	0.08	0.26	0.02	0.16	0.05	0.06	0.04	0.08	0.01	0.06	0.08	0.03	0.01	0.11	0.18
lcl\|BLLF01003690.1_cds_GFH27965.1_22442 (GFH27965)	0.0	1.0	0.0	0.01	0.05	0.04	0.02	0.0	0.08	0.0	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.18	0.54	0.0	0.11	0.0	0.05	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003760.1_cds_GFH28147.1_22624 (GFH28147)	0.05	1.0	0.07	0.01	0.04	0.07	0.06	0.04	0.04	0.17	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.22	0.18	0.14	0.1	0.12	0.13	0.08	0.15	0.05	0.05	0.04
lcl\|BLLF01004089.1_cds_GFH28897.1_23374 (GFH28897)	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.09	0.11	0.06	0.06	0.06	0.06	0.04	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004194.1_cds_GFH29124.1_23601 (GFH29124)	0.02	1.0	0.18	0.11	0.21	0.22	0.45	0.13	0.42	0.44	0.17	0.16	0.34	0.07	0.29	0.46	0.67	0.1	0.14	0.25	0.15	0.14	0.09	0.09	0.15	0.22
lcl\|BLLF01004477.1_cds_GFH29690.1_24167 (GFH29690)	0.03	1.0	0.0	0.0	0.12	0.12	0.09	0.09	0.09	0.26	0.13	0.1	0.13	0.09	0.08	0.19	0.26	0.04	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.09	0.11
lcl\|BLLF01004617.1_cds_GFH29962.1_24439 (GFH29962)	0.16	1.0	0.11	0.11	0.15	0.11	0.21	0.11	0.23	0.36	0.1	0.12	0.13	0.06	0.17	0.15	0.22	0.14	0.09	0.21	0.19	0.12	0.1	0.11	0.29	0.35
lcl\|BLLF01005137.1_cds_GFH30773.1_25250 (GFH30773)	0.0	1.0	0.09	0.0	0.06	0.05	0.05	0.1	0.04	0.23	0.06	0.06	0.08	0.07	0.09	0.11	0.14	0.02	0.25	0.17	0.05	0.2	0.03	0.02	0.14	0.09
lcl\|BLLF01005691.1_cds_GFH31521.1_25998 (GFH31521)	0.03	1.0	0.07	0.07	0.14	0.16	0.35	0.09	0.37	0.21	0.11	0.1	0.26	0.05	0.24	0.08	0.09	0.03	0.07	0.13	0.05	0.08	0.03	0.02	0.09	0.2
lcl\|BLLF01005697.1_cds_GFH31528.1_26005 (GFH31528)	0.06	1.0	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01
lcl\|BLLF01006375.1_cds_GFH32194.1_26671 (GFH32194)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.07	0.19	0.12	0.04	0.26	0.13	0.03	0.04	0.02	0.02	0.1	0.03	0.02	0.05	0.01	0.05	0.06	0.03	0.05	0.0	0.07	0.03
lcl\|BLLF01006618.1_cds_GFH32416.1_26893 (GFH32416)	0.03	1.0	0.0	0.0	0.04	0.03	0.02	0.08	0.02	0.23	0.04	0.03	0.06	0.06	0.04	0.08	0.21	0.02	0.2	0.13	0.0	0.2	0.0	0.0	0.04	0.05
lcl\|BLLF01006836.1_cds_GFH32583.1_27060 (GFH32583)	0.01	1.0	0.13	0.12	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.11	0.08	0.05	0.04	0.15	0.08	0.06	0.0	0.0
lcl\|BLLF01007469.1_cds_GFH32965.1_27442 (GFH32965)	0.04	1.0	0.07	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.3	0.09	0.04	0.07	0.09	0.06	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01
lcl\|BLLF01007570.1_cds_GFH33013.1_27490 (GFH33013)	0.02	1.0	0.0	0.02	0.05	0.15	0.23	0.04	0.21	0.2	0.04	0.05	0.2	0.0	0.14	0.07	0.1	0.0	0.04	0.0	0.0	0.08	0.0	0.02	0.09	0.17
lcl\|BLLF01007991.1_cds_GFH33205.1_27682 (GFH33205)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.02	0.14	0.03	0.08	0.14	0.07	0.04	0.1	0.08	0.02	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.07	0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)