Heatmap: Cluster_239 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000091.1_cds_GFH07377.1_1854 (GFH07377)	0.17	0.24	0.4	0.37	0.35	0.18	0.25	0.43	0.29	0.42	0.38	0.2	0.26	0.32	0.24	0.79	0.69	0.74	0.5	0.78	0.49	0.5	0.86	1.0	0.23	0.16
lcl\|BLLF01000109.1_cds_GFH07671.1_2148 (GFH07671)	0.07	0.0	0.0	0.33	0.05	0.05	0.1	0.01	0.08	0.3	0.02	0.05	0.05	0.01	0.09	0.43	0.64	0.34	0.34	0.29	0.15	0.18	1.0	0.64	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000124.1_cds_GFH07902.1_2379 (GFH07902)	0.27	0.04	0.0	0.18	0.37	0.09	0.21	0.11	0.16	0.18	0.52	0.4	0.34	0.28	0.42	0.19	0.95	0.96	0.2	0.55	0.74	0.6	0.95	1.0	0.24	0.15
lcl\|BLLF01000127.1_cds_GFH07947.1_2424 (GFH07947)	0.02	0.06	0.06	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.24	0.71	0.21	0.22	0.9	0.3	0.62	1.0	0.01	0.01
lcl\|BLLF01000131.1_cds_GFH08010.1_2487 (GFH08010)	0.33	0.02	0.0	0.0	0.12	0.08	0.13	0.14	0.23	0.56	0.06	0.1	0.25	0.08	0.19	0.95	1.0	0.87	0.19	0.26	0.43	0.0	0.92	0.87	0.4	0.36
lcl\|BLLF01000239.1_cds_GFH09491.1_3968 (GFH09491)	0.23	0.17	0.0	0.23	0.01	0.03	0.06	0.01	0.08	0.7	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.4	0.29	0.39	0.12	0.0	0.41	0.25	1.0	0.71	0.02	0.05
lcl\|BLLF01000247.1_cds_GFH09595.1_4072 (GFH09595)	0.18	0.05	0.0	0.32	0.11	0.08	0.16	0.22	0.1	0.27	0.22	0.23	0.29	0.33	0.07	0.38	0.49	0.77	0.26	0.11	1.0	0.0	0.55	0.84	0.42	0.29
lcl\|BLLF01000325.1_cds_GFH10556.1_5033 (GFH10556)	0.45	0.11	0.38	0.0	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.28	0.02	0.03	0.0	0.02	0.02	1.0	0.73	0.88	0.28	0.84	0.64	0.83	0.72	0.89	0.07	0.12
lcl\|BLLF01000360.1_cds_GFH10935.1_5412 (GFH10935)	0.19	0.16	0.0	0.03	0.11	0.12	0.25	0.04	0.13	0.25	0.11	0.08	0.15	0.12	0.15	0.76	0.45	0.24	0.0	0.07	0.69	0.51	1.0	0.66	0.15	0.22
lcl\|BLLF01000389.1_cds_GFH11279.1_5756 (GFH11279)	0.15	0.19	0.0	0.0	0.19	0.26	0.25	0.14	0.25	0.49	0.31	0.24	0.35	0.25	0.24	0.73	1.0	0.73	0.1	0.24	0.79	0.25	0.82	0.91	0.65	0.51
lcl\|BLLF01000412.1_cds_GFH11534.1_6011 (GFH11534)	0.0	0.0	0.0	0.15	0.1	0.2	0.05	0.19	0.34	0.99	0.2	0.1	0.16	0.1	0.0	0.0	0.0	0.72	0.54	0.48	1.0	0.57	0.72	0.65	0.0	0.08
lcl\|BLLF01000680.1_cds_GFH14045.1_8522 (GFH14045)	0.06	0.0	0.0	0.19	0.04	0.02	0.07	0.11	0.07	0.19	0.05	0.0	0.13	0.08	0.06	0.0	0.29	1.0	0.14	0.31	0.88	0.24	0.27	0.97	0.03	0.04
lcl\|BLLF01000795.1_cds_GFH15021.1_9498 (GFH15021)	0.25	0.16	0.0	0.03	0.12	0.17	0.08	0.08	0.15	0.1	0.17	0.14	0.15	0.08	0.17	0.51	0.46	0.56	0.19	0.13	0.55	0.5	1.0	0.76	0.26	0.03
lcl\|BLLF01000840.1_cds_GFH15351.1_9828 (GFH15351)	0.23	0.17	0.52	0.23	0.16	0.11	0.16	0.24	0.19	1.0	0.16	0.1	0.23	0.23	0.21	0.72	0.57	0.92	0.29	0.4	0.86	0.51	0.89	0.98	0.06	0.07
lcl\|BLLF01000848.1_cds_GFH15421.1_9898 (GFH15421)	0.09	0.09	0.08	0.21	0.39	0.44	0.46	0.23	0.48	0.91	0.44	0.39	0.38	0.33	0.24	0.86	0.56	1.0	0.49	0.54	0.84	0.93	0.93	0.96	0.64	0.65
lcl\|BLLF01000877.1_cds_GFH15635.1_10112 (GFH15635)	0.02	0.0	0.0	0.15	0.19	0.14	0.2	0.26	0.29	1.0	0.18	0.14	0.31	0.17	0.34	0.07	0.07	0.81	0.32	0.42	0.88	0.2	0.81	0.77	0.28	0.2
lcl\|BLLF01000994.1_cds_GFH16409.1_10886 (GFH16409)	0.05	0.0	0.0	0.0	0.03	0.09	0.05	0.11	0.14	1.0	0.07	0.06	0.14	0.14	0.07	0.0	0.17	0.64	0.41	0.23	0.76	0.0	0.27	0.93	0.02	0.04
lcl\|BLLF01001012.1_cds_GFH16539.1_11016 (GFH16539)	0.32	0.16	0.83	0.32	0.12	0.06	0.08	0.09	0.1	0.07	0.03	0.11	0.08	0.06	0.08	0.6	0.75	0.68	0.45	0.56	0.93	0.69	0.81	1.0	0.16	0.19
lcl\|BLLF01001089.1_cds_GFH17051.1_11528 (GFH17051)	0.22	0.0	0.0	0.16	0.0	0.07	0.21	0.11	0.05	0.71	0.17	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.39	0.59	1.0	0.54	0.62	0.78	0.62	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001336.1_cds_GFH18678.1_13155 (GFH18678)	0.07	0.0	0.0	0.1	0.08	0.12	0.16	0.03	0.34	0.33	0.09	0.12	0.37	0.05	0.34	0.0	0.0	0.6	0.18	0.31	0.66	0.38	0.72	1.0	0.25	0.22
lcl\|BLLF01001354.1_cds_GFH18776.1_13253 (GFH18776)	0.35	0.05	0.0	0.0	0.08	0.15	0.13	0.12	0.17	0.05	0.07	0.13	0.11	0.08	0.15	0.1	0.14	0.83	0.05	0.14	0.53	0.76	0.66	1.0	0.39	0.3
lcl\|BLLF01001359.1_cds_GFH18798.1_13275 (GFH18798)	0.2	0.0	0.0	0.0	0.11	0.11	0.0	0.25	0.12	0.66	0.02	0.08	0.11	0.07	0.08	0.0	0.13	0.51	0.0	0.83	0.61	0.33	1.0	0.85	0.12	0.06
lcl\|BLLF01001888.1_cds_GFH21712.1_16189 (GFH21712)	0.0	0.07	0.0	0.3	0.26	0.12	0.2	0.16	0.22	0.52	0.29	0.2	0.27	0.18	0.23	0.53	0.9	1.0	0.14	0.32	0.88	0.2	0.69	0.83	0.25	0.2
lcl\|BLLF01001902.1_cds_GFH21769.1_16246 (GFH21769)	0.06	0.08	0.0	0.34	0.08	0.17	0.18	0.04	0.31	0.39	0.09	0.14	0.12	0.15	0.18	0.5	0.34	0.92	0.11	0.06	0.54	0.11	0.67	1.0	0.24	0.27
lcl\|BLLF01002375.1_cds_GFH23832.1_18309 (GFH23832)	0.68	0.5	0.47	0.34	0.35	0.34	0.35	0.4	0.4	0.55	0.35	0.38	0.34	0.3	0.42	0.77	0.62	0.84	0.3	0.38	1.0	0.84	0.82	1.0	0.4	0.31
lcl\|BLLF01002520.1_cds_GFH24377.1_18854 (GFH24377)	0.13	0.06	0.0	0.32	0.18	0.16	0.1	0.43	0.29	0.29	0.12	0.12	0.21	0.24	0.26	0.14	0.0	0.86	0.16	0.64	0.59	0.51	0.74	1.0	0.02	0.07
lcl\|BLLF01002574.1_cds_GFH24575.1_19052 (GFH24575)	0.33	0.22	0.6	0.5	0.39	0.28	0.27	0.14	0.22	0.42	0.33	0.25	0.26	0.33	0.21	0.57	0.7	1.0	0.37	0.81	0.97	0.29	0.76	0.88	0.43	0.45
lcl\|BLLF01002643.1_cds_GFH24829.1_19306 (GFH24829)	0.31	0.09	0.59	0.31	0.0	0.08	0.12	0.04	0.08	0.39	0.06	0.07	0.13	0.12	0.17	1.0	0.71	0.65	0.3	0.46	0.89	0.36	0.84	0.7	0.06	0.06
lcl\|BLLF01002755.1_cds_GFH25225.1_19702 (GFH25225)	0.41	0.24	0.0	0.12	0.3	0.24	0.3	0.19	0.31	0.93	0.34	0.25	0.28	0.29	0.2	0.55	0.41	0.93	0.42	0.59	1.0	0.53	0.9	0.64	0.55	0.55
lcl\|BLLF01002832.1_cds_GFH25499.1_19976 (GFH25499)	0.09	0.0	0.0	0.0	0.13	0.18	0.19	0.12	0.21	0.79	0.16	0.17	0.15	0.09	0.17	0.31	0.43	0.73	0.39	0.38	0.98	0.33	1.0	0.25	0.45	0.41
lcl\|BLLF01002842.1_cds_GFH25538.1_20015 (GFH25538)	0.29	0.0	0.0	0.22	0.14	0.11	0.15	0.09	0.18	0.84	0.21	0.17	0.19	0.17	0.16	0.63	0.49	0.94	0.22	0.25	1.0	0.45	0.86	0.4	0.48	0.59
lcl\|BLLF01002977.1_cds_GFH25972.1_20449 (GFH25972)	0.15	0.19	0.16	0.32	0.25	0.27	0.26	0.16	0.27	0.23	0.22	0.15	0.23	0.17	0.18	0.7	0.62	0.57	0.0	0.25	0.53	0.2	1.0	0.82	0.28	0.17
lcl\|BLLF01003178.1_cds_GFH26604.1_21081 (GFH26604)	0.32	0.0	0.0	0.35	0.15	0.07	0.26	0.11	0.18	0.0	0.16	0.07	0.14	0.19	0.26	0.46	0.34	0.71	0.18	0.0	0.49	0.0	0.71	1.0	0.38	0.22
lcl\|BLLF01003753.1_cds_GFH28121.1_22598 (GFH28121)	0.29	0.09	0.0	0.3	0.31	0.31	0.34	0.2	0.27	0.51	0.32	0.31	0.36	0.24	0.29	0.54	0.89	0.95	0.12	0.2	0.69	0.28	0.97	1.0	0.28	0.29
lcl\|BLLF01003780.1_cds_GFH28199.1_22676 (GFH28199)	0.08	0.06	0.0	0.05	0.06	0.05	0.08	0.08	0.07	0.35	0.09	0.04	0.11	0.06	0.09	0.28	0.1	0.65	0.11	0.03	1.0	0.11	0.43	0.71	0.13	0.1
lcl\|BLLF01004154.1_cds_GFH29044.1_23521 (GFH29044)	0.3	0.14	0.34	0.61	0.2	0.18	0.15	0.11	0.14	0.21	0.13	0.17	0.11	0.1	0.15	1.0	0.7	0.48	0.12	0.35	0.52	0.17	0.62	0.73	0.16	0.17
lcl\|BLLF01004379.1_cds_GFH29489.1_23966 (GFH29489)	0.31	0.0	0.0	0.24	0.36	0.46	0.47	0.34	0.3	0.58	0.31	0.21	0.44	0.49	0.33	0.45	0.94	0.71	0.42	0.3	0.97	0.56	0.7	1.0	0.42	0.41
lcl\|BLLF01004465.1_cds_GFH29667.1_24144 (GFH29667)	0.29	0.31	0.0	0.07	0.26	0.2	0.26	0.09	0.25	0.23	0.15	0.27	0.15	0.23	0.14	0.32	0.32	1.0	0.13	0.14	0.92	0.79	0.91	0.88	0.33	0.23
lcl\|BLLF01004594.1_cds_GFH29916.1_24393 (GFH29916)	0.39	0.05	0.0	0.02	0.16	0.32	0.2	0.19	0.23	0.91	0.22	0.34	0.43	0.17	0.11	0.46	0.34	0.97	0.11	0.31	0.99	0.4	1.0	0.72	0.35	0.25
lcl\|BLLF01005192.1_cds_GFH30857.1_25334 (GFH30857)	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.63	0.0	0.0	0.02	0.02	0.01	0.44	0.26	0.28	0.52	0.06	0.86	0.0	0.48	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01005590.1_cds_GFH31392.1_25869 (GFH31392)	0.2	0.0	0.0	0.01	0.02	0.05	0.05	0.02	0.1	0.67	0.08	0.1	0.1	0.08	0.06	0.69	0.25	0.7	0.11	0.08	0.56	0.15	1.0	0.65	0.34	0.41
lcl\|BLLF01005976.1_cds_GFH31821.1_26298 (GFH31821)	0.11	0.06	0.0	0.02	0.15	0.12	0.12	0.11	0.1	0.65	0.15	0.17	0.27	0.25	0.08	0.23	0.37	0.8	0.3	0.37	1.0	0.38	0.83	0.53	0.44	0.33
lcl\|BLLF01007131.1_cds_GFH32786.1_27263 (GFH32786)	0.02	0.0	0.0	0.15	0.36	0.26	0.34	0.1	0.29	0.52	0.32	0.36	0.31	0.23	0.14	0.64	0.2	1.0	0.21	0.18	0.49	0.57	0.78	0.88	0.36	0.13
lcl\|BLLF01009691.1_cds_GFH33797.1_28274 (GFH33797)	0.33	0.07	0.0	0.25	0.39	0.39	0.45	0.16	0.28	1.0	0.38	0.26	0.33	0.28	0.37	0.55	0.59	0.83	0.24	0.39	0.67	0.64	0.83	0.8	0.49	0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)