Heatmap: Cluster_105 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000004.1_cds_GFH05626.1_103 (GFH05626)	0.34	0.15	0.55	0.06	0.19	0.18	0.15	0.15	0.18	0.09	0.2	0.17	0.19	0.14	0.12	0.52	1.0	0.37	0.39	0.35	0.59	0.78	0.29	0.01	0.3	0.2
lcl\|BLLF01000028.1_cds_GFH06230.1_707 (GFH06230)	0.73	0.51	0.56	0.35	0.45	0.39	0.45	0.25	0.47	0.56	0.46	0.39	0.47	0.32	0.47	0.38	0.45	0.37	0.67	0.65	0.4	1.0	0.47	0.16	0.22	0.16
lcl\|BLLF01000044.1_cds_GFH06543.1_1020 (GFH06543)	0.54	0.46	0.6	0.28	0.43	0.5	0.69	0.3	0.53	0.41	0.45	0.4	0.31	0.38	0.48	1.0	0.77	0.64	0.43	0.38	0.65	0.66	0.66	0.27	0.47	0.44
lcl\|BLLF01000072.1_cds_GFH07062.1_1539 (GFH07062)	0.43	0.33	0.74	0.2	0.73	0.62	0.65	0.39	0.62	0.39	0.75	0.52	0.66	0.45	0.57	0.82	1.0	0.76	0.35	0.35	0.76	0.32	0.67	0.4	0.48	0.45
lcl\|BLLF01000076.1_cds_GFH07128.1_1605 (GFH07128)	0.08	0.04	0.4	0.11	0.06	0.09	0.11	0.07	0.16	0.0	0.18	0.05	0.08	0.11	0.08	0.51	1.0	0.03	0.05	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.17	0.09
lcl\|BLLF01000076.1_cds_GFH07139.1_1616 (GFH07139)	0.78	0.45	0.55	0.2	0.42	0.56	0.7	0.28	0.51	0.68	0.38	0.43	0.53	0.27	0.42	0.96	1.0	0.49	0.26	0.24	0.45	0.83	0.64	0.2	0.51	0.38
lcl\|BLLF01000218.1_cds_GFH09222.1_3699 (GFH09222)	0.5	0.26	0.25	0.03	0.2	0.28	0.35	0.13	0.3	1.0	0.2	0.23	0.28	0.15	0.27	0.61	0.64	0.47	0.2	0.26	0.44	0.75	0.57	0.08	0.27	0.22
lcl\|BLLF01000219.1_cds_GFH09246.1_3723 (GFH09246)	0.58	0.5	0.5	0.49	0.62	0.63	0.54	0.63	0.62	0.75	0.49	0.5	0.47	0.45	0.47	0.86	1.0	0.6	0.49	0.36	0.64	0.8	0.52	0.43	0.36	0.31
lcl\|BLLF01000233.1_cds_GFH09426.1_3903 (GFH09426)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	1.0	0.16	0.24	0.0	0.0	0.3	0.0	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000309.1_cds_GFH10370.1_4847 (GFH10370)	0.38	0.28	0.72	0.16	0.24	0.29	0.27	0.16	0.26	0.31	0.27	0.31	0.34	0.27	0.29	0.66	1.0	0.42	0.35	0.25	0.61	0.34	0.52	0.12	0.21	0.19
lcl\|BLLF01000325.1_cds_GFH10545.1_5022 (GFH10545)	0.42	0.39	0.24	0.32	0.41	0.31	0.46	0.31	0.41	1.0	0.3	0.27	0.36	0.25	0.38	0.65	0.67	0.39	0.25	0.25	0.62	0.47	0.52	0.16	0.41	0.24
lcl\|BLLF01000380.1_cds_GFH11174.1_5651 (GFH11174)	0.12	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.3	0.05	0.33	0.0	0.0	0.0	0.06	0.04	0.14	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000387.1_cds_GFH11251.1_5728 (GFH11251)	0.0	0.07	0.0	0.0	0.04	0.15	0.16	0.1	0.04	0.48	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.3	0.06
lcl\|BLLF01000394.1_cds_GFH11333.1_5810 (GFH11333)	0.13	0.18	0.31	0.04	0.48	0.46	0.4	0.44	0.33	1.0	0.61	0.42	0.21	0.35	0.2	0.36	0.54	0.17	0.17	0.19	0.15	0.07	0.17	0.07	0.18	0.16
lcl\|BLLF01000438.1_cds_GFH11819.1_6296 (GFH11819)	0.0	0.02	0.0	0.0	0.31	0.3	0.18	0.26	0.22	0.37	0.2	0.13	0.25	0.25	0.16	0.0	1.0	0.27	0.0	0.23	0.56	0.22	0.0	0.04	0.28	0.32
lcl\|BLLF01000462.1_cds_GFH12044.1_6521 (GFH12044)	0.43	0.05	0.42	0.0	0.43	0.2	0.48	0.26	0.42	0.06	0.52	0.4	0.58	0.27	0.48	0.87	0.25	0.2	1.0	0.34	0.55	0.84	0.13	0.02	0.0	0.02
lcl\|BLLF01000488.1_cds_GFH12300.1_6777 (GFH12300)	0.53	0.35	0.65	0.24	0.57	0.38	0.47	0.27	0.46	0.66	0.56	0.39	0.4	0.27	0.43	0.75	1.0	0.28	0.19	0.35	0.24	0.33	0.22	0.16	0.15	0.19
lcl\|BLLF01000503.1_cds_GFH12433.1_6910 (GFH12433)	0.22	0.18	0.47	0.27	0.46	0.3	0.35	0.24	0.3	0.33	0.44	0.25	0.21	0.26	0.25	0.79	1.0	0.33	0.2	0.26	0.27	0.48	0.21	0.22	0.3	0.21
lcl\|BLLF01000525.1_cds_GFH12639.1_7116 (GFH12639)	0.24	0.26	0.47	0.19	0.15	0.11	0.18	0.09	0.19	0.17	0.15	0.09	0.14	0.07	0.21	0.27	1.0	0.2	0.1	0.16	0.21	0.18	0.15	0.14	0.11	0.09
lcl\|BLLF01000671.1_cds_GFH13963.1_8440 (GFH13963)	0.64	0.5	0.3	0.5	0.74	0.67	0.66	0.49	0.61	0.77	0.78	0.63	0.71	0.59	0.44	0.96	1.0	0.71	0.63	0.22	0.85	0.86	0.45	0.17	0.36	0.29
lcl\|BLLF01000714.1_cds_GFH14340.1_8817 (GFH14340)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000842.1_cds_GFH15371.1_9848 (GFH15371)	1.0	0.6	0.64	0.65	0.8	0.6	0.66	0.53	0.78	0.62	0.74	0.61	0.71	0.58	0.79	0.38	0.41	0.67	0.69	0.78	0.71	0.8	0.53	0.21	0.32	0.18
lcl\|BLLF01001185.1_cds_GFH17672.1_12149 (GFH17672)	0.1	0.09	0.0	0.06	0.48	0.38	0.32	0.37	0.32	1.0	0.38	0.26	0.07	0.3	0.13	0.19	0.38	0.2	0.23	0.26	0.07	0.0	0.1	0.04	0.06	0.07
lcl\|BLLF01001213.1_cds_GFH17859.1_12336 (GFH17859)	0.51	0.44	0.46	0.58	0.45	0.34	0.36	0.41	0.38	0.67	0.44	0.4	0.4	0.34	0.42	0.79	1.0	0.29	0.55	0.52	0.25	0.69	0.19	0.2	0.19	0.17
lcl\|BLLF01001243.1_cds_GFH18062.1_12539 (GFH18062)	0.1	0.0	0.0	0.14	0.44	0.05	0.05	0.0	0.0	1.0	0.2	0.0	0.08	0.05	0.2	0.0	0.75	0.17	0.0	0.0	0.24	0.0	0.17	0.08	0.04	0.5
lcl\|BLLF01001271.1_cds_GFH18252.1_12729 (GFH18252)	0.42	0.29	0.37	0.18	0.41	0.55	0.53	0.3	0.43	1.0	0.44	0.36	0.43	0.39	0.33	0.86	0.59	0.58	0.21	0.23	0.68	0.42	0.58	0.18	0.35	0.27
lcl\|BLLF01001412.1_cds_GFH19142.1_13619 (GFH19142)	0.41	0.41	0.74	0.21	0.48	0.55	0.55	0.42	0.57	0.36	0.46	0.35	0.46	0.36	0.43	0.72	1.0	0.79	0.38	0.33	0.74	0.26	0.59	0.18	0.38	0.49
lcl\|BLLF01001526.1_cds_GFH19827.1_14304 (GFH19827)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.11	0.17	0.07	0.0	1.0	0.12	0.08	0.08	0.08	0.18	0.0	0.79	0.28	0.0	0.0	0.38	0.0	0.27	0.02	0.06	0.26
lcl\|BLLF01001580.1_cds_GFH20130.1_14607 (GFH20130)	0.26	0.32	0.71	0.16	0.51	0.59	0.55	0.4	0.51	0.32	0.58	0.52	0.58	0.51	0.57	0.91	1.0	0.7	0.49	0.29	0.67	0.73	0.48	0.3	0.34	0.3
lcl\|BLLF01001640.1_cds_GFH20462.1_14939 (GFH20462)	0.26	0.07	0.0	0.22	0.33	0.29	0.2	0.1	0.11	0.48	0.12	0.07	0.04	0.31	0.03	0.0	1.0	0.26	0.0	0.0	0.73	0.0	0.52	0.18	0.36	0.25
lcl\|BLLF01001652.1_cds_GFH20525.1_15002 (GFH20525)	0.29	0.1	0.15	0.03	0.41	0.41	0.35	0.17	0.26	0.7	0.33	0.29	0.23	0.15	0.22	1.0	0.23	0.41	0.15	0.17	0.43	0.21	0.46	0.11	0.2	0.21
lcl\|BLLF01001677.1_cds_GFH20669.1_15146 (GFH20669)	0.79	0.86	1.0	0.65	0.81	0.55	0.64	0.54	0.72	0.66	0.74	0.54	0.73	0.57	0.78	0.47	0.52	0.82	0.52	0.7	0.81	0.73	0.64	0.25	0.34	0.23
lcl\|BLLF01001689.1_cds_GFH20740.1_15217 (GFH20740)	0.52	0.36	0.44	0.36	0.59	0.49	0.35	0.31	0.47	0.36	0.57	0.47	0.41	0.37	0.47	0.3	0.66	0.64	0.65	0.86	0.73	1.0	0.59	0.17	0.24	0.21
lcl\|BLLF01001759.1_cds_GFH21085.1_15562 (GFH21085)	0.54	0.38	0.56	0.17	0.53	0.4	0.34	0.21	0.25	0.36	0.5	0.51	0.28	0.26	0.3	1.0	0.78	0.56	0.51	0.21	0.35	0.23	0.56	0.05	0.17	0.21
lcl\|BLLF01001765.1_cds_GFH21123.1_15600 (GFH21123)	0.07	0.0	0.0	0.56	0.03	0.0	0.03	0.06	0.06	1.0	0.23	0.0	0.19	0.1	0.03	0.0	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001769.1_cds_GFH21145.1_15622 (GFH21145)	0.35	0.0	0.63	0.27	0.13	0.15	0.13	0.13	0.1	0.28	0.16	0.12	0.1	0.12	0.06	0.49	1.0	0.12	0.26	0.23	0.22	0.08	0.25	0.22	0.15	0.22
lcl\|BLLF01001777.1_cds_GFH21198.1_15675 (GFH21198)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.1	0.0	0.0	0.0	0.66	0.1	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.97	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.17
lcl\|BLLF01001857.1_cds_GFH21577.1_16054 (GFH21577)	0.15	0.09	0.0	0.0	0.69	0.48	0.62	0.36	0.37	1.0	0.35	0.28	0.29	0.16	0.17	1.0	0.49	0.5	0.12	0.07	0.61	0.14	0.52	0.15	0.29	0.31
lcl\|BLLF01002128.1_cds_GFH22810.1_17287 (GFH22810)	0.03	0.04	0.03	0.0	0.2	0.23	0.17	0.21	0.25	0.9	0.17	0.22	0.3	0.1	0.29	0.1	1.0	0.13	0.06	0.25	0.13	0.54	0.1	0.09	0.09	0.08
lcl\|BLLF01002230.1_cds_GFH23263.1_17740 (GFH23263)	0.31	0.0	0.48	0.03	0.15	0.12	0.38	0.15	0.25	0.5	0.15	0.09	0.18	0.12	0.17	1.0	0.37	0.47	0.47	0.27	0.65	0.49	0.23	0.18	0.25	0.16
lcl\|BLLF01002310.1_cds_GFH23596.1_18073 (GFH23596)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002372.1_cds_GFH23824.1_18301 (GFH23824)	0.7	0.5	0.56	0.3	1.0	0.65	0.55	0.77	0.6	0.65	0.91	0.65	0.73	0.63	0.66	0.94	0.76	0.93	0.69	0.65	0.93	0.96	0.83	0.33	0.42	0.25
lcl\|BLLF01002479.1_cds_GFH24235.1_18712 (GFH24235)	0.46	0.49	0.82	0.44	0.6	0.59	0.69	0.28	0.57	0.43	0.59	0.4	0.41	0.37	0.55	0.78	1.0	0.54	0.3	0.63	0.59	0.33	0.43	0.15	0.08	0.08
lcl\|BLLF01002516.1_cds_GFH24364.1_18841 (GFH24364)	0.48	0.16	0.34	0.2	0.78	0.53	0.52	0.47	0.36	1.0	0.52	0.43	0.38	0.27	0.24	0.22	0.81	0.19	0.15	0.49	0.09	0.11	0.08	0.14	0.07	0.1
lcl\|BLLF01002933.1_cds_GFH25840.1_20317 (GFH25840)	0.35	0.0	0.0	0.0	0.26	0.23	0.09	0.18	0.15	0.46	0.06	0.2	0.16	0.33	0.13	0.0	1.0	0.51	0.19	0.11	0.35	0.0	0.5	0.2	0.23	0.18
lcl\|BLLF01002955.1_cds_GFH25916.1_20393 (GFH25916)	0.38	0.0	0.0	0.12	0.24	0.24	0.08	0.04	0.19	0.26	0.27	0.2	0.13	0.25	0.13	0.0	0.82	0.58	0.43	0.0	1.0	0.0	0.29	0.33	0.33	0.27
lcl\|BLLF01003173.1_cds_GFH26589.1_21066 (GFH26589)	0.31	0.0	0.0	0.0	0.11	0.07	0.15	0.13	0.12	0.48	0.07	0.07	0.08	0.05	0.3	0.34	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.02	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003272.1_cds_GFH26882.1_21359 (GFH26882)	0.54	0.43	0.64	0.26	0.72	0.64	0.56	0.53	0.53	0.48	0.64	0.53	0.7	0.47	0.56	0.69	0.79	0.69	0.43	0.37	1.0	0.69	0.62	0.16	0.22	0.17
lcl\|BLLF01003272.1_cds_GFH26883.1_21360 (GFH26883)	0.57	0.53	0.77	0.26	0.86	0.66	0.59	0.65	0.66	0.39	0.81	0.56	0.68	0.53	0.62	0.8	1.0	0.86	0.56	0.44	0.83	0.71	0.69	0.31	0.34	0.24
lcl\|BLLF01003365.1_cds_GFH27145.1_21622 (GFH27145)	0.41	0.34	0.78	0.17	0.32	0.22	0.34	0.24	0.35	0.27	0.39	0.25	0.31	0.21	0.37	0.27	1.0	0.3	0.3	0.27	0.28	0.29	0.22	0.21	0.35	0.26
lcl\|BLLF01003444.1_cds_GFH27357.1_21834 (GFH27357)	0.06	0.22	0.38	0.38	0.28	0.23	0.26	0.13	0.28	0.17	0.28	0.27	0.26	0.2	0.24	0.58	1.0	0.42	0.12	0.23	0.28	0.15	0.38	0.22	0.17	0.18
lcl\|BLLF01003669.1_cds_GFH27910.1_22387 (GFH27910)	0.15	0.0	0.54	0.11	0.28	0.26	0.27	0.1	0.18	0.6	0.14	0.13	0.1	0.12	0.23	0.51	1.0	0.92	0.0	0.34	0.41	0.0	0.52	0.04	0.18	0.31
lcl\|BLLF01003875.1_cds_GFH28432.1_22909 (GFH28432)	0.3	0.19	0.65	0.23	0.49	0.44	0.66	0.22	0.43	0.47	0.43	0.35	0.43	0.29	0.4	0.8	1.0	0.25	0.35	0.48	0.2	0.27	0.25	0.06	0.62	0.43
lcl\|BLLF01003895.1_cds_GFH28479.1_22956 (GFH28479)	0.08	0.22	0.36	0.21	0.35	0.34	0.33	0.23	0.27	0.19	0.29	0.26	0.3	0.23	0.28	0.81	1.0	0.35	0.29	0.27	0.37	0.3	0.33	0.21	0.22	0.17
lcl\|BLLF01003977.1_cds_GFH28650.1_23127 (GFH28650)	0.24	0.27	0.6	0.4	0.49	0.46	0.44	0.21	0.3	0.11	0.49	0.37	0.39	0.34	0.34	1.0	0.86	0.62	0.36	0.25	0.49	0.14	0.6	0.11	0.24	0.22
lcl\|BLLF01003989.1_cds_GFH28678.1_23155 (GFH28678)	0.35	0.25	0.29	0.33	0.31	0.23	0.45	0.22	0.5	0.44	0.32	0.26	0.33	0.23	0.49	0.46	1.0	0.36	0.1	0.13	0.37	0.17	0.26	0.2	0.24	0.19
lcl\|BLLF01003989.1_cds_GFH28679.1_23156 (GFH28679)	0.29	0.24	0.51	0.24	0.28	0.23	0.33	0.2	0.38	0.32	0.32	0.21	0.31	0.2	0.38	0.36	1.0	0.2	0.13	0.16	0.23	0.12	0.26	0.12	0.16	0.14
lcl\|BLLF01004039.1_cds_GFH28790.1_23267 (GFH28790)	0.36	0.09	0.17	0.15	0.51	0.35	0.36	0.29	0.27	1.0	0.33	0.28	0.25	0.18	0.2	0.19	0.8	0.13	0.08	0.33	0.06	0.09	0.05	0.07	0.03	0.05
lcl\|BLLF01004203.1_cds_GFH29144.1_23621 (GFH29144)	0.15	0.07	0.42	0.42	0.19	0.25	0.18	0.08	0.21	0.15	0.17	0.18	0.11	0.1	0.1	0.7	1.0	0.37	0.0	0.14	0.31	0.03	0.16	0.04	0.09	0.08
lcl\|BLLF01004323.1_cds_GFH29387.1_23864 (GFH29387)	0.0	0.0	0.09	0.0	0.11	0.04	0.0	0.04	0.11	0.79	0.08	0.11	0.08	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06
lcl\|BLLF01004673.1_cds_GFH30043.1_24520 (GFH30043)	0.27	0.23	0.0	0.43	0.42	0.35	0.32	0.39	0.31	1.0	0.52	0.29	0.29	0.34	0.22	0.3	0.47	0.26	0.23	0.25	0.32	0.14	0.2	0.21	0.19	0.2
lcl\|BLLF01005462.1_cds_GFH31227.1_25704 (GFH31227)	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.04	0.16	0.0	0.0	0.48	0.04	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01005755.1_cds_GFH31594.1_26071 (GFH31594)	0.26	0.39	0.67	0.2	0.57	0.43	0.66	0.37	0.53	0.2	0.57	0.37	0.69	0.35	0.44	0.92	1.0	0.36	0.37	0.25	0.42	0.58	0.49	0.18	0.52	0.37
lcl\|BLLF01005769.1_cds_GFH31607.1_26084 (GFH31607)	0.33	0.0	0.0	0.38	0.0	0.07	0.0	0.07	0.08	0.88	0.17	0.04	0.09	0.08	0.04	0.0	1.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.04	0.16	0.07
lcl\|BLLF01006123.1_cds_GFH31972.1_26449 (GFH31972)	0.03	0.0	0.41	0.06	0.54	0.28	0.3	0.53	0.36	1.0	0.49	0.29	0.36	0.38	0.27	0.72	0.69	0.16	0.0	0.02	0.19	0.04	0.13	0.04	0.08	0.17
lcl\|BLLF01006138.1_cds_GFH31989.1_26466 (GFH31989)	0.93	0.43	1.0	0.69	0.75	0.61	0.5	0.42	0.56	0.44	0.77	0.5	0.63	0.49	0.63	0.53	0.59	0.73	0.86	0.73	0.83	0.59	0.67	0.2	0.37	0.29
lcl\|BLLF01006346.1_cds_GFH32172.1_26649 (GFH32172)	0.2	0.08	0.34	0.03	0.43	0.29	0.3	0.29	0.21	1.0	0.29	0.24	0.26	0.18	0.15	0.24	0.93	0.07	0.04	0.12	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03
lcl\|BLLF01006914.1_cds_GFH32649.1_27126 (GFH32649)	0.55	0.28	0.51	0.08	0.22	0.27	0.32	0.13	0.3	0.69	0.23	0.23	0.3	0.16	0.26	0.3	0.44	0.47	0.32	0.31	0.3	1.0	0.63	0.05	0.29	0.16
lcl\|BLLF01007701.1_cds_GFH33074.1_27551 (GFH33074)	0.07	0.0	0.0	0.0	0.26	0.09	0.21	0.34	0.25	0.62	0.23	0.18	0.13	0.28	0.18	0.47	1.0	0.2	0.0	0.0	0.2	0.45	0.0	0.0	0.12	0.35

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)