Heatmap: Cluster_193 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000148.1_cds_GFH08238.1_2715 (GFH08238)	0.51	0.22	0.1	0.21	0.82	0.61	0.55	0.41	0.45	0.65	0.73	0.58	0.49	0.49	0.44	0.54	0.81	0.38	0.54	0.91	0.4	1.0	0.47	0.96	0.77	0.62
lcl\|BLLF01000150.1_cds_GFH08270.1_2747 (GFH08270)	0.66	0.32	0.26	0.33	0.69	0.64	0.51	0.5	0.56	0.91	0.45	0.59	0.38	0.36	0.5	0.55	0.52	0.35	0.53	0.65	0.41	0.93	0.55	1.0	1.0	0.61
lcl\|BLLF01000193.1_cds_GFH08904.1_3381 (GFH08904)	0.16	0.0	0.0	0.26	0.26	0.48	0.35	0.24	0.29	0.42	0.28	0.19	0.29	0.21	0.21	1.0	0.59	0.42	0.0	0.13	0.22	0.99	0.47	0.18	0.12	0.15
lcl\|BLLF01000215.1_cds_GFH09183.1_3660 (GFH09183)	0.12	0.22	0.15	0.33	0.37	0.46	0.31	0.14	0.31	0.51	0.43	0.27	0.25	0.22	0.17	0.81	1.0	0.21	0.08	0.16	0.51	0.16	0.43	0.38	0.22	0.31
lcl\|BLLF01000241.1_cds_GFH09529.1_4006 (GFH09529)	0.42	0.41	0.54	0.22	0.31	0.34	0.22	0.21	0.14	0.1	0.31	0.55	0.32	0.24	0.28	0.59	0.27	0.1	0.53	0.74	0.08	1.0	0.17	0.33	0.19	0.14
lcl\|BLLF01000245.1_cds_GFH09583.1_4060 (GFH09583)	0.0	0.0	0.0	0.26	0.52	1.0	0.85	0.69	0.26	0.0	0.57	0.73	0.27	0.77	0.22	0.0	0.0	0.13	0.06	0.04	0.06	0.0	0.12	0.64	0.06	0.09
lcl\|BLLF01000412.1_cds_GFH11532.1_6009 (GFH11532)	0.1	0.09	0.0	0.5	0.42	0.14	0.3	0.1	0.23	0.34	0.22	0.22	0.32	0.26	0.18	0.0	0.0	0.19	0.0	0.21	0.17	1.0	0.5	0.25	0.09	0.12
lcl\|BLLF01000478.1_cds_GFH12215.1_6692 (GFH12215)	0.35	0.93	0.56	0.16	0.58	0.73	0.62	0.36	0.48	0.46	0.45	0.53	0.44	0.48	0.35	0.29	0.55	0.44	0.27	0.23	0.35	1.0	0.36	0.19	0.23	0.24
lcl\|BLLF01000510.1_cds_GFH12497.1_6974 (GFH12497)	0.24	0.04	0.0	0.31	0.51	0.79	0.56	0.5	0.48	0.36	0.23	0.78	0.5	0.23	0.51	0.29	0.45	0.1	0.29	0.13	0.24	1.0	0.28	0.38	0.37	0.15
lcl\|BLLF01000545.1_cds_GFH12838.1_7315 (GFH12838)	0.2	0.25	0.0	0.63	0.18	0.39	0.44	0.08	0.24	0.16	0.33	0.29	0.23	0.27	0.15	1.0	0.81	0.44	0.04	0.1	0.54	0.23	0.38	0.37	0.24	0.27
lcl\|BLLF01000551.1_cds_GFH12886.1_7363 (GFH12886)	0.44	0.9	0.47	0.64	0.86	0.98	0.81	0.71	0.67	0.5	0.81	0.82	0.71	0.71	0.57	0.41	0.69	0.85	0.54	0.51	0.79	1.0	0.91	0.58	0.42	0.53
lcl\|BLLF01000557.1_cds_GFH12951.1_7428 (GFH12951)	0.1	0.0	0.0	0.11	0.38	0.49	0.34	0.24	0.24	0.16	0.21	0.39	0.15	0.16	0.2	0.53	1.0	0.04	0.18	0.25	0.11	0.38	0.14	0.29	0.32	0.11
lcl\|BLLF01000681.1_cds_GFH14059.1_8536 (GFH14059)	0.0	0.0	0.0	0.89	0.4	0.35	0.45	0.3	0.38	0.9	0.48	0.29	0.36	0.43	0.24	0.09	0.14	0.42	0.38	0.45	0.28	1.0	0.45	0.43	0.08	0.1
lcl\|BLLF01000773.1_cds_GFH14842.1_9319 (GFH14842)	0.16	0.25	0.26	0.16	0.17	0.4	0.32	0.22	0.19	0.1	0.1	0.51	0.28	0.14	0.27	0.11	0.19	0.01	0.4	0.39	0.0	1.0	0.02	0.36	0.24	0.15
lcl\|BLLF01000778.1_cds_GFH14890.1_9367 (GFH14890)	0.97	0.16	0.08	0.45	0.54	0.66	0.56	0.32	0.47	0.2	0.4	0.55	0.49	0.32	0.55	0.38	0.45	0.2	0.55	0.22	0.29	1.0	0.5	0.69	0.39	0.26
lcl\|BLLF01000798.1_cds_GFH15039.1_9516 (GFH15039)	0.06	0.09	0.0	0.03	0.39	0.23	0.19	0.37	0.14	0.46	0.2	0.28	0.49	0.24	0.59	0.57	0.66	0.13	0.28	0.48	0.44	1.0	0.19	0.11	0.44	0.09
lcl\|BLLF01000881.1_cds_GFH15669.1_10146 (GFH15669)	0.07	0.06	0.03	0.11	0.45	0.54	0.45	0.41	0.3	0.56	0.2	0.84	0.61	0.22	0.86	0.63	0.55	0.0	0.02	0.13	0.0	1.0	0.0	0.04	0.46	0.22
lcl\|BLLF01000913.1_cds_GFH15868.1_10345 (GFH15868)	0.15	0.5	0.37	0.36	0.2	0.32	0.26	0.14	0.18	0.05	0.19	0.36	0.3	0.21	0.2	0.27	0.25	0.08	0.28	0.33	0.09	1.0	0.2	0.26	0.17	0.14
lcl\|BLLF01000927.1_cds_GFH15969.1_10446 (GFH15969)	0.53	0.19	0.11	0.34	0.54	0.53	0.58	0.44	0.49	0.61	0.36	0.57	0.39	0.28	0.49	0.83	1.0	0.13	0.21	0.51	0.19	0.98	0.26	0.71	0.76	0.51
lcl\|BLLF01000945.1_cds_GFH16099.1_10576 (GFH16099)	0.0	0.0	0.0	0.09	0.5	0.53	0.74	0.14	0.6	0.38	0.19	0.41	0.58	0.15	0.82	0.54	0.0	0.63	0.0	0.36	0.29	1.0	0.42	0.28	0.15	0.15
lcl\|BLLF01000961.1_cds_GFH16205.1_10682 (GFH16205)	0.16	0.09	0.09	0.35	0.78	0.78	0.63	0.55	0.7	0.25	0.53	0.71	0.53	0.39	0.71	0.59	0.57	0.13	0.26	0.18	0.18	1.0	0.16	0.5	0.86	0.52
lcl\|BLLF01001038.1_cds_GFH16697.1_11174 (GFH16697)	0.28	0.4	0.33	0.57	0.7	0.87	0.74	0.68	0.53	0.48	0.3	0.89	0.65	0.36	0.63	0.82	0.99	0.19	0.43	0.4	0.28	1.0	0.56	0.63	0.57	0.14
lcl\|BLLF01001038.1_cds_GFH16698.1_11175 (GFH16698)	0.17	0.61	0.42	0.41	0.71	0.8	0.77	0.69	0.5	0.33	0.3	0.92	0.64	0.31	0.56	0.66	0.93	0.08	0.42	0.36	0.23	1.0	0.49	0.72	0.77	0.17
lcl\|BLLF01001038.1_cds_GFH16699.1_11176 (GFH16699)	0.03	0.64	0.59	0.56	0.67	0.7	0.87	0.59	0.61	0.44	0.3	0.69	0.56	0.32	0.64	0.49	0.71	0.11	0.48	0.21	0.23	1.0	0.3	0.51	0.67	0.14
lcl\|BLLF01001058.1_cds_GFH16843.1_11320 (GFH16843)	0.14	0.16	0.23	0.14	0.84	0.92	0.89	1.0	0.71	0.14	0.71	0.88	0.61	0.6	0.81	0.78	0.58	0.24	0.19	0.22	0.22	0.89	0.41	0.62	0.53	0.51
lcl\|BLLF01001119.1_cds_GFH17257.1_11734 (GFH17257)	0.25	0.1	0.0	0.63	0.54	1.0	0.54	0.23	0.54	0.48	0.63	0.6	0.3	0.36	0.25	0.53	0.54	0.59	0.23	0.13	0.34	0.9	0.36	0.2	0.29	0.43
lcl\|BLLF01001169.1_cds_GFH17571.1_12048 (GFH17571)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	1.0	0.81	0.6	0.58	0.13	0.11	0.86	0.55	0.45	0.42	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.22	0.07	0.35	0.22	0.13
lcl\|BLLF01001222.1_cds_GFH17919.1_12396 (GFH17919)	0.11	0.18	0.0	0.39	0.78	0.8	0.66	0.39	0.53	0.18	0.77	0.9	0.51	0.45	0.56	0.31	0.23	0.33	0.55	0.17	0.42	1.0	0.55	0.98	0.48	0.32
lcl\|BLLF01001238.1_cds_GFH18025.1_12502 (GFH18025)	0.46	0.83	0.72	0.38	0.86	0.7	0.73	0.74	0.8	0.89	0.74	0.7	0.81	0.62	0.69	0.61	0.8	0.67	0.49	0.57	0.64	1.0	0.68	0.59	0.56	0.56
lcl\|BLLF01001289.1_cds_GFH18353.1_12830 (GFH18353)	0.06	0.22	0.64	0.43	0.18	0.3	0.3	0.29	0.21	0.07	0.16	0.42	0.28	0.29	0.28	0.31	0.13	0.07	0.95	0.75	0.04	1.0	0.37	0.34	0.25	0.12
lcl\|BLLF01001318.1_cds_GFH18555.1_13032 (GFH18555)	0.12	0.3	0.02	0.27	0.19	0.3	0.32	0.15	0.22	0.63	0.28	0.31	0.25	0.23	0.12	1.0	0.99	0.48	0.17	0.19	0.44	0.06	0.18	0.32	0.29	0.32
lcl\|BLLF01001334.1_cds_GFH18661.1_13138 (GFH18661)	0.66	0.56	0.14	0.59	0.85	1.0	0.64	0.47	0.63	0.75	0.79	0.71	0.48	0.59	0.43	0.61	0.65	0.44	0.64	0.68	0.5	0.89	0.72	0.93	0.55	0.61
lcl\|BLLF01001376.1_cds_GFH18897.1_13374 (GFH18897)	0.09	0.07	0.0	0.31	0.21	0.27	0.37	0.22	0.29	0.07	0.3	0.18	0.28	0.3	0.27	0.15	0.11	0.25	0.38	0.2	0.2	1.0	0.16	0.41	0.16	0.22
lcl\|BLLF01001384.1_cds_GFH18947.1_13424 (GFH18947)	0.0	0.07	0.0	0.0	0.17	0.32	0.21	0.35	0.19	0.07	0.2	0.21	0.24	0.24	0.22	0.76	1.0	0.1	0.08	0.37	0.21	0.57	0.0	0.24	0.2	0.15
lcl\|BLLF01001467.1_cds_GFH19466.1_13943 (GFH19466)	0.56	0.16	0.17	0.38	1.0	0.59	0.61	0.43	0.5	0.3	0.66	0.69	0.54	0.43	0.3	0.75	0.91	0.12	0.11	0.11	0.21	0.16	0.16	0.96	0.59	0.45
lcl\|BLLF01001621.1_cds_GFH20362.1_14839 (GFH20362)	0.04	0.04	0.0	0.42	0.27	0.58	0.43	0.35	0.39	0.11	0.31	0.49	0.51	0.48	0.32	0.16	0.2	0.25	0.44	0.29	0.46	1.0	0.17	0.6	0.23	0.4
lcl\|BLLF01001739.1_cds_GFH20988.1_15465 (GFH20988)	0.22	0.34	0.04	0.3	0.71	0.79	0.56	0.31	0.69	0.18	0.6	0.69	0.44	0.4	0.48	0.29	0.41	0.72	0.22	0.51	0.63	1.0	0.4	0.36	0.44	0.33
lcl\|BLLF01001866.1_cds_GFH21621.1_16098 (GFH21621)	0.76	0.56	0.51	0.36	0.82	0.62	0.61	0.79	0.61	0.69	0.56	0.56	0.64	0.58	0.54	0.74	1.0	0.39	0.5	0.39	0.49	0.98	0.69	0.96	0.43	0.3
lcl\|BLLF01001901.1_cds_GFH21760.1_16237 (GFH21760)	0.36	0.26	0.0	0.22	0.49	0.59	0.58	0.34	0.51	0.34	0.66	0.72	0.56	0.31	0.54	0.67	0.39	0.45	0.33	0.35	0.1	1.0	0.33	0.95	0.66	0.49
lcl\|BLLF01001922.1_cds_GFH21875.1_16352 (GFH21875)	0.21	0.0	0.0	0.0	0.18	0.1	0.1	0.33	0.18	0.17	0.11	0.08	0.33	0.2	0.29	0.82	1.0	0.14	0.55	0.47	0.5	0.29	0.14	0.26	0.23	0.16
lcl\|BLLF01001963.1_cds_GFH22077.1_16554 (GFH22077)	0.16	0.0	0.0	0.15	0.27	0.34	0.15	0.12	0.16	0.32	0.27	0.12	0.15	0.09	0.05	1.0	0.61	0.28	0.0	0.12	0.49	0.0	0.42	0.19	0.13	0.12
lcl\|BLLF01002262.1_cds_GFH23394.1_17871 (GFH23394)	0.05	0.48	0.07	0.02	0.24	0.24	0.26	0.18	0.09	0.36	0.11	0.36	0.12	0.12	0.15	0.26	0.56	0.02	0.37	0.35	0.04	1.0	0.08	0.3	0.21	0.05
lcl\|BLLF01002318.1_cds_GFH23631.1_18108 (GFH23631)	0.2	0.66	0.55	0.12	0.23	0.57	0.62	0.35	0.38	0.34	0.07	0.56	0.39	0.3	0.41	0.15	0.29	0.03	0.39	0.16	0.02	1.0	0.16	0.31	0.27	0.11
lcl\|BLLF01002388.1_cds_GFH23886.1_18363 (GFH23886)	0.16	0.08	0.09	0.04	0.28	0.33	0.22	0.11	0.1	0.05	0.18	0.18	0.14	0.1	0.08	0.38	1.0	0.24	0.15	0.17	0.19	0.11	0.19	0.3	0.08	0.1
lcl\|BLLF01002410.1_cds_GFH23980.1_18457 (GFH23980)	0.0	0.45	0.0	0.13	0.44	0.29	0.37	0.23	0.22	1.0	0.26	0.28	0.23	0.28	0.19	0.3	0.49	0.0	0.01	0.0	0.25	0.61	0.0	0.0	0.12	0.2
lcl\|BLLF01002608.1_cds_GFH24699.1_19176 (GFH24699)	0.63	0.76	0.46	0.54	0.97	0.97	0.65	0.69	0.6	0.28	0.88	0.95	0.69	0.67	0.56	0.64	0.87	0.52	0.46	0.44	0.66	1.0	0.81	0.62	0.34	0.32
lcl\|BLLF01003561.1_cds_GFH27649.1_22126 (GFH27649)	0.09	0.04	0.0	0.21	0.34	0.38	0.19	0.11	0.24	0.09	0.35	0.25	0.15	0.16	0.14	0.53	1.0	0.29	0.14	0.16	0.31	0.25	0.28	0.35	0.08	0.06
lcl\|BLLF01003805.1_cds_GFH28258.1_22735 (GFH28258)	0.16	0.04	0.0	0.11	0.34	0.27	0.33	0.12	0.21	0.37	0.31	0.32	0.24	0.18	0.33	0.29	0.04	0.14	0.0	0.23	0.19	1.0	0.27	0.27	0.14	0.13
lcl\|BLLF01003871.1_cds_GFH28425.1_22902 (GFH28425)	0.32	0.2	0.0	1.0	0.66	0.65	0.65	0.28	0.57	0.4	0.74	0.62	0.47	0.4	0.54	0.9	0.81	0.93	0.78	0.38	0.51	0.71	0.63	0.95	0.98	0.8
lcl\|BLLF01004934.1_cds_GFH30482.1_24959 (GFH30482)	0.0	0.0	0.0	0.04	0.44	0.59	0.45	0.19	0.37	0.38	0.35	0.29	0.21	0.28	0.34	0.4	0.5	0.21	0.0	0.09	0.15	1.0	0.21	0.15	0.17	0.17
lcl\|BLLF01006136.1_cds_GFH31986.1_26463 (GFH31986)	0.21	0.0	0.03	0.0	0.11	0.16	0.28	0.17	0.13	0.2	0.03	0.22	0.11	0.11	0.19	0.14	0.07	0.04	0.28	0.22	0.0	1.0	0.11	0.23	0.03	0.02
lcl\|BLLF01006198.1_cds_GFH32052.1_26529 (GFH32052)	0.57	0.43	0.0	0.45	0.49	0.48	0.36	0.33	0.38	0.27	0.36	0.47	0.24	0.37	0.4	0.28	0.24	0.24	0.36	0.54	0.19	1.0	0.49	0.74	0.49	0.4
lcl\|BLLF01006627.1_cds_GFH32422.1_26899 (GFH32422)	0.05	0.0	0.0	0.44	0.13	0.41	0.39	0.11	0.28	0.09	0.11	0.2	0.15	0.07	0.19	0.2	0.12	0.0	0.05	0.24	0.17	1.0	0.03	0.43	0.0	0.01
lcl\|BLLF01007240.1_cds_GFH32849.1_27326 (GFH32849)	0.54	0.07	0.42	0.05	0.6	0.57	0.61	0.38	0.44	0.83	0.57	1.0	0.76	0.35	0.82	0.71	0.47	0.03	0.05	0.05	0.0	0.0	0.03	0.04	0.98	0.21
lcl\|BLLF01007271.1_cds_GFH32868.1_27345 (GFH32868)	0.08	0.0	0.0	0.35	0.28	0.19	0.15	0.09	0.16	0.17	0.28	0.15	0.16	0.14	0.17	0.41	1.0	0.54	0.04	0.16	0.15	0.38	0.29	0.29	0.11	0.16
lcl\|BLLF01008433.1_cds_GFH33379.1_27856 (GFH33379)	0.21	0.09	0.21	0.96	0.62	0.85	0.75	0.3	0.32	0.08	0.29	0.52	0.51	0.23	0.34	0.48	0.71	0.19	0.28	0.22	0.22	1.0	0.28	0.82	0.29	0.23

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)