Heatmap: Cluster_296 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000002.1_cds_GFH05580.1_57 (GFH05580)	0.55	0.0	0.0	0.12	0.06	0.16	0.06	0.04	0.06	0.52	0.02	0.04	0.15	0.06	0.04	0.0	0.0	0.86	0.86	0.49	0.99	0.23	1.0	0.12	0.13	0.03
lcl\|BLLF01000018.1_cds_GFH05995.1_472 (GFH05995)	0.03	0.14	0.0	0.02	0.45	0.35	0.4	0.38	0.35	0.33	0.37	0.31	0.36	0.35	0.3	0.32	0.82	0.5	0.63	0.78	1.0	0.4	0.75	0.23	0.23	0.29
lcl\|BLLF01000018.1_cds_GFH06003.1_480 (GFH06003)	0.3	0.26	0.0	0.14	0.35	0.41	0.41	0.24	0.39	0.22	0.48	0.27	0.24	0.31	0.39	0.4	0.37	0.87	0.59	1.0	0.74	0.72	0.45	0.07	0.19	0.09
lcl\|BLLF01000105.1_cds_GFH07607.1_2084 (GFH07607)	0.1	0.24	0.0	0.01	0.39	0.43	0.28	0.43	0.33	0.26	0.36	0.29	0.35	0.33	0.35	0.12	0.41	0.84	0.63	1.0	0.8	0.64	0.65	0.12	0.33	0.36
lcl\|BLLF01000133.1_cds_GFH08046.1_2523 (GFH08046)	0.11	0.3	0.0	0.13	0.41	0.37	0.25	0.36	0.28	0.35	0.49	0.38	0.3	0.39	0.2	0.22	0.33	0.56	0.21	0.58	0.48	1.0	0.35	0.41	0.27	0.35
lcl\|BLLF01000143.1_cds_GFH08176.1_2653 (GFH08176)	0.17	0.12	0.17	0.07	0.15	0.16	0.16	0.11	0.12	0.55	0.15	0.13	0.23	0.19	0.1	0.24	0.31	0.45	0.69	0.62	1.0	0.31	0.55	0.07	0.16	0.13
lcl\|BLLF01000203.1_cds_GFH09029.1_3506 (GFH09029)	0.15	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.03	0.0	0.03	0.42	0.03	0.03	0.07	0.0	0.0	0.28	0.21	0.23	1.0	0.94	0.61	0.35	0.0	0.04	0.0	0.16
lcl\|BLLF01000244.1_cds_GFH09564.1_4041 (GFH09564)	0.28	0.24	0.0	0.1	0.49	0.53	0.48	0.61	0.55	0.33	0.45	0.42	0.54	0.44	0.48	0.27	0.3	0.99	0.75	1.0	0.93	0.91	0.79	0.49	0.47	0.39
lcl\|BLLF01000292.1_cds_GFH10164.1_4641 (GFH10164)	0.0	0.21	0.0	0.0	0.04	0.09	0.03	0.0	0.0	0.0	0.13	0.03	0.0	0.09	0.03	0.0	0.2	1.0	0.64	0.34	0.55	0.32	0.22	0.05	0.0	0.2
lcl\|BLLF01000302.1_cds_GFH10277.1_4754 (GFH10277)	0.36	0.34	0.02	0.56	0.34	0.48	0.43	0.29	0.4	0.46	0.51	0.36	0.35	0.36	0.34	0.74	0.33	0.47	0.29	0.92	0.75	1.0	0.4	0.16	0.25	0.34
lcl\|BLLF01000306.1_cds_GFH10322.1_4799 (GFH10322)	0.19	0.06	0.0	0.16	0.11	0.11	0.1	0.19	0.08	0.34	0.16	0.05	0.08	0.1	0.13	0.0	0.0	0.92	0.39	0.85	1.0	0.0	0.57	0.01	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000306.1_cds_GFH10323.1_4800 (GFH10323)	0.33	0.09	0.0	0.09	0.35	0.18	0.15	0.18	0.18	0.48	0.3	0.07	0.12	0.15	0.1	0.14	0.17	1.0	0.61	0.44	0.9	0.36	0.82	0.04	0.15	0.1
lcl\|BLLF01000412.1_cds_GFH11528.1_6005 (GFH11528)	0.23	0.04	0.0	0.14	0.2	0.16	0.08	0.09	0.09	0.06	0.11	0.09	0.12	0.13	0.07	0.06	0.43	1.0	0.61	0.63	0.62	0.11	0.69	0.01	0.13	0.03
lcl\|BLLF01000477.1_cds_GFH12194.1_6671 (GFH12194)	0.34	0.3	0.0	0.04	0.1	0.3	0.17	0.09	0.08	0.49	0.16	0.17	0.21	0.22	0.07	0.16	0.12	0.6	0.71	0.32	1.0	0.4	0.72	0.12	0.27	0.24
lcl\|BLLF01000548.1_cds_GFH12867.1_7344 (GFH12867)	0.15	0.3	0.0	0.3	0.12	0.1	0.16	0.11	0.17	0.27	0.12	0.07	0.09	0.11	0.15	0.45	0.26	0.84	0.08	1.0	0.7	0.16	0.48	0.08	0.09	0.04
lcl\|BLLF01000709.1_cds_GFH14285.1_8762 (GFH14285)	0.06	0.0	0.0	0.02	0.08	0.05	0.04	0.06	0.15	0.42	0.12	0.09	0.09	0.14	0.16	0.27	0.16	0.33	1.0	0.64	0.52	0.2	0.33	0.13	0.12	0.11
lcl\|BLLF01000860.1_cds_GFH15508.1_9985 (GFH15508)	0.31	0.12	0.14	0.17	0.44	0.3	0.32	0.3	0.4	0.64	0.54	0.25	0.31	0.44	0.35	0.43	0.49	1.0	0.44	0.84	0.93	0.38	0.82	0.25	0.22	0.29
lcl\|BLLF01001077.1_cds_GFH16962.1_11439 (GFH16962)	0.23	0.16	0.38	0.15	0.38	0.35	0.35	0.38	0.38	0.31	0.39	0.34	0.37	0.32	0.32	0.44	0.79	0.95	0.4	0.72	1.0	0.39	0.79	0.23	0.27	0.28
lcl\|BLLF01001084.1_cds_GFH17014.1_11491 (GFH17014)	0.2	0.16	0.11	0.12	0.36	0.27	0.15	0.27	0.15	0.53	0.3	0.16	0.14	0.24	0.14	0.29	0.28	0.85	0.69	0.88	1.0	0.58	0.89	0.14	0.12	0.07
lcl\|BLLF01001196.1_cds_GFH17754.1_12231 (GFH17754)	0.16	0.13	0.0	0.34	0.57	0.51	0.38	0.4	0.52	0.29	0.38	0.42	0.63	0.36	0.55	0.42	0.59	0.69	0.55	1.0	0.61	0.33	0.71	0.18	0.42	0.51
lcl\|BLLF01001226.1_cds_GFH17950.1_12427 (GFH17950)	0.17	0.0	0.0	0.44	0.33	0.26	0.29	0.18	0.23	0.36	0.4	0.18	0.23	0.25	0.24	0.46	0.47	0.75	0.44	1.0	0.9	0.16	0.55	0.18	0.4	0.25
lcl\|BLLF01001278.1_cds_GFH18291.1_12768 (GFH18291)	0.55	0.0	0.0	0.02	0.24	0.27	0.14	0.08	0.1	0.59	0.27	0.15	0.16	0.12	0.06	0.44	0.23	1.0	0.53	0.45	0.67	0.33	0.99	0.05	0.2	0.15
lcl\|BLLF01001329.1_cds_GFH18622.1_13099 (GFH18622)	0.12	0.16	0.0	0.09	0.03	0.03	0.0	0.1	0.0	0.21	0.0	0.03	0.03	0.02	0.03	0.0	0.21	1.0	0.83	0.57	0.31	0.0	0.33	0.06	0.03	0.0
lcl\|BLLF01001353.1_cds_GFH18771.1_13248 (GFH18771)	0.22	0.15	0.0	0.0	0.04	0.05	0.11	0.04	0.07	0.2	0.01	0.17	0.04	0.1	0.08	0.09	0.15	1.0	0.43	0.73	1.0	0.0	0.58	0.13	0.05	0.07
lcl\|BLLF01001415.1_cds_GFH19154.1_13631 (GFH19154)	0.29	0.26	0.38	0.3	0.29	0.23	0.2	0.2	0.23	0.35	0.27	0.23	0.23	0.17	0.23	0.35	0.58	0.86	0.35	1.0	0.78	0.44	0.59	0.1	0.18	0.27
lcl\|BLLF01001479.1_cds_GFH19532.1_14009 (GFH19532)	0.01	0.0	0.0	0.01	0.09	0.04	0.11	0.07	0.08	0.34	0.07	0.12	0.13	0.04	0.12	0.26	0.35	0.25	1.0	0.83	0.3	0.38	0.3	0.21	0.12	0.03
lcl\|BLLF01001586.1_cds_GFH20161.1_14638 (GFH20161)	0.15	0.0	0.0	0.16	0.21	0.1	0.16	0.11	0.26	0.58	0.14	0.14	0.15	0.1	0.23	0.25	0.25	0.5	1.0	0.78	0.64	0.73	0.52	0.22	0.22	0.18
lcl\|BLLF01001810.1_cds_GFH21344.1_15821 (GFH21344)	0.27	0.0	0.0	0.0	0.11	0.28	0.16	0.07	0.16	0.15	0.16	0.09	0.17	0.06	0.15	0.0	0.0	0.76	0.68	0.72	1.0	0.18	0.39	0.07	0.17	0.17
lcl\|BLLF01001839.1_cds_GFH21485.1_15962 (GFH21485)	0.19	0.13	0.0	0.2	0.1	0.07	0.09	0.11	0.08	0.43	0.05	0.07	0.05	0.04	0.06	0.25	0.48	0.78	1.0	0.47	0.54	0.25	0.58	0.16	0.02	0.01
lcl\|BLLF01001841.1_cds_GFH21497.1_15974 (GFH21497)	0.08	0.65	0.0	0.02	0.36	0.32	0.23	0.37	0.22	0.87	0.32	0.27	0.3	0.35	0.18	0.2	0.26	1.0	0.56	0.79	0.98	0.66	0.85	0.16	0.28	0.23
lcl\|BLLF01001841.1_cds_GFH21498.1_15975 (GFH21498)	0.07	0.49	0.0	0.02	0.56	0.5	0.32	0.48	0.28	0.6	0.53	0.4	0.39	0.46	0.23	0.21	0.36	0.95	0.69	0.95	1.0	0.75	0.79	0.37	0.43	0.33
lcl\|BLLF01001897.1_cds_GFH21742.1_16219 (GFH21742)	0.11	0.12	0.0	0.16	0.23	0.22	0.15	0.29	0.22	0.4	0.22	0.15	0.18	0.19	0.17	0.1	0.22	0.51	0.89	0.54	0.69	1.0	0.7	0.27	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001940.1_cds_GFH21962.1_16439 (GFH21962)	0.16	0.12	0.13	0.06	0.56	0.26	0.21	0.32	0.24	0.43	0.44	0.22	0.28	0.28	0.27	0.35	0.81	0.97	0.23	1.0	0.85	0.56	0.81	0.11	0.1	0.22
lcl\|BLLF01002194.1_cds_GFH23109.1_17586 (GFH23109)	0.47	0.12	0.01	0.07	0.26	0.41	0.34	0.14	0.32	0.55	0.41	0.28	0.33	0.26	0.26	0.74	0.49	1.0	0.73	0.52	0.97	0.33	0.83	0.07	0.21	0.22
lcl\|BLLF01002628.1_cds_GFH24773.1_19250 (GFH24773)	0.24	0.27	0.07	0.11	0.27	0.17	0.15	0.1	0.15	0.31	0.25	0.17	0.19	0.13	0.18	0.19	0.3	0.59	0.38	1.0	0.61	0.34	0.48	0.1	0.1	0.14
lcl\|BLLF01002635.1_cds_GFH24800.1_19277 (GFH24800)	0.09	0.25	0.0	0.08	0.25	0.19	0.16	0.19	0.21	0.37	0.27	0.14	0.29	0.14	0.1	0.07	0.07	1.0	0.77	0.76	0.55	0.45	0.76	0.06	0.16	0.22
lcl\|BLLF01002704.1_cds_GFH25059.1_19536 (GFH25059)	0.27	0.05	0.0	0.06	0.09	0.32	0.13	0.19	0.08	0.33	0.34	0.11	0.25	0.32	0.08	0.33	0.24	0.74	0.77	1.0	0.71	0.12	0.62	0.01	0.31	0.22
lcl\|BLLF01002746.1_cds_GFH25192.1_19669 (GFH25192)	0.13	0.27	0.0	0.28	0.2	0.24	0.09	0.08	0.13	0.21	0.2	0.11	0.16	0.11	0.06	0.31	0.32	1.0	0.56	0.68	0.56	0.29	0.41	0.1	0.15	0.21
lcl\|BLLF01003019.1_cds_GFH26095.1_20572 (GFH26095)	0.11	0.22	0.0	0.07	0.36	0.41	0.2	0.2	0.14	0.34	0.51	0.49	0.26	0.27	0.17	0.11	0.31	0.82	0.18	0.34	1.0	0.6	0.4	0.27	0.18	0.16
lcl\|BLLF01003960.1_cds_GFH28618.1_23095 (GFH28618)	0.41	0.46	0.09	0.31	0.4	0.23	0.15	0.3	0.16	0.46	0.38	0.3	0.28	0.27	0.16	0.36	0.51	0.85	0.63	1.0	0.76	0.61	0.66	0.21	0.2	0.35
lcl\|BLLF01004962.1_cds_GFH30524.1_25001 (GFH30524)	0.11	0.0	0.0	0.28	0.05	0.03	0.07	0.04	0.08	0.48	0.06	0.03	0.05	0.06	0.03	0.3	0.44	0.43	0.89	0.67	1.0	0.31	0.29	0.12	0.01	0.01
lcl\|BLLF01005288.1_cds_GFH31007.1_25484 (GFH31007)	0.18	0.1	0.0	0.78	0.11	0.11	0.11	0.24	0.13	0.6	0.14	0.09	0.17	0.29	0.15	0.63	0.41	0.71	1.0	0.91	0.98	0.07	0.49	0.15	0.04	0.04
lcl\|BLLF01005962.1_cds_GFH31809.1_26286 (GFH31809)	0.1	0.05	0.0	0.07	0.37	0.3	0.19	0.37	0.21	0.49	0.49	0.25	0.25	0.35	0.27	0.03	0.04	0.87	0.41	1.0	0.79	0.22	0.77	0.14	0.38	0.48
lcl\|BLLF01006796.1_cds_GFH32555.1_27032 (GFH32555)	0.11	0.0	0.03	0.04	0.48	0.38	0.16	0.17	0.18	0.38	0.17	0.29	0.09	0.18	0.31	0.32	0.08	1.0	0.75	0.78	0.92	0.4	0.58	0.18	0.02	0.08
lcl\|BLLF01006889.1_cds_GFH32630.1_27107 (GFH32630)	0.42	0.12	0.0	0.16	0.26	0.18	0.16	0.19	0.21	0.54	0.24	0.2	0.21	0.17	0.25	0.21	0.37	0.83	1.0	0.77	0.84	0.54	0.52	0.16	0.1	0.09
lcl\|BLLF01007012.1_cds_GFH32711.1_27188 (GFH32711)	0.27	0.13	0.0	0.09	0.24	0.18	0.12	0.28	0.13	0.61	0.2	0.16	0.24	0.27	0.16	0.15	0.16	0.86	0.58	0.43	0.95	0.29	1.0	0.19	0.23	0.13
lcl\|BLLF01007780.1_cds_GFH33107.1_27584 (GFH33107)	0.24	0.04	0.0	0.03	0.67	0.52	0.35	0.49	0.31	0.57	0.55	0.48	0.35	0.48	0.21	0.25	0.22	0.69	0.4	0.64	1.0	0.1	0.75	0.09	0.54	0.52
lcl\|BLLF01008600.1_cds_GFH33445.1_27922 (GFH33445)	0.21	0.01	0.0	0.17	0.24	0.15	0.13	0.25	0.18	0.56	0.25	0.12	0.17	0.28	0.16	0.02	0.15	1.0	0.63	0.35	0.9	0.75	0.65	0.15	0.09	0.06

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)