Heatmap: Cluster_55 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000004.1_cds_GFH05649.1_126 (GFH05649)	0.0	0.11	0.0	0.14	0.47	0.23	0.31	0.3	0.32	1.0	0.32	0.23	0.26	0.26	0.25	0.26	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.27	0.24
lcl\|BLLF01000015.1_cds_GFH05946.1_423 (GFH05946)	0.0	0.1	0.09	0.08	0.26	0.33	0.19	0.29	0.23	1.0	0.3	0.3	0.24	0.26	0.19	0.02	0.02	0.11	0.23	0.22	0.1	0.15	0.08	0.11	0.31	0.35
lcl\|BLLF01000024.1_cds_GFH06153.1_630 (GFH06153)	0.19	0.01	0.04	0.02	0.11	0.1	0.11	0.11	0.14	1.0	0.11	0.08	0.09	0.08	0.14	0.15	0.16	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.0	0.02	0.01
lcl\|BLLF01000089.1_cds_GFH07340.1_1817 (GFH07340)	0.24	0.12	0.12	0.13	0.16	0.14	0.2	0.2	0.26	1.0	0.13	0.14	0.17	0.14	0.36	0.07	0.13	0.15	0.1	0.11	0.13	0.13	0.12	0.12	0.15	0.11
lcl\|BLLF01000221.1_cds_GFH09272.1_3749 (GFH09272)	0.03	0.02	0.0	0.0	0.14	0.14	0.13	0.14	0.12	1.0	0.22	0.12	0.14	0.12	0.09	0.1	0.3	0.03	0.0	0.05	0.0	0.04	0.02	0.03	0.05	0.08
lcl\|BLLF01000355.1_cds_GFH10878.1_5355 (GFH10878)	0.04	0.15	0.0	0.03	0.15	0.15	0.12	0.15	0.08	1.0	0.16	0.13	0.13	0.15	0.08	0.07	0.55	0.01	0.01	0.02	0.0	0.04	0.01	0.04	0.03	0.03
lcl\|BLLF01000355.1_cds_GFH10880.1_5357 (GFH10880)	0.02	0.03	0.0	0.01	0.14	0.14	0.09	0.18	0.11	1.0	0.17	0.11	0.13	0.12	0.09	0.1	0.1	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.03
lcl\|BLLF01000355.1_cds_GFH10881.1_5358 (GFH10881)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.11	0.15	0.13	0.15	0.14	1.0	0.15	0.11	0.13	0.13	0.06	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02
lcl\|BLLF01000375.1_cds_GFH11120.1_5597 (GFH11120)	0.09	0.0	0.0	0.0	0.17	0.19	0.04	0.02	0.13	1.0	0.02	0.12	0.06	0.02	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.05
lcl\|BLLF01000377.1_cds_GFH11130.1_5607 (GFH11130)	0.03	0.0	0.0	0.0	0.25	0.17	0.18	0.14	0.1	1.0	0.14	0.15	0.11	0.16	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.08	0.0	0.09	0.21	0.09
lcl\|BLLF01000674.1_cds_GFH13984.1_8461 (GFH13984)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.07	0.15	1.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000727.1_cds_GFH14444.1_8921 (GFH14444)	0.02	0.02	0.0	0.0	0.27	0.19	0.09	0.22	0.11	1.0	0.32	0.25	0.26	0.21	0.1	0.08	0.06	0.16	0.15	0.27	0.17	0.0	0.09	0.04	0.21	0.28
lcl\|BLLF01000778.1_cds_GFH14885.1_9362 (GFH14885)	0.11	0.29	0.0	0.0	0.52	0.38	0.39	0.4	0.49	1.0	0.52	0.37	0.38	0.39	0.49	0.35	0.05	0.17	0.0	0.09	0.15	0.17	0.16	0.08	0.61	0.41
lcl\|BLLF01000779.1_cds_GFH14893.1_9370 (GFH14893)	0.11	0.01	0.0	0.05	0.29	0.25	0.46	0.39	0.67	1.0	0.33	0.32	0.33	0.29	0.68	0.02	0.06	0.11	0.12	0.07	0.11	0.03	0.11	0.05	0.28	0.17
lcl\|BLLF01000830.1_cds_GFH15289.1_9766 (GFH15289)	0.0	0.0	0.0	0.31	0.21	0.07	0.11	0.14	0.21	1.0	0.12	0.07	0.22	0.12	0.21	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.11
lcl\|BLLF01000880.1_cds_GFH15658.1_10135 (GFH15658)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.23	0.18	0.2	0.3	0.24	1.0	0.27	0.11	0.22	0.19	0.18	0.05	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.15
lcl\|BLLF01000880.1_cds_GFH15659.1_10136 (GFH15659)	0.04	0.0	0.0	0.0	0.11	0.13	0.13	0.23	0.27	1.0	0.18	0.11	0.24	0.2	0.24	0.24	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.16
lcl\|BLLF01000956.1_cds_GFH16174.1_10651 (GFH16174)	0.2	0.11	0.16	0.02	0.33	0.17	0.17	0.31	0.25	1.0	0.28	0.21	0.22	0.23	0.23	0.13	0.17	0.06	0.05	0.08	0.07	0.04	0.08	0.02	0.21	0.09
lcl\|BLLF01000958.1_cds_GFH16187.1_10664 (GFH16187)	0.04	0.0	0.0	0.0	0.08	0.06	0.22	0.2	0.21	1.0	0.12	0.06	0.05	0.13	0.19	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.08	0.03	0.19	0.07
lcl\|BLLF01001009.1_cds_GFH16521.1_10998 (GFH16521)	0.06	0.05	0.0	0.0	0.1	0.1	0.09	0.18	0.18	1.0	0.12	0.07	0.12	0.12	0.07	0.21	0.12	0.05	0.0	0.01	0.05	0.01	0.02	0.0	0.1	0.09
lcl\|BLLF01001167.1_cds_GFH17556.1_12033 (GFH17556)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.16	0.18	0.07	0.12	0.09	1.0	0.21	0.07	0.09	0.05	0.12	0.18	0.06	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.03	0.09	0.07
lcl\|BLLF01001218.1_cds_GFH17888.1_12365 (GFH17888)	0.02	0.04	0.0	0.12	0.16	0.2	0.23	0.23	0.35	1.0	0.19	0.21	0.23	0.19	0.36	0.07	0.06	0.06	0.03	0.06	0.06	0.03	0.06	0.01	0.11	0.07
lcl\|BLLF01001218.1_cds_GFH17889.1_12366 (GFH17889)	0.02	0.02	0.06	0.06	0.17	0.16	0.26	0.26	0.44	1.0	0.18	0.17	0.22	0.19	0.4	0.05	0.06	0.06	0.07	0.06	0.08	0.02	0.05	0.01	0.09	0.06
lcl\|BLLF01001323.1_cds_GFH18582.1_13059 (GFH18582)	0.03	0.05	0.0	0.0	0.13	0.06	0.08	0.23	0.08	1.0	0.14	0.11	0.1	0.13	0.1	0.14	0.14	0.01	0.04	0.04	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02
lcl\|BLLF01001335.1_cds_GFH18665.1_13142 (GFH18665)	0.05	0.21	0.0	0.02	0.43	0.37	0.4	0.39	0.52	1.0	0.46	0.42	0.42	0.28	0.47	0.1	0.07	0.03	0.05	0.27	0.1	0.13	0.11	0.07	0.56	0.42
lcl\|BLLF01001416.1_cds_GFH19159.1_13636 (GFH19159)	0.12	0.19	0.0	0.02	0.25	0.22	0.18	0.19	0.09	1.0	0.29	0.18	0.12	0.17	0.05	0.0	0.05	0.05	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.28	0.25
lcl\|BLLF01001416.1_cds_GFH19160.1_13637 (GFH19160)	0.07	0.11	0.0	0.01	0.33	0.23	0.14	0.19	0.13	1.0	0.27	0.22	0.15	0.2	0.07	0.02	0.05	0.27	0.03	0.05	0.17	0.08	0.09	0.02	0.3	0.2
lcl\|BLLF01001499.1_cds_GFH19659.1_14136 (GFH19659)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.19	0.04	0.21	0.04	1.0	0.17	0.12	0.0	0.03	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0
lcl\|BLLF01001881.1_cds_GFH21682.1_16159 (GFH21682)	0.02	0.02	0.04	0.03	0.31	0.22	0.15	0.2	0.17	1.0	0.31	0.21	0.09	0.15	0.1	0.04	0.05	0.04	0.0	0.06	0.05	0.02	0.01	0.02	0.12	0.1
lcl\|BLLF01001931.1_cds_GFH21920.1_16397 (GFH21920)	0.13	0.0	0.0	0.09	0.27	0.14	0.17	0.29	0.22	1.0	0.18	0.13	0.2	0.15	0.17	0.12	0.08	0.09	0.13	0.07	0.07	0.21	0.13	0.05	0.19	0.12
lcl\|BLLF01002146.1_cds_GFH22888.1_17365 (GFH22888)	0.05	0.0	0.0	0.0	0.24	0.31	0.26	0.24	0.24	1.0	0.25	0.17	0.17	0.23	0.32	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.18
lcl\|BLLF01002158.1_cds_GFH22936.1_17413 (GFH22936)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002239.1_cds_GFH23294.1_17771 (GFH23294)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.19	0.21	0.21	0.44	1.0	0.27	0.17	0.28	0.13	0.31	0.08	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.02	0.21	0.06
lcl\|BLLF01002304.1_cds_GFH23578.1_18055 (GFH23578)	0.05	0.03	0.04	0.13	0.26	0.24	0.34	0.28	0.32	1.0	0.31	0.26	0.36	0.27	0.36	0.16	0.18	0.1	0.04	0.07	0.19	0.1	0.1	0.06	0.45	0.34
lcl\|BLLF01002588.1_cds_GFH24627.1_19104 (GFH24627)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.29	0.35	0.39	0.74	1.0	0.14	0.09	0.49	0.15	0.39	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.25
lcl\|BLLF01002671.1_cds_GFH24930.1_19407 (GFH24930)	0.04	0.03	0.0	0.0	0.15	0.21	0.29	0.23	0.33	1.0	0.16	0.17	0.21	0.13	0.3	0.02	0.0	0.08	0.08	0.07	0.0	0.03	0.05	0.04	0.25	0.15
lcl\|BLLF01002903.1_cds_GFH25732.1_20209 (GFH25732)	0.02	0.01	0.0	0.02	0.16	0.2	0.28	0.3	0.47	1.0	0.16	0.25	0.26	0.21	0.46	0.09	0.06	0.07	0.07	0.09	0.08	0.03	0.06	0.01	0.08	0.07
lcl\|BLLF01003572.1_cds_GFH27676.1_22153 (GFH27676)	0.07	0.16	0.22	0.03	0.33	0.25	0.27	0.29	0.43	1.0	0.31	0.27	0.32	0.23	0.49	0.12	0.09	0.02	0.0	0.08	0.03	0.11	0.05	0.02	0.44	0.25
lcl\|BLLF01003932.1_cds_GFH28557.1_23034 (GFH28557)	0.12	0.0	0.0	0.0	0.1	0.05	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004298.1_cds_GFH29340.1_23817 (GFH29340)	0.12	0.0	0.0	0.0	0.19	0.06	0.2	0.18	0.2	1.0	0.21	0.04	0.15	0.02	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
lcl\|BLLF01004347.1_cds_GFH29445.1_23922 (GFH29445)	0.1	0.06	0.15	0.03	0.11	0.09	0.1	0.1	0.14	1.0	0.11	0.09	0.11	0.08	0.15	0.09	0.09	0.03	0.05	0.05	0.04	0.03	0.04	0.01	0.05	0.05
lcl\|BLLF01004568.1_cds_GFH29866.1_24343 (GFH29866)	0.01	0.07	0.0	0.0	0.52	0.22	0.21	0.24	0.32	1.0	0.21	0.14	0.31	0.13	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.12
lcl\|BLLF01004611.1_cds_GFH29953.1_24430 (GFH29953)	0.18	0.07	0.03	0.01	0.17	0.13	0.2	0.13	0.23	1.0	0.16	0.12	0.17	0.09	0.24	0.1	0.14	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01
lcl\|BLLF01005516.1_cds_GFH31299.1_25776 (GFH31299)	0.04	0.0	0.0	0.0	0.08	0.07	0.07	0.17	0.15	1.0	0.14	0.12	0.19	0.13	0.15	0.08	0.06	0.02	0.02	0.03	0.0	0.0	0.05	0.01	0.05	0.08
lcl\|BLLF01005888.1_cds_GFH31734.1_26211 (GFH31734)	0.03	0.05	0.02	0.01	0.28	0.11	0.04	0.24	0.04	1.0	0.25	0.11	0.07	0.13	0.05	0.03	0.01	0.11	0.04	0.08	0.16	0.05	0.14	0.03	0.14	0.12
lcl\|BLLF01006275.1_cds_GFH32117.1_26594 (GFH32117)	0.06	0.06	0.19	0.08	0.34	0.17	0.18	0.22	0.21	1.0	0.3	0.18	0.15	0.16	0.12	0.05	0.06	0.14	0.01	0.06	0.14	0.08	0.07	0.04	0.09	0.08
lcl\|BLLF01006589.1_cds_GFH32388.1_26865 (GFH32388)	0.13	0.08	0.2	0.21	0.38	0.3	0.46	0.46	0.63	1.0	0.26	0.27	0.48	0.25	0.67	0.11	0.09	0.24	0.36	0.25	0.16	0.07	0.14	0.16	0.34	0.29
lcl\|BLLF01006846.1_cds_GFH32591.1_27068 (GFH32591)	0.14	0.0	0.0	0.12	0.14	0.14	0.02	0.07	0.02	1.0	0.1	0.04	0.04	0.09	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01006990.1_cds_GFH32697.1_27174 (GFH32697)	0.1	0.12	0.0	0.02	0.09	0.11	0.15	0.15	0.17	1.0	0.11	0.1	0.13	0.09	0.17	0.13	0.05	0.05	0.06	0.13	0.07	0.04	0.06	0.02	0.12	0.12
lcl\|BLLF01007024.1_cds_GFH32718.1_27195 (GFH32718)	0.03	0.0	0.0	0.0	0.1	0.08	0.07	0.21	0.01	1.0	0.2	0.09	0.15	0.16	0.05	0.1	0.0	0.16	0.12	0.0	0.11	0.0	0.18	0.0	0.04	0.0
lcl\|BLLF01007326.1_cds_GFH32901.1_27378 (GFH32901)	0.18	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.08	0.16	0.09	1.0	0.04	0.01	0.06	0.1	0.09	0.03	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.04	0.0	0.01	0.02	0.01
lcl\|BLLF01008191.1_cds_GFH33282.1_27759 (GFH33282)	0.17	0.03	0.05	0.01	0.15	0.08	0.14	0.15	0.19	1.0	0.16	0.08	0.12	0.11	0.21	0.1	0.17	0.02	0.01	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.04	0.01
lcl\|BLLF01008609.1_cds_GFH33451.1_27928 (GFH33451)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.18	0.19	0.2	0.26	1.0	0.24	0.17	0.2	0.2	0.21	0.09	0.06	0.07	0.04	0.05	0.11	0.16	0.1	0.09	0.24	0.34

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)