Heatmap: Cluster_14 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000078.1_cds_GFH07177.1_1654 (GFH07177)	0.08	0.09	0.0	0.07	0.15	0.52	0.2	0.27	0.35	0.91	0.2	0.26	0.23	0.22	0.26	0.39	0.2	0.31	0.06	0.04	0.56	0.07	0.21	0.02	0.39	1.0
lcl\|BLLF01000084.1_cds_GFH07255.1_1732 (GFH07255)	0.07	0.29	0.16	0.11	0.28	0.27	0.24	0.13	0.2	0.35	0.22	0.18	0.18	0.14	0.13	0.4	0.15	0.23	0.07	0.1	0.24	0.05	0.22	0.18	0.66	1.0
lcl\|BLLF01000126.1_cds_GFH07936.1_2413 (GFH07936)	0.18	0.24	0.0	0.08	0.11	0.1	0.14	0.19	0.12	0.87	0.18	0.12	0.12	0.2	0.16	0.12	0.09	0.19	0.18	0.4	0.22	0.11	0.23	0.15	0.46	1.0
lcl\|BLLF01000188.1_cds_GFH08841.1_3318 (GFH08841)	0.05	0.04	0.0	0.39	0.23	0.19	0.07	0.12	0.11	0.15	0.25	0.05	0.09	0.09	0.07	0.57	0.23	0.08	0.0	0.17	0.34	0.06	0.28	0.27	0.36	1.0
lcl\|BLLF01000215.1_cds_GFH09190.1_3667 (GFH09190)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.04	0.03	0.03	0.04	0.05	0.28	0.03	0.04	0.02	0.03	0.04	0.18	0.1	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	1.0
lcl\|BLLF01000238.1_cds_GFH09486.1_3963 (GFH09486)	0.06	0.21	0.0	0.1	0.27	0.18	0.33	0.11	0.24	0.74	0.27	0.14	0.16	0.16	0.2	0.79	0.43	0.18	0.1	0.29	0.41	0.24	0.12	0.19	0.55	1.0
lcl\|BLLF01000276.1_cds_GFH09939.1_4416 (GFH09939)	0.36	0.0	0.0	0.38	0.06	0.11	0.18	0.04	0.25	0.78	0.04	0.1	0.07	0.05	0.23	0.12	0.05	0.07	0.1	0.11	0.12	0.0	0.07	0.01	0.26	1.0
lcl\|BLLF01000308.1_cds_GFH10351.1_4828 (GFH10351)	0.1	0.1	0.0	0.08	0.23	0.32	0.24	0.14	0.22	0.47	0.25	0.19	0.16	0.14	0.12	0.83	0.25	0.24	0.08	0.22	0.35	0.16	0.18	0.31	0.36	1.0
lcl\|BLLF01000333.1_cds_GFH10646.1_5123 (GFH10646)	0.15	0.24	0.06	0.12	0.3	0.22	0.2	0.32	0.27	0.67	0.25	0.21	0.21	0.17	0.2	0.46	0.32	0.26	0.19	0.32	0.28	0.21	0.21	0.1	0.49	1.0
lcl\|BLLF01000437.1_cds_GFH11798.1_6275 (GFH11798)	0.13	0.15	0.0	0.31	0.17	0.13	0.21	0.15	0.21	0.75	0.15	0.1	0.1	0.09	0.1	0.05	0.09	0.01	0.04	0.04	0.04	0.0	0.01	0.0	0.37	1.0
lcl\|BLLF01000443.1_cds_GFH11861.1_6338 (GFH11861)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.06	0.14	0.0	1.0	0.06	0.05	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.08	0.34
lcl\|BLLF01000450.1_cds_GFH11928.1_6405 (GFH11928)	0.13	0.07	0.05	0.06	0.18	0.16	0.16	0.3	0.22	0.29	0.15	0.1	0.1	0.22	0.09	0.24	0.09	0.06	0.03	0.4	0.08	0.03	0.05	0.06	0.55	1.0
lcl\|BLLF01000605.1_cds_GFH13381.1_7858 (GFH13381)	0.07	0.04	0.0	0.01	0.27	0.47	0.35	0.25	0.37	0.95	0.18	0.18	0.15	0.15	0.13	0.61	0.15	0.26	0.09	0.27	0.23	0.24	0.23	0.38	0.48	1.0
lcl\|BLLF01000618.1_cds_GFH13489.1_7966 (GFH13489)	0.06	0.28	0.0	0.13	0.11	0.13	0.18	0.06	0.2	0.74	0.07	0.05	0.06	0.09	0.08	0.67	0.12	0.26	0.05	0.2	0.31	0.25	0.38	0.08	0.4	1.0
lcl\|BLLF01000618.1_cds_GFH13490.1_7967 (GFH13490)	0.0	0.08	0.15	0.1	0.07	0.12	0.09	0.05	0.15	1.0	0.09	0.03	0.06	0.03	0.08	0.52	0.28	0.08	0.02	0.05	0.18	0.07	0.12	0.07	0.33	0.88
lcl\|BLLF01000630.1_cds_GFH13588.1_8065 (GFH13588)	0.25	0.03	0.0	0.26	0.26	0.24	0.21	0.14	0.25	0.75	0.27	0.18	0.21	0.16	0.23	0.34	0.19	0.32	0.11	0.32	0.34	0.09	0.2	0.12	0.48	1.0
lcl\|BLLF01000630.1_cds_GFH13589.1_8066 (GFH13589)	0.11	0.04	0.0	0.12	0.22	0.3	0.25	0.2	0.29	0.71	0.26	0.23	0.25	0.2	0.23	0.22	0.17	0.14	0.09	0.21	0.42	0.06	0.26	0.08	0.45	1.0
lcl\|BLLF01000646.1_cds_GFH13734.1_8211 (GFH13734)	0.0	0.0	0.0	0.04	0.06	0.07	0.29	0.11	0.37	0.54	0.13	0.15	0.28	0.07	0.37	1.0	0.25	0.11	0.1	0.02	0.19	0.01	0.61	0.02	0.5	0.88
lcl\|BLLF01000666.1_cds_GFH13905.1_8382 (GFH13905)	0.13	0.12	0.0	0.0	0.26	0.3	0.24	0.29	0.23	0.65	0.31	0.26	0.24	0.26	0.19	0.46	0.19	0.3	0.21	0.19	0.31	0.29	0.29	0.15	0.61	1.0
lcl\|BLLF01000719.1_cds_GFH14377.1_8854 (GFH14377)	0.14	0.14	0.0	0.0	0.12	0.22	0.19	0.1	0.2	0.43	0.22	0.27	0.18	0.12	0.16	0.3	0.0	0.08	0.0	0.0	0.11	0.0	0.08	0.03	0.62	1.0
lcl\|BLLF01000807.1_cds_GFH15109.1_9586 (GFH15109)	0.01	0.02	0.0	0.01	0.16	0.15	0.08	0.21	0.08	0.49	0.14	0.11	0.05	0.18	0.09	0.03	0.04	0.1	0.06	0.28	0.11	0.1	0.1	0.01	0.65	1.0
lcl\|BLLF01000825.1_cds_GFH15259.1_9736 (GFH15259)	0.4	0.23	0.0	0.17	0.09	0.14	0.07	0.1	0.13	0.73	0.04	0.05	0.06	0.06	0.06	0.21	0.15	0.0	0.24	0.14	0.11	0.0	0.08	0.0	0.6	1.0
lcl\|BLLF01000936.1_cds_GFH16041.1_10518 (GFH16041)	0.33	0.12	0.0	0.29	0.24	0.32	0.22	0.14	0.25	0.65	0.19	0.22	0.19	0.18	0.22	0.24	0.2	0.14	0.11	0.13	0.27	0.07	0.1	0.04	0.41	1.0
lcl\|BLLF01000936.1_cds_GFH16043.1_10520 (GFH16043)	0.18	0.09	0.0	0.16	0.2	0.29	0.2	0.1	0.24	0.47	0.21	0.18	0.14	0.15	0.15	0.51	0.27	0.34	0.07	0.29	0.3	0.09	0.24	0.27	0.44	1.0
lcl\|BLLF01000995.1_cds_GFH16412.1_10889 (GFH16412)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.07	0.07	1.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64
lcl\|BLLF01001179.1_cds_GFH17634.1_12111 (GFH17634)	0.17	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.1	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.27	0.0	0.03	0.0	0.03	0.15	0.06	0.02	0.06	0.91	1.0
lcl\|BLLF01001266.1_cds_GFH18222.1_12699 (GFH18222)	0.04	0.05	0.0	0.13	0.23	0.32	0.28	0.08	0.28	0.35	0.2	0.2	0.19	0.1	0.13	0.25	0.07	0.31	0.25	0.12	0.47	0.15	0.29	0.3	0.36	1.0
lcl\|BLLF01001474.1_cds_GFH19504.1_13981 (GFH19504)	0.19	0.17	0.0	0.05	0.32	0.34	0.27	0.32	0.25	0.77	0.23	0.22	0.21	0.21	0.2	0.41	0.2	0.24	0.13	0.17	0.33	0.18	0.19	0.16	0.71	1.0
lcl\|BLLF01001487.1_cds_GFH19587.1_14064 (GFH19587)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.05	0.07	0.02	0.07	0.0	0.02	0.1	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	1.0
lcl\|BLLF01001519.1_cds_GFH19782.1_14259 (GFH19782)	0.26	0.0	0.0	0.0	0.09	0.04	0.03	0.2	0.05	0.05	0.13	0.06	0.03	0.18	0.02	0.21	0.0	0.09	0.1	0.09	0.04	0.0	0.06	0.01	0.75	1.0
lcl\|BLLF01001603.1_cds_GFH20255.1_14732 (GFH20255)	0.28	0.39	0.0	0.0	0.22	0.39	0.39	0.19	0.48	0.91	0.23	0.25	0.42	0.22	0.32	1.0	0.07	0.38	0.12	0.11	0.55	0.26	0.55	0.29	0.51	0.92
lcl\|BLLF01001603.1_cds_GFH20256.1_14733 (GFH20256)	0.2	0.32	0.0	0.02	0.15	0.3	0.36	0.16	0.42	0.44	0.2	0.2	0.35	0.15	0.25	1.0	0.09	0.26	0.1	0.1	0.5	0.16	0.29	0.16	0.35	0.63
lcl\|BLLF01001627.1_cds_GFH20404.1_14881 (GFH20404)	0.03	0.02	0.0	0.31	0.14	0.09	0.1	0.04	0.16	0.5	0.17	0.04	0.06	0.01	0.04	0.59	0.0	0.0	0.0	0.31	0.13	0.15	0.0	0.1	0.55	1.0
lcl\|BLLF01001662.1_cds_GFH20589.1_15066 (GFH20589)	0.22	0.14	0.0	0.05	0.15	0.23	0.22	0.06	0.23	0.25	0.14	0.16	0.25	0.11	0.15	1.0	0.32	0.39	0.0	0.05	0.46	0.09	0.22	0.12	0.19	0.36
lcl\|BLLF01001688.1_cds_GFH20733.1_15210 (GFH20733)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.36	0.24	0.15	0.37	0.58	0.2	0.25	0.19	0.22	0.11	0.27	0.0	0.21	0.11	0.12	0.49	0.0	0.28	0.05	0.82	1.0
lcl\|BLLF01001915.1_cds_GFH21840.1_16317 (GFH21840)	0.07	0.13	0.0	0.01	0.16	0.29	0.21	0.09	0.22	0.68	0.1	0.13	0.11	0.1	0.1	0.56	0.11	0.3	0.13	0.17	0.37	0.11	0.38	0.32	0.43	1.0
lcl\|BLLF01001957.1_cds_GFH22050.1_16527 (GFH22050)	0.12	0.13	0.0	0.07	0.34	0.56	0.35	0.19	0.3	0.63	0.3	0.28	0.2	0.17	0.2	0.69	0.25	0.29	0.15	0.19	0.2	0.16	0.27	0.47	0.54	1.0
lcl\|BLLF01002035.1_cds_GFH22417.1_16894 (GFH22417)	0.14	0.08	0.19	0.11	0.06	0.09	0.11	0.02	0.08	0.49	0.07	0.08	0.1	0.01	0.09	0.36	0.04	0.02	0.01	0.16	0.12	0.12	0.05	0.08	0.52	1.0
lcl\|BLLF01002040.1_cds_GFH22439.1_16916 (GFH22439)	0.09	0.04	0.02	0.04	0.07	0.17	0.18	0.1	0.13	0.54	0.16	0.16	0.25	0.23	0.13	0.15	0.2	0.13	0.09	0.03	0.12	0.11	0.17	0.1	0.69	1.0
lcl\|BLLF01002107.1_cds_GFH22718.1_17195 (GFH22718)	0.0	0.13	0.0	0.03	0.12	0.13	0.11	0.09	0.11	0.41	0.12	0.1	0.14	0.11	0.07	0.36	0.09	0.06	0.11	0.18	0.34	0.06	0.11	0.08	0.61	1.0
lcl\|BLLF01002184.1_cds_GFH23060.1_17537 (GFH23060)	0.14	0.18	0.0	0.03	0.16	0.22	0.14	0.13	0.17	0.26	0.16	0.12	0.12	0.12	0.11	0.13	0.07	0.1	0.17	0.2	0.2	0.14	0.05	0.12	0.67	1.0
lcl\|BLLF01002238.1_cds_GFH23289.1_17766 (GFH23289)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.05	0.02	0.06	0.11	0.0	0.1	0.05	0.02	0.02	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	1.0
lcl\|BLLF01002238.1_cds_GFH23290.1_17767 (GFH23290)	0.01	0.05	0.0	0.12	0.07	0.09	0.09	0.03	0.18	0.91	0.08	0.06	0.03	0.02	0.06	0.52	0.3	0.1	0.07	0.04	0.2	0.08	0.08	0.05	0.33	1.0
lcl\|BLLF01002254.1_cds_GFH23365.1_17842 (GFH23365)	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.47	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.33	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.62	1.0
lcl\|BLLF01002265.1_cds_GFH23408.1_17885 (GFH23408)	0.0	0.0	0.0	0.49	0.08	0.09	0.13	0.1	0.18	0.53	0.06	0.0	0.06	0.0	0.03	1.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.31	0.0	0.02	0.48	0.75
lcl\|BLLF01002391.1_cds_GFH23893.1_18370 (GFH23893)	0.05	0.07	0.19	0.09	0.19	0.4	0.3	0.25	0.37	1.0	0.2	0.23	0.29	0.29	0.27	0.25	0.24	0.18	0.09	0.05	0.13	0.08	0.15	0.01	0.27	0.67
lcl\|BLLF01002399.1_cds_GFH23928.1_18405 (GFH23928)	0.01	0.04	0.0	0.02	0.05	0.07	0.12	0.16	0.24	0.37	0.18	0.14	0.21	0.21	0.27	0.54	0.21	0.05	0.09	0.06	0.05	0.02	0.23	0.01	0.42	1.0
lcl\|BLLF01002400.1_cds_GFH23935.1_18412 (GFH23935)	0.0	0.0	0.0	0.09	0.05	0.19	0.14	0.03	0.18	0.0	0.16	0.12	0.13	0.16	0.08	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.22	0.0	0.77	1.0
lcl\|BLLF01002428.1_cds_GFH24047.1_18524 (GFH24047)	0.03	0.0	0.0	0.43	0.14	0.16	0.15	0.07	0.1	0.14	0.32	0.1	0.08	0.12	0.06	1.0	0.37	0.31	0.0	0.33	0.32	0.0	0.31	0.23	0.43	0.93
lcl\|BLLF01002678.1_cds_GFH24955.1_19432 (GFH24955)	0.14	0.42	0.0	0.03	0.13	0.06	0.09	0.02	0.11	0.97	0.06	0.06	0.03	0.03	0.1	0.19	0.11	0.33	0.17	0.31	0.36	0.06	0.15	0.0	0.4	1.0
lcl\|BLLF01003211.1_cds_GFH26701.1_21178 (GFH26701)	0.08	0.04	0.0	0.04	0.2	0.35	0.32	0.18	0.25	0.84	0.27	0.25	0.23	0.29	0.17	0.52	0.34	0.24	0.04	0.0	0.5	0.17	0.18	0.03	0.82	1.0
lcl\|BLLF01003731.1_cds_GFH28074.1_22551 (GFH28074)	0.18	0.31	0.0	0.11	0.15	0.11	0.09	0.1	0.1	0.93	0.12	0.04	0.07	0.09	0.08	0.76	0.27	0.23	0.11	0.12	0.37	0.06	0.18	0.2	0.48	1.0
lcl\|BLLF01004170.1_cds_GFH29080.1_23557 (GFH29080)	0.01	0.03	0.1	0.34	0.03	0.06	0.05	0.02	0.07	0.2	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.17	0.14	0.01	0.06	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.8	1.0
lcl\|BLLF01004273.1_cds_GFH29285.1_23762 (GFH29285)	0.4	0.18	0.0	0.06	0.28	0.37	0.43	0.21	0.59	0.44	0.31	0.21	0.28	0.18	0.3	1.0	0.29	0.45	0.14	0.08	0.5	0.05	0.45	0.24	0.51	0.72
lcl\|BLLF01004326.1_cds_GFH29396.1_23873 (GFH29396)	0.1	0.25	0.0	0.0	0.19	0.27	0.29	0.21	0.18	0.69	0.2	0.14	0.19	0.23	0.1	0.76	0.18	0.25	0.31	0.25	0.57	0.0	0.76	0.34	0.43	1.0
lcl\|BLLF01004606.1_cds_GFH29942.1_24419 (GFH29942)	0.38	0.22	0.0	0.13	0.22	0.2	0.23	0.21	0.33	0.46	0.32	0.13	0.28	0.16	0.21	0.0	0.0	0.03	0.0	0.04	0.16	0.0	0.0	0.04	0.23	1.0
lcl\|BLLF01004705.1_cds_GFH30101.1_24578 (GFH30101)	0.23	0.0	0.0	0.03	0.16	0.31	0.17	0.16	0.19	0.38	0.23	0.19	0.18	0.27	0.15	0.31	0.16	0.18	0.03	0.03	0.5	0.1	0.11	0.02	0.67	1.0
lcl\|BLLF01004761.1_cds_GFH30196.1_24673 (GFH30196)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.18	0.04	0.03	0.04	0.0	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	1.0
lcl\|BLLF01004973.1_cds_GFH30539.1_25016 (GFH30539)	0.04	0.05	0.0	0.13	0.11	0.18	0.12	0.08	0.15	0.18	0.12	0.07	0.17	0.07	0.09	0.12	0.09	0.18	0.07	0.19	0.19	0.0	0.13	0.02	0.8	1.0
lcl\|BLLF01005210.1_cds_GFH30880.1_25357 (GFH30880)	0.31	0.01	0.0	0.34	0.32	0.11	0.14	0.1	0.18	1.0	0.3	0.12	0.12	0.12	0.18	0.3	0.28	0.12	0.09	0.41	0.08	0.0	0.02	0.04	0.28	0.99
lcl\|BLLF01006280.1_cds_GFH32123.1_26600 (GFH32123)	0.15	0.0	0.0	0.01	0.06	0.24	0.12	0.07	0.2	0.27	0.12	0.15	0.12	0.07	0.09	0.43	0.13	0.33	0.35	0.22	0.35	0.12	0.1	0.04	0.63	1.0
lcl\|BLLF01006363.1_cds_GFH32183.1_26660 (GFH32183)	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.08	0.04	0.03	0.05	0.07	0.03	0.09	0.03	0.04	0.02	0.23	0.05	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.03	0.08	0.74	1.0
lcl\|BLLF01007972.1_cds_GFH33201.1_27678 (GFH33201)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)