Heatmap: Cluster_178 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000004.1_cds_GFH05645.1_122 (GFH05645)	0.26	0.06	0.0	0.3	0.22	0.18	0.18	0.16	0.2	1.0	0.16	0.16	0.17	0.11	0.12	0.15	0.2	0.22	0.16	0.33	0.31	0.27	0.3	0.27	0.38	0.4
lcl\|BLLF01000006.1_cds_GFH05714.1_191 (GFH05714)	0.56	0.32	0.33	0.29	0.29	0.35	0.39	0.18	0.39	0.43	0.35	0.26	0.26	0.23	0.27	1.0	0.62	0.51	0.51	0.44	0.47	0.79	0.51	0.43	0.42	0.46
lcl\|BLLF01000015.1_cds_GFH05939.1_416 (GFH05939)	0.49	0.15	0.35	0.14	0.07	0.08	0.27	0.05	0.23	0.34	0.09	0.12	0.11	0.09	0.23	1.0	0.02	0.4	0.47	0.47	0.12	0.53	0.34	0.15	0.12	0.11
lcl\|BLLF01000056.1_cds_GFH06780.1_1257 (GFH06780)	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.05	0.0	0.05	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.1	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.39	0.0	0.18	0.0
lcl\|BLLF01000073.1_cds_GFH07077.1_1554 (GFH07077)	0.32	0.21	0.37	0.51	0.24	0.16	0.24	0.14	0.28	0.86	0.24	0.19	0.21	0.09	0.21	0.72	0.86	0.3	0.19	0.18	0.77	0.41	0.6	1.0	0.52	0.28
lcl\|BLLF01000094.1_cds_GFH07436.1_1913 (GFH07436)	0.36	0.43	0.79	0.21	0.51	0.3	0.28	0.44	0.3	0.7	0.48	0.35	0.32	0.3	0.28	0.49	1.0	0.61	0.31	0.27	0.65	0.51	0.49	0.74	0.41	0.39
lcl\|BLLF01000110.1_cds_GFH07709.1_2186 (GFH07709)	0.28	0.15	0.48	0.41	0.06	0.06	0.07	0.09	0.06	0.3	0.06	0.04	0.05	0.06	0.05	0.44	1.0	0.52	0.19	0.35	0.4	0.3	0.46	0.71	0.58	0.52
lcl\|BLLF01000124.1_cds_GFH07906.1_2383 (GFH07906)	0.42	0.2	0.83	0.37	0.35	0.18	0.15	0.17	0.22	0.77	0.39	0.23	0.24	0.16	0.22	0.23	0.28	0.59	0.63	1.0	0.46	0.71	0.4	0.54	0.14	0.24
lcl\|BLLF01000127.1_cds_GFH07956.1_2433 (GFH07956)	0.28	0.08	1.0	0.31	0.04	0.04	0.08	0.03	0.06	0.79	0.06	0.04	0.03	0.03	0.05	0.45	0.48	0.31	0.61	0.64	0.6	0.67	0.3	0.36	0.48	0.43
lcl\|BLLF01000148.1_cds_GFH08242.1_2719 (GFH08242)	0.55	0.1	0.59	0.57	0.32	0.27	0.32	0.2	0.22	0.6	0.22	0.2	0.17	0.17	0.16	0.64	0.72	0.53	0.25	0.42	0.46	0.1	0.43	0.68	1.0	0.73
lcl\|BLLF01000172.1_cds_GFH08620.1_3097 (GFH08620)	0.67	0.41	0.0	0.0	0.09	0.07	0.11	0.07	0.14	0.0	0.04	0.09	0.09	0.09	0.12	0.42	0.37	1.0	0.31	0.39	0.63	0.59	0.64	0.29	0.08	0.05
lcl\|BLLF01000186.1_cds_GFH08819.1_3296 (GFH08819)	0.49	0.2	0.41	0.56	0.17	0.16	0.16	0.22	0.27	0.21	0.19	0.18	0.19	0.16	0.3	1.0	0.91	0.67	0.17	0.19	0.67	0.18	0.52	0.93	0.76	0.49
lcl\|BLLF01000243.1_cds_GFH09546.1_4023 (GFH09546)	0.49	0.39	0.0	0.03	0.17	0.2	0.13	0.18	0.14	0.81	0.28	0.14	0.15	0.21	0.17	0.67	0.3	0.32	0.16	0.27	0.44	0.29	0.29	0.36	0.61	1.0
lcl\|BLLF01000243.1_cds_GFH09549.1_4026 (GFH09549)	0.66	0.28	0.32	0.57	0.27	0.23	0.26	0.11	0.31	0.67	0.17	0.17	0.2	0.12	0.19	0.68	1.0	0.67	0.28	0.52	0.49	0.27	0.5	0.65	0.61	0.46
lcl\|BLLF01000301.1_cds_GFH10268.1_4745 (GFH10268)	0.48	0.05	0.38	0.04	0.11	0.21	0.17	0.11	0.12	0.22	0.14	0.16	0.1	0.11	0.08	1.0	0.2	0.25	0.12	0.1	0.16	0.72	0.25	0.21	0.21	0.28
lcl\|BLLF01000306.1_cds_GFH10313.1_4790 (GFH10313)	0.76	0.36	0.0	0.14	0.08	0.11	0.05	0.14	0.09	0.29	0.11	0.07	0.09	0.1	0.12	0.21	0.28	0.9	0.44	0.32	1.0	0.5	0.63	0.35	0.09	0.2
lcl\|BLLF01000351.1_cds_GFH10837.1_5314 (GFH10837)	0.37	0.15	0.08	0.59	0.24	0.23	0.35	0.17	0.31	0.5	0.32	0.21	0.21	0.25	0.17	0.59	1.0	0.75	0.24	0.25	0.72	0.51	0.56	0.49	0.5	0.46
lcl\|BLLF01000378.1_cds_GFH11145.1_5622 (GFH11145)	0.22	0.09	0.25	0.03	0.16	0.26	0.16	0.08	0.14	0.44	0.19	0.16	0.14	0.22	0.14	0.88	0.88	0.2	0.0	0.41	1.0	0.26	0.48	0.3	0.32	0.53
lcl\|BLLF01000390.1_cds_GFH11290.1_5767 (GFH11290)	0.55	0.19	0.5	0.22	0.25	0.2	0.16	0.2	0.17	0.3	0.24	0.19	0.2	0.24	0.12	0.8	0.69	0.71	0.27	0.33	1.0	0.23	0.61	0.51	0.39	0.5
lcl\|BLLF01000635.1_cds_GFH13643.1_8120 (GFH13643)	0.16	0.0	0.0	0.3	0.13	0.17	0.51	0.1	0.37	0.99	0.18	0.14	0.17	0.11	0.31	0.68	0.52	0.25	0.24	0.21	0.44	0.22	0.34	1.0	0.55	0.29
lcl\|BLLF01000636.1_cds_GFH13649.1_8126 (GFH13649)	0.81	0.28	0.42	0.09	0.02	0.07	0.18	0.08	0.15	0.32	0.02	0.23	0.23	0.11	0.3	0.93	0.74	0.06	0.18	0.15	0.07	0.55	0.15	0.31	1.0	0.39
lcl\|BLLF01000642.1_cds_GFH13701.1_8178 (GFH13701)	0.26	0.0	0.74	0.2	0.06	0.1	0.1	0.04	0.1	1.0	0.1	0.12	0.11	0.05	0.11	0.65	0.64	0.62	0.0	0.47	0.54	0.31	0.55	0.53	0.13	0.12
lcl\|BLLF01000663.1_cds_GFH13883.1_8360 (GFH13883)	0.32	0.01	0.87	0.45	0.16	0.14	0.16	0.22	0.26	0.25	0.21	0.15	0.15	0.16	0.42	0.24	0.24	0.59	1.0	0.95	0.51	0.98	0.41	0.52	0.46	0.27
lcl\|BLLF01000675.1_cds_GFH14000.1_8477 (GFH14000)	0.24	0.2	0.58	0.46	0.38	0.31	0.28	0.21	0.35	0.45	0.28	0.27	0.28	0.23	0.3	0.5	0.69	0.98	0.2	0.47	0.95	0.16	0.98	1.0	1.0	0.64
lcl\|BLLF01000706.1_cds_GFH14262.1_8739 (GFH14262)	0.33	0.0	0.0	0.01	0.12	0.06	0.04	0.12	0.05	1.0	0.07	0.03	0.03	0.04	0.04	0.3	0.13	0.07	0.11	0.22	0.09	0.14	0.11	0.29	0.46	0.45
lcl\|BLLF01000751.1_cds_GFH14657.1_9134 (GFH14657)	0.66	0.64	0.14	0.19	0.28	0.27	0.19	0.39	0.28	0.64	0.25	0.21	0.22	0.25	0.24	0.51	0.22	0.54	0.21	0.43	0.77	0.15	0.49	0.46	0.63	1.0
lcl\|BLLF01000766.1_cds_GFH14791.1_9268 (GFH14791)	0.5	0.23	0.31	0.11	0.15	0.17	0.15	0.21	0.17	1.0	0.08	0.12	0.07	0.06	0.12	0.76	0.34	0.18	0.13	0.56	0.28	0.43	0.31	0.65	0.86	0.76
lcl\|BLLF01000790.1_cds_GFH14979.1_9456 (GFH14979)	0.38	0.41	0.97	0.1	0.25	0.16	0.25	0.2	0.4	0.82	0.26	0.16	0.27	0.17	0.33	0.56	0.31	0.9	0.47	0.51	1.0	0.13	0.67	0.76	0.64	0.64
lcl\|BLLF01000828.1_cds_GFH15277.1_9754 (GFH15277)	0.27	0.07	0.0	0.09	0.09	0.13	0.47	0.17	0.28	0.62	0.11	0.14	0.28	0.09	0.38	0.55	0.22	0.0	0.17	0.22	0.05	0.42	0.0	1.0	0.21	0.13
lcl\|BLLF01000866.1_cds_GFH15551.1_10028 (GFH15551)	0.39	0.52	0.21	0.17	0.21	0.2	0.27	0.34	0.32	0.99	0.2	0.21	0.32	0.26	0.27	0.39	0.07	0.33	0.38	0.6	0.56	0.53	0.31	0.65	1.0	0.83
lcl\|BLLF01000872.1_cds_GFH15594.1_10071 (GFH15594)	0.59	0.65	0.0	0.07	0.35	0.39	0.42	0.33	0.48	0.52	0.26	0.33	0.3	0.23	0.36	0.96	0.14	0.18	0.11	0.22	0.37	0.55	0.37	0.53	0.49	1.0
lcl\|BLLF01000916.1_cds_GFH15892.1_10369 (GFH15892)	1.0	0.52	0.73	0.22	0.31	0.36	0.37	0.64	0.41	0.21	0.31	0.45	0.38	0.46	0.4	0.42	0.68	0.15	0.37	0.29	0.21	0.72	0.29	0.98	0.83	0.8
lcl\|BLLF01000916.1_cds_GFH15893.1_10370 (GFH15893)	0.15	0.0	0.0	0.16	0.05	0.08	0.04	0.05	0.06	1.0	0.06	0.04	0.05	0.05	0.03	0.03	0.02	0.17	0.06	0.02	0.21	0.03	0.13	0.2	0.15	0.22
lcl\|BLLF01000950.1_cds_GFH16128.1_10605 (GFH16128)	0.65	0.59	0.03	0.11	0.34	0.26	0.22	0.28	0.21	0.83	0.25	0.19	0.19	0.22	0.18	0.71	0.33	0.41	0.39	0.57	0.48	0.27	0.36	0.66	0.64	1.0
lcl\|BLLF01000972.1_cds_GFH16273.1_10750 (GFH16273)	0.85	0.46	0.35	0.24	0.32	0.27	0.27	0.35	0.32	0.67	0.26	0.22	0.25	0.25	0.28	1.0	0.73	0.93	0.37	0.67	0.83	0.68	0.96	0.57	0.42	0.97
lcl\|BLLF01000986.1_cds_GFH16371.1_10848 (GFH16371)	0.23	0.31	0.89	0.32	0.31	0.26	0.36	0.15	0.26	0.2	0.29	0.37	0.21	0.22	0.26	0.34	0.63	0.47	0.45	0.68	0.28	1.0	0.71	0.66	0.4	0.13
lcl\|BLLF01001091.1_cds_GFH17069.1_11546 (GFH17069)	0.48	0.45	0.44	0.36	0.41	0.33	0.25	0.43	0.3	0.4	0.34	0.31	0.3	0.29	0.32	0.57	1.0	0.44	0.36	0.37	0.41	0.67	0.39	0.34	0.67	0.58
lcl\|BLLF01001210.1_cds_GFH17842.1_12319 (GFH17842)	0.95	0.46	0.93	0.47	0.47	0.33	0.32	0.47	0.34	0.3	0.37	0.28	0.27	0.33	0.33	0.9	0.68	0.71	0.52	0.69	0.83	0.7	0.77	0.98	0.98	1.0
lcl\|BLLF01001262.1_cds_GFH18196.1_12673 (GFH18196)	0.63	0.41	0.47	0.27	0.42	0.32	0.25	0.17	0.29	0.76	0.41	0.31	0.24	0.25	0.26	1.0	0.6	0.66	0.81	0.56	0.54	0.85	0.66	0.53	0.79	0.71
lcl\|BLLF01001354.1_cds_GFH18775.1_13252 (GFH18775)	0.8	0.42	0.43	0.14	0.35	0.24	0.22	0.19	0.35	1.0	0.26	0.21	0.26	0.2	0.22	0.46	0.58	0.52	0.17	0.33	0.65	0.57	0.69	0.52	0.51	0.49
lcl\|BLLF01001425.1_cds_GFH19214.1_13691 (GFH19214)	0.19	0.13	0.28	0.11	0.06	0.08	0.11	0.04	0.09	0.14	0.09	0.2	0.13	0.09	0.16	1.0	0.43	0.24	0.27	0.19	0.41	0.84	0.46	0.16	0.2	0.16
lcl\|BLLF01001426.1_cds_GFH19226.1_13703 (GFH19226)	0.14	0.1	0.35	0.35	0.12	0.1	0.12	0.08	0.14	0.57	0.12	0.09	0.12	0.1	0.12	0.76	1.0	0.57	0.15	0.32	0.69	0.37	0.65	0.42	0.48	0.48
lcl\|BLLF01001433.1_cds_GFH19269.1_13746 (GFH19269)	1.0	0.69	0.33	0.17	0.32	0.27	0.27	0.33	0.47	0.59	0.22	0.24	0.33	0.28	0.3	0.4	0.55	0.58	0.25	0.5	0.37	0.35	0.67	0.56	0.47	0.63
lcl\|BLLF01001667.1_cds_GFH20612.1_15089 (GFH20612)	0.31	0.27	1.0	0.37	0.21	0.28	0.21	0.14	0.18	0.66	0.27	0.22	0.2	0.19	0.11	0.73	0.66	0.37	0.22	0.53	0.44	0.32	0.49	0.32	0.63	0.22
lcl\|BLLF01001737.1_cds_GFH20976.1_15453 (GFH20976)	0.6	0.28	0.44	0.41	0.51	0.48	0.33	0.49	0.27	0.12	0.37	0.39	0.27	0.31	0.2	0.53	0.43	0.15	0.39	0.28	0.15	0.51	0.26	1.0	0.75	0.72
lcl\|BLLF01001796.1_cds_GFH21281.1_15758 (GFH21281)	0.13	0.28	1.0	0.07	0.27	0.16	0.14	0.16	0.11	0.47	0.17	0.12	0.08	0.13	0.13	0.28	0.27	0.32	0.28	0.22	0.39	0.5	0.25	0.34	0.57	0.49
lcl\|BLLF01002254.1_cds_GFH23362.1_17839 (GFH23362)	0.05	0.0	0.0	0.19	0.02	0.0	0.06	0.0	0.03	0.36	0.0	0.01	0.02	0.02	0.03	0.45	1.0	0.3	0.08	0.04	0.14	0.24	0.25	0.45	0.48	0.38
lcl\|BLLF01002254.1_cds_GFH23364.1_17841 (GFH23364)	0.05	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.22	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.58	1.0	0.45	0.1	0.0	0.45	0.28	0.32	0.35	0.27	0.28
lcl\|BLLF01002294.1_cds_GFH23529.1_18006 (GFH23529)	0.37	0.58	0.21	0.22	0.32	0.33	0.38	0.4	0.47	0.46	0.39	0.41	0.57	0.37	0.47	0.44	0.33	0.59	0.16	0.3	0.71	0.31	0.69	0.72	0.86	1.0
lcl\|BLLF01002523.1_cds_GFH24385.1_18862 (GFH24385)	0.15	0.23	0.25	0.08	0.04	0.06	0.18	0.05	0.12	0.16	0.1	0.12	0.05	0.05	0.12	0.9	0.02	0.25	0.24	0.34	0.0	1.0	0.38	0.11	0.15	0.13
lcl\|BLLF01002624.1_cds_GFH24756.1_19233 (GFH24756)	1.0	0.97	0.67	0.32	0.38	0.44	0.37	0.49	0.4	0.58	0.35	0.49	0.39	0.34	0.42	0.78	0.91	0.28	0.38	0.56	0.29	0.75	0.4	0.7	0.95	0.9
lcl\|BLLF01002657.1_cds_GFH24881.1_19358 (GFH24881)	1.0	0.36	0.42	0.25	0.51	0.36	0.22	0.27	0.32	0.36	0.38	0.17	0.18	0.21	0.19	0.77	0.63	0.85	0.26	0.55	0.85	0.26	0.66	0.54	0.24	0.6
lcl\|BLLF01002693.1_cds_GFH25013.1_19490 (GFH25013)	0.74	0.37	0.0	0.14	0.13	0.27	0.13	0.09	0.14	0.38	0.19	0.15	0.14	0.15	0.09	0.43	0.21	1.0	0.25	0.42	0.92	0.53	0.77	0.45	0.32	0.4
lcl\|BLLF01002713.1_cds_GFH25084.1_19561 (GFH25084)	0.7	0.27	0.25	0.17	0.08	0.07	0.05	0.06	0.12	0.13	0.05	0.05	0.1	0.08	0.12	0.2	0.42	0.88	0.51	0.25	0.92	0.39	1.0	0.43	0.12	0.13
lcl\|BLLF01002732.1_cds_GFH25144.1_19621 (GFH25144)	0.27	0.3	0.85	0.67	0.47	0.5	0.46	0.27	0.47	0.59	0.59	0.45	0.32	0.35	0.39	0.62	0.82	0.72	0.26	0.29	1.0	0.22	0.72	0.81	0.41	0.38
lcl\|BLLF01002870.1_cds_GFH25633.1_20110 (GFH25633)	0.98	0.76	0.0	0.08	0.31	0.27	0.25	0.21	0.31	0.7	0.32	0.24	0.24	0.22	0.19	0.7	0.14	0.52	0.31	0.41	1.0	0.47	0.53	0.44	0.53	0.92
lcl\|BLLF01003522.1_cds_GFH27554.1_22031 (GFH27554)	0.79	0.03	0.0	0.22	0.04	0.01	0.02	0.0	0.03	0.12	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.09	0.12	0.9	0.19	0.16	1.0	0.2	0.57	0.35	0.01	0.07
lcl\|BLLF01003809.1_cds_GFH28267.1_22744 (GFH28267)	0.79	0.32	0.34	0.19	0.53	0.29	0.34	0.69	0.49	0.33	0.41	0.41	0.39	0.44	0.48	0.39	0.49	0.45	0.36	0.43	0.37	0.59	0.37	1.0	0.73	0.44
lcl\|BLLF01004246.1_cds_GFH29225.1_23702 (GFH29225)	0.45	0.24	0.2	0.75	0.49	0.39	0.43	0.34	0.48	0.47	0.43	0.29	0.29	0.28	0.29	0.63	1.0	0.71	0.33	0.45	0.73	0.38	0.65	0.59	0.49	0.3
lcl\|BLLF01004498.1_cds_GFH29729.1_24206 (GFH29729)	0.48	0.55	0.0	0.0	0.04	0.15	0.08	0.03	0.1	1.0	0.08	0.05	0.01	0.04	0.11	0.32	0.14	0.8	0.0	0.3	0.83	0.48	0.1	0.24	0.79	0.83
lcl\|BLLF01004627.1_cds_GFH29976.1_24453 (GFH29976)	0.14	0.0	1.0	0.01	0.03	0.03	0.06	0.03	0.02	0.7	0.05	0.02	0.05	0.06	0.08	0.17	0.32	0.44	0.7	0.4	0.32	0.61	0.33	0.48	0.06	0.04
lcl\|BLLF01004758.1_cds_GFH30192.1_24669 (GFH30192)	0.75	1.0	0.03	0.04	0.1	0.17	0.2	0.18	0.3	0.47	0.1	0.11	0.12	0.08	0.21	0.94	0.12	0.15	0.14	0.26	0.44	0.27	0.23	0.57	0.52	0.96
lcl\|BLLF01005264.1_cds_GFH30971.1_25448 (GFH30971)	0.78	0.71	0.68	0.36	0.4	0.51	0.47	0.31	0.45	0.82	0.41	0.41	0.4	0.34	0.34	0.98	0.95	0.73	0.52	0.49	0.87	0.71	0.9	0.78	0.87	1.0
lcl\|BLLF01005730.1_cds_GFH31566.1_26043 (GFH31566)	0.55	0.39	0.95	0.55	0.49	0.38	0.28	0.29	0.37	1.0	0.36	0.31	0.24	0.23	0.29	0.73	0.91	0.9	0.28	0.28	0.74	0.51	0.69	0.89	0.4	0.37
lcl\|BLLF01006764.1_cds_GFH32535.1_27012 (GFH32535)	0.41	0.63	0.09	0.24	0.31	0.29	0.2	0.12	0.24	0.67	0.25	0.2	0.19	0.18	0.11	0.93	0.34	0.4	0.29	0.36	0.79	0.2	0.37	0.46	0.81	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)