Heatmap: Cluster_218 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
BOF 92
BOF 92,Log
CCMP1516,Log,5mM sulfate,ESAW,15C
CCMP1516,Log,25mM sulfate,ESAW,15C
CCMP2090
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,18C
CCMP2090,Log,DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP370,pH7.8,Aquil,20C
CCMP370,pH8.1,Aquil,20C
CCMP371,17C
CCMP373,Log
CCMP373,Stationary
CCMP374,Log
CCMP374,Stationary
CCMP374,pH8.3,F/2-Si,18C
CCMP379,pH8.3,F/2-Si,18C
PLY M219,pH7.8,Aquil,20C
PLY M219,pH8.1,Aquil,20C
RCC1253
RCC3782
RCC6660,Log,pH7.2
RCC6660,Log,pH7.5
RCC6660,Log,pH7.8
RCC6660,Log,pH8.2
RCC6666,Log,pH7.2
RCC6666,Log,pH7.5
RCC6666,Log,pH7.8
RCC6666,Log,pH8.2
UNC1419,Log,Aquil,12C
- - - - -2.09 -2.95 -2.44 - -1.67 -3.79 - - -2.74 -1.84 - - -6.66 3.12 3.78 - - -2.06 3.14 - - 0.94 0.24 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.79 2.85 0.36 -1.36 1.26 0.49 0.77 0.12 1.37 - -0.51 0.83 - - -4.04 - 0.88 - 0.15 - - - -0.56 0.17 - - - 1.75 -0.47 -26.02 - 2.27 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -2.59 3.9 3.4 - - -3.59 1.77 - - 2.79 - - - - - - - - - -
- - 2.43 - -4.33 - - - - - - - - - - - - 3.66 2.33 - - - -1.39 2.39 2.7 -1.3 -1.3 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.71 3.3 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.71 - - - - - - - - - - - - -0.84 -1.56 -0.42 3.84 2.28 - - - -1.47 1.8 1.71 1.36 1.0 - - - - - -4.23 -3.19 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -4.43 3.19 3.51 1.08 2.55 - - - - 2.89 - - - - - - - - - -
-5.8 -2.18 -6.82 - -10.73 -10.24 - - -11.09 - - - -10.8 - -3.43 -3.73 -0.69 3.64 3.64 -0.17 0.27 -1.73 -0.37 -3.29 -3.74 -5.76 -3.96 0.13 0.26 0.39 -0.34 -1.38 -1.19 -1.35 -1.18 -0.8
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -4.33 -4.25 1.5 1.57 1.2 1.25 1.18 0.74 0.35 -4.5 1.63 1.28 - - -7.71 -3.46 -2.4 - - - 0.37 - - 3.71 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - -
- - 3.65 3.61 - -2.19 - -1.62 -0.42 - -1.15 - -0.91 -0.04 - - 0.38 - - - - - - - - -0.2 -0.38 - - - 2.34 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.63 3.04 - - - - 2.84 2.59 1.14 - - - - - - - - - -
0.55 - -15.15 - -0.74 -0.03 0.07 -3.3 0.52 -2.0 -0.96 -0.16 -0.5 -0.26 -0.81 -16.14 -16.93 3.12 3.22 -14.11 - 3.09 -16.29 - -20.42 - - - - - -14.23 - - -17.75 -19.23 -18.19
4.12 - - -2.47 0.23 1.57 1.41 -1.45 -0.31 -4.07 -4.59 -4.12 0.56 0.65 - - - - - - - - - - - - - -4.19 - - - - -0.83 -2.44 -7.25 2.68
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.74 -0.4 0.0 -1.51 -3.76 -3.52 -3.6 -3.05 -3.18 -3.37 -3.49 -2.26 -3.55 -3.06 0.06 0.31 -0.06 1.06 1.06 -1.06 -0.34 -1.61 -1.25 -1.65 -1.95 1.11 -1.38 -0.79 -0.63 -1.31 -1.57 -1.51 -0.71 -1.08 -1.0 1.59
2.65 - - - - - 0.95 - - - -1.17 - - -0.7 - - - - 2.16 - - - - - - - 4.48 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.56 - - - - - - - - - - - - - - - 1.53 -5.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.26
- - - - - - - - - - - - - - - - -3.7 - - -2.41 - - 5.16 - - -17.51 - - - - - - - - - -
- - - 0.74 -2.35 -3.44 - -1.42 -3.44 - -0.61 1.51 -2.88 - - - - 4.09 2.61 - - 0.42 2.31 - - - -0.9 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 2.82 4.17 - - - 0.45 - - 2.63 1.73 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -3.62 4.05 4.15 - - - - -3.24 -3.23 - - - - - - - - - - 0.52
2.65 - - - - - 0.61 - - - -1.32 - - -1.08 - - - - 1.86 - - - - - - 4.57 - - - - - - - - - -
- - 0.6 - - - - - - - - - - - - - 0.98 4.53 - 1.1 1.62 - - - - - 2.07 - - - - - - - - -
- - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.06 2.51 -1.45 - - -8.67 - - - - - - - - - - -1.28 4.24 2.43 - - - - -3.32 -5.92 -0.04 -4.96 - - - - - - - - -
-0.63 -3.48 -1.41 -1.24 -3.55 -4.77 -4.35 -4.47 -3.93 -2.98 -2.09 -3.39 -3.6 -3.8 -1.02 -1.52 -1.46 2.41 3.68 -0.29 1.95 2.12 -1.07 -1.88 -2.14 0.16 -1.54 -1.51 -1.57 -1.97 -2.19 -2.27 -1.47 -1.94 -1.66 -1.18
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.73 2.95 - -0.43 - -0.18 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.63 - - - - - - - 3.48 - - - - - - - - -
- 0.2 -0.31 -0.41 -4.61 - -4.93 -4.29 -6.12 - -5.49 - - -6.05 - - -1.0 3.18 3.2 -0.4 - 2.73 - -2.23 - -0.39 1.93 - -3.12 - -4.2 - - -2.58 - 0.89
- - 0.11 - - - - - - - - - - - - - -5.08 1.18 4.82 - 1.14 - - - - - -1.79 0.26 - - -1.48 -2.51 - - -2.29 -
- - - - -0.0 -4.18 -3.75 -0.64 -4.71 -0.41 -0.6 1.42 -2.1 -3.95 - - - 4.55 -0.02 - -1.08 - -0.01 -0.94 - 0.13 1.2 - - - - - - - - -
- - - - -2.85 0.09 1.24 -5.57 -5.01 - -6.2 - -5.49 - - - 0.86 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.8 - 1.39
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.27 - - - - - 5.14 - - - - - - - - - -
- 0.88 - - -1.47 -1.01 - -3.19 - -1.46 - 0.71 -1.75 - - - -1.0 - - - - -0.2 3.49 - - 3.81 1.02 0.21 - - - - - - - 0.17
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.68 -1.71 - -4.62 -4.42 -4.8 -4.54 -3.73 -3.12 -2.35 -4.83 -4.58 -4.08 - - -1.68 2.35 3.86 -0.23 2.1 -3.46 - - - -0.16 -2.67 -0.16 0.46 -0.42 -1.44 -0.19 -0.33 -0.23 -0.1 0.37
0.01 - - - -3.32 - - - - - - - - - - - -4.15 4.12 1.18 - - - -1.59 3.33 2.27 - - - - - - - - - - -
- - 0.24 - -1.44 -1.51 -1.15 -0.1 -1.15 1.38 0.88 1.97 -1.76 -3.61 - - - 1.46 2.78 - - - - - - 3.8 - - - - - - - - - -
- - - - - - - 1.95 - - - - - - - - - - - - - - 5.01 - - - - - - - - - - - - -
-2.48 - -0.44 - - - - -6.3 - - - - - - 0.27 0.42 0.37 -2.27 -3.2 - -3.42 0.66 - 0.42 -0.09 -0.21 -0.52 1.87 1.73 2.5 2.44 0.21 0.48 0.9 0.64 0.46
- - - - - - - - - - - - - - - - -2.83 1.51 2.69 - - 0.96 4.35 - - 2.09 - - - - - - - - - -
- - -4.46 - - - - -7.67 - - - - - - -2.55 -3.11 - 3.96 4.3 - - - -1.41 -4.29 - - -4.46 - - - - - - - - -
- - -2.77 - - - - - - - - - - - - - -5.74 -0.4 -0.9 1.28 -0.23 1.13 - -4.14 -1.82 -2.06 -4.05 1.81 1.64 1.74 0.98 2.0 1.65 1.54 2.42 0.13
- - -1.33 - -5.88 -6.95 - -4.21 - -3.85 - -1.82 - -5.77 - -4.0 -3.58 4.76 -0.27 - - -3.24 1.9 - - 0.98 0.27 -4.16 - - -5.11 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.