Heatmap: Cluster_202 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000037.9 (tig00000037_g10076.t1)	0.06	0.16	0.28	0.37	0.43	0.4	0.63	0.63	0.7	0.65	0.53	0.44	0.06	0.57	0.5	0.66	0.54	0.8	0.62	0.5	0.23	0.69	1.0	0.67	0.85	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000093.135 (tig00000093_g3561.t1)	0.04	0.06	0.11	0.25	0.2	0.28	0.34	0.39	0.55	0.5	0.34	0.29	0.03	0.86	0.32	0.88	0.42	0.64	0.35	0.39	0.21	1.0	0.65	0.28	0.73	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000093.147 (tig00000093_g3575.t1)	0.08	0.14	0.25	0.35	0.4	0.4	0.58	0.49	0.53	0.45	0.36	0.32	0.11	0.67	0.42	0.73	0.59	0.75	0.68	0.49	0.18	0.66	1.0	0.71	0.87	0.93
Cpa\|evm.model.tig00000145.35 (tig00000145_g8835.t1)	0.32	0.37	0.32	0.41	0.3	0.3	0.4	0.44	0.73	0.73	0.64	0.58	0.29	0.39	0.22	0.32	0.32	0.8	0.38	0.38	0.12	0.56	1.0	0.69	0.82	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000158.112 (tig00000158_g10214.t2)	0.18	0.19	0.21	0.33	0.28	0.2	0.42	0.55	0.6	0.56	0.5	0.32	0.17	0.46	0.41	0.56	0.42	0.65	0.38	0.38	0.11	0.68	1.0	0.53	0.58	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000217.12 (tig00000217_g19148.t1)	0.15	0.14	0.14	0.23	0.25	0.19	0.37	0.36	0.3	0.33	0.31	0.25	0.11	0.39	0.31	0.57	0.3	0.75	0.55	0.43	0.19	0.61	1.0	0.46	0.59	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000237.30 (tig00022075_g23564.t1)	0.12	0.17	0.33	0.31	0.38	0.3	0.34	0.29	0.29	0.44	0.36	0.33	0.1	0.51	0.37	0.46	0.29	0.45	0.31	0.28	0.17	1.0	0.38	0.37	0.73	0.81
Cpa\|evm.model.tig00000237.32 (tig00000237_g20481.t1)	0.2	0.33	0.44	0.49	0.53	0.44	0.65	0.6	0.8	0.7	0.62	0.63	0.23	0.86	0.59	0.87	0.67	0.83	0.71	0.54	0.28	0.9	0.99	0.78	1.0	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000293.10 (tig00000572_g2208.t1)	0.03	0.01	0.04	0.14	0.25	0.28	0.4	0.3	0.5	0.53	0.46	0.37	0.07	0.78	0.41	0.78	0.54	0.61	0.44	0.34	0.45	1.0	0.6	0.65	0.71	0.68
Cpa\|evm.model.tig00000367.17 (tig00000367_g24453.t1)	0.25	0.24	0.31	0.31	0.2	0.15	0.18	0.25	0.19	0.23	0.23	0.28	0.22	0.34	0.44	0.78	0.19	0.25	0.28	0.21	0.18	1.0	0.33	0.44	0.7	0.72
Cpa\|evm.model.tig00000383.59 (tig00000383_g24673.t1)	0.23	0.19	0.19	0.34	0.34	0.3	0.46	0.5	0.56	0.49	0.43	0.27	0.18	0.61	0.43	0.62	0.42	0.71	0.5	0.3	0.61	1.0	0.85	0.69	0.91	0.65
Cpa\|evm.model.tig00000383.97 (tig00000383_g24707.t1)	0.22	0.29	0.27	0.46	0.44	0.38	0.46	0.36	0.46	0.45	0.4	0.39	0.16	0.53	0.4	0.5	0.36	0.61	0.51	0.2	0.25	0.8	0.48	0.7	1.0	0.69
Cpa\|evm.model.tig00000403.86 (tig00000403_g346.t1)	0.31	0.25	0.31	0.38	0.35	0.34	0.5	0.54	0.59	0.63	0.57	0.47	0.36	0.38	0.49	1.0	0.39	0.64	0.36	0.37	0.05	0.61	0.83	0.45	0.78	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000430.38 (tig00000430_g623.t1)	0.22	0.56	0.47	0.49	0.49	0.42	0.56	0.54	0.57	0.63	0.62	0.58	0.2	0.6	0.5	0.5	0.5	0.82	0.78	0.61	0.37	0.78	1.0	0.82	0.67	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000451.17 (tig00000451_g974.t1)	0.07	0.16	0.24	0.26	0.38	0.41	0.5	0.48	0.78	0.59	0.7	0.55	0.09	0.74	0.52	0.58	0.28	0.5	0.36	0.31	0.07	1.0	0.75	0.49	0.64	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000492.78 (tig00000492_g1469.t1)	0.26	0.26	0.32	0.46	0.46	0.45	0.67	0.67	0.68	0.66	0.49	0.41	0.27	0.71	0.53	0.84	0.64	0.97	0.8	0.85	0.16	0.99	1.0	0.43	0.87	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000615.32	0.13	0.19	0.21	0.29	0.3	0.3	0.33	0.31	0.35	0.37	0.37	0.37	0.14	0.61	0.24	0.63	0.33	0.36	0.18	0.26	0.19	1.0	0.31	0.44	0.53	0.7
Cpa\|evm.model.tig00000691.10 (tig00000691_g3160.t1)	0.32	0.45	0.47	0.51	0.52	0.48	0.56	0.56	0.58	0.58	0.65	0.6	0.35	0.59	0.59	0.64	0.48	0.77	0.64	0.47	0.45	0.97	1.0	0.64	0.6	0.7
Cpa\|evm.model.tig00000737.29 (tig00000737_g3809.t1)	0.01	0.19	0.29	0.53	0.55	0.33	0.37	0.45	0.55	0.48	0.5	0.46	0.02	0.31	0.3	0.36	0.28	0.39	0.3	0.2	0.08	1.0	0.45	0.62	0.8	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000769.10 (tig00000769_g4005.t1)	0.33	0.35	0.4	0.45	0.43	0.25	0.36	0.4	0.41	0.47	0.59	0.68	0.38	0.46	0.53	0.54	0.49	0.55	0.51	0.35	0.19	1.0	0.62	0.58	0.63	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000789.19 (tig00000789_g4113.t1)	0.05	0.33	0.48	0.57	0.5	0.46	0.57	0.53	0.54	0.55	0.57	0.46	0.07	0.73	0.79	0.75	0.64	0.72	0.7	0.5	0.49	0.94	1.0	0.7	0.73	0.63
Cpa\|evm.model.tig00000821.60 (tig00000821_g4520.t1)	0.05	0.16	0.27	0.41	0.47	0.41	0.48	0.46	0.52	0.53	0.48	0.4	0.06	0.48	0.69	0.81	0.52	0.7	0.46	0.39	0.28	0.91	1.0	0.62	0.83	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000836.21 (tig00000836_g4703.t1)	0.24	0.23	0.34	0.38	0.38	0.27	0.61	0.67	0.59	0.6	0.62	0.62	0.2	0.59	0.41	0.64	0.56	0.73	0.47	0.38	0.12	0.95	0.66	0.57	1.0	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000849.32 (tig00000849_g4772.t1)	0.02	0.06	0.17	0.48	0.55	0.33	0.42	0.35	0.58	0.5	0.55	0.44	0.02	0.38	0.33	0.27	0.17	0.34	0.23	0.12	0.06	0.8	0.57	0.77	1.0	0.73
Cpa\|evm.model.tig00000851.35 (tig00000851_g4919.t1)	0.1	0.12	0.18	0.27	0.2	0.15	0.18	0.2	0.28	0.35	0.43	0.48	0.11	0.35	0.16	0.3	0.22	0.26	0.18	0.25	0.1	1.0	0.55	0.51	0.36	0.63
Cpa\|evm.model.tig00001024.32 (tig00001024_g6340.t1)	0.29	0.48	0.51	0.6	0.61	0.57	0.72	0.76	0.63	0.6	0.52	0.49	0.28	0.7	0.73	0.76	0.71	0.89	0.77	0.67	0.3	0.66	1.0	0.62	0.8	0.8
Cpa\|evm.model.tig00001093.7 (tig00001093_g6883.t1)	0.16	0.32	0.36	0.38	0.47	0.39	0.58	0.55	0.61	0.66	0.59	0.52	0.2	0.64	0.53	0.68	0.53	0.96	0.67	0.53	0.28	1.0	0.9	0.89	0.92	0.71
Cpa\|evm.model.tig00001094.8 (tig00001094_g6979.t1)	0.16	0.15	0.21	0.28	0.33	0.32	0.39	0.34	0.36	0.41	0.37	0.41	0.21	0.57	0.34	0.55	0.4	0.53	0.29	0.38	0.25	1.0	0.4	0.47	0.47	0.51
Cpa\|evm.model.tig00001110.4 (tig00001110_g7078.t1)	0.15	0.29	0.39	0.37	0.25	0.23	0.39	0.52	0.52	0.58	0.63	0.71	0.17	0.48	0.46	0.44	0.4	0.49	0.38	0.37	0.22	1.0	0.67	0.62	0.71	0.74
Cpa\|evm.model.tig00001155.25 (tig00001155_g7331.t1)	0.01	0.02	0.05	0.11	0.29	0.38	0.49	0.4	0.44	0.41	0.29	0.22	0.02	0.53	0.28	1.0	0.25	0.43	0.24	0.14	0.06	0.51	0.94	0.48	0.45	0.3
Cpa\|evm.model.tig00001215.17 (tig00001215_g7583.t1)	0.13	0.18	0.29	0.4	0.4	0.33	0.36	0.38	0.4	0.52	0.45	0.34	0.15	0.7	0.3	0.83	0.37	0.42	0.37	0.45	0.16	1.0	0.43	0.61	0.76	1.0
Cpa\|evm.model.tig00001366.12 (tig00001366_g8386.t1)	0.02	0.03	0.09	0.11	0.15	0.32	0.57	0.47	0.82	0.5	0.42	0.27	0.03	0.73	0.51	0.6	0.39	0.51	0.31	0.21	0.47	0.89	0.64	0.6	1.0	0.8
Cpa\|evm.model.tig00020553.131 (tig00020553_g10619.t1)	0.08	0.13	0.14	0.16	0.2	0.27	0.25	0.22	0.24	0.27	0.26	0.26	0.09	0.85	0.61	1.0	0.57	0.71	0.45	0.46	0.1	0.58	0.79	0.74	0.68	0.68
Cpa\|evm.model.tig00020554.76 (tig00020554_g10856.t1)	0.11	0.28	0.3	0.41	0.44	0.35	0.49	0.57	0.58	0.59	0.56	0.44	0.13	0.59	0.36	1.0	0.36	0.58	0.42	0.38	0.09	0.68	0.66	0.46	0.64	0.57
Cpa\|evm.model.tig00020563.66 (tig00020563_g11242.t1)	0.31	0.26	0.31	0.39	0.39	0.28	0.55	0.54	0.58	0.53	0.51	0.41	0.31	0.83	0.52	0.8	0.54	0.92	0.62	0.43	0.25	1.0	0.63	0.63	0.72	0.68
Cpa\|evm.model.tig00020848.58 (tig00020848_g14588.t1)	0.45	0.39	0.45	0.5	0.51	0.47	0.84	0.73	0.68	0.59	0.53	0.56	0.56	0.87	0.71	0.92	0.75	1.0	0.61	0.59	0.21	0.78	0.89	0.52	0.65	0.66
Cpa\|evm.model.tig00020848.72 (tig00020848_g14604.t1)	0.16	0.25	0.3	0.4	0.42	0.32	0.55	0.48	0.52	0.52	0.49	0.45	0.17	0.71	0.63	0.71	0.63	0.77	0.68	0.52	0.4	1.0	0.96	0.84	0.8	0.72
Cpa\|evm.model.tig00020848.87 (tig00020848_g14617.t1)	0.17	0.24	0.21	0.27	0.31	0.3	0.4	0.48	0.5	0.54	0.55	0.49	0.17	0.4	0.28	0.44	0.28	0.78	0.59	0.31	0.29	0.66	1.0	0.66	0.76	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020965.2 (tig00020965_g16820.t1)	0.24	0.33	0.31	0.44	0.54	0.52	0.66	0.58	0.71	0.68	0.51	0.42	0.2	0.71	0.49	0.84	0.43	0.73	0.41	0.4	0.2	0.86	0.85	0.58	1.0	0.74
Cpa\|evm.model.tig00021070.99 (tig00021070_g17914.t1)	0.14	0.2	0.23	0.25	0.26	0.29	0.42	0.41	0.52	0.48	0.54	0.43	0.22	0.77	0.65	0.77	0.84	0.8	0.73	0.49	0.11	0.9	0.97	0.89	1.0	0.67
Cpa\|evm.model.tig00021108.26 (tig00021108_g18316.t1)	0.21	0.29	0.39	0.51	0.6	0.52	0.52	0.44	0.56	0.49	0.5	0.42	0.13	0.72	0.55	1.0	0.38	0.47	0.48	0.38	0.1	0.9	0.72	0.63	0.86	0.78
Cpa\|evm.model.tig00021122.15 (tig00021122_g18446.t1)	0.28	0.33	0.37	0.54	0.55	0.44	0.52	0.52	0.51	0.52	0.53	0.48	0.3	0.49	0.4	0.46	0.38	0.6	0.52	0.32	0.3	0.88	0.48	0.7	1.0	0.74
Cpa\|evm.model.tig00021128.14 (tig00021128_g18895.t1)	0.03	0.05	0.26	0.38	0.31	0.23	0.31	0.37	0.41	0.48	0.57	0.51	0.03	0.72	0.45	0.66	0.52	0.56	0.55	0.41	0.19	1.0	0.71	0.75	0.87	0.67
Cpa\|evm.model.tig00021319.27 (tig00021319_g20221.t1)	0.22	0.23	0.28	0.44	0.38	0.4	0.48	0.5	0.59	0.56	0.54	0.3	0.14	0.95	0.65	0.87	0.47	0.88	0.56	0.61	0.1	1.0	0.8	0.58	0.51	0.57
Cpa\|evm.model.tig00021348.29 (tig00021348_g20532.t1)	0.17	0.19	0.24	0.31	0.25	0.17	0.29	0.3	0.27	0.34	0.29	0.25	0.17	0.74	0.39	0.8	0.45	0.53	0.38	0.35	0.1	1.0	0.44	0.34	0.86	0.48
Cpa\|evm.model.tig00021350.9 (tig00020528_g9982.t1)	0.29	0.24	0.33	0.39	0.38	0.31	0.48	0.49	0.47	0.53	0.48	0.42	0.29	0.58	0.39	0.5	0.39	0.63	0.42	0.35	0.37	1.0	0.8	0.72	0.76	0.79
Cpa\|evm.model.tig00021357.1 (tig00021357_g20734.t1)	0.25	0.32	0.35	0.47	0.53	0.46	0.56	0.49	0.54	0.43	0.5	0.39	0.22	0.53	0.43	0.6	0.41	0.54	0.54	0.36	0.13	1.0	0.49	0.6	0.86	0.89
Cpa\|evm.model.tig00021434.14 (tig00021434_g21310.t1)	0.07	0.15	0.19	0.24	0.21	0.21	0.22	0.17	0.23	0.25	0.25	0.33	0.06	0.29	0.24	0.46	0.19	0.25	0.22	0.22	0.04	1.0	0.35	0.35	0.44	0.59
Cpa\|evm.model.tig00021434.31 (tig00021434_g21334.t1)	0.01	0.12	0.16	0.19	0.09	0.23	0.28	0.27	0.25	0.21	0.18	0.14	0.01	0.29	0.18	0.26	0.1	0.25	0.2	0.14	0.11	1.0	0.31	0.1	0.62	0.64
Cpa\|evm.model.tig00021464.29 (tig00021464_g21734.t1)	0.2	0.25	0.28	0.35	0.48	0.34	0.52	0.43	0.45	0.43	0.37	0.33	0.21	0.7	0.49	0.82	0.42	0.76	0.45	0.37	0.18	1.0	0.62	0.41	0.98	0.69
Cpa\|evm.model.tig00021489.9 (tig00021489_g21656.t1)	0.08	0.3	0.34	0.43	0.46	0.44	0.63	0.61	0.66	0.6	0.59	0.52	0.08	1.0	0.77	0.98	0.69	0.75	0.69	0.54	0.5	1.0	0.72	0.75	0.83	0.68
Cpa\|evm.model.tig00021537.26 (tig00021537_g22281.t1)	0.16	0.17	0.27	0.46	0.46	0.45	0.53	0.47	0.51	0.59	0.66	0.5	0.07	0.83	0.45	0.89	0.4	0.62	0.42	0.31	0.13	1.0	0.86	0.62	0.62	0.68
Cpa\|evm.model.tig00021623.6 (tig00021623_g23007.t1)	0.31	0.27	0.41	0.51	0.44	0.39	0.7	0.64	0.62	0.7	0.55	0.57	0.36	0.81	0.54	1.0	0.65	0.83	0.57	0.65	0.21	0.96	0.81	0.37	0.6	0.53
Cpa\|evm.model.tig00021687.5 (tig00021687_g23113.t1)	0.15	0.24	0.23	0.35	0.3	0.28	0.38	0.38	0.43	0.47	0.44	0.33	0.15	0.64	0.47	0.6	0.49	0.75	0.44	0.43	0.37	1.0	0.79	0.82	0.76	0.74

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)