Heatmap: Cluster_234 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
BOF 92
BOF 92,Log
CCMP1516,Log,5mM sulfate,ESAW,15C
CCMP1516,Log,25mM sulfate,ESAW,15C
CCMP2090
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,18C
CCMP2090,Log,DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP370,pH7.8,Aquil,20C
CCMP370,pH8.1,Aquil,20C
CCMP371,17C
CCMP373,Log
CCMP373,Stationary
CCMP374,Log
CCMP374,Stationary
CCMP374,pH8.3,F/2-Si,18C
CCMP379,pH8.3,F/2-Si,18C
PLY M219,pH7.8,Aquil,20C
PLY M219,pH8.1,Aquil,20C
RCC1253
RCC3782
RCC6660,Log,pH7.2
RCC6660,Log,pH7.5
RCC6660,Log,pH7.8
RCC6660,Log,pH8.2
RCC6666,Log,pH7.2
RCC6666,Log,pH7.5
RCC6666,Log,pH7.8
RCC6666,Log,pH8.2
UNC1419,Log,Aquil,12C
- - - - - - - - 4.73 - - - - 3.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.79 - -3.1 0.57 2.29 2.1 1.17 -1.21 -1.3 - -2.41 2.41 - - - - 1.47 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.7 1.86 0.29 0.29 -4.24 1.13 0.98 0.92 0.19 0.44 -1.98 0.38 - - -4.02 - - - - - -3.5 - - 0.97 2.13 - - - - - - - - -1.96
- - 0.05 - 1.61 0.22 -0.26 1.0 -0.17 0.03 0.49 -0.97 1.0 0.13 - - -1.2 2.49 2.2 -1.44 -0.17 - -0.6 -1.09 -1.12 -0.97 -2.44 -0.67 -0.47 -0.66 0.73 0.13 -1.93 0.22 -0.86 -3.55
- - 0.94 - 0.26 2.93 1.43 0.91 -2.49 -2.01 -1.09 3.84 1.43 0.89 - - -3.25 -0.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.9 - - -0.42 1.69 - - 0.83 - 2.51 - - 2.38 - - 0.88 - - - - - -14.66 - -21.27 0.66 - - - - 2.05 - 1.11 - 1.09 -
- -3.75 - - 1.58 -0.29 -18.91 -16.57 1.48 -17.26 -16.64 -7.6 -18.5 -6.76 - - -1.19 - 2.89 - -4.51 4.41 - - - -23.03 - -4.65 -14.43 - -3.92 -4.86 - - - -
- - - - 2.74 0.61 2.99 0.11 2.01 1.16 2.85 -0.32 0.4 1.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.97 - 1.23 0.56 -1.16 0.79 1.41 1.38 -0.28 - 1.81 -2.3 - - - - - - - - - - - 2.17 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 2.52 - - - 3.63 - - - - - - - - - 4.16 - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.2 - - - - 3.79 - - 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.69 - 1.17 0.91 0.55 0.7 1.0 1.56 1.82 0.82 -0.25 1.14 - -1.41 2.12 0.61 - - 0.32 - -27.42 -0.2 1.71 -3.35 1.1 - - - - - - - - -
- 0.09 2.92 2.68 0.02 0.71 0.82 0.9 1.1 1.13 1.5 0.73 0.68 0.77 - - -4.91 -0.02 - - - - 0.31 - - - - -1.92 - - - - - - - -
- - 3.71 - 4.5 - - - -1.6 - - - - -12.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.08 2.84 1.89 2.07 1.06 1.88 0.65 - 0.96 2.34 - - 0.33 - - - - - - - - 2.1 - - - - - - - - - -
- - 0.32 - - 1.72 - 2.71 3.13 -0.42 1.78 -21.59 0.35 3.05 - - - - - - - - - - - 1.26 - - - - - - - - - -
- - 3.79 - -3.1 0.57 2.29 2.1 1.17 -1.21 -1.3 - -2.41 2.41 - - - - 1.47 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 0.86 1.22 -0.35 1.92 - 0.28 -0.52 0.44 - -0.33 2.11 2.27 1.14 -1.88 - - - - 3.3 - - - - - - - - - 0.83 - - - -
- - - 2.88 -1.0 1.56 0.05 2.93 0.17 1.74 1.03 - 1.76 0.52 -0.52 0.51 -1.36 - - - - - - -0.67 - - - - - - -0.58 -1.5 -0.5 -1.5 - -
- 1.52 - - -0.54 0.71 0.76 0.34 1.18 2.07 0.29 - 0.54 1.78 - - -0.89 - - 2.11 -2.22 0.99 - - - - 0.59 - - - 2.75 - - - - -
- - - - 1.43 - 1.26 3.29 2.27 - - 3.62 1.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 5.17 -7.95 - -7.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.53 2.59 1.73 - - - - -1.47 1.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.35 0.86 0.28 0.62 1.67 1.63 - -0.01 -0.41 - 1.09 - - -3.33 - - - - 2.86 1.91 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 0.99 2.15 -0.9 3.06 - 0.15 - - 1.13 - - - - - 2.87 3.33 - - - - - - - - - - - - - - -
-0.14 -1.78 2.09 1.54 -0.24 -0.62 -0.51 -0.34 -3.18 -0.01 0.95 -1.34 -0.54 -0.74 -3.92 -4.49 -5.89 -4.94 - - - -1.21 -1.92 -4.68 -5.66 0.51 -1.68 1.04 1.37 1.33 -0.15 0.97 1.38 1.23 1.2 -
- - 2.13 - 2.23 0.52 - 3.44 - 0.65 2.68 - 1.94 1.51 - - - - - - - - - - - - - - - - -16.16 - - - - -
- 4.0 - - - - - 0.85 3.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.8 - - - - - - - - -
- - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - -3.85 -10.94 4.54 -16.26 2.12 - 3.06 -21.76 - -14.86 -11.51 - - - - - - - - - - - - - - - - -17.92 - - - - -
- - - - 0.11 0.98 -1.8 0.71 -1.09 0.21 -1.05 - -2.22 - -1.05 - - - 1.01 2.9 2.94 - - - -2.48 - 2.51 1.26 - - -4.1 - - 0.32 -0.72 -0.12
3.55 - - - -3.68 0.88 1.09 0.95 1.66 0.6 -1.73 0.8 -2.35 -2.42 - - -1.83 - - 0.88 -10.86 - - - - - -9.59 - -22.64 - - - - - - 3.19
- 0.82 2.07 1.17 0.43 0.76 0.54 -0.25 0.7 0.45 0.97 2.09 -0.21 -0.45 -0.8 -0.38 -1.65 -0.24 0.94 - 2.27 -1.23 -2.53 - 0.22 - - - - - - - -2.52 -1.95 -2.48 -
- - - - - - - - - - - - - 3.36 - - - - - - - - 4.69 - - - - - - - - - - - - -
- 2.49 - - - -1.25 1.18 1.15 1.53 0.01 0.34 0.4 0.43 2.17 - - -2.15 1.57 -0.3 - 0.63 - 2.27 - - -0.31 - - - - - - -2.05 - - 0.79
- 3.24 - - 3.63 -1.21 - - -0.15 - - 2.89 0.16 -0.52 - - - - - - - - - - - - 1.86 - - - - - - - - -
- - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.66 0.68 1.1 1.13 1.47 0.26 -0.84 - 0.22 1.86 - - - - - - - - - - - - -0.81 1.47 0.1 2.85 -0.27 2.12 -1.33 -0.32 0.21 -
- - - - - 3.66 - 3.56 - -2.06 -16.03 - - - - - - - 3.51 - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.16 - 1.85 - 0.45 -1.83 0.53 2.51 0.96 2.55 1.74 -1.03 -0.96 0.86 - - -0.15 - - -0.75 - - 1.22 - - - - - - - - - - 0.4 -4.76 -
- - 1.1 1.82 0.43 0.89 1.13 1.96 0.94 1.57 1.57 0.04 1.24 0.36 - - - 0.91 1.16 0.41 0.57 -25.86 - - - -18.52 -8.64 - - - 0.64 - - - - -
- - 1.22 1.03 1.68 1.43 -0.62 0.76 0.26 0.42 1.22 0.73 0.95 -0.34 - - - - - - - - -1.42 2.45 1.88 -1.69 - - - - 0.44 - - - -2.7 1.48
- - -0.54 - -0.85 - 0.12 -0.48 -0.04 -0.66 -0.21 - -1.69 0.55 - - -2.99 - - 0.18 - - - - - -0.03 - 2.47 -0.08 0.63 1.88 1.81 2.0 0.65 2.28 -0.24
- - - - 0.34 2.78 1.03 2.62 1.28 0.92 1.11 - 1.04 1.86 - - -5.72 - - - - -2.57 - - - - - -0.29 -0.21 1.08 -1.03 0.88 -0.73 -0.68 - -
- - - - 2.44 - - - 3.04 0.49 3.69 - -0.82 2.34 - - - - - - - - - - - - - 1.25 - - - - - - - -
- - - - 2.65 3.03 - - - - - - 2.38 - - - 1.47 - - - - - - - - - 3.76 - - - - - - - - -
- - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -18.74
2.67 - 0.56 - 0.45 2.02 -0.61 -1.49 1.5 0.71 -0.15 2.08 0.19 2.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.69 - - - -
- - - - - 0.98 - 0.41 3.85 2.72 - 3.3 0.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.91 - 3.91 1.72 - - - 1.51 - - - - - - - - 0.47 - - - - 2.09 - - 0.26 - - - - - - - - -1.24 -
- - - - -1.24 -1.35 - 1.62 1.54 0.32 -0.05 - -0.78 -0.81 1.2 - -3.17 - - - - - - - -0.27 3.12 - - 2.14 0.29 -0.49 -0.52 1.64 1.17 0.57 -
- - -0.16 - -0.62 -0.38 0.9 -0.82 1.37 0.61 2.85 1.55 0.88 0.01 0.16 0.18 -0.18 - - - - - - 1.0 0.01 - 1.77 0.03 - 0.72 - -0.83 - - - 0.49
- - -1.06 - -1.36 -1.95 0.38 0.24 0.56 0.33 0.83 0.64 -0.62 -1.67 - 0.88 1.35 0.22 - -1.13 - 0.39 - - 0.45 -2.67 1.64 -0.72 0.54 0.42 -1.11 1.74 0.52 1.32 0.35 -0.01
- - - - 1.29 0.78 0.16 2.6 0.48 1.4 2.94 - 2.1 1.47 - - -2.0 - - - - - - - - 1.29 1.33 - -0.5 - - - - - - -
- - - - - - - - 1.82 - - - - - 2.75 - - - - - - - - - 2.61 - 2.36 - - - - - - - - 3.86
- - - - 0.48 2.95 1.65 2.93 2.33 0.23 1.79 - 0.17 2.01 - - - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.98 - - 2.07 -0.39 1.18 1.71 0.19 -2.75 0.44 0.5 2.78 0.49 1.89 - - -1.16 - - - - - - - - - - - -0.67 - - - - - -0.91 -
- - - - 0.94 1.63 -0.13 3.3 - 0.88 2.62 0.72 - -0.61 - - - 2.2 1.9 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.65
- - 1.73 1.39 1.96 1.32 -0.96 - 1.68 - - 0.22 1.0 0.13 - - - 1.62 - - - - 1.97 - 0.69 2.43 0.76 - - - - - - - - -
- - - - 0.15 3.35 1.93 2.08 -1.32 -0.83 0.09 -0.24 1.61 2.06 - - -3.05 0.84 - - 2.22 - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.67 4.04 -2.74 1.74 2.04 1.17 2.12 -0.57 -0.16 - -25.68 0.09 - - - - - - - 0.48 - - -21.9 -0.52 - - - - - - - - - -
- 3.12 - - 2.62 1.46 0.85 1.31 - 1.96 -0.05 - 1.88 1.8 - - -2.2 - - -0.18 - - - - - - - - - - - - - - - -0.02
- - 4.49 - 0.13 - - 2.99 0.42 - 0.61 - 0.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.22 1.87 - - 0.72 - 0.79 -2.77 1.28 -0.43 - 1.72 - 0.35 - - -3.88 - - 3.76 - -17.43 - - - - - - 0.42 -0.55 - - - -0.23 - -
- - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.67 0.5 1.5 1.26 1.46 1.86 0.91 1.9 1.3 0.56 1.07 1.18 1.79 0.89 -0.55 0.47 - - - - - - - - - - 0.1 - - - - - - - - -
- - - - 2.11 1.76 -0.72 1.99 0.87 - 1.71 4.07 0.39 -0.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.25 1.73 - 0.55 1.17 3.14 0.64 0.68 2.21 0.6 -0.66 -0.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-5.57 0.84 0.03 3.16 -0.99 0.78 0.28 -0.23 0.07 - 0.61 - -2.83 -0.25 - - -5.2 -0.13 1.35 0.33 - -0.75 0.13 - - - - - 2.5 - - -3.08 -5.06 -11.0 0.35 1.54
- - - - 0.44 - - - - 0.78 - - -0.07 2.84 - - - - - 2.48 3.83 2.33 - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.