Heatmap: Cluster_149 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
BOF 92
BOF 92,Log
CCMP1516,Log,5mM sulfate,ESAW,15C
CCMP1516,Log,25mM sulfate,ESAW,15C
CCMP2090
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,18C
CCMP2090,Log,DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP370,pH7.8,Aquil,20C
CCMP370,pH8.1,Aquil,20C
CCMP371,17C
CCMP373,Log
CCMP373,Stationary
CCMP374,Log
CCMP374,Stationary
CCMP374,pH8.3,F/2-Si,18C
CCMP379,pH8.3,F/2-Si,18C
PLY M219,pH7.8,Aquil,20C
PLY M219,pH8.1,Aquil,20C
RCC1253
RCC3782
RCC6660,Log,pH7.2
RCC6660,Log,pH7.5
RCC6660,Log,pH7.8
RCC6660,Log,pH8.2
RCC6666,Log,pH7.2
RCC6666,Log,pH7.5
RCC6666,Log,pH7.8
RCC6666,Log,pH8.2
UNC1419,Log,Aquil,12C
- - - - - - -2.95 - - - - 0.64 - - - - -1.33 - - - - - - - - - - - -0.42 4.24 0.67 0.98 1.26 0.72 2.73 -
- 1.63 0.77 - 0.45 0.74 0.68 1.61 0.21 -0.12 -1.37 1.5 1.88 -0.63 - - -0.99 - - - - - - - 0.92 2.23 2.5 - - - - - 0.17 - - -
- - - - 1.02 -0.14 0.13 -0.36 1.23 0.7 0.46 1.6 1.13 - - - - - - - - - - - - 1.61 - 1.5 2.61 2.06 1.54 -1.9 - - 0.38 -
- - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.48 - 3.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.59 2.41 - 0.56 0.82 -0.18 -0.37 0.05 -0.6 -0.22 1.03 0.41 1.12 - - -2.58 2.96 - - - - - 1.48 -0.09 1.07 1.28 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.06 - - - - - - -
- -1.77 -0.41 - 1.8 0.86 -0.55 -0.84 -12.13 -3.03 - - 0.2 -0.12 - - 0.08 2.09 1.99 2.01 3.56 - -2.43 - - -3.33 -2.77 - - - -1.33 - - - - -1.89
- - - - - - - - - - - - - - - 3.6 3.23 - - - 3.12 - 2.52 - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.81 2.91 2.39 0.81 1.78 2.48 0.91 - 1.03 - - - - - - - - - 2.35 - - - - - - - - - - - - -
- - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.29 1.88 - 2.09 1.21 - - 2.84 3.4 1.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.59 - - - - - - - - - - - - - - - 1.01 - - - - - - - - - 4.46
- - - -7.91 - -1.29 0.84 1.13 1.63 -11.64 1.94 0.55 -0.56 0.85 - - 0.37 2.27 - -0.58 -7.85 2.62 2.16 -7.44 - - - - - - - - - - - 1.74
- 0.2 2.86 - -2.13 - - -2.14 0.9 -1.83 -1.15 0.06 -1.22 -1.02 - - -1.19 2.85 1.81 -0.07 2.34 -2.77 - - - - -0.66 - - - - -0.38 1.49 - - -0.0
- - - 2.2 -0.1 -0.33 -0.83 1.04 1.25 1.01 0.92 1.51 -0.69 - - - -2.74 4.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.66 -17.33 -0.89 -1.27 - 0.15 -2.36 -0.21 - - - 3.04 - - - - - - 2.93 3.57 - - - -5.5 - - - - - - 1.0
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - 3.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.23 4.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.52 1.02 2.0 1.83 - - - 2.7 2.0 2.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.4 -0.96 1.09 - 0.37 1.09 0.69 -0.8 -0.28 -2.5 - 2.04 1.43 -1.45 - 1.13 0.5 0.69 -0.63 0.25 1.11 -0.99 0.29 -0.71 -0.73 - - -1.44 -0.81 - -3.11 -0.42 -2.81 -0.49 -1.95 1.68
- - - - - 2.75 - - - 2.62 - 2.48 - - - - 0.88 - - - - - 3.97 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 1.95 - - - - -0.1 - - - - - - - - - - - - 4.27 - 2.58 - - 2.56 -
- - - - -0.0 - - -23.54 2.19 - - - -3.48 - - - - - - - - - - - - - 4.35 2.27 2.23 - - - - -0.97 - -
- - - - - 0.67 - 1.89 3.06 - - - 4.11 2.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.96 2.28 2.53 1.57 -0.01 0.21 1.34 1.15 0.85 -0.92 1.72 1.18 - - -22.81 -2.37 - - - - -0.11 -0.92 - - -2.51 - -20.47 - 0.83 - - - - -3.0
- -1.67 - - -0.38 0.17 0.11 0.7 1.16 1.7 1.43 - -0.93 0.5 - - 1.81 - - - - -0.36 1.92 3.01 1.81 - - -1.93 -0.91 - -0.84 - - - - -
- 0.3 - - -0.39 0.45 -0.13 1.14 1.14 -1.29 1.83 - 0.37 0.81 - - -1.27 - - - - 2.06 0.33 2.43 1.49 - -0.93 - 0.6 - -4.58 -1.44 -3.31 1.01 -4.37 0.7
- - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.08 - - 0.92 2.18 0.99 1.84 0.82 - - - -0.31 -3.43 - - -1.25 - - - -4.09 - - - - - - - - - - - - 2.0 - -
-10.93 - 1.0 2.23 2.21 - - - - - - - -2.95 -15.65 -0.91 0.63 0.55 0.73 -1.68 1.68 2.58 2.57 -0.61 - -1.87 0.02 -24.05 - - - 0.84 - -2.72 - - -
- - - - - - - - - - 3.52 - - - - - - - - - - - - - - - 4.62 - - - - - - - - -
- - - - 2.6 2.55 - - - - 2.12 3.24 0.78 - - - -0.73 - - - - - - - - - - - - - - 2.01 - 1.98 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.32 - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 1.66 5.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.81 -1.65 3.31 - - - - 4.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.5 - - -0.12 -0.43 0.44 1.48 -0.07 1.25 1.09 - 1.27 0.27 - -1.67 0.51 -1.59 - 2.37 2.8 -0.63 0.37 0.79 - 0.49 0.16 - - - - - - - - -
- - - - 2.25 - -0.04 - 1.38 - - 1.6 - - - - 1.65 - - - - - 2.35 1.56 - 1.19 0.2 - - - - - - - - 3.32
- - - - 2.56 0.57 - - -0.3 0.72 1.11 2.9 1.0 - - - - - - - - 2.86 2.87 - - - - - - - - - - - - -
-0.35 1.3 - - -2.03 -0.82 0.01 -1.26 0.39 -3.62 - - -0.34 0.34 2.82 3.66 -2.93 - - - -0.28 2.58 -1.24 - - - - - - - - - - - - -
- - 0.51 2.51 -0.66 -1.15 -0.21 0.17 0.16 -2.49 -1.08 0.34 -0.31 0.11 - - - - - - - - - - - - - 0.52 1.09 -0.25 1.73 1.72 1.13 0.65 2.62 -
- - - - - 3.16 - - - - - - 4.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.87 - -2.16 -1.62 -0.15 - - 0.36 -0.8 2.99 3.39 - - 2.13 - - 2.3 - - - - - - 0.36 - - - - - - -
- - -0.33 - -1.44 -0.18 1.76 -0.52 0.52 1.28 -0.19 -0.03 1.18 0.84 - - -0.84 - 2.29 1.65 2.68 -1.23 - 2.14 -1.83 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.26 - - - - - - - - - - - - - 4.07 - - - - - -
- -4.03 1.23 1.86 -1.2 -0.43 0.06 -0.73 0.39 0.04 -0.08 -0.73 0.06 -0.46 -0.95 0.53 0.33 -0.77 -0.94 -3.7 0.81 0.29 -1.44 1.32 -0.16 -3.17 -1.93 -0.27 -0.29 -0.36 -0.14 0.53 0.46 0.08 -0.26 0.92
- - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.53 -0.18 - 1.87 -0.2 1.8 1.89 1.64 1.14 0.38 1.64 -0.4 0.51 0.39 - 0.15 -2.52 0.22 -0.63 1.48 -5.49 -0.26 -0.88 - -0.27 0.77 - - - - -27.0 - - -2.22 - -4.7
- - 1.67 - - -1.09 - - - - - - - - - - 3.75 - - - - - - - - 3.44 - - 0.77 - -20.39 1.6 - - - 1.73
- - 1.2 - -0.31 - - - - - - 0.96 - - 2.62 1.78 0.37 - - - - - 1.7 1.58 - - 1.13 - 2.2 - - - 0.6 0.54 0.63 1.35
- - - - - - - - - - - 4.23 4.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 2.98 - - 4.14 - - - - - 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -12.37 -10.08 -11.64 -10.62 -10.63 -10.89 -10.54 -13.34 -11.74 - -14.27 -11.85 -1.33 3.77 1.77 3.11 -13.5 - 2.86 -16.03 -21.55 -0.57 - -19.98 - -15.3 -14.56 - -9.68 -13.17 -11.69 -14.97 0.99 -
- - - - 1.09 0.11 2.42 -1.03 3.05 2.04 - - 2.07 -0.45 - - - - 3.27 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -1.29 1.27 1.81 2.6 1.37 2.3 2.07 0.56 -0.03 1.56 - - 1.05 - - - - - - - - 1.54 0.59 - - - - - - - - -
- - - - - - - - 1.47 - - - -0.16 - - 4.51 -0.93 - - - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 0.77 2.9 - 1.82 - - 2.53 - - - - - - - - 4.13 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.95 - - - - 4.27 - 3.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.43 - - 3.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.74 - - -23.23 0.84 2.77 1.13 2.16 0.98 - 1.69 - -0.43 0.56 - - -17.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.83 2.82 - 0.77 - 2.39 3.35 2.0 2.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 1.61 2.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.59 - - 3.81 -
- - - - - -0.75 - - - - - 1.53 - - 2.17 4.52 -1.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.23 -
0.4 -0.96 1.09 - 0.37 1.09 0.69 -0.8 -0.28 -2.5 - 2.04 1.43 -1.45 - 1.13 0.5 0.69 -0.63 0.25 1.11 -0.99 0.29 -0.71 -0.73 - - -1.44 -0.81 - -3.11 -0.42 -2.81 -0.49 -1.95 1.68
- - - - - - - 3.47 - - - - 4.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -17.58 -16.73 - - - - - - - - - - 2.4 - - 0.83 - - - - - - - 4.85 - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.21 1.59 -0.44 0.51 3.07 1.41 - - 1.2 - - - - - - - - 2.16 1.8 - - - - - - - - - - - 2.3
-21.75 1.07 -8.28 0.26 0.23 1.11 0.12 -0.42 0.86 -0.06 -1.48 1.0 -0.25 1.33 - - -1.02 - - - - - 1.29 2.11 2.14 -0.4 -4.26 -4.05 -19.46 -1.65 0.79 -2.05 -3.99 -1.96 -0.36 1.63
- - - - - - - - - - 2.56 - 1.6 3.2 3.05 - 3.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 3.69 - - 3.8 - - - - 3.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.