Heatmap: Cluster_152 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000093.143 (tig00000093_g3570.t1)	0.08	0.04	0.03	0.06	0.12	0.31	0.7	0.48	0.52	0.45	0.28	0.16	0.09	1.0	0.48	0.59	0.36	0.3	0.39	0.22	0.22	0.28	0.9	0.53	0.26	0.26
Cpa\|evm.model.tig00000093.168 (tig00000093_g3595.t1)	0.28	0.15	0.23	0.19	0.16	0.24	0.34	0.32	0.69	0.38	0.35	0.35	0.29	0.5	0.91	0.64	0.78	0.64	0.76	0.52	0.54	0.5	1.0	0.65	0.56	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000093.17 (tig00000093_g3454.t1)	0.83	0.55	0.58	0.58	0.69	0.62	0.62	0.6	0.66	0.67	0.73	0.91	0.92	1.0	0.92	0.97	0.64	0.76	0.74	0.56	0.39	0.95	0.96	0.6	0.7	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000144.170 (tig00000144_g9163.t1)	0.01	0.02	0.02	0.06	0.21	0.41	0.51	0.34	1.0	0.59	0.43	0.33	0.03	0.82	0.44	0.66	0.47	0.39	0.37	0.19	0.42	0.27	0.9	1.0	0.47	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000147.19 (tig00000147_g9456.t1)	0.25	0.35	0.28	0.31	0.31	0.38	0.56	0.56	0.66	0.63	0.58	0.52	0.31	0.87	0.38	1.0	0.31	0.39	0.41	0.31	0.41	0.55	0.74	0.69	0.58	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000197.7 (tig00000197_g15687.t1)	0.22	0.25	0.26	0.28	0.31	0.33	0.36	0.33	0.47	0.45	0.41	0.35	0.21	0.54	1.0	0.52	0.36	0.55	0.39	0.33	0.21	0.73	0.53	0.48	0.48	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000204.95 (tig00000204_g17761.t2)	0.12	0.14	0.45	0.62	0.61	0.72	0.6	0.63	0.58	0.63	0.59	0.52	0.11	1.0	0.54	0.92	0.39	0.46	0.5	0.48	0.02	0.12	0.77	0.5	0.47	0.67
Cpa\|evm.model.tig00000254.3 (tig00000254_g22448.t1)	0.63	0.31	0.35	0.5	0.54	0.38	0.58	0.62	0.47	0.54	0.65	0.59	0.66	0.93	0.63	0.82	0.63	0.95	0.66	0.68	0.48	0.91	1.0	0.74	0.91	0.65
Cpa\|evm.model.tig00000254.4 (tig00000254_g22450.t1)	0.69	0.41	0.46	0.59	0.61	0.57	0.67	0.68	0.59	0.58	0.67	0.72	0.77	0.89	0.76	0.78	0.64	0.76	0.77	0.71	0.44	0.78	1.0	0.64	0.76	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000448.64 (tig00000448_g899.t1)	0.17	0.13	0.21	0.25	0.25	0.33	0.44	0.31	0.61	0.37	0.33	0.26	0.19	0.63	0.84	0.67	1.0	0.48	0.39	0.3	0.34	0.32	0.85	0.63	0.49	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000448.89 (tig00000448_g925.t1)	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.03	0.1	0.04	0.04	0.03	0.02	0.75	1.0	0.36	0.1	0.17	0.18	0.04	0.66	0.1	0.25	0.11	0.17	0.1
Cpa\|evm.model.tig00000494.1 (tig00000494_g1573.t1)	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.16	0.35	0.15	0.84	0.17	0.1	0.07	0.03	0.79	0.79	0.32	0.32	0.15	0.2	0.12	0.16	0.28	1.0	0.55	0.14	0.19
Cpa\|evm.model.tig00000640.11 (tig00000640_g2766.t1)	0.54	0.29	0.3	0.46	0.29	0.21	0.34	0.23	0.46	0.23	0.29	0.33	0.48	0.96	0.45	0.68	0.15	0.29	0.33	0.23	0.24	0.47	1.0	0.44	0.7	0.63
Cpa\|evm.model.tig00000655.17 (tig00000655_g2843.t1)	0.08	0.04	0.04	0.06	0.06	0.14	0.25	0.25	0.28	0.35	0.25	0.14	0.09	0.83	0.92	0.37	0.52	0.35	0.24	0.21	0.04	0.24	1.0	0.3	0.46	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000754.20 (tig00000754_g3903.t1)	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.04	0.05	0.11	0.04	0.02	0.01	0.01	0.43	0.56	0.33	0.16	0.11	0.09	0.07	0.92	0.06	1.0	0.13	0.13	0.19
Cpa\|evm.model.tig00000769.39 (tig00000769_g4036.t1)	0.18	0.25	0.31	0.26	0.3	0.24	0.2	0.16	0.16	0.15	0.14	0.17	0.14	0.32	1.0	0.23	0.25	0.21	0.27	0.22	0.06	0.07	0.58	0.29	0.39	0.69
Cpa\|evm.model.tig00000802.8 (tig00000802_g4259.t1)	0.87	0.62	0.75	0.76	0.8	0.87	0.97	1.0	0.88	0.69	0.68	0.7	0.88	0.88	0.52	0.73	0.47	0.56	0.46	0.52	0.22	0.16	0.72	0.4	0.86	0.81
Cpa\|evm.model.tig00000836.27 (tig00000836_g4707.t1)	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.08	0.14	0.1	0.3	0.07	0.05	0.02	0.01	0.74	1.0	0.58	0.22	0.21	0.17	0.08	0.84	0.05	0.98	0.15	0.17	0.19
Cpa\|evm.model.tig00000842.39 (tig00000842_g4858.t1)	0.16	0.17	0.21	0.29	0.23	0.23	0.4	0.37	0.35	0.3	0.36	0.37	0.22	0.56	0.65	0.84	0.53	0.37	0.29	0.35	0.29	0.05	1.0	0.65	0.43	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000842.40 (tig00000842_g4859.t1)	0.31	0.2	0.36	0.41	0.51	0.29	0.51	0.48	0.43	0.57	0.7	0.62	0.37	0.72	0.89	0.95	0.52	0.4	0.39	0.36	0.4	0.11	1.0	0.93	0.63	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000849.17 (tig00000849_g4758.t1)	0.05	0.02	0.04	0.06	0.08	0.31	0.28	0.11	0.36	0.14	0.15	0.16	0.05	0.88	0.62	0.84	0.29	0.19	0.18	0.1	0.22	0.14	1.0	0.72	0.18	0.32
Cpa\|evm.model.tig00000939.5 (tig00000939_g5483.t1)	0.5	0.22	0.21	0.23	0.18	0.16	0.18	0.29	0.26	0.32	0.31	0.31	0.35	1.0	0.43	0.93	0.26	0.38	0.52	0.36	0.12	0.02	0.86	0.62	0.47	0.39
Cpa\|evm.model.tig00000949.46 (tig00000949_g5757.t1)	0.29	0.27	0.23	0.25	0.32	0.45	0.59	0.48	0.6	0.41	0.37	0.35	0.25	0.67	0.71	0.75	0.69	0.54	0.46	0.4	0.65	0.36	1.0	0.63	0.32	0.3
Cpa\|evm.model.tig00001130.7 (tig00001130_g7236.t1)	0.39	0.47	0.43	0.41	0.49	0.61	0.62	0.53	0.72	0.57	0.51	0.51	0.33	1.0	0.73	0.99	0.53	0.65	0.71	0.6	0.1	0.35	0.8	0.6	0.46	0.42
Cpa\|evm.model.tig00001178.2 (tig00000788_g4091.t1)	0.21	0.09	0.09	0.15	0.05	0.0	0.21	0.18	0.12	0.03	0.09	0.06	0.06	0.36	0.95	0.33	0.82	0.3	0.55	0.09	0.27	0.47	1.0	0.39	0.45	0.88
Cpa\|evm.model.tig00001181.23 (tig00001181_g7437.t1)	0.07	0.02	0.03	0.11	0.18	0.18	0.32	0.36	0.25	0.44	0.41	0.26	0.11	0.31	0.13	0.67	0.2	0.42	0.37	0.29	0.29	0.24	1.0	0.39	0.43	0.48
Cpa\|evm.model.tig00001181.24 (tig00001181_g7437.t1)	0.12	0.03	0.05	0.17	0.27	0.33	0.5	0.45	0.35	0.56	0.49	0.35	0.15	0.45	0.21	0.86	0.24	0.47	0.46	0.39	0.26	0.18	1.0	0.47	0.42	0.64
Cpa\|evm.model.tig00001339.30	0.05	0.01	0.01	0.0	0.07	0.4	0.63	0.25	1.0	0.38	0.29	0.35	0.03	0.71	0.69	0.54	0.38	0.33	0.13	0.16	0.52	0.05	0.91	0.18	0.6	0.33
Cpa\|evm.model.tig00020528.4 (tig00020528_g9979.t1)	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.11	0.11	0.23	0.1	0.05	0.02	0.02	0.64	0.33	0.57	0.29	0.21	0.19	0.1	1.0	0.06	0.85	0.32	0.1	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020553.29 (tig00020553_g10519.t1)	0.1	0.15	0.21	0.25	0.26	0.16	0.21	0.23	0.31	0.31	0.32	0.23	0.11	0.41	0.72	1.0	0.18	0.65	0.46	0.32	0.26	0.29	0.76	0.4	0.25	0.4
Cpa\|evm.model.tig00020554.124 (tig00020554_g10900.t1)	0.16	0.06	0.09	0.19	0.31	0.39	0.52	0.65	0.71	0.82	0.66	0.6	0.24	0.98	0.39	0.58	0.51	0.64	0.43	0.32	0.31	0.53	0.82	1.0	0.51	0.55
Cpa\|evm.model.tig00020554.87 (tig00020554_g10866.t1)	0.02	0.0	0.01	0.02	0.12	0.28	0.33	0.13	0.67	0.49	0.47	0.49	0.03	0.82	0.57	0.39	0.36	0.25	0.16	0.19	0.56	0.7	1.0	0.7	0.32	0.38
Cpa\|evm.model.tig00020563.16 (tig00020563_g11196.t1)	0.08	0.05	0.07	0.06	0.08	0.05	0.05	0.05	0.05	0.08	0.14	0.21	0.12	0.16	1.0	0.69	0.3	0.26	0.25	0.13	0.19	0.2	0.59	0.24	0.29	0.38
Cpa\|evm.model.tig00020610.70 (tig00020610_g12014.t1)	0.12	0.1	0.07	0.09	0.09	0.11	0.2	0.19	0.18	0.17	0.16	0.1	0.09	0.74	1.0	0.49	0.27	0.36	0.34	0.18	0.09	0.88	0.7	0.25	0.38	0.23
Cpa\|evm.model.tig00020675.31 (tig00020675_g12613.t1)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.21	0.16	0.87	0.8	0.66	0.31	0.01	0.54	0.47	0.21	0.12	0.13	0.1	0.17	0.03	0.01	1.0	0.52	0.15	0.23
Cpa\|evm.model.tig00020675.32 (tig00020675_g12614.t1)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.25	0.18	1.0	0.83	0.65	0.32	0.02	0.54	0.54	0.16	0.12	0.13	0.11	0.14	0.04	0.01	0.98	0.56	0.12	0.24
Cpa\|evm.model.tig00020710.88 (tig00020710_g13351.t1)	0.21	0.14	0.17	0.19	0.21	0.22	0.33	0.33	0.3	0.36	0.39	0.35	0.22	0.77	0.34	1.0	0.26	0.26	0.29	0.26	0.23	0.28	0.93	0.54	0.42	0.41
Cpa\|evm.model.tig00020830.120 (tig00020830_g14506.t1)	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.08	0.21	0.06	0.7	0.33	0.39	0.24	0.04	0.42	0.41	0.21	0.14	0.04	0.04	0.02	0.22	0.56	1.0	0.52	0.17	0.05
Cpa\|evm.model.tig00020902.10 (tig00020902_g14952.t1)	0.02	0.01	0.04	0.05	0.09	0.18	0.25	0.16	0.39	0.34	0.36	0.33	0.02	0.77	0.75	0.83	0.55	0.46	0.27	0.27	0.55	0.31	1.0	0.69	0.51	0.5
Cpa\|evm.model.tig00020904.109 (tig00020904_g15238.t1)	0.03	0.06	0.08	0.1	0.1	0.1	0.14	0.12	0.06	0.07	0.06	0.05	0.03	0.32	1.0	0.26	0.18	0.09	0.07	0.06	0.05	0.1	0.65	0.15	0.61	0.42
Cpa\|evm.model.tig00020911.62 (tig00020911_g15766.t1)	0.38	0.22	0.19	0.25	0.28	0.12	0.2	0.28	0.27	0.33	0.31	0.26	0.26	0.91	0.27	0.59	0.24	0.46	0.44	0.3	0.46	0.34	1.0	0.48	0.43	0.46
Cpa\|evm.model.tig00020965.40 (tig00020965_g16855.t1)	0.19	0.27	0.26	0.28	0.21	0.12	0.24	0.24	0.32	0.45	0.47	0.5	0.23	0.71	0.54	0.57	0.8	0.82	0.72	0.52	0.34	0.14	1.0	0.58	0.3	0.33
Cpa\|evm.model.tig00021168.51 (tig00021168_g19119.t2)	0.0	0.01	0.03	0.1	0.23	0.45	0.31	0.13	0.13	0.09	0.06	0.02	0.0	0.46	0.91	0.52	0.03	0.14	0.11	0.11	0.06	1.0	0.64	0.23	0.25	0.3
Cpa\|evm.model.tig00021234.35 (tig00021234_g19409.t1)	0.24	0.26	0.24	0.28	0.35	0.32	0.42	0.4	0.49	0.54	0.57	0.53	0.35	1.0	0.52	0.7	0.38	0.45	0.47	0.45	0.14	0.23	0.99	0.76	0.43	0.5
Cpa\|evm.model.tig00021312.17 (tig00021312_g20053.t1)	0.62	0.36	0.47	0.56	0.59	0.76	0.79	0.97	0.82	0.62	0.6	0.52	0.49	0.93	0.38	1.0	0.45	0.5	0.49	0.53	0.11	0.24	0.67	0.62	0.77	0.78
Cpa\|evm.model.tig00021312.18 (tig00021312_g20053.t1)	0.49	0.3	0.34	0.47	0.44	0.57	0.77	0.71	0.66	0.58	0.48	0.44	0.38	1.0	0.31	0.99	0.39	0.52	0.48	0.55	0.08	0.22	0.66	0.66	0.57	0.75
Cpa\|evm.model.tig00021326.45 (tig00021326_g20310.t1)	0.17	0.34	0.43	0.3	0.15	0.15	0.29	0.47	0.88	0.73	0.81	0.64	0.15	0.4	0.41	0.54	0.39	0.18	0.31	0.32	0.09	0.14	1.0	0.37	0.3	0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)