Heatmap: Cluster_124 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
BOF 92
BOF 92,Log
CCMP1516,Log,5mM sulfate,ESAW,15C
CCMP1516,Log,25mM sulfate,ESAW,15C
CCMP2090
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,18C
CCMP2090,Log,DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP370,pH7.8,Aquil,20C
CCMP370,pH8.1,Aquil,20C
CCMP371,17C
CCMP373,Log
CCMP373,Stationary
CCMP374,Log
CCMP374,Stationary
CCMP374,pH8.3,F/2-Si,18C
CCMP379,pH8.3,F/2-Si,18C
PLY M219,pH7.8,Aquil,20C
PLY M219,pH8.1,Aquil,20C
RCC1253
RCC3782
RCC6660,Log,pH7.2
RCC6660,Log,pH7.5
RCC6660,Log,pH7.8
RCC6660,Log,pH8.2
RCC6666,Log,pH7.2
RCC6666,Log,pH7.5
RCC6666,Log,pH7.8
RCC6666,Log,pH8.2
UNC1419,Log,Aquil,12C
- - 2.46 - 1.45 1.93 1.32 -0.65 1.5 2.68 1.47 1.04 2.36 0.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.91 1.83 0.79 0.93 2.04 3.86 2.35 - 0.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.29 - - - - - - 1.96 - - - - 4.22 - - - 3.1 - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.39 - 1.02 0.99 -1.06 2.07 0.97 0.67 0.51 - -0.63 1.28 2.0 - 0.78 - - - - - - - - 0.6 - -0.51 0.53 - -0.49 1.88 - 1.19 1.29 -
- - - - - 3.19 - - - - - - 2.41 - - - - - - - - - - - 4.43 - - - - - - - - - - -
- - 2.84 3.31 0.53 2.03 1.26 1.55 -3.38 2.11 1.26 - -0.59 -0.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 2.7 - - - - 1.88 1.07 - - - - - - - - 3.95 - - - 0.06 2.86 - - - - - - - -
- 1.97 2.37 - -1.25 -0.25 0.62 0.7 -1.59 1.05 0.96 - -0.42 -1.07 -2.34 -0.72 0.73 1.96 2.56 - - 0.3 1.8 - - - - - - - - - - - - -
- - 2.43 1.53 -1.85 1.44 - -0.29 -1.36 1.19 -0.16 1.89 1.01 0.72 - - - - - - - -0.57 - - 1.2 3.32 - - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.05 - 3.46 - - - - - - - - - - - 4.07 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.78 - - -0.93 -1.51 -2.6 0.14 -0.24 0.47 -1.03 -0.67 -0.4 -1.26 - - 0.53 1.08 - 2.74 1.79 - 0.64 - - - - - 0.59 - 2.06 1.61 - - 1.3 0.25
- - 0.59 - - 1.38 1.69 2.1 2.27 2.05 0.81 2.65 1.21 2.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 3.27 1.24 - 1.5 - - - - 3.17 - - - 3.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.93 2.18 1.08 1.23 2.09 - - 0.76 3.11 2.23 - - - 1.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.19 1.62 0.23 2.71 2.65 3.07 - -1.83 1.71 - - 2.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.16 0.45 2.25 1.14 1.53 -0.0 2.12 3.38 0.08 -2.02 - - - - - - - - 1.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.82 - - - - - - - - - - 2.1 - - - - - - - - - - 3.61 0.69 - 2.26 - 2.0 - 2.47 -
- - - - 3.42 - - - - - - - - - - - - 4.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.57 2.92 0.99 2.93 3.26 0.39 - - 2.28 -2.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.96 - - - - - - - - - - 2.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.62 3.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.23 - 2.53 3.68 - - 2.31 - - - 1.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.19 - - - - 2.92 - - - - - - - - - - - - - - - 1.18 - 4.09 - - -
- - - - - - - 3.05 - 3.46 - - - - - - - - - - - 4.07 - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.25 - -1.1 -0.6 -0.11 - 0.64 - -0.74 0.19 - -2.15 1.82 0.6 -0.42 1.32 2.5 - - - 2.07 2.54 - 0.75 - - - - - - - - - -
- 4.86 - - 0.97 - - 1.46 - - - - -1.21 - - - -0.87 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - -
- - - 0.65 -0.36 1.36 0.97 2.14 1.32 2.16 1.2 2.97 0.52 2.03 - - 0.09 - -0.02 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 2.79 - - - - - - - - - - - - - - - 3.98 - 3.74 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.88 0.53 - - - - - - - - - - 3.53 3.97 - - -17.61 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 1.21 - 3.86 - 4.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -16.14 3.69 0.6 2.02 1.51 -0.23 -1.65 -3.72 -4.09 3.67 -0.68 -14.21 - - - - - - - - - - - - - - - - -17.26 - - - - -
0.48 - - 3.3 -6.54 1.35 -2.51 2.36 1.65 2.19 0.64 - 0.91 -1.12 - - -0.28 - - - - - - - - - 1.56 - - - - - - - - 0.61
- - - - - - - 3.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.51 - - - - - - - - - -
- - - -0.54 0.37 2.37 -0.03 0.34 -0.24 3.76 1.3 -18.15 1.02 0.48 - - - - - - - - - - - 0.65 - - - - -15.97 - - - - 2.24
- - - - 1.44 - - - - - - - - - - 4.51 - - - - - - - - - - - - - - 3.4 - - - - -
- - - - 1.77 2.53 - - 2.46 2.48 - - - 0.52 - - -0.59 - - - - - 3.77 - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.43 1.59 - 0.1 0.83 0.12 1.92 1.36 -1.17 1.51 - 1.95 -1.74 - - - - - - - - - 2.53 - - - - - - - - 2.76
- - - - 1.85 1.42 - - -0.22 - - - - - - - 1.57 2.61 - - 2.74 - - - - - 1.07 - - - - 1.56 - - - 3.0
- - - - 1.78 1.07 - -1.07 2.04 - 2.46 0.79 0.79 1.61 - - - - - - - - - - 0.27 - - -0.72 - 2.73 -0.64 -0.63 -0.62 0.38 1.13 -
- - -16.14 3.69 0.6 2.02 1.51 -0.23 -1.65 -3.72 -4.09 3.67 -0.68 -14.21 - - - - - - - - - - - - - - - - -17.26 - - - - -
- - -2.69 - 1.79 2.26 1.79 2.13 -0.73 2.62 2.3 - 0.32 0.68 - -1.07 -1.44 0.78 - 1.36 - -6.86 - - - - - - - - - - - -3.15 - -
- - - - - 3.6 - 3.45 - 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.91 - 2.29 1.48 - 0.06 -0.53 - - 1.78 2.63 0.67 - - -1.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.88 2.52 0.95 -0.61 0.99 - 1.28 1.94 2.13 -25.97 0.82 - - - - 2.57 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.31 - - -2.59 -1.48 - 1.81 - -0.34 3.71 - - - - - - - - - 3.72 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.29 2.57 1.83 2.68 2.83 - - - 1.24 2.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.16 0.83 - - - - 0.2 - - - - - 0.57 - - - 2.46 - - 2.35 - 0.99 - - - - - - - - - 4.18
- - - - 1.14 2.08 - - - - - 2.41 - 1.07 - - - - - - - 4.04 2.52 - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.95 1.43 -1.12 - - - - - -1.08 - - - - 4.35 3.52 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.76 2.62 -0.39 2.16 1.32 1.12 1.68 0.5 0.05 1.23 1.65 1.75 -3.2 - -5.49 - -2.48 -3.74 -3.86 -2.5 -1.59 -1.55 -2.55 -3.66 -3.08 -4.67 -6.57 - 0.39 - -4.62 -5.54 -4.51 -0.75
- - 2.37 - - 2.57 0.72 1.95 2.24 - - 3.69 0.32 - - - -1.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.72 1.83 - 2.01 2.36 1.14 1.43 0.68 1.16 2.14 1.03 -0.02 -3.15 - - -1.84 2.12 - - - - - - - - - - - -1.6 - - - - - 0.52
- - - - -0.16 1.97 2.61 -1.02 1.63 -0.17 2.42 3.74 0.35 -0.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.16 1.97 2.61 -1.02 1.63 -0.17 2.42 3.74 0.35 -0.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 2.74 - - - - - - - - 0.28 - 4.81 - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.94 - -0.96 1.2 -1.33 0.93 0.35 -0.04 0.09 -1.4 -0.88 - 0.68 0.87 1.34 0.13 - 1.13 1.89 1.23 1.94 0.49 -0.46 -1.67 0.03 - - - - -2.33 - - - - - -
- - - - - 4.22 - 1.33 - - - - 1.28 1.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.16 -
1.78 -1.04 -0.34 - -0.78 -1.0 -0.45 -0.63 0.1 -1.59 -1.31 1.42 0.09 -0.62 1.14 0.98 -0.03 -1.27 -1.13 -1.92 -1.4 0.07 -0.85 0.76 1.27 0.71 0.81 -0.03 0.08 - -0.86 -0.51 0.74 0.35 -0.69 -
- - - - - 3.82 3.32 - 2.12 - - - - 2.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.27 -3.72 0.26 0.83 1.62 1.98 0.19 2.05 0.91 2.31 1.4 1.85 1.76 1.33 -6.29 - -1.79 - - - - -5.02 -3.77 -14.53 -26.39 -3.1 -3.49 -3.27 -3.35 -2.15 -0.95 -25.0 - - -29.81 -4.95

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.