Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
BOF 92
BOF 92,Log
CCMP1516,Log,5mM sulfate,ESAW,15C
CCMP1516,Log,25mM sulfate,ESAW,15C
CCMP2090
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,18C
CCMP2090,Log,DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP370,pH7.8,Aquil,20C
CCMP370,pH8.1,Aquil,20C
CCMP371,17C
CCMP373,Log
CCMP373,Stationary
CCMP374,Log
CCMP374,Stationary
CCMP374,pH8.3,F/2-Si,18C
CCMP379,pH8.3,F/2-Si,18C
PLY M219,pH7.8,Aquil,20C
PLY M219,pH8.1,Aquil,20C
RCC1253
RCC3782
RCC6660,Log,pH7.2
RCC6660,Log,pH7.5
RCC6660,Log,pH7.8
RCC6660,Log,pH8.2
RCC6666,Log,pH7.2
RCC6666,Log,pH7.5
RCC6666,Log,pH7.8
RCC6666,Log,pH8.2
UNC1419,Log,Aquil,12C
- 4.67 - - - - - - - - - - - - - - 3.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.19 3.96 - - -3.69 -8.91 - -7.81 -6.12 - - - -7.21 - - - 1.68 - - 0.35 1.95 -0.59 - 2.32 1.97 - -6.37 -1.43 -1.13 -2.61 -5.04 -1.63 -1.65 -1.92 -1.95 -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.62 - - 1.56 2.72 - - - - 4.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 1.23 - - - - - - 5.07 - - - - - - - - - - - -
0.58 - -1.45 - -2.83 -3.4 -2.11 - -3.22 - -4.53 - -3.87 -3.15 - 0.1 2.52 - - - 0.09 -0.94 2.84 -1.03 - 3.11 3.11 - - - - - - - - -
- - - 1.77 2.62 1.29 - -0.25 1.62 - 1.71 - 0.34 0.38 - - - 2.36 - - - 1.4 1.15 0.59 - - 1.47 - - - - - - - - -
- - - - 1.23 0.81 0.08 -1.48 0.53 3.44 2.54 - 0.12 - - - -1.51 - - - - - 3.45 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.88 - 4.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - -3.75 - - - - - - -0.82 2.46 - 0.11 -0.13 - - - - - - - 1.53 2.92 3.01 0.64 1.7 - - 1.8 0.07
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.95 - - 3.7 - 2.92 -11.41 - - -10.64 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.61 - - - - - - - - - - - - - - 3.56 1.12 1.49 - -0.68 - - - - - 2.69 -0.17 1.61 - - -0.55 0.78 0.22 -1.69 1.49
- -2.67 0.18 - - -9.99 - -7.87 - - - - -9.09 - - - 2.29 - - 2.45 1.83 2.69 2.28 -4.92 - 2.67 1.46 -6.94 - -3.48 -4.74 - - - -14.66 -2.6
4.87 - - - - - - 2.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.24 - - - 4.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.14 - - - -0.29 - -0.43 - - - - - - - - 1.25 - - - - 3.38 - - - - - 0.98 - - 1.03 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.55 - - 3.65 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 1.71 - - - 1.55 - - 2.91 - 0.28 - - - - - 2.69 - 3.68 - - - - - 0.85 - - - - -
- - 2.61 1.04 0.41 -0.22 -1.01 0.43 0.58 -0.17 0.59 -0.0 -0.78 -0.45 2.7 1.91 -0.87 1.04 - - - -1.73 - -1.32 0.74 0.56 - - - - - - - - - -0.14
- - - - - 1.45 2.41 - - - 1.92 - 2.01 4.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.74 - 1.24 -1.18 -1.56 0.73 0.92 0.38 2.31 - -1.94 - - - 1.81 1.02 - - 2.44 0.23 - - - 1.79 -0.95 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - -0.21 - - - - - - 1.11 - - 3.42 3.8 - - - - - - - 1.23 - - 2.58 - - - -
- - - - -0.9 -1.14 - -2.13 0.29 -6.98 1.07 -14.65 0.82 0.06 0.66 1.65 - - 4.43 - - - - - - 0.23 0.23 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.83 - 3.0 - - - - - - - - - - - 4.38 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.18 - - 3.82 4.12 - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.8 - - - -2.05 -1.91 -2.3 -0.89 -2.56 0.35 - -3.0 2.28 2.95 0.59 - - - 0.62 2.39 - 0.05 1.03 - 1.16 - - - - - - - - -
0.81 2.82 - - - - - - - - - - - - - - 3.33 0.99 -1.72 -0.84 2.09 -1.83 - - - 0.55 -0.09 - - - - -3.07 -2.69 -2.25 -4.38 2.76
- - - - - - - 2.55 - - 2.55 - -0.06 2.48 - - -0.31 - - - - 3.29 - - - - - - - - 1.77 - - - 1.92 -
- - 2.64 - -1.87 - - -1.83 - -2.73 -0.43 - -2.06 - 3.1 3.03 -2.93 - - 1.49 1.78 1.18 -1.85 - -1.94 0.37 - - - - - -0.19 - - - -
- - - - -1.37 -1.16 -1.19 -0.17 -1.46 -1.76 -1.26 - -0.41 -1.75 - - 1.36 - 0.83 -0.69 3.1 3.3 2.79 -0.26 - -1.7 -3.62 - - - - - -2.44 - - -
- - - - - - - - - - - - 1.3 - - - 4.43 - - 3.59 - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.25 -0.13 1.67 -0.26 - -1.07 -1.52 -2.01 - -2.13 2.1 - - - -1.28 1.98 - - -1.12 -0.77 -1.27 - -0.47 -1.46 - 2.86 0.13 -2.43 - - 1.41 0.98 -0.71 0.02 1.57
3.18 -0.27 -0.27 1.2 -1.53 -1.79 -0.97 -1.54 -1.43 -0.48 -1.09 -1.27 -1.51 -1.51 -0.3 -1.33 0.85 1.37 0.65 0.86 1.69 -1.61 -3.28 -1.24 -1.26 -1.13 -0.3 -1.49 -1.08 -1.99 -0.47 -1.04 -1.14 -1.61 -1.3 -0.73
4.08 0.79 0.58 0.73 -2.42 - -4.74 -2.25 -3.38 -1.77 -0.89 0.24 -5.22 -4.58 -2.59 -1.55 1.99 1.07 -0.48 - - -2.78 -1.09 - -2.89 - -0.87 -1.65 -0.78 -0.6 -2.9 -2.3 -1.9 -1.51 -1.47 -3.01
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.07 3.07 - -0.54 - -1.5 - - - - -0.49 -1.51 - - 0.96 - 1.77 - - 3.26 - - - - - - 0.95 0.83 - 0.33 - 0.49 - -
- - -0.94 - -3.19 -6.3 - -4.04 -3.57 - -1.14 - -5.72 -5.07 -0.53 1.84 -0.03 - - -3.17 -2.66 - - 1.55 0.99 1.11 -3.68 -3.85 -0.86 - - 2.11 -2.42 2.43 1.89 2.97
- - - - - - - - - - 2.47 3.26 - - - - 4.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - 3.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.86 -1.1 - 0.51 -1.09 0.6 -2.81 - -0.32 -2.3 - - 4.62 - 2.21 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -1.27 - - -0.99 -1.15 -1.59 0.78 1.91 - - 3.06 3.06 -1.53 - - 1.44 0.77 1.77 1.98 - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.52 1.0 2.56 -1.18 2.3 - 2.59 - -0.77 0.61 - - 3.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 0.51 -0.1 - 1.37 - - - 2.85 - 2.69 - - - - 2.67 - - - - 3.46 - - - - - - - - -
- - - - -0.27 -0.51 - -1.5 0.92 -6.35 1.71 2.89 1.45 0.69 1.29 2.29 - - - - - - 2.64 - - 0.86 0.87 - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.3 - - - - - - - - 4.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.79 - -1.35 -1.31 0.55 -3.08 -2.03 -4.09 - - -1.91 -1.88 -1.43 - 0.93 0.19 2.38 - - - -1.11 1.49 - 1.41 -3.22 -1.7 -1.49 0.64 -11.48 2.4 0.08 -0.37 1.41 2.13
- - - - - 1.87 2.29 2.29 - 2.46 - - - 2.58 - - 0.61 - - - - - - - - - - - 3.25 - - - - - -15.1 -
- - 2.33 - - -0.47 -0.26 - -0.06 -1.76 1.25 - -0.95 -1.36 - - - 0.97 3.15 - - - 3.56 - - 0.45 -0.27 - - - - - - - - -
- - - 1.22 0.96 0.16 0.48 -0.13 1.22 0.97 1.81 0.21 -0.26 1.03 -2.87 - -2.78 -7.35 1.3 -16.95 - 0.7 1.54 2.13 -24.24 1.61 - - - - -0.06 - - - - -0.32
- - - - - - - - - - - - - - - - 0.73 - 3.61 - - - 4.47 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 0.25 -0.4 1.6 - - 3.57 3.96 1.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - -1.01 0.8 -0.43 1.72 0.51 0.69 2.05 1.97 - -0.23 1.67 0.41 - 1.65 - - -0.42 - - -0.11 - - - - - -2.9 -1.15 2.85 - - - - -0.6
- 3.48 - - - - - - - - - - - - - - 2.3 - 3.7 - - 1.98 - - - - 1.55 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.02 3.45 - - 2.91 0.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.79 2.74 - - - - - - - - 0.37 - - - - 3.78 - - 0.46 1.6 - - - - - - - - - - -0.1 - 0.04 0.05 -
- - - - 2.41 2.76 -15.21 1.06 -17.08 - 3.48 - - 3.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.62 - - 1.56 2.72 - - - - 4.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.44 - - - - - - - - - - - - - 4.26 3.51 - -13.73 -0.1 0.7 -3.23 - - -0.31 -0.25 - -2.68 - -2.69 - -4.13 - - -
- - - - - - - - 2.07 - 3.66 3.72 - 2.58 - - - - - - - - - - - -20.07 - - - - - - - - - -
- - - - - -9.91 -2.27 -4.46 -1.57 -4.41 - - -5.33 -2.61 - - 2.8 - 1.83 3.12 - 3.68 - - - -0.57 1.34 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.43 - - - - 3.76 - - - - 3.54 - - - - - - - - -
3.52 0.59 -3.12 -2.16 -1.32 -1.77 -1.59 -1.56 -1.74 -2.03 -1.59 -2.59 -1.5 -1.57 -1.87 -2.06 1.76 1.72 1.6 -2.16 -0.64 -1.59 -1.62 -4.64 -5.01 -2.15 -1.55 -4.73 -3.45 -3.94 -3.38 -4.18 -3.75 -4.45 -3.37 2.73
- 4.67 - - - - - - - - - - - - - - 2.72 - - - - - - - - - - - 0.16 0.39 - 0.59 - - - -
- - - - 2.48 1.02 -5.13 1.85 1.15 0.37 3.02 2.54 0.35 0.88 - - - - 2.07 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - -3.61 -0.69 - -4.05 - - 2.04 3.9 3.72 - - - - - -1.3 1.39 - - - - - - - - - -
-13.3 2.66 - 1.45 -0.07 1.7 1.32 -0.12 -0.68 1.28 1.68 - -0.89 0.84 - 0.18 -2.81 - - -3.94 -0.03 -1.97 -1.68 1.77 0.82 -0.25 -1.59 - - - - - - - - 0.6
- - - - - - - - - - - - - 1.82 - - - - - - - 3.92 3.75 - - - - - - - - - - - 1.98 -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.76 - - - - - - - - - - - 3.2 - 3.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - -0.02 - - - 1.58 - - - - - - 2.59 - - - - - - - 4.29 - 2.68 - - - - - - - - -
- - - - - - - 2.35 - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.2 - - - - - - - 4.14 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 2.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.9 - - - - - - - -
- - -0.73 - 0.23 0.93 3.98 0.17 -0.43 -0.2 -0.54 -1.82 -0.0 0.01 -1.96 -0.17 1.03 -7.13 -16.75 0.64 -18.65 -1.91 -2.13 -2.79 -0.23 -1.42 -1.45 -1.17 1.48 - -21.61 - - -14.29 - -0.79
- 1.72 - - - -2.0 -4.06 -2.25 -3.37 -3.75 -4.3 - -3.22 -5.82 - -2.9 1.27 4.04 0.64 2.19 2.49 -2.27 -2.29 - - -2.92 - - - - - -4.0 - - - -1.14
- - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.